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GrainGenes Sequence Report: AA032252

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Sequence
AA032252
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA032252
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGAAGTTGACATTTCGACAACTATCTGTACATAATATAAACACTCAGTA
CTCCCTCTGTTCCAATTTACTCTGCGCCTAAGTTTTTTTTTGGTTTTTCC
AAATTACTCTGCGCGTTGTGTCCGGGAGTAACTGCTTCCTAAATTGCCCC
TCCGCCGTTTCACCTCCTAGCCAGCTATCATGGCGTGTGAATCGTTCTAA
TCCCATCTATAGCAACCGTCCCTTCCTCTCCTCCTCCCAATCTCCAATCC
CATGAGAGTGAGAGACATGGAAGGGGCCAGCCAAGGCGACGAGGAGCGTG
ACGGCCGCGGGATGGATCGGCGTGCGCCCAGCCACGGCCGCGAGCACGGA
TTTCACAGGATTCGGCGCCGCACGCCCGCGAACATGTCCAACACCGATGT
GATGCTCCTGGTTCCAAATGACAGTCCCTGGTCATGCTTCGCCGGTCAGA
CACCATGACCGGCTCTGCCATGGCTAGAGCCTCGTACATGGCCGGTCAAA
CCAGCCTGCTGCGGCTGATTGCTGCCACCCGCATCGGCGTCGCCGCTGCT
TTCGTTCCTGCCGGCGTCGCAGATTCTGCTCCCGTCGGAGCCACTACTCC
CGCTCCCGCCGATGCTGCTGCTCCCGTTCGCTCTAGCTCACTTGCAGATG
CGACGATGGGCAAGATGGAGGGACACGAGCCAATACAAGCCCGTAGTGTT
TAGGGGCAATAACGTCCAGCTACGGTGAAAAGGGGCTCTCCCGCTGCTCT
CCTTGGTATCTGAGCTTTTGCTTAGGCGCAGAGTAAACAGAGGGAGTATA
AACAACAGTATATTTATAAGGGCTCCAAACGCATATATGCTGTATGTAGG
ACGTTTTAATATATTCACAGAAGCAGAGGTGCGTTAGCGCAAAAAGACCC
CTCCTCGGGCAAACGCGGCACCCTGTGCGTGTGCTTGGTTTTTTATCCGC
GCCTGGAGTAACAGTCTCCTCCCCATCGCTCGCTTCTCGTCTGCTCCCCC
AAACCTCCCAAGCCAAGCTCACCCTAGGGTTTTCCCCGCCGCCGCCCATG
GCCACCTCCCCCGACCGCGCCAATGACGACCTCCGCCGCCGCCTCGCCGT
CGATACGCCTCCACCGTCCCAGATCGCCAAAGGTCTGTCCCTTCCTCCAT
CACCCCGCGCCTCCTTCCACCCACCCTCGATCCGTCACTCCAGGCCGAAA
CCCTAGCGAGCTCGGGCTGGCTTGATTTGTTGCTTGTACGTTCGTTCGAT
CCTTGCCGACGTCACTAGGGTTCGGTGGGTTATGGGCGGTTGCGAAATGG
TACTGCCAGGTTGGGCTTCCGCAGCTTTACTGCCGTGTAGGGCTGTGCCT
GGACAGTTTCTGCTGTGGTGGGGCGGTAGTTCTAGGTATAAAGGGCGACG
GCTTGGTAGTTAAGTTGAGGTTTTCGGATTTCGGTGGATCGGATGCTGTG
GTCCAGTTATTACTTTATAGTTTTTGCTTCGTTTTTGGGGTGGCTGGTTT
TACCTTATTGGATAGCCGTCCTTTGTTCTAGTACTTCGATTTTTGTTGTT
AAATTACGCTTGTGAATGTAATTTTTTGGTTTAACCTAGCTGCTGTGACC
TGTGTGTGACTCCAAACGTGGCCATCTCTAGCTGGAGTTGATTGTTTTTA
TGTGTTGGTATTTGTAGGATGCAGAATATAACTGAAAACTATTGATGCTT
CATTTTGGGCTAAGAAATGTTGAGTTCGTTGTACCCACATGTGCTGGCTG
CAACATCCGTGGCGACTTCTTTTACTGATTGTTTGCTCAATTTGTCATAG
CTTTAGAAGCTGGTGTAGGCTATCTTTTTATCTACATTTGCAACCTATGG
TATTAGAGTTGATCTTTGGTAAAAACATGACTTGACTGTACATACAGCCA
GTATATGGACAGCCATCCAATCCAATTAGTTACATATGAGGTATATGCTA
CTTAAATATTATTGCATGTTTCTCTTGTCTAACTACTGAACATCTCTTGG
GTTGTCCAATGTGTCTTACACTTAGTTGAAAACGAAGCTTTCATCAGTAA
CATAGGACGTTTATAGTGCATTATGAGCATGTTCCCATCCTATCTTTCAC
