Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA031715

[Submit comment/correction]

Sequence	AA031715
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA031715
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACGTCCACACAAAAAACCCAGCGAAAGGGGAAAAGAGAGGAAAAAAGCC CTACGAGTTTCTCTCTCGTCTCCCAAAACCCAACGCTGTCGGCGGCGATG GCGGACTCGGCTGCGGCCGCTGCGGCGGCGCAACCGGCGACAGTGGGGCA AGCAGTGATCCCGCTCGTCAACAGGCTGCAGGACATCATGGCGCGGCTGG ATGGCGACGCCGCCGCCGGCGTGGAGCTGCCACAGGTGGCGGCGATCGGA GGGCAGAGCAGCGGCAAGTCGAGTGTGCTGGAGGCGCTCGTCGGCCGCGA CTTCCTCCCGAGGGGCCCCGAAATCTGCACGCGCCGGCCCCTCGTGCTCC AGCTCGTGCGGCACTCGGCCCCCGAGGAGTGGGGCGAGTTCCTCCACGCC CCCGGCCGCCGATTCGACAATTTCGAGCACATCAAGCGCGAGATCCAGGT CAGTTTCTCTCTGCGATTGCTGTAGCTTTGCTTGTTTGGTGCGTGCAGGA GATATGCTTGCTTTTGCTGGAGGCTTGAAACGAGTGTCTCGGTCTCAGGC GTGTATTCGGAGTGCAGGCTATATGTTTGCTGTAATGCTGGTGCTGGATA CTTAGAAACCGTGCCCCCGTCTTAGTGATTTCTGTACCTTTGCTTGTTTG CTGCTCGTAGTGTGTAAGCAATTTCTGTTTGCCAATTCCACGACTTAAAC AAGGATAGTAATTCGTGTAAGGGTACTACTGTACTAAAATTATACGCAAT TTGCAGTTTGTGTAATTTGTGGATGGAGTAGTGTGCTAACGTAATGTTTT ACCTCTGCGCTAGCATTGGCCGATATCATGGGCTACATTTTAATCAGTCA ATGTTTATCTTGACACCAGTTTATTTTCTGAAAATAACTGTTCCTTAAAC TTCGTAGCACATACTGTGAATCATGCACTTTTAGCATCAGCTATGGACCT TAAGGAGCATATAATTATTCCTGTATGGTGGGAAGATCAGCACCAAGGTC AAAGTTTGAAGGCAGTTTTTGTTCCTTTTTCCAACTCAGGGGACCATTTC GCAAGGTGCAAGTAACCTATAAATATCAGTATGCAGTCCTAGAACACCAG ACTTGATTTGCTTGTTCACTAGCAGTCAGTTACACAATTTACTTACTGAT GCTTGTTAGCTATAGTATATGCTCAAATGCTGAAGTCAATTAGACATTAG CTGATTAACATGTGAGAGAGTCATATAAGATTTAAGTACATTCTTGAAAT TCAGAAATGCTGCCTTTATGGAACACTTAGGAGAGTTTGTCATGTGCTTA CATGCTTATCCTATCTTGGGGGATCTTGCAAGGTTGCACACTTGGTGGTT GGGTACTTCAGCGGTATGTGCTTGATCAGCTATTCAGTGAGCATGTAACC TTCTTCATAGTGCTGTTGAAGTGTTGATGCTCTGCCCCCCATCCTACATC ATCATTAATCTGTTGAGTGTTTACAGTGTGCTTGGCATACATATTGTATT TTGGATTCTGCAGTCTCAATTGAGCAACTTTGACCATTAATATTTGTACA AATATGTAAGTAAAAATTATGAAATATATTATATTGTGAAATTATATTTC ATGACAAATCTGAATGTATGGTTTTTGCCTAACAAGTCCAAGTAGTTTTC TAGCAATTAGTGGTCAGAGGTTTAGAAGTTTGACCAGACACTTTCTAGAA TATCATATATTTTGGAACAAAGGTATTGGTTTATATGCCATCTTATCTGC