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GrainGenes Sequence Report: AA038795

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Sequence
AA038795
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038795
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGGGAGAGGAGGAGGTACTGTTCCTTCTCTAGCCATGGCATCTCGCG
GCCGCTACCGCTGCTCTCCTTCCTCTTTTTCTCGTGCCTTCATGTTTCCA
TAGTCGCCGCCGCCGGAAGCGGCAAGCTACTCCTTCTAAACAGCACACAT
GAATCCATCCTGAGGGATCTCTTGCGCGTGGAGCGCATATTGGGGTGGAA
CACAACCGCCTCGAATCCATGCCTGTGGAGTGGAATCACTTGCTCTCCTT
CCGATTCCAATTCGTCCTCCGTGGTGACCGGCATCACCTTGCCCGGCTAT
GGCATTTCCAACTCTTCCATCTTCGCCTCGATATGCGCTCTTGGCACCTT
ACTCTCCCTTGATCTCTCGAAAAACTCCCTCGCCGATTTGGGGGATCGAT
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TGCCACCCCTCCCTCTCGGCCTCTCCTCTCTCACCTAGCAGGCCACCTGT
CTACCCCTCTCTCTCTCTCTCCACCCCAGCCCTAAAACAAACCCTAACCG
AGCCTAGCTCCCACCCTAGCCCGAGCCTCTCCTCTCCCCTCTTTTTCTCT
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CCCCACGGCACCCCCTCTCCCTCCCGTCCTTATCTACTCCCTCTCCCTCG
CCTCTGTCTCTCCCAGATCCGCCAGGGCCTTGCCCTCCCCTCTCCTTCCT
CTCCACCATCGTCTACCCCCAACGCCGGCCACCATCGGTGCCCACCACCG
AGCCCTCGAACCAGCAGGCAGGCGTGGCGTGGAGGTTGTCGAGGGAGCCG
AGGAAGACCCGCTGCGTCACCCCGTACACGCAAGCGAGAAGGAGAAGCCC
CAGGAGCCCCAGAACCAGCACGCCCCGACGAAACCCTAGCTTCGCTCGGC
CCCTGCCTCGTCGATGATCGGCGCCCCCCCCAGCCCGAACCACCTCCACC
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ATCACCGTCTAGCGCCGCCGTTCCTTTCGTCGAGCGCCGTCAGTGCGTCG
GGTTCGTCGGCGTCACCCAGTTCCTACGCCACCGAGAACCTTACCTAGCC
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CGCCGCGCGGAAACGCAAGGTCGTGGGTTCGAATCCTGCATCGCGCCCCG
CGTGTCGAACGCCGTTCGTCGTCAGAGGTTCAGGGAAGATCCACAGTACC
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ACCCCAGAGTCCAGTACCTCAACCCGCGGTCCCTGGCTCTGCCGCGTGGC
CTCAGCTCGCCAGCTCAGCGCAGGCCCCACCCGTCAGTGACTGTGGATGG
GACTGTCTGAGTATAAAAAGGTTTTCTGTTTTCTGTTTTTAATTTAAATC
TTTTCAAATTAATTTAAGTTCAAATTTAAATCTGTTTCAATATAACTTTA
AAATACAAATCCAAATAATACAAATGATATATGTTTTTAAATCAGAAAAA
