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GrainGenes Sequence Report: AA005816

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Sequence
AA005816
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005816
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGGTCAGCTCCATCATAATATGCCATGCCTTCACCTCCGGATCCAA
TGGCCGATTTGTCGACTCTCAAGATCATGAGGTCCTCTTTTCTTTCCTTC
ACCGCGGTTCGTTACCTTACAAAGCAAGATTTTCTTGTCTTGCTTCTCCC
CAACAAGGCCACTCACCATGCATCTGTCTCTCCTCAAAATATGTTTTCGC
CCCGCTATTTAATATAACAACCACACGAAACAACTTCGAGATCATTGCTG
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GGATCATCATCATCCACACCATCATATCCACCAGCACCATCATCATCACT
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AATTACTTTCCTGTAGTTGCGGATGCTTGCAGGAAGTTTAATCACAAGTA
TGTATTAGTCCAAGTAAGGTCGGTATGTTAGCACATGTTCACCCACACAA
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ACTAAAAATCCGTTTGCTAAGTATTTACAGAGAGTTCCTGCTCCATACCA
CTAGTCAACACCTTCTGCTCCTCGTTGGGATCGACACTCCTATTTATCGA
AAGTACTGCGATACACCCCCTATACTTGTGGGTCGTCAAGACTATTTTCT
GGCGCCGTTGCCAGGGAGTGAAGCGCTATTGAAGAGTGGAACTGGTAAAG
GAAACTTCTATTGTGAGTATTGCTTTTGTTTATGTTTGTTGCTTTGTTTC
CAATATGGATAACCCCCTTGGTTTTCTGTTTGGAAAACTACTACCACTGT
TAGGGTAGTAGATGAACCACCACCTGTTGAGATAGATCCTTTTAAGATAC
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ATGTGTGCATTGCTTTCATGCATAGAAAATCTGAATAATTTTCGCGCTTT
TAAAATAAGAACTTGTCAAAGTGATTGAAGCTTCTCTTAACTTGATGGGA
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TAAATATAACACAAATAATAATAATGTAACAACTATATCTTAATCTCATC
TACTTATACCATGAGTATCATGGAAATACCTAACTTTAACTCTCTAGTGA
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TTTCCATATCAATTCTTATCATCTCTATTGAATCCTATCCTTATATTTGT
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GCTAAATAGAAGATAATTATAATACAACTGTAATGTTGTATGGATGGAAG
CCTTGTTTAGTAACTAGAAACATGAACCATAAAGGATCAAAAGATTATAA
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TGATTAGGGAAAGTATGAGTGGAAATCACTTGTTGAATGGGAGATTATCA
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GGTGGATAAGAATATTCTGTAAAGCAAAGCTCATCATGTTAGCACATGAT
GATGGACATAGAGAAGTAATATATCTAGGAAAGGAATTCCTTAATAAGAA
GTCAAGAATTATAAAATATGCAAGGTAGGACTTCTTGGTAAACATGTAAA
CCTAATCTTTAATCAAACATAATATTCATTTCATCTAATTGATCTATCAT
TTAATTCCACAATGGTTTATAGGAATATTTTCCTATACCAACTTACTTAA
GAACATATATGTCATTTTCAATCATCATTATCATATGTGCTTAAGAATTA
