Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002186

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002186
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002186
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTTGCTGGGATCATCGACCGACCACCGCCGTGTCGAGTCTACCCCCACT
CTTCCTTCTCCCAGATCTCTCCGCCCATGAAGTGCCACTCGGTGGCTGCG
CTCTGGCCGCCGTCGCCGCCGTCCCACCAAATCACTGCCGTCGCGGCCAC
CGCCGACGCGCTCTTCACCGGCGCCGCCGACGGCACCGTCCTCCACTGGC
CTCTCCCTCCTTCCCCGCCCTTCCACCCGCGCCCCTCCTCCCTCCTCTGC
GCCCACGCCGCAGCCATCACTGCCCTCTGCCCCCTCCCAACCCCCGCCTC
CCTCCTCGTGTCCTGCACCGGCGGCGTCCTATCCCTCTTCTCCGCCTCCG
CCTCCCTCCGCTGCCTCCGTCGCCGCTCGCTCCCGCCCTGGGCCGGCTCC
CCTTCCTTCGTCGCACCTCTACTCCCTTCCTCCCCCTCCTCCTCCTCCGC
TTCGTCAAACCCCCGGGTCGCGATCCTCTGCCATGCCCACGACGACGGCC
ATGGTCACCGGCACGTGTCCGCAGTTGTGGTCGTCGACGCACGCACCCTC
GCAGTCCTTCACACCGTCTTCCACGGCGCCCTCTCTGTCGGGTCCCCGAG
GGCGATCGCGCTCACGTTCTGCAGTGGCGATAATGCCGTTAGCGTTGTGC
TGGCTGACGCGCAGGGGCGGGCGCAGATGGTGCCAGTGGAGGGCGCGACC
GTCGAGGGTGACTCGCCAAGGCGGCTAAGCGCGAGCTCCTTGTCCAGCGT
TGCGTCCGCAGAGGCGCCGGATGGTGTGGTGGAGGCTGTGGCACTATCTG
ATGACGGGAAGGTTGTTGCTTTGGTGCTGAAGACGAGCTGTTTGTTGAAA
TGCGTCGTCGAGGGTTCTGTGCTGGGCGAGGTGTCTCTGGCAAATACTCC
TCTATGCAAAGAGGAAGAACCAGGGATCAAGGGCTGCCTTGCTGGTGGTT
TGTTTCTCCACGGTGGGGAATGGGGAGCCCGGCATTTGGAGGATGGCAAT
TTGGTCAGGAGCTTGGTCTTATGGAGTAGCAATGGTGGTGCCATTATTTA
CAGGGTTGCTGTTGGTACTCCATCGTTTTCCTGTGAGGCGGTGTGCCAAG
TTCCTGGTATTGCATCTGAGCAGGGAGAGATGTCATCTGCTGTTCAGTGT
TGCCAGATGGGCAACTGTCTTATCAGGGTGGAGTCTCGAGCGTATAAGAT
TGGCGGGTCCTTTTTGTGGAAACCTTTTATCTCCATATGGTCTATGGATC
AACTAGAGTTGGGCATTGTAATGAACACAGAGAGCCTACCTTTCAGCAAA
GTTCTTGGAGAAGGCAGTCTCCAGGGAGAAGAATTTAGGTCAGATACTTC
TCATTCACTGCACAAGTCGGACAATGGAGTGGAAATGAGTTCACAGATGT
GCAATGGATTGGGTATGTATGGAAGCACCGTGTCCTCTTCGATGGTACTT
TCTGAGGATTCTTATGCTCCATATGCTATAGTTTATGGTCTCCATAATGG
TGACATAGAAGTTATAAGATTTCTCAACCTGTTACCAGCTGCAAAATTTG
GTGGAGGGGTTTACCCACATATTTCTGAAAAGGTTTTTGTGGGGCACAAG
GGAGCAATTCTTTGCTTGGCTGCACACCACATGCATGCACACTCTGACTC
