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GrainGenes Sequence Report: AA009061

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Sequence
AA009061
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009061
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGCCGCACGCGCGATGAGTTTTCGCGGCTATTGAAGTTGCTCTTGTGTT
TGCATCAAATCTCAATTCCGTTTGTCATTTACAAATACCGTCCCGCTTGC
GAGGGTCGCGTTGCGCTCTCTCTCTCTCCCACTCGCCTCCTCGCCATTAA
AGACACAAACCTCTAGAAACAAAAGCAAAAAAAGAAAACTATCGAGCTAA
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AAGGGAAAAAAATAAATTTAACATTGGCATTTTTCTGTCAGCATGTGCAT
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AATTCGTTCTTATTGTTTTACACTAACTTGAGATTTGTTGCGAAGAAAAT
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CTAGCTAGTACATAACTGCAATGTTGACACCAGTTATCCGTTCAAATGTT
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TGTATTTTCCAAGTTGTTTTCTACTTCACTGATAGCTTGAAGCTGTTTGA
GATGATTTCATATCATTGTAAAATAATACTGCTATTTCTTATCTGGAGCA
CTAAATGTTTACCAGACATCTCTTTACGTCAGTTCTCCTTACTTTTGTTC
TCCAGGAAGAAGGGAATTAGTTTTGTACCAGTTGATGAGACTTGTCCTCT
CTCCGAACAAGGCCCATTTGATATTATTTTGCACAAGGTCAGCGATGTCT
TCCCTGACTTCTAAATAAAATATTTGATAATGCAATCAAGGAGTCCCATA
TGTTGGGTAGATTTAGTCAAACAACCACTGTCAAGTGGGTGAGTTACACT
TACACATGTGCTAGATTTAATGATCATATCATATGGCATTAGGGATGTGG
TCTGTCCGCCGGACATAACGGACAATTCGTTTAATTAGTGAATCCTTAGG
GCAACTCCAACGAGCCCCCGCATTCTGGACACGCGGTTCGGTGCCGGCCC
GTTTTGCGGGGTGTAGTGCACCCAACGGCTGCCCCGCAAAAAAAGGAAGA
AAAAACAGTAGCAAATACTAGAAATTAATTATACATACAAATATTAATAA
GTCCACGACCAAAATACATTGAAAAAAAGAAAAAACACCCACTATACTAC
CGGGTGCATCCTAGGGGCTAGCTGGGGCTGGGAGCTGGGGGGACTGTAAC
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AAAGTAATATCATTACACAATAGTCCTCGATGGAACCCACAAAACAGATA
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ATTGAGCTAAGAGCCCTGAAGAATAACCAATGGCGTCCATAACCCTGCCT
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TAGGTATGGTGGACTGAAGCGGTAGCGCAACATGCACTAAACAACCTATA
GAGACTCGATACAACTATCGGCTATCAGAGAGGGATAAGAAAGACCTATT
CGAAACCAACCTGATTCTACCACCAAACATACCCATCCTGGTATTTCCCC
CTTGAGACCAAACGAGGAAGTCAATCCGAGGAAACTCACACAGTTGGTGG
TTTATTCATTCATTTCATGGTGGTTATCCAACTTACTAGTCATATTAGAT