AACTTGGTATGAACTTATGAAATATGTGACACTGATATTTTTTTTTACTC GTCATATTTGGTTATATTGCACTCTTCCCATTTGTAGCACCTCTCAAATT ACATTTGATATTATGCTATTCACTAATTCAATACCTTCATAATGTTCTCA CGAGATGAAATATTGACTACTTTCAGTCGGAAACTGACAAAGAAGCTGGA GGTAACAAAGGGGTTTCCGAGAAACAGATTCGTCTAAAGATCTTCTCGCC GAATGTCATTGACATCACCTTGGTTGACCTCCCTGGAATAACAAGGGTTC CAGTCGGAGATCAGCCTAGTGATATTGAGTCAAGAATAAGAACAATGATC ATGCAATACATTAAGCATCCAAGCTGCATTATCTTGGCTGTCTCACCCGC AAATGCAGATTTAGCTAATTCTGATGCGCTTCAACTGGCAAGGCTTGGTG ATCCTGATGGTACTTAAGCAACTCTATTAAAGAATTGATTGTGAATTTCC TTGTGGTGGAAAGCAAGTTAAGAAGTGTAAACCTTTAACTGTTTGCTGTA TATATGTGACAGGATCTCGGACAATTGGTGTTATCACAAAGGTATTAATG TGCTTTACACAAACAGCAAAATTCTTAGCTTACTTAATGATCACTAATTA AATCTTTCTTCGATGGCCATAGCTGGACATCATGGACAGGGGCACTGATG CTCGTAACTTTTTACTGGGAAATGTGATTCCCCTCAAGCTTGGTTATGTA GGCATTGTGAATCGCAGCCAAGAGGTATATTCTTAGGCAAAACTATGATC CTAATAATTTTGTCTGTCATTTTGAATTTCCTGTCCCGACTTCTCTTTTC TGTCATCTAGTGCAAGGTTTATGTCGGCAACCACAATAGAACAGTGCATA AGAAAACACATGTACTCTTATATTTCTCAATTTCTTGATTTGTAGTATGC GTTGGTAGTTGATTCTATTGGTTATGTAACTTGAATCTTATCAGTTGATG AAAATACTACTGCCTAAACTTCTAAATTATTTGTTATCACTTCTAACAAT TGGATGATTCCTACAGGACATCAACTTTAACCGAAGCATTAAAGATGCAC TTGCCTTTGAGGAGAAGTTTTTCTCAACTCTACCTGTATGCCCAGAACTT ATATTTTTCTCACAGCAGTACCATCCATTGTGAATTAGGCATATTTTCTT AAAGCTATGGCTGATTGTATTTAGCTCTATTTTTGTTTTGACAGGCTTAT AACGGTCTTTCACAATGCTGTGGTGTTCCTCAATTAGCCAAGAAGTTAAA TATGGTATTGACCTATTGCCGTTAAATATTTATTTTTGTACTTTGCCCTT GTACTCTTTTTTATGTAGGTGGTCTCTCTTTACTTCATTTGTCAATAATA CCCCGAACGAACTTCCAGGAGAAGTATCTCAGACAATAATTTGATCTTAG AATTAATTAGTCCCAGTTTACTGCATTATAGAGGGTCAAAGAATGATTTT TCATGATTAAGCTGAAACCTCAAGTTTTAGGATTTTAGCAAGGAACTGAG AGAGTAATTTAGTGAAAACCAGTGTGGTCAATAAAACTAATACTCTTTGT ATAGCTACTAATGGAAGCCTTGCTGAACAAGTTTGCAACTTCTGCCATAT GTATTAATGCAGTATGTATGGGCACCTTTCATGATGTTTCCACAAATGGT ATTAATATATTTTCTAATGATATTTTATCTGTGCAACTCATTAATGCAAC TCTTGGCTCTTATTTGCAGATTCTACTAAAGCACATTACAGATATGCTTC CAGGTTTGAAATCTCGAATAAATGCTCAGTTGGTAGCAGTTGCAAAGGAA CATGCTGCTTATGGTGATACTGCAGAATCAACGGTAATTACATATAGATA CCTCCATATGTATATACTCCATCTGTTCTCTTTTAGTCTACATCCTAGAA