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GrainGenes Sequence Report: AA011715

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Sequence
AA011715
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA011715
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCCCCATTCCCCCACTCTCCACCCCCTCCCCCACACTCGCTCGCTGAT
CCCTCCGCCGCCCCCACCATGGCGGTGAAGGGGAAGGGCAAGCAGCTCGC
CTCCGACGCCCCCGGCGGCTCAGGGTCCGGCTCCGGCTCCAAGCGGCGCA
GCGGCGGCGGTGCGGGCCCCTCCTACTCCTACAAGGCCGCGGCCAAGCGC
GGCCGCCGCGAGGGCGTACTCCAGTTCTTCGACGACGTCGCCGCCGACGA
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GTTCCTAGCTTGCTATCACCTCGTGTAAAACCATCTGGAGTCTCTCCAGG
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TAAATTTGGTACCCATAATCTGAATGATTCCTTTTCACCCCCTCTGCCTA
ACAGCTATATGCATTTGTAGGGAGGTGCAATTTCCCTAAAAGATGCCGCA
GTTCCCGCGCCACGACTAATCAGCTCACAGGAACTAGAGTAATTGCTTCT
GTTTTATGTTTAATGTCCTTCTACTATCATTTGTTTCTAACCAGGCTTTG
ACATTCTTTCCATGATCTTTCTGATCCTACTAGGCTCTTCGGACCTCATA
TTGAGAGGAGGCGTGATCGTCAGACTGGTGATATTTTTGAAGTGCTTGAT
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TTTGATTTACTGGGGGATACAACCAACGGATACTGAGCTTGTCAAGTTCT
CTTCTAGTCCAAGCACTAAAACTTCTGCTGATGACATGGATTGGGTCTCT
AGTGTCTATGGTCATAAGAAAAGAAACGTGCCCAGAGAACCTGATATGTC
ATCTGACATGAAGACATCATCATCTTCTAAAGACAAGTGCTCCAAGGCAT
CGAATCTTAAAGGTTCCAGTTCTACTGAGAATTATGAAGAAGATGGCGAT
GAAGATGAATTCCGTCTTCATGATCTTGTACTTTTTGGGTGAGTCCCCTT
TATTATGATCTTTGTTCACTAATCACTCTCAATTGAATACTAGGTTCAGA
ATGCCATCAATGTATTTTATTTCCTAATGAGCAGGCGAAAAGATTTTGGT
GTGGTTATTGCTGTTGAAAAAGATGGTTTTAAGGTAGCATTCTTCTCATG
CCCTCGTCACACTTCAGATCCACATTCTTGTTTTCTGTTCTAAGAACATG
TGATTTTGTTGTAGATTTTAAAGGGTGGTCCTGAAGGATCTGCTGTGACA
GTTAGAAAGCAGGATATTAAGAAAGGATGCGTAGACAAAATGTTTACAGC
TGTTGACCATCAGAAGAAGACAATAGCCATTAATGACACAGTTAAAGTTC
TGGAAGGACCAGTTCAGGTGAAATTTTAATTTCCGATTATCGAAGTCAGC
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TTTCTTTTCAAGAAAACATTAAATTAAAATACTTCTCTGTATTCTGGTGT
GTTCATGCTCCTTCTGTCAAATATTTGCTAATTGTACCAATCTTGTACTT
TATATATGATGCCTTGTTGTAATTACATGCTTCATAGCTAGAAGTTATGT
CTTTGCAGTTCCTGTATTTGAGAAAACATTCCTTCCATTTGGTACCCTTT
CTGATCTGCTTAATATATCTTGCAGGGTAAGGAAGGAGTTGTTAAACACT
TGTACATGGGAATACTTTTTATATATAATGAAAATGAAAGTGAGAACAGC
GGATATTTCTGTGCCCAATGCGGGTCATGTGAAAATATCAAGAAAAGGAG
GGAACTGGCAGATTCGGTATGTTCAATGCAGTACATCCACATGTCTTATG
AATCAGAAATGTTCTTTTCTTCACTCTGTTTTGATCTATCAGGAGGACAA
