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GrainGenes Sequence Report: AA001248

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Sequence
AA001248
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA001248
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCAGAAATACTGGAAGGGCGTGCGATTAAGACGTCTGGAAGTCCGAGA
GAAATTTTCTCACACCCTTTCTACATTAGTCCAGAATGTGGACTTGTAAG
CATTACCAAACATTCAAGTTATCTCTTGCTGCTAGAGTACCTCATGAACC
ATGTGTTATTGCCCCAAAATCAGGAAATGCTTTGGACTGAATTCTGATTT
TATTTGGCAATTACTCTTCTTCTTCAATGCAAAGAGAGGAGAGGATGTTG
ATATCTCTGTCAACTTTGTGAAATCATTCTACAGTATGTTAAATATGCTG
GTAAGTTTAGTGCAACCGTTTAACAATATCCTTAAGTTTGTACAATCGTT
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ATTTTCACTGCTACTATGGCATTAACTATTATTTGTTCTTTTTATTTCCT
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GTCTTCTCTAGTCTATTTTATTTTCAATTGCGTGATGGAAACCGATTTTA
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TTGATCCAAAACTTCCGTGGAACTGTGAAGTAGTTGGATATCTTCAGCAG
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TTTCTATTTCCTTCTCACGATTGTGCACTTTTTCTTTACCGATGTGACGT
TACCTTTGTAGATTACTATCTGACCAGGATATATCAGTGGCATTAGACTG
CTTTAACTGGGTACATATAATCAGTCCACTTTCCGAGACCTAGTATTCAC
TGATGTGCTAAGTGCTAGTCAGTTGGCAGACCAGCACCGGGCTAATTAAG
TGGGTCTAGGTGGCCGCCTCAGATGCAACCTAGGTGGGCTGGCTATGTAG
CTTCTTTTTAGCAAAACCGTTGAATCATTCTTGTCATTTTGTAAGGTGCA
CCCAGTTCATGTAAACCTCGGGAAACCCTGCATACATACATTCCAACAAA
TTTCATCGATTTATGCAAGTCCTGGATGAAACTTATGGGCTTCATATCTC
GTAGGTGTTATGCTTTCTCCAGTCATGATAAGCCGAAGCTGAACACATGT
TGTGCTCATATTTCGAATTTGGATCAATCTTAATTGCACTAGAGAGTTCA
CATGGGCATTTCTAGTATTTATATATTCATGTAACCATTTGGTAGCAGGG
TGTAGAACATCTTATTTTACACGTGCCCTCATGGCGGACTGCCTTCCTGC
CTCAGTGTATAGATGTGGTTTCTGGGGCTTTGAAGCTCGATCATAAATAC
CATGTTTAGTAAATAGCCAAACCCTGCTATATCATCATAAATAGATACAA
ATCCAGTAAAAAGTTGTGCAGTAGCCATGCACTATGATCATGAAAGCTTT
GTTTTACGATTCTGCATTATCATGCATGCCTATTTATGATCTGGATGGAC
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GCATTTATGATTCTATATGAGGCATTTACAATACAATAGAATTTACGATC
TGATAGAAGCTTTTACGATTAAAGAACTAGTAAGTGGCTTCCATTTTCTG