AAAGTCAGACAAACTAGTACTGCATTTTTTAGTACTACTTATATATGTAA ACAGCCAATCTGAGCTACATTGAAAATAATGACATCCAATAGAGAGAGCA GGACCACTTCTTTTTCTGTGGTTTTGTTGACTAAAAGCTACCACCTCCGT TACACAACTGCTAGAAAGGCTTACATTTTGGAATGGAGGTAGTAGAATGT AGATTAATATGGAACAAAAATTTGGTCTAGAATGTAGATTAAAAGAGAAC GTAGGGACTACGTTGTTAATAGTTGCTTTATGATGCAATTGTCTTGTATT GCTGCTATGCATTAACTGCATATGTTTCTAGATTCTAGTTCGTTATATGC ATTGCCAAGATAATCACTCTTATGTCATCCTTTGTCGAACCGCATAATGA CACATCTCATGTGGCTCCCTATTGTGTGTTCTTTTCTATAACCATATATT TACCTGGTCTTCTCTTATTTTGCGTGCATGTTGTTTTGTTTCTAGTGACT TTTCTTACCTCTCAACCCTGCTTTTCTGGTCTTTGATACATGCAGGCTGG TCAGGGAGTTAAACTACTGAACATATTGGGAAAATATTGTGAAGGTAAAG AAGAATAACCTGTTCCATAATTCTATTCGCTGTAAAACCTTATGGAACTA AATTATATTTGTTTACCATTTGTAGAAATATAATCTCTGTTATAGTGATG CAGACAATCCTTTTTAGTCCCATTTAGTAATTATGTCAAAACGCTGAAAA AGTACTGGTATATTTGAATTATCTAAACTGTCTAGAAAACATTTTCTTAT TTCTGTTTATCTTTATGTGACTCTTTGAATTGAATGGCAATTTAGACTCG AGAATAATTACTAAGAACCTCTTACGTGAAGAGATTTTCACTCAGCTTGT CTGGCTTCTTTTCAATCTGCCTGTTTAATTTTATCAAAGCTATGTTTTTC CAATGTTAGTACTATTATTCTATTAAATTTCCTGTTTTCAGCCTTTTCTT CAATGGTGGAGGGCAAAAATAAAGTGTCAACAGATCAGCTTTCTGGTGGA GCAAGAATTCACTACATTTTTCAGTCCATTTTTGTCAAGAGCTTGGAGGT TTGCAAAAAATAACCTTAAATATTTGCATAGCAGACATGTGTCCATCTAA TAACGGTTCACTATGCGTCAATGAAATTTCTAAGTAAAGAGAAAATTGAT CTCAACACTACCAGAAACTGTAGTAGTTTGCAAAAATACCACTCACATTG TCATGCTTCATCTAAATAAAGAGAAATTCAAAGGATCTAGGTTTACATCG TATGGTCATTGATGGGGTACTGAATGGTGCATATTTTAGGAGCACTATGC GAGTTAAAGTGGTTTTAATGCGCACCACGAGAGCAATTATCCCCTAAATA AAAAGATGGAAGATGATACTTTTACTGAAATTTCAAGTCATAAGCTGATC TCCAGTGGTAACTAAACAAATAAAAAGTATATTCACAGCGAACATAAATT TCTATCATTGTACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTCAAATTTGTCTA GATTTAGATGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGGTTCATCTAAATTTT AATAAATCGAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTAGATTAAATCAGC GCTTTGAATTTTATGCAATGGCTTCATTCTTTGGTGCTGATATCCTCTTT TTATTCGCGAATTTGTTGTTACAATTTAATATCCTGTATGCAGTCATTGC CAAGTTCTCACCCACAGAATATCCATGTGATCCACTCCTTCAAGAAGAAT TTTGCTCTCCATAATTGCATTTCTTTTGATATATTTTATGTTCCCTATAT