Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA013632

[Submit comment/correction]

Sequence	AA013632
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA013632
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCCTCCCTCCCTTTCTTGCCGTCGGCCACCCCAGCCCCGCCACCTTCCC GCCCAGCCGATTCAGCTATCCCAGGCTTCCAGTCGCGCCACTGCGCGCGA ACCCTAGCGGAGCCCCTGCAGGCCGGCGTCGACCACGAACCAGCCCGGCC TCGCACGGCTTCTCCAGCTCCTCCCCGACCTCCTACGCGGCACGGATGAC GCTCCTCGTCGCTGGTCCGGTCCTACTTCCGGCGCTCGTCTTAGACAAGG ATGGCGACCGGTTTCTCCTCCAGAGGCGCCGCCAGAACAAGGATGCCGAC CTGCTGCTGCGACTTTCCTCTGACCTCGCTCATCACCCTCGCCTCCGCTT CCACACGCCGCCGGTGAGCACACACGAGTCACGAAGCTGCATCCTCCCTT GACCTCACGTTTCTTGTTTCTCTACTGCTGCTGATGCTGCTGCGTTTTTT CCCTCTGTGTGTGTGACAGTGGGTGTGGCGAAAACAAACCCTAGCAGCTT GGGATGGATGCCGCGGTGAAAGGCGGCGGTGGGTTCAGGCCTGAGGATGA CTTGGTCTTGCTCCGCTTGGACGACACGGGAATGGCGAGAATGTCTGTGG CTGGCTGCCAGGTGACTTCTGCTATTGCTACCCATTTCGTTTTGTTGGTC AGCATATTGAATTCAACGTGGCAAGATTTAATTGTCATTATAAACTGTCG ATCTGTGATGACTTGAGAGCAGAATGCCCATATATGTGTTTCCAGTTACT AGAAGAATCTGCTCATGTCAAAGATTATTCTAGTTGCTTTATTATGGCTG TATGACTAACTTCTCAATTGGTATTCCTAGACCCTGAATGTTTGAACCTG AAGTATGTGCGCTTTTTCATTTTTTATATCCCTGATGACTCTTGTTGGAT GCTAGTTTGCTACGGTTATGATGAGTGCAGTGTGATGACAAGCAAGCATC TGATCTAATTTTTTTCATGTCTCAGGGATGGCATCCAGCAGGGGAAGAGC TGATGGCAAGTCGGCGTTCTCGGAATGAACTGCCCAATACCGCCATGATG GAACTAGACATATAACTTCCAGGTCAAGGACCGGACCAAGAGCCAAGAGG CACCCCTGCCCCGACCTAGCTCAGGAGGACCCAAGGCTGCTGCTGCCAAG TCTTCTTTGAGTGTGGCTCTGCCATAGGTAAATCCCTATGGAGAGGACCA CCTTAGCCAGCTCCACCCGCCTCATTCTTCCCAATGAATGGAATTAGTTT CATTCATAGATTGCTTTGCTTTTCACGGTGGTGGTAGACATAAATTATAG TTTCCAAGCTAAATGCTTCTTTAGTTTTCATTGATTAAAAATCTTGGGAA CTTTAGTCTACAAATTCTTTGTCAGGAAAAATGAGTAGCTCTCCCCATTC CATGAATCATATAGGCTGCAGTAACCATGTATTACGGCTGCATGCTTACT TGCTTGATTAGTTCTGCCTGCAAATATATCTCCAAGTTCTGCTCATGCTT GAACCTAACATGCATTTGATTGATTAAATTTTGCGATCGAGTAGAGTTTG CCTTGCATCTTATATTCAGAATTCTTGGGTGACTGTATTTGCCAAGAGAG GACATAAAGCACAAAAGTAAGAGCTAGTGACTTTGGTTACAGACTTGACA TATATATAGGGACCAGCTTACTGTTAATATTTGTGTGTACCGAGGAAGAT TATAGGGACCAGCTTACTGTTAATATTTGTGTGTCAATTTGCTTCAGGTG ATGCTTCTCCGGGCTCCCGAGTTGCAGCAGTAGCGGATAGTTCTTCCTCT ACTTCACTTTTCCTCCCGCTGTGCTCCAAGTCCCGCTTCTGGCTAGTATG GCTGCCATCGCCCTCGCCGCTGCTGGAACTGGCTGCCCCTGTCTCCACCA ACCGCTGCCTCATCGGGGACTTGGGAGGTTGCATGTCCACTATCGCCACA CCCATGCAACTCCCATCTCTTCTTCTCCCTCTAGACTAGACTTTGAAGGT GAGTAGTTACCTAGTCTACACTTTGAAATAGCTAATATGCTATTCCTGCC ATACTAAATTGATGAATCAATTATGTATGTAATATTGTCTTAGATAGATA TGATATGATATGATAAATGATATTAATTTCCCTATTGGTTTGATTGGCTG