Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA044888

[Submit comment/correction]

Sequence
AA044888
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA044888
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCGGTGACCTCCATGGATTCAGATGAGGACACTGAATCTAATTCCAG
CGAATCAGGTTTGATAATCCCCGCAACCTCGTTTAACTTACATCGGACCA
GATTCTTCCGACAATACTAGATCGTTTTCATTTTTTCCATGGTCTTTCTA
GTTTTCTACTATGCGGGCACACATTCAGATGAATCCCTTAAGTTCTTAAT
GCTAATCCGTAAGATTCGATTTGGTCCGATGCTAGACTGTTTTGGGGAAT
TTCCTCTGGATTCAGTGTTTTGCTTTTTTGGAGAGCTAGAGTGTTACTGT
ACACTGCATTTAACAGGTATGTAAATGTATTTGTTCAATGGTTCATACTT
GTTTATAGGAAACAATCTGATACAATCTTAACCAATATCTATATCTCGCA
ACTTTACCTCCCATGTTGTGGAAATAACCACTGGATCCTTGTGGTAGTAA
ATATTAGAGGATCAAATGTTCAATTTTATGATTCTCTGCTGACCGTGAAG
AAAGGAGAACACCCTTATGGAAAAATGTGGAATACTATGGTTTGTTTCTA
TACTCCATTCTCTAAACTTACTCTAAATTTGGGTGCTAATTATTTGCTTT
CGTGCACACACAACCCCAGGCTTTGAATTTGCATAAAGCTTTCTGCCTTG
CGACAAATTACCCAGTCAAAAGGTTTTCAGAGTTCACCTGCCAATATCCC
AAGTGTGCTACACAAGATAACAAGTTTGTTTTCTTGTTCTGATCTTATCC
ATTTCCAATTTTGCAATTTCCAATTTATTAATTGGTCAATAATTCTTTTT
ACCAGCCATGATTGCGGCTTCTGTGTTATTCGCCTCCTCGAGTGTCACAA
TGGAACTGATTTAATTGGATATGGAGCTGTAATTTCCATATATTATTTGT
CACAAGTATAGTTATTCAAAAGAATATGCTTTAACATGTTCTAATTTGCG
TATTTGAACAGAAAAGAATGGACATCTACAGGCAGGAGATATCGTCCATC
ATGAGTATAATGATTACCATCCTTGGAGGTTTCTGACGAAGCGAATGAAT
AGAAAATCTCATACAAATGTTTAGGGTGTCTTCCATTTCCTATATTAATG
ATGGAACCCGGTAATTGCCAAGTAGTGATATATTTCAGAAACTGGCAGTG
TTAAGGACCTCGTAATTTCTTGCTCTGTGCTCTTATGACTTCTAGTTGTG
TATGACAGCACTATCATCTCTGTTATGACCCTGTTGTGTATCGATCCACA
ATTTGAGCCACCAGTACTTTCCAATAGACGATTTACAGTTTATCTTATCT
CAATGCGTAGCAGACATGAAAACCTTTAGAACAAGTTCCATTTTACCTTC
TTACATATTCGACAGATCATCTTCTATGAAAACTTTAAGCTCTACATTTT
ATAGGTCCGTTCCATGCTTTCTGATAACACGTGGTATTTCTAAAATTGTA
AATTAACTTCTGTATCTAAAAGAGGTAGAGCTTCTGTATCTAAAGAGGTA
GAGCTTCTAAAATTGCGGCTTCTGTATCTAAAATTGGCATTGGTATAACA
AGTTGTATTGATTTTCTAATTTAAATTGTCGCATGCATAACGCTCGCCAC
GTTCCATCACTCGCTAGTAAGTGTGAAATTCAGTTAGGACTCTGGGACAT
