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GrainGenes Sequence Report: AA009700

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Sequence
AA009700
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009700
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCGCTTCGTCGAGCACTTCACTGCCGCGCACCGTCCTACACTCCCCGAT
CGCTCCCGCTTTTTTTTCCCTTACATTACTCGTACATGGGTGCCCCGACT
TAATTACCGCGACTGCCCCGCCCGTCCTTTCCTTTGCATTTCGAGGCGTC
TCTCTCTCTCTCCTTCCCTCTCTCTCCCCCACCCTTCGCTCGCTGTACTC
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AGTTCAATCTGACCTGTCCTGTTTCTTGATGCCACTCATGTCAGGTTGGC
ACATTTGCAGCAGCTGTGAGAAGGCAGTAACTTTCATGTGCTATACTTGT
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TCTCATTTCTTTGGATTAAAGCACCAGTACATTTTAAGTAAATATACCGT
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GTCACCTTCAGAAGACTCAATACATAACAATCGTGTGGAGGGCAGGCTAC
ACTGGACTCTTGGTGCAGCCATCTGGAGATGGTTGCACGGGGCATCTTCA
ACAGATTTGGTTGGCGACCTAATAATAAGATTAGCAATGCGTTAAGTGCT
TGATGTAATCTTATTATGACTTGTTTGGCTTCTATAGCTTTTCTCGCTTG
TTGGAGTGATACTTCGCATTTTCGCAATAATGAATGGCTGTGTGCACCAA
TCGGTGCAAAGGCCAGGGGTTACCCTCCTTTAAAAAAAAGTCAAGAACAA
GTACTTGTACCTAAGTAGATGCAGAATCAAAAAAGTGCAGAATCGGCATG
TACTTCGTTATATCATTTCTAAATCTGGGTGTGCTTACTTTTTTATCTTC
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GAGCCTAGGTTTGGCTCTGCATTCAGATGACTTAGATTTACTGCCTTGAA
TGAGTTCCACGCGGGTAGATGCTTGATAGTTGTTTACTTGGTGCCTTGTT
GATACTTCATCCAGCGATTGGCAGTGGGGAGAACTTTTATCTTTGCCGAG
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TCTCTTTAAGTTATATTGGCTCGATCTGAAAGGGAAGCATTTATTAACAT
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CTTCTGTAAGGACAAAGGGACGGAAGCGTCAAATCGATGATGTTGTTACT
GCAAAGATATCTGAAATTTCAGTTAAAGGTTCTGAAAGCTTAACGGGGGT
GCCATTTGAGGGGATGGACTCATCGGGTGATTCCGAGTGGGCCTCATCAG
AGCTGCTGGAATTTGTTGGGCACATGAGAAATGGTGATAAGTCACAGATT
TCTCAATTTGATGTTCAGGTCCTTTTGCTCGAGTATATAAAGCAAAGTAA
CCTTCGTGACTCTCGCAGAAAAAGACAAATTATCTGTGATGAAAGGCTTA
GCAGTCTTTTTAGGAAACCACGTGTTGGTCATTTTGAGATGTTGAAGCTT
TTGGACATGCATTTTCGTGTGAAAGAGACTCAAACAGTAAATGGTGATGG
CAAAAGACCTCATGATCCAGATTCATCTCAAGTAGATAGCAGAGGATATA
GTGAGATGTCAACTAATAAGAGGAGGAAGACTAATAAGAAGCTTGAAAGA
GATCCACCAGCTAATGTAGAGGATTATGCAGCCATTGACGTGCATAATAT
CAATTTAATTTACTTGCGGCGCAGCTTGATGGAGGAGATTATTGATGATG
TCGCTGCATTCTCTGAGAAAATTGCTGGTGCTTTTGTGAGGATAAGGATT
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TGCATACATATTAATGCTAAAATATACCAGGAATGACTCTAATTGGAAAT
CAATTTAAATTTTAAATTACAAACCCACAACTTTTATGTTCAATCTACCT
