Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039131

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039131
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039131
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCTCCTTCCTGTACGAATCTAAACAACAACCGGTCTGCCGTGAACGGGAA CGGGATGGGTCGGAGTCTCGATCACGGGCAATGTCCCGCCGAGCTTCTGC TGCACCTCCGGCGGCTACCTGCTTTCCTGAAGCACCACGGCCTCCATCAC ACCGCCCACACGTACGTGCGATGCGTACGCGCTCTGCAATTTCGCGCTCG ATTTTCCTTGTTAGTTCTCGGTTCGCGATTCAGTTCAGTGTTCCGACTGA TTCCAACTCAGGCTGGAGATGGAGGCCGGAGTATTCTTCGAGGCGGCGCA CCTGCTGGAGCTGGCGAGTCAAGGACGGTGGGCTCCCGCGCACCGCTACC TGCGCTGCTTCTCGGCCCTTTGGGATGACGAGGATGGCGGCGGGGGCGCG ACCCAGTACACCGCCCTCCTCGACTGCCTCGCCCACAACTCCGCCCTCGC TTGGTTCGCCTGCCGCGGCGACGAAGGCGGCCGCGCCGCTTCCTTGCTTA GCCCTCCCTACCACGCCCTCCGCGAGTCCTACCCCAACATGGCCGAACGC CAGGCCATGTACTGCTCCATGGCCTCCAGACAAGCCAGGTACACGACGCC GATCCCAGATCGATCTCTGTTCGATCTCGCCGGTTTAAACAGATGGTTAG GTTTGTGCTTTGCTAATTACAAGGAATCCGTGGACTGGAATGACATAAAA TTCAGGACCTTAGAGCGGATGAAAGAGTTGATCTGTCTGCGTCCCAACCT GGAACTACGCCTGCCGTCGAACCGATTGCCGCGACACATGCCCATCATGC CTCAGGACACAATTCCTCTCGGGTACGGATTTTACAGCTTAATTGCGAGC TCTCACCCTACTCAAGAACAGTATCGCCTTGATCTCTCTTGCACTTTGAT CTCAACAATTATGTCTTGCTAGCTTCCGGGGTTGTCGGAGGCATCGAAGG AAGAGAGTAGGCCTTAAAGCAGCGCGTGACCTCGCGTATTTCATTACTAG CAAAATGCCCGCGCGTTGCTGCGAAAGAGCAAGATTCTTGATTTTATAGG ATCTACTACATAAACATTAGTGTAGTGTTTGAAAAGATATTTTGCATGTG CAAAAAAAAAACACCATCATAAATAAAATAAATATTTCAAACAGGACGTA CATGCATTGCGCAGCTCTATTTCTCACATACGAGCTATAGCTCAATGGCG CACGCCGTGCAAAGCACAGTTCGGCGCAGAGACCATAGCCCCCCCCCCCC CCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTCACGCCTGAGATGGGCGTTTTGATCCAAG GACAGAAGCGTTGATTCATGGTCAGGTCCTCCTTCCACCAAACTCCTTCC TTTCCTGAGTTGCGACACAACCTCTAGGCGCTCCTTTCCTTCTTTTCTCT TCTCTCAGGAGAGAATCCCTCATTCCTTTAACCCATTTAATTTCAGATCC TTGGATCATGCACATATATGCCTAGCAGGCCGCCCACAGTTTTTTCCATA CAGTTGACACAGTTATCATATATTCAATGCGGTTGACTTGGCTTGCTTAT ATCAAAGCAAATAGAAAACGAATATAAGCTGGAGAGACTCACTCTAAAGA GACGAGGTGGTACTATTGAAGACAAAATATACTCATCTGTACGAGGCGGT ACAACCTTCAGGCGCTCATTCTTTTCTCCAGGCAATCTTTGTAGTTTGGA GGCATCGATTTCTTGAGTTAAAGCCCACCTAATTTGTCCAGCTAAAGGCC CAGCTAGAGCCTAATTTTCCCAGCCGGCAAGCCTCGTTGCTCATAGGTGG TAGTTACTTTAATAAATCCAGAACACCAGGGGTAAATTCGTCCAAAAAAG TGTTGGACCGGAAAAAACACTTCGTCCTTTATTATTAGGTATAGATACAT AAAAGGTATTAGTACATGATACTTGTCTTTGTACCCCCACTTGTGCGCAT ACACATAATTACCTATTCTTTTTATTTTGATAATGTCGGGTATTTTCAGC ATTTACACAAACACTTTTGCTTCGGTTCCCCCCCTCCTTCCTCCTTTTCA