TTTTAATAATTGAATAAGCGGTTGTCAAAAAATTGTGTTGGCACAAACCC
GCGTACTATACATAGACAAAAAAACTTAATACTTGATTTGCTGGTAAACA
AACACTAGTCTACTGATTGGTACCTGTCTTCCTTAGACCCTTAAAATTTA
GGGCGAAGGAAGGCAAACTACCAATCAATGAACTAATTTTGTTATCATCT
TCAGATCACCAACTGTGTTTTCTGTGGGTTTACATGGGTCTATAATATAT
AGGAGTAGCAACCCAGTTGAGCTAGAGCCACCAGCGGGGTGGGAATATTG
TTCAAAAGGGATCTACAACGGCTGCTAACAAAAAACATTTTACTACGTTG
AGATCAACATGTATCATCATGGTTCACTATGGAGGTTTACAAAAAAATCA
TGGTTCACTATGGAACAAAGGAATACAATAAGAAATTCTTTGCGTGCGAC
ATAACTACATCATGCATCCAAGAAAAATGAATCTACCTACAGAATTACAC
AACAGTTGGATACAAGTTCTCGTTTCCTGTTTGAGCTAGAATCTCCGATA
ACAATGGACTTATCTCATTAGCATTACTAAGATTCACTGTCATTACCATT
ACTAAGATTCACTATGTTAACATTTCTCCATCATTAAATCATGCATTATT
AACTAGCTTCATTTTTCTAGTGATTTCCAAAAAAATTAGGACATATTCCG
ACAATATCTTACGCAGTTCACTGAAAACTGAAAGCCTTCACCCCAAACAA
ATAATTGGAAACATACATTTTGTAGCTCTTACGTAGGGATGACTAATATC
ATACAACGACAGATGCATCCAACTAGTACCTTCATTTTTCTAGTGATTGC
AAAAAAATTCAGGATATGTTCCGACAATATCTTACGCAGTTCACGCATTC
ACTGAGAACTGAAAGCCTTCACTCCAAACAAATAACTGGAAACATACATT
TTGTAGCTCTTACATAGGGATGAATAATATCATACAACGACAGATACATC
CAACTAGTAGGTTCAAACATGATGATCATAGAATACTACAAACCATAGAA
GTTTCGAAACTAAGGTGGAACGAAGGCCATCCTAAGCTGACAGATACATC
AGACCAATAACTACAAACATTGCCACCCTCAACATAGATGAATCAGGGCA
ATAGAAACTGGCTGATATTAGCATCATCAAGACAAGACATGCCCACTTCA
TTCTTCTTTTATTAATCTCAAGAATCTCTAGTTTGCCTGATGCTATGAGT
AGATCCTTCTTCACTGGATCTAGGAAATATTTCAGTGTTGATTTCACATA
ACTGTTGAGTAGATCAGCCTAGATCCACGTCTTGCAGACATAATCATCCA
GTGAACAAACCTACAACCAAAAACACCCCATGTAAAATCTGCAAGGGCAC
GACATAGAAAGAAACTATTTTCTCCTCCGCCCAACTGTATGTAATATGAG
ACGCAGAATCTAACCTTTCTTCCGAACTTGATGAATTCCCTTCCTTTGTT
TCGGCTGGTGTTGGAGATGTACTTGTTTGCAGGCAGAGAGCAAGCACACT
CCCGAAAATGCAACTCTGGCGTGCACGCGACCTCGCGTGCACGTCCGAGC
CGTCGATCCTTTCGAGATTCGGATAACCCAGCGCACCAAGTTTCACGTAT
AAGCTCCGTATTGCATCTGGCCGGACTTTTTACTCCATGTATCCTGCGAG
CACCCGTCCATCCATCTGACACCACCTTCTCCCCACGACCCCAACTCTCT
CTTCTTCCATAACTCCTTGCCTCCTCGTTTCTCCCGCTCTCCTCCCAAAC
CATGGCCAGGCCAATCCTTTCTTCTCCCCCTACGCAGCCTCAGATCTAGC
ACACGCGACCTCGATCTACCGGCCGTCGACCTTATCGCCACTGAGGGCGG
