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GrainGenes Sequence Report: AA002355

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Sequence
AA002355
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002355
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGAAGAGATTTTTTTTCCGTGCTTCTTCTTCTGGTTATTCACATCATCAC
ATTGGAGCGGAGAAGCGAAAATCGCAAGGAGGGGAGGAGGATTCCGAATC
GCAGTTGCAGCCCAGTAATCCACTCCACCGCCACACGGATTCGATCGCCG
CCGCCATCTCCATCGCCTCCCCCGCCGCTGTAGGAAACCTCACCCTCACC
GCCGCCGCCATCGTCCCCTCTCTTCCCCCTCGGCTAGGGTCTCCTTTTCG
CGCCGCGCTGCGAGCTGCTAGGGTTCGCCTCGCCCTCGCGGTTAGGGTTC
CCCCTCCGGAACGTCCGGCGCCGACTGGCCTCTCCTCTTCAGCGGGGTGC
GGGCCGACTCTGGGGAAGAAGCGCGCCTAGGGCCTCTCCGCCCGATGGCT
CCCGCCGCCAAGCGGGGCGCCAAGGGCAAAAAATGGACCAGAGACCCGCA
GCTCGGGGACCTGGTCCTCGCCAGGGTCAAGGGCTACCCTTTCTGGCCAG
CCAAGGTCCTGCCTACACTCCTGCCCTGCCTGCCTGCCTGCTAGCTAGGG
TTTTCTTCCTCCATAGCCAGCCAGTTCCCTTCCTTTCTACTTCTTTCTTG
GCCACATCTCTGCCTGCCTGAATCCTGATATTGTGTAGGATGCTGACCGT
GTGCTTTCAGTCTTGGGGTTGATGTTTCTTGTTTATGCAGGTGAGCAGGC
CGGAGGACTGGAATCATGAGCCGATCGCACGCAAGTTCTTTGTCCTCTTC
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TCCTTTTGTTGCCATGTTTAACAGTATCCAACTGCCAATTCTACCGCGGA
TGACGCACCGGATACATAAATGTCATGCGCGCCTCGTTCTTGATAAATGC
GCTACCACAAACTTGCCTTTTTGTGTCTGATTTACATTTATCATGCATTT
TCTCAGAGTGTCATCTAGCAGCTGTGCAATTACTAACAGTCGAGATCTCG
TGCAGGGGACACTAACACTTTCTTTTATTTATTTAATTAGTTATCCCCAA
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TCTGCCTGCTTTAGTGAAAACATATTTCTTATTTTTGGCAAGATGGGTTT
TACATGTGCACTAATTGATGAAAGAGCGTAAATACATGTTAAAAGTTTAA
GGCCTCTATCACGCTCTATTGTCAGAAGGCGAATTGATCATTTTATTCTG
ATCTAATAACGGCTTGTACTGCAGAATTTGCAGTTCTCAATTCTGCTTAT
TTTATTTTAACCTGAGTATTACTTTATCTGACTTCCTGCTTTTGTTGATA
CATATACTAGACTGGTACATAAACTAGACATTCTTTGGCATGTGTATGTC
CGTGTAAATTTTAAATTGTGTGATTAGGGGCATCAGCAATGATCTAAGGT
TTCGCATTGCTGTGCATGGTCAGTCTAGCAGGTACAATTCTTTATAGACT
GAACCTGAAAGATGAAAGTAGTACTTTTATGCCAGTTTGATTTTTGAACT
AGCGACCTTTTTTTTGTAATTAAAGTAGTCTTTTCTGTTATCCGTAAGTA
CTCTTGACCACTCCCATGGCCTTCTATTTTCTTCCAAATAGTAAAAGTGG
GAATGTTTTGAATTCTTTTGTAACTTGAGCCTGTCTAGCAAGCTCACCTA
