Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004235

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004235
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004235
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTGGAATTGCCCTAAACCCTTGAGGAACATAGCGGAAAAAAAAATGAGAA ACCCTCCTCCCGCACCGCCAATGGCCACGCCGCCGGCGCAGTCGCCGTCG CCCGTTAGGCTTCGGCTCGTGTTCGACAATCGCCGCCTTCTCCGGCGGTC GCAGCGGGAGGACGGCCTCCGCCGCTGCTGGCTTCTACTCGGACCCGAGC TCGCCACTGTTGCCGATCTCTCCGCCCATGTCGCCGCCCGCTTCCACCTC CGCCGCTCCTGTCCTGGTGGCATCGTCCTCACGGTGGGACACTCTCGGTC CTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTGCTTTTC CCTATTTGTGTGACCCATGGAGCATTTTATCAATTTTTCCATCGTGTGTT GGGTTTTAATCGGAGGATTCACAAATGTGGGGAACTAATTGATGTGGTTG TCTTGAAGTGCGGTCTCTCGTAGACGAATGCCTCAGGGTTTCTGGGCAGT TCTTAGTTGCTTATGGATTTTTTTTCACATTTTTTTGTTGATTATTACTA CTTTTCTGTACTAACGAGGTTCTTGTATCTCTGAGCAGATGGATGGATTT TCCTTGCCACCATTCGAGTCGACTTGCATCTTCAGGGACAAGGATATTAT AAGGTATTTGTTCAAGAATTGAATCTCTGAGTTCCGGGGCAATCTTTGGG CTGCGGGCTTTTGGCTATGCTGAACACCCATGTCATTTTCACTCGATGCT AAGGCTATTCTTTATTGAAGTGTATCTCTGACATTTCCTTATGGATGTAA AAGTCGGACTGATTATCATGGCCATGAATAAGTGAGATGTGAACATATGA GACATTTGCATGGCAGTTAACTCCGTTCCTGTGAAGAACAAATAGCACAT ATTATGGACAAACTTGAAAGAAATCAAACATTTTACTAGCAGACATAGAG CTATAGTTCCACAAGAATCATAGGATTGTGGAAGTAGGAACTCTTTCTTG TGTTGTGGGATGTAACAAGTTGGATTTCCACTAGCGTGTTGAGTTGTGTA CTTATATGGTGACAATATGGAAATTTACGGTGAACAAACATCTTCACTCG GCTAGCAAAGAAAAACTTCTCCATTTTGTATTTCTGTTTCCATACAGCCA TGTGTGTAACTTCTTGTGGAAATGATGTTATACACAACAATGCTCCCTTC CCTTCTCCTTGGATGCAGGGTTAAACAGAAAACTTGCAAGAGTATAGTAC ATCATAATGACGTACACTGCATTGAAGATCCTGAGATAGTAGAAAAGCGT CCGCTTCCAACTGATGATAAAATTCTTGCAATCGAGTATCAAATTGACCG TAGTAAGCACCAAGAGGAGGTACACTGTGATCATCAGCCTGAAGACAATT CAACATCCAACCACAATCTAGAAAACGGGCATACAAGTTCGAAGAGGAAA TGGCGAGATGGAGATGCAAGAATACCTGAGAGCTCAAAGTATCCTCCTTT GTTCTTGTATTTCTGCTTCACTTTCTGGCAATAAAAGATGCTATGATCAC ACCTGGTTTTCTGTTTCATCAACCATGGCTACCTTTCAACTGATTCGGCT AATTATCTGGTGATGCAGGGGAAAGAAACTGAAGATGGCAAAAGACACAG CGTGCGACAAGGTAGACACCATTTGCCAAGACCGCGGTCGCCGTGGCTCC