Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA004270

[Submit comment/correction]

Sequence
AA004270
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004270
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAGCGTAAAAGAGAAGAGAAAAAAGGAAGAAAAAAAATAGAAAGGGGGG
GCGGCCAAGCACCACTGCTGCTACCTACGTTCCCCTCCCCTTCCTCCTCC
ACCGCGCCGAAACCCTCGCCGCCACCGCCGCCGCCCTCGAAACCCTCGTC
GCGGTGACGATCGCCGCTCCGCCCCTGGCACCCGCAGAAGGGGCACGGGA
CCGTCCTGCCGCGTCATGATCTCGCGCCTCCCGGCTTCGGTGCTCCGCGC
CGCCCTCCAATGTGAGCCTCTCCCCCCGTCCCCGTAGCAACGATTCTTCT
TCCTCGAGAAGGCGAGCGCGCTTCCGTGCGTGCTGTAATCCGCTGTGCTC
TTTTGCTTCGCAAGCCCTTTCTTGCTGCGATTTTCCCCTTCGCGCACGTG
TTCTTGGAGGATTATTTGGGCGTGCTCTGGAGGAGGCTGGTTTGCGTAAT
TTCGACTTTTCGAGGCTAGGGTTCTGGAATTTACTTCATGTGTCCTTTAC
CTCCCGAGTTTCTTGTAAAGAACCCGCGACTTTTAAGCGCAATTTAGAGC
TAGTCCGAAGCCTGGTCTTTTTTTAGTCTTTATTTAGGCGGATTTCGCTC
CAGATTCTTTTTCCCTTTTCTCGATGCGTTTTCCGTGCGCTGGTACTATA
TGCATCTGAAATTCTTGATGGCATGTGCTACACATTAGTTGATTTATGCC
TGCAATTTTTCACAGAAAAAGAGGGAAGAAGGCGTCTCTCTCCCTCTTTC
ATGGGGCAGCCAGGGATGGAGCCCCTGGAAGGGAAGGAGAGCAATGGTGC
TGTTCCTGACTGCAACGGTGGTGCTGTTGCTTTCCCTGCGAAGCAGCAGC
AGCAGCCGGAAGGGGCGGATGCGTTGCGGTACGCCAACATCCTCCGTTCA
CGCAACAAATTCGCTGATGCTCTCCAGTTGTACAGCACCGTGCTTGAGAA
GGATGGCGCCAACGTGGAGGCCCTTATCGGAAAAGGGATTTGCCTCCAGG
CGCAGAGCCTGCTCAAGCAGGCCTTGGAGTGCTTCACCGAGGCCGTGAAG
GTTGACCCCAACAACGCATGCGCTCTCACGCATTGTGGGATGATATACAA
AGACGAGGGGCACTTGGTTGAGGCTGCAGAGGTAAGGACCAAGATTCATT
GTGTGCTTTCTCCTACCTGTCTGTTGGCTTGCTGGTTCTTGTGAACCGTG
TCCTAGGAAAAAAAGACCTTGTTTTATTTATAGGATGAGATGTCAACAAC
TAACAATGCAAGTTTGTTATGGAGTATGTGGTCATTTGAAAGCAAAATAT
ACTGTTGATTTATGAGTCACCCATCCCCCCTATTGCACTATTGCACTGTG
GCACTAGCACTATTAGGAACCCACTAGTTTTGTGCTCCTTGTTTGTGCCA
TGTTAGCCTGAATGGATGATTTCATGCTGGTATGCTTGTGTAAATTTGAG
TTTCTTCTTGCAGAGAATACCAGTTAAATTTAGTTTTAATAGGGCTATTT
ATAAAGTGACTTAACCCTAAGTTTGCCCAATTAACCTAGCCATCATTGGA
TTCCACTTATGTGTGATGGAATTGGTGTCTAGCGGTCTAGCTGGTTGGTG
TAGATAGTGGGACTGTAACTGTGGCAAAAGAAAGTTTGATTCTACCGGGA
AATGTCCCTGGTTACCATTTTCCCCATTGAGAACAGGAACCCCTTGCATT
TTGTTATCAATCTACTCCCTCCGTTTTGTTGCTTACGGCGTATAACATCT
GGCGTGTGGATTAAGAAGAGCCGCATAGTCTAGTTCTTTTCCCGTAGTGC
