Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA012085

[Submit comment/correction]

Sequence
AA012085
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012085
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCGCGGCCCCACGTCCGTGCGACGGGACGGGGACCCAGGCGGCCAGATA
GCCCAATTCGTTTGGTCCTCCTCCGCCTTCCCCGCGCGTAGAGCACGAGA
CACCCGCCCTCCCCCGCCCCCCGGCACCGCCACCGCCACTCTTCCACAGC
ACTCCACTCTCCGCCACTTTCCTGCCCGCGGTCGCCGCTTCAAGCTCCCA
CACCAGAGCCGCCTCTCCCTCTTCCTGTTCCTATGGCGTGCTCGACGGCG
GCGGGCGTCGAGGCGACCGCCCTCCTGTCCCCCCGTCCCGTCCCGTCTTC
AGTCGCCCGCTCCCGCCTCGCCCTGGCCTGCCGGACTCGCCATCGCAGCC
TAAGGTAAGTCGCTCAATTCGAGCGCGTCGGGTGGGTGTGCGCGTATCCT
GGTCGTGCGTCGGTAGCTAGCCGCCGATTAGGAAATGGGAAGGTGTTTGT
TTTGCTTGTCAGGATTCAGATGGACAGTACTGATACGAAGATTTAGTGGG
GGTTCTAGTGATCGCTGGAAATCCGTGTTGATCTGTCTCTCTAGTTTGTA
GCTATTGGGAAGTACAGCGAGTGGCATCCTGGGTAAGCGTTTTTTTTTGT
GTGTGCGTGCTTGCTCTGTGTGTGCGAAATGGTGTGATCCTGTCTGGTCG
AATCAAAATACAGAATTGGGAATGTTCAAATGTCCACTAAGTGTATGCTC
GGTGGTGACAACGTAGTTCTGGATGTTGGCACCTGCTGGACAAAATGTCT
GTCCCGACTCATGATCTTCGGTCATGATCAGACCACCATAAACACTCTGC
TGAGATTCCTTGTTTCTGGATTTTACGAATATGTCAAGCGAATCTGACTT
TTGTCCGCTGGTTCTAGGGCGGCCGCGCAACGTCCGCAGAAGAGTACAAC
TGGCGCCGACCCGCTTAATGGGGCTAATGTCCAGAGCGATGAAGCAGCGG
TTTCCACTGGCAAGGAACGACAAAGGGTATTGCAGCATTTTTATTACTTT
AGCAGTTTATATGTTTCCAAATCCATTTGTCCGACCGTGGAGCAACGCGA
CAATAGATGGGGATTCTTCTTTTTATGAAAGCAAATTTGGGTCTTGGCTG
CCAATGGAAGGCAATACCTTACTCATATGAGTTTCCACCTTATTTTAACT
TAAAGGGAATGAATTAAAAGCATTACCTAAATTTACCACAAATTATATTT
TGAACCAAATGGCTTTTAAGAGTTTCTAGATTTGTGGTTTCCCCCACAGA
ACTACGGCGACGGAGATGGCATATCAAACCTTCAACTGGAAGATTTGGTA
GGAATGATACAGAACACCGAGAAGAGTAAGGAATTCCTTCCTTTTGGATA
TCCATACAGTTTCCTAAAATGCATAGAGTTGTAAGTGTGTGCGTAAAAAA
CACTGAACTGAAAATTGATTTTGTTAGATATACTTCTTTTGAATCAAGCT
CGTGTTCAGGCTTTGGAATATGCTGATAAAATTCTTAAAGAAAAGGAAGC
CTTGAAGAGGAAGATAAATATTTTAGAGACGAGGTTGTCAGAAACAGATG
CACAACATAAGCTTTCAACTGAAGGGAATTTCAGTGACTCTTCACTACTG
