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GrainGenes Sequence Report: AA008590

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Sequence
AA008590
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008590
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGCAGCGTGCCCACCGATACCCATTCGGTAACGGAAGAGTGGAAAGCAA
ACAAACTATCAGCAAACCCCAGCCCCGACGGCCCACCTCGCCGTCTCCGG
CGATCGCCGCCGCCGCGGTGCCCTTAACACCAGCCTTTCCCTTGCCCCCG
TTTAGAGCGCGCTCATACCCTGATGCTTCACACCCCATGGCCTACCACAT
TCCCCTCCCCCTTCGACGTCGCATCTACCACCTCCTCCTCTTTGCCGTCC
TCGCCGTCGCATCGGGGAACCCTAGCGCCGCCCCCGGGGTGTATGATCGA
GGGGACGAGGAGGCGGATTCCTACTCGATCCTGATGTTCCACGATTACAC
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GCCCTTCATATCTATATTTCACAAACCTTATTATATTTTCAGTTTCACAT
TTTAATTTATGTTTATCTAGACCCTTTTTGTAAAAAAAGTATTAATTAAT
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TCTGCCATCTTCAAGCTATCCGTGTTTTCTTGGTAGAGCTGAATTTGGGT
TTCTGGCCTTCAAAAACTGTTCGGGCTAAATGTCAGTCAAGGTGCAAAGT
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CATTGTCGTTTAATGTGAGCAACTAGTATATTACTTTTAACTAACCTCTG
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TGTTCTAGGTTAGGTAGTAAACTCTATCGTGCTGGTCCAGAGTTTCTATC
TTTTATTCTGACAAAGTATTTTATGTTGAAATCTGTAGCTGAAATTTGAG
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TTTTCAACAATTCTCCCCTCCGCCTTTTGGTCACATTCCACGTGGTCATT
TATTTTGAGAGGACCAGCTATCCATATTTGTATTAACCGTATGGTTAGTA
GATGGAAATGACCCAGCCTGTACAAGCTTATTCACATATTTAATATTGGT
GTTTAAATGTTACATTTACAGGTGGGAGGAGTTCAGGATGTTCAGAAAAT
GCAGGAGCAGCTGGGACACTTTATGAAGAAGTACCAAAGAGTATTACTGT
CAGCAACAATAACTTGAGCACACAAACTGATACAATTTTCTTAGACCCCC
CAGACGAGCCACTCTGGACAAATGTTTTTATCAAGAATCGTGCAAAAGTT
TCTCTGCCCCTGCGCTGGAGTCGTCTTCAGGTCTGAGGTTTAAACATTAT
CTTCACTGAAAGCGTGTTAAAATGATCTTACGAATACCACTGCATTTTCT
CTCTTGACTTTTGTGGAGACTAATGACAATTCACGTGCAAAGCACGTTCG
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TTTATTATGTTGAATATTTCTTATCTTACAAGCACAAGAAATTTCTAAGC
TGTTTGAAAAGTTCTGACAACGTGCTTCGCTCGAAAATAAGGAAATAGCA
CGTGCACATCAAAATTTTCAAGCACGAAAACTCTAATTTCCATTCGTGCA
AATTAAGAATAGGGAGTAATTAAATGGCAATAGATATAGTTAGGAGGCAA
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TTTCACATCCTAACTCCTGCCTTTTATATTGGCATAGATGAACTTGCACA
AGAACCATAAACTAATTTTTCTATAGAGAGCCCTGTTTTGTCTTTCCTAG
TCAAATAACTGGATAGCCATTATTCTGGTGAGTGGTGTCTTGTGCTTTCT
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GCTATTGAGCTGGTTGCCTAAAAAATGTAATAGAATATACCTATTGTTTG
CAAGTGATATGAAAAGGTTAGTTGCAGGATTCCAAAGACATAGGAATAGG
AAAAATACAGGAATATAATAGGAATGCATGTGCAAAACAAAGGATTGGAT
AACACAGGAATTTTGTAAACTTGTTTGGTTCACATGAATAGGAAAAACAA
