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GrainGenes Sequence Report: AA000170

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Sequence
AA000170
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000170
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTGCACCACGTCCAGCAAATTTAAGTGTTACGTGGCCTTTTAGACAGA
GAAAGCCTCACCGGTTCAGCCTTTTAGGAATAAACAAAGCCCAATAGACA
ATATATCTTATCTAATGGGCTAACGACATATGGGAGGCCTGAGCAAACGG
GCAGAAACAGATCAATTAACCGATCGTTTAGATGCGATAATCACGCACGC
GTTGGATCGGTGGTGTTGTAGACGAAATCCTCTGATCCTCTCTCCACGAC
GCGACTTGCTCAGCCCCTCCGGACTCACCGACGGCCGACGCATCTCTGTG
CTCACTACCGAGTATAGGATATTTGCCTGCCCAGCAGCCGATCAAGGATC
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GCTAGTTGTTTTGCAGGTCAGATAATGAGTTCTATTCTCAAAGAAATTGG
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AAGAGCAGATGGCTGTGGTCTTGCGGTATGTCAATAGTTTTGGAATTGTT
AAAGAGAGTTTTGTTGGTCTCGTTCATGTGAAAGAGACAACATCTTCATA
TCTCAAGTCCTCAATTGATTCTCTCTTTAAAAAATATAAGTTGAGCTTCA
AGCAAGTTCGAGGACAAGGATACGACGGTGCAAGCAATATGCGAGGTGAG
TTCAATGGCCTCCAAGCATTGATCATGAGGGAAAATAGCACGGCCTTTTA
TGTTCACTGTTTTGCACATCAACTTCAGTTAGTTGTGGTTGCTGTGGTGA
GAAAACACATAGGAATTGGAAGTTTTTTTAATATGATCTCTGTCTTGCTG
AATGTTGTGGGTGGATCTTCAAAGAGAAGAGACATGATTCGAGATATAAA
TCTTGAGGAAGTGCAAAAGGCCTTAGGTTGTGGGATGCTTAAAACTGGTA
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AGTTCGCACTATAAAACACTGAAAAGTTTGGTTGATATGTTTCAAGCAGT
TGTCAAAGTTTTAGAGTTTGTGGAAGAAGAAGACACGGATAGAACAAACA
GAGAGCAAGCAAATGGTCTTCTAGTGTACTTCCAATCATTTGATTTTGTC
TTCTTCTTGCATCTCATGTTGACTATATTAATAGTCACCAACACCTTATC
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TCTTTGATATCTGATGTGCAAGCATTTTGTGAGGAACATGATATTGTCTC
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CTTGATTGGCTAATTCAAGAATTTGATAGTCGTTTCAATGAGACATCCTC
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TTCGACTCTGTTGAACTGAGGGATCTAAGCCACCATCTACGCCTCTATAT
TGTTGACGTGCGAGCAGATGACAGATTCTCCAACATACAAGATATTGGCG
ATCTTTCTAAGACAATGGTTGAGACGAGGAAGCATATTTGTTATCCTTTA
GTTTATCGGCTGCTGAATCTAGTACTTGTGTTGCCTGTTGCCACTGCGAC
GGTCGAGAGGAGTTTCTCAGCGATGAAGCTCGTGAAAACTTATTTGCGTA
ATCGCCTCAATGATGATAGTTTGAGTGATAACGTCATCTGCTATGTGGAG