TGTGAGGAATTCAAATATGCCATCCAAAATATATTTTGGACACTTTAATT
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AGCTCAACGAGAACTTTCCGTTTATGCATTCCATGATCTGAATTAAAGCA
TGCATCATATAAATATTGAATAATCAGAACTGTTTATGGGAGTAAAACAT
GCCTAAATAATTTAACGAAGTGCTTAATTAATGTTTCTCACCTCACCCAT
GCCATGCTACTTCATTGCCATGCAAATTGTGCATCATTCATCATGGCATG
ATTGTTTGCTTGTTGCATATTTATTCCTATGCTTGTGCACTTTATTTATA
TTGTGTAACTACCTCGGTGAATTACGCTCCTAGATACAAGCCTGATGAGC
GGTAGTGGTTGAAATAGTACGGTGGGGCCCCAAAAGCCACTCACGGGTAG
ACCTTTCGGCCGTCCCAACCACTACCATCTCAACGGGGCCTGTACGGGCG
GCGTAATCGGCAGGCGAAGGGATCAACTACATACACAAGTGGGTATGTAT
GCAAGCCACCATACAAGAGTACATCAGAGCCATACCATCTAGAAAGAAAG
GAAAATATAGAAACGCCATACGGAAAGATTCAAATGACCTAGATAGATCT
AATATTTTAGGATACTTCCTCATACAACACACATCAGAGTAACATGCGGA
AGCGGCAAACAAAATCCGAGTACGGATAAGAAGCAAATCGGCATAAGATG
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GGAATCTCTACACCGAACGATCGTTGCCCACATCATCGGCTTCTTCCACC
CAGTAACCGTCCTGTGAGGGTACCTGTCCATCTGAACCAATAATTTATCG
TGTGAGACCCTAAGGGTACTCAACAAGACTTAATGCCTCTAAAGGGGACA
CATCCTGGGGTGACACAATTGCAGCGAAAGATAAACCCTAGCAGTTCTAC
AGACAAACGCTAACCATCCGCCTAACTAATGATAGACGGATGTCCGTGAA
ATAAGGACAACAGTTATAATAGTAATTTCATCAGATCCATCCTCCTCCTC
GCTTACCAACGAGGAAGCGGACGAACAACCCCCCCCCATCCGTTGGAAAT
TTTATTAACCATTCCATGAGTGTTGCACTATTTACTAGTCAAATTACTTA
GTCAGATTAAAGCGGTACTTTAGTTATGCTTGTCTATGATCGAGAAACTG
TGCTCCAAGTCGTCCATAACCGCGGACACGGCTTTCAGAAAGTTTTACCC
GGCCGGGGTGCACCAATAGCAACACACGCTCGATCAACCTTGGAAAAACC
AAATCAAAACCCAACGAGGCTTTCACGACTGAACAATCACAGGATTCAGA
AATATTTCAGGGGGCCACCCCTGGGAGTACACCCGCAACGGAGTAGGCTA
GCTCCGAGACGGACTCCAGGTTTGCGTCAATGGCTGTAAACGACAGCAGA
TCCCCAATCGGGGACTGTCGATACCGCGAAAACATTCCGCTTACCTAAAC
AGTACAGTGTGCTCCTCGCACAAACGTAAATAAACAGTAGCATGGCATAA
GTACAGGATAGTAAATAAAACCTCAAACTAGTTTGTGGCCCCAAGAAATA
AGACGGAATCAAGCTCTGGCTCAGGGGGGTCCCATATACCTCCCGGATGT
GGATAGCGCGATAAATCAAGGAACAGGAATCAAGTACTCGGGGTCTTACG
GGACACAAGTGAGCAGGAAAAACCAAATAGCAGATGTTGCTCACCGGTGC
CACTTTCATTAGTTATCTCATTAATACTCAGGTTAAGTTGTTTAAGTACC
TCGTTATCCATCTGACTCTCACAAACCCTACACATGCTGTTCTACGACTC