CAGAAGCTTTCAACGAGCACTCATATCGGGGAGTTTGGATTGTACGATTC
GTGTCTGGGATCTTGATGCTGGCACCCTCCTTTCTGTGATGCATCACCAT
GTTGCGCCGGTTAAGCAAATAATACTACCACCAGCTTGTACTCATCATCC
TTGGGATGATTGTTTTGTTTCTGTTGGAGAAGATGGCCTTGTAGCGCTTG
TTTCTCTTCAAACCATGCGTGTTGAGAGGATGTTTCCTGGGCATTATTGT
TGCCCATCAATGGTTGCTTGGGATGGAGTAAAAGGGTACATTGCTTGTTT
ATGCCGTAGTATGCACTCTAGTAATGACGTGGGTAGCATATTGTACATCT
GGGATATGAAAACAGGTGCTCAAGAACGAATTATTAGGGGCACAACATCT
CAATCATTTTTTGAACACTTCTGTAGGGGTATTTCCAAAAATGCAGTTAG
TGGCGGCATATTGGGAGGGACAACTTCAGCATCTTCCTTACTTGCTCCAG
TTTTGAAAGACACCGCCCTCCATCAGTCTCGTGCAAATAGAAATGAGCTT
AACATTTCACCTGTAGCAAAGAACCATCACACTGCTGCAGATTCTTTAGT
GTTGGGCGCCTTTACTGCACATGATGTGAAGGGGAAGACATCAGCTCCAG
ATGATAGAGATAACTCTTCATATAGTTCAGGAAAGGTTGGCTCTGCCAAG
ATCATAAACAAAAGAAGAAAGTATCCCATAAAGTGCTCTTGTCCTTATCC
TGGCATTGCAAGTCTGAGATTTGACCTCACAGAAATCATGTCCACACAAG
GAAGTTTTAGTGATAGGCAGTCTAGGGATCATCTTTATGGTGATGATACC
AAAGAAACCATACAGTCTGGATCTTTAGATAATATTTCTGGGATCCAAGA
AATGGATAGCCCATCTAGAGAGTCATTGGAAGGGCAATTACTTCGATTCA
GTCTCTGTTTTCTGCACTTGTGGGATGTTGATTGTGAGCTGGACAAATTA
ATTGTAGATGAGATGCAAGTTTGCAAGCCAGAAGGCTGTCATATAGCTAC
AGGGGTGGTAGGGGATAGAGGCGCGTTTACATTGATGTTCCCGGGGAAAG
AAGCCACTCTTGAAGTAAGCTGTTTACTGCGTATTTGTTTGTTTAAGCAC
ATCTGGGGTCTAAACATGATAAAATTTTCTGCTTCAGCTTTGGAAGTCGT
CTGCTGAATTTTGTGCTATGAGATCGCTGTCAATTGTTTCTCTTGCCCAA
CGCATGATCACGTTATCTCGTTCTTGTACAAATGCTAGCAGGTACTGAGT
CATCTTTCCTTTCCATTTCGTGTGGGTTCATATTCTGCATAGCATGAGAC
TGGCATCTTTCATTTGGTTTGTTGGAGTGTTGCAGAAAATATTTTATTTT
GATAGAAAACATTGCCAAAAAAAGGTGCCAAAATCTTGAACATGTCTGGG
TATGTTTTGAGCATATCTATACTGCACTAGTAATTTAACCCTGGATTCTC
AAGTTCTACCAATGAGCGCCAACTATTTGGGAACTGTTAAATTGTTTTGG
TAAATGGTAACTAGCATTTGTATTGTGCCACATCGTGGTTGGCTTTGCCG
TGAAAAATATGAACTTTTGTGGCTTGAAAGATTAGTATCAAATTCATGTT
TTTTTCTTATATACACCGCGTGTCTTGCTGCAGTGCCTTGGCAGCCTTTT
ATACAAGGCACTTTGCTGAGAAAGTTCCAGATATCAAGCCCCCTTCCCTC
CAGGTACTATATTTGTTCACACATCTTTTCTTGCAGTTTATGATATTTTT
TTCTTTACCGAAACCAATGTCTTTGATGATATTTATTATGTGAAAATAAT