AAAGTAGAAATGAAGAGAGTCACCAATGATCAAGTCATCGATCGATTCAT
GAAAATAAGAAACCGTAAATATTAAAAGGTAAAACTCTCTAGCTTAAAAT
AATTTATCTTGTTATAATATTTCATTTGATAACTTGATTCTATGTTGCTA
ATTTGTAGATTATGGAGGATGCGAGGTTAGATGACGTTTCATCTATTATC
GGCTATCTTTTGTGAGTCACATGAACATCTGTTTATTTATTTTAGGAAGA
ACTTGATCGTTCTTATATGTGTGAGCATATCGTTTGTGCTTTGCATTGTG
GAAATCATTGTGCTAAGACTTGTTTAACGCAATGGTATTACTAAATATTT
TATTCAACTAAATATACCGCAAAGTCAATGTAAATCTTGTGCACCATGGT
AATTTTTCCCTAGATTCGCCCCTGCCGGTGTGTGGGCATGGGCGGAGCTA
CGTAGAGCTAGCCTGGTGCACATGCACCAGGGTCGAAAAAATTGTTTAAT
AGCGATTAGGCATCTGGTAATTGCGATGCACCAGGTTCTAGCGGCAGATG
TGCACCACGTCCAGCAAATTTAAGTGTTACGTGGCCTTTTAGACAGAGAA
AGCCTCACCGGTTCAGCCTTTTAGGAATAAACAAAGCCCAATAGACAATA
TATCTTATCTAATGGGCTAACGACATATGGGAGGCCTGAGCAAACGGGCA
GAAACAGATCAATTAACCGATCGTTTAGATGCGATAATCACGCACGCGTT
GGATCGGTGGTGTTGTAGACGAAATCCTCTGATCCTCTCTCCACGACGCG
ACTTGCTCAGCCCCTCCGGACTCACCGACGGCCGACGCATCTCTGTGCTC
ACTACCGAGTATAGGATATTTGCCTGCCCAGCAGCCGATCAAGGATCGTC
CTCTCGCCCTTCGCTCTATAATCCAATCACAACCCAAAGCTAAGGTACCA
GGACTACAACTCCATGACTTTTTCATCTATTTTTCAATTTTCTTGATTGT
TACGAAGTGGTTAAGTCAACTTATTTAATCGGTCTTTATCAAATACAGAT
ATGTCGATAGATAGGTTTCTTTTGAAGAGAAAAGCGCCATCGCAAAATCC
AGATGATTTAAATTGGGAAGAGGAGATTAAGTATGATCCGGGACAAAGGA
AAAAAATAGAAGATTATCATCCGAATCTCAAGGACTTGGTGAGAAGAAAG
TACTTAATTAATGGACCTTGTCAACCTCGCACTTACGAATTTCCGTATAC
ACTGATTGGGGGTAGGAATAGAAGGTTTAATCCTGAATGGTTTGATGAGT
TTGGTAGTTGGCTGGAGTACAGCGAGTCCAAAGACAAGGCATACTGCTTT
TGTTGCTTCTTATTTAGGGACCGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGGCTACGA
GGCATTTGTCGTTAATGGCTGGAATGCATGGAACAATAAAAATAGACTGA
AAGATCATATTGGTGAAGTTGGCAGTGTCCACAATCAAGCCCTAAAAAAT
TGTGATGCATTGTTGAGAAGAGATGAACACATTGATGTTGCTATACAGGT
GCAAAGTGAAGCTGCAAAGATTGCTTATTTTACGCGACTAAATTCTTCAA
TTGACACAGCTAGATTGTTACTGAAACAAGGATTGCCATTCCGAGGCCAT
GATGAGTCAAAAGATTCACTCAATAAAGGGAACTTCAGGGAAGTTCGTGA
TGTCCTAGCAGAGCATAATCCAGCTTATGGCAAGGCACTGGGCCAAGATG
CTGCAGGTAATTCTGTTATGGTGTCCCCTGAGGTCCAAAAAGATATTGCT
AGTTGTTTTGCAGGTCAGATAATGAGTTCTATTCTCAAAGAAATTGGCCA
TGGTGTCTTTTGCTTGCTTGTCGATGAGTCTAGAGATGTCTCTTGCAAAG
AGCAGATGGCTGTGGTCTTGCGGTATGTCAATAGTTTTGGAATTGTTAAA
GAGAGTTTTGTTGGTCTCGTTCATGTGAAAGAGACAACATCTTCATATCT
CAAGTCCTCAATTGATTCTCTCTTTAAAAAATATAAGTTGAGCTTCAAGC