GCATGGCTCAAACAACTCCTGTAGTAATGGCTCATGGGATGGGGGAACAA
GCTTGGTGGAGTTTAAAAGTAAAGGCTATGCATACTTGGGATTCAATTTA
ATGCAATCGCGACTCAATGATGCAAGAATAAGATAGAGGCAATAGGTACT
GTATGTATGCAAGCATGTGGAAGTGCTTGCCTGACGACTCAGTTGAAGCG
AGGGACGGATCTGGGTAGTGCTCCTGGTTCTCTTGATATAACCCCTGCTC
AGTGTCTATCCGAGAAAAACCAAACAAACAAGGCCAACATGAATATAGAG
CACAAGCATATGAATAAGATGCGTCAAGCAAACAATCATGCCATGATGAA
TGATGCACAATTTACATGGCAATAAGGTAGCATGGCATGGTGAGGTGTGG
AAGACAAGTAATAGCATTTTGACGGGGTTTTGGATCACATTTTGTTGTCA
TAACAATTGCTGTTTACTATATATTGATATGATGCATGCTGCAATTGAAG
TCATGGATAGCATAAACAGAAAGGTCTCGTCGAGCTGATCATTTTAGACA
TATCATTTGCTAAATTTGGAATTATAAATCAAAAGTTATTAATTATTTAA
GTTCTAGTGGCATCTGTGGTAATTTAATTCAACTTGGAATTTTAAATGTT
CAAAAGGAAATTTGAATGGCATATTTGAAATCCTCACATTTTTCTGATCT
CAAAACATATATTATTTGCATTATTTGGATTTGTAGTTTAAAAGATATTT
TAAAACAGAATTAAATTTGAATTTGAATTAATTTTGCAAATGTTTGAATT
TAAACAGACATGCAGAAATACTTTTCGTACCTAAGCTAAGCTAGCCACAG
TCACTGCCCAGGGGGACCGGCGCTGACTGGACAGACACACGCGCAGACGA
CGTTTTTGCACCGCGGGTTGAGCTAGACCTAGAGGCCGACAGGTGGGGCC
ATCGACCTCACAGGTCCACGTGACAGCGGGCGTACCCGGGGGTGCCACGC
GGCGCAGCGAGGGAGCGCGGATTGAGGGCATACTTCTACGGGGTGTGTTT
TGCAAAACGACCAGAGAGGCCGACGCGTGGGCTCGTTTGTACCGCGGGTT
TAAGAATAAAAACTAGGGGGGGTTTACTGCAAAACGGCATAGCCGTACTG
TTCCTCTTCTCCTCTGCGGACAGTTCGGTCCGTGCGCGACAGAGGGCAGG
CGCCGCGGCGGGACTCGAACCAGGGACGTGCGGGCGCGCGCTGGGGGTGC
GCACCAGTGCGGCTAGGTGCGGTTGGTGTCAGGGAGGTGGGCGATGCCTA
GCTACGGTGTTTGCGACTTGGGAGCGAGCAGAAACGAGCGCGACGCCGGC
GCACAGAGACCGTTCGACGATTTGCCCGGCGAGCACCGGCGACGGCGGCG
AAGCGGACCGTGTCTAGGTGGTACAGGGGCTCACCGAGAGGTTGATGGTG
GAGTTAGATCGGGTCGGCGAGCAGCAGGTCGTCGGTGAAGCAGAGGCCCA
GCTAGCTAGCGTTTCCGGTGGGAGTCCCCACGTACAGCAGCGTGCAGGCC
TTCTCCTCCTCGCTGGCGCGGTCCAGGTGAAGCAGAAGGGTACTCCAAGT
GTCCTCGATCTCCTCCACGACGTGCTCGCGAGCCGGATCGATGAGGAACA
GCGGGTGGCCGTGGTACCTGCGGTGGCCGGCGAGAGGGAGCTGGGGCGGT
GTTGGAGAGGGAGGAGAGGAGAGCCAGGCGCCTCGGCCAGATCTAGAGAG
CAGAGAGGGGGGCTGGGGGGTAGATAAGAACGGGGCGGTGTGGCTTGCGT
GGGGGAGGGGAAGGTGGCCTCGGTGCCACCTTTTTCCTCCTCACGTGCAT