CAACCCGATTGGTGTTCTTCTCCATGCCGGTGACCTCCATGGATTCAGAT
GAGGACACTGAATCTAATTCCAGCGAATCAGGTTTGATAATCCTCGCGAC
CTCGTTTAACTTACATCCGACCAGATTCTTCCGACAATACTAGATCGTTT
TCATTTTTTCCATGGTCTTTCTAGTTTTCTACTATGCGGGCACACATTCA
CATGAATCCCTTAAGTTCTTAATGCTAATCCGTAAGATTCGATTTGGTCC
GATGCTAGACTGTTTTTTGAATTTTCCTCTGGATTCAGTGTTTTGCTTTT
TTTGGGGAGCTAGAGTGTTATTGTACACTGCATTCAGCGTAGAAAGGAAC
CATGCACTGCTGCGTTGGATTATAGAAAGGAGCCAGCTCCTGTTGGGGAT
TTCCCCCTGTATTTTTGTGTTTTGCATGGGAAGGAGCCAGCTCCTGTTGG
GGATTTCCCCCTGTATTTTTGTGTTTTGCATGGGACGGGAAAACGCAGCA
CATACTGAGCATATAAATTTGAGTTCGGATTATAGGTATTGATTTTAGTA
ATTACTAAAACTGCTGCATTACCTGATCCTTTTTATTTCTTGTTTTTCAT
GTAACAAACATAAGCCAGGACAATATTTAGTTTGCTCTAAATATATTACA
GTTCTAGCTGTTGCCAGGACAATATTTGTTGTGTAGAAACCATCTGGGCA
TATGGTGTTGCGCTGAATAATTTTGTTTTGTAGCAAACCATTTGTTTTTT
AGAATAAATTTGGAAATTATCATTGTCTATAGAACTTGATCTTAGTAAAT
CTAAATGAAGCCTAATGTTATTGGTCTTTCTTGATCGAAAAGGCCAAATA
GTGACCTGGATGGTAATCAGCACATTCCATCCTAAAAATGATCCTGCTAT
ATAGTTGACTTATTGTTTGTTCCAAACAGTACACCTGTCTACCTAAAGTT
TACATCGTACTATTGCACTTTTTTAAGTTAAGATAGTAGCCTGCTTGTAA
AACATATTGAACTCTGTACGTATCACCATTCTTTTCGTAGCAATCATAGT
CAAACTTCTTATTCTTGATAAAACTGTGGTATAATTGTTCGAATCACTTT
CTTTAGGAGTCTTGTTTAATTATTCAGAATGAATATACATATAATTTTTC
CATTAATGGCACATTGCATTTCGATTTTTTTGTAGCATAACAGTATGGAT
GCAAAAAGGTTATGATAATGCGGAAGAAAAGGAAAACAGATCACTCAAAG
AAGTCACGGGTTAGAAAGCGTCAGCACTCTGACAGTAGTGACGAAACAAC
TGGATCATCTGCCAAACAGGTGTGTCGTACCAAGAAGGTCAAAGATAAGA
TGAAGAAGAAACAGAAAACTTCTGCTAGAAAGGTGTGCTATTTTAGAGTG
TCCTTTTTTGAAAATTTTATATTCAAACAACCATGGTACTTGATGGATCA
CTTGTATTATTTGTCAGGTTGAAAATAATAGATGCTGTCCTCACATGATC
CCACCAATAATCAAGCGTTTATCGCCAAGACAGAAGGACTGGGTTAGAAA
TATAGGTTTGGGTGTATTTTTAGAAATGCCGGAGTGTCAGCTGCCAAAAC
CAATCACTATGTAGCTAGTCAGTAAGGTTAATACTAAGGATAAAACACTC
GAGATTGACAGCCAACATACTATCCCCATTGACAAAGGTATTGAACAGTT
GATTGGCTTACCCAATGGCAAGATAAGGGTACCACATCCAAAGAGTCTGA
GGACATTGCCTAAAGCCAAGAAATTGGATCCTGATCCTAGCAACGCTAAA
TTCTCTGACCATGGACGTGGCAAGAAACTTCCAAAAATCATCGAAGATCT
AGTGGGTAATGACGATGAGGATGATTTCTGCATACCCTTTGTTATGGTAA