ACTTTATCAATTCTTTCTCAGAAGTTATCCTAGAAAACAGTTCCACTATT
TTACTTTGAAGGGTGATATTAATAAAAATCATAAACATAAAGATAGTATG
TTTAGACATTAACCTTTATTCACATCAACAAAAGAAAATAAGTATAGTAA
GTACCTTAAACCCTAGGGTGAGTAATTACCATTCAGAACTCTAAACTTAT
TAATAAGTTTTCTCATCAACATCTCATAAATATTCTATCTATAATCATAA
GACAAAGTCTTTAATTCATTTCTCTAAACCACTCATCCGATATGAGCATG
GAATAAGTGGGGATCCAATATTAAAAATCATCATATCCTATACTATGTGA
TTAAATACATACAAATAAACCCTATGAATATTATTAAATATTTTAAAACT
TAATTACTCCAAATAAAAGTGAAAACAATGTTATAGAAAAAATATATATA
AAGGAAATATAGAAAATATCACAATACATAATAAAAGTTCACAAATTGAT
TCTTAATAACTTTATTGTTGCTACAAGTATTCAGCAAATAAAATTCCAAA
AAAAGAAAAGTTTAAACCAAATATAAAAATACAAACCTGAAAAAAACAGA
AAATGAAAAAGGAATAAAACCAGGAAAAAACAGAAGAAGCATCAATTCCG
GCCCACGACCCATTTCCTTACGGGACTAAACGTCGCCCGCGTGCAGCAGC
AGCCGCCAGCCGCTCGCTCTGCTTCAGCCCATTTCAGCCCATCTGGCCCG
ATACCCCTTCGTCGCCTCTTTTATTTTCTTCTGCCTCGCGACAGTAGGAC
GCCGCCGAGGAGCTGCTGCGTGTTGACGCCGCCGTCCCCGTCTCTCCGTG
ATGCCCACTGCAAGGAGATACGTGCTACCATCCTAGATGTCGTCTACAAG
ACCCCCTCTTGTGCAGAGACGAACCCTAACTTCCTTTCTTCCGCCAATTT
CCTCTGAGCCGGAACCCTAGCTTGCCGGACCTCTCTGTCCCTGTCGTCTC
CGGCTGTTCCAAACCAAGCCAGGACCATCGTTCGACTCCCCTCGCTCGGC
TTGTTCATCCTAGCCCTCTCTCATTCACGCGCACGCTTCTAGACGCTTGA
ATCGAGACCACCGTCTGCCGGCAGGAAATTCTTCCCGCCGTCGATCTGCG
CTGCGCCACGTGTCGCCACCGGCATATACGCGCTCTTGGTGAGTTTCTGA
CCCTACTGGTCCTCTCCGATTTGCTGTTCGCTTGCTGTGATGCTGTCCCC
GCGTGCACCTGCCGCTGCCATTGCCGTTCGTCGTTGCAGGCCATGCTCCG
ATGGTCAAGATCGAGCGGCGCCGCCCGATTTTGGTCAGCATGACGCACTG
TCGAATACGCACAACCCCGCGTTCCCGCTCGCCCTCCTATGCCGTTCCTC
GCCGCCGTCTGGCTCGCTGGCCGGCGTGTCGACGTGGCGCCGAGGTGGTG
TCTACGTGGCCATGGCCCATCTGTCATTGACTAGCAGTAGGAATAGAAAC
GGTAACAAATGCATTTACTGCTTTGAGTATGCCAAGTGGCAACTGGCCCA
CGGGTCAGGGACCCTGGGTAAGTCTAGCTCAAGTGTAAAAAGTTTCATGT
CTGTTTAGGAAATAATTAAAACAATATAACTTCAAATATCAATATTCCTG
AAATGAAATAAAATGATTAAATCTTGTAAATTTGATATCTTTTGTTTTAT
AAATCAGAAAAATACATATAACATATGAAATTGTTTAGAAAAATAAAATC
TACAACTTAAAACTATTATAAAATATTAGTATGATGACTATTTAAATAAA
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ATTAATATTTTAATAATGGTAATTGTTAAATATAAATAAAATACCAAAAA
TCTTAGAAAAATAAGAATTAGAGTTTAAAACTAGAATCATGCATTATTAT
TCCTCTTAATGAAATATTTATTATTTATTAAGTATTTATATAGTAATAAA
CCTTATTAAAATCATATCTTATTATTTATAAATCACAAAAATAAATGTAA
TATACCAAAATGATCACAAAAATAATAACTACATGTTAAAAATGTGATAT
TCCACTTTTGAGTTAAATAAAAAGTTAAAAACTTTTATAACTTGAATTTA