TTGGAATTTGATGTTCTAAAGGAAGAAAATATTCTGCTGAAGGTGGACAT
AGAATTCCTTAAAACAAAGCTTATCGAGGTTGCAGAGACAGAGGAGAGTA
TATTCGAATTGGAGAAAGAGCGTGCTCTTTTAGATGCTTCCCTTAGGGAG
CTGGAGTCTAGGTTCATTGCTGCCCAAGCAGATATGATGAAACTTGGTCC
TAGGAAGTATGACGCCTGGTGGGAGAAAGTAGAAAAATTGGAAGACTTGC
TTGAGACCACAGCAAACAAAGTAGAGCATGCTGCTATGATATTGGACCGC
AATCACGATCTGCAGGATAAGCTTGACAAATTAGAGGAGTCACTGAGAGC
AGCAAATATTTCAAAGTTCTCTTGTTATATTGTTGATCTTTTGCAGCAAA
AGCTAAAATCGGTGGAAGAACGATTTCAAGCATGCAATCGTGAAATGCAT
TCTCAGATTGAACTGTATGAGCACTCAATAGTGGAATTTCATGGTACTCT
TAGCAAACTAATAGAGGAAAGTGAGAAAAGATCACTGGAGAATTTCACAG
GAAACATGCCTTCGGAATTATGGAGCAGAATTTCCCTTTTGATTGATGGG
TGGTTACTGGAGAAGAAAATATCTTACAATGATGCAAATACGTTACGAGA
AATGGTTCGGAAAAGGGACAGTCGTCTTCGCGAAGCGTACTTGTCTTGCA
GAGATACGGAAAGCAAGGAAGTTATGGATAATTTTCTTAAGATGGCATTA
CCAGGAACCAGGTACACTCTCTCCTTTACTAATGAGAAAACAAGTTTATA
GAAAATAGTTGGTTTGTAATATGTATGATTAATGCAGTTCTGGTTTGCAC
ATTGTCCACATAGCAGCAGAGATGGCTCCTGTCGCAAAGGTGAGTTATAG
TATTAGTTCAGCCTTTCATAAGCACATTTAAAATTTTGAATTTTATCTTT
GGATAAGTCGCTACCTAGTACATCTACTATTTTAGGGGGGCTTAAAGAGA
ACAGTATTTTTAAGTTTTAATATTCTGCAACTTAACAAAGTACTAATTTT
TCCAGTTTTGCACGTAAACTCGAGCCTATCCGCATATCTTACACATCAAC
ATTAAGCACTATTTTCAAATATGGTTCTGCTCAGTTGTTCTCAGATAGGC
CCTGATGACCCAAGCGCTGATTCAAGCCGTGGTAAAACTGACACTGTTGA
ATGTGTGCTCTGATATGTAGCTCTAATAGTTTATAAAGCTGCATGTATAC
TATTTTAGCTTATCAGTTATGATTGTGCAACCATGAACAGTAAATAAAGC
TTTGGTTCTACCAAATAGGTGAAATGTTGACTTCATGTTTCAACAAAGTT
ACAATCTGCAAATAAACTGTCTAAAATGTGCAGATATTTGTCCATTGATT
ATGTGCCTATAAGTTCCATTAGATCTATCTCCTCTAACTGCATTACCCGA
GTTGTTTCTGAGGATATTTGTTAAACTACCGATGTTGATGCAATGGATAG
TTGTTTTGTAATCTTATGTCCATTCTGATTAATTTGAATCCTATTAGTCA
TCTGTTATCTTGCTTATATGCATGAATATTTAGGTCGGTGGCCTTGCGGA
TGTGATATCTGGTCTTGGGAAGGCACTTCAGAAAAAAGGGCATCTAGTAG
AGATTATTCTTCCCAAATACGACTGCATGCAGGTTGACCAAGTTAGCAAT
CTTAAGGTATGTAACAATGTTGCTTATTGATATTTTTGGTAAGATCTTGG
GTAAGATTTCTATCACGTGATTGTGCAGGTTTTAGATGTTCTTGTGCAGT