GGGCGGCCACGGCAGGGCAGGGGCAGGTAGGGGAGGATGCCAGGTGGGGT
AGGCGAGGCCAGGGAGGTAGGCAGCTGCGGGGTGGGGCTGCTGAGTGGCC
AGGGAAGGAAAAAGAGGGAGAGGGGCCGGCTCGGGCTAGGTTTAGCTTTG
GGAGGTGGCTCGGCTAGGGGGGGGGGGGTACGGTGGGACCAGCTAGGAGG
GAGGGAACAACTGAGGGGAAGAGGTAGCTCGGGGTGCTGCTAGCAGAAAC
AGAGAGGGGAGGTCGAGAGAGGAAGAGAGATAGCTAGGTTGGGGTATGGG
GTGACTTAGCGTTTTGGTGAGATTAGAGGGTTTGGTTTAGGCTTTAGTTG
AGAGGGTTAGAGCTAAGCTCACCCACATGACCACATGATCATGCAAGTGT
GGGATGGATAAAAGGAGAGGTGGGGGATTAGGTTTATTTTGATTCATGCA
TGCTCCAAATCAAAGACCAAGCAAGATCAAAAAGAAAAGAGGTAGGGAGA
AGGATGTGGGGTTTAGGTTTGTGCAAGCCACATAATCACATGTGCATGCA
TGGGGTATGGGGATTAAGGTTTAGCTATAGGGGGATAGAGAGGTAGAGGA
TGTGGTGAAGAATTCTACAATCCAAAACAAGATTGAAACAAAGGAGAGAT
GATCCATGCAAGCAAAGCCAAAAACATTCCAAAGTCAAGCAAAAGGTGGC
ACTTGCATGGCCCATGCAAACAATAATTTCCATGTAGTTATATTGTGAAA
ACAACATTAATTTATGTGGCATTATTCCTTGCATTCCCGAAAGGTGGGCA
AAGGCCAAGCAAAAAGGTTATGGTGGAATCCAACCAACCAACATGAGCTA
GAGGTAAACTCCAATAAAATGCCAAGCTCATATTAATTGGATGGTGGAAT
TATAAGGTGGTGAAAGAAAGGTGGTGGAGTTTAAAAGAGATATGCCCCCA
AATCAACTTGGGCATTTAACAATAATTAAGAACCAAATATAATATCAAGA
GGCAACTACAATTAATAATGCACATGAGATAAGAACCAAACAAGAAGGGG
TTTTATATGATGCTCAAATGCAAGGTGGCATGATGACATGAGCATGACAT
GGTGATGATGCAACAATTATATGTTGGAAGTGGCCCTTTTTATTACTAGA
ACAAGTAGCATTACAGGTGTTAGACAACTGGGATGCTACATATTGGCCCT
TGTTTGTTTGGTTCTTCTTCGAATAGACGCTGAGCAGGGGATATATCAAG
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TTATTCTTGCATCATTGAGTCGCGATTGCATTAAACTGAATCCCAAGTAT
TGCATAGCCATTACTTTTACACCCCACCACAGCTTGTTCCTCCATCCCAT
GAGCCATTACTACAGGAGTTGTTTGAGCCATGCGAGTCGTAGAACAACAT
GTGTAGGGTATGTGAGTGTCTGATGGATAACGAGGTACCTAAACAACTTA
ACCTGAGTAGTAATGGGATAATTAATGAAAGTGGCACCGGTGAGCAATAT
CTGCTATTTGGTTTTTCCTGCTCACTTGTGTCCCGTAGGACCCCGAGTAC
TTGATTCCTGTTCCTTGATTATTCGCGCTATCCACATCCGGGAGGCTTAT
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TCGTTTACAGCCACTGGCGCAAACCTTGAGTCCGTCTCGGAGTCGGCTAA
CTTCGTTGCGGGTGTACTCAATGGGGTGGCCCCCTAAAATATTTCTGAAC
CCTGTGATTGCTTTGTCGTGAAGGCCTCGTTGGGTTTTGATTTGGTTTTT
CCGAGGTTGATCGAGTGTGTGTTGCTATTTGTGCACCCCTGCAGGGTAAA
