Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA028619

[Submit comment/correction]

Sequence	AA028619
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA028619
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCAGCCTGTACCAGGTTGTATCCACTCTCCCCGCGCCGCCTCCGCCACG CAGCCACCATGGCCGCCACCGCAACGGCCGACGACCGGCCGGACCCTTGC CCCGCCGCCGCGGCAGACTCCTCTCAGACGCCTCCCACCCCGGACGAGCT GGTGGCCCGCGCCGTCGCCCCCGTCAAGGCCGCCTTCCTCCGCCCGCCTC CCGTCCGCGACACCCCTACCAACGAGGAGAGCAGGGCCAGTGGCGCCGTT CCCCTGGAGAAGAAGTCCAAGCGCCAGTTCAGGCGCGAGCGCAAGCAGGT AACCCGTAGTAGCGAACACGAGCTGCTTGTTGTAATGTCCCGGTGCTCGT GTGTGCAAGATGCTTGTGGTATTGCCTGCATGTAGTTTCTCTCGACTTGG ATGTCGTTCCAGCCATGCTGTATCTGTTTCCTGAAAATTTGATTTGTTGG CAGGGTGTGCAAAGTAAAAACTAGGCGAAACATCATGATGACGCTGGGTT AAAGAATTTTTAGGTTACATAGTTTCTAGCAATTTGTAGTCTTGAACCTA TTTTTAGATAACTACTTATGCAGAAATGGCTAGTACATACAGAAGTCATG AGCAACAACCACATACTGGATATAAATGTGAGGACTATTTTCTTTTCACT GTCCTGGATGGATGCATGTTCTGCTTGGTTACCTTTTGTGAAAGAAGCAA TTTCGTGGGCATCGGACTTCTATCTAATGGAAGTGCCACTGCCAACTTGT AGCTAGATGTAAAATACTCGAGTAACTGTTACATGTCTGATTGCTATGGT GGCACGAAGTCTTGCTACATTTGAGTATTCAATGGCTATTTTACTAAGCT GGAATTTGCACTCCATTACTGCATTTTTGGTTTCTAAGTCAGCAATTCTA TGTGCTAAGTTGGAAGCGACTTTAGACTCATTATGTTTCATCTAATGCTT GCTTGTAGTAAGTAGTAATGATATAAAATGGCCTATTTGGGGCTACTTTA CTAGTAAGATCCATAAGTCTAGTTATGCACCAGTTTTTTTTTTTGCAGAA CCGTCTTTAAACTACCCCTGTTGCATACCTGCATTTCCTGTCACTATTTG TCCCTGCTATGCGCCTGTGCTCTGGTCATAAATATGTGCATGCTTTCGTA ATGTGCACAATATGCCCATGAACATGGCAGGCCTTCTGTGCATGTAGGCA ACATATACTGCAAAATTATTGGTTGTTGACTTTCTTTGGGTGCTTATGTT ATGTACCACTATGCAGGAACAGGAGTCTGTGTCACGTCTTTGTGTAGCAG TAGGTAAAACTGGAAATGCGGACGCTTGCAAATATGGCGCTTCCTGCCGT TTCAGCCATGACGTAGATGCTTATTTGGCTCAGGTATTGTTTTTATACGG ACATTCTTGGCCTTGTTGATTTGGTGCTCGTCATGAACCTATAACTCATG GCTAATCTCTTTGTTACTTTCCTTGTGCAGAAACCAGCTGATCTTGAAGG AATGTGCCCATTTACAGTTTTGGAGCAGCCCTGCCAGTATGGGCTAACTT GTCGATTTTTTGGTACACACAAGGACAACCATGCACCTTCTGAAAGCCAT GAGATAAATCCTTTGAGTAAAGATATTCAAAAGCTTTTATGGAAGACCAA ATATAAATTTCCTAGGGCCAGTGCCCAGATCAAACTTCTTGGTCTTAAGG TACATAAGTATTTTTTTCTGGATTATAATGTGTATCTGGTCTATCTTACA CTTCTATTGGAGCTCATTACATTTACTATGGGTTTAAATGTGTATATTGA ATACATTTACTATGGATTATCACCTATCACTTGCATAAGTAATAATGACT ATTACATATAGGAGTAGTAAATCTATGTTACTGTATAGAAGTTGTGCTGC CTAATAACTTTCTGCATCTCTAATCTTATTTCTCTCTAATTAGGTAGAAT ATGACGTCTGAATTGGGATTGCATCAATACTTACTTTTCGCTGGTAAATT ATCAATGATCAGTCAGTTACTCCGAAAAGTTTCTTGTAGGTAGTAGGGGC