Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA009498

[Submit comment/correction]

Sequence
AA009498
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009498
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGCGCCGCCGTCGCGGCGCCGCTTCCCGCGAGGCGGGTTAACCGGGTGT
TCGATAAGACCGCGCACACCGACCGTATCCAGGAGCTTGCAGGACTCGGC
TGCCTGCGGGAGGCCAGGGAGGTGTTCGATGCCATGCCACACCGCGGCAT
CTTCGCCTGGAACACCATGATTTCCGCGTACTGCACCAGCGGAATGCTCG
AGGACGCGAGAGCCCTCGCCGACGCTATCTCCGGAGGGAACGTGCGCACG
ACCACCATCCTGCTGTCAGGGTACGCTCGCCTCGGCCGCGTGCTCGATGC
TCGCAGGGTGTTTGATGGAATGCGCGAGCGGAACACTGTGGCGTGGAACG
CGATGGTAAGCTGCTATGTACGGAATGGGGATATCACCATGGCGCGTAGG
ATGTTCGATTCGATGCCGAGCAGGAATGTCATTTCATGGAACTCGATGCT
CACTGGGTACTGCCACAGTCGGCAAATGGTGGATGCATGGCGTCTGTTTG
AACATATGCCAGAGCGCAACTTGGCTTCTTGGACGGTTATGATTTCTGGG
TATACTAGAACTGATCAGCACCGCAAGGCTTGGGACATCTTCCGCATGAT
GCACCGTGAAGGTGTGTCGCCAGACCAGTCAAACTTTGTGTCCGTGCTTT
TAGCGCTGACGGGTCTTCGGGATCTTTCTGTTCTAGAGGGCTTGCGCCCT
CTTGCCCTTAAGACAGGCTTTGAGAGTGATCTGGTCATCGGGACATCGAT
GTTAAATGCATATACTAGGGATGCAGGTGCACTTGACATTGCAGTTAAAT
TCTTTGAGGGTATGCCAGAAAGGAATGAGTACACATGGTCAACCATGATA
GCTGGACTATCTCATGGTGGTCGAATCGATGCTGCTATTGCCGTCTATGA
CAGAGACCCTGTGAAATCCATTCCATGTCAAACAGCATTGCTCACAGGCT
TAGCTCGATGTGGCAGGATTGCTGATGCAAGGATTTTATTTGAGCAGATT
CCAGATCCTGGTGTTGTGTCGTGGAACGCCATGATTACTGGCTATATGCA
GAATAGAATGGTTGATGAGGCAAAAGAGCTGTTCGACAGGATGCCTTTTA
GGAACACAATATCCTGGGCTGGAATGATTGCAGGATATGCACAGAATGGA
AGGAGTGAAGATGCTTTGGATTTACTCCAAGCGCTCCATAGGAATGGAAT
GTTACCTAGCCTATCTAGTTTGACCAGTAGCTTCTTTGCTTGTTCAAATA
TTGGAGCTCTTGAGACAGGAAGACAGGTGCATTCACTTGCGGTTAAGGCT
GGCTGCCAGTTCAATAGCTATGTATGCAATGCTCTCGTTACTATGTATGG
TAAGTGCAGAAACTTGGAGTATGTGAGACAAGTCTTCAATGGAATGAGAG
TGAAGGACACCGTTTCATGGAACTCCTTTATTTCGGCACTTGTACACAAT
AATATGATGGAGGATGCAAGACATATATTTGACAACATGCTTAGTCGGGA
TGTTGTCTCTTGGACCACGATAATATCTGCATATGCACAGGCTGAACGGG
GAAATGAGGCAGTGGAGTTTTTCAAAACAATGTTACATGAGCATGAACTA
CCAAATTCCCAAATATTAACTATACTTCTCAGTGTTTGTGGAAGCGTTGG
TGTTTCTAAGCTTGGGCAACAAATTCACACAGTAGCCATTAAGCATGGAA
TGGATTCAGAACTTATAGTGGCTAATGCTCTCATGTCAATGTATTTCAAG
TGTGGTTCTGCAGATTCACATAAGGTTTTCGATTCAATGGAGGAACGGGA
CATATTTACATGGAATACCTTTATTACAGGTTGTGCACAGCATGGCCTTG
