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GrainGenes Sequence Report: AA028316

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Sequence
AA028316
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028316
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTAGCTAGGTGTGCCAAGAATTTTGATGCCGATGATATGAAGCTTTTAAA
AAGTTTCATGTCCAAGTGTGGCGGAATTCCTAGAATTATAGCTACTATTG
CAGAAGAGTTGGCAAAAAAAGTTAGAGGACGGGAAAGAGAAGCCAAATAT
ATGTTGAAGGCTATAAATGATGACTTTATGGGCATCTTGGAGACCAATAC
ATTATTCCATCGTTTAAGGGGTTTATTTTCATGGATGCAGTCCTACTTTG
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AGTGCGACTCGACAAGGATAAGGAAGGTCTCTTTTTTCGCCTAAATGACA
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GTCTAGGAAAGAGTTCAGAGTCAGGGTCCTCCAGATCGATTGCACCTCCA
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ATGGTTCGCTGCTCTATTGGATCATCTTTGCGGATTTCTGGGCTATCATC
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GTGTTGAAGGTGCAGGAACCACGCTCGTCCTGATCAATGGGGTTCTTCCG
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TCTTCTAGCTTTTATTTATTTTCATCATCAATAATACACACATGCTGTAT
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TGTCGGTCTACATCTATCCTAGACTTCACATGTACAATTCTATGGGGTTT
TTTTTTACTGTAACTGGCAGTATGGTATCTCATAGCACAAGTTAATTCGT
GAGTAGCATATTGTTGCCATTTTGATAATAATATCGTGCACGTATGTAAT
GTCTGATGCTCAGTGTTTAGTCGAGCAAAAATTCTTAAAAAGCATGCATA
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GAACAGCAGGATCAGTGCAAGAACACGGACCAGGAGATTTGCCAAGCCTT
CTTGTGCTGAGATTAGACTTCATAGTCATGTTTCCTTTTAGCTTTGTGAA
GTGGACGTATCTAGGAGTTTTTTAGTATTAGGTTTACTCCGAACCACTAC
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AAGTCTTATATTTCTGAACGGAGGGGGTACCTATGAATTAGGTTCTTTAA
TTAATTTCACAGGATGGACATGCTGAAAGTCTCGAGGGCAGGACAAGCAC
GGATTTCAAAATGTTTAGATTTAAAAGTTGTTCGTATTTTAAAAATGTTC
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GTCCTGCACGAGCTCCATGCTTGAGGTGGTTGTTCTTCAGCATCACCATA
CGTGCTCTGCTCATATCTGATTGTACATGCATCCCAGCTAGCTTAATTAA
TTACATGTCTCGATTTAATGGTGCATATGCAAGCCCTGCCACTGTCAGGT
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GTGGCCGGCCAATGTGTTCAGTGCAGTGCAAATGCAAATATTTCAGCCTG
TCCTGAACAGTAGCACCACTTGTGCCCGAATCTGATTCTTCAGTTCCGCT
GAGCAACAAATGGTCGATAGAATTATACTAGTTTTCCTCGGAAGGAATTT