AAGTTCGAGGACAAGGATACGACGGTGCAAGCAATATGCGAGGTGAGTTC
AATGGCCTCCAAGCATTGATCATGAGGGAAAATAGCACGGCCTTTTATGT
TCACTGTTTTGCACATCAACTTCAGTTAGTTGTGGTTGCTGTGGTGAGAA
AACACATAGGAATTGGAAGTTTTTTTAATATGATCTCTGTCTTGCTGAAT
GTTGTGGGTGGATCTTCAAAGAGAAGAGACATGATTCGAGATATAAATCT
TGAGGAAGTGCAAAAGGCCTTAGGTTGTGGGATGCTTAAAACTGGTACGG
GCTTAAATCAAGAGCAATGTCTTCAGAGACCCGGAGACACTCGTTGGAGT
TCGCACTATAAAACACTGAAAAGTTTGGTTGATATGTTTCAAGCAGTTGT
CAAAGTTTTAGAGTTTGTGGAAGAAGAAGACACGGATAGAACAAACAGAG
AGCAAGCAAATGGTCTTCTAGTGTACTTCCAATCATTTGATTTTGTCTTC
TTCTTGCATCTCATGTTGACTATATTAATAGTCACCAACACCTTATCATT
AGCTCTCCAACGGAAGGACCAAGATATTGTGAATGCCATGAACTGTGTCA
AGTCAACTAGAAGTCATTTGGTTGATCTTAGAGAAAGCGGATGGGACTCT
TTGATATCTGATGTGCAAGCATTTTGTGAGGAACATGATATTGTCTCGTT
AGAGATGGAAGATGATTATGTCAATCCTAAGAAGAAACGACAAAAGACTG
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GATTGGCTAATTCAAGAATTTGATAGTCGTTTCAATGAGACATCCTCCAA
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TTAATTTGGAGAATCTAATGAGCCTGGCTAAACTATATCCTAATGATTTC
GACTCTGTTGAACTGAGGGATCTAAGCCACCATCTACGCCTCTATATTGT
TGACGTGCGAGCAGATGACAGATTCTCCAACATACAAGATATTGGCGATC
TTTCTAAGACAATGGTTGAGACGAGGAAGCATATTTGTTATCCTTTAGTT
TATCGGCTGCTGAATCTAGTACTTGTGTTGCCTGTTGCCACTGCGACGGT
CGAGAGGAGTTTCTCAGCGATGAAGCTCGTGAAAACTTATTTGCGTAATC
GCCTCAATGATGATAGTTTGAGTGATAACGTCATCTGCTATGTGGAGAAA
GTAGAAATGAAGAGAGTCACCAATGATCAAGTCATCGATCGATTCATGAA
AATAAGAAACCGTAAATATTAAAAGGTAAAACTCTCTAGCTTAAAATAAT
TTATCTTGTTATAATATTTCATTTGATAACTTGATTCTATGTTGCTAATT
TGTAGATTATGGAGGATGCGAGGTTAGATGACGTTTCATCTATTATCGGC
TATCTTTTGTGAGTCACATGAACATCTGTTTATTTATTTTAGGAAGAACT
TGATCGTTCTTATATGTGTGAGCATATCGTTTGTGCTTTGCATTGTGGAA
ATCATTGTGCTAAGACTTGTTTAACGCAATGGTATTACTAAATATTTTAT
TCAACTAAATATACCGCAAAGTCAATGTAAATCTTGTGCACCATGGTAAT
TTTTCCCTAGATTCGCCCCTGCCGGTGTGTGGGCATGGGCGGAGCTACGT
AGAGCTAGCCTGGTGCACATGCACCAGGGTCGAAAAAATTGTTTAATAGC
GATTAGGCATCTGGTAATTGCGATGCACCAGGTTCTAGCGGCAGATGTGC
ACCACGTCCAGCAAATTTAAGTGTTACGTGGCCTTTTAGACAGAGAAAGC
CTCACCGGTTCAGCCTTTTAGGAATAAACAAAGCCCAATAGACAATATAT
CTTATCTAATGGGCTAACGACATATGGGAGGCCTGAGCAAACGGGCAGAA
ACAGATCAATTAACCGATCGTTTAGATGCGATAATCACGCACGCGTTGGA
TCGGTGGTGTTGTAGACGAAATCCTCTGATCCTCTCTCCACGACGCGACT
