Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA028990

[Submit comment/correction]

Sequence	AA028990
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA028990
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGGACCGCCGCCGCCGACGAGCGATGTAGCAGGAGGGAGCACCTCCGG CGGTGCGAACGTTGAGGTCATCACCCGGCGGCAGCCGCCGTTCTCTCCTC GCTTCCATTTTTTGCTATTTTGCTATGGGGATTTTTGCTACTTGCTACTC TGTGTTTTGCTACTCAGTAGCATGATTAGTACTCTATGTTATACTCATAT TTGCTACTCTATGGGGATTAGTACTCTGTGTTTTGCTACACATTCAGATA GTTATACTCATATTTATCATTTATATATCGGATTTTTGCTACTTGCTACT CTGTGTTTTGCTACTCAGTAGCATGATTAGTACTAGGAGTATGATTCATA CTCCACATTGCTACTTGCTACTGTGTTAATTTGCTACTTGCTACTGTGTT AATTTTCTACTTGCTACTGTGTTGTGCCAAGCTACTGTGTTAATTTGCTA CTTGCTACTCTGTTGTGCCAAGCTACTATATTAGACATGTAGATTCATAC TCCACATTGCTACTTGCTACTGTGTTGTGCCAAGCTACTGTGTTGCTAAT CCTAGACAGGAGGAAGATTTGCTAGTCCTTCCTAGCAAGCTACAGTGTTG GTTGTGTTGTACACTTGTTGATTAGTACTAGGCATTTATTTGGCCAAGCT ACTGTTTGTTTTACACTTGTGGTGTACACTTGTTGATTAGTACTAGGCAT TTATTTGGCCAAGCTATCTGTTTGTGTTGTACACTTGTTTACACTTGTTG ATTAGTACTAGGAAGAGTAGCTAGTCCTTCCTAGCAAGCTACTGTGTTGG TTGTGTTGTACACATGTTGTGTTATACACTTGTTGATTAGTACTAGGAGC AAGCTACTGTGTTGTGCCAAGCTACTGTGTTGTACACTTGTTGATTAGTA CTAGGAGTATGATTACTACTAGGATTTGCTAGTCTAGTAGTTTTGCTACG TGTGCATTGATCCCAGTAGTGGCTACTCTAGTGTATATGTTTGCTACTTT AGTTCATTTTTTTGCTACTCTAGTATGATATAGTGTACTGGGATTTGCTA CTCTAGTATGATATAGTGTATATCCCAGTAGTTGCTACTCTAGTATGATA TAGTGTAGTGGGATCTGCTACTTGCTACTGGGATTTGCTATTGCAGTAGC ATGATTAGTACTAGGATTAGTGCTAGGACTATGATTAGTACTAGGATTTG CTATTCCAGTAGTTTTGCTAGTTGTGCATTATGATTTTGATCCCAGTAGT ATGATTGGTAATCCCAGTAGTTTTGCTACTTGCTACTTGTGCATTTTTTG TAATCCCAGTAGTATGATTAGTAGGCCAATGTTTAGTAGTTTTGCTATAA CCATACATGTTTCTATTTTCCTTTTGCTACAGGTTGCTGCTGTTGATAAG AGCCAAAAGGGCAAAAAGGTTGTTGTGAGCCGCAAGAAAGTTGGCGAGGG AGCGAGTAATGTCAAGGAGGATATTTGGATGTCGAAGGACCGTTTCGGTG CCAAGCGTTTGAGTATCCTTGCGGACAACCTTTCTCCAGCCAAGAAGCAG ATTATTCAGTCAAAGAGTGCATTTCGAGCATTGTTGAATGTTGCATAGTT TAGGATTCCTAATGAGCTTACGGATTTTGTTGCTGCACATACTTCTGCTC ATCTCCGTGAGTACAAGCTTCGGAAGAACCAGATGGTGTTTACCACGGAT ATGGTGAGAAAAGTGTTTGGAATCCGCTGCGGGGGCAAGCCTATTGATCT TTCTATTACTGGAGGTGCAGAGCTTGATGATATTCGAGCCCTCTACCATG