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GrainGenes Sequence Report: AA013531

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Sequence
AA013531
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013531
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCGCCACCTCATCAAAAAAGGCAAAGAATAAGACACGCACCCGCGCAG
CGTGCGCCGTGTGCCCAGCCCACCCTCTCGCCCGCTCTATCCTCAAAGGG
GGAGAAGGGGATAGAGTGAGGAGCAGAGCAGAGCAGAGCTCAGCTCACTT
CAGCTCAGCTCAGCAGCCAAGCCCGGAAACCCCACATGGCCATGGCGACC
TCCACCTTCTCCCCCCACCCGCTCCCGCTCAAGCCCCAGCTCGGCCCCAA
GCCCCACCGCCTCCACCTCGCCCCCTTCCCGCGCCTCCGCGCCAACCGCC
GCCTCGCCGCCGCCGGGGAGGCCCCCGTCGAGGCGCCGCCCAAGCCGGAG
GCCGCGGATCCCTCCCCCGCCGCCTCCAACGGTTCCGCTGCCGCTGTCGC
TGCTCCGGCAGCCCCCGCGGCCAAGTTCAAGGCTGCTGCGGCGGCGGAGG
TGGTGGCGGCACCCAAGTTCGAGGACTCGAGGTGGGTGAACGGTACCTGG
GACCTCAGCCGCTTCGGGAGCCCGGGCGGCGCCGTCGACTGGGACGCCGT
CATAGACGCCGGTCAGATTTACTGCTCACCTTCCCATTCATGTCTGTCTT
CATGCTGCCGCTGCTGCTGAGTAGCAGTTGACAGTAGCTAAGCACATAAT
CATTCCATTCGAATCCGGGTGGGGATGAGTAAGCACTCCATATTTGCTCC
ACATAATCATTTCGACGGCGCGGTAATCGCGCATTAGCTATAATCCGGCC
GAGTTGCTAGTGTGCTTGAAGGGGTAATTCTCAGGATGGTGCAAGCTGGA
GGAGAGATTTACAACTATGTGCTTTACTCTCTCCAAGGGTTTTGCAACCT
ATCCGTCATAGCATGTTGCGCTTTATGCGCGGCGGGGCTAGTGACCTCCA
TCTTCTGCGTATCAAATTGCCGCATCCTTGGAATTTTTGCATGGCTTTTG
ATGCCTAGCGTGCTTGATGAGACGATGCTCAGGGTGATACAGTTACAAGC
CGAAGGAGGGGGCTTTCCAGCTATGTGATATACCCTCTCCATGGGTTCTT
CAGCCTATCGGAGCATATTGCGCACTATTCGCAGAGCTAGGGGCTTCCAT
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TACTCCTATTTCTCAAGTGTGTCGCTAGATGGAAAGGTTCGACGAGTAGG
CTCTTCCCCATTGGGAAATCGGTACTTCATGTACACCAGCTCTCACACGA
AAGCAAGTAAAGTTCTAACGGTTTCAAAATTCAAATCGGGCTGCAAGGTA
GTCAATGATAATAAAGAAGGGAGTTGAACTTCAGCCAGATCCTAAGGGAG
ATGCGCTCCCACTCTCGCTCTCGCTCCCGCTCTAGCTCCGGGCGAGGGGC
TCGGCACCGCCGCCATCGCTTAGCTAGCTGCCTGTCGCCCGTCTCCTCCG
CGCTTCGCGGTCGGGGCGCCACCACCACGTCGCGTGCGAGTTCCTCGCCT
CCGGGACCCAGGTACACGTCGCCGCAGCTCTCCCCCGCGGCGAGCCCGCA
GCAATCTCCCCGGCGTTTGTCGCCTACTCTACTTCCATCCTCTTCGCGGC
CACGCTCCCCACGCCGTCTCCCGCTCACCTTGCTTCCCCAGTCTCCCCCG
CCGCGAGGATGCAGCGCGCCCGTGCCTGCCGGCGATGCGAATATTCGCAG