TCCAATTCCCATGTTCTCAGACTCGGGTTTCATACCATCTGAGCAAAATG
AACAACATAACAGTAAGTGTTTCATGATTATTTTACGTATTGTTTTTAAG
TGATAAGGTTTTATGACTGTAAGCAGAAGCTACATTTTGTTTTGATTTCC
TTGATCATACAGACGAAAGGTCTTACAGGGCACCCAGAGAACAACTCTTC
TCAATCGGGGAAATGCTCCGTATTCGCAAGGGTCCTTTGAAGGGCTATCT
CTGTCGTGTAATTCGGATATTCCGAAATGATGTAACTGTTAAGCTGGATT
CTCTGCTGAAGATTGTTACAGGTTAGTTAGCTAAGTTTGCATGGATTGGA
GCTGTACTTTGGACAATGCTTACTTCTTTGTTTTATATTGTAGTGCAAGC
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TCAAGCTTCTCTTACCTATTGTTGCTTTATATGCTGTTTGAATCATCATA
TTGAGGCATAATTTCACCATCACATTTGCTTCTTAATTGGTTATGCCAGG
GATAACTCATCTAGTGCTCCATCTAGTTCTTTCGGAACTCATGATACACC
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GATTCATCTCTATCATGTGTGCAAGAGAAATAGTTGCAAATCTTTTCCAA
AATTACTTGCTGCTGGCCCACTGTCTATAATGAGACCGATATTTCTTATT
TGGTAGAGTTTATAAGATGTGAGAAATTTAAAACTGAATCTTAAACTTTT
TTAGAAGGTGTAGAAGACTATAATTTTTTGTCATAATATCTCATCAGTTT
ATTCTTTTAAGACATGGAATTTGTTATATTGGTTTTATATTTAGGTTCGG
AAGCAGCGAAAACCTCATGGGACAATGGATTTACATCTCTTGGCAGGTTT
GTTTCATATTTTTCAGTTTCTTTTGTGATTCCATGTCAGCTTACTGGTTT
CCTGTAAACCAGCCAAACTGGATTATAAGATTTCTGATTTCATAGTATGT
GTGTCTGGGTTGAGGGACGGAGTGGTTAGACCTACATATGCAATCCTCTT
ATTCAACCCTACCTATCCATGAAAACAGTATTGTGCAGTTGACTTGCTAA
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TTTACCTTTTCTATCGTTCTAGATGAGTTGCTTTTCAACTGGCTAAGAAA
GTGGGCAATGATAACCTTAAGTTGAGGACCTTATGTATTATTTTGTGTAA
CGCTACCTTTTTAATGTATTTGTAAACATGAGTGACAAATTTTGACCAAC
AAGGCCTTTTAGCATCTGATGGTCTGGATTTTTTCTGTTGGTGGCCACTC
AATTGACCTGCAAAGTTGCACAAAAAATGAAAAGACAGGCAGTAACCTTT
AATGTTTAACTAGTAATTTGCTATATCTGATTTCTTTATTTATAGCTATC
CAGAACTGTATGGTATGTGAGAAGTTTCTTGAACCAGATTTCCTTCTTTT
TCTTTTGTACCTTAATAATCCTCTATTTTGTTCTTCTGTACTTATTTAAT
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TAATCCTGCTTTGTAGTTGGTAATGATTAGATCAAGCTATCATTACAAAA
GCAAGATTCCTATGATTGCATCTCTACTTGTATTTTTTCCCCTTCTGGTT
TGCTGTTGCAAATGGCTAAATGCTAAATCAAAATCTTCCCCTTTTCACCG
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ACTAAAACTACCACCTTTAGTTTTTCTATTATGAAACTACATAACATGTA
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TATTTAGCCTAGAAGTTATGAATTTAAAAGACGATACATCACTGATCACA
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TGATCAAGTTTAACCTATCCTTTGCGAGTTTGTTAGGATCACTATATGTT
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GTGTTGCGTGCGTGTTTACCTCACCATCATCTTGAAAAGGGTAGGTGGAT