GAAATTGCTGAGTATGTTATTCTCTCTAAATTTTGGCAGACTATTTAGAC
CTCTTTAAATTACTTTGGTGCTAATAGAGCAACTAAATCATCTGATTTGA
TTGATTCCCTTTAGCCTAGAGGTGCTTGCTAAATGGAACATTTCATCATT
CCCTCTAGAGCCAACCTTTGTTTGTTGCCCCTGCTGTCCTCCACATCTGT
ATTTTCTTTGCTATTTGATCTTACTGTGACAACTTTTGGAAGTCCAAAGT
ATAATTATTACTTGATTGCTAATGAATGAATATCTCCTGCAGTGCTTTTG
TAGCTTTGCAAGATCTCGAACCATTTACAGAAGAGGTGAAGAATGACTTG
GTAAATCAAGCCCGAGAGAAACGCTTCCAGAAAAGACATGCGAAAGGTCT
TGAGGAAGCCTTGGTGGAGATATGCAAGGCCTATGATGAGCTGCCGAATT
CATCTGAAACTGCAAAATCATCTGAAACTGGAAATGGTTTGTTGCCTGAG
CGAACTCTTGACCTGATTGAAAAACCTACGGAGCACCTTATAAAGCCACC
TGATGATGGTGGGACTCAAAAGATGGAACAAATGGAAGGTGATAGTTCCA
TGGACAACTTGAATACTTTAGGGCACATTTCAGGAACTGATGGGGATGTG
AAAGATGATGGTCATGACAGAAAGGATCCTTTTCTGACAGCTTCTAAAAG
GAAAATATCTGTAGAAAAGGATTCAGACCATCCCAAGAAAAAGAAGCCTG
TCGCATCAAAGTCAGCTTCTGACCTGCACCTTGAACAAGAGCATTTTTTA
CCAACTTCTCCGTTCTCCAAAAGAGAGACTGAAGACCAAAAGGTTGAGAA
AGAGAGCCATCCAACTGAAGATTTTATTTTGGACCCTACTGTAGAGATAG
TTTTTGCTCTTGAAGTGCCAAAGGAATGTAAAACCAAGAAGCAGTTGAAG
GATGCTGACAGGAAGGAAAACAAACACGTTGATGTCACTGGTGTTTCTAT
GAGGACTGCTCCTGAGGCTCTGCCTGTTACTGTACCAAACAATATTGCTG
ACAAAGAGAGCAGGGGATTTAAAAAGTTGAAGACGATAATGAAAACATCA
GGTACGGACAAATCAGAGAGAAGGGATCATAATAACAAAGTAATACTTGA
CAAGCCTAACAAGGAGTTGACTGGAAAATCACCTGCTGCTGTATTTTCTC
CTAATAAGAAATCTCTGCCTGCTAGTGGTCAGCGCAAGTCGGAGGGTAGT
GCTGATATGCGTCCGACAAAGAGGCCAAAACTAATTGACAGAGCCAATGA
AACAGGTAAGACAGGGGCACAGAGTGAGCCGAAGTTACCTGTTGATAATA
AAAAGGATATCTCTGTGAAAAATGAGAAATCAACTTCTGTGGGAACTGGA
AACAACACATTTCCTGAGACTGTAACCACCGATGGCAAGACACGGAAATC
AGGTGAAATTTTAGCACCCTTACCAAGGCTGCACTCTGAGGGATTGGAAC
AGCCACCCGGCTCTGCAACCAAGTTAAGTGTTATTGATAGTGCTAAGAAG
GGATCCAGCATAAAGGAAAATGGCTCACGTGCTGCCAGGCCGTTGGTTAA
ACCCAGGAGAAGAGCGTGTCGCTTTCCTGATGACGAGGAGGAAGAACAAC
GGACACCACCTCATAAAACTGTGGCCAAATCAAGCTCCACGCATGTAGCC
CCAACGGAAAAGATCCATCAGACAGGTATTCGGGGAATTCCTTCCTCACA
AGTTAGCAATGTTTCTGCAAAAAAATCTGGTGTGGCAAGAGAAGAGAAAC
CTAAAAGTGTTGGAAGGTCACCTGTGAAGCATGAACCAATTTATTCGCCA
ACTCAAAATAAAGTGCTCGGACAAGGAAGAAAATCGACAACCACCTCAGT
CAATGCCTTTGCTGAATTGGGTAACAAAATTCACCCGGCAGATCTCAAAT