AGGAATTCTAATGAACTCAAAGTCAAACCCCACGAACAGGTCCTATTATG
GCACTAACGACGTAGGTCTCATACTTCGTGCATAGGAAGTCTGAAAAGAG
GTCCAGTTGGATTGAAAAATTCCTGTGATTTCCCTCCGAACTGAATTAAA
GGAGATTGTCCTCCGCTTTTCATTTGAACCAAATGGATGAATAGTGCCAC
CGAATATACCTTTGTAAGGAGATTGTTCTGATAACCTTTTTATTTGTTTT
CTTATTTTCAGGCTCAAGGACAAATTAGTCTTATATCTCGGTCCACTCTA
ACTTTTGGCCTGACACATTATCCATATTCAGAGTTTGAACTGCTGGCTGA
GGAACTTCTTATGAGTGATTCCATAGTACAGGTACTTGTTTGGTGTTCGC
CCTGCTCGATACCATATTTTGGAAAATTAACCATCTACTTGGTGCTTTTG
CACTGCACCCTTCTTAATAATTTCAGGTCTTCGGTGCTCTACGAATGTCT
GTAAAGATGCTCCTTATGTGGAACTCTAGGATGGTTATTGATGGTGGCAG
AGATTCAGGAGTTGCCACTTCTTTACTGGAAGGTAGCAATTTGATAGTTT
TGAGGGTATGTCATTGGCCTACCATTGTAAGGTGTACACCCCCTTTACCT
GCCGTTACCCTCTTTATGATACTTTGTTCACATGCTTGTCAGGAATCATC
AGTGATACATTCTAATGCTAATCTTGGAATTCATGGTCAAGGCGTTCTGA
ATTTATCTGGAAATGGTGACACAATTGAGGCCCAACGTCTTATTTTATCA
CTGTTCTACAACATAGTGGTACATCAGAATGCTTTTGGTTTATTTGTCTA
AAGTTTCGGCTATCTAATTGCGCTTGGCACAACTTAATGGGTTTACGTTG
TATCTAGAGGTTTGGTAGCGTTTCTTGTCTTTGATGTCATTATAATTTGA
TGCATTGTGAAGTTTATGTTTGGGAGCTTGATCGCCAGTTTGCATGTTCT
ATCCAGTAGTGTTATTCATTCCTCTCGGAACGCAAGAATCAGGATACTGA
ATTTGATTGTTAGAACTTACTTCATGTGATGAACTATGTTACTTTCTGTA
ATTGAACTGATAAACATTTTCCCGAACTTTTTATAATTCTGAGTACAACA
TTTGAAGTACTCCTTTTCTTTTCTCTGCCTTGTGGTGTACGTTGGCATAA
CCCATTCAATTTCATCTTTCAGTTTGGCACCTAGATGTTTCTGATCTTTT
GTTGTCATTCAAGAACAGAATATGCTAATCGATACATAATATTTTTAGGT
TGGACCTGGAGCTATTCTACGGGGCCCACTTACAAATACGAGCAGTGATG
ATGTGTAAATACCACCGCCTTCAGTTTTTGTGTTAAATACTTGTGTTATG
CTATTTTTCTTAGCCATGGAGAGGTTAAAAATTTTAATGAGCTCTTGTGG
CTACTCTAGGGCCCCAAAGCTGAATTGTGAAAATGAGAGTTGTCCTATGG
AAATTTTTCATCCGCCTGAGGATTGCAATCTGAACTCTTCATTGTCCTTT
ACTCTACAGGTGCACTCTTAAATTTTTAAACATTCCACATGCAGTGGGGC
TTCACATATTTCTTATTTGTTAAAATACCTTTTAATTTAACATGTAACCC
ATAGTGGAATATTTTATGCAGATATGCCGTGTTGAAGATATTGATGTTTC
TGGCCTTGTGCAAGGAACTGTCATTAATTTCAATAGAGCAAGAAATGTCA
CTGTACAGCGACGTGGGAGCATTAGTGCAACAGGATTAGGTAACAATTCA
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CTGATGGCAGGTTGCCGAGGTGGAATTGGACAAGGAGGAATGTTAAAAAG
TGGCCTTAGTGGTGGGGGTGGGCATGGTGGCAAAGGAGGAGACGGTTTTT
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CCTTGTGAACTTGGCAGTGGAAGTGGTAATGTCAGTACAACATCTTCAAC
GGCTGGTGGTGGTATAATAGGTAACAGTGATGGTGTACATGAACCACCAC
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ATTCTCTCCGTCTCTGGTTCAGTGGAGGCAAATGGTGGCAGTTTCACTGG
CGTGGCAACTCATGCTTCAAATGGAGGACCTGGTGGTGGTTCTGGGGGCA
CAGTTCTTCTATTTGTGCGGACTTTATCCCTAGAGAAGAACTCTGTACTT
TCTAGTATTGGTGGGGTTGGAAGCAATGGTAGCGGTGGAGGTGGAGGTGG
CCGCATTCACTTCCACTGGTCTGACGTTCCCACCGGAGATGACTATGTCC