GAAGACAAGCCATCATTATGTATAAGCATATGGAATCCGCAGGGGTGTTG
CCAAATGGGGTCACTTTTGTGGGGCTTCTAAATGCATGCAGCCATGCTAG
TTTGGTAGATGAAGGTTGGCAATTTTTCAAGTCACTGAGCAGGGATTATG
GACTAACTCCTCTGCTGGAACACTATGCGTGCATGGTCGATCTACTTGGG
CGAACCGGTGATGTGCAAGGAGCTGAACAATTTATTTATGATATGCCTAT
TGAGCCAGATGCAGTGATTTGGAGTGCTCTTCTTGGGGCATGCAAGATTC
ACAAGAATGCAGAAATTGGTAGAAGGGCTGCCGAGAAGCTCTTCACTACT
GAGCCATCAAATGCTGGCAACTACGTCATGCTATCAAATATATATTCTTC
TCTGGGTATGTGGGTAGAAGTCGCAGAGGTACGTAGAATTATGAAACGAC
AAGGTGTAACAAAAGAGCCTGGCTGTAGCTGGATGCAGATAAGGAACAAA
GTACACTCTTTTATCACTGGAGATAAACAACATGAGCAAATCAAAGAGAT
AGAATCTACCCTCCAGGATTTGTACACTTTGTTAAGGTCTACAGGCTATG
AGCCTGACACTGAATTTGTTCTCCATGACATTGATGAAGAGCAGAAGCAG
AGTTCCCTTCTCTACCACAGTGAGAAGCTTGCTGTTGCTTATGGCCTTCT
TGTTACACCCAAGGGCATGCCTATACAGATAATGAAGAACCTTCGAATAT
GTGGTGACTGTCACACTTTCATCAAGTTTGTATCACATGTCACCAAGAGA
CATATTGACATTAGGGATGGAAATCGGTTTCATCATTTCAGGAATGGAAG
TTGTTCATGTGGTGACTTTTGGTGATACAGTATTTTCTATAAGCATCAAA
GCAGATACATTTGGATGGTTCCAGAAGACATGTTTGATGGCCATTCAGAA
GTTTTTATTGAGTTATACACACAAAGCAGAAAAGAGTATGCTGACTGACT
ATGATGCTCTCCTGTGCCCTGCCATGGGTTCTTAAATGCAATATTGGGAT
GATTAACTGTCTGTTACTCCCTAGAAGCGCATGGATTGGCATCTGGTGAG
TGCATAAAATATATGGTTATCCACTTTACTTTACACTATGGTAATAACCA
ATTATTCAACAGCATCACTGTCATCGTTTTGCATGATAGCTCAACAAGAA
GAAACAAAGGGAGGATGGATAGGTGCAGCTGAAAGCCTTCAACAAATACC
TCATTGCTGATGCAACAACAGTGCTTCATAACAGAGAAACTATCAATGTA
TATGAACTATATGCAGGCAAGTTGACACTTAGCAGCCTATATATCAATGC
TGATAGAAAGAGCCATTTCCTATGTCTGCCTAATGTCCGTCGGCCTGTTC
TCTTACCACGTGTTCTCGGTTGTTATGTCCTAGTCTTAGAATTGTACATG
ATTCTTTCTACCAGTGCAATGCTATACAAAGCTTCTGTGCATTCTTGGGA
GAAACGCATGGCTTGACAAAAGGAAGACAAAGTCGGCACTGAATTCATTC
ATCTTTGTAGATTGGCACTTGGACAGACGTACTCTGTACCAAATGAAACC
ATTAGAGATGTGACTAACATGTATGAATAACATTTGGCTGCAGTTTTGGA
TAAGTCTGTTGAAGATTTATTCAAGGCGTTCACGTATTCATCCCCAAAGC
ATATCATGGGTTGGAAGTATGAAGTTCATTATACAGCAAAACTTTCTGGT
AACCCACACTTCATTCAGTTTTATCATATCGACCATAATGTTCTTCTAAA
CTATGAGGTTAAGTTGTTTATTACTGAGGTTATACCGTTATACCTAGGGC
ATTAAATACACGGGGTTGGCAAAATATTGTAGTTTGACTCAAGCCCAGTT
GAGCACTTGAGCTGAAATCAAGCTTGGCTAGATTGGGCTCGAATTCGTAC
TTGTGTCATATAACATATTAATAGGCCTCAGCAGGCCAAGCTCGACCATA
TTGCGCAGTCATAATTCACAATACACTATCAGAAAGTAAATGTAAACCTG