AAAGAGTCGAAACAGTCAACCATTGACATTGAAGCAAAGAAGGCAGCAAT ACAAGCTGAATTTAGTGTTGAACTGGACGGGAAGGAAAAAGCTGGCAGGT ACTACATCATGTCCCCTATTTCAGACATCTTTCCACCCCAATCCGATAAA CAAGTTTTTCTTTTTCCTGGTACTACCAAGAAGACAACAAAGCGCCAGTC CAAGAAATACATCTAATTGGTGGTAACTAAGTTTCAGTATATGATTACAT CATATCAGGTATATCACCACAAGATACTTTGGACCTGACTCGTAAGAGTC ATCAACTGTTGACTATAGTCGATATGACTTAACTGCAGATTAACATATCA GAAATTTTGGCTATAGTCCTATTGTCATCATGATTCTAATGAATATGCCC ACTTCAGCAATATGTTATTTCCTTGTAGCAGATCCAGTATTGACAACACT TGTCACTTTAAGAACTTATTAAGATATAGGAATACTGTCGTTACATTGGA CACAAAAAAGGGCATGTACTTGTGTATGTTTCTTTCTGCTGTTCCAGTAT AGTACTAACTGTATAGTTTGATTGCTACATTTCGTGAGTAGAATACTGGT GAGATATTGCAAAAACTTTTCGCTTATGCCGTATGAAAGAACACCTTAGT AGTGCATTAGGAATTGTATTTCCTTCCAAGGATATCCATGCACTTCAGAT TAATAGCTATGAGAGAAAGTAATAGATCAGCAAGATAAGTATAAGAGGCT GTCGTCACATTGGACACAAAAAAGGGCATGCACTTGTGTATGTTTCTTTC TACTGTTCCAGTATAGTACTAACTGTATAGTTTGATTGCTACATTTCGTG AGTAAATACTGATGAGATATTGCAAAAACTTGTCGCTTATTCCGTATGAA AGAACACCGTAATAGCGCATTAGGAATTGTATTTCCTTCCAAGGATATCT ATGCACTTCAGATTAATTGCTATGGGAGAAAGTAATAGATTAGCAAGATA AGTATAAGAGGTTGCCCGGAAATAGTGATTCTGGAATAATGCTACTCCAC AATCACTAAATAGATTTGATTTTTGTCTTTTTATAGTCTTCTCTGTGAGT AATAAGTAAGTAATAAGAAATATAGCACCCCCTCCATCCCATAACATAAG ATGTTATTACAACCAATATAATCTTATATTACGGGACAGAGGGAGTAATA AGTAAGTAATAATCACTAAAAAAAATGTACTGGCAAGTAATAAGCAGTAC AGAAATTATAGATTGCAAAAGCATTTCTCAGAAAAATGTAATGTCATTAT CTTCCATGCTGCATGTCTATATTTTTACATGCAGGAAACGTAAATATAGA AAAAAGTGTTACTGCATTTTCCATTTGGTTAGACAAGAAGGAACGCTGTA AAATAAATGGTAGTTTGAAATCCATATAATCTGTTCAAAATTATATATTT TGTGTTAAGTTACGCTTCTTTTAGTACTCTCATGCAATACCAAATAGCCT GTAAGTTCTAATTAATCAGTCAGTAAATGTCTAAACTGTATACAGTATAG CATTTATGTTAGTTTTCTTTGTATTAAATCTGTATGGAAAATTTTCAGTT ATCTCTGATGTTCATGTCACCATGAGATAATGATCACGTGTTATTATATT TGCATAAAGGTGAGAGGCTTTTTGAACAATGCATTTGTAATGATTCAGCA TTCATCTTGGTTACACTGTTTTAAAGACTGTTTTTGCTTTTTTGAAATGG CAAATATGTTTTAGCATTATTACATTTCTTCAACAAAAGGGAGGGTCGTA TTAAGAAGCCAGGGACCCCCCTCCCAACACGCACACACCACAAGTATAGT AGTATGTAAAACCACCCTACATAGTATTGACATGATACACTAAGACTTAT