Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA027610

[Submit comment/correction]

Sequence	AA027610
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA027610
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCGGTGTGGCGAGGCTACAGAGTGGTGCAATGCCACGAGGTTGGCGT GCAGGTAGGAGACGGTGTTGCTGGGCGATGTCTGGCGCACGCGGTGGACA CAGTGAAGGCAGGAAGGCGTCAAAGTTGAAGGCGAGGGGAGACAATTCTT TGGTTTCCTTTTCTTTGATCAAAATCGCGTGATTGCAGGGACATGGGATT GTGAGTTCGAATATTCCTCTGACCGTGGAGTACGGTCAGTCATTGTAATT TGCTAAATGCACACCGTAGAACATTAGACAAATGATAGCTGTTAGATTGA GGTTAGTGTGCCTAATCGTGCGTTGTTGATTGCTTGGTGTGACGTAAGCG GGGTGTACATAAAAAAATTCATGTTTGCTTCTTTAATAGTAGTGGAGATA AGTTTTTTTTAGCAAACTAGGCTTATATTATAAAACGAAGATGCCCTACA GCCCATTTGGTAAAGAAAAATAGCCCACCGCGGCCTAGTGTCGACTGTCG AGGAGATGCGTTCGATCGGACCACTGGGGAAACGAAACGGGATCTTTCGA AAAAGAAAGGATTGAGAAACGAAGTAGGCAGTAGCCGCGTCGAGTCTGTC GCCACCCACTGCGCCCCAAAGCCCCGCCGTTTCGAGCCTGTCGCCACCCA CTGCTCCACAAAGCCCCGCCGTTTCGAGCCTGTCGCCGCGCCGCCGCCAC GCCGGTCGAGGTCCGTTAGGAGGTCGGCGAGAGCCACCGTCTTCTCCCGC GACATCTCCGCGGCCGCCGCCCGTGCTGCTCCTGCGACCGTCACAATGTG AGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTCCGCCTCCCTACCCTTA ATCTTCTAATTAATCAGCGCTCTAGGTTTTTTAGAGAACAAACCAATCAA TGTTGCAGTTTAGCCATTACTAACCGTGGTTTTTGGATAGGTTGTCCTTT GTGATGTTTTTATATAACCAAATCCGCTGTCAACTGAACTCGTCATTCTC ACTTGCACTTGAAAGAAAAGGGACAACTTTTATCACCACCCAGAACTTTC ATATAACAGTATAGTTTCCACATGTAAACTATGCAGGAAGAGGATGGTTG CCTGTAGTGAATAAGTTGTTTCAATTCTTGGAAAAGTCTGTAGTTTAAGT TGCTTCAGAGATAGGCATTGCACACATGCGGCTGACTTTCAGATGTTCCT CATAACTGCCTAAATATCCTTCATTTTAATATAATATTTGATGTTCATAT TATTTCTAGCAAAACGTACAACTTGAATAATGTCAAAACGAGGAGCAAAT ATGGGCCACCATTGCTAATAGACTTGGACTTCAGAGAGATTTCTTTGTAT GGACATTCCGACTAGATGCCAGACCTAGGAAAACTAGCAATCGGTTGTAG GTAATCTACACACGCCAACGTGTGTCTTGTTGTTAGAGTATGGTATTACT AATAAACTACAAAATAGGGCAATCCGATTTTTATAACCAGGTTATCCAAC CTATTAAATATAGTTATCCAACTTATTGTTATTTATTTTATTATGAACAT ATAGTATGTGAATGTTATCGTTGTCTACCAGATGGTTATTAGTGTTTTAT TATATTTTTTATTATCTTAGTGTTTTATGCGTTCTTAATGTAGAAATTTT AATGCTTGCTAATTTTTTATGTATAATTTAAGTCTAAAGCATGTTAATTT GCACATCATTCATACGTTGTATACCCATATTGTTAAAATACATTTGCTTA AACATCCATGTCCTGTAAATGTAAGTTTACACATTAATTGGTACTGTTAT ATAACATTTGGTTTCATGTGGTCTTTATTGATAATATATTTCTCATATTC ATGTGATATAGGTCTATTTTTCTGACCCGACTCCGATCTGTTCGTAATCC TGTATTTGAATCTACTGACACTATCCGACCGCAGCCTCTCATGTTTCACA TTGAATGACAATCGATTCATGTTTCCATAGTGATTCATGGTTGATATACC GTTTGGCCTTCAGTTATTTATATTATTCTTATATTGATGAAAATATTATA