ATGCACATATCTATCAAATGAACAGTATAAACAGGCTGGAAATGACTAAT ACCCTAGCTTCCTTGTAGTTAATGTGCAAAATATGTTGTGCTTGCCTGCT TATGCCTGTGTGATAGCTCTGATTCCAACTGGTATTGCCCTACTTTCCTT ATTAGTTAATGTGCAAATGGTATGTAGATGAGTCTGCTAGTATTTAGTTG CTAGTTTTTTTATCTACGAAAAGTCTACTTTACTGGCTTTGTATAGGATA GTTACTGTGGTGAGTGGTGGCACGTAAATTAAAAAGTGCTATTCATGTAG CAAACAAGTATGATTGTGTCAGGAAGCCAAAAGATATGTTCAAACAGTGG CCCTCTTTCAATAAATAAAATAAAATAAAGAGAGAGATATGCTATTAATG TGGTAGTTACGTGCCTTATACAGATCCAGGAAATGTACATCAACAGATGC CCAGTGAAATCTGTTAGGTATAGTAACACCTTTCTGTTAGATGATAAGTT ATTGTTATGAAGATCCTATGATGCATGTGGTGTCCACTGTTTCGTGTGTA TTAGAGTCTTAGAGATATATTTTCTGATTTCTGTCACATGATGATATGTT CATCTTTTCTCTCCGGATGGGTATGTTTCATATTGCAGGAAGTCATCAAG ATTAAAGCAAATGCTGCAGCAGATGATCAGAGAGCTGAACATGATAATCC AGATGTATCATGTGAAATGAATGGTGACGATAAAACTGAATCTCTTTGCT GTCCTCCTATGACCGTGGAACATGATTCCAGTTTGTGTGAAGAAATGGAT AAATTGGCGGGAGAACCTTTGGTTGATAACTCTGTTCCGTGTCCTGAACC AAGGGCATCAAAGAAGTCAAAGGTTGAAGGTGATGAAATTCACAAAAATG AAGCTGGTAATCTTGTTTCTGAACTTAAGAGTCAATGTTTTAAGTTCTCT TATTGCTTATAGCGTGGTTTCAACTTTCATTGGCTTACCTTTTTATTAAC ATTATGGTTCAGATACTCATGACACAAAGGCGTACCCTGAAGATTCTAAT CTAGTTAATAGATTGGAAGTGCCCTCAAATAGCACAAGCTCTTGCAGAGT TGACCTAGTCGCAACACCTCATTTACGTGAAAAGAAGATCATAGATTTTC GGGAGAAATTGTACCTTGCTCCCTTGACCACTGTTGGGAACCTTCCTTTT CGGAGGTTATGCAAAACATTAGGAGCTGATATTACTTGTGGAGAAATGGC TATGTGCACAAATCTTATGCAGGTTAGAAACTTACCTCCTCTCGTTTGTT CCATCATATGTGACACATGCCCCTTCTGCGATTGGAGTTGTTTCTTAAAT CCGTTTCAAAGTTTGCTAGAGGCAAAGGTACCGAATTATCATCTGTTGGA TATTCTTCATGAGCTCATATTTCATGCAGGGGCAAGCGTCAGAGTGGGCT TTGCTGCGACGACATTCATCAGAAGATATATTTGGGGTGCAAATCTGTGG AGCTTTTCCAGATACAGTAGCACGGACAGTTGAACTTGTGGATAATGAGT GTTCGTTTGACTTCATTGACATAAATATGGGCTGCCCAATTGATGTAGTT GTCAATAAGGGTGCTGGGTCCTCATTGCTCAACAAACCTATGAGGATTAA GAGTATTGTTCAAGCATCATCTGCTGTTACTGAAAGACCTTTAACTGTTA AGGTAATTCCATGGCACAATTTTCTTGGGATTCTTAGAAGCTAGCTAATG TGTGAGTGACTAGGTGTTTCGTTACTACATCTGTTGCAGATGTAGCATGC TCAATGATCTTCACATGTAGAATCGATAGACTAGAAATTGCTATGAAAAC CAGTTTATTTCAGTTAAGTCCTTCATTATGGTGCTACAGTACATAGCATA TATATTATATGGAATCGCTGAACTGTTTTGCTCACCTTTCTTTGCTGCTT GATTTCAGGTAAGAACAGCTTTCTTTGAAGGAAGGAACCGTGCTGATTCT TTAGTTTCAGACATTTATGACTGGGGTGCTTCAGCCATAACAATACATGG TCGATCACGGCAACAACGGTACAGCAAACTTGCCGATTGGGACTATATTA ACCAGTGTGCACAGAAGGCCCCTGACGACTTGCATGTAATTGGAAATGGT GATATATTCTCCTTCACAGACTGGAAAAGGCATGTTTCAGGCTCCTCCAA AATCTCCACATGCATGATTGCTCGTGGTGCACTTATCAAGGTTAGTATAT