ATACTCCCTTGGCCCTTGCAAATTTTCCGTATTGCTCTGGAGTATCTTAA AATTAATATCAGTCTTTGTTCTATTACCATTGCAAAAAATTCATGTTGGA ATTTTTTAGGTGCAACCAGACCGAGTTGAGTTGTGAAACTGAGGTGGCTG GGCAGACAACTCAAAGTCCTAAGACGGTATGTGTAATCCACACTTCTGTT TCTAGATAAATCCAGTTATTGCACTCTATGTATGTTAGTTTGTATGCAGT CAGTTGCTGTAAATCAACTTTGATGTTTCCTGTAGTTGGTAAAGTTTGTT ATGCATGTATATAGAGTACGTTATGATGCTTACCTTGACGTATCTGCCTG TGGACTTATTTGAGATTTGGAATGTTTTCCTGTCAGCCTTGCAAGACCTG ATTAGTTACAAACTTACAACTTCCTTCAAATTTTGTTGTAGCAAATATAG TGAAAGTCTTACCTGTCTAAATGTAGTCTAGTAATTAATCAATACTAGTA AGTAGCAAGACACCTGTGCTACGCTGCGGATAAAATAATAATAATAATGT GAAACATAGTTTACTCAAATCTCATGTCGAATTGTTCCCTTTGACACTTT GATTTATTGGGGTTGTGCTGTATTTCCTCCTCTTATTTGATTTATTCTTC CATATTTGATAAGACTATAGATAGTTTCCTTTATCTCCTCTTTTTAATAT GCTAATATACATACTAAAATCTTGAAACAGAAGCTGATGTAACGGGTTTT CTTCCTTTACATTTTGTTTAATTATCACATGTTTTGTTGTCTTTGTTTTG TCCTGTCAGAGTCGAAGTGCTCGTCGTAAGAAGATCAAAAGGCAACTTAG GAAGAAAGCAAAAGAACAGCTGAAAGAGGTACTTTTAATGATTTTATGCG TCTTTATGTTCTGGTTTCATAGGGTATCCTTTTCTCCGTACAAGGGCATG TTGGGCAGGAAAATTCTGATTATACTGTAGATTTCTGAACCACTGCCACT GACAAGCCTGCTGGATCAGTGGCAACTGAAGATATAAGATGTTCGCTTAA CTCACTAGTCACAACCCCATGTGCACTTTCCAAAGCAAGCTCTGTGCTTT TCTTAGATTGCACCTTTTCCCAAGTCTCCCAAGAAGACTATTGGTGAGTT GGTATTACTCCCTCCGTTCCGAGAAAAGAGGGCGTGAAGCTTCTGGCATG CCGACCAAGGCAGCTGCATCCGGGGCTAACTTTAGCATTCCCTGGACTCT TTTGCCCCTTCTGAGTCACATTGTATGCAGTTATGAGCACCTGTAAGCCA CACGGTACCTCGTCTCTGCGTCAAATTGACCGACCTGCATGTAATGGACC AATCCACAGCTAGGTTCGTTCTAATGCAATGCTGCCTAGGCTCATGCCGG CAAAAAGCATGCTGGCCAGGAGCACGGCAGCAAGGCGCGCCTCTTCCTGG GGTAGGCCCCTGCTCTTGTCGGCAAGGACGCCCATTGCCCAATACGGCTC CTTCCTGGATGGCAAGAACGCCACCGCCATGGCTTGCCATGCCTCTCTGC GCTCGTCGGAGAACGCCGTCACCCTGTGCGCCTCCCTCCTGGACGACGTG GCGCCTGACGCCAATCACCACTCTCAACTGGATTCCAGAGACGATGGGAC GTGGGACAGTGGGAGACGAGGGGAGTTACGTTTTCCTGCATAGTTTACTG CTGTATTGGGGCAGATGGGCCATGGGGGCATTTTTTAAACAAAGGGAACA AAAACGAATCCGTGCCTTACTTTCCGTGAAAAAAATCGATTTTTTACACG CCCGCTTTCTCGGAACAGAGGGAGTAGATTCTAAGAAGATTCTGAGCCTG TACATTTGTAGGGTGTTCGCTATCTATGAATCTGTAGTAGGGTCTATTAA GGATTTTAACAAGCATTGCTAATAAAAGATGTGAGGTTGCTGACCCCTGA