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GrainGenes Sequence Report: AA043509

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Sequence
AA043509
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043509
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGGCTCTCCCCCCTCCCCCCCTTCACCCTGGGGTTTCCCCTGGCCGCCCT
GCACCGACGCCCTCTCCGCTATCTGCCCTGCTGACCTCCTCCGGCAAGCG
GAAAGCTCACCGCATCGTACTCGGCACCGGCAAGCTCACCGTCTCCTCCT
ACCTGTCCTTCTCACCAAGGTGAGCCGTGAGCTGCAACCGCAAGTCCCCA
CCATGAAGCTCAATAGGGTTCGCCGACGCCGCCGTGATGTAAGTCAATAC
TTGCAGTTGTGCTTTGTTCATGTTAATTCCTTCCTTCGATGCAAGTCAAT
CTACCGATATTATCACCAATGACTGTTTTTCCCCTGGCTATGTGCAGATG
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CATCTTTCATCTCCAAGCGAATGCAGAAGCTTCCCAGCATGCTCTCGCAG
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GACTGACGTGACCTGCAAGATCCTGAGCAAGAGGTCTCCGGAGATCACCA
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GTTGGCAAATCTGTTGGCCTCGCCATGGCGACCCAGAAACTGGATGCAGC
TGAGTTTGATATTCTGACGCCCAAGAATTCTTATCTTTGCAAGGATGCCG
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GATGCGTTTTCTGGTCTCACACGACTGCAACTGGAGAATCTGAGGTTTGG
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GCAGCTTGACTGTCTACCAAAGCTCCAAAGGGTGGCCTATACTTGGATAC
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GCTTGCTAATGTCCAGACTGTAAGCGATCTGTATCTGAATGTTCTAAGTG
AAAAGGTACTCACTTCAATCATCTCTGTGTTGATTTCACCGTATCATGGT
TGTATGTAACAGTAGCAATAACTTAAACAGTTCTTTCTGCTATGTGAGGA
TGTGATTATTGCACAACTTGCACTCATAATTATTTTGTTTTATCTGTTCC
AGAATTGGTTTCGACCAGAATGCCCGAGAGTAATTTCTCATTTGCTTGGC
CAGCTGCGGTTTGTGAATCTGGACAATCTTCCCGAGGAATGTGATATTGC
TTGGACAATGTTCCTTCTTGAAGCTGCACCATTCATAGAGGACCTTTGCA
TCACTGTATGGGATCATAAGTGTGCAAGGGAGTCACAAAAGAGCTACTCC
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GAATCTCACCAAGCTAACCATCTACGGCTTCCAGTCAGACAGCAAGTTCA
TGGGCTACATCAGGCGTGTCATGGAAGCTGCTTTGAACATCAAGGAGGTG
TCTTTGCACGACAGGAAGGTGTGCAATCTCTGTGCTGTCCTTTTTCCTCA
CGTCGGGGTTCGTCCTTCGACATATCCAAGAAGCTTTGAGGAAAAGGATT
CATTGAGGAAGAAGATCACAGAGGCATCAATGATGATGGCTTCCCCTGCT
GTGATTCACTTCCGGTCTTAAATACCACAATCTATCCTTTGTGTGGTTTG
AAGGAGTCCCACTCCCACTCCCACTAATACATAAGTTAGTAGTTACTCTG
TGGGGGACAAGGAGTTCTGACTCCTGTAAGTGGTAGTTTTAAAGGAAAAA
CAAATCTGAGTGCTTTTTGCTAGGCAGTTCAATAATTTTCTTCGTGATTG
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GTTTGGCGAATTAGACATAACCAACATCTTTATGGCTTGCAAGCGGTTGG
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AGTCAATAGGTGTTGTTTCAGTCAATAGGTGTTGTGATAGAGGAAAACAC
CCTATATAAGCTTGGTAATAATATTGTGTACTTACAGTTTCCTTTTCTAA
