Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA042599

[Submit comment/correction]

Sequence	AA042599
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA042599
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCACATGCCCAAGAGAGAAACCTCCCTTCCGCTAACCCTCGTCGCACCG CTGCCGCCACCTTGCCTCTGTCGACGCAGCGCCGCCCCCTCCACCGTGCC TCTCTCTACGCACCGCCGCCTCGCCTCAGCCTGCGCGTGCTCCGTATCCA CTCCTAACTTCGCTCCTTGACCACCCAAGACCTCCGCAGAACGCACGCCG CCGCTGTCATGCGTCAATCCGACCACTGCCGCCCCTTCCGCCCGCCGGAC TGGGGTTCCCCGCCTCCCCACTGCCGAAACCACCACCAGAGCCACCGCCA GCCACAGCGCCCCCCGCAGTTCGCCGTGATCCTCTTCCGCGCGGGCCCCA ATGTCTCCACCCCGACCGCCACGGAAATTGACGCGCTCGTCGACGGCCTC AAGTTGCCGCCCCCGGACAACCTCTCCGTCTTCTCCTCCGGCCGCGACGC CGCTCGCCTCCTCTTCCGCTCCCTCCCAGCCGCCGCGGCCGCCGCGCGCG AGCTCTGGTCGCTCCGCCTCGAGGGCCTCCACCTCCTCACTCCCTACCTC CCCAATGCCGCTGTTGCCGCCCACGCCTTCCCCCTCATCGCTTCTCTCTT CGCCTCTCACGCCTCGCGCCTCCTCGACTCCGACCTCGTTTCTCTTTCAG CCGCCCGCTCCGCTGAGCTCGCAGCATCCATCGAGTCCGTGAAACACAGC CTCAGCGTCCGGAATAACTTCCGTGACTTCGACCAGCTTAATCTCCAGAA GAAAACACTGGAGGCTGAGAAGGACTTGGTAGATGCCAAAATTGCCGAGT ACAAAGCATCAATGAGTCTGATACGGCGTGCCATGTTACGCGGGACCGAT GAGGAGGAGGAGGTGGAGGTGGATGAAGAGGGGGTGGATGTGTTCGGGAT TGGAGAATGCGAGGACGTGGACTTTGTGAGGTTGCACAAGATGATGCTGC GCGAGAGCAGGAGGCTCAACGAGGGGCTACCAATATACGCATACCGCAGA AAGATTCTCAATCACATTTTCCATAACCAGGTGAGGATGTGAATTCTCTG CAGTTTTATTTGTGATGGCATTGCAAATTTGCAGTGTGGGCCATTCAGTC CTCATTCTTTGATGCTTAGAACCATGGAGAATGATCGTGTATGTAGTTAT CTCGTGTGCGTGTTATCAGATTGCAATTTTCCATTTAGTTTCAACCTTGT GTACCTAGGTATTCCATGGCTGTAATTAACCTGAGTCATCTCTTGAGTTA TAGCCTCATAGGTATTCCAGATCAAATTTCCACTATATTTAGTTTGCCTT TCTTGTATATTATTTGTAAATCATGACATACCAATGCAAAAATCATTATC TAAGTCATGTGACCTTTGTTTCTACAGGTTATAATCTTAATTGGGGAAAC TGGTTCTGGGAAAAGCACACAATTGGTTCAGTTTCTTGCTGACTCAGGTC TTGCTGCTGATGGTTCAATTGTCTGTACTCAACCTCGAAAAATTGCTGCT GCAGCGTTGGCACGCAGAGTGGATGAAGAAAGCAATGGCTGCTACACTGA CAATTTCGTGTTGTCATATTCAACCTTTTTTAATTGTCAAGACTTCAGTT CGAAGATTATATTTTGCACAGATAGTTGTCTATTACATCACTGCATGAAT GATGTTGGCCTGGATGACATTTCGTATATCATTATTGACGAAGCTCATGA AAGAAGCTTGAACACTGATCTTCTCTTAGCTTTGATCAAGAAGAAGCTGC TTGATAGGGTGGATTTGCGTCTCGTCATTATGTCTGCTACTGCTGATGCT GATAGGCTTTCTGACTACTTTTATGGCTGTCAAACATTCCACGTTAAAGG