TCCTAGCTATATACCTAGCCCCAGGCACAAGCCAAACTTTGAACAGAGGT
TTTCTACCCCATATTCAAGATGTCAAGAAGATCAAGGAAATGAACTAGTG
TAATTTTGCCGTCCAATATCTCATGAAGGGCATTAATAAATTTAGGTCTA
ACATGCACACAAATATTATCCTACAAGGTTGTGTCCACATACTGCTGGTA
AGCACATTTCTCCTTACAATTTTCCATTTTGTTTCCCATACCGTGTTCTT
ATTTCCTTGTATTTTTGACATTCCTTTCATCATTTTGCTGAAGCTTGCTT
ACATAAGTGCTATAAGAAGCTCAAAAATAACTGTCCCACCCGGTTATCCT
ATAATGAAATTTGTGACAACTGAACTGTTGGACCTTCTTGCTGAAGAGGA
CCAGAAGGATGTAGATGGTTCCACCCATGAGTATGGACTTCTTATGGTGC
GTAACTCAACTATCTTATTACATATATAATCGAAAGATGTATTCTAATGA
ATGTGATTATCTTAAACATTGAGCAGACCAATGAACAAGATAGGAAGGTG
CTAGCAACTGGATCAACAATTTGTGGGTTTATGGACCCAACTGGTCCATC
AATCAGTAAGAACTTTCATGTTACCACGTTGGAATCTGAATCATACAAAG
AACTCCAGTCTAATAAGGTAACTCTATTTCCACTTACGGCCCAGTTTTTT
CCTACCATATCTCATGTATTAATATCGAATGCATTCTTTTCAGGCAATTG
AGTCTTTATTTATGGAATTAAAAAGTTTTTTATGTCGCAACCGTGCTGAA
ATAATTGCTGAAGTTATAGCTAAGATGGCTGAGTCAGAAACTAGAATCTG
CGATAATTTCTTGGAGAAAGCAAAAGGAATGATTGCTGAGTCCGAAACTA
AAATCTGTTCAGGCTTGTGTCCTTACAAATCATCAGGGCACCATTCTGAA
ACTGAGCAAGTTGATACAGTAACTCCTACCCGGGAACAAGCCCTTGTCAT
CAATACAGAACACTACGAGCCAGATAATTGCATGCAAGATGTAGCTAACA
AAGGTATCCTAGCTGCAAGAGAGGCCCTTGAATCCTCTGAAATTCCATGT
GAAGAGCAAACTGAACATCCAGAGTTTAAAATCCATAATGATGAAAATCA
TAGTTTGGGTGTTGCATCACGTTCTACCTCCGGAGACAAGATAACAGACC
CCAATGCAAGCAATCAGATCGAAGTTGCTCAAGAGTGCACCCAATCCGAA
GTTGTACCTACCTTAGACCAACCAATTGCATCTAATCCTCATCAGACCGA
TACAATTGTCAAGCAATCAGAAGGTACAATAAAATATCTAACAATCTATG
ACCCAATGAGGATTGTCTTCCATTATGTTTGTTACAAAAATCTGCTCAGC
CATGCGTTCATTATGTTACCTGAATTCTTACAAATAGCATACCTTAATCT
CTATATGTTCAAGCATTGATTACAAATTTATAATACACAATCCTCGTCCG
ATACACAAGGCTACTGTCATTATGTTTAATACACAATACTCTCTTTATGT
TTAGTACACAATGCTCATATTATAAGGGGTCATTATGTTTAATACACAAT
GCTCATTATAATTAATACACAATGCTACTCTCATTCTGTTTAATACACAA
TTCTTATTTTATAAGGGGTCATTATGTTTAATGCTAGTCTCGGTAAACAT
AATACCCAAAGTGATTAATCAACACCACCATATTTATTGTGTAAATTAGA
AAAATGTTCAGCGGGCATACATTGTGTCCACATACAAGCGTTTGGTACCA
AGTAACAATTAGCAATAACATCTTTTACTCCTCCTGGTTATCTATTTCTT
CACACTAACGACTTCTTTTTTTAAATCAGTTTTACCGGGTCGAGATGTTC
