Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023437

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023437
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023437
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCTTCTCCACCACGCTCCTTGGGAGTCGGGTCCCTCTCACAAACCCCCC TTTCCACATCGTCTCCTCCGCCGCCCTTCTCACACCCACCGACTCACCCA CCCTCCCAAGAAACCACACTAGCACTAAAGCGGCGGCGATCACCTAGCTC CCACTCCGATGGGGCGCCGCCGGCCCAAGAAGCGCCCTCCGACAACCCCC TCCGAGCCGGAAGACGAGGCGAGGGCGGAGGAGGAAGAGGCACCTATGTT TCCCGTCGGCGCAGAGGTGGAGGTGCGCAGCGACGACCCCGGCTTCGAAG GCTCCTTCTACGAGGCCACTGTTACCGGTCACCTCTCCACTCGCGGCGGC GGTCACCGATACACGCTGGCCTACTCGACGCTCGTGGCCGAGGACGGGGG CCCGCTCAAGGAGACCGCGGCTGCCGCCGACGTGCGGTCGCGGCCGCCGC CCGAGGAAAACGCGCGGAGGGAGTTCGCGATCTGCGAGATGGTTGAGGCG TTCCACAACGACGGGTGGTGGGCCGGCGTGGTCTCCGCCGTTCCGCTGGC GGTGGCCGGGGATCGCCCGCGGGGGGCGTATGAGGTGACGTTCCCGACGT CGCGGGAGAAGATGGAGTTCGAGGAGACGGCTCTGCGGCCGCACCGCGTG TTCGAGGACGGACGGTGGGTCCCAGCTGCAGGGGTGGTGAGTCCGCTTGT TCCATCGTTTCTCCAAACTCCGGATTTTGCAAACTTGCAACCAGTTGTTT TGTTACTACATGAAGTGAGCGTATAGTGCACAAATGGATTGCTGCGTGCT CTTTATTCAAGTTTAAAACATGAATATTCGTTTTTTCCTAATCATCTGAA CTTTATTGGATGGATTATACCTATTTTTTCGAAGTTACAAAAATAAATAT GTGTGGAGTAAATAAAGGAACTGGCAATTGCATGGTGGACTGCAACAGAC CTACAAATTCTCGTGCGTGAAAAACAACAGACTAAAATTCCTCACCAAAA ACACAGACTTAACAATGGAGATTCTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGA TGTTTTATGTTTGTGAAGTTCGTGTATCTAGATACCTTTTAGTGCGTAGA TTCAGAGTGAATCTCTCCGAAACTACATACTAAAAGAGGTCTAGATACTT TATCTTCACAAAGCTAAAATATTTTATATTATGAAACAGAGGGAGTATTT ATTTATTCATCTTCATTATGCATTATGATATATTGGACAGGATCATGATC CCGGTCCTTGTGAAAAGACATGGCAATTAGAGAAGCTAACATGACATACA ACCGTGCCTCATGACACATCATCCTGATATTGGTCAGCATGCAGTCTCAC TACATCTATATCGATCGCCATTATGTTAGGAACTTAGGTCCACTTAAGAT GTCCTAGTTTTACACTTTTCAGGTTTTGTCAAACGCTGATGTAAGTTTAA TAAGTTTTAGGGCCAAGAGCATCCATTGCATCAATATTGATATTGGGGAC ACGGTGAAATTTATCATGTTGAGGGGTTTCAAAATTAATCACATTCGCAT TGAGATTATATTTTAATGTTAAACAGTTCATGTTGTGTTTGTGCAATTAT ATTTGTCATTTGAGTTTTTGGTGTATTTATCATCTGAATTAGTTTTACTA TTTTTTGCTCGTATATTATCTATGCTATGTGTCCTTAGTTAGACCGGCCA TTCGCCCGTTAAGTGAGAACAAATGTTGGAATATTAGCATTGCTCCTAAC TATTTTCATGAAAATTAATGATAAAAAATTGACGGTTGCACTTGTGATTT CTTAATGGGAGTTATGGGTATGGGATTTTATAGTTCTCGATGATATTTTT CAAGTTTAATGAATCAATCATACTCTTGTATTTTAGTATTTTTTTTAGGC TCGAACTGTATATTGTCATAAATTTTCAAATGTAAAGTTATGTACAAGAG TTCGGAGGTAGAGGTTAGATTCTAAAAGAAAAATACAAGGTCATGGACCC CCTAAATCTAAGCTGACAGAAGGAATTCACCGAAGCTTCTATACCAGAAA GCCCATCAAAGATGGGAGCATATGCATTGATTTGGTTCAACATATAATTT AGAGTAAATTCCGGACTTTACCCCCTAGTTTGATAATTTTGACACTAATT ACCCCATTTAACAATTTTTTGTTCGTATTACCCCATTTAGTGGGAATTTT