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ACATATGTAGAAAAGTACCAAAAGCGACAATAAAATCAAGTAAGCAAACA
GAAGTGGATGTAGAGAAAAAGCCACAGGAAAAGCTTTCTTCGTGTATTTA
TAACATAGTATTGCAAGGTCAAAGTAGTATAGCTTTATCAGGGAGAAACT
AAGGACTGTTTCAGTATTAACGAGCAACTCCATGAGTTTTTGGCATGATT
TCAGATAAGACATCAGGGGCGAAGTTCAGCTTTTCAAATTAGAGGACAAT
CCTTTTGTGTTTTCTTCTAAAGTGAAACAGGTTTTCTGTGTGAGAGATCC
AAAACTTGAAGGATGGAACATAGTAGTTGGAGGCACGACACATGTGATTT
TTCTTTTGTATGGGCGAGGAGGCAATCATCGAATGAATCTTTTGGATAGC
AGTGGGGACAAATCATCGGACGGAACATATTAGAGCAATGTGATTGCTTT
TTTCTAAGAGATCCTAATTTATACAATTGTCAAACAAGTTATGTACTTCA
AATATTATCTTTTTCCCACATATATATTTGGTTTACATGTACTGATAAAT
TGATTTGAACCAATGAAACCATCGTCAGGCTTTGATATGTAGCACACACA
GTTACATGTTTCCTGGAACAAAGTCCTTTTGTCGAAACTGAAAATATGCT
AAAGCAGCTGCTACTCTCTGAATAAATGGCCAAGTACAAGTCTGCTATGA
CAAAAAAGCCCTTAGCATGATTTGTGGTTCATTTTTAACTCTTACCTAGG
TTCCTAATTAGATAAGCAAGCATGCCAATTATTTGCAGGACATCACTATA
ATAGTTCTAAACTTTCAAAACAAGTTGAAGTATGTTTTCAGAGATAAGTA
TGCATATACATGAACTGACTAATACAGTGATATTCAGAGTTTGTGGCTCT
TTTCCATTGCTGCCTCCCATGCGCAGGTGTCCATATAGTACTCAATTTCC
TCGATCTAGGACTTAGATTAGCATGCATGATGACACACATGAGAGACTAA
AGTTTAGAGAAAGTGGCGCCCAGCCCTGCAATCCATCGATCTCTGAACTT
GTCGGACTGCAACAGCTCAGAGTTGAGTGAACTTTGCTTGAATTCTGAAG
TTTGCATCACCGTGGCCAGTCCACATCTAGTCCTGATCCAAGCAGCTGGA
GTCCCCTCTCTCCCCACCGCTCTCGCTCCCTCCCCTCTCTTGAGATTCGC
CTGCGTGTCCTCGGCGCCTACACCCTTCCTCTCCGGTGGCTCGCCGTCTG
AAGGGGAAGGGGGATGGTGGCGGGCCTCTATATAGCAGCAGTAGTAGGTG
TCTTGGCCTTGTGCCGGCAGTGGGCCTTGTGCCCGTAGGTTGGAGCAAGG
CGCTAAATCCCGATCTGATATGGAAGCTAGGGCTGCTCGTCGGCGTCTTC
TTGCTCCACTGGTTGAACACGAAGATGACGGAGAGCGGTTCGGCTCCTCA
AAAAAATATCTTCTGCCGGCATGTCATGTGGCAAAGCATCGGCGTGGATT
GGGTTCCTCGGACCTTCCGTACTACTAGGAAACTAGCTATAGATTAAAAA
GAATTTTTGTGGCGCATATAAAAGGGTATGCTTCACGTAATTAATTCTGT
GGTGTATACAAACACAAGCACCACAGAAATATCACAATTTTATGGCGCAC
AGAACCCATATACGCCACCGAAACATATATTTCTATGACGCATATTTTCC
CGTGCGCCACAAGAAGTGGTGATTCCGTGGCGCACATATGCACCATAGAA
ATTTGAAGGGACCCAGAACCAACTAAGGGGAGACAATTCTATGCGCCATG
GAAAGTGAGATGTAGTTATATTTTGGGGTATAGTTGTAGGGAAAATTGAT
AAACATGAATTTCAATATATTTTGCAAAAAAAAGTCATGTCACGGATAAA
TGGCCATAACTTTTGCACACGATGTCGGAAAAAAATGTTTTACCTATCAA
AATGATTGTCTCGAGATTTCCTACTTGAATTCAACTGCCAAAGGCTGTTC
TAAATTTTACAGAATCCCCAAATTTGAAAAAATTTAAAAGTTATGACAAA
AAGAAGATTTTTCCTGCAAAAAATAAAAAAGAGAGACAATTCTGTGGCGC
ATATTCCACAAAATTGTTGAGCGGGATTCGAATTTTGAATCTCCACCGGT
GCCCTCCCCATCTCTTTTCTCCTTCTATCTTTTACTCCTCTCCTCCACTT
CTTCTCTCCTTTCCCCCCTTCTTCTCCCTCCCCCTTCTCCACTCTCCGGC
GAACTCCTCCTCCACCACCCTGCTGACCTCCTCCGACGACCCCTCCTCCA
