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GrainGenes Sequence Report: AA003162

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Sequence
AA003162
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA003162
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCTCCTGGGCGTCACCCTCCTCGTCCTAATCCTCACCGTGCTCCGCGT
CCGTGACCCCAGCCTCCTTCACCGGCATCCTTCTCCTTCGTCTTCGGTCT
CCTTCTCCTTCGATGTCGACGGATCGAGCACCGCCACTCAAAGATCTTGG
GGCACCGCAGGTATCTTGCCCAAAAAATCTGATCTTGGAGCACTGCTGCT
CACAGATCTTGGGGGACCACCGAAGACTGAGCGAGGTCGCGTGGGGCGGC
CAGGCGGCGGCGTAGGGCGCATCGTGAGTGGAGCCAGACAGTGGCGTCGG
GGGAGGGGGCCAAAGCAGCGACGTGTGGGTAGCAAGGCGGCGCTGCGGAC
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GTTCACACACATGAGGTTGCATCCCATAGTTATACTGAATTTAAGCATTC
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ATTGGGAGCTATCTACCTGCAGTTCATATTTTATTTTTTTGCATCATGAC
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CTTCGTTCCAATTCAGAGTTGTGGCCGGAGTGTGCCGCTGGTAGGTCAAG
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AGAAGTTACTATTTCCTAAATATGGGTATTGGCTTATCAGGTCTATAGGC
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GCTAAAACTAGAAAAATAGCAGTCCTCATGAAAGACCTTTTTTCTTCTTA
TGCACCAGTGGTATTCTTTGCACTTGCTAAATGAATTTGTATCTCTGCAA
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GATAATACCCAAACTTGACTTGAGCCTCTTTCCCATCTGGTAAAGCTCCG
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GATTCATCCTGCAGGATAATACTTAATATCACTATGTTTTACTTTTCTCG
TTGGTGCTTAGGCTTCTCCTGCCAGGCCTAAGAATGTGTGACAATTTTTA
TTAACACTGCAGTAGCATTTTCAGTGTTCAAAGAGACTGAATTTGTCCAC
TGCTATTTGGTGCTTCACATACAGTATAAGAGCCTACGACTCCCCTATCT
TTACTTCAGATAACACTGCTATTGGAATGGAGGTGATACAGGTTAATTAG
TTGCTGACGGATGGCAAGACGAGCTTATTTTGATACTTCTCTCATGCTTT
CTCTGCACGTGTTGCCATGTGTGTTGGTTCTTGCCTGACTGAATATATTT
GGAATTTTGGGAATATTGATAATGCTGCAGTAGCTTTTCCTTGTACTATG
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TGTTGTAGACTATCAAATGTTATCTTGAATGTTGTAGACCTGTTTCTTTA
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TAGAAAATTCCATTGTTACTTGGTGGTTGTATTTATTTTTTTACCTTTTG
GGAGATAGAAGAAAGTCGTTCTACTTTCTGCAGTTAGTTTACATATAAAT
ACTACTCTATGGACATGGGGCGTGGAAAGTTTGAATTTGTATTGCATAGT
ACTGTAGTAAGTAGCAACAAAAAGTACAATAGTCATGCACTCACGGATTT
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CATATGAGTTTGATTAAGGTTATACGGGACAATAATGCAAAATTTACTAG
GATGAACTCAAAGAGCCAATTAGAAAATCAGAAATTTACCAGGATTTTCC
ATTTCTAGGAAATTACCGCTCATTGGTATTTCTATGAGGTCTTCGCATGA
AATTGCGCCCTTTAAAACTCTTGGTCTTCACATGATTTTTTTATTTTCCA
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TTGTGCCCTTTAAAACTCTTGCTCTTCACATGATTTTTTTGTAAACAGAG
AAACTCCTTTAAAGCGGACGTATGGACAATGTTGGCCAGAGGGCGACGCG
GGGGCCCATATGGCAGCACCACGGCGCACCAGCCAACAAAGGATGCCACA
TCCACCAGTCCGACGACCCCGAGTGGGCAAGCAGTGAGAAGCGGCTGCTA
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CCCTTCAAAATCTCAACCTCAGCATGTTCTTTTGGCCAATTTCAGTGCAA
