Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA019854

[Submit comment/correction]

Sequence	AA019854
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA019854
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGACGATCGCACGGCTCACGCGCGCGGCAGTTCAATGGAAACGTAGTGG GGGCAGTTTTGTGGGGAGCTGATTTTGATCCCTCTCATCCCAAATCGTCT CTCTCTCTCTCTGGCTCCGGCGTTGATTTTGCTCCCTCCCACCGGCGATC TGGTGAGTCGTTGTGAGATTGGTGGTAGCGAGGGAGGGGAGAGCCGCGCT TCGCCGCCTGCGCGAGTGCTCTCGCGGCGGTTCCTGGACATCTTCCTCCC ACACCGTCGACGTCGGCGAGGAACCAGATCCGTGCCGGACCCGCGGCGGG GCTATCTCCGGCGGCTACACCGAGGTGAATCTACGTGGTACTTTGAGTTG ATTCCGTGACTCCGCGCCCATTGGCCTGCCGCTTTGCGGCAAAAGCTCAT CACGTAGGCACTGTCAGTCACGATCCCCACAACACGATTTTATGCAGCAT AAGGAGTGCTTTTGAACCAATTTTGCGTGATTGCTTGATTAGTTGTGTTC GCACGTAAATCGCTTCGCTCCCTGGCTGGCAGGATGATTCTTTGGAACTA AAGGCTATTATGGTTTGTGCTCGTTTTTGGTTTGAGTATTAAGTGTACTA ATATAGTTAGTGCGAAAAAACCTGTATGGCAAATGTACAATTAAGTGTAT TATAGTTAGTGCGAAAAAAACTACAAAGGCTTATTAAACTTTGGGACAAA TTTACAGTTCTCCAGTTTATGGAGAGAATTGCAGATTTGTCCCAAAGTTA TCTGACTTGGAGAAAATTCTGTTGAATAAGTTACTGTTGCAGCTTGATGA TAATATTACTCATAAATTTAATCATGCTGATTCGCAAATGAATAAATAAA TTTAATCATGCTGGATCTGCAGGTTGACTGTATCATTGGTTATCAGCCAC AGCTTTAAGACGATGTATCTTGTGGGCCTATTCATTCTCTACAGGCCGGT GGAAAATTATTGAATTGGACAGGGTTACAGATCTGATGATATGTCACTCA GACTTCCACTTCCGCAAGGGCTCTCCTTTTTCAAAAGTGTTGGGTGGTTC GAAGACAGTAAGGTTGACTCAGCTGCCAAGCAGCACTTGGCTCAGAAATT TAAGCTCCAGACAGATAAGGAGGTGTACAGACCTGGTGATTCAGTTATCG TGACCATAGAAATCTGTAGTCCCGCTAGCTTAAAGGATGATGCAGGAGCA CTGTCGGGTGAAGCTGTCCCATCTCTCTTAGTAGATGGGCTATCGTTCGA ACTTAAAGGAATTGAGAAATTGGATAGCCAATGGTTCTCTGTTCCAAAGC CCTTACCAGGGTCTAAGCAAAGGAGAGGTACAGTTTTGCTATCTTATCAT ATGTAAACAACTGATCAATGTATCTTTATTTAATGTTTCTGATAACCCTC TTATGTTGGGATTGAAAACATAGGTGAATATTTGTTTTTGGATTATTCGG CTCCATCATTATTCTCTAAAGTAATAATCGCTTCGGGGCAAACAAAAACA TGTAAGTTATCTCTTGTTTGGAGGATTAATGGAGGTTTACTACTGCACTT ATGTAATGTTACATTTCTAGATTGCTTGAAACATAAATATTGTTCATATG CTTTATCTCCATTCTTTCCTAGCAGTGTTAAACATGTTGGTGTAATACAG TAAATGGAATTTCCTTTACTTTATGTTCTGCTAATCACCTGTGTCATCTA TCACCTTGTATTTGATCTTAAATAATGCTCCATGTCTCTGTTTTTCACAT TACCTTGAAGTCAAACAGTACAGTATTGACTATGATGATATAGGGATATG GCATTGACACATGCATGTTTCTCCAACACTTTATGAGCGCCGGTTCATGT