Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA026566

[Submit comment/correction]

Sequence	AA026566
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA026566
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAGCCGCCGCCGGTGGCATCCACCTGTCGCCGGCTCGCCGTCGCGGA CCTCCTCCTCCTCCGCCGCCCCACAGCTGGTGCGTACTCCCTCCCGACTT CCTCCCCCTCTCCTTCCCCCGCCACCTCCACCTCACAGCCCCGCAAGAAG CCCAAGCTTTCCGCTCCGAATCCTGCCCCTACCACGGCCCCCTTCGCCCC AATCCCCCACCCCGTCCTCCTCGCCGGCACCCTCTCCCTCCCTTCCGCCT CCTGCTCCGATGCCTGCCGCAACCACTGCCTATCCCTCTCCGACCCATCC TCCGCCACCTCCGTCTGCTGCTACCTCCTCGACTTCGACCCCGCTGCCAT CGGTCGTGAGATCCTCGTCCTCTCCTGGAACTACCTCCCATCCATCCGCC AAAACGAAGAGGCCGTGCTGGAGGTGGTCCGATGGCGCCTGGGTGAGTTG CCCGGTCCTGTCCCCGGCCCTACCTTCCTGACGCCGATTCCGCTCACTTG CGTGGATACGGAGCCTGATTTGACCACCCGCGGCCGCGTTTTCGGGGTGC TGAGGTCGGTGAGCGTGGTGTTCAGTGTGCCGCATGCTGCGCAGAAGAGT AAGGCGGATGGGGGTGGGGACTTGGTCGGATTTATAGCAGAGATGATGTG CTGTGGGTGCCGCCAGTGCAAGGCATCACAGCCGGAGTCTGAGCATGATC ACAAGTTCGAGGTGGAGAAGTTTGTGTACTTTGTGGATTCGGCAAGCAGG TGGCGGCCTGTGCTGGCGAGGCTGATTGCGAGACCGGTGTCTGTCACAGG TTTGAGGAAGAAAATGGTTTCTGTTGGGAAAAAGGGCTCATACATCATGT TGGTGTCATCTGCGAAAACCAGGGTGGCATGGTGCCCATCCTATGTGGGT GTTCCACCATCATATGAGTTGCCAGGAAAGTGCGGCGGAGTATACAGTGG GATTGTCTCTGGAATTTACATGCAGGGCATGTTGGTTGAGCTGGATGAGA TCGCGTTGATGCTAATTGATGATATGCAGCTTGTGCCGCCACATTCTCTT CGAGTTGGTGCTGTTGTATGTAGCTAATTTGCAGCTTTGAACATTTATTT TGCAAATTGTTCATTCCGTTTAAGATGCCAGTGTAACTCTTCTTGTTCTT TTGTAGATTTCTGTGAAGAAAGTCCGATTGGTTCGCCTAAACTTTGCTTG GACGACGGTTGTTCTACTTGGAACATGCAGTAAAACTAGCATTACTGTCA ATTCTTTCTCTCTGGTGGATTCAAAGTAAGATGCAACTTTTGGCACACTG GGTATGTTGTGTTACTGGCATCACTCAACAATTTTTTTTTTCTTTTGGTG CAGATGTCATATACGGGCAGAGAACAGCAGTCTGCTTGGGAAGTCTGTCA ACTCTTTGGATCTGTCCTCTAGGTTTTGGTACGAATTTATGATAGTTGTA TTTCTCTCAGATACTTTAACCATGATTGACAATAGACATATTTTTTCTCA CCTCATTGTATGGTCCTTTTTGTTCCATCATTTTTCAGGACATTACTTTT GACATCATGCTTTAAGCAGAAGTTCAAGTTAGGTTTCAAGAAAGAGATTT GGGGCTCAAAAAACGTAACTTCACTAATTTTTATTGTTGTTCATAGACTG GAGTAAATAATATATTAATCCATTGCATTTGCTGCTAATTTATTCAACTG AAACTCTTGAACTGCAAGATATCAACAGAAGCTAGGTCTGGTTCATGCTT ATGCGGCTAAAGTTCTCTCATCAAAGGGCTTCGAACCTCAGGCATGTTCA TTAGTAGTACATTTGTTTCAATGAACGGGTATCATATCATAAAATGCATT ATGTTGTGTCTCTACATACTTGATAGTCTGATTGTACTGTTGCTTTGTTT