GCCGGAGCGTAGAGTACTCCTGGAGAATTGAATGACCTTATGTACTGAAC
ACGCTAGTTTTCTCATGATCTAATTGGGCCTCGTACGTTTTGACTTCATG
GTCTCCCTCAATGTCTGGTCCATTTGGCTGGAGCGTAGCAGAAGGTTGTT
GTAGAGGGTAGGCATAAACGTCCTGTCTATGGAAGATGACCTTAAGGCGG
AGGCAAAGCGATGGTGTCATGCTTTCAAACTGCCATGAGAATTAGCTAGT
ATGTGTGCGCACGTATATGTATTGTTTGTGTTAAAGAATTGTTTGATCTT
TGATTGCGGCACTTGCTGCCTGACTCTTGTATCTATTTGCTTCTCCTCTT
AATAAAAATATGCGCAAACACTTGATTGCATGTTCCCTCAAAACTCTATG
ATAACATTTATTGACTTTGTTTTGATTAGCATTTGTTGGTAGGTAATGTG
GGAGTTTATATACTGTCTAGTGCAGCAACACTGTGCTGGTTTACTTATGC
CATTCGGTTGTTTGGAATTGATCATGGCCATTGTTCTAAATCTTTGATGG
TCTATTTTTTTGATTTTTTTATGGTTCTAATCCTTTTCAGCAAAATGAAC
GGCATATAGAGCATCTTGATTTTTCATCTGCACTGAGTAAGATCCTCACA
ATTGTTGCTTCACATGTTGGCAATCATCCTTGTCGTTGTCCGAGTGTCGA
TCCCAGATGGGGCTTTTCATCACAGATTCTCTCCATTCCTTCTCTCTGGC
ATTGTTTACCAGATTTTAAGGAGGTGAGCATTCTCCTTAATATTTTGTTT
GATATTTATTTCTCAGAACATTTTACTTGTGGACAGAGAATTTCAGAGTG
TTAAATGTGAGCTGTTACTATTTGTGCATTAGTCATTTGTTGGAGTTTGT
TTGAGGAGTGGTGTGTGTACTAGTTATTGCAGTGAGTTTACAATTGATTG
TTCTTATTTCTCATCACTTCAGGTTTTCTCTACTAATGGATTCAGCTCAA
ATTATATCCATCAGAAAGCTTGTTTTGTTACATCTTCTGCTGATATTCTT
CCAAATGATATATTGGCTAATCATCCTGGACAAGCATGTTTGCTGGCAAA
TGTACTTGAAACTGCAACCTGGATTTTGTCCGAGCAAGACTTCACTCCTG
AAAGCGTAGGTGTTCTACTTTGCTTTGTAGGTTACTACAACATTTCAGTT
GTTTTAGTGGATTGTTGTAAACAGTTAGGCGAAATTGCATAAATATTACA
ATATATGATAGTGAAAAAGACAATTAGGCCCCTTACTCTCAAACTTATGT
TGTAAGTGCCTTTGCTTTGTTTGCTTAGGCATTTTTATTTACTTTTCAAA
TTTTGAGCTAAGGTGGAAAGCTTGAGTTGGTAGGCAAGTCTATTTGATCT
AATACCAACTGCTTCGTACACATGCAAACACTCTGCTAGTTTATAGTCAT
CGGTCATTCTTTAATTATCAATCATGATAATGATAGCTGTACATTTTACT
TAATAATGTAGTGGAAAGGGTGAGTTGATATGGATAGTCAATTTATGTAA
ACCAACTTCTTGTACATAGAAAACACTTTGCTAATTTGTCATTATTCATC
AAGGATAAATCATGATAATGATTATGGAACATTTGCACGTAAAGTTGTAA
ATCATGTATGTGCTTTGCATACACCTTTTCCAACATTTACTAATCATCTG
CTAGTGGAATTGGGTGATTGATCAGTGAAACTGCCAGGGAGAAGTTCTAA
AATGTATCCATAGTCATCTCTTCAGTGATTTGTGTAAATAAATTGTAGTA
GGTTGTTTGCAAGTTGTAACTGCTCCTTCAATGCCACAGTTTGATTTGCA
TAATTATTATTGTTTTTCAAACCCTTCACAGAAGATATATTTTGTTACTT
ATATGGTATCCTGCTCACCAGGAATCCTTTTTCTTACTTTTTTTTCTGTT