CCGGCGGCCTCCTACTCCTCCTCCTTCTCCTACACGACGACCCCTCCTCC
ATCGGCGGCCTCCTACTCCTCCTACTCCGGCGACCTTCTCCTCCACCGGC
GACCTCCAACTCCTACTCCGGCGACCCACTCCTCCACCGGCGGCCTCCTC
CCCCTCCTACTACACCGGCGAGCTCCTCCTCCTCCTACTCCGGCAACCCT
CCTTCTTCATCCACCCCCGGAGACCCCCACCTCCGGCCTAGATCTAGGAC
GTTTTATTTTTAAATTCGATAAAAATTATGTGGCGAATTTTTGGCGGGAT
CTGGCCCACTTTTTAAAAATATTCAAAAAAAATCTATGGCGCATATTGCC
AATATGCGCCACAGAAATGTGAGAATTCTATGTGCATATCAATATGCATC
ACAAAATTATAATTTAGCGGCAAGATAACAGTGACGCATCTCATATGTGC
CATAGAATGTTAAAATCCATGCGCCACAGATAAGGCTTTTCCTAGTAGTG
CCGTGGTGGCGAGGTGAGTACGCGGGTTGTCCCGCCCTGCTATGGTGCAG
GTGTTTGGTGTGGCGACCTGTTGTTCCTGCGGAGGTTTGCGGTGGTTCTT
CCTCTGGCCGGCCGTGAAGGCGAGGGGAGTCGGGAAGTTGGCCGGCCATG
GAGACACCATAACTACAACTTGACTCTTTGCAGATCGGGAAGTCGACGGT
GTGGACGCACCAGTGCTACATCTTGTAGGGGCGGAATCTCGACGACGTCT
TTGCCACCGACGACATTAGATAAAGGACAACCACTCCTTTGTTCTCGGAG
CTCCTCTCCGGCGGCGCATCGACGACAAGTTTTCGTCCTACCGTAGGACT
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AAGGTGTTCTTCCTCCAGGCCATGGTGTCGATGCGGAGGTTCTCTGGCTC
CGAGGCGGCGTGCTCCTGCTGCTCTAGTCCAAGTGGCGAAGTCCCCGTTG
GTGTCGCAGTCGGCCGTGCTCGACAACATGGTGGTTACGGTGGAGAAGGA
GCAAGGAGAAGGCCAGGACCTGATGGATTTTTTACGATTTCTTTCACGGT
CTTCTCTGTAAATTTGTGGAGCCTTGTTGTGCTTTCTTTTCTTCTTAGGG
CCTCTCTGTAAATGTTACTGCACCGTTGATAATCTAATGTAGCATCGGGG
TCCCCGTGCAAAAGAAAAAAAAATCAAACAGCTGAAAAGGGAATAAGTAA
TTAGAATGCTTATACACCAGCACATTTCCAAATCATTTAAACTTGGTTTG
TTTTCAATTCAAATTCGAATTAGGGGCAAAACTCTAGTCGTACTATATTA
CAAAAAAAAATGTATCCGTATTAGAGTGGTATACCACACACGGATACCCC
TCCTCCTTCCTCGAGTTTTCTCATGGCCGCCGCCTATCTAGCCTAGGATT
GTCCACCGCCACCGCCACCGCCCTGAACCGCTACCGGCCTACCGCCGCCG
CAGCCCTGCAGCACCGCCCACCCTCTAGATCGCGTCCCCCCTTCACCCTA
GGGTTCCCTCGCCGCCCTGCACCCGTCTCCGCCACCTGCCCTGCTGACCT
CCTCCGGCCGGCAAGCGGCAAGCTCACCGCATCGTACTCTCCACCGGCAA
GCTCTCGGTTTCCTCCGACCTGTCCTTCTCACCAAGGTATCCGTGAGCCG
CAACTCCCCACCATGTGGTTCAGTAGTTTCCCCCACACACGGACACACTG
ACTACTTTGTTCCGGGTTTTTTTTTTGCAGTCAGATCACCATGAAGCTCA
ATAGGGTTCGCCGCCGCCGACGTGATGTAAGTCGATGCTTTCTGTTGTGC
TCTGTTCATGTTAATTCCTCCTCCATTGCAACAAAATCACCGATGAGTGT
TTTTTCCCTGTCTAACTGCAGTTGCAGAAAGTAGCAGCTGTTAATGTGGA
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TGCTGCTCAACATCCTGGAGAGAATGGACACGCTCGACGCCATCAGAGCA
TGCACCGTCTCCAAGCAAATGCAGAAGCTCCCCACCTTGCTCTCGCAGAT
CGTCATTGTTCTCGACAGGCGCCAGTTGGTTCGGCAGAACAGTGTCGTGG
CTGACGTGATCGACAAGATCCTGAGCAAGAGGTCTCCGCATATCACCATT
CGCAAGCTGAAGATCAAACTATTCTTGACTCATAATGCCTGTCGCTCCGT
TGGCAAATCTGTTGGCCTGGCCATGGCGACCCAGAAATTGGACGCAGCTG
AGTTTGAAATCGTGACGCTGAAGAATTCTTTAAATTGCAAGAATGCCGAC