TGCTCAGCCCCTCCGGACTCACCGACGGCCGACGCATCTCTGTGCTCACT
ACCGAGTATAGGATATTTGCCTGCCCAGCAGCCGATCAAGGATCGTCCTC
TCGCCCTTCGCTCTATAATCCAATCACAACCCAAAGCTAAGGTACCAGGA
CTACAACTCCATGACTTTTTCATCTATTTTTCAATTTTCTTGATTGTTAC
GAAGTGGTTAAGTCAACTTATTTAATCGGTCTTTATCAAATACAGATATG
TCGATAGATAGGTTTCTTTTGAAGAGAAAAGCGCCATCGCAAAATCCAGA
TGATTTAAATTGGGAAGAGGAGATTAAGTATGATCCGGGACAAAGGAAAA
AAATAGAAGATTATCATCCGAATCTCAAGGACTTGGTGAGAAGAAAGTAC
TTAATTAATGGACCTTGTCAACCTCGCACTTACGAATTTCCGTATACACT
GATTGGGGGTAGGAATAGAAGGTTTAATCCTGAATGGTTTGATGAGTTTG
GTAGTTGGCTGGAGTACAGCGAGTCCAAAGACAAGGCATACTGCTTTTGT
TGCTTCTTATTTAGGGACCGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGGCTACGAGGC
ATTTGTCGTTAATGGCTGGAATGCATGGAACAATAAAAATAGACTGAAAG
ATCATATTGGTGAAGTTGGCAGTGTCCACAATCAAGCCCTAAAAAATTGT
GATGCATTGTTGAGAAGAGATGAACACATTGATGTTGCTATACAGGTGCA
AAGTGAAGCTGCAAAGATTGCTTATTTTACGCGACTAAATTCTTCAATTG
ACACAGCTAGATTGTTACTGAAACAAGGATTGCCATTCCGAGGCCATGAT
GAGTCAAAAGATTCACTCAATAAAGGGAACTTCAGGGAAGTTCGTGATGT
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CAGGTAATTCTGTTATGGTGTCCCCTGAGGTCCAAAAAGATATTGCTAGT
TGTTTTGCAGGTCAGATAATGAGTTCTATTCTCAAAGAAATTGGCCATGG
TGTCTTTTGCTTGCTTGTCGATGAGTCTAGAGATGTCTCTTGCAAAGAGC
AGATGGCTGTGGTCTTGCGGTATGTCAATAGTTTTGGAATTGTTAAAGAG
AGTTTTGTTGGTCTCGTTCATGTGAAAGAGACAACATCTTCATATCTCAA
GTCCTCAATTGATTCTCTCTTTAAAAAATATAAGTTGAGCTTCAAGCAAG
TTCGAGGACAAGGATACGACGGTGCAAGCAATATGCGAGGTGAGTTCAAT
GGCCTCCAAGCATTGATCATGAGGGAAAATAGCACGGCCTTTTATGTTCA
CTGTTTTGCACATCAACTTCAGTTAGTTGTGGTTGCTGTGGTGAGAAAAC
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GTGGGTGGATCTTCAAAGAGAAGAGACATGATTCGAGATATAAATCTTGA
GGAAGTGCAAAAGGCCTTAGGTTGTGGGATGCTTAAAACTGGTACGGGCT
TAAATCAAGAGCAATGTCTTCAGAGACCCGGAGACACTCGTTGGAGTTCG
CACTATAAAACACTGAAAAGTTTGGTTGATATGTTTCAAGCAGTTGTCAA
AGTTTTAGAGTTTGTGGAAGAAGAAGACACGGATAGAACAAACAGAGAGC
AAGCAAATGGTCTTCTAGTGTACTTCCAATCATTTGATTTTGTCTTCTTC
TTGCATCTCATGTTGACTATATTAATAGTCACCAACACCTTATCATTAGC
TCTCCAACGGAAGGACCAAGATATTGTGAATGCCATGAACTGTGTCAAGT
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ATATCTGATGTGCAAGCATTTTGTGAGGAACATGATATTGTCTCGTTAGA
GATGGAAGATGATTATGTCAATCCTAAGAAGAAACGACAAAAGACTGGTA