CAACAGGGTGCAGAGAAAAAAATTGTCCTGTCATACACTAGTAAATCTTC TCCTGAACAGTTTAATTTCTGGGCAGAAACAGTTAACCCTGTTTCAGTGT AACATTATCATCTAATGTAGCTGCATGTAGTTACAAACTACATTTTGTAT TCCCATAATTTTAGTAACAGTATGTGTTGTAATTTTCACCTGCTTCATGT TGTTGTTCACATTATTCCTTTTTGCTTTGTTTTGTGACAAATTTCTTAGT TACTTACTCTTATATGCAGGAAGTCGACCCTTGCAAGAACATAAGCGATG AAGATATCCGCACGAGCATACAGAATTCTGGCGGTCCAAAGGGTGCTATG TTTCTGCCAGAGGTTTAATTTTGTCTGGATGATGCAATCCTTCCTTGTCA AATTTTGTTATTTCCTCTCTGCATAAAAATATTTTTTAATTCCAATTCAT GTTTTTACCTAACTCATCCATGCTCAAGTATGTGTTTTCCTGTTAAATTT TAGGTGCCTTTTGAGATTCTTGTACGAAGGCAGATTGGCCGTTTGCTTGA TCCAAGTCTTCAGTGCGCTAAATTTATCTATGATGAGTTAGTCAAAGTAT GTACTCATAACTCTTTTATTTCTTTTGAAAATCTAATAAAGTTGCTTATA AGGAATCCTGAATAATGCAGATCAGCCATGGTTGCTTAACCAGTGAGCTG CAGAAATACCCAATTCTTAAAAGGCGGATGGGTGAATCAGTTAGTAATTT CTTGAGAGATGGTCTTCGACCTGCAGAAACTATGATAACCCATATTATTG AAATGGAGGTAAGTATTTAGTTTTATGGGTTTATATCTGCCAATAGTAGG TAATAATTGGATTACTCTGGCAATGGAGTTTAGTTTTTGGAGCTTCTACT TTCCTCAATCCTGGTTTCCAACTGAAAGTAACCATTAAATGATGGGCTTC TTTCATACTGAAATTTGCTTTGTTGCACTATTGCATATGCTTTGCAAAGA AGTTGGTTTATTAACTGTGTGGCTGCAGCAACCTGTGACCGAGCACTCTG GTTTAAGTGTCCCACTGTACTGGTTTCTCTCCTCTATTGGTCCAAAGCTG TACGATCCTTCTTGAGTGTTCTATAGAAAGTTGGTTATGTCTGCTTTTAT TGGAAAGTTCAGTTTTAAACACCGCTGAGTGTTGACTACATATAACAGTG TATCTTTTTTTCCCTTCTGTTAGTATTCTCTGAAATGAGATCTTCATTTG TCATTAGCAAGGAATAAGTTTAGGTTATTATGATTTAGGAGCTTGAGCCC ATATTTGTTTTTGAATTTTGTGGAATGTGGACTGCTAATTCATAATGGAG TTCCCGATACATGTTAACAAGCCTCTAGGTTTGTTATGCAGTTGTGCATA TAACTTCATTTTAATATTTCTTTTGTGTCTCTCTTCTGGATATAAAAAAG CACTTCTCGACATATCTTTTGTGTCTGTTTTCTTGTATGCAATGATACAA ATCTTTCTACAGATGGATTACATAAATACATCACATTCAAGCTTTGTTGG AGGCAGCAAGGTTGTTGAACTTGCTAAGCACGAAGGTCTACCTTTGAGAG GACCAACTTCACTATCGGCTCATAAGGTACCACTTTTTCCACCTCAGATT TCATGTTGCAGGATCTATTTCCTGAGTAACATAAAGAAGTACGATGGGGG TGAGTGGGCTGTAGATGGGAGTAGGTCAAATCGTATGGTAACTCTGAAAT CAATGTAGATGGAAGTTACTGAATTTATACACAATTCTTCCGTAGCTTTG ATAGTTCTGTGTCAAAATCTTGACAGATCACATACTGTGATCATGCATGT CAAATTCACATCATTAGAAAAAGAGAGATAACATGAATTTTCAGCTTTGT TTATGAGAGGTAAATTATGAATATTCACTATTTAGGTCCTCACAACACAT