ACTTTCTGAAAGCCGTGTCCGCGGTTATAGACGACTTGGAGCACAGTTTC
TCGATCATAGACAAGCATAACTAAAGTACCGCTTTTAATTTGACTAAGTA
ACTGACTAGTAAATAGTGCAACACTCATGGAATGGATAATAAAACTGCCA
ACGGATGGGGGTTGTTCGTCCACTTCCTCGTCGGTAAGCGAGGAGGAGGA
TGGATCTGTTGATATTACTTTTATAACTGTTGTCATTAATTCACGGACAT
CCGTCTATCTTTGGTTAGGCGGATGGTTAGCGAGTATCTATAGAATTGCT
AGGTATTATCTTTTGCTGCAATTGCGTCACCCCAGGTTGTGTCCCTTTAG
AGGCATAAAGACTTGCTGAGTACCCCTAGGGTCTCACACGATAAATTGTT
TGATTCAGATGGACAGGTACACTCACAAGATGGATACTGGGTGGAGGAGG
CAGACGATGTGGGCAACGATCGTTCGGTGTAGAGATTCCGGGAACGGGGA
TCCGTGAGATCTGTGGACGGGATGTGTTTATTTATGGGGCATCTCATGCC
GATTTGCTTCTTATCCGTACTCGGATCTTGTTTGCCGCTTCCGCCTGATA
CTCTGATGTTTGATGTATGAGGAGATATCCTAAACTATTATATCTATCTA
GGACATTTGAATCTCGCTGTATGGCGTTGCTATATTTTTTTTCTTTTTAG
ATGGAATGGCTCTGATGTACTGTTGTATGGTGGCTTGCATACATACTCAT
TTGTGTATGTAGTTGATCCCTTCGCCTGCCGATTACGTCGCCCGTTCTTG
TCCCGATGTTTGGAAATGGTTGGGACGGCCGAAAGGTCTACCTGTGAGTG
GCATTTGGGCTCCACCGTACTATTTCAACCATTTCCGTTCATCCAGGCTT
GTAACTAGGAGCGTAATTCACCGAGGTAGTTACAGAACCTTAGCACCAAC
GAATTGATTGGTGGTGTCCCTACAAGCATGGTACCCTCTTTGGAGGAGCT
GGTGCTGTCTGGCAATCATCTGAGTGGTCCAATTCCACAGGGTTTGTTCG
CGTATGTTAGTCTTGTTATGCTGGATCTCAGCCAGAACAGTCTAACTGGT
GATGTCCCCGATGAGTTCTGGAAGATCGAAAAGCTCGAGACTTTGCTCCT
TTAAGGTAATGAGCTGAGTGGAGCAATACCTGGGAGACTGCCCAATTCAA
CGACGCTGTCCCGGTTTGCAGCCAACCAGAACAAGTTTACCGGCTCGATC
CCGAGTGGGGTAACCGAACATGTGAAGATGTTGGATTTGAGCTATAACAA
TCTGAGTGGGAAGATCCCATCTGATCTACTCTCGTCTCCAGTGTTGGAGA
CCATTGATATTACTAGTAACAGCCTCGAAGGGTCCATTCCAGGGAACTTT
TCTGCCAGGCTCTTTCGCCTCCGGTTTGGTATGAACCTGCTGACTGGGAG
CATTCCAGACTCCATAGGCGATGCCTCCAAGTTGGCTTATCTTGAGTTGG
ATGACAATAATTTGTCAGGTTCTATACCTCCCCAGCTCGGCAAATGCAGC
GAGTTGGCTCTCTTGAATCTGGCATCAAATGGTTTGCATGGTCAAGTACC
TGATCAGATCAGCACCCTGGAGAAGCTAGTGGTTCTGAAGCTTCAGATGA
ACAACCTCGGTGGTTCTATCAAAAACACATTTTCTTCTCTTACAAGCCTG
AGCATATTAAATCTTAGTCGGAATTCATTCACGGGAGAGATACCCCAAAC
TTTTGATCAGTTATCAAAGCTCTCCAACATGAACCTTGCAGGCAACAAGA
TTAGTGGTCCCATTCCAGTCTCAGTCAGTTCACTGCAATATTTAATCGAA
CTCAACCTGGGGGGAAATTCCCTGACTGGTACCATCCCAAAAATGCCAGT