CTTTTGCAACTGTTAAGGGATCAATACTTGCAAGGTGCGTCCTGAAATCT
GATGCTTTCTCTGTCTGCCTTTTCCCTTTTGTGTCTACCTGCTAGTTCAG
TAAGTATCAGGTTGTCTTAGCTCAGCTTTGCATCTGTGTTATTAATTTTT
AAGATTATTCCATTTTGTAATGGTGTACCAGAATAATATATATAGTTTAC
AGTTCTTTAATTTGGCTCTGGAGTAGTCTAAAGGATTTTGGATCGCCTTG
TCTTGTGTAAAACAAGTTTTTGTCTATCTTTTTTTTTGTGAACTTATTTA
CACTGGTGTTACTGATTTTTTTCCTTGTTCATGTTCCCTTTGGCTTGTCA
GGGTTCTATGGTTTTTAAGTCTGTACTGCCATGTTTTTTGTTGTTGAGCA
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TGAGAATGGCACTGTTACAGGAAAAGATTGCCCGGCAGGTCTTTATGGTA
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TGTGTCGTTATTTATTATGCTGTGAAAACAAAGGTCATTGTCCTTTGTAG
TTTTTTCCGTCTGTTATGAACTTATGATTTCTTGAGGCACATAATATTGA
CGTCGAGAGTTTTGTTGCTTACCATGTTTCTGTGTTTACATCAGATAAGC
ATATCATTGTCGACATAGAAGCGTGCCGGAGTCATACCTTGTACTACCTC
TGTTTGGGATTATTAGTCCTAAGAGCTTTTTTATATTGTTTGAGATTATA
AGGGCTATCTCATTTATTACTCTCTCTTGTCCAATGCATGTTCACCTTTT
CCTCTCACTTCTCTCATGCATGTAGTACTATTGGCGCATGCATATATTAA
TGAGAAAGAGTTATGAAGTGTCTTGGTATTAGCAACTTGGCCCTTAGGAC
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CAAATTTGGGTATTTCCAAAACTACAACGTTTTTAGGCGCATAAGAATTA
ATTATTGATCAATGTGGAAGCTTTTCTCCCAACTTTCTATGCATGCAACA
GTCTTCCACCAATGCATGCGCTTAACCGCTTATTAATAGGCCTAATTTTC
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GCAGGAGTGTCCTGCAGGAACATACAAGAACATTACTGGGTCTTCTAAGT
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ATGAATATCCGAGGTAGTTCTTGCTGTATTTATTTCTCCACGAGAAACAT
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GCAGTGTGCTGTTATTCATAAACTTCTATCTTTGCTGGTCTTGTTTACAA
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TCTCTATATATTTTCTAGTTTCAGAATCGTTGTGTTCCTTATGTGATATT
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ATGCCTCACTGCTTTACTGCTCTCGAAGAGCTGATATACACTTTTGGCGG
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TAATGTGACAGGTATTGGAAACCAATAGGGCTGAAGAATCTCACTGCCAT
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ATTGAGTATTGGCTCCTTTGTTGTGCTGTTTGTCTTCAATTGTCAGGTAT
GAGGATGCATTTAACAAGTTTGTTGACGAAATCAATGCTCTGGCAGCTTA
TCAGTGGTGGGAGGGATCAATTTGTAGCATCTTGTGTATACTTTCCTACC
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CTACGCGAGTTTGTTCGATCTGAATATGATCATTCGTGCTTACGGTCCTG
CCGTTCACGTGCACTTTATGAAGGACTGAAGGTATGTGGTTTATACCAAG
TGCTTAATACAAACTTTTATTTTTGTAAAGAACTGAAGTATGCCTTGGAA
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ATAGTAACTAGATGCAGCCAGGGTAACCAGATAGATGTTTGCTGCACTAT
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AAGTGTGTAGCTGCACTTACAGTTACCGAATTGTTATATGATTGACAGTC