CATTCTTGTCAAATTTTTATTGAGAATAACATTCTCTTCAAATATATTCT
CTGAAGACAGAGGACATCAATTCATGTCAAATGGCTCCCAATAAGTGTCT
TCAGCTTGTGACGCTCAAAGCATATGCATGTCTTGTTATATTACTACCTC
CGATCCTAAATAAGTGTCTCAACTTTGTCTAGAAACACATGTATCTAACA
CTAAAACAAGTCTAGATACATGCGTATCTAGAAAAAAGTTGAGACACTTA
TTTAGGATCGGAGGGAGTATTATATTGCCACCTAAAATTATCTTGGTTCT
GTAATAGCTGTCTTTTTTCCATTCTCTTTTGGGATGCTCACGGATGGGTA
ATTGAAGATACTGACGTCAACTTTTATTACATGGGTCATGAACATTTTAT
GTTTATGTTTTTTCCAAACCAGGGAGCTGAAATCATTGATGTTTGTACAT
TATTGTTGGATGCATTCCCAAAAATCACATCACCTGTTGAAAGTAAGTTG
CGTACTAGTAAACCAAAACAGCATTCCATCTCTTGGCATTATAGTTTGCT
ACTTAGTATGTATGCAGCATTTTGTGTTCCATTTCTGTCGCACATCTTCA
TGATAATGATAAGTGAGATATGCTTCATTGAGAAGCACTTTCTTCTATTT
TCAAGTTCTCAGCTTGTTGTGATTGTATGATTTCTGATATCTATCTGTTA
AATAGGTATAACTCAAAATATAGAAGAATCATAATAGAAGATTAAATTTT
AAAATGACTGTTCTGAAACAGTCTCATCTAAGTCAGTTACTAGGCTTCGT
ACAGGGACTAGGTGCTCTACCTATTCCAGTTATTGCAAAATGATCAAACC
ATAAGGTTAGACTTTTAGCTGACCACAAGGTCTGTTTAATCTCTTGTTAT
AAAAAAGAAAGTATAATTAGGTAGGTTTGATCTCTGTCCTTTTATCAGTT
AGTCCTTTTGCAGTTGTGGCCTTTCGTAAATTAGGGTTTTGAGAGCACAC
ACCATAATAACATATCAGCTGATCTCATTGTCACAATTTTATTTGGGAAG
GGATTGCGTCCCGATCCCTGCAATTGATGGTTGATATGAGGTTGCCTTTC
TCATCCCAGGATATGCATAGTTTGGTGCACCTGCACGTCTAGAACTTTGG
TGTTCTGGTCTTTGCACTACCCCTGTTCCAAAATATAAGACTGTTTTGGT
AGGCTATTTTGGCCTAAACGCCTTATATTTTGAAATATAGGTATTATATT
TTAGCATAGTCTGTACTGTATAGCTCGTTTAATGTCATTATGTCATCTCA
TGCATTTATATATTTCCTTATTTCGACGTAATCACATGAAATTCTTACAA
AAAACAATCTCAATCATTCAAAATCAGGCTCAGCTCCTATTGGGAGGATT
CTTACCGCCTATCGCTAAATCGGGCATAGGAGGACCTCCCCTGTGAAAAT
TGGCATGTTTCCATCCCTAGCCTTAGTTGACTCCTCGGGAACTATAAGAC
TACCACAAATGTCTGGTGTAGCTATAAATGAGTACTATTTGTGATGCTCT
ATTGTTACTCTATGTTGCTCTTGATTTGTTCCTGCTGTTTGTTCATTTTT
AAGGGAGTCTAATGTAAACTGTATTCTTATTAAATATGTACAGGGACATA
TGTCGATGGTACCATACCTATTGACGTCGATGTCAACAATTGTCTTGATT
TTGAGCTGCAAAAGCACATATCGACAACGGTTCAACACTTGGTATGCTTA
TTTCTGAACAAGATGGTAGTTTCAACATTATTACACTTCATTTTTATGTC
TTCCGTTTGACTCTAGCCTGTATTATGCATAGGTGAATGCTGCAGCTAGC
GCTATACTGAGCATACATTGTTCCGAATCAGCTGGCCCTTCAATTACTGA