CCTACTTTGAAGGAAATATGTTCAACAACAAAATTTGGACCGGGACAGTT
GAAGGTTACAAGCACCTCTCAGTTGTACTACTGTATCAAACTATAGTCTG
CATTGGCCTAATTAAAATTAGCATATGCAGGCCTACCTGTCTACTTTATC
GAGCCACAGCATCCAGCAAACTACTTTTGGAGGGCTCAGTACTATGGAGA
GAATGATGACTTCAAACGTTTTTCATACTTCAGCCGCGCAGCACTGGAAT
TACTTCACCAATCTGGGAAGAAAATTGATATAATCCACTGCCATGACTGG
CAAACTGCATTTGTTGTAAGCGTCTAAGATCATTTGGCAGCATCGACTCA
TTGCCTACTGAATATTGATCTTATTTTCCTTGGTTGATTTACAAAGTTTA
GTGTGCTAAGTTCCCTTTTTAAATGTAAACTTCAGGCACCTCTTTATTGG
GATGTATATGCAAATCTAGGTTTCAACTCAGCTAGAGTTTGCTTCACCTG
TCACAATTTCGAATATCAAGGAACTGCTCCAGCTCGTGATTTAGCATGGT
GTGGCCTTGATGTTGAACACCTAGATAGACCAGACAGGATGCGGGACAAT
TCACATGGAAGAATAAATGTTGTTAAGGTATCGTTTATGTCAAACTGTAG
CAATAGATTTGGAATGCAAACCCACTGCTTCGGTATCAATTATGCTGGTC
TGGATTCATATTTATTCAGGGTGCAATTGTGTATTCGAACATCGTGACAA
CTGTCTCACCAACATATGCACTAGAGGTTCGCTCAGAGGTAATATTTCTT
ATGAACGTTATGCCATATAAATTTCTTCAGCTGTTTTTCAACCGCCCTTT
ATATATTTCATAGTTCCCTAGTAGTCTTCTACCTCTGAGATTCATGGGAA
AAATAGATAATTTCTAAGAATGTCGCTCGAAATAGGTTATTGTTTCGAGG
CAACTATTTCTTGAAGAGGAGGGCTAGAAGTTGCACAAGCTGTGGGAACT
AATAGTAATATGTACTGTTACCTTTGTTTGATCAGTAGAGCCAGACATAG
TGATGTTTCTCCATGGACTGGACACTAAAGAGATGCTAGATCATTATTCA
TAAAAGCTTGAATGCTTGAGAATACCCTAAATCAAGATATCTTGACATGC
ATGTCCATACAGGCTTCTGTATTGCAAGTTCATTGTAATAGTTTCAGTTT
GCAAGTAAAGTGTTTCTGCATTTTTTTTGTTGATGCTGCTCTTCTCGTTC
CCAGGGTGGGCGTGGACTCCAAGATACACTTAAAGTACATTCCAGGAAAT
TTCTTGGGATACTTAATGGAATCGACACAGATACATGGAACCCTTCCACC
GATAGGCATCTCAAGGTCCAATATAATGCTAATGATCTCCAGGGAAAGGC
AGCAAACAAAGCAGCCCTGAGAAAGCAGCTAAACCTTGCTTCTGCATATC
CCTCACAACCGCTGGTACGATTTTCAATCATGTTATAACCAGGTCCCAAC
TACTGGTAAACTGGATATGCAAAGGTTCACCCTGTACGTGAAGTTGAACA
TTTTTCCTGTCGTTATCCTCGTCACTTTTCTCTAAGGATGCAAATTTGTG
ACCCTTAGGGTACCTTGTGGCCCTCTTTAGTTCAACCAAATGAACTAAAA
TTTCAGAAATCACATAATTTTTTAGAAGTTCATTTGATTGAACTAGAGAA
GGTTGAAGGGTACCCTAAGTGTCAAGTATTTGCATCTCTACTTTTCTCCA
CGGGGTAGTCTTTAGCTATCCGGTTCTATTATTTTTCATTATTTTTATTG
TGGCATGGCCCATCTAGTCTGAAATGAGGTAGGGCAATCCTATTTTTATT