CCTCTGGACAATCAAGAATACCAGCATCATCTGAAGTGAAGAAACCGCAA
GGTAGTTCTTCTAAAGTATTGTATCAGACATCCGGGATCTCTCATGCTCA
AAGCCATGCTGCCTTAGAAAAGAATGTGCTTCTGTCCAAATCAGAAAATG
CCAAGGCTAAAGGTAAGCCTAGCACACAGACACCTATGGCTGTGGAGAAT
AGGTTAAGTGCCACTTTGTCAGGTGAACGAAATGTGAAGCTGGATCACTC
GAAAGATGACAGGTATACTGCTTTTGATCAGCTAAGTTTCTTTCTATATG
CTTTTCTTGTCCACGTGCATACTCCCTCCGTTCCAAAATATAAAATGTCT
TAGCCTTTTTCTGAAACATATGTTATATGTATCTAGACGCCTTTTAGTGT
GTAGATTAACTCATTTTGCTCCGTACCTACACACTAAAAGGGGTCTAGAT
TCATGCGTTTCAGAAAAAGGCTAAAACATCTTATAATTTGGAACGGAGGG
AGTACATTTTAGCTATGCACTTTGTTGATGCTTGCAGTTTCCTCTTATGC
AGATCAAATTTTGTTGATAAAGCCGATTTTGCCGATCCTAGTGCTGAATC
TGTCAAGTCAATGAAACATCTGATTGCAGCTGCTCAGGCAAGGAGAAACC
TTCTTGCGTCTGGTCAAGGCAATTCTGATGGGTCTCTTGCAGACAATGCT
GTTCTTGCCTCAACACCATATGGCTTGCCTGGACTAAGTCCTAGTCCTAG
CTTTCACATTCGATCTGCATCTAAAAGTGCTATTCCAGAGGGTGACATTA
TGCAATTTCAAGACTCAATATGTGAACCTAGTCAACGAGTTGACCTAAAA
AAGCCAGCAGAAACTGACCGTGAACATGAAAAGAGTCCTAAACCTAAGCA
ATCCAGTGGTTCTTTGAGTGGTGGTACTGATGCAGCAATTGCACGGGACA
CCCTGGAGGGAATGATAGAGACACTATCGAGGACAAAGGATAGTATAGGT
CGTGCTACACGTCATGCAATCGAGTGCTCTAAACATGGCATTGCTGATGA
GGTACCCCCTCACACTCACACCCCTGTATGCTCTCACAGAGACACATTGT
CTTATCATGTACATTCATTAACCCACATGCCATCAGCAATTCAGCATCAC
CTTTTCATCACAAGTGAAGTATTCTTATTAATTTGTTTCATCATTCGTAA
TTAGATTGTTGAGCTTCTCATAAGGAAAATGGAGAGTGAGCCAAATTTTC
ACCGCAGAATTGATCTCCTTTTTCTTTTGGATTCCATAACACAGTGTTCT
CACTCTCAGAAAGGTAAGTTTTCTTTGTATCACATAACATCTCAGAATTA
TGTGTTTCCTTAACCTCAAAATTTAATTATCTGTTTCTCTCAAATGGTTA
GGTGTTGCTGGGGCTTCATACATTCGCAGTGTTCAAGCTGCATTAGCACG
TATTTTGAGCGCTGCTGCTCCACCTGTAACTGGTGCTCGTGAAAACAAAC
GCCAGTGCCTCAAAGTAACAACTTCACTGCTAACTTTTCTTAGTTATTTC
CACAAGCAATTTACATTTCTGACCAGTGGCTTTGCAGGTTTTAAGATTGT
GGCTACAGAGAAAGATTATGCCAGAAGAAGTACTACGAAGATACATGAAT
GACATTGAGGTGCCAAATGATAACACAAACACAGGTTTTCTGCTCAGGCG
ACCATCCCGAGCTGAACGTTCTGTAGATGATCCTATTAGGGAGATGGAAG
ACATGCTTGTCGATGAATATGGAAGGTATTATAGATTCCCTTATCCTTTC
ATATTTAATGTTTTGGAATCCATACAGTTAAGCCTGACTACCATTATGTT
CAGAACTCTCAGGGTAGAGATCTACGCAACCAGATTTTTCATTGAAAGAT
ATTGTTGTTCTATTAATTTATTGTAATAGGAAGTTACATAAAGGCAACAG