TATTTCTATATTTTTCCTCTTTCAGAGTAGTATATGCTTAGCGAAATATA
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TAACATACTGTCCATTGTTACCTTCCAGGTATACGCGGGGTCCATTCCGC
CCAGCCTCCGCACAGTATCTACCAAGATCCATTTCCATCGTATTCGCAAC
TGTGATTTGGCAACGGAAAAGGTCTGAGTGAGCTAAGTTTTTCTAGGAGC
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ATGGACAATGTTGGCCAGAGGGCGACGCGAGGCCCCATATGGCAGCACCA
CGGCGCACCGGCCAGCAAAGGATGCCACATCCACCAGTCCGACGACCCCG
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CCGCCCGATACCACATTTAGATGTGTGCCTGAGACAAAAAAAAGGAGATA
AGCTAACAATTACAAGTCAGTAGGTGTGAATTCATTTGAAACTGAACTTG
CTATAGAGATTGATATACCCTGCAATACCCTCTCCGCATCCATAGGTTAG
CAAATATAAGCCCCAAGGTTGTGGGAGAACCTATGCCAATCGTGTGTTAC
CCATGGCATTATACAGGGGCGGAGCCGAGGGGGGGCTAGCAGGGGCAAGA
CCCCCCCCCCCCCCCCCCTAACCATTGACCCCCCTCAATACATACGTACA
AATTTTAGTACTAAACTAATGGCTTTATAGGCTTAATTAGCAAGCATTAA
GCCTAAATTTAATTGATTAGTCATACTGCTCTCTACCGAAGGCGAAGACC
AAAGGTAGCCCATGGTTTTTACGTATTAGTCAACTGTAGTAACCTGTCTC
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ACTTTGAACCTTTGTGACTTTTTTGTCTTATTAGAGAAATGATGGTTTTT
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ATATTTTCTTAGCAGGTAGACGCGCTTTGCTTGAATTTGTCTTAGGTATA
TTTCGATTCGCAGGATTTGTTTTCCTCGATTCCTGATGGAATTTATATTT
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GGAATTTGTTGTATGACATGTTGGGTTAGCACACATTTCCCTATCGTGGA
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TTATATGCTTTGTTTATTGGCCTTTCCTTTATATTGTAGGCGGCTGCATG
TGTTATGTCCATAGACCATAGTGTAACTCGGTTTTATCTTGCTTATAATT
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TTGGATTACTTTGCTGGCTATCTGCTAAAAGTAATGTGTAAATGGCGTAA
CATCTCATCGGGTTACTAATAAGCTCCTTTTCAGGTGTAAACTAATAAGC
ATTTGTGTCTAGGGTCGCAGCTATAGTAGCATGTAATTATATGGTCCTTC
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AGAGGTGATTATGTTTGCCTCATAGGTCCTGTATCGACGTTTTCACTTCA
TATTGGGCATGAAGATTTCGAAAATTATCTAGGCATAGGTTTCTAAGATA
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TCTCCTCCCCCTCACCGCCGCCAGAAGGGCATGGCCGGGCGAAGCTCGGT
CGAGGCCGGCGGCAGCAGCGTCTCCTCGCCCTCTCGCGTGTGGGGCTGGC
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GGCGCGTCGGCGCACGGGCTAGTCCTGCGGCGGCGGCACAACGTACGATG
GGGCGGCGGGGGTGCGTCTCGGAGGTGGCGGCAAGGGTGCTCTCCAGGCG
GCGAGGGCTGGGCAGCGGGGGCGCCATGGTGCGATGGGTCCTGCTCGGCG
GACGCGGCAGGAGGGTCGGGGGCTCGTCATCCGGGGCCGCGGTAGTGGAG
CGAGGCGCCGGCAGGAGCAGGCAGGGTGGCGCACCGCGGGCTTGCGTCCT
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GCGGCAGAGACTTTATGGGCCCTTTTTGGGCCCGGCCGGGCCCGAGACCT
AGTGTGTCTCTGCTGCCGCATCTGGACGGCAACCGCCATTGGTGGTGGAG
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GAGCCCGGCTCGGTGGACGCCGGGGCGGCGGCCTCGAAAGGTGGATGGCT
TCGACTTCCCTCCGGCGGCGGAGGCTCTAGGAGGCGACGCGAGATCCCTA
GACCGGTGGTGGTTCGGCAGGCCCGGGGGAGCTCGGTGGCGACGGTGTTG
TTGCTTGGCGGCCGGGATTTGCCGTAGAGGCGGGTCCCCTGGTGGGAGGA
GGAGTAGGGCCTAGGGCGGCGGTTGGCGTGCTCGGTGGCACCCCTGATGC
AATGCGGCGGTAGGACTTCACGAGCCTCCGCGGGCTCGGCCGGGCCGGTG