TGTTGTAATATAGGTACTACTCCCTCCGTTCCATAATGTAGATAGTTTGC
CAAAACGTTCTATATTATGGAACAGAGTGATACAAAACAAGGCTGTACTC
ATATGTTGTTCCATATCTCACATCTGACTTCAAGTAAACAAGCCGAGTAC
ATAACAACCTGCTTTTAGCTGCTCTACTCACATGTAAGCAAATAAACTCA
TTTGTTTTTGCAGAATTATACCAAAGCTAATCTACCGCATATGTAACACA
ATTTACCAGTACCACCAGCTAATCTATATTCCATGAATGAAAAATCATCC
TCTTAATACCGCCCTTTTTCAATATCACCACTTATACATTGCAACAGTCA
CTATCCTCTCACGGGTGCGAAATCTTCCTAGTATTTGTGTATATTACTCT
GTAAGCCGGGCTAGCAGCCAGGCCGTTGAGGGAAATCTGCCACGCCCTGT
CGCTGGCATGTGGTCTGCCGTCCTCCTCCCTGTCGCGAAGCCATACTCCT
CCCGGCATCCAAGTCGACGTCCTCCACCCGAAACTCTGGTCGGTGCCGCG
TTACCTTACCGGCCTGCCAGCTGCTCTCGGCTCCATCTAGCTCCTCTAGG
CCTCAGCCCAGTATAGGTCCTGTCAACCGCCGGCAGCTCCTCTCGGCCTC
CGCCCTGTCAAGATCCTTATGCCATGGAGCTCGCCGTCTGTTTGTTCCCG
TTCCTTTTCTTTTCTTCCAGTCTCTTTTGATTGAGATCACACAGGTTGCT
GGTTGATGTCTCTGTTTGCTTCTTCAGAATTTCTTTGCAGGGTGACTAGT
TGACATGTTCTGGCTGGACCAAGGTTGCTTGATTGGAAGTATGCATAGTT
GAAACGAAAGTTCAGAGTTCAGGTTTCTTCTGTCAATATTTAATCTGAAT
TTCTTCTGACAGTAATATGAATGGAAGAATGCATGTCCAGTAGTTTCAAG
TAACTGAGCTTGTGCAATGTGCACTGCAATTCATATATGTCATCAGTAAC
CTGAATCTTCTGCACTTTTGTCCTGAATTCTAGATCATGCAATTTTTGCT
GGTATTGTTTCAACTATGAATGGGATCTGGTATTGCTGCGAGGGAGTAGC
ATAAGTCATCTATGTAATCTTATTCAACAAACAGAACTGTCAGCCAATGA
GATGTTTCACAGACATGATTTTTTATCTAGGAATTGTTAAAAATAGATTA
AGTAGACATCACTCAATCAAGTTGACACAATTCTGGTGGTAGTTAGAATT
AGATAGCTAAGATGTTCTCATGTTAATGCAGAGAAAGAAGTTGCTCCTTG
GCTTGATGTATGTTCAGTTAACATGCGCTTAAGCAGTACTGCCCACGAAT
TAAGTACTAGTAAGAATCACGTTACTTTGTTTTCACAGGATGCCAATACG
CTGTGTACGCGTGATGAAGATGCTGGTGGTTTAATAACTATTGCTGAATA
TGGCCAAGATTTACAATTAAAAAGATCCGATACAAGTTCCGTATCCGTAT
CACGGGTTTGTCCACTATGATTCCGTACTGAATCCTGTTGTTGGTTCATG
TCATTGTTGTGGACTGTTTCTCCAAATACTGGAAACACGTTTTCTCACCA
TGCCTTTTTATGGTGGCATTCTCACCATTGCAGGGCGACGCGGACGTGAA
ACTCGTGGCGGAACAATACCTGAAGCGCGAGGTCCTTGCAGAGGGAAAAT
ACGGAGTGGTCTTTGAGGCCATCGACACCACTCCAAAATCCTTGCTGGTC
TGCCCTAGCCCCTTTACAGTTAGTTCTGCAGCTATAATTTGAACTAGGAG
CTGTAATTTTCATTTTGCTAATTAGACTGAAGGAGGTGCCCCACCCGAGT
ACAAGGCCGGCGACGGCGAGTATCATATCCCTTCCGAGTCCGCATTTTTT
TTTCGCCTGATTGGATTGCTTCGATGCCGGCAGCACCGCGCGTGCCCCCT
TGTGTCATCCGTCGTCCTTTCATCTCCACTTCTCCAGGCACAGCCTTTGC
CGGGGAAGAGTTGGCAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.