TGTCTAATCATCTGGTTGATATTCAGCCAGTTGCCGCGACAATATTTTCA
TCGTCAATTAAACATCTCAATATTGAGGCCACGAGTCCTAGACCACAACT
TGGAGGTATAAACATTTTAATTTGGTTTGTTTAGTACCAATCATGTATCC
ACTGCTTAATAAAGATTTAAAGACACTCATTTACCATAACAAGTGTTTTT
AATTTTTTGTTTTTCCCACGTCATATGCTGTATTTCCCGTGACTAACTTC
CTCTAACATGAATGTCATTTGAGACCTTCTATTCCTGCACTTATAGTACA
ACATTCCCAAGTTGTAGCACTTGAGAACCAAACCCAAGAGTGCATTACAA
AGGAGAACCAGCTTGAAGGTACATTCAAACACCCATGGCTCTATGACGAA
ATGTTTTTTTATTAATCTAATAAATGAAATCAGAAACTTTATTGCATTCT
TGCAGAAAAACTCAAAGTAGAAGCAATATTATTATATACTACCCTCATCT
ATAGATTTCAATGTTTTTTACTTACATTGATCCATGTACAAAAAATGTAG
AAATTTGTCCTTGTAAAAAAATATAAATTGTTGCGCAGGGGTTCATCACC
TTTGCGTGGCCTATATGGCAGATATCATCGAAAGGCAAGCCTGTGTAAAG
TCAATGGGTATTTTCGTGCATGTTTCATTATTTTTATTGGAAAAAATATG
GTTGTTACCTATTCTTTTATACAATCATTATTACTACAACACAACTATTA
ATTCTTCAGTTCTTCTTTTTAAAAATAGTTCAAATTCATGTCCAACCTTT
TGATGGAAAAGAATCTTCCGGCAAGATGAACTCCCAAAAATATTGCAGCA
CATTGCCGTTAAACGAAAGTCAAGGTACAATACAAAAACTATTTTTTCAA
TGTTTCTACCTTACTTCAAGCCCTTTTAGTCCTTCTTCCTTCTATCGATC
TGCCACCAGATTGTATCACACATTGTACTATGCAAATAGTTTTCTTTTTT
GGCAAACTGCTAGATGCGTCTTAAACAAACTGTATCACATATAGGATCAC
AAGTTTAATTAATTGATACACAAGCTACTACTAACATTTTTTTTGCTATG
CAAAAATAATGACTCGCACTGTTACATCCGTTAGGAAATTTCCCAACCTG
GGATTCCACTCCCCAAACCAATCAAAGAGAGCATCAACAGACAGTACAAA
TGAACGATGTTCTAGGTACGCGGTTTTTTTAAATATGTCCTACTTGTTGG
GCGATATCTTCTCATACCCTGATGCTGCATTCTTTTATCAAATAGTTATG
TTAAGCGGGAAGCCAGAATCAAACGCCCTTCCTGGAATTTTTGGTATTTT
CTGTTCATACTCACATCACCAATTATCTATTTCAAGTTTGTTTTATAGCA
ACTTTCTAATATTACAGTTCCCAATATTCTTTTCATAACAGAAGAACCAG
TACCTGCATGAGATCGGACCCCACATATCATCATCAGGAAACATGGAATG
CCAAACAAAGATGTCCAATGTTCACCTTTAGGTAACTTAAAAAAGTTTAA
AATTTCCACCAATAACAATAATTCAGGGGTGTCCCTACGAATGTATTAAC
TCTTCTGTTTTTTGTCAATGATTCATGGATGACTCTTTTATCTACATATT
GACAATGATTCATGCAGGATTAGTTTATGGTACAAGTAGCACCTACCGAA
CTAAATTTTTGCATTTGTGTATGCCCATATTTCTAGCAGATACCTCTCAC
ATCGTGACGGAAAAGGAAAACTTGGAGCCACTAATGCAAGATGGTAAACA
AGATAAACTATTTAAAACACACCCTGATCTCATTGCTCCTCTTGGTGATT