TTACCAACCAACACCACTATCAGGTTGATTGTTTTAATGGTGTTCTTGAT
TGGCTAATTCAAGAATTTGATAGTCGTTTCAATGAGACATCCTCCAACTT
GCTTATATGGTCTGCGGCTTTGTGTCCGAGAGACTCATTTCATGATTTTA
ATTTGGAGAATCTAATGAGCCTGGCTAAACTATATCCTAATGATTTCGAC
TCTGTTGAACTGAGGGATCTAAGCCACCATCTACGCCTCTATATTGTTGA
CGTGCGAGCAGATGACAGATTCTCCAACATACAAGATATTGGCGATCTTT
CTAAGACAATGGTTGAGACGAGGAAGCATATTTGTTATCCTTTAGTTTAT
CGGCTGCTGAATCTAGTACTTGTGTTGCCTGTTGCCACTGCGACGGTCGA
GAGGAGTTTCTCAGCGATGAAGCTCGTGAAAACTTATTTGCGTAATCGCC
TCAATGATGATAGTTTGAGTGATAACGTCATCTGCTATGTGGAGAAAGTA
GAAATGAAGAGAGTCACCAATGATCAAGTCATCGATCGATTCATGAAAAT
AAGAAACCGTAAATATTAAAAGGTAAAACTCTCTAGCTTAAAATAATTTA
TCTTGTTATAATATTTCATTTGATAACTTGATTCTATGTTGCTAATTTGT
AGATTATGGAGGATGCGAGGTTAGATGACGTTTCATCTATTATCGGCTAT
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TCGTTCTTATATGTGTGAGCATATCGTTTGTGCTTTGCATTGTGGAAATC
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ACTAAATATACCGCAAAGTCAATGTAAATCTTGTGCACCATGGTAATTTT
TCCCTAGATTCGCCCCTGCCGGTGTGTGGGCATGGGCGGAGCTACGTAGA
GCTAGCCTGGTGCACATGCACCAGGGTCGAAAAAATTGTTTAATAGCGAT
TAGGCATCTGGTAATTGCGATGCACCAGGTTCTAGCGGCAGATGTGCACC
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ATCTAATGGGCTAACGACATATGGGAGGCCTGAGCAAACGGGCAGAAACA
GATCAATTAACCGATCGTTTAGATGCGATAATCACGCACGCGTTGGATCG
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GAGTATAGGATATTTGCCTGCCCAGCAGCCGATCAAGGATCGTCCTCTCG
CCCTTCGCTCTATAATCCAATCACAACCCAAAGCTAAGGTACCAGGACTA
CAACTCCATGACTTTTTCATCTATTTTTCAATTTTCTTGATTGTTACGAA
GTGGTTAAGTCAACTTATTTAATCGGTCTTTATCAAATACAGATATGTCG
ATAGATAGGTTTCTTTTGAAGAGAAAAGCGCCATCGCAAAATCCAGATGA
TTTAAATTGGGAAGAGGAGATTAAGTATGATCCGGGACAAAGGAAAAAAA
TAGAAGATTATCATCCGAATCTCAAGGACTTGGTGAGAAGAAAGTACTTA
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TGGGGGTAGGAATAGAAGGTTTAATCCTGAATGGTTTGATGAGTTTGGTA
GTTGGCTGGAGTACAGCGAGTCCAAAGACAAGGCATACTGCTTTTGTTGC
TTCTTATTTAGGGACCGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGGCTACGAGGCATT
TGTCGTTAATGGCTGGAATGCATGGAACAATAAAAATAGACTGAAAGATC
ATATTGGTGAAGTTGGCAGTGTCCACAATCAAGCCCTAAAAAATTGTGAT
GCATTGTTGAGAAGAGATGAACACATTGATGTTGCTATACAGGTGCAAAG
TGAAGCTGCAAAGATTGCTTATTTTACGCGACTAAATTCTTCAATTGACA