TGCATGTGCTTACTGATGTTGGTTTCACAGTGTAAAGCAAATTAGCTCAT CTTTCTTAGTTCTTACTTCCTTCAAAAATTGACACACCATATATTTGCTC TTACTTCCTTAGAAGGCTTATACTCCCTCCGTTTGGAAATATATTGAACC TATACACTAAAAGGTGTCTAGATACATCTCCTTCACAAACCTAAAACATC TTATATTTCTAAACGGAGGGAGTACAATATATTGCCTGGAAAGTTTACAC AAATTAGACAAAATTTTGAATATTTCTTTCGTAGGTAAATTCTGGATTAT GGCCTACTTATAGGATGTGGACTGATTAGTCTTTCTAGAAGTAGCAAGGC TCTTAGGCATTATTGTGTTTCTTTTGGTATTATTTTTCTGGATATGGTTT GGTACTTCACATGGTAATAGAACTGAATGGTGCTCATTGTATCAACCCTT TGTCATGCTTTTAAACCCATTTTCTGTGTGGTTTACTTACCTGGACCTGA TTGCGCAGCATGATGTCCTTATGAAATTTTGCAATCATGTTTGTGACAAT TCAAGCACAGGATCAAACTTGGAAGCTTGTAAATTGGTAATGGTTTCTCC TTTAATTGCTTGCAGTATACCTGCTAAATCGTTTTGACTTTTTTTATCCA TCTAACCATTTAATCTTTGTTAGGTAATACCCTTTGCTAATTTCATATCG AAGTGTGAATCATTGTGGATATCGATAATGCTAAAATGTTGGAATGGCAT GGAAGAAGTGGGCAAGAACCAGGGTCTTAACAAGTTTCTATGTGATGGGC TTTCCTATCCTGGTACCACAAAAAGGATAATTTCAACTGGCGATCTGGGC TTTGTATTAGTGGGAAGCATGAAGGTGATTTCTAAAATTTGATCGTACCT GCTTCAGAAGTAATGATATTGGTTTTCAGTCATTCTGTCTCTGTAAGATA CAGGAAGTTTGATTCATGGAATGTGTCCTATTTTCTTTTAATGATTATTC AACTCACAGCTTTCTTTCACCACATTCATGCCACCAACCAGACGTGGAAA CCCACTTAATCGATTTACTTACTTAGATAGGTGACTTGATTTTCTTGCAT CTTTCGTGGCATCCTGAATCTTGCTATAAACAGTCCATCTATTATAGTTG GCAGATGCTTTTACTTTTGCAGGCTTATTGTTGAATACAATTTGCATGCA GACAGGCTTATGAACAGATCATGTCAATTGATTTGAGGATGCCATGTTGC CGAATTATTTATTTATTTTAAGACTTTTGAAGTTTTTAAGTATGGAAGGT GCTAAGTATCTTCCATTTCAACTTTCCATGAGAATTCCTGTAGTATCTTA TCTGTACAAACCGCCAAGTTAGTTGCATGGATGCCTCGTTTTCATGACAC TCTGTGACCACGTCTTTGATGCATACAGATGTCTTCAGTGCCACGGAGGC TGCAGTTGGTTGATGACACAGGATGTATAGATATTATTATACCTGATCTT CCGCCAAATCTTTGCTTGGATGGCATGTATGAGGTGATAGCTATAATTTA CTTTAAAAAAGTGATGCATTCCGTGTATTAAATTCAGTTATCAGTTGACT ACATGGCACTCGCTTGAACGTCAGAACTAAGACCGTACCATTCATCACTT AAGTAATATGGCATATGTTAAAGTATGAATAGAACTCTATTCTGTACAAT TGCCTTGATCTTGATTAGGTAGGTTGATGATTCGTGAATTCTAACTGATT ACCAGCAAAGCAGCATACTGATACTAACTGTCATGTACGCATAGGGTTTA CTAAAGCAACTATGCAGTACAATGAAGTGATACACCTTCAGCGGTAAGAG TTTCTTGGGTGTTGGTTTAATTTTGTATATGCAGTCCTTGCCATAAACTA GAGACAGGTAGCATCTAACAGTTCGATAGAAAATTTGGTTCCCAAGATTA TATAATTAGAAAACTCAAGAGCCTTACATAGTACAGCTGAATAACTCACT CTTAACATCTACAGTTTCTGTACTTGTGTCTGCTGTACTGACTTTTTTCA TATTTATGTACACTGAACTGAAAAAGTGTAGTAGAACTGACGCTATTGAT CTTCCTCCATTACCACTCCTTTTGCATTTATGAGGCTTTAATATGGTCTG