CCCTCATAAATAGCTACACACGATTATCTTTGTTACGGTGGGACTCCTCG
TTTCATGCGAACCCAATCAACATTCAATTCCAGCCAATTAGCACGGCCGA
CGTCTCCTAAATTCCAGCGCGCGGGAGGGTACTTCAGGAAGTTAGCGATT
TTTACGTATGTTCGCCTTATTCTGTGGTGAAAAACGGGAAAAATATTTAC
GCCCTAATCTTAGGAATGGAGGGAGTAGTTTACTGTTGGAAACTGTTAAA
AAAATGCTCTTAAGTTTTGTTGCTTTACTGTGTTTAGTGTGTTCTTTACG
TTTTCAATGTTCTGATTGAGAAAACAAATCTGGAACAGGCGTATCAAAAA
GCTCGAAGTGCGGATCCTTCCTATAAAGCTGCTGCCGAATTTCTTGCTAT
TGTATTAACCGATCTTGGAACTAGCTTGAAGCTTGCAGGCAGTACAGAAG
ATGGGATTCAAAAATACTGCGAAGCTCTTGAAGTGGATAGCCACTATGCG
GTATCATCATCATCAATTCTAGTTTATCTTCATATCTCTATTATTATATT
TTCAACGTGAACAAATCTGGAACAGGCGTAGCAAAAAATACATTATATTT
TTTCTCTGATTTCTGCAGCCTGCTTATTACAACCTTGGAGTGGTTTATTC
AGAGATGATGCAATTTGATGTAGCTCTTACTTGTTATGAAAAAGCTGCAT
TGGAGAGACCATTGTATGCCGAAGCTTATTGCAATATGGGAGTTATTTAC
AAGAATCGGGGAGAGCTAGATGCAGCAATTGCCTGCTATGACAGGTAAGC
TTGCCATTATTTTGTTCATAAAGTAATATACAACAAGAACATCTTGAAGT
TCATGCATGGCATAACTTTACTGTATCCCAGGTGCTTGACTATATCCCCG
AACTTCGAGATTGCTAAGAATAACATGGCGATAGCACTAACCGACATGGG
TACAAAGGTGCGGATTCATCCACTACTATGGTTGTGTCAATTCTACCGCT
TACCATCATTCTCCGTTTCCTCTTCTCTTTGACTGACCTTAAAATGGCAT
TAGATCTATGCATCATTACTACTATTTTCCACTGTTTGAATTACTCCATG
TTGTACAGAAGCTCAGCTGCAACTGTCATACTTTTTTGTATATATTTAGT
AGTCCATAGCACTGACACTGTTCATGATTGATTAAAGGCAAATCTATTAT
ATTTTGGCTTATTAATTTTCATTTAAACATTGGAAATGCTCAGGTAAAAA
TTGAGGGTGACATCAATCAAGGTGTGGCATATTACAAGAAAGCTCTGTTC
TATAATTGGCATTATGCTGATGCAATGTATAATCTTGGCGTTGCATATGG
TGAAATGTTGAATTTTGAGATGGTGAGTTACAAGAAAATTCCATTAATTT
TGTTCTACTGTTAGCATTCAAGTTTTTCTGACATAATCTACTTATGAGTT
TCATGAAGGCTATTGTATTTTATGAACTTGCTCTACACTTCAATCCTCGC
TGTGCGGAGGCATGCAATAATCTGGGAGTAATATATAAGGATAGGGATAA
TCTCGACAAGGCTGTTGAATGTTATCTAGTAAGCGAAACTAATAATGCTC
TTCTGTTCAAGTATTTTAGGCTCGTGTTTACTAACCGGCTATTCTCCTTT
CTTGTTTCTGTAGATGGCCTTGACAATAAAGCCAAATTTCTCTCAGTCAT
TAAATAACCTTGGAGTTGTCTATACAGTTCAGGTATGTTCCAATATTATC
ATATTTGTCTTGCTCACATTCTTACTTTGGCTGGCTGGTTACATTGCACT
TATGGTTTATCAAAATACATAACTCATATTTAGGGCAAGATGGATGCTGC
TGCGAGCATGATTGAGAAGGCCATACTTGCAAATCCCACGTATGCTGAGG
CATATAATAACTTAGGTAATGAATAACAAACCTCTACCATTATAGATTAT
TCGATTCTATTATGTTGAAACAGCATGTTCCATCTCGGTATTCACAAGGG