AACGATAGCTAAATAAAGTGTTAATGATTAACAATGTTCACCTTTTTTGT
GAATTGGTGGCTATACGAAAATTAGATTAGTGCAAATTGTTGGAATGAGA
ACCTAGGAGAGGCTTATCTGTAAATGCTGATGCTTGTTCTTATGTGCATT
CTCTTTGCTCAACCAGCAAGAGCTTGCTGTTAGTCATGGTTTACTGGTTA
TGGAAGTCTGTAACCATATTTCAGCAGTTAGCATGAAAAGTTCCAAATTG
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ATGTAATGATGAATGATTTCCAGTTTTTTAGCATACAGAGAGCAAACCAG
GAGTTTAAGGTTCATTGCGTCTTACTATTTTGACCATTTACATAGGGCTA
ACAGGTGTTTCACTATTTGGTTTACTTTTCATTATCCATTTTTAAGTAAC
TTCACTGTTTGATGTATTGCAGATAAACTGGGACGAATCCACACCAGGGT
TGTTAAGGAACATAGTTCTTCGTGGTTGGCAAGTCTATCCATGTCTTCTT
GAGATCGCTGCTGGAACAAAATTTAGGCCCTCCCTTTCTATCTTACCCAG
TTTGTAATCTAGTAAGAGTCCTAGTTTGTTGCTTGTCATCCTTGATCTTG
CTAGAAACTATCCTTGAAGCCTTGAAGGATCCATTGAATTCTGTTATGTC
AAGATATTGTTGTTTACGTGTGAACTATGTTGTCTTTCTTTCAGAGCTGG
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CTGTGACAGTGTCAGGTTTGACTATTGAGGCATGGCATAATTTCTTATTT
GGTTGTAGTTCTATCAAGAAGGTCTGTTCTAAACATTTTCATGGCCTATG
ATATCCTGTAGTTCTATCAAGGTGGTATGTTCTCTGTTGGTTAAGGTCTG
TTCTGCAATCTTTGTGTGCTATAGAGAAATAATTTATCTACTTTTGTTCA
TCAATGTCCTTCCATTTTTCAGGTCGCCAAATGATTCATGGTTTCTGAAG
AGTACTTATTTTCAATACCAAAGGTTAGTGTCAAATATTTTGTCGACATC
AAGAAATGTGTGTTCTGGCTGTGTTGTTCAATTGTGTGGTGGGCCAAGGA
TTAATGAAAAAGTATTATATATGGGGGCTGTGAGGTTGGCTATAAATGAT
GTGGCAATATGATAGAGTCCACAGCTATATCTGTTACTAGCGTGCTCGTA
TAGAATATCAGTTTAGCATTATTTGATCTTATCTTGTCAAATCGAACCCA
TGTGGCAGCTTGGTTTATTTATGTAGCTAGAATCGTTGAATCAAGCTGGC
ACATTCAATTATTGGTGTATAAAAATATACAATACATAATTATTTCTGTA
CACGTTAGACCGACTTGAGTGCTCTGTCAGGTAATTAATATCTTATCAGG
ACCTCCATGTCTTCTCCTGGATCTGGTTCAACAATGTCTAAAACCTTCTC
ATCGGTCACCCCTACATAATCCCATCTGTTTGCGGAGTTTGCTAACTACA
AGCCTACACCACAACCACAACCAGAAAACGGGAGCGAGACAGACGAGAGA
GCAACAATGGCGGAGTTCGCGCTTGGGCTGACCAAGACGGCGGTGGAGGG
GACCCTAAGCAGAGTCAAGTCGGCGATAGAGGAGGAGGCAAAGCTCAACG
ATCAGGTGCAGAATGACCTGGTGTTCATCACGGGAGAATTTGAGATGATG
CAGGCCTTCCTGAAGGTCGCCAACAGTGAGCGTGTCAAGAATGAGGTGGT
GCGGACCTGGGTGAGGCAGCTCCGCAGCTTGGCCTTTGATGTTGAGGACT
GTGTTGAGTTCATCGTCCACCTTGACAAGAAGTCGACCTGGGGGTGGGTG
CGGCGATTGTGGCATATGGTGTACTGCTATGCACCGCCGTTACCCCTGGA
CATGGCGATCACTGAGATCAAGCTGCTAAAGGCCAGGGTCGAAGATGTGA
GCCAGAGGAACACACGCTACAACCTCATCATCGACTCCAGCTCCACCACC
AAGCCAGTCACGCCAATGGAGCAGCCCACCCAGCGTACCACCGGTGCATC