CACCATAGCATGTTTCCTGTCTTATTCATTGTATTTTTTTTTGCAGAGAA
GCAAGGCCTGGATACTGACATGCCCCTTTCTCCTCAGTGGCTTATGAAGG
TAGGCGAAAACACGGTCAGGGTTATAGGTTTAGCGGCAGTAATAACTAAA
CTCAAACAATTGGATTTCTTAACACTATGCTTGCATGGTGAACATGGCAG
TAGAATACCATCTAGGTTGTTATTCGACTTTGTTTATTAGTTTGCGCGCA
AGATGGCAATTTATGTAATTGTTGTTTGTTGCAGGACCCCGGTTCACAGG
GTTCACGCTCAGATGCTACTAAAACATCAGGTAACGGTGAAGACATGGGC
TCCGGTGCGAAGAAAAAAGATGTCTTCAGGGCTTCCGTGCTTGATGGTGA
AACTGGGCGTCGTGAGCGTTGGCGCGATGATGAGCGAGAACCAAATTCAG
CCCCCCGGTGGACTCGCTGGAGGGAAACAGACAAGGAACATGGCGATACA
CGCAAGGTGGAAAAATGGTCAGATGACCCGTCCAAGTTTTCTGTGGATGG
CCGTCGTGCTCCACAGGAACGCTGGGGTGATTCCAATAACAAGGAGGGCA
ACTATGACCAACGCCGTGAGGGCAAGTGGAGCACTCGCTGGGGTGCCAAT
GATAAGGAGTCTGAAAATTGGCGTGACAGGTGGGGTGATTCAGGCAAAGA
GGGTGATGCTTCTCGTGAAAAAGGATTTTCCCAGTTTGGGACACATGGAA
AAGATGGCAACAATCACGATAAGGATACTGAAAGAGATGATAATATCTCT
CGATCATGGAAGTCTAGTCATCCTGTGGGCCGTGGCCGGGGCGATTCATC
TTATCACCCCTCGCAGACTTCACAAAAACCATCTTCTATGTATGGGTATG
GTAGAGGAAAACCAGAGAATGAAATCTCAGCTTTTCCAAGTTCTCGTGGA
AAGTTTACACCCAGTACTGGTAGTACTAATACTGGCAGTACTGGATCATC
ACGTCCATTCCATCTTGGTCTACTTTCTGACAGACCTGGTGGCGCATCAG
GGGATCGCACAGCATTTAGATATAGTAGGATGAAACTGCTTGACATATAC
AGAACAACTTCACATGTTACTGACTTCAAGATGCCTTCTGATGTTTGTGA
GGAAGTGTCCGCATTTATGCAAGAAGAAATGTTGGAACCTTTAGCATTGT
TTGCTCCTACAGCCGAAGAAGCGGTAAAGTTTTTATCCTATCATTTTCTG
AATTATGATAATCTTACTATTATGTTGTAATGTATATGATCTTTATATCT
CACGGTTGTTATATTTGTAGGCCGTTTTAAAAGCAATTGACAAAGGGGAA
GTCATAAACAGTGGTGTCTATCAAGTTTCAAAAGATGGTTCTGTTGGGAA
AAGTAATCCTGATGGGGTGCCTCTAAAACAATCTAAATTAGGTTTGATGC
AGTTTTCAAACTTGCTTGTGGCATAAACATCCAAATATGTTATCACGTTA
TGAATTGAATGTTCCTCCTTTTAACCAGGTGGGAGAGATGATCAACCTGG
AAATGCAGAAGATTTTAAGGGAGAAACAGCTGGAAGTCTCAGGGGTACCA
TATCTTATTCCATGTTTACTCGGTTCTTCTTGTTTAATGCGTGCCACTTA
GTTGGGCCAGTTTCAAGTGATTACATAGGGATGCTTGTGTGTTCAGTTGT
CCATACATAGGGAATTTGTCATTTGTGAAACATCTAACCTATTAAAACTT
GGGAGTCTTCCACATCGTCTGGGTTCACAATTTAATAATCAGTCCACATG
GTTCACATTTTGTTTTTGGAATATCTCCTTTTGTAAGTTCAGGATGATTT
TAGTTCAGGAAGGTTTGTCCATATAACAGTAGTGCGAATTCAATATGGCA
TACTACATAGGATTTTGAAATTGATCTGGAGATATAATACCAGATTCAGT
TGGTGGTGTATCAAGTTGTGCCTTTTGTCTATTTCTCAAAATATTCCTCA
GTTTTTCTGGCAATAAGTTGTTTCTTTGTGTCATATCGGGTTGTAAATTG
GTTGCCAAACTTTAGGCTTGCATGTGTTCTATGATATCTTATTTTGCTAT
TTTGAAGTGCTTGCCCTTTTTTGGTAGTTAACTAGTTGGTATTCCACCAT
TGTTCTTTGCTGAATGTTTGCATAATTTGTATAAATCATTTCTGCTCTTT
AAAGGCAATTGTTGATCTTATAATAGGTGTTCCTGGAAATGTTGATTTGC
TGCGGACAGAGACACCTAGTTATGTTGTTCCACAAAGATCTCGGTTTATT