AACTTTGACAAACAAAAACTCATACCAATTGTTTTCAGGACCGTACGAAC CCACCCGAAATTCATATGGTCCTCTTAGACGTATACTCCCCGTACACGAA TACTCATGTGCCTGCAGAAACGAAAATCGTAAGTTATATAACATCAACAA CAAAAAAAATTAAATATGACATGCAAAGACGTAGATCGCGATAATAAGAG GTGGGATCAGCCGTCCAGGACATGGATTATACTCACTTCGACCGAGCACA CATATACGGAGATATACGTGGCCTCGATATGGGTTTCGACGGGTCAAAGA AATAAAGTGGCCCATGAAACTTAAGTTTAGGGAAGGGGAACCAAAGCACA CCTCTTGTTTATCCACAACCCAGTCCACGTAGTTAATTTGGTGCCAATCT GACACCAATTCTTTCTAATCTTTACTTATTATAAATTCGAGTTGGTGGCT TATTTTGTGGTCAAACATTGGGAGGATCTGAACCTTTAAACACGACCATC AAACATTGAGAGAATCATAGCCCTTGGATCCTACTGCCCTTACCATGTAG TAGATAGCCGCTCCTTCTTTTCCTCAACGAACTAAACAGGAAGACAATCA CGATTGATTTTGATCCTAATTTCTTGTTCGCTAGAATCAGAGCGTTTTCA TTCCATGTGATTGTTAATTTCGTTCGTCGTAGCTGTCGTTAAGCTTTGGT AGACTCGATCAACTCGGCGGGCCATTTAGTTTTCGTGGTATGACAAAACA TGGGATCGAACTTAGACCTGCGCAAGGGGAGCACATCGGTGTGGTGGCAC GACCTCATCGGCGTCACCCGAACGGGCTCCGGCAAAACCACCGTCTTCAT GCTCCGCATGCTGTCCTATGTCGCCCCTATATGGTCGCGTGTCAGTACGT CCGTGACCCCATATGGCCATATCACATTTCCCCAGTAGTTCTGCTGCTGA TCGATCCGTGACATGCGCGTTACAAGTACAACACCGTAGCGCAACAGGTC AGATGATCTCCTGAACCTAACTGCAGTTGTGAGATGCGTTCCAGTAAGCT TCCCTATGGCAAATAGTTTTCTTTTCTTCTTAGATTGCAAAATTGCTTTG CCTTCTTGTGGCAAAATGTTGAATGGAGGAATCCGTTAATAAGTCCTTGG CCCCTGAAATCTGCACAGAATAGATGTTCATGATCCTAATTTTACTTGAG TAAAATCATACTATGGCTTGGGCCGGATGCCATGCACAACAGTACAAATG TGTTGTCTAATAGACTATATACCTAAGGAATAATGTTGAAAATACTTCTA AGAAATGGTTGGGTGAAGATAAGCGACATATACACTGATTTTTTTCATGC TTTGCAAGTTTTTGACGCAACCGCCAAAAATGGCATGCCATTATCAACGG AAGAGGAAAGCGGAACTAATTCTTAACTGTAGTTGTATCAAGAAGGACGT TCGCCGTGTCAAGAAAAACCTGATTTCCAATGCTGAGAATCTAATGACAT AAAAAATATTCAATACAAATCAACCTGTATATAGTTTCTCATTAATGATG TGTTGAGAAAAAAACCTGATTTCCAATGTCGCGAGTCTCACGACGCGCGG TCATATTTATTTGAAATAGTAATATCTTTGGCACAGAAATTATGGTTTAT TACCTTGCATTTCTGGTTAAGGCAACAAATTATGGAATCCCACAAAATGC AAGGAGGAGCTATTTCGTATCACACGATCTGATGTTTAGAGCAAAGTTTG TTTACTTGATATTCTGTAGCAACGCACGGGTACTATGCTAATAGTATACA ATGTTTCAGTTGCTGCATCTAATGTAGTACTGCCCGTAATCTATCTCATG CGACCACTGGCAGGCCCAGACAGCCCACAATTGTTTTTTGAAACAAGGCA CAAGATTTTCTATTTTTATTGATTAATAAGCTTAGATTAGATGTCATAGA ATGAGCCTAGGCTATTACAAGGAACATACTCTCCCGACATTGTGCTACTC AAGAATTTAGCTCCTGGCAAGCCTCCAAGCTTTCCTCTCCTCTTTAGCCT TCATGATGATGGAAAACGCTGTGAATGCATGATTCCGAAAGATTATTGCA TTGCATTCCTGTCACACTTTCCATAAAATTAAGCATAGCCACAGAAGCCA AAGTCTTCCTCTTGTCTCTATTTTGTAAGGTGATTTGCACCCACAAATCT TGAACTGTAGCTTCATTTGCCCATTGAGCCGATTGTATCTCTTGTAGTCC ACACCAAGCAAGCATGGCCGTCCAAATACGAGTTGTGAAGTGGCATTTGA