ATATGATTTCCTAAATACCAAACGAATCTGATCATTCTCTCATTTCCATG AAAAAACATGAGTTTTTTGCTTGCACTGTATGCCTTTGCCAATCTATATT CTTTCTTGTTGCTTTTTTAGGGGAACACTATTGATGTAGATGAGGTGACA CAAGTTTTATGGGTAATTTGCATCTGAGGCATCCCTGTGATGTAATCTAG CATTTCTGTTGCTTCTCATAATTCCACGAGAGAAGACCACTGCAGCATCT GCGAGCTGTTGTGACTGTTTTCTCATAATAGTTAATATATTAGAGTTTTT AGTCATTCTTATAACCTGTTCGTTTGCTGGCCTGTAATTTTTGGTGCTGT TTATAAGCTGACTAACAGTAGTATTCTTTGACCTCTAACTTTATTTAATC TTACACATGTTGTTTTGATGATGTGGTGAAGTAGTGCCCTGTTGATCTCG ACTAATTGATCAACTAGCACTTATGCATGCTCTTGCTGGCATGTGCCTAT ATTTTTCCCAATGATGTGTTCATTGTAGTCAACATGTGGGGTTTCTTTGT TTGACTTAAACCAAATATTTACTTAAACCTGGAGCTGAGTTCTTGTTATT TATGAAGTTTTTGTCTATAATGTGGCTGGTAGCTCTCTTATAGGAGCTGA TCTAGACTAGCTCAAAGTCTCTTTCGTGACTGAACACAATGTTGTTCCTT AAGATGAACTCTCATTGATGCATGTGCAACTGCCTCTAAACTGTTGTCTA GTATAATGTTGCCTCTAAAATGTTGTCTAGTAAAATGTTGCTTCTAAACT GTTGTCTACTACTAGTTGCCTGACTTCAGAATTGTTTCTAGATTAATCAA TTTCTTTTTTCTTAATAGAAAGAAATTTGGAACTAGAAGCCGGTTGTGTC AGATTTCTTTCAACTTGAGCTCGAAGATTATAAGAAATTTGCATGCAAAT ATTCTAACCCTTAACAATACTGTCACCTTGTGTTATTGCTCGTTTCTACT TGATACTCATCCCATTTTTTCTTGTAGGTTAACAGATTGTCCCAAGCCCA TGAGCATCCTTGTACTCCGTTGAGACCTTCTTACCATGCTCTCCTAGTTG CATTTCGAGTACTTTCTCCTTCACCTCCGCCCTAGCTGTCGTGCAATGGC AGAGAGTTCACTGTGCCGCGGTTGCCGTCTTCTATGCCTCCATGGATTAA GTAAGCTCTTGGGTTATTCTTCTTTAATCGAACATGTTTTGAAAATGTGG TGAAGTAATGCCTTGCTGATCTTGACTAATTGATCAACCAACACTTATAC ATGCTCTTGCTGGCCTGTGCCTATGTTCATTCTAGTCAACGTGGGGTTCA TTTGTTTGACTTAGTTACTGTCAAACTTGATATCATTTAGTGTGGGCTAA ACCTGGAGCTTGAGTTTTTGTTATCTAAGAAGGCTTTGTCTATAAGGTGT CTGGTAGCACTTGTAGGAGGTGATATAGACTTGATCAAATCTCTTTCATG ACTGAACAGTGTTGTTCCCTAAGGTGAATTCTTATTGATGCATTTGCAGC TGCTTATAAACTGTTGTCTAGTAAATTGCTGCCTCTAAACTGTTGTGTAC CACTTGTTGCTTGACTCTGCAATTGTTTCTAGCCTCTAACCAGAAGTGGG TTGCGTCAGCCTTTCAACTTGAGCTCGGAAAAAATAGAAGAAATTCGCAT AACCTCATGCAAGCATTCTACCCCCTAACAAGATTGTCTCCTTGTGTTAT TATTCATTTCTTCTCGGTACTCATTCCATTTTTTTCTTGTAGGTGAACAG ATCGTCCCAAGCCCATGAAGATGCTTCGACTCCGTGTAGAGCTTCTTCCC GTGTTCACCTACTTGAATTTGAACTACTTTCTCCTTCACCTCTTCCCTAG CTGTCGTGCTATGGCGGAGAGTTCACTGTGCCTGCCTTCTTCCATGCCTC CATGGATTAGGTAAGCTCTCGGGTTTCTCTTAATTTTTCCTCTGCAATTG GTGGTTTTGTGCTGTTGGCCTAAGCTTGGTAATATTTGGTTCTCAATACC ACTAGTTGGTGCTGTATAGTGCATGGCTAGTTCAACTTTGGAGATTACAC TTGTACTATTTTTTTCTTGCATGTCTACTAATGTTCAGTTTTTTTACCAT GTACGATGTTCACTTGTCCTATTGTTCTTTCATCAGAAATCTTGCATGGC TTTTTTGACAGATAAAATAACTTCGTTGGATGATAAGTAACTTTGGAATG TTAGTGCTGATTATTTAATTTGGAGTGCTATACAATTTTGAAAGGGAGTG CATGCTTTTGTTTGTTGCCTGCCTCACGTCTGTTTGGCGGATTAAAAATA