CCGAAATTTTCCTGTTGAAATTAAATATGTCCCAGACGTATCAGTAGAGG CGTCTGTCAATACTGTACCAAACTCTGTGCGTGATGCTTGTGCAACTGCT TCTTATCTCAATGATGTTGTAAGACTGGTAAGCATCATTCACAAGAATGA AGAAGAGGGTGCTATCCTTGCTTTCTTGACATCTCAGCTGGAAGTTGAAT GGGCTTGTGAAAATTTTAGCGATTCAAGTGCCATGGTACTTCCTATGCAT GGAAAGCTCTCCCAAGTAGAACAGAGCCGTGTTTTCAAAAGCTATGATGG AAAGAGAAAAATTATCTTCTGCACGAATATGGCTGAAACATCACTGACCA TAAAAGAAGTAAGGTATGTTGTTGATTCTGGACTCGCCAAGGAGAGCAGA TTTGTACCCAGTAGTGGTCTCAACATATTGAAAGTTAATTGGATTTCCCA AAGTTCCGCTAATCAACGTGCTGGCCGGGCAGGTCGAACAGGACCAGGGA AGTGTTACAGGCTTTACTCTGAATCTGACTTCAGTATGATGGAAGTGCAT CAAGAACCTGAGATCAGGAAAGTTCATCTTGGCACTGCTGTTCTAAGAAT ACTTGCTTTGGGTGTTAAAGATGCACAGAATTTCGAGTTTGTTGATGCCC CAATTCCTGAAGCAATCAATATGGCTGTGAAGAATCTTGAACAGTTGGGT GCTGTCAAATCTAGACTTAATTGCTTTGAGCTGACTGATACTGGGCACCA CCTGGTCAAATTGGGAATTGAGCCAAGGCTTGGGAAAATTATGCTTGATT GCTTCAGTTTTGGTTTGAGGAAGGAAGGTGTAGTTCTAGCTGCTGTTATG GCAAACTCTAGCAGCATATTTTGTAGAGTGGGCACTGATGAGGAGAAACA TAAAGCTGACCTTCAAAAGGTCCGACTGTGTCACCGAGATGGAGATCTTT TCACTCTACTTGCTGTTTATAAGAAATGGGAAGGTGGGCATGACAACAGA AATTTGTGGTGCTGGCAGAACAGCATCAATGCCAAGGCCATGAGGAGATG CCAGGAAACTATATCAGAACTTGAAGACTGTCTAAAGCATCAGTTGAACA TTATTATCCCAAGTTATTGGTCTTGGAATCCCGAGGCTCCCTCTCTGGAT GATAAGCTGCTAAAGAGAATTATCCTATCATCTCTTTCATGTAATCTTGC TATGTTTTTAGGACATGAAAGGTTTGGTTACCAGGTGATTTCCACAGATC AGGTTGTGAACCTTCATCCCTCATCCTCATTGCTTAATTATGGTATTAAG CCTGAGTGGGTGGTGTTTACAGAAATCTTGTCAGTCCCGAATCAATATTT GGTATGTGTAACTGCTGTTGATCATGATGCCTTGTATACAATTCACCCGA TGTCTTTCATTCAGCAACTGGAGGAACATAAATTGCAGATAAAGGTGATT AGTGGGCTTGGTACTAACTTGTTGAGAAGGTTTTATGGCAAATATGGCCA AAATCAGCAAACGATCATCTCACGTCTCAAGGAAGATTGCAGGGATGACC GAATAACTGTTGAAATTAATTTTAGAAGTAATGAACTTGTGTTATTTGCT ACAAAGCAGAACATGGAGAAGGTTTCTTGCATTGTTAACAGTGCTTTGGA CTGTGAAGGTAAGATGTTGAGGAATGAATGCCTTGAGAGAAGTTTATTTC CTGGGAGGCCCGGCAATTCTCCTATTGCACTATTTGGCTCAGGTGCTGAA ATCAAGCATTTGGAACTTGGGAAGAGATATCTAACAGTAGAGGTTTTGCA TCAAAATGCTCATGACATCAATGACAAGGAGCTTATTTGCTTGGTGGATA GTATTGTCTCCGGTGTTGCTAATTTTCATAAATCCACCGGTAATTTTAGG ATAGCCTCAGATGCAACTAAATGGGGGAAGTTTACATTCCTCAAACCTGA AAATGCTGAAGATGCTGTTTCAAAACTGAATGGGATAGAGTTTCATGGTT CCTCATTAAAAGTACTTCCTGTATTTTCCTTCGATAATCGAGGATTACCC