CTCTATGACCACTAAGCATCTTTTATAATTGCAACGACACGCAACAAGGA
TACAATGAAACATCAGTATATATGTATCTAGATGAAACAAATACATCATG
TATAGAGTATTAGAGGATGAACATTGCGCAAATCATTAACATTGAACAAT
TAGCTATAAGATTGTAAACGAGGGGCAAAGAGGCATTCTCAGATCTGACA
TGAGATGGCCATTAGGTTTTTTCCTTTGAAGGTTTCTGGTGCAGAAACGT
CCAAGAAAATCAGGTTATTTATTTATTTATTTTGAAAATCAAAATTCTTC
AATAGTCCCCAAGGGCCCAATGTATGTATCTCCACATATCGATGACTAAC
GGGTACAACTATGGCACTACTGCCATTTTTTTGTGCAGTTTTTATGTAAC
TGACAATTCACCATTGCTTTATCATAGGTGTTCTTTACAGAGATGCAGGA
AGTATCACATTATCTGTACAGGCATACGAGAGATGCCTTCAAATTGATCC
TGATTCACGAAATGCTGGCCAGGTACTTTTGAGGCCTAGAGCTTTGATTA
TTTAACATTTCTGCAGGACTCCTGTATGTTGTTATAGTATTTAATAGTTG
AGCAAGTACCACATGTATGCCCTTGCCCCATTTAGCATCTGAAAACATCC
TGTAAATAGTCTCTGGCATTGTACTCATTATGGACCGAAATATTTACTTA
AGACATGCCATCTAGGATCCCCCCTCATTAAGTAACCTGATGCACTATCT
CCTATTTCCTTTCAACCCTTCTGTTGCTTGCACATTCTATCTGTAATTTT
ACTGGAACACCTATGTTCTATATTCTTTTAACACCTTGCCCATTTGTGCA
CTGTATAGATTACGATCTATTCTGATGTTGTCAACTTAACAGAATAACTC
ATTTTGCAGAATCGATTGCTTGCAATGAACTATATAGATGAGGGCTCAGA
TGACAAGCTTTATGATGCTCACAGGTCCTTCTATGCACTATTTGCAATGG
ATGCCCATTTTTGCGTTACCATGATTTGTATTTCTGCATGGTATTGATAC
TATTTGGTACTTGCTCTCTTTCTATATTTTGCAGAGAATGGGGGAAGCGC
TTTATGAAACTGTATACGCAGTATACTAGTTGGGATAACTCAAAAGTCGT
GGATCGCCCACTGGTCATTGGTTATGTATCTCCTGATTTTTTTACTCACT
CTGTATCATACTTCGTTGAGGCCCCCCTTGCACACCATGACTACACAAAT
TGCAAGATGGTTGTCTACTCTGGTGTTGTGAAGGTAGAGATAATTTGTTC
ATTCTTTGGCTATTCATGATTTTGTGCACACCGTGGCTATCAACTCATTT
AGACTTCATTGCCTCATTTGGAATCATAATTTCTATGGAAATAAATATGC
AAAATGATCACTTTATCAAAATAAAACTGTGATCCATTGGTTAATAGGGT
AGGAGCTGGGTATCTAGTTATCTACAAACAATAGTTTGGTAACACATGAT
TTCTAAATTGAAAAAATTAACATGCAATATGATTCTGTCAAGTTGGGTCT
AGGGTTATCTCCTTGTTATGTTTTATCCTTTTCCATATATTTTTCTCTTT
ACTTTCTCATTATATTTTTTCCATTTATAATTCTTAGGCAGATGCCAAGA
CCCTTCGATTCAAGGATAAGGTGTTAAAGAAGGGTGGGTTGTGGAGAGAT
ATATATGGCATTGACGAAAAGAAGGTTGCTAGCTTGATCAGAGAGGATAA
AGTGGATATACTTGTGGAACTTACTGGTCATACGGCAAATAACAAATTAG
GAACAATGGCATGCAGGCCTGCTCCTATTCAGGTATATTTGTGTTCCATG
AGGCATTTCTAGGACTAAATTTTATTTCCAGAACTACTTGCACGTGAGCA
GTATTATTCCTGTATGCTCTGGAATCTTCAGTAGATGTTAAACCATTCAA
GTATTTCATGATCATTGATTTGATGGCTATCTGATTGCAGCCTAAAAGGG