AATACAGAAACTGGAGTTATATTTCTGTTCTTGCAGTGTCTTGTAGGAAA
TCAAGTGACGATACGTGAGGTACTACTCATAGGTGAAAGCTTAGTTCATA
CCTGTGATACTCCCAGCCCAGTTGACTTAGTTTAGTTGGACCTTTTGGTG
TTACGACATTAAGATATTGCCCTCGTTTCTTTTGTTTGTCATGGGTTAGG
TGTGGGATGATGGAATGTAGGGGGGTAGGGTCTTATAAATAAACCAATGA
CAGAGCAAATAGACTGGTTCTAGATGTACAAAATATGGTAATGTACACTT
ACAACTAGGTCCCGATCACCCCCTAAGTTTGTATGTCTATATCCACTTGA
ATTGGTCTAGTATATAACCCTCTAGGAACAAGAATAAGGCTGGATTAATC
TGTTCAAGGTAAACAACAAAGACAAAAAGTTTAGCTGCTGGTGCACATTT
GGACCTTGGCTCATGACAATTCATTACCACATCAAAAGTACTCATGCATA
AATGGTGATGAGCCGTATTCACCCAAGTGATACTTCAGGACCAAATAGTT
GTACTTAGCTCCATCCCAGATATTCTGCTCTGTCTATTTACTCAATGGTA
ACTAGCAGCACCTTACAAGTAGATCCCTAGCCTGGTAAATTGATTATGTC
ATATACGTACATGTATTTGTTAAATGAGTCTGCAACTGTCGTGTTCTGTG
GAGTTAGGATGGAATCATCTGTAAACGAAGCTTTCTACGGAGAGGGATCA
ACTGGGCTTGGTTAAGGCCCTGGAACCTGTGTCCGCTAAGCGGGTGCAAC
TTTGAAAAAACTGTCATCACATCAGTCTTAGCAGCACCCCAACAGGTCTG
CAAGAATTTCGCTGTGAACCCATCCAGTCCGGGCGCCTTGCTGTGCTGAA
GAAGCCTTACGACCTCCTGTTCCTCCTCGCTAAAGGGGGCGTCGAGATCT
GACAGGTCTCCCGAGCGTGTATCTAGGAAGTCTAGGTCAAGCGAGAAGTC
CTGCTGCTCAGCCATACCAGTGAGCCAGTTGAAGTGATTATAAGATGCAT
CTGCCCTGGCCACGTGTTACATGACCACCGTGCCATTGACCATAATGTTA
TGGATCATGTTCTTCTGTCTCCTGTACGAAGTATTGTGGAAGAACACTGT
GTTCGCGTACACTTCATGCTCCTGTGCGATCCTTGAGTGCTGCTGAGACA
TATAGTGTGCTCAAGGGAAGCCAACCCGAGGCAAGGGCTTGAATGACAAA
CTGCTTTCATTCTACCTATACATATAGGATAACCCTGTGACTTCTCTAAG
TTCATTTATACATTTATTATAGGAAATAAACCCGTGTCTTTGTAATCTTT
TCACTGCTGCATACTTGTATTTTCTTGCTAAGTACTACCTCTGTTTCAAA
TCATAAGACGTTTTGGAAGGACCTAGTTTTCCAAAACATCTTATAATTTA
GAACAGAGAGGTGCATGATAAGCACTGTCATCTGCTTGCAAATATTATAT
TTCTTAACTGAGTGGTGTCTGGTGTGTATATTTACAGCTTCTGGTGAGCT
TTTGGCAACATCCTTGTGAACATGTACGAATGGCTGCTCGCTCCTTATTT
CACTGCTCAGCTCCTCGTTCTGTTCCACAACCCCTCCGCATACAGAGAAA
CAAATTTCCTAATGCCCACTTGTCGTCATCTGGTCTTGTGGACAACCTTA
TCCCCGCGATGCAGAATGCCTCTGTATCTAGTTATGGACAGTTGAAGACG
GATGGTGAAATTTTTGATAGGGACGATGATGATGATACTTCTCAGATAAG
CTCATGGCTGGAATCATTAGAGAATCAGGAGTGGCTATCTTGGATTGGAG