CTCCTGAAGTTTGCTAAGCAGTTCAATGCTTTCCTTGCTGATTGTCCTGA
AGCATTTTCTGGTCTCACGCGGCTGCGACTGGAGAATCTGAGGTTTGGTG
AATCAGACATACCCAATATCCTTAGCGCCTGCAAGCGGCTGGAGTCATTG
TGTTTCTTTGAGTGTGACGCAGGGGTTCGGTCAGTACTGCATGTAGAGCA
TGCTCGACTCGTTGAGCTTGATATTTCCTATGGGGAATTCAAAATCGTGG
GGCTGGACTGTCTACCAAAGCTCCAACGGATGACCTATATTTGGTTCTTT
GATGAAAGTCCCTTGGTTCTTGGTTTTGTCCCTCAGCTTTCGAAGCTTAG
CCTCACTAATGTACGTGTTTCAGACAAGACCCTCGTTCTAAGTCAGCTGC
TTGCTAATGTCCAGACTGTAAACGATCTGTATCTGGATTTTGGAAGTGAA
AAGGTACTCGGTCCAATCAATTTCTGTGTTGGTTTCACCATATGATGGCT
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TTATCGCACAACTTGCACTAATTTTATTATTTTGTTTCTTCTATTCCAGA
TTTGGTTTCAACCAGAATGCTCGACAGTGCTCGCTCCTTTGCTTGGCCAA
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CATTATGGGATCATAAGTGTGGAAACGAGTCACAAAAGAGTTATTCTAAG
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TCTGGCCAAGCTAATCATCTATGGCTTCCAGTCCGACAGGAACTTCATTG
GGTACATCAGGCGTGTCATGGAAGCTGCGGTGAACATCAAGGAGGTGTCT
CTGCATGACAGGAAGGTGTGCAAGCTCTGCGCTGACATGTTTCCTCACGT
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TGAGGAATAAGATCACAGAGGCATTGGTGATGATGGCTTCCCCTGCTGTG
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TTGCCACGATCTATCCTCTGTGTGGTTTGAAGGAGTCCCACTCCCACTGC
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GAACATGATGTGTGTTCTAAATTCATATGAAATTTCGTAGAGAAGAAACA
TCTGTAGTGGTAGTCTGAAAGAAAAAACAAATCTTAGTGCTCTAAAAGGG
TTTTCTTTGAGCACGAAATTTTGTTTATTATGCCCGGACCACCACATGGT
CTTTTCTCGGTGAAATTTTGCATGCAGTTAGAATACATTTTCATGTCATT
GTAAAAAAAAAATAGTTTTCTTAGTTTGTTTGCTATGTCCTGAGCTCTCT
TTTGAATTTCTACTCAGGCAGGAGCATTAAGCCTGAGCTCTCTTTTGAAT
TTCTGCCCCGTGTGTGCCTTGTAATGTTATTGCCTCATTGGCTAGCTCAT
ATGAAATGTACCTCAGCTACCTTGTTGGAATAATATATTTTTTGTATTTT
GTGAGAATGAAAAGATGAAACATATATGAGTTTTCATGTATTAGTATTTT
TATAAATGCTCTTTTCATTTCGTTGTAAGTTAATTAATTAATAGATGACT
GTTTTTCCTCTGCCTAAGTGCAGTTGGAGAAAGAAGCTGGCAATGTGGAG
AGGCTAAACTGCCTAATGACTGCTCCTCAACATTCTAGAGAGGGTGAGTA
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CTCACTATGCTCTCACAGATCGTCATTGAACTGAGCCTTTGCGATTTGGT
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GCCAATCTTTCCAGTAGCAAGCGAGCGTATAGTAGTAGTAGGTGCAACCG
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TTGTGGGGAAAATATGAGCTTCATGTATTTACATATGGTTTGCAATTGTT
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ACACTCAATTTTGCAATGTATTATTATGATGATCGAAGAAGTGTTTAACT
TCCACTTCCCGTTATGTTCTTTTTTTGTCACCAGTAAAATATTGTAATGG
TTATATAGTTACCGGAAGTATGTTTAAAGCTGGATTGACTACAAGGCAGG
GAATGAGTGGGGGATAGGAGGGATGGGTGTGTCCCTTCATTGATTTTGCA