TACCTTGAGCACATCTCTTAATCTTAGTCATAATTGTCTTACTGGATCTA
TTCCCTCAAACATTGGGTCTTTAAAGGAGTTAGAGATCCTTGATCTTTCG
TACAACAATTTGTCTGGTACAGTGCCATCCCTGCCTGATTTGCCGCCAAG
TTTGACACTGTTGGTGCTTTCCTATAATCAGCTCACTGGGTACTTTAGCC
CGCCTCCTCACGTTGTAGTCAATATCACTGGAAATCCTGGCCTTACAACT
GCGAGTGATACAGATGGTGATGGCATCCCAGCTGATGGTAAAAAAAGAGA
CACGCTGTTCTGATTGTTATCTTTGCTATTGTCGGTGCTGTTGTTGGATT
GTGCTTGCTTGGTACTGTTATTATGTTCTCTTTGTCCAAGAGGATTTATC
GCGTTGAAGATATAGGACCACCACCAGAGCAGGTTCTTCCTCAAATCATC
AATGATCACCTCATAACAATGAACAGCATCCACACCTCTGCAATTGACTT
TACGTATGCAATGGAAGCAGTCTCCAATCCCTCCAACATATTTCGAAGAC
AAGGTTTTGCACCTACTACAAGGCTGTGATGCCAAATAAGTCGATCTATT
CTGTGAAGAAGCTGGATTGGAGTGACAAGATATTTCAAATCGGGAGCCAA
GAGAAATTTGGTCATGAGCTTGAGGTTCTTGGTAAACTAAGCAATTCCAA
CGTCATAGTGCCATTGGCCTATGTCTTGACAGCAGAAAATGTGTACCTAC
TCTATGAGCATGTATACAAGGGCACAGTATTCGATTTACTCCATGATGGA
AGGTCAGGTGTTCTGGACTGGCCCTCACGGTATAGCATTGCTTTGGGGGT
GGCCCAAGGGCTGACGTTTCTTCATGGGCGCACCCATCCAGTTCTGCTTC
TTGATTTGTCAACAAGGACTATCCACTTAAAGTCAATGAATGAGCCTCAG
ATTGGAGATATTGAGCTTTACAAAATTATTGATCCTTCCAAAAGTAGTGG
GAGCCTTTCAACCATTGCTGGTACAGTTGGTTATATTCCGCCAGGTAAAA
CACGTATTCACATGTGCTAAATTAGTTTGAGCCTTTCAACTAACTATTTT
TTAGTTATTGAACTCTTGATGGTATCTGTTTCCATTTGTAGTAAATATAT
GAATTAATTTTCTTCACTGCAAATTTGTCTTAGCTCCAAATTTCATTTAT
CCCATAGCTCCGCTTAAACTGAAAGCACCATCCCTTTTTCTTAAATGTTT
CAGTGGAACGTTAACTTTCATGTAGACACAAGTTCATATTTTGTCTGCAT
TACACTGGAATCTCCCATCCAAATTGAACCACACCTCCCCACTTCTGGGC
AGGTATAATAAAATAATTCGAATAGTTAAGTGCTTTTAGGCAAACTTATT
TGTAGCTTCTCAAACATTACCACATGTTAGATTGATAGTCTTGCAAAAAA
TGTGTTCGATTTTTCTGTAATCCAGAAGGACCACATATGCTAACACTAAA
TTCCACTGAACTTCGATTGCAGAGTATGCGTATACCATGAGGTTGACGAT
GGCTGGCAACGTTTATAGCTTTGGAGTCATTTTACTAGGGCTCTTGACAG
GGAAACCATCGGTCAGCGATGGCACAGAGCTAGCCAAGTGGGCTCTCAGT
CTCTCAGTTAGGCCTGAGCAAAGGGAGAATGTCCTTGACACCAGGGTCTC
AAGAACTTCAGTTGGTGCTCACAGCCAGATGCTGTCAGTTCTGAATGTCG
CCCTTGCCTGCGTCGCTTTCTCCCCAGACACTCGGCCCAAGATGCGCAAC
GTCTTGAGGTTGCTCATCAACGCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.