AGCATTGCACATCCTAAGAGGAGCATGGGAGGCCATGGGAAAGTGGCGCA
GCATGGGAGACCTCCAGAAGTTGGTCAATGGTGAAGGCAATGACCTTCAA
GTGATTTCCATATGGGACAGCACCGGAGGTGATCTTGGGACAAGATCCAT
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GCGCTTGGGTTAAACTGAATCATCCTTTTAACCCCGATGAGTGTATCAAG
AGCATGCTTACTCAGTTCTGCGCAAGCTCTCACCAAACAAACATAGATGT
GGACTTCCGGACAAGAATGAAATCAGCGGTGGCTATGGAAGATGATCTTA
TGAAGGCCCAACTCGTGCAGGAAGTCATGAGGGGGCATAAGTACATCATC
ATCTTTGAGGATGTACCCTCTGTGGTCGAGTGGGATGTCATCAAAATGTA
CCTGCCTGATAATAAGAATGGAAGTCGGATCATTTTGTCAACAAAGCAGT
TAAGGGTTGCACTTCTGTGCACAGGGCAGCCTTACCAAGTATCAGAGCTT
ACGCAGTTGTCTCATGATCAATCTATTTGTGCATTTTCCAAGAAGGTATT
CCAGAAAAACTTTAAGTACTTCTGTGATGGTACTGCTGAAAAAATCATGC
ATGCACAAGTTTTCCAAACAACTGTACCAATAGGAAGGGCATTCTGTGCA
TCCCCACAAAACATTTCAAACTCGGATTCTATGTAATATATGCATTTAAG
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ATTAAGTATTAACATGACAATCCTAGTCAAACACGGGTGCGGAAAACATA
GTCAAGACACTTTGCTCCGGTGTCCTCCCCCTCCTTCAAAACTTAGGAAA
CTAAAAACACAAGAATGGCTAGGATTGGCTGATACCCCTTCATGGTCTTC
TAGCCGAAGGGGTATTATCCAAATCCTGGCTAACTTCATACTATGCTAAA
GGGGGTTAGCAGGCTTTAACCAGATATCTTGACCGTAAGAACATGGAGCA
GTGAACATTTTGGATAATAGGTATATTAATTCTAATCCTTGTCCCATAGT
TTAACACAAATGTTTCTTGCAGTGTGGGCGTCGCAGTGGTATAGGTGAAC
TTTTATGGCAACTAAGATGCCGTGGTGTAATTTCTGTGTGTGGGAGTGAT
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TTACGGTCAGAAGATCTTGTTGCTGAAGAAATTGCAGCTGTTGGTATGAT
GAGAGACCCGTGCCTCTCTCAAGAGTGTTCTAACCTTCTGCGCAATGATG
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AAGGTATGTATGTATGCATGGTTACTAGTCACCTCAAACTCAAACCCAAT
TCTATGTGTCATCTCGTTGATGCGCGCACACGCATATTAATTGATGGATC
AATGGACAGATTTAATGTTGACAGCCCCGGTGTGAACTCTTGTGCTTAAT
AATTTAACTGTTATGTGACTTAACATGTAGGGTTTTGAATATTATGGAAG
TGGAGGCACTGAGGCTTCTCACAGGGGTCGCCATTTCTCCGTCAGGAAGG
AACAGGCACGTGAATGGTTGAGGAAATTAGGACGTGTGTATTGGAATGAA
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GGGAGTAGCTGATGCTGAAAAATCAACTCTCGTCAGAAGAGCGTACTATG
AAAAAATGGTTAGCTGTGAAGGTTCTTTTGAATCGGGATATGAAGAGCGA
TGGGTTCGTGTGCAGGACAAAACTGCCAAGTTTAGCTGGGTCGATGTTTC
CCATCCGTTCAACTTGACAGACTTCTCTTGCCGGTTATTTTTGGATTTTC
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GGCGAAGATCCAATTAAAGGGTGTTGTAAGTTTCTGCGTGAAAATCAATG
CTTAGTTGTCATTGATGGTCTGCGATCCAAGCATGAATGGGACTTGATAA