CAGCTAGATTGTTACTGAAACAAGGATTGCCATTCCGAGGCCATGATGAG
TCAAAAGATTCACTCAATAAAGGGAACTTCAGGGAAGTTCGTGATGTCCT
AGCAGAGCATAATCCAGCTTATGGCAAGGCACTGGGCCAAGATGCTGCAG
GTAATTCTGTTATGGTGTCCCCTGAGGTCCAAAAAGATATTGCTAGTTGT
TTTGCAGGTCAGATAATGAGTTCTATTCTCAAAGAAATTGGCCATGGTGT
CTTTTGCTTGCTTGTCGATGAGTCTAGAGATGTCTCTTGCAAAGAGCAGA
TGGCTGTGGTCTTGCGGTATGTCAATAGTTTTGGAATTGTTAAAGAGAGT
TTTGTTGGTCTCGTTCATGTGAAAGAGACAACATCTTCATATCTCAAGTC
CTCAATTGATTCTCTCTTTAAAAAATATAAGTTGAGCTTCAAGCAAGTTC
GAGGACAAGGATACGACGGTGCAAGCAATATGCGAGGTGAGTTCAATGGC
CTCCAAGCATTGATCATGAGGGAAAATAGCACGGCCTTTTATGTTCACTG
TTTTGCACATCAACTTCAGTTAGTTGTGGTTGCTGTGGTGAGAAAACACA
TAGGAATTGGAAGTTTTTTTAATATGATCTCTGTCTTGCTGAATGTTGTG
GGTGGATCTTCAAAGAGAAGAGACATGATTCGAGATATAAATCTTGAGGA
AGTGCAAAAGGCCTTAGGTTGTGGGATGCTTAAAACTGGTACGGGCTTAA
ATCAAGAGCAATGTCTTCAGAGACCCGGAGACACTCGTTGGAGTTCGCAC
TATAAAACACTGAAAAGTTTGGTTGATATGTTTCAAGCAGTTGTCAAAGT
TTTAGAGTTTGTGGAAGAAGAAGACACGGATAGAACAAACAGAGAGCAAG
CAAATGGTCTTCTAGTGTACTTCCAATCATTTGATTTTGTCTTCTTCTTG
CATCTCATGTTGACTATATTAATAGTCACCAACACCTTATCATTAGCTCT
CCAACGGAAGGACCAAGATATTGTGAATGCCATGAACTGTGTCAAGTCAA
CTAGAAGTCATTTGGTTGATCTTAGAGAAAGCGGATGGGACTCTTTGATA
TCTGATGTGCAAGCATTTTGTGAGGAACATGATATTGTCTCGTTAGAGAT
GGAAGATGATTATGTCAATCCTAAGAAGAAACGACAAAAGACTGGTATTA
CCAACCAACACCACTATCAGGTTGATTGTTTTAATGGTGTTCTTGATTGG
CTAATTCAAGAATTTGATAGTCGTTTCAATGAGACATCCTCCAACTTGCT
TATATGGTCTGCGGCTTTGTGTCCGAGAGACTCATTTCATGATTTTAATT
TGGAGAATCTAATGAGCCTGGCTAAACTATATCCTAATGATTTCGACTCT
GTTGAACTGAGGGATCTAAGCCACCATCTACGCCTCTATATTGTTGACGT
GCGAGCAGATGACAGATTCTCCAACATACAAGATATTGGCGATCTTTCTA
AGACAATGGTTGAGACGAGGAAGCATATTTGTTATCCTTTAGTTTATCGG
CTGCTGAATCTAGTACTTGTGTTGCCTGTTGCCACTGCGACGGTCGAGAG
GAGTTTCTCAGCGATGAAGCTCGTGAAAACTTATTTGCGTAATCGCCTCA
ATGATGATAGTTTGAGTGATAACGTCATCTGCTATGTGGAGAAAGTAGAA
ATGAAGAGAGTCACCAATGATCAAGTCATCGATCGATTCATGAAAATAAG
AAACCGTAAATATTAAAAGGTAAAACTCTCTAGCTTAAAATAATTTATCT
TGTTATAATATTTCATTTGATAACTTGATTCTATGTTGCTAATTTGTAGA
TTATGGAGGATGCGAGGTTAGATGACGTTTCATCTATTATCGGCTATCTT
TTGTGAGTCACATGAACATCTGTTTATTTATTTTAGGAAGAACTTGATCG
TTCTTATATGTGTGAGCATATCGTTTGTGCTTTGCATTGTGGAAATCATT
GTGCTAAGACTTGTTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.