TTGGCATAGGATCTTCAGCGGACAATGGAAAATTGTCTCCTGTTAACCTG CTTGCTTAACTAAGCTCTTTCGTCTAGGATCTACACTCTTTGTAGAAATT GTAACTCAGCTGAAAAGTAAACTTTCTGCAGATATTGTACGTCTTGAGCT CCCAAAGATTTTACCACCATCATATAGGGGCATCAGTATTCGCTATATTT ATTATGTTAGGAGTACATTGTTTGGGAGATTGATTGAGAGTAATGGAGAT CAAACTAAAGGCCATGTGAATAGTGCGGTTCAGCTGGTGAGTTTTCTTCT TCCAGTTGACATAAAATTGTACTCCTTAAGTTCACACATTCTGTGTTGAA ATATTGGAAGCTTTGATCTGGGAGCCATCGATTCTTCCATTGGTAATTTG TATTATTATCCAAACTTAGTGCTCTAGCCTGTGACTTGTGAAGTACTTAA AAAGCATGTTTAGTGGAAGTTCAGTGGAATCACTTCGGATTTCTAACTAT CTTAGAAAGAAAATACATTTAAATAGCACTAAAGACATTGTTTAAGCATT TAATTTTAACATAAGATACGAAAATCAAGTAAATACCATGCAAAATGGAG TGTTGCAGCTCAAGCCTTGGCCAATCATCCATACAACCTTCCATCCAAGG GAAACAGTATGACAGTAGTCAAGTTTACTTAAGTGTTAAAATATGCAGTT TTTAATAAACAGCCTTACTTAAGTGTCAAAAGCATTTGTCATAATAACCT TTTATGCCTGGGGATTTAGGGCATGTGAACGTGTAGACCCAGAACCCGAC AGAAAGACATCAACTGGTATTAGTTCTAGCTCGTCCTAGCCTGTAGGTTC AGAAGAATGCGATGTCAATTTCTTTTATTTTGGTTCATCTGTGCGGGCCT CCATTATAATGTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGGGGGG GGTACTCATTCTGTAGCACAATTATCCAAGTTTCAGGCATATAAAAATTA AGTCACATATCTCAGAAGGATGGCTTAAAATTGACTCTGTTTCTGTAGGA GGCTCGAGTTCCATTGCAGATATGTGTTTCCCAGAAAAGCAGCAACTTAC TTGATGAAGAAGGTCAGTGATGTGAATGTAATAATTTGAGTTGCACTTAA AAGCATTCTGTGTGTGAGAGTGTTATTCTGCTGGTTTTCAAAAGTATGTT ATTGATTAAATTTTTTTCTATTAAGTAGTGGCGCACAAGGGATGTTGTTC AACATGGACACTCGTTAAGCCATTCCAGTTTCACCACGGTCCTTATAGGT GACTGAATCCAGTGGTTGCCCCTTTCAGGAAAATTCTTGTAGCTTTCTCT TTTTCATGAAAATCTACATATACGACAGGCTTCCTAAATAATCCAGTGGA GACTGACACCACACCTCTATTAATATGGAGATGCAAAACAACAAAGGAGT ACTGCAGAGTTGTTAGTGGATGTGCAACAGCAGAAATTTAGTACTCCCTC CGTCCTAAATTAATTGACGCAGCTTTGTCTAGATACGGATGCAACTTGTC TAGATGCATCCGTATCTAGACAAAGCTACGTCAATTAATTTGGGATGGAG GGAATAATACTGAAGTGTTTACTATGTTATTCCTCAGCAATGCTAAACTG TTTGCACATCTCAGGGAGTTTTCCATTATCAGTTGAGCAACTGAGTATAT TTTGGAGGGAAAAAGATGAAGATTCAGAATGGGTGAGTCCTTATTTAGCT TCTAACACATCTCCCAGATTTGGCACTTAATTATGTTTTTTCCATTTCTT ACATGTTTGTTACATGAGTGTATGAGTTGTCCGTAGTCATTTGTATCAAT ACTCAGCACATCCATAGTTTGTAGTTTTGTCAACTGTTAAAACTATTAGC AGGAACTGAACTGTTCTCCAAGATATGGTAATTTTCATCTATGTACAGGC AGAAATTATTGACTAAATCGTGTTAATCAGTGATATCCATAATTGCTGAT TGAACCGCTGCTAAAATATATTATTCTTATTGCAGATCAGAGCAAATGAT