CGGCTCTTTCCGCGTCCTGCGATCGCGCCGCCCTGGGGATGCATTTTCCC
GTCGCGTCCGTCGCCAGCTACGTGTGTCCGTCTGCAACCCCGCCGCTGCT
GCCGCGCGAGGCCTTTCCCCCGCCTCCATCTGGGTGACGCTGCTCCCCGG
CGAACGGTGCGTCAACGCCTTCGTCGTCGCCAATGGGCTCACCCATGTCT
TCTCCTCGTTCGAGGACAGGTTCCGTGTCTCCGAGCTCAGCGCTGGGGTT
TTCTCCTCGTCTGTCTCGTGCGCTGCCGTCGCACGGCTGCTGCGCCGCCG
TGCAGCTTTCATCTTCGCTGGCGTCGTCTTCCTCATCCACCTCACTCCGC
CGGCCGCTGTGCAACGGTCGGGAACTCAAAGCGTGGATGTCAACTCATGC
CGGTTCGGGGCGTTGACCTTCCCCTTTGGATCGCCAACGTTCCCTGTCCC
TTTCCGTGGTGGGTCCCACCCTGTCGCCCCCGCTCGGCGCTACGTACCGT
TCCACACCGCTCAACGGTGCGACGTGCCAAAGCCAGGGCCTGCCCCCCTC
CCGTCCGGGATACGTGGCGGACTCCGCGGGCTTCACACTGCCACGTCGGG
TGGAGTTGGGGTGAATCACGCCTCCTCCCCATCGTCCGTCGCCGATCGTG
CGGCTCGTACGTGGGCAGAAGTTGTGAAATCTCCGCCTGGGCCCAGCGCA
GCGTCAACTCCCTCGCTACCTCCGGAAAACTCCAGGCCTACCCCGTTTGC
CCCGCAGCGACCCCGTCGCCGCCCTTTTAACCCTCTTCTCTGCTGTTACC
GGTGCCTTTCACCGGAGCACTACGTCAACGAGTGCAGGGACCCCATCAAA
TGCAAATTGTGTCGTCGCTCCGGCCACCGTGCGCGTGAGTGCACTGACCA
TGCTGCCCGGTGCCGCTCGGCGCCGCCAGCTCCGATGGAACCTCACCACA
TCACCCCTCCGCCCCGCCGCTACCCCGGCGGCCGGCAGTACCCCGTCACT
CCACACCCTGCGCCTCCGCCGGCCGGGCAGCCGTCGCCATACGTCCCGCC
CTCTCCTATCTCCCACTTTGATCTTGGCGAGTCGTCGAGCAGTGACTCCA
CCGACTCCGACGTCCCGGCACAGCAGCGTCACCCGGACAAGCTCGTCGTG
TTCATGCCGCCCGTTGACATGAGCGCCTTCTCCCGGTTCGGCTTCGCGTG
GGTCGACCCGGAGGTGTCCTCGCCCGGTCCAATCATCCAAGAGGCGCTTC
TTCTCCATGTCCCTCTTGGCATGGAGGCCAGGACGGCCACAAGTGCGTAC
GGCGGTGCGCTGGTGCGCTTCCGCACCCCCGCCTCGCGCGCGGCTGCTGT
GGATGGCCCCTACGCGGTGCAGGAGCACAACGTGTACTTTGAGCGCCATG
AGGATGCGCCCAACCGCCTCCGCCTCGCGCACCAGGGCTACGCTGCCCTT
TCCCTCGTCGGCTACCCGATTGAGCACTGGAACCGCACCCACATCCGCCA
CTCCGTGGGTGGCGTCGGGAACCCGATGGAAATCGCGGAGCTGTGCATGG
CGGGCAACGAATTCATTTCGGTTCTTGTTGTGTGCAAATATGATCGCTTC
AACCGCATTCCCCAGGACCTGGACATGGTAAACGCGGATGGTCTGTACAC
TGTTGTTCAGGTGCGGCGTGTTCGCCGCTGGACATTTGCCGACGGAGCCC
CAGGCGGTCCCGACGGCCCTCCAGGCGGCCCCCCCGGCGGCCCTCCCGGT
GGCCCCCCCGGCAGCCCTCCGGGTGGCCCGCCCGGCGGCCGCGGCGGCCC
TCCGCCCGACTCCTCCGTCGCCAACGCATACGACTGGCCTAGCCTCCTCT
TGCCGGCGCATGGCGCTGGCGGCCGCAGGGGCGGCGGTTGTGGGGGCTCT
GCTCCCAGTCCATGTGATGAGTTGGACGTCAAGATCGACGTGCCTCTGGC
