Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA013599

[Submit comment/correction]

Sequence	AA013599
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA013599
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTACAGCAACGGCCTCCGTCGGCCGCATCACGATCCACCACACGATCTCG CTCGGGCTCGGCGTCGCAGCCTATCTACATTCTACAGTGGGACAAGTACT GTCATGTACCACTCCACCGCGCGCGGCACCGTGCACGCTTGTCGCTTGGC AACTCCAGCGGTCCAGCGATGTCCGCCCACCTCCGCCTCCTCTCCGCGGC GGCCGCCCTCCCCTTACCCGCCTCCGCCTCCCTCCGCCGCGCACGCCCGC TCCCTCCCGCGCCCCCGCTCCCCTCTACCCGCGGCGTCCGCCTCCTCGCC CGCTCGCGCCTCTTGCCTCGTGCGTCCGTCCGCTGCCGATGCGTCGCCGT CGCGGGCGCGGCCGACGGGGGCGAGCTGGAGGGCGGGGAGGAGGCGATAG CGCCGGACGCGGGGATCTGGGAGCAGGTGCGGGACGTGGTGGTGTTCGCG GGGCCGGCGCTCGGGCTCTGGATCTGCGGCCCGCTCATGAGCCTCATCGA CACCATGGTCATCGGCCAGACCTCTTCCCTCCAGCTCGCCGCACTAGGTC TGTATCACCATACTCTATTCACTTCCTTCTCTGCTCTCCGATTAATAACA TCCATGATCCTCCTAACCAAACGGAGCATTTCCCCGCCGCGCACTCGATG GTATGTGAATTTACAGAACTGGCTCCTTACCTTAGGCGATACCGCGCGCT TGATGAACCGCGAAGCAAACCGATTAATTTGATGAATCGTCTGATTATGC TGCCGAAATCAATTAAAGTGTAGTTAACCTGTGCTTGTGTTGGCTCTCGT TTCAGGGCCTGGGACCGTGTTCTGCGACTACCTGTGCTACATATTCATGT TCCTGTCCGTCGCAACCTCCAACATGGTGGCCACATCCTTAGCTAACAAG GTGCGTGCAGCTAGTGCTACATTATTAACTCGCGGAGCCGCGCAAAAGTG TACTATGGGTGTTCGGGAAATAACACGAGGCGTGGATTTTCAACCCATCT ATAGAGTATTTTAAATTGTGGTGTAGCTTCTTCGCGTAAATTTCTTTTAT AGAAAAGAGAGAAGCTGACTAAAACTTGCCAAAGTACAAGCTCCACAAAA CATTTTTTACAGAAACTAGAGTAGAGTAGTCCTGTATGTCGAGATATGCT TGTGCTCTCTGCGTGAAACTATATACATTTGTTTGCTGCCCGAAAGAAAA AGAACACCGTGAACACATAAGATGTTCATTGGAGGTTTAGACTTTATAGG TAGTCAGAAGTTGAAGCCTCTTAAGATGTTTATCTCTTTGTTGCAGCCAC TTGACACACAGTGGCGGAACCACGCCTAACCTTTATAGTCATTTGACTAC ACAGTTTTTTGGTAATAGAAGCTAATAGTAGGCCAAAAATAATTAAAAAA TCATACAAATACATGTATTTGACAACACAGCGCTGAACTGACTACACAGG GTTGATGTTCTGGCTCCGCCACTGTTGACACATATATGTAATCTAATGCA ACTGCAGCTACCATATGCAGGATGAAGAACTTGCACAACATCAAGTATCT ATGTTGCTATTTCTTGCTCTTGCTTTTGGTATAGGAATGTTCTTGTTCAC TAAGATTTTTGGCGTTCAAGTATTGACTGGTAAGTCTTTCAAAGAAAATG TTCTATGTGCTTGAAAGTACCGTCTTGTTTGAAGTATTGAGCATTTTGTA TGTTCAAACGAAGTGCTGGAGGAATTCTTTTGCTATTACATTCTGTACTT