AGCATACCATATGATCATTCCTCATATTTCTGCGAAAACTAATCGAAATT TCTCATTTCTTCTCCTCAACCTCGATCTCACCTCCATGTCACTCCTTTGT CTCCACTTTGCGGGTATCTTTCTCTGGCGGTGCCTTCAAGAAATGACTTC TCGGTTGGCCACCTACTTCACTATTTTTGTGAAGGAGACAATGGGTTGGT TGGGTTGTGTTTTGGCAGTGGTGAAGAAGTGGCTGTAGGTATATCACACC TGTGGGATAATGTTGATCTGGGGATTGAGGGTAAAGCCTGGTGTTGATGG AAGAGTTGCTGTGAAAATAGCTGCACAATTTAGGGAAACATGAGGGCCTA TTCTAAAATTGCTTGTCTTACCTGGTCTCTACTCCAGTGGCTCTTGATCT CTCATGAGTTGCACCTGATGTGGTCTCATATCTATAATATGCATAAAGAA TAAAGTGGTGTTAGCCAAACATATTAATCCACTATGTATATTTGTAGTGT GGGGACTGCCAGAAATCACCCACTGCTGCTGACTTTCCATCTTCAAGCAA CCAAGATGATCTTCCTTGCCCGTCAAGCAATGAGAATGGCCTGCAGTTAC CATTTTCAAGGCATGAAGCAGAGGAGGAAGAATCAGATACATCAGACGAT GTTGTTCCAGTTGTGGTTCGTCCTGGTCATATTCGCTTTGAGCCAGCAGG TATTCCTCAGCCTGTGGAGAACTAATTGCACCTAATATGATTAACTGTTG ATTTAATGTTTTTTGCTGATAGCGTATCTGTTTACCTTCCCCATTGGGAA GAAAGAATATATTATTGGAGTGTCCCTGGCTACACTCTGCATGTGAGCTT GCACACATGTCATGACGCATGGACGCATGTTTATATCCTGTATGATCAAC GGGAAAATGTTATTTGATATCTTGATAGCAATTTACCATTACTCAAGTAA GTTTTATGGTTGATTTATAGGAGCTGCTTGACTGAATGTGTCTTGCTTCT TGAGTTATACTTGAAGCTCAAAATCAGTGTTTCATTCAGATAAGCGGCAA ACGATTTATGTTGTGTTGGGACAAAATTCCGGTAAGTTGCATCATGGACC AGTTAGTCTGTATATGCCTAAAAGGTTGGATCCTCAAGGCGATAATTGCA CGGAGAAAATATAAAGCAGTGCTCCTCTTAACCCTATGAATTTTGTTGCC GAATTGGTGGTCTGAGAGAAAATAGCATAGTCTTACCGCACAGGAGGTTG CAAAACGGCACTGCTGATAGTTGGTGTTCACTGTGTCCACATGCACCATT AGTTGGAAATATAACAAGATTTGGTTTGCTTCTAGTTACTTAGTGGGTTT TATTTATAGACTCTCTGTATTAGAGATAAATTCAGTAATTCACTTGGTGT TGGAGATTATATTCATATCTTATTAGGTCATGGTAAGCTCTATGAAGGGA CAAATTCTATCTTTGCTTTCAAGCAAGAATAATGAATTAGCTTTCTCGCA TCTCTGTATCTCAGATTATATCTAACCTTTTCCTCTGGAACCTTAATCCC CTTCAAGCAATGTCATCCGTCTCTTACACTGTAGGTACCCCGGTGTGAAC AAATGGTTTGCATCACAGTGAAACTGGGTTCGCTAACTTGAAAGTCATTT GTCTATATTCCTATGGAGCTGTACATATTTTCTGTGTGAATAAGTAGAAT TGCACTTCCAGTTTCTCTTCATGACTTGTATATTTTACTGTTTTATTTAT TTATCTAACAGTTTCATAAGAAACAATACTGTTGTGTTATCGACATTATT GTACAACCTTCAATACCTACCTGAATAATCATATATTTTATATAACACAG AATTCTTTGTGTTTCTAGGTGAACTAAATACATCGTTAGCGGACGAAACA