ACAAGTCATATTTTAACAGTAAACTTGAGTTATAGTTGTCTATGATCGAG
AACTGCGCTCCAAGTCGTCTATAACCGCGGACACGGCATCTCGAAAAGAT
TTAACCCTGCAAGGGTGCACCAAAGTTTCCACACGCATCTACACCCTTGT
TGTCAGATCAGGTAGGTACAAGATCACAAAACATACACCCAACGGTATGT
CGACGGGGTTTTAGACACGACGTTTCCCAGACCCAAAGCAAGTACATGGG
GGCCACCCCACTAAGCTACCCGCAACGAAGTCGGCCGTCTCCGATACGTA
CCCAGGGTGTGTGGCGACGGTTGTAAACGACTGGAAACCCGAAAGTGTGA
CTGGGCTTGTCAATACAGCGAAAACGTGGCACGGGGTTCCTAAACAGTAC
AGGCGCTCCACGCACAATAGTAAATAAGCAATAAAACATGGCATAAGTAC
ATGATAGTAATAAAGCCCCAAACTAGTTTGTGGTCCCTAGTACAATACTT
TGAAATCAGGTACTAAATCGATGGGGTGCCCACACACCCCACCTGTGGTG
CGCTCGATCTCGGAACATGTGTCAAGAACTCGGGGTCCTACGGGACAGAA
GTGGGCGGTTAAAAACCAAATATTGTCTATTACCCATCGGTGCCTATGTA
TTATTTACCTACTTTCAATTTTAGTTATTAAACGGTCATTAAATCCATGA
TCATCTCCACCATTAAGCATGTGCCAACCACGAAGCAGCACCTGAGCAAG
CAACTACGACTCGCAAGGCCGACTATCTACCAAACAACAGGTAATAGGAG
GTGTCCATGGAAATATACAGGCCGCAGGGACGTATAAAGGGGTACGGAAT
CTATAGCATCGAGGAAATAAAGACTATAAAGATAAAATTGGGAGAAAGGG
GAGAATGCACGCCTGATAACATTGCCGAAGGTTCATCCGAAGATCGGGTC
GATACTCGCATCAACTCATCGGCCTAATCCGTGAGGAAGCAAAGCACTAG
AAGAAACACCGAATACACTATTTAATACTACGACAGAAGATCGGGCATGA
TGCATATATGATGTATGACATGGTAAAGGTGCAAAGCAATTAGGCAATAT
TAAGCGGACCCGGGGTCCCGACAATTAATTAAAAGGTTCATGTTGCTTAG
ATACCCCGCAATTTAAATGTTGGTTTAACAAGGCAAAAATATGTCATCGG
TTTGCTACACAAATTTAAATGGAACCAATATTAGACTAGATTCGCCCGCA
TATGGCCTCCATATTTAATTATTAGGTGAGTCGGCAAAATACCCCCAAAT
AACCAAGTATGAATGCAATCATGAATAATTATTATGCAACAAGTTATGTT
ATATGATAGAAAATATGGTTAGGGGCGGGGGCTCACGGTCTGAATTCGAG
TCGTAGAGATAGTCTTCGGAATGTCGTGAAAGTAGAGAAACTAGCCAATG
CAACCTTCTCCATATTCCTGGAATGGAAGTAGTCAAATTGGACACCGATA
ATAAGAAAACACCATCAAATCTCGTGGGAATTTGGTCGAACAGCTTACGT
ACAGAGCAGAGTGGGAACGGTACCTTCAGGTGAACAGGAGAACTGAAGTC
TATTGAGGCACGCTCAGAAGAATAGGTGGCCGAATTGACGGCTCTCGGGC
CTATGCGGTACCGATGCACTTGCTGAGAGGCAGCAGGAACCATGCGGCGC
CTTGCCTCACAGTACTGTATCAGGTGGAGTTGACTGTCTGGCTGCTGCGG
TCGATCGGGAGCGGGTGACCTACACGCGGCCAAATGAACAAGTAAACGGC
AGCTGAAGCGAGTGGAGCACGGCGACAGAAGGCAGGTGGAGCTGCAGCGA
TGGAATCTGGTGGCATGTGGTGATCGTGCTCCTGGAGGATTTGACGCGCG
GCAGAACTGGTCGGCATGCGCGCACGGGAGCATCTCTGCTTACTGATGAA
TCAAATGGGAGATGTGCATGGATCGATTGGGTAGCTAGCTAGCTTCATGG
ATCAATTGGGTAGCTAGCCAGCTCTTGGGGAATTCTTCACTTGGCTGGTG