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AAGTAGTCTCAATTTTTTTAGAGAGACAACTTTCACGCTAGCATGATTTA
GCTAGACAGCAAACTATCAGTAGTGTTTAGTTGTCCTCGCCTCCCCCCAT
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TCTTCCGTTTCAAAATATAGATGTTTTAGCTTTTATGAAAGGAATGCATC
TAGACGTATTTTAGTGTGTAGGTTCAGAGTGAATATGTATATTCTGATTT
AAAAAATATTAAAACATATCCTATATTGGTGCTATTTCAAAAGGTTGTCT
TTCTGTATCTGTATTGGCCCAATACCGATATCCGTATCCATAAACCAATA
ATGTGATCTACTCCCCCCAGGTTTGTATACAAGGTCACTATCTCAATTTC
GAGATACCAATAAAACAAAGTCAATTATTAAATAGCACAATTAGTTGTGT
GGAAAACTTTTGGTGTTTCGGGCTAATTAAACATGTTGCACGTGGTGCCT
CTTTTTATATGGCTGTATGCAACGTTCATATTAATGAACACCACCATACG
AGGTAGAAATCTAATTATTTTTTCTCCGGAAGGGATAGTGGTCTTGCATT
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TTGTAGTTGTATTCGAACATTTCTAATTTTCTATTGATAATGTATGAAGC
GGACGGCCACGAGGATATCTCACGAAACTGTATCTGACATGCAGGCTTGC
CCTTCTCACTTATTCTCAAATAGAAGGGAAGATGCACGTGACTGGACAAA
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GGAGTCGCCCGGATTTCACCATCTACTTATGGGCCGATGTGCCCCATCCA
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GTTACTGACGGCCTAAGGTCCAAAGATGATTGGGATCTGATAGAAGCTGC
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GTAAAAGGTCTTGAAGCTGATACGGCGCTTAATCTCTTTCAAGAGGTATA
TGTTGTTCTCTCGACCATTGCTTTCTATGTTTATATTGTTGTTGTTTTCC
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TCAATCCACACAACCTCACTTATTACTGAGTTTGTCAACTAAATTATTAC
ATTTCATGGATCACTTAAGGTCGAAACGTGTATCAACTAAAGGAAATATT
TTGTTATATTTTGATACTTTTGTCGGTCAATAACTCGTTCAAGGTAAAGG
ACTGCAAAACGGATTACTGGAAACACTTTTACAGACAATAATTGCAATAA
AAATGAATACAAACTAACCCAAGCTTAATTTATAGGGTCTCTCTAATTCA
CTTTCTACTGAGATTTTTATTAAATCTCGGTCAGTTGTATCGTAGGGTTG
ATTTTTTCCGTAACACCCCCTAAACTAGCACTTCCTGTAGTTGTTCTGTT
GGTCCACGTTTGCTATTAGGGAGGATGCTACTGGCCAAATAAATTAGTGA
TAGTTTCCATCATGCATAAACTGATTTAAAGAACCAAAAAAAGGTGGATG
AACCCCAGCTTCTATATTGATAATGCACAGGGCCATATGTTATTAATTAT
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GTGTTTGGCCTCACGACAATATCTCTCTCCATAATCATTTCATGAACAAG
GAAACGTGCACAACTACTAGAGAAGGCCTTCAAGAAGGGTTCGTCGCACA
TGTGCCGATGATAACGAGTCCAACCATAGGTCGATCTTGAATCCCCCCAA
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AACATTGTTTGTTTGGTGGGGAAAGGTCATGTTTGTGGAGTGGGATGCAA
CATCTAGCACTAACCGATTGCAGATATATTGTGCATTTGGATGTCAACGT