GTTGTTTGAGAAAAATCCAGCCAGCCTTGCTTCGTAGAGGGCTGGCTGGA
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GTAGCACTATCCTACTTCCACCCTGAGGGCCTTCCTTCTCTCTGATTCAC
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TCTACTGGAATTGATTGCCAAAGTATTAGACATCTGATCAGTTATCCATT
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TGAGGGGTCAGCAGTGAATAAACAGGTTGGATGGGAGGGGCATGACCTCT
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CTTACATTTCAAACCTTTATGCAGTCTGGGATATATGATGTCACTTGAAG
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CATTATGCGTAGTATAATCTCTTATTTCAGTTCCGGGGAAGTTGGATGTG
TCATCTCTCTGCAGCAATGTCAAATCTTAAATGAATTTTTATTCATGCTT
ATGTGATTGTTTTGCCTTCATTTACCAGTCGTTGAGGTTAGCTTCACTGA
TTCTTGCCTTTACATGTTCAGATGGAGGAGCAGATGGTGATCCTTGGTGT
AAGAAACCAACATCTTCTGTTGATGGTGATTCTGATCCATGGAATAATAA
AACATCTGCAGCATCTGAAATCTGGAGCAATAGCACTACACAAAAGGAAA
GCTCCAGTGACAATGCATGGGGTAAACCAGCTGGAGGAGGTAGTGGATTG
GATGCTGGTGGCAGCTCTTGGGGTGGAGCAGCAGTCAACAAGGACAGTGA
AAAGAGTGACGACTGGGGTGCATGGGGTAAACCAGCTGGAGGTAGTGGAT
TGGATGCTGGTGGCAGCTCTTGGGGTGGAGCAGCAGTCAACAAGGATAGT
GAAAAGAGTGACAACCGGGGTGAAGCATGCAAGACGGTGGACATGGCAAT
CGGTGGTGACACAGATCCTTGGGGCAGTAAGGTTAAAGTAGTTAAGGAAT
CAGATAGTTGGGGAAACTTGCCAGGGCCACCAGAGAAATCTGATGATGGT
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CCAAGCAGTCGAGTGGAACAAAGCTGAATCATCAGACCAACTTGGTGGCA
GTGATTGGAGTAAACCAAAAAATTCCGGGGGTGCTGGTGCATCAAGCTGG
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ACCTGCTGGAAACTTTGAAGCTGGCCGAGGACGTGGGAGAGGCCAGGGCC
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GGTGGATAACGAAGGTGGAGATTCTGGTGGATACAGGGGAAGGGGAAGAG
GAAGGGGCCAATATGGAGGACGGGGGAGAGGAAGAGACAATGGAGATGGT
TCTGGGTTTGGAAGGGAAAAGAGCAGTGGTGATACACCAAACTGGGGAAA
CAGTCAGCCTTGGAGTGGTAGTGAAGGCACCAAGACATGTGATGAAAATC
AGACTTCCACTTGGAACAGGTTGGAGGATAAAAAACTTTCTGGAGGTGAG
TACCCTGTTTCTGACTTCTAGCTTTATTTGATGGACATGGTTGGAGTACT
ACTTTGTCTTGTATAAATGTATGTAAGTTCCCTATCCCATTTCAGTTTGA
TGTTGCCACCAAGACCTAGATAAATACCATACCTATACTATAATGCTGTG
GTGCTTCAATTAACTTCGACATGATTACACTAAATTTTATGCTGCTTAGA
GTTGTGCCTCTCTTATTACTCTTGACTTTTGGTGAAGCACAACTTGATCC
TTGGCTTTAACAAATGGCATCTCCCAAGTACTGAGAATACTGCTACAAGG
TACTAACTTGTATTCTCTTGTGTAGGTGAACAAGATGATCCCTGGGGGAG
CAAGCTGGTTACTAAAGGTTACAGAGATAATTGAAATGCCCATATTTTGT
ACTCAATTTGATGTTTTGAGCTATACTTGTGTGTTGACTATTCAATCTTG
TAGGCCAAGAGCAACAAAATGATGCTTGGTCAAGCAAGGTGGCTTCGACA
GCAGGTGCTGAGAACAATGATGGCTGGAACACAAAGGCGAAAGAGTCTTC