GAACAAGTCAGGATGCAGTGGCATCAAATATCATTGTTGCAGCTGCTTTC
GTTGTTTGGTACCCGAGCATTGTGAAAGTTAAGCTTGCAAAGTTGGTTGT
TAATCAACTAATCAAGTTAGTTATGTCGATGAATGATCGTTACAGTTCAA
CTGCAGCTGAACTTCTAGCAGAGGGAATGCAAAGCACATGGAAAGCATGT
TTGGGTACTGACATCGCTCATTTCTTGAGTGATGTCCTTTTCCAAATTGA
GTGCCTAAGCAGTGCACCTTCTAACAATGCCATCTATAAAACTGCAGTTG
CTGTTACGATGAGGGAAGCATTGGTTGGTACCCTTCTACCAAGCTTGGCT
ATGGCTGACATAATGGGATTTTTCGGTGTAATACAAAGTCAAATTTGGGC
TACTTCATCTGATTCACCAGTTCATGTAGTTTCACTCAAAACCCTCATCC
GAGTAGTTCGAGGCTCTCCAAAGGCCCTGGCTCCTTATCTTGACAAGGTA
TGCACCGTATCCTCATTGCACAATTTACCATATGTAAATTGTATCCTCAT
TTTACACATTATAAATTTCTTATATGGGTTGTTGTAATCACTATACATTG
TGGATTCCAACCTTATAGGAACAATTTTTATTTTGCATTGTCTTTTTGTT
AAATTCCACGACCCTAAAGTCTACTATGTGTTCTCTTTGAAGTTCTAGTA
AAACATTTGTACAGCACTCAAAATGCATTTGGTACATCATGGAAATCACT
GGGTAGCTCAATAGTTCGCACACATTGTTTTGTTGCCAAACCCCCTGGTT
CGAATTCCATCTCCCTGAAAAAGTCAAGGGGATATTATGCCTGATATTTT
TCATTTGGTACAACATGATATTTGTAAACCTCAGTTTAGTGTTGGGAGAA
ACAAGTAGGACCTGGTTCAGTCAAGCTGAAATATCTATGATATATGTATG
GAAGCCTAACCGATTTCTTTTTGTTTGTAAGAGTTGGAACAATTGGTTAG
TGTAGTCATTTAAGGGTCTCAAGCTGGTCACACGTTCCTATCCTAGGATC
ATAGATTCATATTACTCCCAATCTGCAGTTGGTGGAGCCAAGAGATTTTG
GTACTTACTAGTAACTTGGTAGTAGTTAATAGTTTCTCCAAGTTAGAAGC
TTTCTAGAGTTGCAGCAAAATCGGTAGTATGTGAGTTGTACAATTCTCCG
ATGTATATTCCCGTAATTTTGTGGTTTACAAAGTTCTATTAGAAGACTAT
GGACATGTTCCAATTTTTATTTCTAGTTTTTCTTTAATTTTATCCAGCTA
TGTATAGTTTGAACTTTGTTTTATCAAGTTGTCCAGTACCACAGTGACGT
GCCATACCCAAACATTACATATCTACTAGAATATGTTATGCCCAAAAGGA
AAACCTTTTTCTATTGTGCAGGCAATTAGCTATATCCTACACACCATGGA
TCCAAGCAATCTAATAATGCGTAAAGCTTGCATTATTAGCTCAATGATGG
CTCTAAGAGAAATTGCTCGTGTTTTTCCAATGGTTGCTCTCAACGAGTCA
ATGACAAGATTAGCTGTCGGTGATGCTATCGGAGAGATCCACAGTGCCAC
AATTCGTGTTTATGACATAGAAAGGTACACTTATTTCAAGTCGCAGAAAG
TTGTACTTGTTGAGCTATTAAAATATGCAGAAAAATGACATATATGGCTT
CAGAGTTGTCATGGGAACTATGCATTGACACTTTTGTAGACAATTTAATA
TTTGAAAGTTCTTTTGGGATGTATTTCGTTCGTGTTGGCCCAAATGATAT
GATAACTATTCCGTGGAACTCGTTTTGAATCAAATGTATGACCTTAATTC