TTCTAGGATGAACTAGGTAATATTTACTGCCACATGTTTATATTTCTAAG TTTGCTTGATTTTTGTTGTAAAATATTGTATGTATGTCATCATACCATGT TTGCACAGAAATGAACTATTTTTTATTTCTGTGTTGTAGGGTTGAAATGG AGGAATTGTACCGTGAGGTTTCTGAGAAGGTATCTAACAGTATTGCGATC GTCCGTTCACGAGGCCTCTATTGTATTGGCTCTGTAGTTCACAGCACAGT GGATACCACATTGATCTTGACATCGTCTTCTCTCATTAGGAAAGACACCC AAATAGATGTTCACTTTCATGATAACACTGTAGCTCCAGCAAGAACATTA GTGGTAGGAGATAGATTCACTTTACTAGCCGTTGAATCTAGAGTTGCTTG TAGTGTGATTCAGTTTAGCGAAAAAGATATTGATATCGTCTCTGAAGCTC TTGTTCTGTCTCCCACATCTGTGTCCACTTTGTCACATATTCCATCATTT GTGATACAACCTTCATGTGCTGCAAGAGATGACAAAATGGTTAACATTCA AGAATCCGAGCAGTACTTTCTGATCTCATGTCACTATGGGGGCTCAATCG ATAGTGGATATCACAATATGTTAGTATCTGCTCCGGTTTTTGATATGAGT GGCAAGACCATTGGGCTTGTGACTTCTCAGTGTGGCGAGGAGAAGAACAA AGTTGATATCAAGATTGGACTTTCAGCCTCCAATGCTCGGGTAAAACAAA TTTCAGTTGAGATCAAGTTGATAAAAACATATAATCTATATCTGACCTTT GTGATATGATCAACAAATATGCAGAAAAGCTTTCTTGATCTACTTGAGAA AAGCAAGCAACAAGAAAAGGTAGCTCGGAGCCCCGAGGAAAACAAGAAAC AGGAAAGGGTAGCTGAGACTGGGAGCTCTGCAGGTCCAAGGTAAGCGGCC ATTAACAGTACCCGAGTTGTTTTGCAACAAGGTACTAGTATATAACTCTT AGGAACCCACACTTGTAACTTGGCTTTCTTTTGCCAAAACAAATAAAGTG AAAAAACTAGGATGTACATGTACTAGTAGCACTTTGTTGGTGTTGATAGG TGGGAAAAAACCTTGGATAAAAACAGAAACCATATATAAATTATTTCTGT CTGGTTGATGTCCTATTCATGTCATGATGGACAATATTAATTCTTCTCAA AAATATGTTGAGTGAAATGCATTAGAACTCTTGAAACTATTCGAGGGGTC TGAATAGTCCTAAAACACCAAAAGTGTAGATTCAGGTCCCAAAAGTGGAC ACATCAAGTCAATGTGTGGGTTGACCTGTCGGTGGCAAAGTTGAATTTGC CTCGATGGTGAACACCTCCTGATGGATGGAGTCTGGGGGTGGCGTGGAGG CATAGGCCGATGACGGTGCCGGCTCAAGCAAGGAAGGCGGCGGCGCAGTG TAGAAAAGGGGAGGATAGAGGAGGTGGCTGTGTTGGTCGTTGTCAGTGGG CAATGACATGTGCTCTTATGTCGCTCGCTTGGGCACAGGCAGTGGTGGAG TCTACCCGAAGGGATAGCCTGGGCAAACAAGAGGGTTCTGACTGATTGCC TTTTGCCCACTGAAACCTTTCATCAACTACCCTATACCTTCTATTACTTC AAACGATTTTGACAGAGAGTTTCCCAGGCTGAAGCTCTGCTACTCGCACA GGTCAAGACAGGGAAGGAAGGAGATAGAGGGACCGCTAGTGAGAATGAGA GCCATGCCTTACATACTTTCTAAGTATTAGGACCTTATGGTGCATTTCAG TCATATGTCACGTAGATCAACCTAAATGCTTTTGGTGACCTTTTACGATG CAATGATGCAATCAGGTACATATATTACATTGGATTATAAGTTCTCTAAA TAAAAAATGTAAGTGTGTGGTAGCTGAGACATTTAGGAAACATGAATTCA TAGCTTGCTTGCATATTATAAAACTGCTGTCTAGGAAACATTAATATGCT AGTAGCACTTGTATTCTTTCTTCATATTTGGCTGAAAATTTGTTAAATTC AGGAAACTAGTGATGATGATTTTATATACTAGAAGTCATTGCTTACGTCT AGATGTTTTATTTTTCGACGATGAACCGATTACTTCGGTGATGAGCAATA ATAGTAATTTGACATTACTGGAGAGCTCTTTAGTATTTGAAATTCCAAAA GGACAAGGCCACAGAATCGCAGAACTGAAGGACATGACACAGCTGACTGA AATTTTACATGTTAGGAATCTTGAGAATGTTGTGAAGGTTGATGCTTTAA AAGCTAAGATGAACACAAAAGCACACCTACAACGGTTGATTATGGAATGG