CTTTCTGCAATTAATCTTCATAACTGTTTCAGACATTCACTCAATTTAGC ATCCTGATTTTCCTATTGCCACCCAGATAAATGATTGCAAACTAGCCCTT GAAGGGCCAGTGGCTTACCTAGATCATTATGGTGTTGCTGATCCACTATC CTGTAAGGCTGTGTTTCAGCAGCTCTCATGCCGAAAAAGATTGCATCATC TCAAGTTCTATGTTATAGTTAACTGGAGTGAACTGAATCGCATTGGCCCT TCCTCACAAATTCCTTTGCAAACTAATAATTGTGCCAGGCTGTTTCACCT GTTGAAACTGTCGCACATTTTTCCAGCAATCAATAATGTGAGTACTTCTT TAGCTACCCATTGACAATCTTGAGGTTTAGCATCATCATGCTCATAAGTA GTGACTGACTGTGTTCCCTTTTCACCATTTTGCTCTTGCAGCATCAGAAC ACTTCAGAGCTTACCATGTTCGCTGAGGCTGTGATAGTACCATACAATTT ACAGTTTACTGGACAAGATGATTGCATTGAGCATGCTGAGAGCTTTAGAA TGTCAAGGACTCATTCACTTTGTGATTCCAAAGTGCCTATGGAGAAACCA TGTTACATTCCATGTTCCCTAAGCTTCAGAACCACCAGTCTTTCTGGCAC TCTAGTGTCCAGCTATTCCTGTGGGTCTGATGGTACTATTCTAATTGATT CTAGTGGTGAAGAACAAGGTAACGAATCAAGGATTTTGTTGGAGTTCAAG GAGGGGTGTTTACTTAAGTATCAGGTATGATTTTTATATGAAGCTGACTT TAAACATTTAGCCTTAGTTTATAGCTAGAATTACTGATTTATCTGATCAA ACTGCAGTTACTGCGGATTGGTGGCTACTGTATTCTTGAATGTCCTAGTG ACAGTTTGAGTTTTGCCGTGAAAGGCTGTGGATGTTTTCAATGTGGCAAA ATTTCATTAGATTCTCAGGATAAACTTTGGAGCCTTGCCATTACCTTTAA TGGTAATATAAACAGCAAACAGGGTATTGTAGATCAGTTTATTGGGGAGG TGGATGAGCTATTTTCGAGAAATTCCTCCCATAATGAGATAAGATTAGTA CAATCTTGGAATGACTTCCGTCAGTATTCGGATTTTCAATTGAATTTTTA TTGTGAAGCAGTGAGTGAAAAGATGGAAGAATATGATGCCTTCTGTTATG TATTAAATGGATTGTGCTCTTACTCAGTTGAAGTTATTACTGTCTCTTCA TGCACTGAGATTATGATGCGCAAAAAGTCTTTTGGTTCTCCTGACTTGCA AACTAAAAAACTTGTCCAAGGAGATTTAATATCATTACACGGGAAAGTAG AAAATATCCATTCACATGACTGTAAGGATCGACGACTTCTACCTGGTAAT GAGAAGCTCAACATATGTATCCATGTCGCTGATGATAATCAAACGGTAAA TCACTAGGTTATCATTTTCAGTTAATGCTCAGCTTGTCATTCTATTTAAT GGAATTCATTGTAGGTGCGACTCCGTGGATACTTAAGCAAACATTGTTAT CCTGTTGGCATAGGGCGAGGGGCAGCAGTGACATTCCACCGCGTCCTCTT GACACAGTGTTGTGCTCCTTCTTTTCCTGGCTTTCCATGGAATCTTATAT TTATTAACATTTTAAGTTGGCTGTAAGAAAATAATGTCTATGCAGCACTG TGCCTTGCCTGTATATATATGGCTTGGGAACTTAGATACGACCAAAAAAG GGCCTCTCCTTTGCTTGTTTTGTATTAGGTGTTAGGTTGAAAAAATCCTT AATAGTGGAGTTGCACTCTGTTATCAGTAGAAAAACATGCATTTTTTATT CATACTCTGGTAGTCAGTATCTATACTTTGCAATTTTGCATTATTTACAA GGCATGTAATCTCTGTAGAATAGGAAATGCTGTATTCAGGATCTTTAGTA TGCAGCTAATGTGAATTTCAGTGTAGAAGACCTATTTGTTGTCAACTACT TCCTCTGTTCCTAAATATAAGACGTTTTTGGAGTTCAAATTGAACTCAAG AACGGAGGGAGTACTAAAATAAATTGATGCATTATTCCTCCAAAAATGTA