TCAAAGTCACATTTCATTTTGAATACTGTAGAAGTCAAAACATAAAATGG
AAAAGAATAGAGAGAAGGGAGTACTATTTACTAGCTTGTGACTGTCTATT
TTATTTTATTTTTGTGGCTGAAAGTTATTAGTTCGTATGATTGATTTTTT
GGATTTCTTTACAAATATTTTAAATCTAGAATGAGTACCACTTAATGAAC
ACTTGCCAATGAGTTATTTGTTTCTATACTCTTGGATTAAGCTCTAGGTT
TTCTGTGACATCTCTTCTAAGTAGATCTGGTACATATTGGAGGTATGATG
TTATGAGCTTTGAGCCCTGTGCGAAGCAGCTGTGGTGTGGGCTTGGCATG
TGCACATGCTGGCAGCCTTGTGTGGGCATATAGGAAGGTATACAATAGGA
TATTTAGAGAAATATAAAGAGTCAAGCAAAACAAGTTTTGTCCATGTTGA
ATATGGCTGGGTCTTTTAAATTAGGAAGGATCAAGTTAAGTTTGGAAGAT
AGAGTTATGGACTTATGGTTTGGTCGAAAGTCTAGTTTAGTTCCGGCTTG
TGGATCAATACACTTGCCTAGATAGGGCAATCATGTATTAATTACTCAAT
GAAGAATCAATAGTTCAACTAAGCCTGAGAGTCTAGCTACCATGTTGGAG
ATTAGGCCCTTGGTTAGATGAGGTGAATGCCCTACCCCTGGTCTTTGGAC
CCTTACCTCTACCAAGATCCATGACACCTGAACTAGGGTTATCTGTTTTT
TTCATTTTATAAGAGATGGCAGACCCAGCAGAAAGATACATGTTGTTCTG
CTCAAGGCATAAAACAAGGAACCGTGTTTTGTAGTTACCTGATAACGGTT
TTGGTAAAATAATGAATGGCTGTATCTGTGGCGTAATAGGCGTACTTGTA
GCATTCTATGTGAATGTCGCATGCTTTGACCACGTAGGTACTCTATAGCG
ACCTTGATCTAGTTCCAATGATCCAATTGCATCAGCTTATTTTACTTGCC
TACATTTATACTAGAACTTTTGAAGTGGCCTCTCCACCTCTTCCAGCAAT
TTTAATGAGTTTATATGTGGTGCTATCTTAATTCAACTCCATTGTTGCCA
TCCTTGACACGTGTTATGTGTTTTCTGTGTGTTTTGCGCAGCAATACAAC
CTTTGTCTTCGAAAATGATGAAGATTTCCCTCGAATTAATGGGTTGTCAC
CAGTTATCTCACTGCAAGTTGAAAGGGGTGGAATACAAGAAGGCGTAGAA
ATTACCGCTCCAAATTCTGCTGATGAACACACCGTGGTGCTAGAGAGTGT
AACCAGTGATGCTGTCATGGAAGATGCTACAGATTTACCAAGGAACAGCC
AACAGATAGATGGAGCTGTCCTCATTGAGCATGATTCAAGGCAGGGAGCA
GGTTCACAGGAAGCATTGACTAATCAGTATGAGCTTCCCCCTCTACCTGA
GGGCCCTCCACCACTTCCACTGGATTTACCACCTCCCCCACCTTTACCGG
AGGGCCCTCCACCTCTCCCATTGGATTCACCACCTTCCCCACCCCCTTTG
CCTCCCTCACCACCACCTGCTACACCACCGCCGCCACCTACACCACTTTC
TCCATCTTCACCACCTCCACCGCCACCCCTGCCATCTGGCCCACCTCCAC
AGCCTGCTCCACCACCTCCCCATCCTTCTATCCCGCCACCTGTTCTGTCA
TCTCCATCATCATTGGGTTATCAGCCTGCCATGCCAGAATATTTCAGGCC
TCCCAATGTAAAACTTTTCTTCAATGTACTTCATTTTGCAGATCCTCCTG
TGTTCTTAGCTTAATAATAAAGTTCTGTTGATGCAGGGTAACCAACTAAC
AGAAAATTCATCAATTCAAGGTATTGGAAATCCGCCAAACTTCATGCCTG