GATTTTCGTTTTTTTATAAAATGGGATCACTGGTGCCCATGTGCACCAAA TCTCCACTCTGTTTTCCCCATGCAATATATATTGCGAGAAATGTGTACGT CACATGTCAAGTTTCTAGTAAATATTAGCCATCAAATTATATAGGCTATA AATCAATTCGGGACACCAAGTTTGGTGGATTTAGCAAAGAATCAGCATGT GTATTTTAACCAATAATCTAAGTGTAGACTACTATAAGATGGTACTTGAC ATGCATCAACATATATAATTGGTTGCTAAGCTCATTTGATTTTGGTTAGA CTCTGGCAAAAAGTATTACTGCCTTTTTTCCACTTCCTTTATTGCAGGAT GGTATTGCTATAAGTTCTCAGCTGCAGTTAAAATCTTCTATTGAGAACAA TATACAACTCAAATCTGAAAGCGGTCAAAAGTCACGTGCCGTTTTTGCAA GAGATGCTACCAGAGGAGCAACTGCTGAGCAGGTTAGCAGATTTCAAGTG ATATCTTGTTATTGTCAACTTTGGTTTTTAGATGTGTTCTAAGATGGTAT TAACATTTTTATACAACTTTATTTTTTGTCCTGTGTTTTTTGCTGGACAG AGATTTCAGCCTGATACAGATGCAGGTAAACCCATGTAGCTGTGATCTGC ATTTTTTTCCTGCTTTGGGGATTTTGTAATTGTATCTTCTGCAAGAACAA TGTCCTTGGTTCCACTTAGTTGACTGCTTATTTTATTCCACTTCAGGCAT GGCATTCTTATTCTTTATTAGGGCATAATGATTCTTTTCGTATGATACTG CATTGAGTCATGCTTTCCTGACAGCTCATTTCATTTCATATTTTAACCAA TTACATATTATATACTATAAAGTATGATCATTTGTATCCTATGGTGAGTA ATCTGTCTAAGAGGTAGTTCCCGTTTCCTGTCTGGTTACTGGTATGGCTG GCATACAGGTATCGTGGATCAGCCTCCAGCTGAAACACATGTCCTGAACT TTAAAGACCTGGGTCAGGAACGCAGGATAACTAAGGTGCTGGTTGATCTA GGTCATCCTTACACAGGCTTCTCCAGGATGCAACAAAATAATATTCAGGC AGCTCCCAGGAAGCTCCAGGCCAGGCGTTGAGCAGCCAGGACACCGATCA AACTTGGACATATATGGGATTTGCTAGTAGCCATGCATAGATGCACCACC GATATTCATACTACCATCTTTTTCTTTTCGTTTAGAAGAAAATAGCCACA TTTGATGTCGAGAGGTGGAATTTTGCCCAACTCCTACATGGTTTGCCCCA TTGTGGTTTAACACGAATTTTACTAGTCACTGGTGGTGCCTGGCTGTTAT AACCTGCCCTTAACCCTAGCTGATCTGACAGGTTAATGCTTGCAATTTGA ATCCTTCTTGGCACAAATTCATACCAAACAAAGATAAAAAGAAAATCTTC TGATGATCAAGTTTTGAACTGTAGTATGACATTCCAAATTTAGTCACTTC TATATGATGTGAATACCGTTCGGTTGGGAACTTTGATCCGTCCTTTTTGC TAAGTGATGAGATTGGATTTCCAATATAACTACCTGATTTCTGACATACT ACCTCCATCCTCTTTTACTTGCCATTTCAGATATTGACACAGAGTATGTT TGGGTCCAAGGCAAGGAAAATCCTAGCCTTGCCAGGCGAGGTTAGTCATT TTGTAAAAATATATAGATTTTGTTGGCAATGTGGCCTGCAACCATGCTAG CAAACTCTTGATGGCTGAGGAAAGGTGAATCAAGTCTCCTGCATGGGCAA ACGAGCGGACCATGGAAATAATATTGGATTAGTGGAGTAATGGTCATCCA GATAGTTTCTTGTCTTGAACACCATCCATTAGGGCATGCGTTAGAGCGTC ACTGCTGTGGAGTCATCGACCACCCATTTTGACGTACTTAAGGAGTACTC