AATACTGATCTGGAAGAAGGATATGATAGTTCGAAAGATGAAGTTTCATC GGTTTCCTCATACAACCCTTCCAAATCAAATACAGAATATCCCCTCAGGA ACTCAACATCGACACACTCCTTGTCATCACGTCTCTCCACCAATGAAGCA CTGTATTCTCAGGGAGAGCGCTCCACTTTCCCATCATATACTGCAATTCC TCGATTGTCAGTATCCGAGATTTCAGATGATCATGGTGGAGGTAAAGAGT CAATCTATAGTTATTGTGGGGTTGTGCGAGAGCTGCAATACTCATAAGGA ATACCAGCTTCACAATACTGTCTTTCGTGCTATAGGATTTTCTCCGCCTC CTTATATGTCTACTTTTTTTTACTTATTGTCATATTCTTGTAAACGTTTT ACTCCACGTTTTCTTTTAATGAACAGGGAATATTTTTAGTTGTCCGTACC TTTTCAAATTGAATTGGGGGCATCTCCTTAGGATTTTTTAACCAGGCTTA TTCCCCTTCCATTTCACAATGAAATAACAAGTGTTACATTAGTCAGGTTT CCATGAGAATGCTACCTATTTGTTACGTATGAACAAATTTTGATGAGCAT GTGTAAATGTTTCATGCTACATATTTATTTATGTCAGATAGACTTATACT TTCACTGTGGGTGTTTAATGAAGTAAATTGTACAAACAGGAATAGTGTCA CCTCTAAGGAAGCTAGATCATCTGCATTTAGATCATCCTCCATCAAATGG TCAAAGGTTTTCTTTAGATTCTGATCAAACAAAAGATGACGTTGGACTCC CTCTCACGCCAAAACATGTTGAACCGTCTGGATGTAAGCCATCATGCCCC AGCTATGGAGTTATTTTAGTTCATCACTGCTCCCTTTGTTGTAAATTTAC ATGCCATGTGACCAAAATTAGTTTCCAATGCTTAGTTGCCATTCCGGTGT TTTGCAGCAGAAGGCTTTATGAGAGGAAGATCATATAATATACGAATAGA TGATCAAGTCTTGCTTCGTTTCTCACCAAAGAATTCTGACTCAACTTACT ACTTCGGTGATATGGTATTATAATTATCCTTTAATATGCTTCTTACTGGC TTCTTGCTTTGTCATTTATAGAGTTGATTATCTGAGTTTACTGATTGCAG ATTGGTGGAGCACTCACTTTTTTTCATGAAACTGGAACACGTAGATGCCT AGAGGTAAAATACCAAGCTTAATATAAAATTATTATGTATTGAACTGGGA TTAACTAGTTATGGTGCTTCACAGGTATCTGTAACCTTGGAAACATCAGA AACAATTAATCCTCGTGTAATACATCCTTCAAGAAGGGTCTCACCCACAA TAACCAAGGTATCCTTTCTGCAGCTACAGGGGCATCTCTGTGATCAGATG TCATTTGTGCATGGAGTTTGATTAGCACATTGTACCTTGTGTTATTTGTT GGGATTACATAAGATGTGTGTAATTCCAAAGTACCCAATCTTGATAAATG GTACTATGAACTTCCACCTTCAATAAACTCACTGAAAATCACCGCATTAC CTTCGTATTTCACATGTGTTGAATGCAAACGCCCTCGTCTTTTATGTCTC CACATCCTTCTCAGTGGCTGCAATGATGATTATCGCGATGTTGGCTGATG TGGGCCAATCTAACAGGGTAGTTGTTGGCATGTCAGTTCATTGTAGCTGG AACAGGTCTGCTACTGTCATCCCCTTGTGCTGCATAGGACACAGAGTCGT CAAACCCATGGACAGGGCGAAGTTGCCGTCACCACCTTTGGATCCAAAGT TGGACACAGCATGAATAGCACCATATCCGCAGGTGAAATCGAGCTGCTGC CGCCATGTATCGATCATTCAGTGGGCAGGAGCTTGCAGATGTGGTCATCC ATTTATATCCCCACCCCTAGACCTGAATACCAGCCAGCTTCGCGGTAGTT AGTCCCTGGTTGGTCGTTTTAAAATTCGAGAAGGTCCGAGATGTGAGGGG GCTGCCGATAGAGGCAAAAGAGACAATAATATGGCTATTAGTGCAGCACT GCGTGAGGTCGGGTTGGCCCAGAGGTAGGTGGAAAACCATAACTTGCCAT