TTTGTAGCACTATTGTTGATTTATGATGATATGAGTTCTCTCCAAAAATA
AGCTTGAACTAGGAGGTGCTACTTTGTATTTTGTTCATCTCAATGTTTCC
ATTTTTTCCTTGCAGTGTCACAAAAATAAGGATTCTCGATGCATGCGGAC
CACCAGGTCTTCCAAGCTTTCTTGAAGGACCATCAGATACAACAACCACC
ATACTGATTACAGCTTTGAGTTTATCGCCGGATGGAGAGGTTTGATATTG
TGATGTGCATACAAGAATCAGAATATTTTAATGAAAGCCATACATGTTTA
TATTATGCATATAGCTTGTGTTGGCTTAAGATTACCTCCCAAGTGTATCT
AAATATCTCTGCAGTACATTGGTATATACAAATTATGTCACACATGTCAC
ACTTAAGTATTTTTACTAGAGTTTTGCTGAATCTTACATTCCATGTTACA
TTATTGCTCTTGCACAAGGGATAATGTCAGAAGAAACGTATGCAGATATA
GCAACATCTATTTGACTATTTTGGCCAAGTATATGAGCATCACTCTTGCA
CTCAGAGGGAATCCTGACAGTTTATGCCAAAGTTGATCCTGTTGCACCAC
ATGATCACTAATTAGAGAAAATGGAATTATTCTCTCTTGAAGTAATTATC
CTAGATGGCTTATCACAGAGCGTAGGAAACATTTATGGTATGTCTGGTCA
ATAAATTATTGTCCAGTAGCTACTTAGGGATATCCCTATGTCCAAAGTGG
CTACGGGATATCGATTACTTCCTTTTTTTTCCTTTTTAAAGAGGGGCATT
CTATGTCCAATATCTCGAGCGAAGTATGGAGATCAGAATACATAGACTAG
TGATGAATGGAGAAAAGGGGAAAAAATCCGAATCTGTATCCCTTGTGATT
TTATGCCTATAGGGAGAAGGGTTTATGGCGTTACATGTTCCATGAAATAT
GTATCATGATGCATGTGTTGCTACTTGTAGTGAAAAAGGTGGTAGTTTCA
CCGAAGATTGAGTTATATGACAAACATAATCAACATTTTTTTTACCTATA
GTTTGTGTTGATGGTATGTTTTGACAGTATCTTTTACTCCTTTCTACCTA
GGGCCTTGTTGCTTTTTCCGAGAATGGATTGATGATTAGATGGTGGTCTC
TAGGTTCGGCCTGGTGGGAGAGGCTAAGCAGAAGCCTTACTCCTATCCAA
TGCACAAAGCTTATCTATGTTCCTCCATGGGAAGGATTTTCACCCAACTC
AGCTCGCCTAAGTATAATCTCTAACATCTTGGGACATGATAAACATGTAA
ATCCAGAGGTATATTTTCTACTAGTTTCTTCTCACTGATATGTTCTATTG
TTTGATGTTGGTGAATGATGTTGTTAAGCGTTTTTTTTTTTGTAATTGTC
AATCTTCAAGTGAAGGTACAGCCATACAAGGGACCAGACATGCCATTGCT
GTAATTTACTAATGTCATCTTTTGCATTGTTTATATTAGTCGGGGGAACG
ATTTGTGTGATGTATTGACTAAGCTCAATGGACCTGCAAAGCAACACATG
TGAATGATTTAAGGTCGTCAAATTAAGTTCATATATAGTCCTTAGAACAT
TCTGAATCCCAGTTGAGCCATCATTATAATTCATAAAGGATATTGCTTCT
CTGTGCTGATTGATTAGTTTTAGAATCCTCATCTCAACTCTAAATATCTT
GAAACAATTCACAAAGGATATTGCTTATTTGTACTACAACTGATTGTAAG
GGCAATGATGCTGTTGAGACTCGAGTCTTTAAGGATAATTTGCTTTCCCT
ATCCCATATTATGTTCTCTCTTTCTGTCTGGTGTTTGATGTGAAAGTACC
ATCTTCAGCTCTTTTATCATCTGTAGTATGTTAAGAACACATAATATCGG