ACAAAATCGTATCTTCAACTTTTAAGAAGTATAATGAATGGTTGTGCTAG
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GCGACTTGGATTTGTCTAGATTCGCATGTACCTATACACTAAAACACGTC
GAGATACATGCGAATCTAGACAATTCCAAAGTCACTTATTTTCGGACAGA
GGGAGTAGCTATTTTGGTGCGCACACATGCTTCCACGTCATTATTTAAAT
CCCAGCCATCTATTGATATTCCTCTCAAGTAATTCAATTAATATTATATA
TATTGCGTTTTGATTAGCACATTAGTTGCCATTGGTCTTATTTGTTTTAG
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TTTGGTGTGTATGGAAGCAAAAAGATCTATGTGAGCAAAATTTATTGTAC
ACTAATGTTTAAACACCACAGAGTGATTTTTTTAACATGCATTTGTTAAA
ATAAAATCATTTATAAATGTGTGGATTCATTTGCGTTGAAACATAAGAAC
TCTACCTTTATTGCCTTATTTACATTTATGATTTAAGTGACATGATGAAA
AAAACTAGTTTTTTATTAGTCGTGGCACTAAGAATTCAGAAACCTTTTAT
ACTGCATTCTCTACAGAATCAACATTGCTCACGTATATCTCTGACAATTT
CTGCAGCAACGTGTGGTGATTTTCTAGTTTCTGTAGTTAATGACACAAGA
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CAAATATTCTTGTTTATTGGCCTTATAATGCAATATCATGTTGACGTACC
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GGTTTACTGCTTGTTTATGTAGGAGGAATGCAAACGCTTACGCCAAAGTA
TGAAATATGGTCTAATTCCTCGACTTAAAGTGGTACTGCTGATGAAGAAC
CAAACTAATGATCCGTCTGATTCCTAGGTGACCAAACTGCGTTATCTGAC
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GTTTGACCTAACAGCACTTACTCTGTTAAATCCTCTTTAGTGGTTGGGAA
ATGAAAAGCAGAGGCTGAGCCATCTCCGTGACCGTGCTAGTGAAACTGGA
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GTTTAACTTTTGTGTTGGTGGTGTGAATATATGATTTTAGTCCTCGATTA
TTTGGCCACAGCTTTGCATGCATATGGTTACCAAAGATGGGCCTGTTAGA
ATTGGCACACACTATCTGCGTGGACATATTTGTTGGCATGAGGAAACATT
ATTCTTGCAAACTTTACTTGAGCAAATTGTGACCAAGGACAGTGTTATTG
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GTGGTGACCAATTTATCCACCATGAAAACTGTGGCAAACAAATGTGGCAA
AGTTTGGAGGGCAACCAAACATGCCTTTCATCTTTAAACATGATATATCA
CCCAGTGCTCTCCAGATGATGCATGTGCCTCTATCCTGTCATAAAATCTC
AAGCAGTTTATCTTCTAGCTTTCTTTAGGCTTACGATAGGTAGTCCCGTG
TGCTCTCCATTAAGTTGCTATTAGCCATACCTTTCTGTTGTGCTTGTTCA
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ATGCAGATGATTGGACTATAAATAGGAATGGATCAGATCTTCATTTTCCT
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TGCATCAGTTTCATCATCTGGAGTTGTATCAAGTGACACAGAGCCAGAAA
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GATTGCCTAGCCAGTCTGCTGACCGTTCTATTGGAAGAGAAAATTCGAAC
TTTCTGGGTGAAGCTTTGCCAATGAGAACTGGCTGGGAACAACTGAAGAA
CTATTCATGCACCATTCCAGCTTCTGCTGGTTCGTATGGATCACCAGGAT
CTCATGGTGATGGGGTCCCCCGAGAAAAGAGTGGGGAACACAACAATCAT
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ACCTGCTGCTCATGATGAAATTCAACTTTCAATTGCTTCAGCAAAGCCTG