AGAGAAGATGCGTCTCTTGGATTCCTAAACTTGGTTATAAGAGGGTAATT GCCACAATTATTTCAACCGTGGTGTTGTAGCAGCCAAATCCACCGCCCAA ATCCTATTTTGCAAAGCAAGCCACGGGAAGAATTTCCATTTTGGTGCAGC CCAAGGTTTCCACACCATAGCATTTGACATGTCTTAGATTTTTCCAGATG ACAATAAATTACATGATATTCAAATGTAAAACAAAAATGTATTCTTGGTG GATATTAGCTCTGTTCCATAATATAGTATGTCTTGGTAGGCTTTTTTAGC CTACAAAAATATATTTTGGAAAGGAGGTAGTAAGTAACAGTTAGGAATTT TTGATCCACCACACAAGTATTCTAGCAACTTGAAGTAGACAAGTGGTAGT ATATGTACATTTACAATGGGCATAAAAAAGGATATCAAAAGTTTAATACT TGCTCTCCCTTACGTACTTGGGCTGGACCCTGGCCTCAGCCTGTCTAGTC ACCTTAGCGAAGATACATAATTATCACCTGCTGTATGATGCTAGTCTGCT TATTTGGCATCCCTATTCACATATTGACTAGTCATACAAAAATCAAACAC CCAGTCAACATATTTACTGATCATAAACATGAAGTGGAGTTAATTTCTGA CACCGTGACTTTAATTGCTGCCAAATGTGGTTTGTGCCATTTTAAGAGAA AAATGATGCCATGTTTATTTTGTCACTCTCAATGAAAGACTAAGATGCAT GTTGCTTCCTTTCTACACCATCGTTTCTCTGTAATTGGAACGTGAGATAG CTAATGAATTATGTGTTATAGGTGCTTCTTCAGAAGCTGGAACTCCCATC ATGTTAGATGAAGGAATTGGCTTTGATTGGAACAAAGGTTTGGACATATA CAGCTATTGTTTACTTGCTTACAACTTCAGTTTATTCATAAATTTCTCAT GAATCATCTCCAGGTTTTACAGTTAGTGTCAATGTACTGCAGATATCTCG TGCATATTACTAGGAATGCTTAAAATTTCCGAGGGAAATTATTAGCAAGG ATATGTATAATAAACTTTGTGGACACATTTTTTCTCCCAAATAATACTAT ACACACGGATAGGTACCAAGATGCGAAGAGCAAAAGTAAATCTTAAATCA TCGAATATTGACAAGCATAATACTTCCCAGACCATATTATCACTGAATCA GATTTTTTCCTGTGGAGCCCATAAAAGAGATATTTCTTAAAAAAATTCAT AGACACATTGGGCACACATGAATTAATGTATGTGTGGATATTTTATCAAA GAAAAATGTATCGAAGCATGCAATTTTTGATTTTTTGAGAATTTCGAGCT CCAGGTGATGAGCCAGTAGGGCAAATGTCTGCGGATGCGGAAGTCTATGA TTGTTCATTCAGTTTGACCAATACTTCATTCTTGATGGTAACACTTGTTT AAGAACTAAGAAGATTTTATAAGACTATAATCTGTCTAGTTAAATAGTGT GGGTATTCTGTTTGTGGGTCAATTTTAACATATATATATATGCACATTTT CTGAACATATATCCAGTTGCTATCTTGCTCGTACAGAACATTTCAGGTTG TTTTGATTTTCGACTTACGGTATACTAGGATTCTGGTACTTAATTGCTGA TTACTTGTGCTCTTTTTCATGATATGTTTTGTCCCACATGCTATGGGAAG TGTGGGAAAGAGCTTTTTTTCTTTCAATACTAGCGATTACATAACAGTTT AATAACGTACGTTGCACTTTCCTGATAATATGCTAACAACAAATAGTTTG AAAGATTGAGCAGGCATACTTCCACAATTCTGATTAGGTCCCCTTTAGAG AACTCTTAAGAGTATAGATCAGCCCAGGACCAAATAGTCAGTTTGAGTCA GGGGCCATCTGTAATGACTGTTATTTGGCATTTGTGGCGCATCTTCTTCA TTTCTTTTAGTCCCTGGTCTCCAGAAGTGGATATTAAATTGTTTTTGTTT TCTGGCAGCAATGGGATTGGGAGGAAAATGATTTCAGCTGATGATGAAAT AGAAAGGAAGGAATGCAGGATCACAGTTGGATCTGAGCCTTTGAATTTTT GAAAGACTGCGCCTAGCAATCTATAGCATGTAGAGTGTGATGCGAGTACA CATTTTAGTACTAGTTGCTTCTGTCAATGTATCGTCTCTGGTGAGGCTTT GGATGATACCTGATCTGTCGATTGTACTGTTATTATATAAAAAGTAAGGT GG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.