GCCAATTTTTACCCTCCCTAAAATTTTACACGTGATTTATCATGTGTGTT TTGTTAGGTAATTTCCTCCAATTTTTTCTTGTACTCAAAGAAACCTTAAA TCCAAAAACATTCTGTCCATAACCACTATCTTGTGAAAATAATCATGACA CCCATTATGACGCGACGCATGTCAGCGTCGCGTCATCTCGGTTGAGTTTT ATTTCAACACTGATAGTATTTGTACATTTCCGTGTAGGTATATAATCACA TATACTAGTCACATGATCTTGATACCCCGCAAGAAATATGCACGCACGTT TGTGTAAGCGATAACTTTTTCTAGCTACTTGTAGTAGATTTTAATTGAGC CAGCAAGTTCGTACTTGTTGTTGCAGTTGGCCAAACACATCGTTTCAACA TTTAAAAATAAATTCATTTGGTCTCGGGTCATTGCCTCCGACTGTGAAAT CGCAAGCGATCATCTTGACAAGTCCCCTATCACCGACTGCTCCATCAAAA TAATATGTACCTACACCAACGACTGTGTGTAAAAATCGATCTAATCAGCC ATCGGACGATCTGGGCGTGGAAAAAATCTAATAGTAGAAAACAAATGACA TCACATGGCATGTGTACGGTGTACCTGACATAGGGATTCACCTAGTGAAG GGCTCTCGGATTTTTAAAATGGGGTTAAAACTGACAAAAAATTCTCTAAA TTGGGTAACATGGATAAAAAATTGTTTAGTGGGGTAATTGGTGTCAAAAA TATGAAACTATGGGGTAAAATCTGGAATTTACTCTATAATTTATACAGCA AGAGTCATTTACTATTTGATTATTTGCATTCCTAGATAAAATTAAATAGT TTCCTGAGGTATATTAACTTCTCTAACTTCAAAGTGAAAGGAAGTTGTGT GTATGACCTAAACGAACAAGGGCTGAGGGGATCCATAGATTAATATTTCT ACCTAATCCTTGTGTCAAGAAGTACGTAAGTTTCCAAGAATGAGGATCAC CCTTATGTTTCAATTTGATAATGGATCTTAGAAACGAATTCCATGTGCAT TGTGAAATAGCAACATTTTCATCATGTGTTTTATTTTTATGGAATAAACA TTTTCAAAATATTGATCCATTTTATGAAAGTGTATGCATATTACTTTCGA GACAGTTAGAATTGCACATGCTTATGTTTTATCAAGAGAGTTAGGTACTT TTCATCAGTTGAGTTAGGGTAAACATTGGTAGGATAAATCTCTAGAATAC ATTCTGCTGGCATACTTGAAGAGTCCCATGATTTAAAATAGGCATTTGAA ATGCGCATGTACGGAGAATTTATTTACTAACTGAAAAGAAGACGTTGCAA GTGGAAGTGATTTGGGTATGTTTGGATGATGGCCAAAACCAAAATATTGT CCATGTTTTGACTTTGGATGGTTGCCAATTTTTTGTCGTGCAAATGCCTC TTTGCCCACTCTAGTTTTTTTGTTGTTGCTTTTGCCAATATTAATGGCCA ACTCATGAGCAAGCAATTGGCTGACCAGAAATTTTCCTTGCCAAATATTT GGTATGGCAGGGTTGGGGTAAAAATAAATGTACCCAAGGAGCAAATAACC TGTTTCACAGTACAAGCGACCCCACCCTTACAACCAGAACACTAATATTA CATTATTTCTACTACTCTCGGTGTGTGCAGGACAATGTAAGTCCTCTGTT CCGTGAGGGAAACCAAGTTGAAGTGAATCAGTTGGCAGAAGACTTCAGTG AATCCTGGAGTCCAGCTACTGTTTTAAAAGTGATTGGTGCACATTTCCTA GTACAGTACACACATATTGAAAAAGATGGGGAATTGGCTACTGAGATTGT AGATTCTCAATATATTCGGCCAGCACTAGTTGTTACCGGCATGGGCTCTA GGCACAGATTTTCTCCATCTTTACATGTTGAGGTATTGCATCAAGGTAGC TGGTGCCCTGGTGTTATTGTGGAAGTATCAGGTAGTGGAATTGACAAGAA GTATGTAGTGGAGTTGAAGGATCACAAGGCAGACAACGAGGACATGGATT GTGTGGGTGTGCTGACGGTTGAAAGTACACAGATGAGGCCACGGTATGAC TGGGACTGGGACAGTAAAAAATGGGTACTCTACATTGAAAAGGTGCGTGC ATATTCTGTATTTCTGACTTCTGTCAATTTTTTTCTAGTCTTGTTTTCAT GTGTGTATTTTATCAAGGAGCAAGAGGCCCCAACCAAACTACGGTTGATT GTAACAAGTGCACTACACATTTATGCACTCCTTTAGATTTCAAAAGATGT GGCCATATTTGTCTACATTGGATCCTTTTATCACTATTGTTGCAGCATTG TGCACTATTTTGATCAGGGCTAGTGACACTTTCCATCTGTTTGTTCTCAA TCCGTTGGGCCCAGCTAATCAATAGACTCAGTCAGCCTGTTATTATATCA