CAGGTTTACACTGCTTCGCTTTGTCTTTTAACGCTATTCATCATGGAATT GCCTCGATGTTCATTTTCTCTGCAACTAGTTTTGGGAGGCCAATCTATAT AAGTTACTTAAGCTCCTTCCTTATCGCTCAGTTCAAGTGGATGTGTTGTC CTGCTCAAATATGCATCAACAGATGCAAAGACTTAAATATTAACTTGTGA TGGACTAACTTCTGCCTTTGTCTACATGCTACGTTCTTCTCATTAGCTTA GACTCAAAATTACTTCTGGCTTGTTAACACAATAATTAGTATTCTAGATA GCCTTTTCCCCTTTTTTTGTGGTGTGAGGTTTATTTTGTCTGGATGGGTT ACAACATCGAAGAAGAAGCCACCCACTCTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCA AAAAAAAAAAAAACAATACTTCAGAGGGTAGGTCATTTCAAGATCTGTCG TGATTGGAAGAGATGACATCTGACAAACAATGAAATGGGGAGTGTAATTT TCCTTTTCATACCTTCCAACGTGTACCGATTTTGATCCTAAAATCTAACT TGTTTGCAGAATAACATCTCCCCAGGGTTGGAAGCTTTGAAAATCCTTTT GTAACATATGGGGAGATGTTATTCTGCAAACAAGTTACAACTCATAGAGA ACACTTTAGAAACTACTACAATACGTATGACTAAATGACCATATTACCTA GAATATAGTAGAAGTGTGTAGAAGCTAGCACTGGATTTACTTATGTTTTC TTTTCTTTTCTTTTATTTTCTCTACTGTCCCTCACCAAAAGCTGTAAGCA CTTTATCAAGGAACGGAGGGAGTATAAGGCAGATATCTAAGAAGTTAGAT GTTGATTTGAATTTATACATTACTGAAACGACCATTTTACCTAAATGAAA ATAGGAAATAAAAAACTTGTTTAAATTTACTAAAATCAGCAGTTAATTTC CTTACCATTGACGCTGGGCTTGTGGTTCCAGGCAACTTTTGCGTGGAGTG GGACTATGAGCAAAAAGAAGGGCCAGAAGTGGGGTATGAACAACTCGAAT AAGAGAATGGCTGATATTGGCAAACTTGGGAAAATAGTTGGAAGTAATAC TGAAGTTAACCACCTTATGATAAATAATAAGGATGAGGGAAATGGTTTTT GTCACGTCAGCAATCAAAATGTCAATGAGAGCAATCATGAGGAAGGGAAG TCTAGCAGTGAACCGTTGGACTTTGATGGACTTTACCCCTTAACACGACT TCCAGAGGTAATTATTTTCCTATCAGAATATGAAAGAAAGCTTCACAAAT CATATAATTGTGATGAAAGAGTATAGTGATTGTTTCTGTCCCATTGAGCA TTCCAAGATGATGATGATATATTAATTTCCCAAGTGAATGGTTAGCTGCA TCCTAATGGACATGTGTACATATATGATTTTGTGTATGTTTATGTATTCG CGTAAGAGATAGGCATCTACGAGATTCTGCTTCCATCGGAAAGAGTCACC CAAAATACAGAAACCAAAGGGACATTCTGCATCCATGTAAAGAATATCTG AAATCAAACCCCTCAACTTCATGAGAATCAACTTTTCTATCATACAAGTA ATTAGTTGAGAGCTTGTAACTTGGCGGGAAAGGACACAAGTTATGCACTA AAACGAATATCATTAGTCAACTAACATTGATAGGTACTACTCGAAATAAA GGTTCCTAACGGTATGTGCTTTCATTGGAGAAGTCTGTGCTAGTTCACAG AATAGTAGCTGAATGGTGGCAACCACTGGCGGTCTAGTAGATAGGTACAC CAGATGATATGAATGGGATGTCTAGGAACTAGGAATCATTAGCAATCTCT GGAGGGAAGGGGGAGTATTTTAGGTGGGACCTAGACCAGAGGGTATTATC