CTCCGTTCTAACTTTGATATGTGTGTCTATACAGGTTACATGGATTGGTT
ACCCTAATACGACAGGATTACCAACAATTGACTACCGGATAACAGATTCA
TTGGCTGATACACCTAATACAAACCAAAAGTATGCCATATGCTTTTCCCT
TGTCTATGTTCTGTGATGCAGTTTCTCCCTATGTATCTAGACCCCATACT
AGCAATTTTTTGCAGGCATGTTGAAGAGTTGGTGCGTCTTCCTGAAAGCT
TTCTTTGTTACACTCCTTCCCCAGAAGCTGGGCCAGTTTGTCCAACACCA
GCAATTTCAAATGGTTTTGTCACATTTGGAAGTTTTAACAACCTTGCAAA
GGTACATGATAGATTTGGATGCTTCAGTTTATCTCGATTGGATCACTCTG
TTCATCGAGTTATTTTTGTCAGATAACACCGAAAGTGATGCAAGTTTGGG
CCAGAATATTATGTGCAGTCCCTAATTCGCGGCTTGTGGTTAAGTGCAAA
CCATTCTGCTGTGACAGTATCAGACAGAAATTTTTATCAACACTTGAGGA
GTTGGGTTTGGAGCCTTTACGAGTTGATTTGCTGCCACTCATCCATCTCA
ACCATGATCACATGCAATCATATTCCTTAATGGACATCAGGTGAGAAGTT
ATGGCACGTTTAGGATCTTCCAAGTTATGTTTTAAAATGTTTGGCGGGGT
AGCAACTCCTTATATTTTGTTCTCGGTTATCTGCATTCCTCTGAACAGAC
GACTGAACTTGGCTTATGTTTTTGCAGCCTTGATACGTTTCCTTATGCTG
GGACTACCACTACATGTGAATCCCTTTACATGGGGGTTCCGTGTGTTACA
ATGGCTGGTTCAGTCCATGCTCATAATGTTGGTGTTAGCCTGCTTACCAA
AGTTGGTATGTGACACTGCACTGTATACTCTAACGCTGGGAAACGTACAT
TTTAAATTTTTACTGCTTATTTGATTTTATTTTCATTTTCCTGCATGGTT
ATTTCTAGGAGCTGCATTTTATCCCACTTTTTTTCAAGTAACATATCTGC
TGGAGTATTAAAACACTCCCTTTTTTCTCACTGTCCAATCAGATACAGTA
TATAATCATGAGGAAAATGGTTGATTGATAGTTTTTTCTTGCAGGGTTGG
GTAGGCTGGTTGCCAAAACGGAGGATGAATATGTTAGCTTAGCATTGGGT
TTGGCATCAGATGTCAGTGCCTTGCAAGAACTGAGAATGAGCCTCCGAGA
GCTGATGATAAAATCGCCAGTCTGCGATGGAGAGAGCTTCACACGTGGCC
TGGAATCTGCATACAGAACCATGTGGCGCAGGTACTGTGATGGAGATTCG
CCAGCTCTCAGGCGCCTAGAACTGTTGGCGGCGGATCAGCCAGGCTCCAA
CAAGGAAGACTTGGACAAGACAGCTGGGAAGCTTGGAGATAACCAGGCCC
TGATAAAGGTTAATGCCATTCCTGAGGAAGGTGAGCTGCCCCGAATAGCG
GTGAATGCTGTGAGTTCGCCTGGAGATAACCAGGCCCTTGTAGTCACGGC
GCAGCAAGATAAGCAGCCCCAAATAACGGTGAACGGTGTGAGTTCACCTC
ATTCCACCTCTGGGGGATGCAAAGCGAACGGGCATAGCAGCCGATGACCA
ATGGGAGGCAGGCAATGCTCCATTGATGCAGGCACACACTGATATAGCTC
GAGATGTGCCATTGGTGTGCGTGATGTCAGCATGAACTTGCTGTTGGGGG
ATTGATACTAGTTTCCCCTCCCCTTTCTTCGACATCAGGAGCAGATAACA
GCACGTAAAACTCTGGTGACCCATGACTTGTAGCAGGTGTAATGTAACTC
AGCAGGGGGATGCTTATAGAGTCTGAGTTGTAAAGGTTTATCCCCCCTTT
AGGTGTACGAGTATATGACAAGTTGAGTTGGCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.