CTTGCATTTTTTATTATAATAAGCAGCGACTTGAAAGTATTGACAATGCA
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AAACTGTTTAACTTCCAGTTCTGGTAATGTGTAGTTATGTTTTTTTTTGT
CATTTGTAAATATTGCAATTGTTCGTTTGAAACGACAGTCTCCCGTTCAA
TCTAACCGGATGCATATTTTTGGGACCTAGGAACTTTTGTATCTTGTAGT
GCATGAGAACTGATTTACCATAAGAGTTTTGCAGTCAGACCTGCCAGTAT
TGTTTGAATGGGTGTACTTCTCTCAAGAGTTGTTGACTGTACGGAAACAT
ACTACTGCTGTGGTTTTTCTGTGCCCATGCTATATCTGACTAGTTGAATG
CTCGTGCTACGGGTGAAAAGTTATATATGATTAAAAAAGATAGGTGCAAT
ATTAAAAAATAATAGAATTTCATCTTAACAAAAAATTAATAATTTGATAA
AAATTTAAAATTCAATATCATAGGAAGCAATAACCTAACAGTTATCTCTT
ACATTTAAGTGCAAGTGAGTCACAAAATAAAGTATACAACCTCAATAAAG
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TTCCCAACAGCTACATGAACTATAGCTTTAAATTATGTCTCAATTAGAAA
GCTCTAGTCGTTCAAGCTAAGACTGCAAAACTCTCATCAGTGAACTTGAG
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ATATGGTTCTGATTATGAATCACATATTCACGTCAGATTCGCCAATGAAA
AAAATCTAATCTGCAATTCAGAAATCATTTTTTATGTCATAATTCTATTC
TTAGGAGAATTCAGGACAGATATCAAACTTCTCATATCATATCATTCATG
CTTATTAATATATGCCACACACACACACAAGTGGCAGGGACCAATAGAAT
CATAATAATCATCAAAAGTCGGATAATATTTACCAAACACCTTAACAGCA
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TAATTTAGAACTGCCATCCACAAAATTCAGAGACATGTGTATATACACTA
AGACAAATGTGTATTTTATCACACAAGTTGCAGACACTGCGAAAGAAATC
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CCATTGTCTCGGCCTATTGTTTCCCTCTTTTTAATCGCCATAAAGGCAGA
CCTCTTGCCTAGTTTCAAAGTGGAAGAGGTCTGCAATCAGGACGCAGATA
CCTATTGCAGATGGGCTAAGGGCGACTCCTCCAAGGTCTCGCTAGAATAC
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CACCAGGATCTTTGCACAATCCCTGGAATCATCACAAAGAAGATTGGTTG
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CTTATAGTAGCTGTGATTCAGTATTGCAGGTACAATGCGTATTGCACAAG
CACCACTTCAGCGTCAGTGAAAAATAACGCCATGTTCTCCATCTACATTC
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AGCACATAATGTCTCCCTCTCGGCTAGCTCCTTACAAATCTGAGTGCTCT
TTGCTAGGCAGTTCAATAATTTTCTTCGTGATTGTCCAGATGCATTTGCT
GGTCTCACGCGACTGCATCTGCAGAATATGAGGTTTGGCGAATTAGACAT
AACCAACATCTTTATGGCTTGCAAGCGGTTTGGTGCTGCATGTAGAACAT
GCCAGACTCATTGAGCTTGGTATCATTTTTTCTTGAAGCTGCACCATGCC
TGGAGAAGCTTTGCATCATGGTATGGGATCATAAGTGTTGCAGGGAGTCA
CAAAAAAGTATCTCCAAGAAAACAGATGTGAAGTGGGGGCCATCTTCCAT
TTATTTTAAGCACAAGAATTTTGCCAAGCTAACCATATATGGCTTTCAGT
CTGACAACAACTTCATGGCATACTATTGAAAACTGCGGTGAACATCAAAC
TGGTTTCTCTGTATGATAGGAAGGTGTGTAAGATCTGCACTGAGAGGTTT
CCTCATGTCGAGGTTCGTCCTTCGAGTTATCCACAAACAGACGAGGAGAA
GGATTCATTGAGGAAGAAGATTACAGCGGAGCCAAGGATGATGGCTTCCC
CTGCTGCGATTCACTTCCTGTCTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.