GTGGACCAGCAAATGCACAAGCTCCAGTTAATTTTGTCCAGTCATTGCCA
CCAGATTATGGAAGTAATAATATCTTTCTGGCACAACAAGCTTCTAATGG
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CTTTCCCATCAGCACAAACACCACCAGTTCATCCCCACACTCATCACACA
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TTACCAGGTGGCAGATCATTATCTTGCTCAGATGGGTCATTCATGCAGGA
TGGTATGTTTGCATGTAACCTGTTTAATAGTGTTGATTTTTCAGAGGCCT
GAGATGGTTATGGTTCACTTTTCTGGTAGGATATTCGAGGTCCAACATTG
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TTGCCATCTGGAGCACAGCATCCAGGTTTTTTTTTGCTTCTTAAGATTCA
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TAATGAAACTTTAGAAGATCCCTTGACAACCAGTACCTTGCACCCGATTG
TGCTGTGATGCCTCCTTGTCAATTCATCTTATGGAATTTGTTAAAAAATC
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TTATTTTTGGCAGGTCATGTTGTTCCTCAGATGCTGCCAGCCAAGCCTGA
TATTCATGCACTTAATCGCTGGAGGCCTTCTAGATAAAGTCTTATAGTTA
ACTCCTTGCTTGCGGTACTCTCCTCTCTGTTGATACTTTGTAATGCTCTT
CTATTTGTTCCTTTGTATGATACTTCTATCTACTACTGCAGTTGAGCTGA
CTTCTCAGCTCTTCACATACAGGTTTTGACATGGGAAATTGGTGGTGCTG
GAAGCCATTTGAAACGAGGATGCAACAAGAGGTGCTTATACTAGTCTGTT
TTGTGATGAGGATGCACTTTTGCATGAGGAGTAATGATGAGATCTGACGA
TAGTAATTGGAATGGACATTTTACATTGTAATTAGTCTTTGGCAGCAGCA
TCCAGCAGACCAATCTCTCTTAGTGTAAGCACATGTTTTACATGACACAA
GTATTCTCTGTTCTTTTAGATGTTGGTTCTGGTGTTTGCTTGAGACTTTG
AGGACTGCAAACTGTTCAATGTATCTTGCTCAGACGCTGTGCCGTGTGCG
GTAGACATAAGTATCAGTTCTCATAGTAAAATAATGTGAACTTATTTATA
CAAGAGCATATTGATGTATCAGGTGGTATTCAAAAACGGGTTGGCTGAAA
CCTGTGAAAACCAGAAAGCTGAGCCAGCGCCCTAATCTCTGCTCGCGCGG
GGTGTGTGTGGGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTATTTGC
TAGTCCAAAAATGGTGAAGAAGAATAGCACCTGGTTTTCAACAGTTCGAG
AAACCTGTTGTTGCTATGTACGATACTTTTTGCAGTTTGTTGTACTTGCG
CTGTTGTGCCTACTGTGCAGAACATATCAAGTTTCAACTAGATAGACATC
TAAGCACAAACAGGAAAGCTGAAACACTGCCTACTCTTATGTTAAGTGAT
GTGAGTTAGCTCTTTAGAAAAAATTAGCTGTCTCTTATCCAGTTATAGGG
TAGAAGACAAGGCTAGAACTACAGGTTTATGCAGACATCCAAGAGCTAGT
AGTTTATTTGAGTTTCCATAGATTGCTTGTTATTTGTCATATGCTGGTAT
TCATTTTCCAGTGATTGGCTGATATTGTTGTATGCTGGTTTTCATTTTCG
AGTGGAAATTACCTGGTTCCCTATTCAGAGTGGGCCATGTGAGCGATTCC
ATTATTTTTTCAAGTTCCATGGATGCATTACAGTAATATAGTAAAATACA