ATAGTATCGTGTCAAATCTTCTTGCTGAAGACGATGAATAATTATAATTG ATAATTCATGTTACCATTACTGATAATAGAGATGATGGTTTTTTTCGTGT AATGTTTAACTGAAACTGAAACTGAATCTTATGAAGCGCTGCAACATATT TTGTGTTCTGCAAATTTAAAGTGACATACTCTGAGCTGTCTAAAATTTTA TTTTCTTGCTACAGACATGAACTATTGTTAACCCCAGTAACATATATTGA AGTTATATCCATCAGTCACGCGGAACTGAATAGAGAACGCGCTACTTCCT CACTCATGCCTGTTGGCTTAAAAGACAGTTCACCGAGCACAGTTTTGCAG CATCTGTCCTTGCATCGGAAGGATTTTAAAGGGCAGTGCAGGGTAGGTTG AATTCTGCTTCTATATTTGGCCGATGTATAGGCCTCAGCTGTACCATTTT TTGGACATATTAACATCTGACAATGTTTATAGTTCAATTATAGTCGGTGA TTTTAGGCTAAAACGTTCTCTTATTTGATGTCCATTTTCTTAATACAGGT AGTTACCATCCATTTGTTGGTGTTGGAGAGTTGTTTAAATGACTTACAAA CATCAGAAGCAATTAACAAGGGGAAGATGCTAAAAGTAAAAGTTCCACTA GCTGGGTTTATTGTTGGTAAGAGATGCAGGCGAACTCTAGTATTCTTGCA ACGTTATATCCTAGATCAAATTTGTTAACTTATCCAAAGGGGTGTTTTGC TTTTCTGTTTTACTTGGAGCATCATGTATAAAAAATGTTACTTCTGCTTT TTGAACAGATAATGGAACATCTTTGTGCTGTTGCTGGGCTGATGATGCAA GGGCTGAACTTTTGCTCAGGCTGCAGGAAATTGCCGTCCTAGATGCTCCT GTTAGTTTGAAGTTTTCAAAAGCTAGAAACAAGGCAAACATACAGCAGAC TGTCAGTTCTTGCCTACAAAAATTACTGAAGAAGCACAAAAATGTCATTG TAAGAAACTATGGAATCCCTCCCGACATCGCTTGCCGAGACTTGGAACTA TCATCTGGTATTGGCAATGTCTTAAGTAGCCTGGAAGAGAAACTGTTGAA ATTCATCGTCGTCAATGCTTGTCGAAAGGGAACTCTGGTGAGTTCATGTT TTTTCTATCTGTTGAGCATTACAATTTGGCGAGTTTTTAGTTACTTCTAT ATGATGTTTTCAGTCAGTATATACAGAGAACACGAGGACACTGTCCTATA GCATTGTTTTGGCCCTTGTAGAAGGGAAGTGTTGCTTGTGTAGCCATTAT ATGGATCCACTACTTCAGTCATGCCAGATGGTCTCTTTCCCTAACAACTT AGAAAGCTGCCGCATTGGTTACTCATGTGTTGAATGTTTGGCTGTAGTAT TAAATTACTCTACCAGAATTGCTGGAAGGAATGTTGTTTTAACGAGTTTC TATGCTTTGCAGAATGTTAACGCATCAGTTCTTGATCCGAACGCAATAAA TGCATCAAATGTAGAGCTTCCTGATGTGCATCCAGTGCCGAACATGCAGA ATTTTTGGGTTAATGAATCATTTCAAGTGGATCCTTTGGAAGAGGCCAGG AGATTGTTTAACACTTTGGAGAACAACTGATGTTATTGGACTATCAGGTA CTCAGATTCCTGATCAAGAAATTGAAGGAAAATTCCTGATAAATTTGTGA AGAACGCAGGAGGGGCGAGCAGTTCACTGCGTCAGTTACTCAGTACCCAG TCTGATCCCCTATACTATGCCCATCAGTGGGGCGGCTTCCAGTTTGGTGA ACACATTCTGAGTTGCAAGTATGCAGCGAGAACCATGTGGTCCTGCAGGG AATAGGTATGATTCTTTTGGGTAGGAGGGTGGCATTTGGCTACATTAACA ATTGGATGGGTGATGTAAAGCTGTTATGGGATTGGAACTTGGAAGATGTC ATGGTGATAGAGCTCACGGAGAAAGTTTTTTTTTTGCTGATAGTCAAGTG TTTTGTATAGTCATTGTATCGGTAGCCGAATTATGATGGCAAGAGAAGAT TTGTATAGTTACTGCTTATTCTCTTTTTAAGCAGTCGATGATGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.