GTGGGAAGAAGAGGGCAGAGTTAGCAACTGCTATCAATATCTTGAAGAAT TGTGCTGATACAGATGAGGAAACCATCATTCGCACTTGGGATCTTGTTTC CCTGGCCACTATTGTTGCTCCAAAAAGATCGAACCATGTTAACTTGGAAT ATGTTGGTCTCATGGCTGACCCAACCAAAACAGATGGGTATGCTTGGGAT GAGCATTTGTTGGGTTTGTTGATGCAAACTGTGAGCAATATTCAGAAGAA GAAGAAGAAGAAGCAAGCACATGTTCTTCCAAAGGACTGTAGCAAATTTG AGTTTTGGATAACTGGCCCATTCATTCTTCTTGGTGTAAGTTATCTCCCA TCTTTTATATTTGTTTGTAGCGGTTTGTAGCGTTTGTTTTGCTACTACTA ACTTTATTTGGCCTCTTTTTGTAGATTGCTTATATGGACCATTTGGATTT CCCACCCTGCGATCACACGTTTAACAAGTCATTGCCTAGAGTATGCTCTG TCAAGACCCGTGACTTCACTTTTGTTGTACAACATGACTCGGATAGGAAG ATTTTATCGAACAAAACTGTTTTCGACAGGCGAGATGTAATGTTCTTTCC AGCACCACAAACATTCTATTCTTTCGTTAATCCTCTTAATGTTAACATTA CTTTTTATTGTGTGTAGTTCCTCCCATTGTCTGCAACACCTTATGGTACT GCTCCTGGTTATGATGATTTCAACAAACCTGCTCCAGTGGAAGATGTTGA TGTTAATCCTTCTGCTTCATTGAATGAATGGCTAAATTTCCCTAGCAGCC AGGATTTGCAGGTATGAAATTGCTACTGAACTGTTTTTTGATTGCTACTT TAGTGCATTTGATTTTGCTACTTAGCTACATTGCTCTGCTACCTCTTTTT GCAATCAGTGAACATGTATTATAGGTTTTGCTACTTTAGTGTATATGTCT TGCTACTTTAGTGTATAGGTTTTGCTACTTTAGTTTACAGGTTTTGCTAC TTCAGTTTACAGGTTTTGCTACTTTAGTGTATAGGTTTTGCTACTTTAGT TTACAGGTTTTGCTACTTTAGTGTTTTGGTTTTGCTACTTTAGTTTACAG GTTTTGCTACTTTAGTGTATAGGTTTTGCTACATTAGCTTTATGAATTTG CTACTCCTTATGCGTTAGCCTCGGTGTTAGGGTACCGAGGCGGAGTCGCC GTCGACGCGATAGCGGCTATGCTTAGAATTTGATCATTTATCTTGTTTCT GGTTTACTAACTTGCTTCTAATGTTTGCTAACAGGTTCCCGCTCGTTTCA AAACATTGTATGAGAAGCACAAGGCTATTTTTGAAGCAGATGTTGATGTG ACAATGAAGAACCTTTCTGCTGGATTGAAGCGCATGCAGGCTCAACGCAT GGCTGACCTTTTGGTTGATGTTGAATCATCAAGTAAAGAAGAAGAAGCTG GACCAAGTGTTGTTTTTCCAACCAAAAGTACAACAGATGATGATGATCAG CTGCAGGATGATGATGGTTCAGAAACTGAGGATGATGAGAAGCTTTATGC TACATCGAAGCTCGAGGACCATGGTGTTGCTGCAGCTGCCACTAAGGATA CTGATGGTGATGCAGATGATGTTGTGGAGCAAGGTGGTGCTGCAGATGCT TCTATGGAGCAAGGTGGTCCTGTAGCAACAAAACATGCCGATGTTCCTCA AGCAGCAATAATCATTGATTCTATGAGCAAGGGAGCTGATGCTACTGAGC AGCCGGATGTTGTTAGCCCTGACAGGTCTCCAATTCACAGCCTCAGGAAG GATATTTCTGATGAAGCTTGGGCCAATGCTCCGGACAAACCCCTGTTTGA TCTTTTCGAGCCTGGGACCGATGAGTATGCAGAGTTTTGCATTTCACAGT CTCTCCCACCTTCCCGTGATGCCCCAACCGGTGCCGTGACCACTGCCTCT GATGCCTCTGAGAGTATTCCAGCATCACCTTCCACTTTGGTCGATCTTGC