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ACTCCAGATTTAATGCTAGGTTATTTGGATTTTTTCCTTGGTGGTGATGA
GAAGAGGCCCGATCTCCCCGCTCGTCTTCATCAAAGGTTTCCAATGTCCT
TGATTTTTGGTGGTGATGGAAGCTACATGGCTCCATTTTCACTTCACAGT
GATAGTGTGGTCACAAGTCTTATAAGCCAGGTTGATTGTGAAACATTTCA
TGCTGTGCTGAATCGCTGTTAACGTTTTATTCATTTAACCTGATAAATAT
CTTGTATAGGCTGTACAATCATCAATATGGCACCGTCTTGTTGCTGGAAT
GAATGCCCAGTTGCGTTTGGTTCGTCGTGGAAATTTGAAAGCAACATTTC
ATCCTGCACTCAAATGGCTTGAAACTCATGCAAATCCTGCCTTGAATACA
TACCGTGTACGTGTTGACCTTGCATGGTTTCAAGTTACTGCATTAGGGTA
CTGTCAATATGGTCTTGTTATTCATGCTGTGGGGGGAGAAGCAGTGGCTG
CTGAACTTCAAGGTGGCTCTGGAATAAAATTTGATCAACATTCTCAGTGA
GTTATTTGCTACTAGCTCAGTATTCTCCAATTTCCTCTCTTATCACATTT
TATCTGTAATGATCCCTAGCATGTCGAACAGAAACCACAATTTAAATGCT
GACTCTCAACTGAGCCACTCGAGGAGCAATGATGCTTATATGTGTAAAGG
AATAACCGGTGGAATTCTCAACATTGACAACTTAATGGTGCTTAGAGACA
GGGGTGATTTGTTTTATCCTCTGTCTCTTCTCTTACACAATACTAAACCG
GTTGGACATCAGGTGACTAGTTTTGCACAGCGATCTAACATCATTTCAAT
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ACTCCATGGTTGATCTTTTGTTAGTCATGTTTGTTCTTCCTCTTGGGATA
CTGGCACCATTTCCTGCTGGGATAAATGCTCTCTTTAGTCATGGCCCACG
TCGCTCAGCAGGCCTTGCTCGGGTGTATGCGTTGTGGAACATTACATCGC
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TTATTTTGAATGTTGTAAATTTGTGGAACATAATTAGAGTTAAACATTAT
CCCTACTTTCTGCACAAACTTGTCATTGGTTTATTTTGATAGAGATGTAT
ATACTTCACATATATTAGATGTGTATCATCTCCATTGTGCAAGGGGTTTC
CTGCATATCTACCCTAGAGTTGCGTGCATATATATATACTAGCCTACAGC
CTCATGGAAATACAAGCTGCATATGTCCTCACAATATCCACACACATCAA
TGAACTTCCAACCTTCTCTTTTGTTTTTCTCCCTAGGGAGCTTGTAAACA
AACTTCCAACCTGTTCAATGCAATGAAAGACAAAAGTCTTCTGCCTTTTC
TCGAAAAATATTCACACACATCCACAAGCATATAACATTGCGTGTAGCCT
ATTTATCAAACAACTATGGCAATGATGTTCTTTCTTGGTGATTTTTCTAG
ATGGCATGTGGGATCTCTTTGTTCGGGTCATTTGACTATTTGCTCGTGAA
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ATGCCAGATTACCTTACGACTATATGCTATCATTATCATGTTTTACTGCC
TCCTGAATAATAGCAAGTTCAGCTAATGATATAAAAGTTCAGCTAATGCT
ATCATTTTTTTTTTGCGAGAACAGCTAATGCTATCATTATCAGTCTTTGT
AACCTATTTGCTCTTGGCTCAGGTCGTGGCCTTTATATGTGGACTTGTGC
ATTATAAGTTGTCAACGAAAGGACATCCAAGCATGCAGCCTTGGAAATTG
GGCGGGTAAGCATCTTACGCCCTCTGCAACGAAGAGTTACTAAACACCAT
TGGTCTGCCATATCTTCTACCTAACTAACTCGGACTCAAAATATTTTCAG
TGATGAAACTAGCTGGTGGTTATTCCCAGTTGGGCTTGTGTTGTGTAAAT
GCATCCAGGCATGGCTTGTCAATTGGCACGTCTCCATCTTAGAGATCCAG
GATCGTGCGGTATACAGCAAAGACCCAGCTATATTCTGGCAGTGATGCTA
CTCGGATCACTAGAACGCTCAGTGGAGTTTTGCAACTCGAGTTTTTGGGA
GTTGATAAAAGGAAGGCTAGAAAGTTAGTCTGTTCTTTGTCGACCAGACA
GAGGAAGCAAGTACAAATTAGAATGCCTACAGATGCATGCTTATAGTTTA
CCGTTAATCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.