ACGATCTGCTTCTGTCCGATGAGAGAAAATAAATAGAAGAGCTGGCGGCG
GCAGAGGAAAAATAAAAGGAGGGGAATCTGGCTCAGATTTGTAGACCAGG
GTTTGGTAGGGGAAAGGGGAGTATTGGGACATATATATAATCTAAAGTAG
GATATATGAGGTTAGTTTTGGGCTAAAACTTTAGACGGGCCTTTTGTCAT
TTTATTATTTTAATAAAGTAAGAAAACCTTTATGGTCACGTAACGGACCG
AAAATATTACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTCAACTTTATCAAAAT
TTGGATGAATCTAGACACTATTTAGTTTATAGGTTCATCCAAATTTTGAC
AAATCCAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTATTTTATTTTAATTTG
AAAATAAGAAAGGGGATGGGTTTAATAAAACCACAGGGATATTTTAGTAA
AACAAAATATGTTTTTAACAAAATCGTTTGCAGTCAAACATGCAAACAAA
AATATGCATGATGATGTAATGATGATGCGAGCAATAAAACAACACGTATT
TTCTAGGTAGGAATTTACCTAGGTGCTACATGGACTGCGGCGGCGGCGAC
CAACCTCCACGCCACAGTGTCCTAGTCGTTGTCGTCCTCGATCTTGATGA
AGACCGAGGGCGGCGGCGCGAGCAGTGGAGGCGCCGGCAAGGTCAGAGGT
GGCGGGGGAGCATCGTGGCCGTGCTGAGCCGCAAGCTAGGACTTGTGGAG
GGCCTACACGGTGCCGTCCCACTTGCGCTCCTCTAGCTGGGACGCGAGGA
TGGCAGCCTGGAGCTCCTCCTTTGTCATCCTGCCTCGGTCTCGCCGTGGC
GGCTCGTCCGCCTCCTCCTTGGCGGCCACCGGTGGGAACTGCTGGGCAGT
GTCGGGCTCGCTGAACGGCCACACCTTCGAGGCCACGGTGTCGGCGCCAC
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GAAGTAGCTTTAGTCCCCGTCACCGCCCTCCTCCTCCCTCTCCTCGTCGG
CGGAGTCATCGAGCTCCTCGAGGCGGGCCTCAATGGTCGTGCGCCGGGTC
TCGTGCTCGGCCTCGAACCACCTGTCCCACAGGTGGGAATGAATGGCATA
GGCCGGGTCGCGACGCAGATCTAGCGGGAGGTTGGCGCGGCGGCAACAGA
TCTCTCGCTGGCGAGTAGGACTAGAGGCGGGGATGGCCAAAACCGGCACA
CGACCAAAGTGGCAACCGGCCGGCAGGTGCACATCCGTCTACGTCCCTAT
ATGACATGCTTGCTGTACTTGGCATTCGACCAAAGTGGCATCTAAGGCAA
GGGGCAAATTACTAAGCATGCACCCAAGGCCTGGCGGCTCCTATGCGTCT
TCGTCACCAGGTCCTTATCTTCAGAGAGTCTGGCTGCAACCATGCACAGA
GTGGCTTTCTTGGTGTCAGCCATGGCTCCACCTAGAAGCTTAGGACGAGC
TGGTCTTTGAGGGAGATGGGAATCTCATGTGGGTGGTTCACTCACATAAT
AGGCCAGCTGACGTTAGCTGACTTCAGTTACCAATATAATCCCAGTTATG
TTTTATGTTAGATATAATACATCCATTTGATATAAGATATCTCTTAGCTT
GGGCCTTAAGCAAATTGGAGATAAGAAATTTTGTTTGTAACCCAGTTTGG
GTTGTTAGGCCTCTATATAGAGGACCCCTTGAGATGAACAATTAAGCAAG
AAGAATTACAATCTATCTCTCCTCTACTCAGTCCTGTCAAATCCCTAATC
TAACCCCTCTCGCTGATCAGCTGTTCCACCATGGCCATCCCCCTGATGGT
ATTTATCCTCGTGAACCCGGGTTCATGACAATCACATACTTAATCTTCTA
TTAGAACAATCGAGCTTCTTACATCTTGTTTTCAAAACTTTTGTCAGTAC
CGTATGGTGCTCCTTAAGATTCTTTTTTTTTCTGATTGAGTTTGTTGCAT