GCTATGCAATTTTGTGATGAGATTGCATAAGTCCTAAATGTAAGTTTAAT
GATTATGCTACTTATTTTATAACTTAATTTTGTTCTACATTTCAGATTGC
TAGGAGTGCCAAGGATTTTAATGCCGATGATATGGAGCTTTTAAAACTTA
TCATGGCTAAGTGTGGCGGAATTCCTAAAATTATAGCTACTATTGCAGAA
TATATAGCAGCAAATTTCCGAGAATTTGGCACTTCAGGAACCACATATTT
ATTGAAGGGTATGAATGAAAACTTTATGGGCCAGGTGGAGACCGATGCAA
GATTCCGTAGTTTAAGGGGTTTATTTTCGTGGATGCAGTCCTACTTTGAT
GCTTGCTCGGATTCACTCAAACCATGCATCTTCTATCTGTCAGTCTTTCC
TGCTGGCCACAACATAAAGAAAAGGCGTTTGCTGCGACGGTGGATCGCAG
AATGTTACTCTAGAGACACATCTAGTAGTACAGCAGAGGAGAACGGGGAG
AAGTTGATCTCTGAACTCATAAGCTTGAGCATAATCCAGCACAAAGCATA
CACGGCCCATTGCGAGGTTAATGGCTTTTTCCATGAATACATCATCTCAC
GGCAAATGGAGGATAACCTTGTCTTTGCACTGGAGGGGAATTGCAGCCTG
AACTCACAGCGTGCAGGGCAACACCTCACCATAAGGAGCAGCTGGGACAG
GGACATCACAATGTTTACAAGCATGGACTTGTCACACTTAAGGTCCTTGA
CAGTGTTTGGAAAGTGGATGCCATTCTTCATTTCTACAGATATGGGTCTG
CTTCGGGTGCTAGATCTGGCAGACACATCCCATGTAACAAATGATGACCT
TGAGCAGATTGGGAAGGTTATGCCTCGCCTCAAGTTCCTCTCGGTACGAG
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CTGCAGACTCTAGATGTCAGACACACCTCCATAGTCATGTTTCCACTGGC
TATCCTCAAGCTGAAGAAGTTACAATATGTCCGTGCCGGAACCACTATAT
CATCAGATGAATATGATGGCACTAGCATGACTTGTGTTCCGCTATCAGAC
ATAGAACAAACATCAGCACCACCAGAGGATGGTGATGGTACGGTTGAAAC
CTTGCTTGTGCGAACAGTTGATGTTAAGACACCAACACCGTCAGCGAGCT
GCATGCCCCGTAGTTCGGTGTCCAGTTGGCTGTCCAAGTTATGCCGCACA
CGCCAACATGATAATGGGGGTGTCAAGGTTCCTTCAGGGATTGGGAAGCT
GACGGCTTTGCATACCCTTGGTGTTGTCGATGTTAATGTGGCAGGTGGTA
AGGCTATCCTCAAAGAGCTCAGGAAGCTGACACAACTGCGCAAACTTGGT
GTGTCGGGTATCAATCAAGGAAACTCCCATGAATTGTGTTCTGTTATCTC
AGGTCATGCCCATTTGGAGTCCTTGTCAGTGCAGCTTGACAAGGATAAGG
AAGGTGTCTTTTTCCGCCTGGATGACATCACTCAGCCACCAAAGACCCTG
AAGAGCCTTAAGCTGTACGGGGATGCCCAAATATTGCCAAGCTGGGTAAT
GCACCATGAGAATCTCAAAAAGGGAAACCTTGAGATGAATGTATCAACAC
AAGAGGACATAGACGCCATTGAAACTTTACGGTGTGGAGACATCTTCCAT
CGTCTTTGTGTCAAGCCGATTCAAGATGGCGTGCTTCGCATTGGTAAGTT
GGAAGATGGTTCCACACGTCCTGGCTGGTCTGGGAAAGAGTTCAGGGTCA
GGGTCCTCGAGATCGATTGCACCTCCAGGTTAGAGTTAAAATTTGGATGG
TGGGTGGAAATGCATGTTGAGCTGCTGAAGGTTCGCTGCTCTCGTGGGTC
ATCTTTGCAGGTTTCTGGGCTAACGGATCTAGGCGGTCTCAAGGAAGTGT
GGCTTATGGGTTCCTATTCTGAAGAACTCAAGCAAGACTTGCAGCGCCAA
ATTGACATGTTCCCAGAGAAGCCTGCGTTGAAGCTGCAGGAACCTCGCTC
GTCCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.