ACCTTTCGGCTCTACTGAGCCTGCGACACCTGCTGTTCCTATTGCACCTG GTATGAAAATTTTATTGTAGTTTCTTAGATATGCTTCCGCTTGTTTGCTT CTTAGATATGTTTCCGCTTGTTTTGCTTAAGACACAATTGTTTTCTATTT TTGCAGTTGTTGTTAACATTGAGTCAAGTGTTAAAGGAGATGGTAGCTCG GGTTTGTTGACACATGAGAAGAAGACAAGGTTTAAGAGGGCTGCCAAGGA TGAGCTCACACCTCCAAAGTTGAAAAAGATGAAGGTCTCTGAAGATGTAG AACAAAAATACTCCACATTTGTGATGAATGGTCGAAAATTCAAGGGTCAT CCGAAGGATAGGGCACCGTAAGTTTATGTTTTTTGCTACTCTGAAGTAAT GTTTTTGCTACCTTACATCTAGTTGATTGCTACATGTGTCAATGTGTTTT GCTACTTACTTTTTTCACTTGTAGGATACATTTTTCCATTTAATCTTCTA CAGCTTGAACTACCTGCTACCTTATTTCATTTTTTTTGCTACTTTACATT GAACTGTTTGCTACTTTAGTTCATAGTTTTTACTACCTGCTACCTTAGTT CATTCATTTTTCTACTGTACATTGAACTGTTTGCTACTTTAGTTCATAGT TTTTGCTACTGTACATTGAACTATTTGCTACTTTAGTTTATTGTTTTTGC TACTTTACATTAAACTTTTTGCTACTTTAGTTTACAGGTTTTGCTACTTT AGATTGAACTGTTTGCTACTTTAGTTTATTGTTTTTGCTACTATACATTG AACTATTTGCTACTTTATGTATAACTATCTGCTACATGTGCATTCCTTTG TGCAGGCCGGTTTTTGTGGAGATTGGGCGGTATTATTGTTGCTACAGAAC TTTCCAAACATCGCTTCGGCCGCGCCAAAATCTAGATAGTGAGTTGATGA ATGTTTGGATTGAAAAATTTAACCATGAGTCGGACATTGTTTGCAAGAAA AGTGCACGGCAGAAGAGGAAGTACGCTTTCACGCAGCACTTTGTGGTAAG TAGCACTTTTCTTGATCTTTTACTTGCTCAATATGCATATGACAGGTACT CTGCTAGCATTTTGCTACCTTTTGTGTGCTTGCTGAACCAATACAGATAG TAGCAAATTTTACTTGCTTTTGCTGCTGCCTCATACTACTTTTTATCCTC AACACAAAATAGGAGAAGCTTATTGTTGATCCAAAAGCATTCAATGCTAA AGCATGTATGGATGAGTTGAAAGAGCAGAATGCAAAGTTCAAGATTTTCA AGTGTGACCTTGTGCGATAACATCTTTGCTTCCTATCTTGTTCATGTTTG CTTTCTATACAAGATGCTAAATATTAATTCATGTTTGAATGTAGCTATAC TTTCCTATTGTGAAGTTCAACCATTGGGCAGTTCCCTGTATCAACCTAGT AGCAAAGCAGATGCATATTTTTGATTCAATGAAAGGGTCCAAAAATGCTA GTGTGACGGATGATTGTGCATGCAATCTGGTTAGTAATCCAGCTATACTT GTTCATTGTGTTTGCTACGTTTATAGTTGGGACTTTTATTTGCTGCATAT CATTAACCATGCAGTGTGTTTGCTTTGTTTTCCAGTTCGCAAACTTTGCA ATTCTTGTGAAGCAATCAAAACTAGCAGACAATATCAACTTCGACACTTA CCTGCTAACCAATCCTGATCACCTACAGCAAACTACCATGTAAGATTTTG CTCACCTTTTTTCAATCCTTGTCCTGATCACTAGTTTCAACTTTTGCTAC ATTATTGTTTTTTAATTGCTACCTAAGTTTACAACTCTTGCTACTTTAGC TTCCTACACTTGCTACATCAGTTTCTGCTTGTTTTTTACTAATCTATCTG TTTGTTTTTTGACAGATTTGATTGTGGATTCTTCAGCATGCTCTTCATGG AAAGTTTCACCGGCAAGGTCATGGTGGAGTTCGACAACAATGCTATACCA