GCTACAGTTTGTAGGTTCTGTCAGTTATTTCCTTCATGGCATGTTACATA
CAACTCTTATTGATGGAATACTGACTGAGCTGGCATACTATACTGAAATC
ATTCCTGCACTATGGAATTTTATAAAGATCTGCCATACAAATGATAAATG
GCAGTCGTTTTCCGAGTATTGTTCTCCATTGCTTCCAGATACTCCTGGCT
GGCTGCTACCTCTGTCCATTTTCTGTCTAATGTACAGGTAAATACACACT
TCCATACTGTCGCAAACTGTTGCTGGTTTTTTGTCTCCTTTTTTCGAAGT
ACTAATTGATATTGGAAAAAAACCCATTATATTTTCTCAAGCGCCAATAT
ATACTTTATCAACGCTTTGTTATTTCTTTGTACCAGCCACATCTTACGGT
TTATGGATATTGTGGAACTTAGGAAATCTGAAAATCCTGTTTCTCTTGAT
GATTTGCCACATCTTGTTTTCATTTTAAAGGAGGTATGCAATATACACCA
CAATACCATTACAGCCGCTATAAATGATGCTGGTGTGTTGTTTCTTTGGT
GTTACTTTAACATGCTTTCAATTTCAAACTGCAGGCTTTATGGGAACTTC
TGTTGACTATTCCTCCACAATCCTCTTCTTTACAGACAACACCCAGTTCT
CTAGATAAGAAGAAAATGTTGATTGAGATTCTCATGCGCAGTGTTAGGGC
TGGATTATGCGAATTACTTTTACAGGTATTATTTTAAACCAACTAAGCCG
AGGTTTTGTTATTCACTTGGACCTCCACACCCTCATCTCATATATATAAC
ACTTTAACTGGGCTTACAACTTGACTCACACATATATTCTTATGCGCCTA
TTATGACACTGAGATACTTTTATCTGACACACTAACTCACACTACAATGC
CCCCCCTCAAAATGGGCATGGGTTAACCACTATGGCCATCTTGTTACAAT
TACATGACACTACGTCCGCTACAACTCTAGCTTGCCACCATATTCTTCAT
TGACCATCATGCCAAATGCAAACAACAAGAGTATATATGGGAGCATTTTG
CTCCAGCTCTTGCTTCTTTGGTCTTCATCTGTTGTCAAGCACCCATTCAA
CTCTGACCATCCAAGCTCCACCCATGTGTGCCTGAGCATCACCAGCACCG
CGCCCAACTCTGCATCAAGGTAGCTACCTCCAATACCACTTGAGTTTGGG
CCACCGTTGCCTCTCCAAGCTGCCACAACCGCCTCATCTGTCCAATTGCT
CCTAAACCAAGCACTCTCCTCCTGCAATGCTCCTCTCAGCTCTCAGCCCT
TCCTTGTCGATATGTCTTCCACCTCTACAATGCAATCCCAACCCTGGCCT
CAACATTCTCTATCAAATACCCAGCCACCCTGGCCACAACCATTGTCGCG
GCAGGCCACTTGGTCACTATGGCCTCTACCACCTCTTTCCCCAAACCCTT
TGACTACTCCAGCAACACAACCTCCAAGGTTTCTAAGAAGGCCTCCTTAA
GGCGTTTTATCCTTGCTCTGACGCCAAGCGCCTAAGGCGGCCAAAATTCC
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GAACCTCTGCCATTAGCCCATTACCATCAAGCTTCTCGCTTACACCCTGC
ATTGCCGCACTTCTAACGACATCTCTTCAAGCTCTGCCTCAATCAGCCTC
CTTAGAAACTAAGGTTGCACCACCGCAGCATACAAACCACATACAAACCA
TCATTCTGTCCATGTTTCACGGATCACCTAACCCTGCAGTCCCTGTTTAC
TCCAGAGCTTAGCAGGCCTGTCCCATCTCTGCCTTTGGCAGGAACAAAGT
ACAAAAAAAATCATCCCATCTCTGCCTCTATCAGAACCAAGCAACCACAC
TCCTTTCTGCTTCTGTAGTGCAATAGTTTCATAACACAAGCCATGCCAAA