TTTCCTGCAGTAAGAGCTAAATTATGTTGGCCAAATAAACGTAGCAGTGG ACGTGCACTTGTAACATGTGCCAGTGGGGAAGCCGAATCTGTCGTAAATG ACTGCTTTGCCCTAGGAATTGGTGGAAGGTATATCAATTGCAGGGTTAGT ACTAAGGATGAGAACTGCGTCTTTGTCGAAGGAATTCCGGTGCATGTTAC CGAGGCAGAGCTGTATGATGCTTTTTGTAGCACTACAACAAGGAGAATCC TTAATATCCATTTGCTCAGGGTTAAGGGAAATGCAACCGCTATCCCCTCT GTTTCTACATGTGAAGAAGAACTGGTTAGAGAAATTTCTCCATTCATGTC AAATAAGAGTTGTCCTGGACAAAATTTCCGTGTTGAGGTGTTCCCTCCAG AGGAAAACGATTCATTGACGAGAGCAGTTATAACTTTTGATGGAAGTCTT CATCGAGAGGCTGCAAGAGCACTGGACCATCTTGAAGGGAGCTTTCTTCC TTGTTGTCAACCTTGGCAGATAATACAGTGCAAGCATGTGTTTCATAGCA CTCTGTCCTGTTCGCTACGTGTTTACAATGTTATCAGCCAGGAAGTTGCT TCTCTCCTCGAGAGCTTCCAAAACCAAAAAGGTATGTGTACATTCCTCAT TTTATCCTTTTCACTGTTCTATGGTTGAATGATATTCCTCCATTTTCGTT ATTTCTTTATTCGTTATGTATTTTCATTTTGCTTAGTTTTGTATGAGCTA GCCAGCTTTTTGAGCTTCCATTTTTGTACATCTGGATATTGCCTCTCATC ATCAGATTGTGCATAGTCACCTACACCAGAGTCATCTACATAAGCCGTTG TAGCAGCGTTGTCAAGGCACACTTATGTTGGCTCAGAACAAGATTCAACC ATAACCTGAGAAGGGGGATCAATGGATGGGGTGCTTGGTCGTTGACTGCT GCATACACACACTATTCTTCTTTTAAAACTACAGTAGCCATACAGGTGTT AAAATGACATTTTTTTCTTGATGTGTGAAGTCAACAATTTCTTTGCTAGG ACCTATCAGCTACAGTATTCCTCATAACAAGGTAATATTTTGCTTGATCT GGGAATAGTTGAAAGACATACCTGACTATATGAACGCTCAATGGCTGTAA AAGAGCCGATGAAGTTTTTCATTCAGAAATAGATTTTGTAAGTTGCTATT TGTTCCAGCATATTTAATTTGCATAAGTATTTTCCATCTGATAATCTTAT TTCAAACCTTGCTCATATTATTTGGTGCATTTTCCAATTTTTCTAGTTAC CTTTACCAGGAATGCTCTTATTAAGTAGTGATAGCTATAATCCTATAAAT GTCCTCCTTCAACTGTCTCTAATGCACCAATTGACCCGTGCGAAGAAAAT ATGGCCAATTAAAGAGTGTAAAAATGCCATAGTAGTGATGCGTTATCTAT CACTGCCTTGCTTGTTTCTGAGGGCTAAAACTGTCTGGTGGTTGTATATG CATACATACAACATTTGTCTATTGTTGGATTGTTAGTTCTCTGTAAATTT AGAGGTATGTGTTTTTTGTGCTCAGATGTGATTTTTTTCCAAGTACGGTT GTAAGCTTTGCTGGGTACGCTAACATATGTTTAAGATCAGCTGCACGACT GCAACTAAAGTAGGCATTGACGAATATGCTGCTAATCTTGCATAGCTCTG TTTCAACCTTCGTATTTTTGTTTAGTTGTTTGAGAGTGCAAAATAATCAT ATGTGCTGGTGGGTTTAAGGTCGTAATCACTTTTCTACTTCATGCAGGTG TGTCTTACAATTTTGAAAAGACTGAGAATGGTATTTTTCGATTAAAGCTC ACTGCAACTGCCACAAAAACAATAGCAGATTTGAGAAGACCTCTTGAGAT TTTGATGAAAGGAAAATCCATAAACCATCCTGATCTGACATTAAGTGCAG TTCAGCTGCTCTTCTCCCGTGATGGTTTAGCACATTTGAAATCAATTGAA CAAGAAACTGGTACTTATATTATGTATGACAGGCAAAGTCTAAATGTTAA AGTCTTTGGACACCAAGATCAGATGGCTGCAGCGGAGGCGAAATTGGTTC