TACTGTTGTCCCTGTTGAAAAGCCACTTCTTCTCCTAGATTCAAACTAAG CTTGGATTATGTAATGCTTTTTTTCTCAATAATATTCATGTTCTAACTTC ATTGCGAGATTAGGATGTGTGCTTGCGAAATAGATGCCACTAATTTGTTC TACCATTTTGGAGTTTCACATGCATTTTGTTCTACCATTACATTTGTTAA AATTTTTATGTGGTATCTTCTACTATTTTACCTTTTTAAGGTTCTACTAG TTTACATTAACTTGTGCTTTCTTAATCTTCTTTTCAGCTTTTACTGGATC AAAGAATTATGAAATTATTTCTGCTGCCAATACATATGCGCAGGTCTGTA TATGACAGTGTCTCAATATTTTCACCTTTTGAAATATACTCATTTGATTA TTTTGTGGTTTGACAGCCTGCATAGGTCTTTTTCCCTTATGTTGTTAGTG ATATTACAAACTTATAGTTCTGACTGCAAGGCTTGTTGGGGAATCTTGTT TCATATGCTTGTAGTACTCTTCTAATACCTTCTATTATATGGTATGCAAT TGGATTTTCCTGTGTCATGTGGAATAACAGAAACTCACTTTCAGATTCGA GGCTTTGCATGGCCTGCAGTTCTCGTTGGCTTAGTTGCTCAAAGTGCTAG GTACAAACTGTTCCTATTCTTTTATTTTATTGGATCGGATATATTTGTCT CTTCAAATTTCTATTTATTGCATGCCTTCTTTCTTTGACCATTTGTTTTG CTGAACTACATATTGTGGAAGTACATATCACTACTATTGTTTTCTTCCAG TAATTTATGCACAAAGAGATGTAACATTAGGCAAAAAGGTCAAACTTAAC TCAGCTCAGGAAATGAAATTCTGAAATCTATATGTCTAACTCCACGTGTA GAACCCTACCTGTTGTCTTAATGTTCTTGTTTAAAGTCACATCGCTAGGA CACTGCATTACTGCACCTATCTCAAGCAGCTGCAGGAACGAATGGAACTG TACACTTTTCTTTGGAATATTAGTAGACATCTGTTTTGAGCTTGTGATTT CTTTTACAATTATATTTCGAAGTATGTGTTTGCCTTTAATTGCTATTTGT CTGTTCAATCCTTATATTGCCATCGAGTAAGCAGATACTGATTGCATACC TACACGAGTATAATAGTTCAGGAAACAGTATTACAATATCTTTGATTGGA TGCTTTTCTTATCAGATTATATGTTTGCTATAACTCAGTCTAGGCATGAA AGATTCTTGGGGTCCTTTGAAGGCATTGGCAGCTGCTAGTGTTATAAATG GCGTCGGTGACATATTTCTTTGCTCTGTATGTGGCTATGGAATTGCTGGT GCTGCCTGGGCTACCATGGTTTCGCAGGTACACATATTCCCCAGTCTCCT CAACATGTCTCCATGTTGTCACTTCTTGACTTGAGCATAATTCAGGGGAG TCGTTTGTCCAATCTGTAAGCTTAATGAATACGCTATCTTAATAGCATTC ATTTGAGAGAAACACCACATTTCTGAAAATCAAGTTTCCACACCTCTATG AAGCAACAATACCTGGTTAACCCGTATTCCTAGAAGTACATTGCTTATTG ATGCAGACCGCACCCTGTCCAGAGGGAGCCACTTGCTCTTCTGTTGTCAA TTATATGTTCCAGAAATCCTAGCATTTTCTTATCCATTTATTTACTATTC ATGATCTGTATCTAGATCCAGCTTTTGTGATGTTTGATCACATTGCCAAT TTCTCTGCAGGTTTCAGTTATCTGCTCACATGTTTTTGAATAAGTTGCTA CCTTTTGACACACACTCAGATTATTGCAGCTTATATGATGATGCGAAATC TGACTAATAGAGGTTTCCGAGCTTTCTCATTCACAATCCCGTCAACAAGA GAGCTTCTGCAGATATTTGAAATTGCAGCTCCTGTTTTTGTGACAATGAC