TCAACAGTTTGTAAGATTTACGTCTATATGTATTATGAAAGCAACAACAA AATGGTTCTGTCACCTGTGTACTAAGTGTAGTTGTGAACCACATGTTGGC TTGGAGTCGTGTTTAGTTCTGGATTAGTGAATTATGCCCCAAAGTTTAGT CTTGGAAAGTTCCATATTCTTCTCCAACTGTCAATGATGGTCTGACATAA AAATAAGTGCTATTCTGTGTTGCAATCTATCGTGTATTTGTGAGTGCTTT ATGCTCTGCATATGCCGTTCTGAATCTTGTGTCAATGTTTTTTTAAATAC TTCTGACAATTCTAGGATGAAATAGCTATTAAATATGTCTTCTGTAGTGG CTCAACCAGAACATATTAACTGTGTTTTCACATCTGGTTCCTCTTCTTTC ATGAATGTTTCCAACTGGTCCCTCTCCTTACGGTCTAAAAGTTCAGATGC CAATGTTTTAGAAGTCTGTAGATTCGATCCCTGTTTCTGGCAGCGAAATG GCTGATGGCTGTGCATCCGTATTGTTTACATAGCTAGTGAAAGGTGTTTG CGCAGCTTTATACACAGTTCCAATCCATTCTTCACATTGAGTTGATACCC TATGTACAAGATAATTTGTAGCATGTAATCCTGGTAATTCACGAGGATGC ATGCAAAATAATTTATTACTTCAATGCTAGTAGGTCCAAATATTTTTGTA TATTTATTGTTTGTGGGATGCTTTTACTAGCTTAATAACCTCTATGCATC TATTAAGCTAGTAAAATTGATGAATCCAATTGCGCCTGATCAGTATTGAA ATAATACATGCATTTGTTTGTGAAAAGTCATGTGGCGTCATATGGTCGTC AGTAAATATTGGTGCCAAGTGGACTCTTCCAATTTTGTCTTGTTCCCATT TGAGGCATAGTAGTACTCAGTTTGCATGGGTAGGATTCATGGGGACTCTT TGGCACGGGTAGGATTCAGAACCATTAGCTTACACAGCTGTGAATGGGAG CACTAAAGATCAGGAAGCAATGGATTCCTGCTCCTGCTAATAATATCATA AGTACATCACAATCTAGCTAATGCACGCATACATTTTATGTTGTTGTCCA TTGCTGTTTTTTTAATGCTCAAATAATGACATGTTCCCTCAAGAATGCCC ATGTCTATATGGGCATGCCCTTATTAGAGATGCAAGTAGGATTCCACCAA AGTACCACTTCTAGTTCATTTTGTGATTTCTAGTGTAAATTTTGGTCCAA ATTTTGTACTACTAGAAATCACAAAATGAAGTATTAAGTGGGACATTGGC GGGATCCCACTTGACACCTTAGCCCTTATGAGCAATTGTATTAATTGATC TGGTGCTAACGCATGGCGTTTGATTCTTGACAGCCATGGATATTTACCGA GATAAAAGAAGAAAAGGACTGGGATATTACATCTGGTGAGAGATTCAATA TCCTCAAAGACTACGTGCGTTTCGGTCTGGAACACTGGGGCTCTGATACC AAAGGTGGGTGTTCCTCATCTCCATAAAGCGGAATGTAAACAGTATCGTC CCACCATGTAGTTCTTTTCCTGATCGCACTGAAACTTCCATCCTGAAGAA GTCAAGTTTTCTAGCGAAGAACCTAGATGGAAAAAATGTCTTGCAAATAA AGATTATTCATGATTCTCAACCGAACTGTCTGAATTTCCTTGGGTTTTCA GGTGTGGAGACGACCCGCCATTTCCTTCTCGAATGGCTGAGCTACATGTG CCGGTACATCCCGGTTGGGCTGCTAGACGTGGTCCCGCAACGGCTGAACT GGAGGCCCCCAAGCTACTGCGGCCGCGACGACCTCGAGACCCTGATGGCC TCAGAGTCAGCAGCTGACTGGGTAAGTTGTCATGTTTCTCCCGTGCCCTA GGTGCGAACCACTTACCATGATTGAGAAAGCCGACGTGTCTTATCTTGTC TGCGTGCGTGCGTAGGTGAGGATCTCGGAGATGCTGCTTGGCAAGGTCCC GGAAGGGTTCACATTCGCGCCCAAGCACAAGTCCAACGCCTACGACCGCG CAGAAAATGGCTAATGAAATGAAATTTCATGTCAGGCGGCCCCCTACATG TTTGGCATGATTAACACCAGAAACTCAGCAGACATGACATCTCATTTCTT CTCAGTTAGCGTCTTTAGCTACGAATGATGATTGCATGTTGTTAGAAGAA TGCATAATGCTGCTACTAGCAAGCCCTCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.