ACAGCAATACCAGAATTCTTCTTTTCTCCAATTCTCTTCTCAATCCCCTA
CCAGGAGCAATTCCTTCTGGCTTCTCTCACCAAACTCCCTTCTCCCAGCA
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ATGCACATGCACAACGCCCTTACAGCTCAATTCTCCCCGCCTCTGCTCCG
TACAGCAGGCTGGAAGGTGCTGCTGCATCTACCTCAGCTGCACAACACCC
ACAACGACCATTCTTCTTTCTCATCCTCCTGCAGCTAACACTTAGCAGCC
TGCTATGAGCACGCCGCCACCGGCTCCATGGTAAGCACACTCACACCTCG
ATCTTCCTACAGACCAAGAGAAGACAGCTGTTTCCCACCATATTAGGGGC
ACTCCAGCCAGGTCTGGCCATCTCCAGCCAGATCAGAGATACTCCTCCAC
CTCCAAACTTTCTTTGTCCGCAAATCCAACCTCCCAAACTTATTCTTCCG
TCAGCACCCGACTTGCACCATTCTAATCTAGCTTCCTTAGTATCGCCCCG
TGCGGAGCAGCAAGGCTCACATGACACACCTCGTGAACATGAGGTGGCTG
CCGCCCACACAGAGCGACGCAGTGCGTTCACTTGCTGCCTGAGTGACTAC
AATGCCCCAGTAGTCTGGACGGCAAGAGCCTGAGTGGTGCTGGATGTGTG
CATGATGATGGCTAGGGTTAGGGTTAGGAAGAGCCAAGCTTTGATACCAT
GTCTATTCTGGATGAAATTTCAGGATTTCTTAGTGGCTTGGACCTCCACA
TCCTCAAATATATAACTCTTTACTAGGCTTAGAATTTGGCTCCCACGTGG
GTCTCTATGGGGATATTAGGACACTAAACTACTCTTGCTTCATGAATTAA
CTCACACTACAACACTATATTTTCGTAGTGTTTTGCACACATTATGGATG
ATTGGGATAGTTTTATCTTCTAAGAAGGTAGCATTGCAGTATTTTCCCTC
AACAGTCCATGGTTCTTCTGTAGTTCCCATTTCTATGGGGTTCTTGTTGC
ATATGCACTTGTGTATATTTTGGCCCTTCGGCCCAATAGCAATAGAGATG
CATTCATCTAACAGTTTCTATGTGTTATTTCCTGCATACATAAAGTAGAA
ATCTGAAATCTGTATCTAATTGCAGTTAGAGGATTGGAATAATATGGATC
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GTTCAGGAACATATTTCTTCATCATGTAATTTTCCTTCAGGCAATTATTG
TGGGAACCCATGAAGCAGAAATTATAAGGCTTGCTCCATTTTTGGTACCT
TTTGACATAAGACTTGAGATATTCCAGGTAGGTTATTACTAATTTGTTGT
CTAAACATTGCTGAAAAAGACTGGTATACTTCTTAAGGTAATATCTTACA
AGTTCCTTCATGTGTGGTCAGTTACGTCTGGCAGCTGATCAATTGCGCCT
GGCGAACTCTAGACAAGCTTTAGAGTGTCGTACCCTGGAAATTAGCAGAA
CCAATCTATGGAAAGATGCTTTTGATAAGCTAAGCCTTCTCTCTGCAGAG
GATCTTAAAGGAAGGGTATGATGATGACTTCAAAAAAAATCTTTGTTCCT
GTTATCACCTCCTGTGGTAGGATGGTGCTACTGTGGTACCAATACATGAT
AGCACCACTCAGAAGTTATTACTAGATCTATTTCTTTTTGTGACAACACA
TTAACCCAAGATGCATCTATCGTGCAAATGTCAAATACAAATATGATCAA
CATAAAGAACATAATTTTGTGTTTGCATAGAAACTTCCTTTTTTCTCAAT
GTGAATCAAATTTGGACTTGAACTTTCCTGGCATAGCAATAACATATGCT