TTATATTTCATGAAAACTTGCTGATTATTATTGTCTCCAGTTTTTTCATA
TTGACAGTCTGAGGTACAGTCATGTAAGTTGTCATTGGAGAATCATATTG
CTACTTTTATTTATTATGAAATATATGGTTCTGGGATTTGCAGACTAAGA
CGAGGGAACTAGATGAGGCTGATAATCTAAAACTGTTGCTACATAATCTT
GACCTTTCTTACCGCCTTCATTGGATTGGTGGAAAGGCCATTAAACTTAC
AAGGCATGGCCAGGAGTTGGGTACATTTCAGTTGTGATTGCATGACGAGT
TATGCCTTTATTGATGACTATGGATTTTGTTGAGTTGCCTTGGAAGTTTA
GTAGGCACATATGTACTGAAGTGTGACCGGAGTGGCCCAACGTTTTAGCC
AAACCATCAAGCAGACAGTCATATATCATGTAAGCCACTTCTCTTTGTCT
TTCAAGACATACTTGTGCACACAATTGGATAAACAGTGCATTGTATGTTT
CTAATGTACTATTGGAAAATTTGAAACGCAGCACCAACAGGATTATTGAT
TACATGGATGTCTTTGGAAGAGGCACTTCGTTTCACCATCATGCTACAAA
TGCAGCATGCTTTCTGGTTGGCAGACTGGAGACACTTTGGAGTTAGTGCC
AACATAAGGTAGAGTCTCTTGTTTCAGAAGTCTAAAGTGATAATACCTCA
TTCCATAATGTAAGCCTACCTCCGTTCCATAATGTAAGCCTTTCTAGCAG
TTCACTTACATTATGGAACGGAGGTAGTATTTGTTTTGGTGCCCCATTTA
AACTTGCTGGTCGACCAGCACTGACCATTCAATGTATCTAACTTTATGCT
CATGCTTGATGCTAAGACACAAGATGAGAAGTTTGAGGAAAGAATGTGAG
AATTTAAGTATTGTCTGTCATTTGTCTGGATAAGCCAGAATCATTTATAC
TATTAATTAATATTTTTGCACTACCACCTATACTTAATTTTAAGCAAGAT
TGAAACTAGGAATGGGAAATTGCCGAAGATAATTCAGTCTTTTCTAAGTT
GCTTGTCCTGATAAATATTTGTTCTTAGAGATAACTCATAATGTAATCAT
TCTGCAGTAAAGTTCGTGGGAACTGCCAAGAATCAGGAGCTTCTCTCAGT
TAACTATCAGCTGACTGGCCTGTAGAGCTGAAGGATATCAGTTTCTGGTA
GTAACTTGTTTGAGTTGCAGGCACACATCTTTCTTCATTCTGCTGCATGT
TATCGGTGTTGTACTGCCAGTCTGCTATTACAGATACCACCTGAAGAGAC
AACATGCAATTTTGAGACTACCGATATTGAAGGGAAATTTCACAAAATCA
GTATACTCTTATAACCGAGTATAGTTAACTCATGATTTATCTGCAAGGCA
GATATAACCAAGGTTGGTCTAAAGTGTTTTTTTTTCTGCGTTACAAGAGT
GTTGTATAGTGTAAAATATAAACGAATTTTCTTGTACAGGCAGTTTTTTT
TTGGTATTTATGCCCATGTAACAATATTTGTTGTGGGCTCATGTTGGAGT
TTTAGATGAACAGGGTTTTTAGAAGAACCTTTGTTCTCTTTCTTGCAAGG
TTGGACAGAAGTATTAGAATGGTTGAAGGTGATTGCGCATGGGTGATGGC
ACATTATATCCAGTGTCCTTTCCCCCATCCAATTCTCATTGTCACATATT
CAGTGCGTTGTTGTGCACGGTGCTCACCTGGCCCGTTCACTTGGTTGTGT
ATGCATCATTATATAGTTCGTGCAATATATATTCTGTAAATGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.