GGCCTGGTTTGTCTTGCGGCTACATCCGGTCGGCTACCACCTGTTGGTGG
TGGAGGTAGTTCCCTCCCGCGTGTTATTGACAGGCCGACCCTCGCCGAAG
TCCCTGCTATCTCGACCTACCGGCTTCGCTCTGTGGCGCTCGGTGTGACG
GCGGTGGCGACCTCAAGACCAGGATGGCGCATGCTCGTGGGTGACGTGAG
TGGTGGAGCTCTACAAAGTGCTCAGGCGGGTGGTTCTGGAGGGGTCGGGA
GAAATCCTTGTCTGTTGTCACTGGCACGGTGACGTCCGAGGGTGTAACCT
TCCTTCTTGAAGGGTGTTGGGGCCCCCCTCCCCTACCCCCGCTGCGTACC
GGGGGAAACCCTAGGTCTCGGCCGGACAGCAGTGTCGTCATCGTCACTCC
CCTTCTTGGAGGTGCTGTTTTGATACGCAGGCGCTTTGGATTGCGGGATG
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TCGGCACACCGCCGTTCGCGGCTTTTTTCTTCTTCTTTCTTTTCGTGTTG
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CGATGTGCTGGATATGCTGTCTGGCCCAGCAGCGGTCTCACCTGTGTGCT
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TAAATTAAAACACAATTATAGTCGGGGTCCTAATTAAAGTTGATCATGAA
AAGATCGATAGATCAGCTTTGGCCCTGATTAGATCGGAAACCTCCGCTGT
GATCAGCCGCCGTCTGCTGTGCGCACGTTCTATCTTGACAGTCCTTGTGC
TGTCAGCGGGTCAGTTCTTGCCATATATTACCGCTAGACTAGTACAATGC
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AGCAATACTTATCAAGTGCTCACTTACTTTTACGGCCGGCAGCAACGGCA
CGGGCCGGCGGCGACGACAGCGGTCACAACCAGAATACGCTGACGAATTA
CAGCAGCCACCGATGGACGCTGTGGTAGTTGGTCTCCCTCCAGGAGGAGC
GATGGTTAGAAGCGTATGCGCACGCCATGAGGTTTCTGGTCTGATCCATC
GTCCTTTCATGACCAGCTCTAATTAGGATCCCTGCTATAATTGTGTTTTA
ATTTAAGATCCCTATTAGGTACTTTACCAATGTACAATCAACTTTGGGTA
GATGATCCAAGGTAGATGAACTTTTGGGTAAATAACTAATTTTCCCTTAT
TTATAAAGCGGGACGAAAGCCTGATTCGAGAGAGGGCTGGAGAATAGTTG
TGTCTGACAATGAGAAGCTAGCTGGTGGTTAGGTGATGCTCCACAGGAGG
GAAGTGCAGTGTGTGTATGAGGGAAAGGAGGATTTCCATGCCTAATAAAT
ATCATGTTACTATACCTGAACTGTTTCTGTAGGTATAATAAACACATGTG
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GGTCTGTTTGTAAAACATCCATGCTTATGTCCTTTATGTAGCATGTCTCA
GTTGGACATAGTTGTCGAGGTTCTTTAATTCAAATGCACAAGTCAATTCT
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TCTGACCAAGTATCTAGGCTAGGCCGCTTATCACTCTATGTTGGTGTTCT
CGTAGTGCCACTGTGCTAGCGCCTCTGTTTTGCCCTGGGTACACCGTGCA
CTGCTATACATATACTACCAATAGTAACTGGTGATTTTTCCTGATAGATC
AAATTCTGCAAGTCTTAGTTTCTTCAGATTACAATATACCAGCGCTATTT
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ATAAGGTGGGGTGAATTAATTTACTAGGGAGAGTTCCATTGTGTTGCGTC
CCTGTAGTCTTAGTCTCTTTTTTATTGCTGAGTATTTTCAGTTGTTTCTC
TTAAAAACCAGCATGTTGTAATGGTTTTAATTTTTTGATCTTTTCACTGC
TTGCCATATGCTTCTCTGTTTACTTGGTTCCTGTTATGAGGTCTACTCAC
AGGGCCCAGCTGAAGAACTTATCTTATCTTAGTATCACTCGCTGCCTCGA
TATCCGCTGAGACTCAGCGTTCTCCTTTAGTACATTGTCGAGCTAGCGTG
AGGAGGTTGTTAGATGTATATATTTGTATATTGTAGTTTCCCCATATGTT
AGGGGGCTTCCTGCATATTTACACCTATATCTGTATTATATATTGTGGCC
TTTGGCCTCCAGAGGAATACATATTGCATATTCCTGACATGGTATCAGAG
CTAGGTTAGAGCGTTTCTCTGCAACATCGTCACAGCCGCCATCGTCCCTG
TTGTCGTTTTTTTCCGACGTCGCCGCCGCCGGTCGCCGCTGTCTCGGGCC
ATCTCTCCGGCCGCCTCCTCCCGTCATCTGCCTGTCCCGCTCCGTCTGCT
GGTATCCCGATCGGATCTGGGCGAGATCTGGTCGCATCCCAATCGGATCG
GATCTGGGCGATCTGGAGACTTCAGCTTCTGCCTCGAGCAAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.