CTCTGGCACCGCTGGCGTTCCTTTTGCCTCCATCACGAAGGGCGGCGTCC
ATGGCTCCCCCGACATTCAGGTGGCTGTATGCGACACATACCTGCACGTG
TTCGTATGTGGAGCTCGCGAAGGACAGGCCTACTTCCGCGTGCCACGCAA
GATTGCCTTCTCCTCCGACCCCGGGCCGCGCGGCATGGCGCACGTCAACC
TCGCGACTGGGGCCGTTGGTGTCATCGACGAGATCACCGTCGTCCGAGGC
GCTGCGACGATCGTCTCCGTCGGCCTTCTCGCGGATGCCATCATCTCCGA
GACGCCTTCGACCTTCGCCTCGCTGGGTTCCGCTGCTGGTTTGGGTGTCG
TGGAGCCAGGCCGGGTGTCTCCGGTGCATGGGCCCGACGCTGCGTTCCCT
TGCTGTGGCCATGGGGATGGAGACGCGCGCCTCAAGTCTGCTGCTGCCGC
ACTCCCTGCGGTCGGCCGCCCTCGTAGCTGCAAAGGTGCTCGTGCTCCTG
GACCTGCGTGCATTCCTGGACCGAGCCGAGGCCCGCGCGAGAGCGCCCGG
ATCAAGCGCAAAGCTGGCGCCTCGTTCCAGTCCGTCCTCTCCCGAGCCGT
CCAACGCCGCGCCGCAAAAGACGGGGATGCGGTCGTTCCTCGCCAGGCGC
CGCTGCCCCTCACTGCCCTCGAGGTGCGTGTTGTTGGCGAAGCCTGCCAG
CTGCCTGACGAGGACATCGACGGTGCAGTTGCTGCTGTCCCGGTGGTGAC
CGGTGCTCCATGAATCTCAAGTATGCTCCTGTGAAGACCTGCAGCATAGA
GTTCTGCATGGCTTCTCTGCATATTCCCGTTCCTGTATATTCTTGCGCTA
GCTATTCTGTTTCATGCACTGGGGCGCGTGTGTTCTGCTGCAAGCGTCTA
GTGTGTGTGGTTCGTGGGCTTAGGTGTACAGGTCGCCGTGCTGCGTCACG
AGCGTGCCCTTCTCCCTGCTTAAATCTCTGTATTTTGGCCAGTGCCGTGA
TGCCTGGTTGTACAGCTCGCCGTGCCTCGCCGCGCGCGAACCGTAGAGGT
GTGTATATATGTTAGGTATGGAAGCTGTCCCCGTAAAAAAGCTTGCCATC
GGTTCCTGGAACGTTCGTGGCATCAACGATGAAGATAAATGCATCGATGT
TAAGCGCGGGCTTTCTGCACACCCTATGGACTTGATCTGCCTCCAAGAAA
CAAAGCTGCGCGACGTATCCTCTCGGAAAGCGTCGTCCTTTCTCCCGCCG
GGCTTCACCTCCTTCGTGTTCAAAAACTCGGACGGGGCATCGGGGGGCCT
CCTCACTGCGTGGCGGCCATCGTCTTTTACTCACATCCGTGATGACCAGC
GGGTGTTCACACTCACCTCCTTTTTCGAGTTCGCCGTCGACGGGACCCAA
TTCGCGGTCACCAACGTCTATGCTCCCTGCCTCTCTGAGCTTCGCGCCAC
TTTCCTCGCTGAACTCCGATCTGTGGCATCCGACGTTGCGGTCCCCTGGC
TCGTCCTCGGCGACTTCAACGTTTCTCGTTGCGAGGGGGACAAGAATAAT
GGAAATTTTGATGCTTCCTCCGCGGGAGCCTTTAATGAGGTGCTCGACGA
CCTCCTGCTCCAGGAACTCCCACTACTCGATCGGCGTTTCACCTGGACAA
ATGGACGTGCGGTGCCCACTCTAGTGCGCCTTGATCGAGCTTTCATCGAC
CCTAGCTGGCAGCAAGTGCTCTTTAACTCATGTCTCCGCTCGCTCGTCCG
AACGACCTCGGATCACGTGCCCCTGGTTGTCGAGGCATCCTCGCGCGCCC
CGATCAGCTCTGTCTTCAGGTTTGAACGAGGGTGGGCCCACTCTGAGGAG
TACCGGGCCAGTATCTGTGCTGTGTGGGCTGACTCCCGGGACCACCTCCC
CTCCGCGGGCCGACGCTTGTCCAGGTCGTTGAAGTGGGCCCGTGCCTCTT