ATCCAAGGTAGCATTGTTTTTGGTTATAATGTTATGTGCCATTTCCTTGG CTTCACTGTAAGTCTGTAGCTAATTGTTTCAATCTTATTCAGGTAGCATT TTATGCATTACTTACATACTCCGCGACTTCTATGGGAGCAATAACTCTTG CAGCCCACCAGGTTCATACTTTGTAGCTTACAGAATCCTTCCCTATAAGG ACATGTCTACAAGAAACATGACAAAATATAGTTTGCTTGATCCTGTGAAG GTTATGGTTAATATCTTATGCATGTGCACTGTTTGGGGCGAGCCGCTGTC ACAAACTGCACAGTCGTTCATGCCAGAGATGATATATGGAGCTAAGCGCA ATTTGATGAAGGTACCTATCTTAAGTGTTCATTTTTATGTGTGTACCATA CCATTTTATTTTTATCCATGTTGATATCGTTAGCAGTGCTATCAGGATAT GTCCTGAGAATTTGTTCAAACCTGTGTTTGATGAACATGTGTTCTTGGGC ACTTATTTTTGAATCTCTTCTCTGATTTGGTTAAATGAATCAACTGATAT GCGAAGCGTCCCTTTACATTTTCAACAGAGTTTTTTTTCACAAGGCACTC CATTTTCTTCTTGTTTGAGAGATTTATGAAAGGTGCATCCTTTTCTGTTC TCTTCTTCAAAATATTTTGGTCGATCAAGAGTCAAGACAGGGCTGAATAT GACTGACTAGAACTTATGCTGTTGATAAGACATTTCGAAAGCCTAGAAAA ATAGGGTTCAACTAAGAAGTCTAATTATCTTATTCAATGATGTCTATCAG AAGCTTGATACTATTGCAATTTTGGTAGATTAATATTTCTTAGGATATGA AGTGTATTGACAGTTGGTGGGTACTGTTAATATAAAGTATGCAGCATTTG GATTCTGACCTGTGCATGTTGCATTCAGGCTTGAATATGTTTAATCGGTG TATACCTACCTTCTTTTCCCTGTAATAGAGCAAAAACTTCTGGTGGGCCC AACACCACTATGCATACTTAACTCAACCTGTGCTGCAATGATGGTACTTT GATTGACTAAAGTAGCGCCTGCATTTTACTGTAGCTATTTATGCATTAAA TTATATGAATATTATGTTTATTACTCTGAATGTTAATGAAGGTACATTTA ATCTAGGCAAGGATGCTACTGAAGTCCCTTGTAATGATTGGAGCTATAGC TGGAGTGACTGTAGGAACACTTGGGACGATTGTTCCATGGCTTTTTCCCA GTCTATTTACCAACGACCAACTGGTTGTACAACAGGTTTGACAAACTGCT TTAGTTTTCTACACATTCAGAAGTACTTCCAATATAGATAGCTCCTCAGA AACTATCAGTATGTCAGTTGCCTATGTAAATGTTGTTTCCAAGTATGTTG TAGCTTCCTATAAAGGCTATCTTCACCATGTATTGTATTGTATATCTAGA ATCTACATCTTTTATGTATGCATGTATTAAAAAAATAGTGCTCCTATATC TATTCTCTAAATGATACCGTTTCATGCTTTATATGTTACTTTGGTTGCAT AGCTTCTTAGATGCTTATCACTTGGGACCCTGACTGAATTTTGTGTGCGT GGTAATGTAGCTGAATATAGTGCCTGACTGCCCACTCGCTCACTGTTTGC ATGGGACCTGAGGACTGGGTTGGATTAGCTACCTCAGAGATAAGAGTACA TTGGATTGTCAGAATATTAGACGAGTCTTTTAAGGATTGAGGAAAAAAAT GAGAAATATATCAATCTACTCCTGTTTACTTCTCCCCGCCCCTGTGCTGT GGCTTCCATCATGGCGTGGTTGCACTCAGACACTCCGATCTAGCGCCATC TAACTGTAGTCCATGACATTTACAAGTCTGCTTGCTAGTTTATTGCTAAT CCTGACACAGATTTTAGAGTGAATTCCACTTTTTACCCTCTAGTTATGCA TTTCTGACACTAATTACCCTGTCGAGTGAAAATTCGTCTAGATTAACCCT