AACCTATCTCCTTAATTAATAATTCTTATAAAGATAAATAAAACTTGTAA
ATAGTTCTAAAAATTAATCAATTGAGTCTAATAAATAGTATTAATCTTAA
ATATTGGTAGTGTGCATTCAAAATGAATTAACCACTTTAAATATAATTTT
ATTAAATTATCTCTCAACCATAAATACAGATTATTTTAGAAAAGGATTCT
TATTTAATATAAAATCTCAAAGAATATTTTGTAGTGAAATAAAACCTATT
CCTTTACTTTAACCACAAGTTTATAAACAAATCAAAACACCATAGTGAGT
TCATAGGAAGTGAATAATATTGTTTACCTATTCATAAAGTTTAACCACAC
CCTTATAAGTAGATATATTCCTTTATACAATTATAATAAGAAACCATTAC
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TAACTTTGGTCTGTTATAATTAAGTTATAAACACTACTAGAGAAAAGGCT
ATAGGAGACATGCTTATGCGAGGAACATTTAGACATATGCGCCTCCTATA
AAAATAGGCAAGGCGCACTTTGCGATATGCGCCTCTAGTATAAAAATAGG
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CTGTGTGGGCCCGCGTGTTGGTAGGTGCACGAATATGCGAGGTGCATATG
GTTATATGCGCCGACCATATGCGCCTCAAGTAACTCCTACGGGTCCGGGC
GAAGGTAGGTGGCCGAATATGCGAGGCGTATATTGCTATATGCGCCTCCT
ATAGTTTGAATTATAGGAGGTGCATATTGTGCATAACCTGGCGGTAGCTT
TCTTGTTAGTAGCCTCTGCGTGGAAGCACCCCAGGAAGCTGCGTTGCGTC
ACCCCTGCTGGTTCCGAGCAGAGCCAGCGCCGCCACTCCAGGCCGATCCC
CGTCCCCGCCTCCTCGTCCCCAAGCCCGACCCGGACGCGCCCCCACGATC
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GTCGAGGCCGTGCAGACCTCCGGGCTGGCCCGCCGGTGGCGCCACCTCTG
GAAGCGCATGCCCGTGCGAGCGAGCGACTGAGCCGACAGCCGCACCCTCG
CTCGCACGCACACGGCCGGCGGCGCAAATCCTAGATGGTGCCGGAGGACG
GCGCGCGAGCGGCTGCCGCTGCTGCGGAGGAAGCGGCAATGGATACGCCC
GCCGCCGCGGAGGCACCCCGGTGGACGCGTTCCGGCGACAGGTCGACGAC
CTCGCCTTCAAGACCGACCTGGTAACGCCTCCCCTCGCTAACCTCCGCAG
TAATCCGCCCCTCCCTCCCTAGCGCAGAGGATGTGAATCTAACTGCCGAG
CAAGCAAAATTGCCCAATAATTTGGGTGGTGCCGAAGTAGGCGTCAGGTC
CTGCGGTTTCCTGTTGCGTTTTCCTCCAAAGAATTGGGGAAAAGTGGTCT
CAGATCGGGACTGGATGCTGATGCGGTTTGCGTGTTGCAGCTGGAGAAGA
GGGTGAACGAGGTGGTACGGTTCTACGACGTCAAGAAGCATGGCAGCGGA
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GTTCTACATGGATAAAACATGCAATCTACTACTTCTGGGCTTAAGGTGTA
CTTCTGCGTTTTCCCTATTTATTAGTTTAAAATATCTACCCAAAGTTTCT
ACCAACTTCAATTATTTCGTTTCATAAGCTGCAAAACTTGAGTTTCTGAT
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GCAAGTATATTCTAAGTTTTTATTAGTCATCATTTAGAGTTACAATAACA
GCATCTATATTCTTCTTTAGTACGAATTGATGGAGTTCAGAAGGGATACA
TATCTCACCAGGATCTGGGTGCCACTAATAGTTGAAATACATTTCCATGG
TGTATTGGTGCCTATAAATCTGTACCCCTTGACTGATTAATTTTTGTGAC
ATAAACAGTACTAGTAGTTTCCATCTTGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.