CCAAAAAATGGGCCCGCGCCAAAAAGCGGCCTCCCGTCGTCGTGTCAAAT
TGTCGAGCTGTGATCGACCTCTTAGATCGCATGGAGGAGCTCCGCGCCCT
CGCGCCTCATGAGATGCTGCTGCGTGATGCGGTCAAGCGCCAGCTTTCCC
GTATGTACAAGCAACTGGACGTATACTGGAAGCAACGCTTCGCCTTCAAG
TTGTGCAAGCTAGGAGATGAAAACACCGCCTTCTTCCACGCCGGGGCGTC
TGCGAGGCTGCGCAGGAATCAGATCAAGGTGCTCCATGCCGACGGGGTGC
CTGTGGCGTGCCATGTTGGGAAGGAGCGTATCCTAAGTGACTTCTACGCA
AATCTACTAGGAGAATCCTCTCCCCCCATTTGGTGTCGTGAGCCTAGCCT
GTTGCTTGACTGCGTGCCTGGGCTCACCGCGCTTGAGGATCCCTTCACAC
TTGAGGAGCTTCGGAAGGCACTCTGGTCGATGAGGCTAGACAGTAGCCCC
GGGCCCGACGGCTTTGGCCCCGCCTTCTTTCGCTGCTTCTGGACCACGGT
CTCGTCTGATCTCATGGCCTTCCTTGACGAATTCTACCATTGTCGTGCGG
AGCTCGATGGCCTGAACCGCGCGTACATTGCCCTACTTCCCAAGTCCGAA
GATGTTGCCACCGCGGACGGGTTTAGGCCCATATCCCTTCAGAACTGTGT
GGTGAAGCTGCTCACGAAAATCTTGACCTCACGCCTACAAAAGTTCATTG
AGCAACTGGTGGCATACGAGCAGACAGGGTTCATCCGAGGGCGCTGTATC
ACTGACGGGTTCCTCTATGCAGCCGACCTGGTCCAGTGTTGCCGCATCCG
GGGGGTTCCTGCGGTTGCCCTGAAACTGGACTTCAGAAAGGCCTTTGATT
CAGTGAATTGGGATGCCCTCGATGCAATCCTCCGGGCGCGTGGATTTGGT
GACCGGTGGTGTGCTTGGATCCGCATCCTCCTTGATACCAGCAAAGCTGC
TGTGCTACTCAATGGGGTTCCGGGGCGCTGGATCAACTGTAGGAACGGGC
TGCGCCAGGGGGACCCCCTCTCGCCGTATCTGTTTCTGATAGTTGCCGAC
CTTCTGCGCCAAATGATCCTGAAAGATACGGACGAACATCGCCTCCTACA
TCCCCTTGTGGACGGCCTTCCGTGCCCGGTGGTGCAGTACGCCGACGACA
CGCTGCTCCTGGTGCGCGCTGATCCCGACCAACTTCGTCGCCTGCGTGAC
ATACTTCAGGAGTTCTCAGACGCGACGGGTCTCGCCATCAACTTCCATAA
AAGCGCCTTCGTGCCCATCGGCGTACCTGCTACCGACGCCGCACATCTAT
CTGCCATATTGGGGTGCCCAGTATCCTCGTTCCCGCAGACGTACCTTGGA
CTCCCGTTGTCGGATCGCAAGCTGCCTTCCTCCGCCATGGACTACCTGGC
TGGGAAGATCGAGCGTTGCATCCCCCCTTGGCAGATCCGCCCCACCTCGC
TTGGTGCTAGGCTGACTCTCTCGACATCTGTTCTATCCGCGCTCCCCGCT
TATGCGATGTCGGTAATGCAACTGTCTAAGGGGACAATCGCGAAGATGGA
TCGCCCCCGGCGTGGCATGCTATGGGGTGCCATGACATCCTGCTCTGGTG
GCTCGTGCCAGGTGTCGTGGGAGGTGGTGTGCCGGCTCCGCTCAGAGGGT
GGACTGGGTATTGTCGACCTCGCTCTTCACAACACGTGCCTCCTGCTCAA
GAAACTTCATGTTGTCCTCTCTGGGCAGCGCACCCCGTGGGCGGACTGGG
TTCGCGCGAACTACATGTGTGCTCGCCCTGCTCCCTTGACTCCTGCCTGG
CAGGTCTTCGCATCTCTCTTGCCCCTGTATCGGGCAATCACCTCTGTTCG
TGTGGGCCACGGCCGTTCCGTGGACCTCTGGGGGGACAATTGGACCTCCC