CTTCTAAGGAAACTTCTTGCATCTGATCTGATTGAGGCAAGGCAAAACAA AGGATCATTGCTACAGCTGATGGAAGAAGAGTTACATAAGAAGCATAGTT AGGTTGAAACTAATGTAATCGTTGAAACTGATGTCGTCCTTGTGATCTTA TTTTGCACTTTGTAATGGTTCAAACTAATGTAATCGTGGATGTGTTCGTT GCTGCAGCATCTATGGATTATCTTTTGTGGATAGGTTATGTTGGATGGAT AAGTGCTACATGTTTGGAATGGAAGCTTTTGAAGTTTGGAATGTTGATTA TTGTCTTCTGAAGCTTCAAATAGTGTGATTGCTTTGATAAGTTCTGTACA TGCTACATACATGCTGCATAAATGCTAAAAATGAGTATTTACCTAGACAT GCTGTCAATTGTTTTTGGCCACCCCAGGTGTTAATTTGCTACATCTGTGT AGCCATATTGCTACATGCATAGAAATGGTGTGCTACCCAGGTGTGCAAGA TTTGCTACTAGGTTTAATGTAGCAAATATACCTATGACATTTATTCATAA GAACAAGTTTTGTCTATGGTAGCAATTTTATATACAAAATGCAGGCTGTA TGCTCTAAAGTGGAAATATTTTTGCTACCAACAATATTCTGTCATATCAC AAAATTCATATCTTGCATCAAGATGATGCTACATCTATACTGTATGTATG CTACATAGTAATGACAAAAATGCTACTCTCTGGTAGTACATGTAGTTTCA ACTCTATAGTTTCAACTCTATTTTCACAGCATTCCCCGCAATCAGTGCTT CCATGGAGACACATTGTTTGACGGTGTGACCTTCTTCATTGCAGTATGGG CATTTTTGCTTTCTTGGCTTCTTCTTCTTCGGCGTTGCATCAGTTTGCTT CTTCTTTGTCTCTTGAGCTTTTTTCCTTCTCTTGGCATTTGCTTCATCAC GAAGCTGAACCAATGGTTTGTTACGCTTTGACTTCTCGGTTGGTCTTCCT TTTGGCTTTACCCTCGCAGGGTTCTTGAGCGTGCTACTCGGAGCATCATT ACGTTCTTCTTCTTGTCGTTGATTGTTTACACCATGCTGTGGAGGAATAC TTTGCTCTTGTAGCAAAATTTCTGGCCCTCCTCCTTGCTGCTCTACTTCT TGCTCCTGTGTAGCATGTTGTGTGTTCCTCATATTTGCTACAAGACGCTT CGCATCATCAATCATCTTGGAAACAACAAGATATGTTTCATCAGTGAAGC AAGCATCAAAAGCGAGTTCATTCATCTTTCTGCACAATGCATTGTACTTG AGAGTATTGGTTCCTGGGATCCCAAATCTGATGGTATTTGTCCCGGGATC AGGTGCATGCATTGTTGCTGCAGCAGACCATCTTCATAGCATGTATCTCT CTGGAATTTGCTGGACATTCAAGTGCACCATCACCCTCACTATGTGCGGG CATATAAGGCCACACATCTCAAATGTGTTGCATCCGCACTTGTAGCACTC ATCATCTAACTTGACTTGCACCTGGTAGGTTTTGACACCATAACCAGGGT TTGGAATGAGATCAAAGCACATGCCTTCACCATCAACCTGCATTGGATAA AACCTGGTAGATTTCTCCATCATCTTTTGGAATCTTGTGAAGATCTCCCT TGTGTAGAACTCCAGCCCCTGCTTTTCAATGTTGTAGCTACAAAATAAGG TATGTTTTTGCTGACTGTCAGGTTGGTGCTACATCAGGTGTTACATTATG CTACAACAGTTTAAAAAATCTGCTATCACAGATATAAAATAATGCTACTT GGGAAAATCTGTCTGTAAAGAGAAAATCTCACCTTCCCCATAGTGGTGCT GTTTTTGTATCCATTGTGAATGCTGCATTGTCTTCTCTGTCTAGCATCAG GTTTTGGCACAACTCGTATTGCTGCACGAAGTTCCAAACTGAGCCACTTG GGCGAACTAAAGTTTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.