AGTTGAAAGAGGGAGGTCCCAAAGGAAGGTGTGGTACTACTGTCCACTAT TAGTGGAACATGTAGCCCGATGATATCTTTCTCTAATGAGTTCGTAGTGT CAATTTTCAAAGCAAGTCACTTTGCAGTGACATGTCTAAACCACCAGTTT TTGCAGTAATCCGAAAACAGAAAAGGAAATGTGCTGATGCTCTCAACCAG TCACATGATAAGCCATGCTCTCATGATCATCAAGAGATAGTTTAATACGA ACTTCTATATTTACCTTATGATGATAACACTTAACATATTCCAGCAATAT AAGATGTCATGAGTTCTTGCTAGCTTATTATTCAAGTAGCTTGGTCTATT TGAATATTTACTTCTATTCTGTAAAACACGAGACCTGTGTTATTTTATGA TCCAACCTTGACTCTGTGAGCAGGTACACAGTGAACATCATGAAGTTGTT GCAGATCTTCATCAGACGAGCTTTCTCTTTTCAATTCCTATTGATGGACC AATGTCATTTGCTACTTCAAAGGTCTCTGTACAGTGGTCCCTTAGATTTG AGTTCTTCACAACCCCTCCAGGAATGGACTCATCTAGGTATGTAACGTGA TGATTTTATTGGAGTCGATTTGTGTTTACTATTACTCTTTCCATGTGCAT GTGTTTACCGCAAGTTAGTCAATGACATAATACCTCCATCTGTAAATATA AGGCGTGTTTTACTATTCAGTCATCAATGCATTATTTTGACTATAATGCA ATATTATGCCTACCAAATAATAAAAGGATATGTAACATAAAAGTATTTTG CAAGACAAATACAATAATATTATTCATGGATGCTTGGTCCATGTCTTTTA GACGTATTAGAGGTCAAAATTTTAAAACATTGACTGCACACAAGCTATGA GCAACTTGTGTTTATAACCAGTTCCTTGAGAGTTAATGCTATTTCCGATA TGTTTAGCAATTTTGTTAAAGTGTTATCAGGTTCCGGTGAAGTGTGAATA TTTCTAGTCTGTTGCTGCTAGCTTTGAGTCGGCAATTCTGGTCTATCTTT GGCAGGTATGAGCATCCACTTCTTGTTGAGAAAAGAGAGAAGGGGGATTG GGTCCTCCCAATAACAGTTTATGCACCTCCACAGCGTAGACGAGCTCCTC ATGGAAGAAACAATAAATCTGTGTTAGTTGGAAATTTGTTCAACTCTTGA AGGTATGCAGTCTCGGTCTCGCCATCTATAACTAGATTTTTTACGTATCT CACTTTGCCAAAGTGTTGCTTCGTGAAGCTGGAAAAGTATTACTCCTACC ATAGTATTTTTTTTTCACTGTGAGTTCTTATGTGATCAGTAAATGATCCA ACTGGAGTGTTTGTCCTTACTAGGTTGAAGTCGCTTCTGCCTGGTGTATA GCTCTAGTTTAATCAAAGGACTTGTGTTTATCCATCTGGTTTCTTTGCAT GTTCGTCCTACTTCTGTTACTTATACATCAGATTTTATCTCTTTTATCCT CTGAACTATATTCAAGCCACTGCTTTGTAGTATTTTTGTTTGCTGTTGTA CACAGATAATCTGAACATCTAACCACCTTTTATCTTAATTTCAGATTCAC GAGTTGCTGCTGATCTTTGAAAATCAGTACCATGTTTACATCCGCGGACC TCTGGTGAGTACTTCTGCAGTTCGGCATGCACAACTGGACCCAGGTCATA CCTGTAAAAATTCATCACCATAGAACAGAACAGGAACTGCTGCATTGGCG CTTGATTTATGTGACGTGACATCAATAGTGAAGATATGGTACCATACCAT ACCAACCTAGCGCATCAAGTGTCACCGCACATCCAAATCCAATGTGTATA CCGTTTTACTGATGGACTGAATTTTTTGTGGTGCTCCAGTAGCTATTACA ACCCTTGTATGGTTGGTTACATGTGCTTGGGATATCTTCCCTGTAATTCC ATCGTTTTGGAAACCATACTGTTGTCCGGACTACGCATATCTTGTTCCTT GA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.