TAAAATTTGGTGGGATCTTTCTTTTAATTGATGGCCCCAAACAAATTGAT CTGAGGAGAGCTAGCGGTTCTTCCTATTGCTTAAGTGCCAACAAGCTGGC GAATAATGTTGGGCCGCTGTTGGCTTAATATTTCTACTGGACAGGACTCT TAGGTAAAAGCTGAATTCCAAGGCTAGGTGGAGCACTTTGGCACTTGGAG CTTTTGACACCCCTGGACATTGTACTATTTGTTTGAGAGTAAAATAGTAC CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCATTCACTAATGTAAGACCTTTTAG ATATTTCAAAGCGAACTAGATACATCCTAAAATGAGTGAACCTACACACT AATTGCTAGTGAAACAGCATTCTGTAGAATTGCTGTTCAATATTAGTAGT AGTACGGATTAAGATTTCAATGAAATCCTGTTCTTTTGTTTAGCTATGTT CTACCTGATATCCATGTGTGTTCCAGCAAAAACTATACCTGACGCAATGT CTATCCAAATTCATACTTTTTTGTCCTAAATGTGGATACGATTCTCCACT CCATAGCCAATCACATATTCACATCACATTTGGCATACTTGCATACCCAG TATGGTCTTCAGCAAGCATTCAAAATTTCTGTTGGTAGCTTTGTTCTTAG GCTGTATTTTATTTTGCTCTAGTTTAATTCTCTTTCTGAGCTTACCACTT TTTGTCTTTCAGGAGGGAGATCTTATTGTATATCGGTTGGTTGAGCTGTC TTCCTCCTGGTGTCCGGAGATTTCTCCTTACCGGGTATGACATGATTTCC AATAGCAATTTCAGATTGAAACATTTCTGGCCTAGGTCATTTGTTGTTTG AAACATGTTTGGGCAATTCATGTTAACTGTTTCAGGTCGGTAAAGTTCTT GTATATGATTTGATATCAATGCGCATCATTCTCTTGCCTGTTCCGGAGTA TCCAATCATCACGAAGGAGATGACAATTGAGGACAAGTTAGACACGCCGG TGGATATTTCACCCTACAAGGAAGATGGTTCCTTGGAGGTAATCATTAGT TCAATTTCCAATCTTACCGCGTACCCTAAGCTCGTAAACATCACACTCAA CGTCTACCGCAGATCGAGTACTCTTCCCTTATTGATGTAAGACTACTGAA GGGTAGTGAGCCAGTATCTGCAGCTCCTAGTACTCCCATTCGAGAAGCAG GAAAGAAAGGCGAATCAACGGTCGGAGAACCAGTTACCTTGGAGAAAAAT AAAGGCATAGCTCACAGCGAGATTGGAATCTTGGTGCCAAATAACACTAA AGATCCAGAAGAGGCACCAGGTATGGAGTCATTTGTAAGCATTTATTTTT CTATATCCAACAAGTCTGGTTATATTCTAATTGAGAAATAACTGTTTTGT GCAGAAAAGAAAGATAATAAGGTTTGGGAGGAAAGCAGCGAGATCCCAAA GCCTGATGAAGTTCAGGAGAATGGCTGGGGAACTTGGAAACCAAACGGTA GCACGTCGGCCTGGTCATATAGAGCACAAAGAAGCAGCGCTCTTGGCCCA ACACTTGCCCTTTTGAGAGGCAAAGATGGCAAGGGAGGCAAACCTAAACC TCCCAGTCAGAAGTATGCCAGGTGAGATATTAGGGAAATGATGATAATTC TGTATTTGATGTTTGGCTGAACGAACCGAACCTTGATCATGTACCTAGGA CTGGGGAGCTGAATGTTTCTGTTGCAACTTGTAAGTATTGGTGACTGCCC AATGCTGCTTTGACAGTCTGGTACTCCTCTTTCTTAGCGATCCACCCTCC GGAGAACTCTTTGGTTGACTTTCTCTTCTTTTTTTTTTCGATTTTCTCTG ACTTGACTCAACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.