TAAATATGTATGTAAGTTTAGTTTTGGAGTTTAAAACTCTTTGTGGCGCT
ATATCCGGTAGCACCATGAGTAGTGGTTGATGCATAATATCCTCTTTAAG
CCTATGTTTTAATCTTTCAAGGACGTTTTTGTAGATTCAAATAGTCTTTT
TCAATGAGCATGGCATGAAGGAAGATGGAGTTGATGGGGGTGGAATATTT
CGAGATTTCATGAGTATTATCACCCAGCATGGTTTTAGTATGGAGGCTGG
CTTATTCAAGGTATCTGCTCTTTTAATCTATTTTGTTGATTTGGTTTCAT
GGCATTAATTATAGACATAATAGTACTCTTGTACTATTTTGTGCTTAGAT
GCGATGCATATTATTAGTATCTGGTGATCAAGTAGTAGGTAAAGGAACTG
GTAGAAAGAAAGGCGATGCTGTGATACTATGCCTCACAGCTTCTTTTCCT
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GCTCATGAAGATCATCTTCAGTATTTCCATTTTCTCGGAGTTCTACTTGG
AAAGGTACATCGATCATATATGTTAACTTAGTTAACTTTAAGAGTTTCTG
CAAGTTATGTAATCAGCCTATGCGAGTATTGTGATATGTAAAATATCTGA
AATTGATGTCATTTGACTGGTAATGAGATCAAGATTGGATGTTTTTTTCT
GCAATATGTTTCATATTTCATGACGGAGAATCAAGACTACCTATACCTCA
CGTGCAATATCGTGTTATGTTAGGTCCAACGTCTTTACTACATTTATCTC
AACTTTGTCTTGTATATGTTGAATAATCTGCTGATATGTGTGCATTGGTT
GCTCATTACCCATTATTGGGCATGTCATAGGGTTTATTTGGAACTGTTTG
CTGGGTTTCTGACTAAATGATCCAGACACTACCTATTAAGAAAGTTACTG
TTGGATGATCTCACATGTGATTTATTCTTGTCTCGCAGGCAATATATGAG
GGGATACCGGTTGGCTTGGTATTTGCAATATTCTTCTTAAGGAAATTGAA
ACAGAAGTAATTCTCTCACATTCTCTACCCCTTCATTATTTGGGAAATTT
TAGTTCTTGTGCTACGAGTAACGGGAGATTTTTGGTGCTTGTGTTGACTT
AAATTATGTTCATGTATTAAGCTGTTTTGACTTGTCGTGGATTAAATGTG
CTCCAATGTTTCATCAATTGACATAGTGGGTGTAATTAGTCGACAGGATG
ATGTTTGAGTATATGATAGACCATATTTGAATATTGTGTTAAGATACTTC
TGTAAATTTGTTAATAAAGCATTATGTCACACGATATCATTCTTTCGTTC
TGCTAGCCGTGTTTTAGTTTTAACGAGGTTAATATTTACGTTTAGCATTT
CATGATGCACCAGGGCAACATTCTTTAATGATTTGTTTTCACTGGATCCA
GAAATGTATCATGGTCTACTGAATTTAAAGGTATGTCTGCATAACTTGAA
ATACCATTATATGGATTCTGTTTAGCCTTATGACTTCTCTTGTCATCTGA
TCTTGCTTTCCAACCTCAGAATTCAGATGATCTATCCCATCTTTACTTCA
CTACGGTTGATGGTAAAGAACTGTTTCCTGGTGGGAGAAAGATGCATGTT
ACTACTCATAATGTTATTATGTATCTACATCTTGTTGCCAACTATCAGTT
AAACTGTCAGGTAAATAATAATGTCAATTTATCAGTTGCTTGTCATGAAA
AGCTGTGATAAACAATCTGCCATTTTATGGTCACAGAACCGTGAGCAAAC
TGTACAATTTTTGAGAGGTTTTCAGCAACTTATACCCACAGAATGGACCA
ACATGTTCAATGAACATGAATTTCAGGTATTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.