ATGCACTTCCACAACTCCTTGAGAAGAAGCCTCTTGAAATTTTTCTTCGT GGCCATAACCTCCCTCCAGACTTGATGAAGAAAACAGTAGAAAACTTTGG AGTTGATCTGGAAGGATTTAAGAAAGAGATGCCCACGGTAAAGGTTGAGT TGCAGAAAAACCGTCATTTACTTAAAGTGTGGGGCAGTAAGGAGGATAAG AGAAAGGTGGAAAGGATGATCTCAGAGTTATCCTCTGTTGAAAAGAGTAC CCTGGTTCGACTTCCACTAGAGAATGTTGGGGGCAATAAAGAAGATAAGC AAAGGGTAGACTACGATGAGCCATCAGAGGATTCATGCCCTATTTGCTTG TGTGAGATAGAAGATCCTTTTAGGCTTGAATCATGTGGGCACATGTTTTG TCTCGCTTGTTTGGTGGATCAGTGTGAATCTGCCGCGAAATCACATGATG GGTTCCCTATTTGTTGCCTAAAGACTGGGTGCAAGAAGCCCCTTCTTGTT GTTGATCTGAAGCACCTGTTGTCAAATGAGAAGCTGGAGGACCTATTTAG AGCTTCCTTGAGGGCATTTGTTGCATCTAGAGCAGGAATGTACCGCTTCT GCCCGACGCCCGATTGCCAATCCATCTACCAAGTGGCAGCTCCAGATGCA GAAACCAAACTTTTTTCCTGCGGGGTTTGCTATGTGGAGATATGCACCAA GTGTCATCTAGAGTATCATCCTTTCATATCATGTGAGGCTTACAAAGAAT ACAAGGAAGACCCAGACTCAACACTGCTTGAATGGCGCAAAGGGAAGGCG AATGTGAAGAGCTGCCCTTCCTGTGGATACACAATTGAGAAAGCTGAGGG CTGCAACCATGTTGAGTGCAGGTGTGGCAGACACATTTGCTGGGTATGCT TGGAGAACTTCAAGTGCAGTGAAGAGTGCTATGGCCATCTCAGGTCTGCA CACCAATCTTTTGTGGACATTGTGTAGTAGAACCTGGATGTAGTTTCAGA AGGCAGGTGGTGGCCACGTAATGTATTACTGTTTCAAAATACCTTCTTGG CTTCTTGTTTGCCGTGCAATTTCGTTTTGTCCATCTGGTTGAGGTGTGGA TGCAGAAGAGAAACCAGTAGAGGGCTTCGTGTCCCAGTTGCAAATCAAGC TCGGCGTGGCATCCTTACATGTAGTAAGTCATTTGCCTCATTACCCTCTG TAGGTTGATATCTGGTATTTTGTTGTCTTTTTTGTTCTGTTTCTATTGTT ATTAGTATTTTATTTCTTGCGAGTTCATCATGTTTTATGTTATAGAATTA GTCCAATTTTCTTTGTCACAGGTTTATTCTCTGGATCACAAAGATTTTGG TTTTAATCAAGTCCCATATGGCATGCTTAGAGTTACTATTTTGAGAAGTG GGTGTGATAAATGTTGCAAGCTTGATGAATCTCCAAGAAATGAGTATCTT CCGTGGACGGTATGGATATATGAATTCCATAAACTTTGATTCATACAAAC ATTTTTCAGTTTTAGCAATGCTTCGGCATGTTCATTTGAAAATGCCATTA TTTTTATCTTATTTCGGAACAAAGCACACAAGGACAATTGCTACTGTTCG GTAGATACTGGTTTATTTTCTGCCTGTATACATTTTATGTTAATTTTTTT CCTTTTGTGCTTCATTATTTTTTTAGTCTCATATTTTTTTACTTGTTTGT AGGAGATCTATGCCTCAACCATTTTGTGCTGCTGCATGGACACCAAATTC GTTCCTGGTTGCTAAAGTACAGGATTACAAGGTGATTGGCTGCTTTGTGC AATCTTGGTTGTCCCTCCATGGACCAAGCTAGGTGGTGTAATCCTGGTGG GTTCGATGCATGGTCACGGATATCTGCTGTAAGGCAACCTCGGCTGCCAT ACCTGGGCCTGCGGTTAAGGTAGATTTGGAGAGTTGCTGCCGCGATGTGA TCTTGGAGGTGGAAGGTGTGCATTGTTCAGTTGCTAGCCGGATCGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.