ATAGACTCAGTCAGCCTGTTATTTTGTCTACCAAATGATATTATTTGGTG TTAGCTAAGATGTGCCTTGAAGATTGCAGACTCAGCTACCAGTATTATGG TGTTTTTTTTCCTTTTGCCTGAGTTTTTGCACAAAATTTATGTTGATGAA ATATAATACCTTTTCCATTTCAGAAACCTGCCAAAGGACCTCGATTAACT GCTCGAAAAAGGCCAATTTCTGCTGCCTTACCATTGCATGATGAAGGCGA TGGTTCTTGTCGTGACAAAAAGGTGAAGAAGGCAGATGTAGTGTCAGAAT CAATGTCTCCACTCATACCTGTTGGTGAAAAATGTGAAATCAATCATATG TCTTCTTATACCGAAGAAACAATGGAGCAACGAAATGCAGTATTAGCATT AGCGTCTCAGTTGCCACTTCCTTCACCGCCACCAATGACTTCACTTGGCT ATCTAAGTTCATCTTCACTTGCTCCAAGCTGTCATCTTGAACAACCACCT CAGATAATTATCCTACCTTATAGGCCACAAGGCCCATATTTAGGAACAAG ATCTCGTAACTCAGATTGGTCAAAAATAGTATTACCTGATCAGGAAAAGC AGTCAACTGTTGGAAGCAGGACTGATCTGTCGAGACAAAAAGATGAATGT GTTACTTTTCAAACACCAGATTCTCGAGGGGAGAGCACTGAAATTGTGAG TTGTTGATTTTAACACATCTCCTTTAATATTCTAAGATAGTAAAGCAATC AATTAAAAATCAGTTCTTATTTGCCTTTTACATTTGTAACTACAGCCAAA GAAAGGGATAGCTGCTGAAACTATTGAGGAAGACGACAACATTATAGCTA TCTTTGAGGACTGTAAGTTTTCGGACTGTTTTAACTTCGAAAATTTTATT AATGGTACTCCCTCCATCCGGAAATAAGTGAATTGCATTTGTCTATAGTC ACATGTATCTATACACTAAAATGTGTCTAGATGCATGCGAATCTAGGCAA ATCCAAGTCAGTTATTTCCGGGCGGAGGGAGTACAACAAATACTAGATAA AATTTGCAGTGGCTCAACTGACCAATGATATGATCGCTGGATGTGAAATA CTTCCATAAATGAACACCGTTAGTTGTATTGACCTGACACCACGCAAGGA CATCAGAGGCATTTCCACGGATTACAGATAACAATTTCACTACTAGCACT TGTACAATGATACTTTCCATTTGCAGGTTCACAAGAAAGCAGTGGAATAG ATGATCTTCAGCAAGGGGGCTACGCTGGTGAAACAAGTTTTGAGGAGGAT GCTCATGAAGATTTATGTCAGAGGTATTTGGTCATGCCTGATGATGCTAA CGTTCATTCCTTGCCTTCAGAAAAGAGTTGTGAAGCTGTTGCGCTTGACA ACCAGATCTGTATGGACAATGCAGCAACTATGACTGAGTGCTTGGCTGGT TATGTCGCTCCAGCCGAGGACTTGTCTATTGTCTCTCCAGCTACTTTAGA TGGTGCTGTGCCCAACCCATTACAGTTGGCTGCGAAGTTCGAAGTTATCG AAAGTCACACCAAGGTGTTCTCAGACAGTAGCCAGTCCATCGAGAAGTCG ACAGTAACTCGGTTGTCTTCAGTTGGTACGGATAATTGTACTGAAGCAAA ACCTGGTAATAGCTTGGCTATAATAAAATACGTGGAGGGAACACCAATGT CCAAGTATGTTGCAAGTAGAACACGTGATAATTGCTGCCCCTTGTCGCCA GAATCTGTAGATGTGAATGGGAGTATCATCGACACAAATGGCCCGCTTTC AGAATCCTCAGCCATCCAGCATCTTCCGTTTGTGAAGACCTCACCAATAT GGGCAGAGGTTGAGGCACTGGAAATATTCAGTAGAGTGCCACAGAGGCCA AATTTCAGCCTGGTCCAGCAGTATAATCCAGAGCTCCGCGAAGGAATGGC ATTAGGTCTGATGGTCACTTTTGCTAATGTCGCAGTAAGCATCGACAGGC TGGAGGTTCAGGATGACAATAATGGACCGCTCGAAGAGAAGATGCTTAGT CTTTCTCTGCTGGAGGCAAACGGTTTTGATGTCGGGGACATGAGATCACG CCTGGAAACTCTGCTTCACGCAGGGAGGAATAGCCGCGCCATGCTACGGG ACGCTATGAAAAAGCTCGAGCAGAGGATCGCTCGCAAAGAAACCGAAGAC AGAGATCTTGGCGCTCTGATTCGCAAGCTAGCCATGGCTGTCCCTGATCT CGAACGACATGCCTATGTCATGCGCGGCGTGATGCGGTCTGCCATCTCCC AGAAGATGTTCAATGCTATGGAGATCTCACGACTCAAAACAGAAGCTGTC GAGCTGGAGCTATCATATGCATCCACCACCGCGCCGTGGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.