TCTTCTAGTCATATTGGTAATGCAGAATTTAGCAACGCTGAGTGATCAGA AGCAACAATGATTATTGGATCACTTGAGCCTCACCCCAACCTTCCCAGTT TGAAACTGAAGTACTACGGTGGCATCCAAACACCATCTTGGTTACAAGCT GGAACTCTTTGCTGCTTGACTGAACTCAGTCTCTCGAACTGCCCTTTCCT AAATGAAGTAACCAGCCTCAGAGGAGTTTGCATATCATAGGATGCAGAAA CTTGAGGAGCCTCGATTAGTGTCTACAGCCACAGAGCTTGCAGGGAATCA ATGAAATAACTGTCATGAATTGCTCAAAACTATCCTTGGTCCCTGTCGAG AGATTACACGGCTTTGCTTCTCTTCACATATTGGAAATATAAAATTGTCC AGAGCTTCCACCCACAAGGAATTGACCCTGCCACCATCTATGGAGGAGTT TCTTATAAGGTCAAGCGTCTATGTTGCTGCATCACTTTCTTCCTGCTTGC ATAATCTGCCTTTACTCGTAAACCTGTATTTAAACAAATGTCCTAAATTA TTATCCCTCCCAGCAGAAATAGTTTCGCAGCTGCAATCACTCCGCGTGGA TGTATGTCAATAACTGCAGCTGCCTGCAATCCTTTGGTAGGTTGCACCAC CTTTCTTCACTCATCAATCTGCACATTGTGAACTGTCCTAGATTGACAGA CCTTGATCCCTCTATGTTTCTCGACATCAGTGAAGACCAGGGATTGCAAA AGCTAGAGTGCCTAACTATCAGTATCACCTCTCTTAGCCTGATGATGAGA AGTTCAGTGCTCTTACAACCCTTGCCCTCTACCAGGCTACTGACTCCCTG ATTGTTCATGGCCCTCGCAACGAGTTGTGTCGGTGTTTTCCGTCATTGGA GGAGCTATTGTTTCAGGACTGTGGAAATCTTCTTGCGCTCCCCGAAGAAT TGCACACTCTGTCCTTTCTCCAGTTCTTGCGGATATTCAACTGTCCGAAG ATTCAGTCGTTGCAACATAAGGGCTTGCCGCGCTCCTTGAGAACATTGTC ATTCGAGAAATGCCACCCATTGCTGGAGGAGCAGTTAAAGAAACTGACGT TTTCCTTCAATACGGCATAGTCTCTGTAACTCCGCTGTCAGAGCAAGAAT CAGCTTGTGTGCTTGAAATTTGCATGCAGCTTACTGAGTTAAGCTTGCAG CTTTGAGACATGGCAGCCATAATATTTCTATAGGACTGTCCTTTTCAATT TTCATTTGGATAATTTGACCTGTCCCAGTTACTCAAATAACACCAAATGT GTGCAGTTGGTTCGGGTTGTGTGCTAGAATTCTGCATGCGGATAACTGCA TTAGCTTTCAGAGTTTGACAGAGTGTAACCATAATCTTTGTTGAAGCCCT GTTCTTGCCAATTCATTAGGATAGCCTTTTTGTTTCAGGAACTCAAATTT TACATTTAGATGTGAAAGTATGGGTCATCTTTCAATATCAAATCGCACGC TGATTGACTGAACTTGTAAAACAAATTTCTGTTTCTTGGTGTATTTATGT AAGGTTGTTGGTTTTGTTGAACTGTGGGTGTTTGTAGTTGATGAAAACAT TATCTCCATTTTCTGTTTGAGTCTAAGTCTTATCTTGTTTTATGTATTTT TATAGCACGAGGAAGAGGAAACTCAGGAGGTTGGGATAGTATGATTGTGG GTAAGATGATCTACGCTTAGCATGGTGTATTCATTGTGAGTGTGCTCTTA CTAAAGCCCTCTTGTTATTTTTCATTCATGCAGATATGTCCGCTGCTATA TTATCAGCTAACTGAATCTAACCCGGGTTATGTACTTGTGCAGGAAGAGA AGAAACTGATGGTGAGGCAGATGATTAACCCGGGTTATGTACTTGTTTAA TGCTTTCTAGTACAATCCTGGCAGTGATGTATGACCGTACAACCTTCCAA TTGTGCTGGGACGAAAGCAAAACATCTTTTGTTGGTGTCTGACAAGCGTG TCTTGTCACATTTTTTGGCCACTTCTAGCTTCCAAGTGTGTTGGGAGCCT GGGACAAGCACATAAGGCTCTCTTTTTTGTTATGGTGGGAAGCATGTCTC CTGACATCCACACTGGATCTTGCCACGCTATCAATTTCCCTTTGCCAAGT TTAGGCAATTTTGTTAGTAGTGGTCTTCCATTTGTGTTGGTACATTACAA AGATTGCTGCTGTCAGAGTTTTGTTTGCAACTGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.