CTTTTTCTCAGCGTACTAACAAGGAATGGCAGCAAGCTCTGGAGGTAAGT
CATGAACACCAAACCAAAAATCTTCTGATAAGCAATGGTTACGTTGCAAA
ATGTAGCTGCTGACATCTTCTGTTTGCAAGTTTGCAACATTGTGGCTTAG
TACTATAATTAATTAGGTCCCTGTTTGCAGCTAGTCATCACTTATTATTA
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ATCGTGAAGAGCATCCCGAAGTAACTGTCGTTGACCCACCAAGTGCTATC
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GTCAGCAGGCTTGTTCATTTCTGCTTAGATTTGTTAGGGCTGCTTTCATT
AGAGATAAGATTGCCTAGGACCAGATAAAGTTTGTTTCCTTTTGTTAGAT
ATGTTCTGTTAGACTGGGCTCTTTATACAAAGGAGCTGCATCAATCAGGA
GAAGGAAGTAAAAACCTAAGGAGACTTACCTCCACAAGCGTTAGAGCCCC
TTGGTTTCCCTAGTCTTTAGATCTTACGGATACCAACTAGGGTTTGACCT
CGCCTAGGCGTCGCCTAGGCGACGCTTAGGCGTCCAGGCGCTCCTCCCCC
GCCTTGAAAAAATGGGCGCCTTAGGCGCCTAGGCGTCCAAAGCTCCCGCC
TAGGCGTCAGAGCGCCCCTGCATCGCCTTATGACGCCTTAACGCCTTAAA
AACCATGGTTATGGGTTATGCATGTCCTTATTCGTTGTCACTCCCCTTGT
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TAAAAGAGTTTTTACTCACAGTTACGGCATAAAGAAAAGAACCTCCCTCA
AAATAAATTGACATTACATTGCTTGTTAGTTTTAAATCAATTTAGCAATC
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TTGCCAAGGCTGGACTAACCTTGCCGTTGGGTAAGTTATTCAATCTTCTA
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GGCGGTTTAAGGAGGGGCGCCTAGGCGCTCAAAGCGCGAAGCGAGGCGAT
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TGTTCCTATTTTTCCTCCACCAATTTTACTATCGAGTGCCATGTTTGTCC
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GGTTGGTTAAGATTTTTTTCCCTCCCCTGATTTTAGGATCGTGCACCTCC
CACGCACACCACCACGTCAGTCCACCACAAGCAGAACAGAGAGGAGCAAA
TCTGGGCGGAGAGGAAAGAGACCATGGGGAGAGAGAGGGGGGCCTTACCT
TGTTGCCTTGCTTGGGAGAGGGCTCCGCCAGGTGGAGGAGAAGCCCCAAA
GCTTGGCCGGAGAGGAGGAGGCCGGCGGAGGAGGGAGGAATCGGCCGGGG
CAGGAACCGATCTGGCGGAGGAGGAGCTGGCCGCCAGCTCTCTATCTGAA
TCGATTCCTGTGAACCAAATGCCCTAGTTCTATTCCCCGCTCTCTCCCCT
CTCTCCAGACCCCAATTTCCCTCCCATCGCCACCCAATTTCTGTTTTGCC
ACTCGCTCGCTCTCTTCCCCGCTCGACCTGCACCCAGCATGTCCATGGCG
TCCAAATTCGACCTAGGCAACGCCTTCCCTGCCTAAGCGACGACTTGGAC
GCCTCAAAGGTACAATTTGGACGCCTAACGCACGATTCTAAGGCGAGGAC
GGCGCCTTGCCCTCCCAGGGAGCCCTGACGCTTAGGCGTCGCCTTCAAAA
CCATGAAATAAATGAATTTTATCATGCATGTTTACCTAATGCACATATAA
TTTTAATACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTTGGATTTGTCTAGATT
CGGATGTAATCCAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACATTTATAA
TGGTTTCTCTAGATTTTCAGGGGTTTCCTCAACGGCATGTAGGTTTTTTG
CATCATATGTTTAAAATGCCTTTATACTTGATGTTGAATTGCTGGTATTT
ACTAGTGACGTGTGGATGCAGTTGAGGCTACTGCTGGGTATGAGTGTGAT
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TGCCTACTCAATTTCCATTTTAGCTTGCTGTTTACCATACATGTATTTGT
TTCTCAGGCATTATACGTTAAATTTCCAAATTGGGATGGGTGGTAGACTG
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TTCCCACCAAATAGTGGATGTCCAGGTCTCACCTTATTGTCCATACAGGC
GGGATCTTATTCAAGGTATACATTGTTGGTGAAACAATACGGGTTGTACG
CCGGTTTTCTCTTCCTGATGTTAACGGCTATGACATTGAAAACAATGAGG
GGATCTTTCGGTTCCCAAGAGTTTCCTGCGCAACAAATAGCGCAGAAGAT
GCAGACATTGACCCTTGTATATCAGGTGAGGCTTCTTTGCTGGTGCATTA
ATTGTCTTCCCATTTTGGTTTAAACTAGTGCATCTAGCTCGCAGGTGAGG
CTTCTTTGCTGGTGCATTAATTAACTCCCCCTTTTGGTTTAAACTAGTTG
CATGGGGACTTTTTGTGGGAACACCAGTCTTGTCATTACAAATTGTTTGT
GCTATCGGACCCTCTGTATGGTACACTAAAAGGGTGTTTTCGGTTGAGGT
CATGAAGTGGAATGTAATGGAATGGTTTCACACCTGAGAGTTGTTCGAGT
GTTTGGTTGAGAAATGGAATGGAACGAGATGATTCCTTAAAAGAGAATAT
TCCCTCTAGATCCAGAGCGCAGCCATTCCTCTAAAGTCACCCAAACTTGC
TCACTCTATTCTCTTGCCACCCTTTTTGCTAAATGCACCCCATGCTTGCT
CACCTGTTTTGTTCCCATAATCTATTGCATTCCATTCAATTTTTTGGCCC
AACCAAACATAGAACGGAACCATTCCATTACACTTCTTTGTCCTAACCAA
ACGCGAGAACGGAACCAACCCATTCTAGTGGAATGGAACCATGACATTCC
ATTCCACTTCGCTCCCGAACTGAACACACCACATGGTTCCATTCCACTTC
GCTCCCGAACTGAACACACCCTATAGCTTTTTACATCTGTGGTTTTTTAA
AGATCTCTAGTGCTGAAGTTTTTCAGACTCACATAATAGTCTCTATAATT
TTCTTGTTAATCATTTGTGTTACTGAATAGAACTTAATGCTATCACGTGA
CAGAACTTCCTCCAAGACCACTTTTAGAAAATCTGGGCAAAGAACTTCGG
CGACGACTGGTAAGAGTAAATTTCATTGTCTGTTAGCAAAGTGCAAATTC
TGTAATCACTTAAACTGACATTTTAAAAATTCCAGGGTCTTAGACTGTTT
AACTTAGACATGATTAGGGAGCATGGTAGAAAGGATCGGTACTATGTAAT
TGACATTAACTATTTCCCTGGTGAGTTACTCTTCTAGACTTATTTTAACC
TCTATTGCCTTTGCTAGTACTCTACTTGTTGCGCATAAGTTATTGCATAA
GCTGCTTACCTTGTTTAGTCGCTGTGTTATTCTAGGTTCAAGGTAATACT
GCACTTTCTCAATGGCGAACTTTTTGCTTCTAGCATGTCACCTAAGCACT
ATTTTGCTACCTAGTGCTGTGTTTATCTAATTGTCCCAGTTGAAACTCTG
CAGGATATGGTAAAATGCCAGGCTATGAGCACGTATTCACCGACTTCCTC
CTAGGCCTAGTGCAAAGCAAGTACAAGAGGCGTTTAAGCGGGAGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.