TTTAGAAGCTTTGGACCCTTGTTTCCTGATGTGTGTCCATTGGGTAAGAT GTGAGATGATGATCGGGTTTCGAAAATATCAGGACGATGAAGAGGAATGG GACAGATGGATAAGATAAGTCTAGACATGATCATCGATGGCGCCTTCCGA TTTTTACACATTTTGTCATGCCACATCGATGTAACATGTACGTCCTACCT AACAAAAACAAGAAAAATGCTAAATTGGCGTAAAACCATGGTCAAAGTCT CCTAGATGGGATATTTCGATAGAGTTCCACTAAATGGGGTGGCATGTGTC ACAAGAGCACAGCTGCAGGGTAAAAACTAGAATTCCTTCCTGATTTTAAA AGGCTACATTCATCATATCAGCCTAGTTACGAAATGTTTGCTGTACTCTC TGGAGAACTGGCTTGCATGTCATCCTAGAAATCTCCTGTGGTGACGCCTT CAATAACATTTTTTTCTGCAGAAATTTGTATGCTTAATTCCCATGATTAC CAGTGTGTCTAACCTTCTGAGTTCTGTCTGGAACTTAATAAGTCCTCTTT TTTCTCAGATGCACAAAGTGTTGATCCCATATTTCACTGCATTGTTGGTG ACACCTTCAGTACACTGCCTTGAAGGAACATTATTGGTAAGCTGGTATAC TTCATTTCGACAATGGAGTCCAGGATAACTTATCAAAATGCTTGCATGAA TTGTCATTGCTTCTACAATAAGTATATGCCTGGACACTAGGCCATCATTA ATGAATGTGGAAACCATCTTTAACATGTTATGATACTGCAGTAACAGTAA TACAATAAATGGCCTATTCTGCAAAGTTCATAAGATCAGCACTTGCAAAC CAAGCATTTGCTGGAAAATGTGATGGAAGTGTCTGATAGTTCTCTTTCTC TTCAGGCTGGAAGAGATCTCAGGTACTTGAGTCAATCAATGGGTGCATGC TTCTCAATTGGAACTGTTCTACTATTGGTATGTCTATTCTTCTCTCGAGT GATTTTTTTAGGGAAGAGAAATCCTCTCGTCCTCTGCCTTCTCAGATGCA CAGCCATAATCTCGAGTGATCTTTGTGAGACCGCATTGGGTTTCAGTTTT TAATTTTCTTCTTTGATTAGTGATAACATTGATAAATGATAACTTGAGAA GGAAAAATGTCTGAATTTTTTAATTATGAGGTCCTGAACCATGGCAAATA GGACCACAATCTGGTCTTTACAGTGAACTATCTACCTTCTGGTCACTTGT GAATGCTGTCAGTTCCAAAAATCCAAGTGCTATCTTGAACAGCCTTTTGT TTTCTGTTATTCTTTGTAGTTAAGAGGACTTGTATGTTAATATTCTTGCG ATAATGACGATTCATCTTTTCCTGTTTCTCTCTATTAAAAGCTTGCCCGC GACAAATTTGGTAGCTTGGCAATATGCTGGTGGATACTTGTTTTCTTCCA GTGGGTATGGTCTTTTCTATACATTATGTATTACATTTAATATGTAACAT CTTATGATAGCCCTAATTCGTTTTTTGAACAATGTTCCCATTCCAGAGTC GGTTCGGAAGTGGTCTACAACGGCTTGTTTCTCCAGCTGGCATGCTGTAT AATGAAAATTTCAACCAGCCCGAGTATGCGAAGGTGAAGGCCACATAAGG TGATGCATTATTGGTTGGCGCGAAGTGACAACAAATACATGCGTACAGAC TGCCATCCTGGAAAGATCATGCTGTTTCTGACCATCTGTTGTACTGCATC GTGGTCATAGCTGAGCTGCACATGATGATATTTGAAGCAAAAGTTCAAGG CCTTGTCCAAGGTGGTTAGGAGTGTAGGATTCATCCTCTTGTCAGTATCT TTTGTCCTAGGAACCTGCATCTCATGCATTATTGTTGCTGAGAAGGCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.