TAGGGGCACATCCTCATACATATTTTAATCTTTGGCCCAAAAAATCCTAA CTTGCCTCAGTGTTTAGTAACTGCAATACATTATATTGAAGTATTTAATA CCTTGAAATTATAATATGTTAAATGGTTCTGTCCAAGTTTTCATATGTAA GGAGATAATATTATTGGGCTATCATCTGACATCTGGTATAAAAAATGTGA TTTGCAGTTACTAAATAGCTTACATAGCTTATACTTCTATGACACACAGG TGGAGGCCAGAAGGGTAACTCTCTGGATGGTGGGAGTTTGTCAAGCATGT CAGGTCCGCGAGTTCACAGCCTAAATAGCTTATACTCTATGATTCGGTTA AGAGAGGTAAAATTTGCTATCAGAAGTGAGCTTTGGAATTTGGAATTCCT CCAGTTTTAATATCTTATCTCCAATTGTCGTCCTTATTTGTACTAGCCAC CCATCACCTTGAAGCCATCAGAAAACAAGACTGACCAGGACAGAACAGAG ATAGCAATCGTGAAGCTATTGATCAAATCTTACTATGACATTGTCAGAAA GAGTATTGAGGATGCAGTTCCGAAAGCTATAATGCACTTTCTGGTACGTT TATCTTCTACAAGTGGTGGTCCCTGTAAAGGGTACCATATTGACTATCTA CTTATTGGTGCATTTTCATTATATTTATACTTGACTTGGGACTCTCTTAT TTGTTATTCTTGGCTCCAGTTGTCAGAGAGATTTAAAAATTCATACCTCC AATGTTGAAGGTTGAATTATCAATGAAAACTGGGATGTATCAATTACTTG TGGGTGTGATGATATATAATTCCTGCTGTAGATGTATATCCCATGTAATA TTGCTAGTATATCTGAAACATGGACATTTTAGCGACGGCCTTCAACATCT TCTCATGATAGAACTTACCATTTCCTTCTGTTCCTAGTTAATATAGTCTT GCATGGACTAAAATATTGTTGCTAAAAGGTTTCAGGCAACACTAGTCATT GTGCCAGCCATGTAAAATTGCTTGTTAGTCAATGTTGTAGTTGGAATGTA CTTCCTCTGTTTCATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAAGAAGTGTATCTAG ACTTCTTTTAGTGTGTAGGTTCGGAGTGACTAGGAGTGAACCTACACACC AAAAGAGGTCTAGATACTCTCATTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTA TGAAACAGAGGGAGTAACTTGCGATGTAGTTGTTGTATTGGTGCTGGTGC TTGACTGATCTTTTTTACTTAGGTGAACCACACAAAGCGGGAGCTCCATA ACGTTTTAATTCGGAAACTGTACAGGTGAGTTGCATTTGGTTTTTGTACT TGCTAGTGAGCAGCTCAATCTTACAATTCAGATTATCATCTGAAAGAACT ATTCTAAAATGATCATCTGATGTGTAGAGAGAACCTACTTGATGAAATGC TGAGGGAAACAGATGAAGTACTTATCAGACGACAGCGTATTCAAGAAACA CTCCAAGTTCTTGAACAGGCACATAGGGTATTACTTTTCTCCTAAATGTC CTTTTCAACTTATGTGTCCAGCATCCTTTTTGACATCTGTATTTTTTCAG ACTCTCGAAGAGTTTCCCCTTGAAGCTGAAAAGGTCGAGAGGGGCTACAG CCTAGCTGAATATACAACCGGCCTGCCGAAACTCGCTGGGCTTGGCAACC GCAGCCCCAGCTTGTACAGTTAAAAGATGCATCTCATGTAGATGAACATG CGCCTGTGGCATCTTTAGTCATACCCAGATGCCAATAAAGGGCACCTCTC CACTTTATTTTGATCCAATCCTTTTTCGAGCATTGCCCTTGAGTTTTGAC ATGTAAATCCAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.