CAGGTTCGTTCCAGAGCCATTAGTTACTTCTCAAACTCATGCGCCTTATA
CTGGGAAAACATAACCATATTGCATTATATTCCTTCCAGGCCAAATAGAC
AATCTAGAAGGTCGGCTATCGGGATTGGTTGTCTCCATATCCGATTCTCC
AATTAAAGATGATGTCGACGATGATGTGATATCCACGGTCACCAAACCAA
TTGATGAAGGATCAAGGTTCAATACTTTTGGCATTCAGAATGCTAGACCA
AAGAGGGGCCAATATACTAAGACATACAGTGAGCAAGTTCTAAATGCAAA
AAACAGAGCGACATCCAGGACATATGATCCTAACAACCCTGCCAATAGGA
AAACCAAGATTCGCATTTCTGGTTACCATATCACAGAGCAGGAATTCATC
AGCTCCCTTGTGCCCACTGGAGAGGTAGATCTCAATTTCATGAGAATCTG
CTGTGTAGCAATAATGAAGGACAGCGGTGATACAACAAAGATCATCTTGG
ATCATCTAACAATAGTGAGTAAACATCTTATAAAGTCCTGCAAGAAATAT
TCTATCATTTATTTAGTTATTTCCATCCATTTTGTATCTCATCTGGCCAA
TCATATTTGTATCCTCTATAAGAACCTCATTGCATATTAGTTCTTGAATA
CATTTTTTGAATCCTTTTCTCATGCTTACATGCTCTTTAACAACCTCTCT
ACATATTATGTCAAAATATATGTATCCTCTTTAACAGTGCTATCTTTTCT
CTAGCACAAGCTGCTCAAATCATTTGATGCATGTGATCATGAATATGTCG
CCGCATTAAAAAAAAACACAAACTTGAACAACTTGAACAGGTATGTAAAT
GTATTTGTTCAATGGTTCATACTTGTTTATAGGAAACAATCTGATACAAT
CTTAACCAATATCTATATCTCGCAGCTTTACCTCCCATGTTGTGGAAATA
ACCTCTGGATCCTTGTGGTAGTAAATATTAGAGGATCAAATGTTCAATTT
TATGATTCTCTGCTGACTGTGAAGAAAGGAGAGCACCCTTATGGAAAAAT
GTGGAATACTATGGTTTGTTTCTATACTCCATTCTCTAAATTTACTCTAA
ATTTGGGTGCTAATTATTTGCTTTCGTGCACACACAATCCCAGGCTTTGA
ATTTGCATAAAGCTTTCTGCCTTGCGACAAATTACCCAGTCAAAAGGTTT
TTAGAGTTCACCTGCCAATATCCCAAGTGTGCTACACAAGATAACAAGTT
TGTTTTCTTGTTCTGATCTTATCCATTTCCAATTTTGCAATTTCCAATTT
ATTAATTGGTCAATAATTCTTTTTACCAGCCATGATTGCGGCTTCTGTGT
TATTCGCCTCCTCGAGTGTCACAATGGAACTGATTTAATTGGATATGGAG
CGGTAATTTCCATCTATTATTTGTCACAAGTATAGTTATTCAAAAGAATA
TGCTTTAACATGTTCTAATTTGCGTATTTGAACAGAAAAGAATGGACATC
TACAGGCAGGAGATATCGTCCATCATGAGTATAATGATTACCATCCTTGG
AGGTTTCTGACGAAGCGAATGAATAGAAAATCTCATACAAATGTTTAGGG
TGTCTTCCATTTCCTATATTAATGATGGAACCCGGTAATTGCCAAGTAGT
GATACATTTCAGAAACTGGCAGTGTTAAGGACCTCGTAATTTCTTGCTCT
ATGCTCTTATGACTTCTAGTTGTGTATGACAGCACTATCATCTCTGTTAT
GACCCTGTTGTGTATCGATCCACAATTTGAGCCACCAGTACTTTCCAATA
GACGATTTACAGTTTATCTTATCTCAATGCGTAGCAGACATGGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.