TGCTGAATTTCGTAGTCAAATTTGGCCACATCCTATATCACCAAAATTAA
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TATTTCAGATATTAGCCCTTGAAAATTCTGCATGCATGCCATTATTCTGT
ATTCATAGGCCTTTGGAATATTGCATCTTAGTCTTAGAGAAACCACCGGT
TCTTTGGGTATCTAGGCTCAGTAACTAGTGCAAAGTTACAGTACCACTAA
AGTTGAGAGAAGTTTGAGGGAGTAAGCTTGTTGAGCTAGTTGTGTTTTGT
GATTGAGTGATAATGGCTTCAGGAGAGTACATTCCATTTTATCTTCTAAT
ATATGTCTCGTAAGATTGTTTAATGGACATTCAACAAGCATGCAAAGTAG
ATTCTTAGTTTTGAAGGGCCAATATACGTATCTTTCTACTTCAGATCTGA
TTTTGTCCTGCTCCAGATTGCCAGTGATGAGCATGAATTCTGTTTGATCT
TGTTGTTATTTTCCAGTGGACTTTCAGCTACTTTTGTCTTTCCACAGAGT
GGATGATGTGTTGCTAGGTAGTTTACGAAGAATAGCCAACTGATGGGATA
TTGGGAGTTATGAAATTTAGAAACTGTATCATCTATCTTCATATTGTCAG
ATCTGATTTTGTTCTGTTCTATTTTTCTATGATGTACATGACTATTCCTT
GATTTTATGGTTATTCTCCATTTACTTTTGAGAATTTTTCTTCCCTGTGA
AGTTGGTAGCGGGTGTTGGGTACTATTGTTGAAAAGATATGCAGATTTGC
CTAAATATTGTACACAATTGCTCCTTCCAGATTCATATGTGCGAAGAAAA
AAATAGAGATTCATTTTCTCCATTTGTTAAATTTTTCATTTCAAGTGGGA
GAAAGTTTGCATATATAATCCTGTTGAACCTTAACACTATAGAATTGCTG
CTTCCAGTTTCGTATATGCTAAAAGGAAATATAGATCCACTTTGAATGTG
AAATTTGTTACATGTACCCAAACTTTTAACTGTACTTTGGCTTTGTGTGA
GTATGAACATGATAAATATCTGTAGTCTGGGGAATGAATGATGCAAACAC
GTTCTGTGATTTCTTATTTGTACTTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGG
GGGGGGGGGGGGGGGGCACCAATTGGTGGTACTTTGCTTGATCTCCTTTT
ATTTTTGGCTGGGCTAATCACAGTTTCCAGGTTACAACAGTTGGCAATGT
GTTTTTCAGCTGGAAATGTAGTTCCTTAGTTTATCATTGGTCAAATGTAG
TTTATTTAGCTTCAAATCTGGTAGGCTGCAAGGCTTCTATCTGAACATTG
CATGCGTCTTCTATGGCTGAAGTGCTTTTCGGTGACTTTGCATGTACTAC
GTGCCGCGTTTTCTGAGAAGTGAACCTTGTTTGACTGAAACCTTTGTTGT
TGATATGGCAGGTCTGAAGAATATGCAACTCGGTGCGCGTGCGTCATGGT
TTGGTGCGATGGGCTGTTGGTGTCCTTGATGAAGCCGAGGGGAGCTTATG
TGGTGAGTTGAGTGTTCCATTTTGTTCTTTTGGCCGGCAACTTTGAGTGC
TTCATTTGAAGAGGCCTCAGCGAAGAACTGTACAAAAGAGAGGCCCCATG
TACAGCTTTTTTGGTAACTGAAAGTTAGTCTATGTATAGCGGATAATATT
ATTATGCCTAGTATATTAGTCCCTTGGCACAAGCTCGGGATGATAGATGG
GGTTACTCTTTTTGTTGGAGAAATGGAAGAAAGAAAGGTGGGGATCATTT
AAAGCATGCAGTGCGAACGGTGATGTATGTATTATCGGTCTTATTTTCCT
GTATCGGTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.