TGGGCACTCATAGCATGTATCACCCATCTGTAACAAGTTTTGTTCTTTAG CATTTATCTCGGTCAGAACTGGCCTAGTAAGCTACTTATTTGGCCTGATT GGAGCTCTTCTCCAGTCATCTATTTTGTCATGGCAAATGTCTAAGAAGCC AAATCAATCTTAGCTTATATGAGGCTTTACACAGAAAGTAGGACTAGGTG AGTGCTTATTGAGTAATTGGCACCAAATTAAGTTATTTGTTTAACCCCGA CTTTAATGTATGGGCCAGTAGCTGAAGAAGAACCAGGCCTAAAGTTTAAA AGTAGTTCTGTTGTCGGTCATGATCAATGCTCCACAAAACTTCATGTTTT TTGCCACCATAAAATGTTTGAACTTGACCTAAGTAGTGGTATATCACCAT CGCTCAGCTAGTATGTTCCTATTCGCGTTTTACCTTTAAGGTTAATGACA GTAACCAAAATCTTTTATCCTTGAGGGTTTGACTACTTCACAACAGGACA GGATAGCTTCACGATCTTTTATTCTGTTACTAGGGATTTAGCTGCTTATA TTATGCACATGAAGCTTCTCTGTCTAGTTGAGAATCTTGTCTCTGTCCAA GAAGCCAGACCAATGTCAGCTTATATGGGGCTTATTAGAGCTTATTTTGT AATTAGCCCCATATATGGAGTTTAGTAAAACTTGGAATGAGGACTTGAGG TCCCATGTGGTCACATTGGCTGATAAAGGTTTGAATGTTTGTATCTGATT TTAAGAAGTGAATGCATTTGATTTGTTTTCAGCTCTAGACTATTTAGTGT ATTTAATTAAATTTGGGTTACTGTGAGAAACTTAACGGAGTCATAGAAAG CAACACCCATCTACCTAGTTCTTTTATTTAGATAAGGACTAGAGTAGGTT AAGAACTCATTTGCTTCTGTAAGTATGGCAGATGTCCACGAAGCAACATG ATTTCCAGCTCATATGGGGCTTTACGCAGTAGTGGCCATATTTGAGAAAC TTTATTCATCATGATGGTTTATTGGACCGATTTAGCATACATTTTTCACA TATAACACTACAATTAGTTAAACGATGGAGTATCTCTTCTGCACTGTTTC TTATATTCTTTTAGAATAGGAGAGTAAATCCCATCCTGTTTTTCTGTCTT GTTTTGATAGATCTCTGTATTGTGTACATCTTGTTTAACATGTCTATTTA TTTGATTGGTTGAGTTGAGTTTTGAGGATTACTGTGATTACTTTCTGTTC ATGCATTCAACATAAATGTAATCTTGTGATTAGTTAAGTTAAGGGAGCTA GATTTCTAAGTTTCTTATAACCTGGGGATCTCATGGCAATGTCTTGATGA ATGACAAAGGGCCATGTGGGTGCAACGACTCATCCTTTCAGAGGGCATCA AGTATGCGACTATCAATGCTGAGCTAGGGTGATTGGTTCTCTCGCTTCCA TCATTATTAGGTTGCATCACTATTTTTGATTTTCTCCTGTTTCTTCATAT ATATATACTCTATTAAGCGGTGGGCATGTTAACAAGTAATAACACTACCT CATTTCTGAAATCTTTGAACCATACAAATTGTCTCCCTGTTATGATGCCA CCATACTGTCTCCCGGATCGAGCTAAGCAGAGTGGCATATTGCACTTGAA TATATGCTGTTTTCCATAATGCTATGATGTTGTTTTCATTTGGTTTCTGT CACTGCTGGTAAAAACCCTTCCCATCTACTTCCTGTTCAATTACTTGGCA ATACTTAGCACCTGAAGTCAAGACCCTCATTTTGGCATGCTTGGCACATG ATCTACTTGTGCAAGAAGGAGAGGCATTGCATGTTCTGGCTATGGCTGTG CTTGCCGTGGCCTCCTGTGCCTTGCACACAGTTGTAGGCCTGGATGACCG TGGACTGGAGTGTTACACGGATCAGTCAGCGGATTGTCGCGGGCTCGTGG CGCTGCACTCGTGAAGGGGAGATAAGTGGATTTTTCTCTGATGCAGCAGC AGTGGAAAAGTAGAGCTGGCCGGGAGGGAGCCTTGGCTCATTGGCTGCCA GATGGAACCTGTTTTATTCTAAGCTAAGAATTAATGATGTTTCTCTTGGG CAGACTGCCTTTCATCTTTAGGTAGCTATATGCTGGCATAATCTTGCTTG ATTAGAGTTTGAGTCGGATTGTTGGTTTCTGTGGCTGCTAGCTAGAAAGT CCCTAACATTGTTGGTGTAGTAGCAATCATGTATATATGTAAATCTTTTT GTTGTATAGGCGTCAATTTCTCATATCTTTGTGTGATAAATTATCTTCTG AGGCATGACCTATAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.