TTGGCGCGCTCTCGACTGCCCTGCCTGCAGCATATTCCCACATTGTCCGT
GCTGCCGGCTCTGTATCCGATGCGCTTGCTGATCGGGCTCTCGTGCTCCG
CACGCATGATAGGGTGACCGACCGGGCTGAGAGTGAGCTTCGTCTGCTCC
ACGATGCCCTCGACCACCTCCTCGCGCGCTCCTCCACCGCGGACGATGAG
CGGTCTCTATTGTGGGGTGATGCCACCCATTTCAGTGCCAAGGGCGCATA
CATGATGCTGAAGAGCTCTGGGTGCGGCCCTCCCCTACACGACCTGAATT
GGGCTGGGTATGCGCCTCTCAAGGTCAAGGTATTCGTCTGGGTCCTTCGT
CATGGCAATACTCGCACGCGTGCTTTCCTGCGGCACATTGGGTGTCTGGA
CACGGACATATGCCCCTTCTGCCCGTGCCGGCCGGAGACTCTCGCCCACC
TATTCTTCACCTGCTCCCGCCTGCGTCTCTTCTGGCGGCGTGTGCTTGGG
CCTCGCCGACGCGCTCTCCCCACCTCTACCGAGGCAGCCTGGGTCTCGCT
CCAGGCAAGCAACCCCTCCTGGGGCGTACCGCTGTGGAGCACCGTCACCT
CATGCCTCCTCTGGGTGATTTGGAAAACCAGGAACCGAATGGTCTTTGAC
GCTGTTCGTCTTCCCTCTTCGGCGATCCTCGAGCAAGTCGTTGAGCACCT
GCGGCTATGGCGGGCTCGGGTCCCCCCGCGTGTTAGCTTTGAGTGTGTAG
AGCAATGGTGCACCACGCTCTTGTAATTCCCTTTGAGCCGATGCTCCTCC
CCCATTCTGTAAAAAGTTTTTTGGGCATTCTTCTGCCCTCTCGTTAAATG
GAAAATACAGGTGGGCAGTTCGCCCCCCGTTGTGCCGTTCAAAAAAAAAA
TTTCAAATCGGTGCTAGTCTCTCAACTAATTCCAAATTTGATCCCATCTT
GACAGCTGTTTATTGCTGTAGTGTTTTTTGCATGAATTAACCTGAACCAG
AGTTTGTCACATGTGGCATGTGGCTGTGGGCACTTGTAACCATGCAACAG
CTTCTGCGGTGAACAGAACAAACATTGCATTCCCTGACAATTCTGGTGAC
ACTGAATGACATCTTTGTCTTGTTTCCAGAGGCCAGGAGGAGGAAATGGC
TTGAAGATTCCCCAGAGGCAAGCAGCAGCGATGACGCGGTTGTGTTCGAC
ACTTCGGTGATCCCATGGTGGGCATGGATCAAGCGGTTCCATCTCCCTGA
AGCCGAGAAGCTAAATGGTTGTTATTCCTGAACGCTTTTCTGTTTAAATA
ACTGAATCATGTGTTTCCAAATCACCTCAAAACTGCTGGTGCTGAGCGGA
CCGGTATGGCACAGGAAGGAAGGATAGTACGTTCATATCTAGCTTACACC
TTTGCATTTTCAAATCTTCTAATAGCAGCTTAACGGATGCGTATGCAGGC
CGTGCTGCCATGGTTGGATTCTTCATGGCGTACTTCGTTGATAGCTTGAC
GGGCGTGGGGCTCGTCGACCAAATGGGCAACTTCTTCTGCAAAACCCTGC
TGTTTGTTGCCGTGGCTGGCGTGCTGCTGGTCAGGAAAAACGAGGACATC
GATAATCTGAAGAAGCTGATTGATGAGTCGACGTTCTATGACAAGCAATG
GCAGTCAACCTGGCAAGACGATTCCACTACCGGGCCGAAGTAGCTGGAAG
GTTGAATTTTGTGAGAGCCAAGAGGGGTGATGCGGTGGACTTTCTCCTCC
TTATGTTCCACTGTTTCTTTTATATCAGCATTTTGTTTCCCAATTTTAGT
GAGGCTCGGTACCTATCGACGAACTTTGTAATACCTATGCCGTCTTGTAA
AAAGTATGAACTCATTTCTGTGCTAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.