GTTCTGTTCAGTTAGCTAATGTCATTATTTGATCCCCTGATGTGTGTACT
CATCTGCTTTCAGTTGTCTTGGAAACTTGACACTGAATGTTAACTACATA
ACTACATTTTTCTCAAGCAGGTTGGTTGCATTACAAGGCTAGTTCCTCAG
AAGGGTGTACATCTCATCAGGCATGCGATATACAAAACAGCAGAATTAGG
AGGACAGTTTGTCCTTCTGGGTTCAAGTCCAGTACCACACATTCAGGTGC
GTTTATCAGTTTGTGTCACACAGTTTATTTTGCAGTATCTGTGCAGATAA
TTTGACCAGGCTTGAATCTCCAAATAACAAAGGAAAACACACTTCACTAC
CGCATGAACAGTTTGTTTATTGCTGAACAACAGTCTGAAATAGTGTTTTC
GTCTGTTCTTTCTGTTAAGCACATCTGTGCCTATAGCTGAAACAGTGAAC
ATGTTTGCTTCTTATTTGTTTCACAGAAGGAGTTTGAAGGTATTGCAGAC
TATTTTCAGAACAACAACAATATCCGGCTGCTTTTGAAGTATGATGACGC
TTTGTCTCATTGTATATATGCTGCATCTGACATGTTCATTGTTCCCTCTA
TATTTGAGCCATGTGGCCTCACTCAGGTGTGCATTCTTTCCTTACTTGGA
TTATGTATGCATATTACGTAGTGTGTATTAGGTACACATGTAGCAAGCCA
ACATCATGTAGCACGATACTTAATTTTGTATCACGTACTAAAATATAGGT
TTTTTTACTGTTGTGATCATTTGGCATCTTCCTAGAAGTAACTAAAGAAA
GCACAAGTCCAAGTCTGACCTCTTCCACTTCTATTTGATATTTGATGTGT
GGCCTTCTGATGTGTGATTCTGACATGTTTATTATCCGCAGATGATAGCC
ATGAGATATGGTTCCGTGCCAATTGTTCGTAAAACTGGTGGATTGAATGA
TAGGTAAATAGTGAACCAACTGTTCTTCCAGATATAGTTGTCTCATTCAA
TCAAGTAGTAACAAAAATGATGGCACATATGGTGCTTTTTGGTTTCAGTG
TATTTGACTTTGACGATGAAACAATACCTACGGAAGTGCGGAATGGCTTT
ACATTTGTCAAGGCCGATGAGCAGGTGGGTCTTGTTTGCGCGCATTGCCT
AAAGAGGAAAATTGCAAATTGATGATTTCTGGTGGGCACAACTCATTTGG
GTGTTCATTGTGACAGGGCCTAAGCAGCGCGATGGAGAGAGCATTCAACT
ACTACAAAAGAAAACCCGAGGTCTGGAAACAGTTGGTGCAGAAAGACATG
AGGATAGACTTCAGCTGGGACACTTCAGCTTCGCAGTACGAAGACATCTA
CCAAAAGGCAGCCGCTCGAGCTAGGGCAGCAGCATGAGCACATGTGGTTT
CATGATGCCTCCATGCCCTCCCCCTGCTTACGCTATGTGTAGCGCAAATG
CTCATTTCCTGACGGAATCAGGGGATCAGAAACGCAGAATCATGCAGGAA
GTTCCATGCTCTCGACGCGCATTTGACGTATATCTGGTTATACATGCTCT
GTGCTGAGCCAGAATGCAAAGGCGGAAGCGCGGGTTGATCATCTGTCTAG
AATGTGACGGCTACCGTGGAACTGATAAGATTGTAGTACGTGCACTCTTG
TTGGTGCATAAATTGGTGTAAATTATGAACTGTACATGTGGCTGTGCAGG
ATTTTTCCCAAGAAAGAAATCTTATGGTCCCGTGGCATGAAAGGAGCAAG
AAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.