GGAGCTGTTATCCAACGAATCCTAGTCAGTCAGTGGCTCCATTTACATGT
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CCCTGATGCATTAAATGTGTCTGTTAACCAACTTACTGGGCCTAAAATTG
ATCCAATATTATCCCCTGACACTCAAGATCAATATCCCAGTCCAACTCCA
AAACTTGAGAGGAAGCAGACTTCTATGCACAAGTCACGGTCAACATCAGT
AGCACCTGAAGATTCAGCTATGAAGGCACATGACCACTCTTCAGTAACTT
TCGTACCACAAATATCTGGTCCACCTTCTGGTAAAATATTTGGCTTGCAA
TTACACAAGGAAACACAAACGTCATGTGTAGAAGAAAGAGATCCAAAAGA
TAGAGGCTCTGTTGCTCAAGCAGAGCAACTAAAAGGAGAGGCCACATCAG
CTAAGAGACAGAACATACTTGTTAGTCCTGCCTGTGATGTTGAAGCAATT
GCTGTGTCTGATGTATTGGAGTCTTCAACAGCACAACATTGTGGAACTTA
TAATATGCATGGAGTAACACCTTTGGGAAATTTCACGCCAGCTTCAGCCG
AGGAAGAAAGACCGCAGTGCTCTAGCCCTATCGCGCTATCTCCATGGGGT
GAACCAGGTTACTATCAAGGTGAAGCTGTTGATTCTGCTCTGTGGGGTGT
CCAAGATGACCCAAGCAATGACATGTGGTCATTGTCTTCACCAACACCTG
CTCTCCAACCTTCATCAGGTTAATGAAGTGCTATTCTGTTCTTGTTTTTG
TTGTTAACTTGACAGTTTTTTTCGAAATGGGTTAACTTGACAGATCTTAC
ATAATCTTGTACAGACCTTGGAGCTCATGGAAAAGATACTTCATGCGTTA
TAGAGGAGGTGATAGTAGCCCAAGGAAATAGTGCTGTTGATGAAACGCCG
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AGTTTGTGGAGTGCAGGGGCAGGTAATGCTATTTGACATATTTAAGGATT
GAAGTCCAACATGATGTGTCTTCTGAAAAAAGATTCCTCTTAAAATGGTC
TTCCATGTCCCAACTTACATGTTTCTTTTTTACTTGATTAGGTAAGACAA
AAACAAATTGCTGCATCGAGCTTGTCTCTCAAGCGAACGGAAGCTTCATG
TGGGCAACCATTAGGCTCATCTTTGGAGAGGACTAAAGAAGCTTCAGGTA
GGCAACCATCAGGCTCAACTTTGCAGGGGAGCACAAAAGGTTCAGACAGG
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ACCAGCAGGCTCATTCCTGGATGGGAGCACAACAAATCCATCCAGGCAAC
CATCAGACTCATTTCTGGAGGGGAGCACAAAAGCTTCAGGCTGGCAATCA
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TGTAGAGGGAAGTACAAAAGCTTCAGGTTGGGGTTCATCCCTTGAGGGAA
GCACAAAAGCTTCAGGTTGGGGTTTGTCTCTAGAGGGGAGCACAAAAGCT
TCGGGTTGGCCACAATCAAGTTCATCTCCAGAGGGGAGAAAAACTCCAGG
TTGGCCTTCGTCAGCTCGTGAGAGCTCAAAGGTGAATTCCACGAGTGCTA
GCCAAAACCGCAGATCTTCAAGTCACCAAACAACAACACCAACAGTTAAA
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TGGCTGGGGAGAGGCACCAGGGAACAAGAGTTGGCATCCATCGTCTGGTA
ATGATAGTCGAGGTAGCCAGTCGAGTCAGCACCATGATAGGTACTCTCAG
GGAAATGAATCACGGAGGGGTAGCTATCAGGGCAATGAATCACGTCGAGG
TAGCTCAAACCACTCTAGGAGGTCTGATCATTGTCAAGATCATGGCAGCG
GCGTGTCATCAAGATCATCGTCAAGAGGGCAGCCTCAACGAGGAATATGC
AAATATTACGAGAGTGGCCACTGCAGGAAGGGGCCATCTTGCTATTATGT
TCACCGTTGATCTTCATGCTAGGAAACACATCGTGGAGTTACCACGTCTT
ACCTCACATTTTTGTATAGCCTGATAAGTAAGTTCACTTCGTAGTCAACT
TAGAAGAGAGCTCTTGGCGCTACTCAGATGCTAGTAAATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.