CTCTAGCCTTGGGTCTAAATCGGAGAATGCTCCATCTGGTAGTTCTGAAA
CAAAGACACATATGCTTTTATGCTCGATTGTTGTTGTGCATGCTGCAAGC
TTATCTTTTATGCTCATGTTTAGGTGAAGAACGACAAGGTGATCCTTGGT
CAAGCAAGATTGATTCTTCTGCTAAAGGTGTTGACTGCTGAGGGGACTAA
TTAAACACTTCATCTTTGATTCTCCGCTTAAAATCTTGGCGGATCTTTTG
ATTTTCTTTTCTTGTGGTAACTTGCGATGCTTATATTTGATTCTTGCAGG
CAAGGAACAAGAAACTGATCCCTGGGCAAGCAAAGTATCTTCTACTGCTG
CAGAGGAAAGGGCTGACACCTGGGGCAATGGGAATGGAGGAAGTTGGAAT
AGTTCTGGTTCCTCTTTTGGGCAGCAGGAATCTTCTTGGGGCAAACCAAG
TTCCTCAAGTGGAGATCAAGAGCCAGCTTGGAACAAGCCAAACAATGGTG
ATGATAATACTGGATATGGTAGTGGCGGATTTGGACGTGGGAATCGAGGC
AGAGGGAGAGGAAGGTTTGGGGACTCTTCATGGAATGGAGGAGGTAACGC
AAATGATGAATCGGGTGGAGAAAGATCTGAAGGTGGCAGAGGAAGAGGTA
GAGGACGCTTTGGCCGAGGTGATCGCAATCAAGGTAATAACTTTGGGTCA
GGCGACAGGGATGGTGGCAGTTGGGGCTCTGGCAGGGGAAACAGAGGCCG
AGGTGGTGGTTACAAAAACTGGAATGACAACAATGACGGAAGGGCCTCCA
GTCAAGAACGAGGTGGTGGCTGGTCTCAGTCGGCGGACTGGAATGCTGGC
AAAAAGGGAAGCGCGGAAGGAGATCAAGCTTTCTCACAAGGCAAGTCCAG
CTGGGGGAGTGACAAAAATGATAGCTGGGGAGCTCCTAAACCATCTGGCG
GAGATGATCAGGCAGGAAAGAAGGATGGAAACAACACCTGGAGTCAAAAC
AAGCCATCTTCTGGTAGTGGATCATCTATCCTGGGCCAGTGGGGTGGTCC
TCCTGGCGGCACTGGTGGTAGAGGAGGATCTGCTGGAGGAGGATCTTGGG
GAAAAAGCAATGAAGAGAAGTCCAGCTGGGGGAGTGACAAAAATGATAGC
TGGGGAGCGCCGAAACCATCCGGTGGAGATGATGCGGCAGGAAAGAAGGA
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CTATCCTTGGTCAATGGGGTGCTCCTCCTGGTGACACTACAGCAGGCGGA
GGAGGATCATGGGGAAAGAGCAATGAGGATGGCTGGAATTCGTCAAAAGG
AACCGGAGGTTCAGGTATGTCCACCAAGAATCCTTCGCTGCAAACATATC
ACTTCGGAGTGAAAGACTCAATCTTGTTAAACATCAGTGCATTCACCACG
TGCCCCACTTCACTCCACCCCTGTCACAACAATACTCTGTATTTCAAATC
CATAAATATTTCAATGCCCTTTTGGTATTTCTTATGCTAATCTTACAAAT
GAATCTAAAATAGCCAATCTTTCTCATGCTGTTTCACAAGGTGGTTCTAA
GAAGGAAGGATCTCTGGACAAGGCAGAAGGGAGTGGGAGCCAAGGAGGTG
GCGGCGGCAGTTCCTGGGACAAAGCAGATGGTGGTGGATGGAACAGCAGC
AAGGGCGGGGATGCCGGCAGTAGGGGCGGCGGGTGGTAAGCTTGGTCCAG
AATCAGCTGTGCCTGATCTTTGGGCTATGTACATAAAGAAAGGGTCTGCG
CTATGTACATCTCTGCGCTGTAGCACCCTGTGGTTGGTTCCTTTGCCATG
CTACTGGACCTTATAAACATGGCCTAGCTGGGGCAGGACGCTCCCTCGTA
TCGTACTGGCAGTTAGTAGTGCCAGCTAGAACTTTTCCTGTTCAAGTACC
TTTACTACAATCATGTCAGAGATTTCCACGTGGTTATTGTCGTAATGCTA
TGTGATGGCGATGCCTGATGTGGATATATGCGTATTCAGCTCTTAGTTTT
TAGTGCTGTTGATAATTTCCATCCGCTTATGTCTGGGCTCATAGCTTTGC
TGTTAGTCGGAATTGACCTTTCTTCCGTTCCGTTTTTGAAGTACTCCCTC
CGTCCAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.