GGAGACCATAGGCTTGGACCAACTGACTTTCCGCAGCAAATACCCAACGT
CTTTGATCAAGAAAGTAAAGTCGCGTTGACAGGTGTTGATGAGTTGGCCA
GTCCTATTCAACCTTATCCTAATCCAGAAAGTCTTTCATTATGCTACAAA
GATCCGCAAGGTCGAGTTCAAGGCCCTTTTTCTGGTGCTGACATCATTGG
CTGGTTCGAGGCTAGTTATTTTGGTATTGATTTGCTGGTTCGTGTTGCAA
ATGCGCCTCCTGATGCTCCTTTCTTAACGCTTGGGGATGTTATGCCTCAC
CTAAGAGCAAAGGCAAGGCCACCTCCAGGATTCAGCACCACACAATCCAG
TGATATGCTAATGCCAGAGACTGCACCTACTGGGAAGTTTGTCAGCTCCA
GTAGCGCACATGGCGGATCATCTGGTGTTGGTATTTTTAACGGCGGGCCA
AGCAGGAATGGTGGTGCAGTTGAAGCCCAGAATCGTTTTCTGGAGTCACT
TATGTCTAATAGCATGCAAGGTTCTTCAGCTGCTATGACTGGAGGTTTGT
TTACTGGCTAGAGCCCTGCCACTTCCATTTCATATATTTTATAATTATCT
CTGCTACACCCTCCGTCCCAAATTAATTGACTCAACTTTGTCTAGATACA
CATGCATCTAGAAACGTTGAGTGTGTAGATACATGCGTATCTAGGCAAAG
CTGAGTCAATTAATTTGGGACGGAGGGAATACTTATCATGCATACTTTCT
GGCTTGACACCATATTTTTTTGGAATTAGGGCTGAATGAATATAGCAACA
TTGCGATGGCTGGAGGCGAGAGTGGGAACAACATGAATTATTTTCTGGCG
CAGCAAAGATTGTTGGAGAGACAAAAATCTTCCCAAAACACTGTTCCATA
TTGGTCTGGAGATGGTAATCCAGCAACTCAAGCACAAAATAAAGATACAG
CTTCAGAAGTGTCTGCTCTGCACTCTAAAGTGCCCAGTTCCATGGCTGAT
CCATCTCGTCAAGCTCCGCAATCTCAGAATGTTGACTTGCTAGCTATGCT
TCATTCTGCAGAGAAACCTAAAGCACCTGCTGGACTGCCACCATGGTCAA
ACTATCCGGAAGCCAGAAATGTTAATCCTAACCTTCACGTGGATCTCACT
CAAGGGCCACTCAACATGCATCAAAATCTGCAGAATTCTCAGCAAATGGC
TACTCCTGGTCAACAACAGAACTTCATGTCACAGAACCAGCCACCAACTC
ATTTGCCACCTGAGAAGTTGCTTGCTGAGATATCTCAAGATCCACAACTC
TTGCACATGTTTCAGCAACAGTATCTGCTATCACAACTACAGTTGCAATC
ACAGCCACCAGTGACACCTCAGCCTCAGCCACAACTCTCAATGTTGGACA
AGATGATATTGCTTCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTG
CAACAACGACTACAGCTTGAGCAGCAGCAGAAGGTGTTACTGCAGCAACA
ACACCTACTTTCCCAAGTTGCACCTCATGGACATTCCAACCAGCAGCTTG
ATGACCCTTATGGGTCGAAGCATACTTCATTGCCAGCTGGTGATTCCATG
AACCTTGGTGTTCGAAAGATTCAAGATGTTCTTGAAGTTGATCGGATTTT
GACTAACCATGGTACACTGCAAGGGCAACAATCTAGTCAAGCATTTATGA
ATATGAGGGGTATGGAGGGTGTTGGATTATCTCAAAACTCTGTACCTACC
GTGCCAATGCCTCATGAAATTTTTATGGGTGTGTCTCCAAAAGAACGGTA
TTCCCATCCTCAGAAGTCTGGAAATTTTGCAAGTAATAACGCTCAACCTA
GTGCAAGTACAGTCAACCTGATGCTAACAGAAGTTGCAGAAAGGTATGAA
GAGAAGTCTGCTGACTATCAACAAGTTGGAATAAACAAAGCTGAAAGTAA
GCCTGCAAATATTTTGGGTTCAAGGTTTAATGTGGCTAGCAGTTCAGCTC
TTGGTGAAGTTAAAGGTTTTCCTGAGACATCACTGAATCCAATATCGGAA
ATCATGTCACATCATAACCATGTCCAGGAAATGAAAGATACCCCTGATGC
AGTTGAGCTTACTATGGAAACTGATGTAAAAGCTCCTGATACACAAGAGA
CAAAGAAAGCAGAAAAGAAAAAGAAGCAGAAGAAGAAGCAGACAGCTGTA
GATGTTGGCAAAGCAGCTCCAAAGACAGTTTCCCAACAGCCAAGTCTAGA
TGCTGAAGTTGATGGATATAATCAGGGTAGTACTAAGCATGATTTGCCAG
ATGATACAGAGGATCTTTTTTGGGGTTCCCCTGTCAGAGCGGGAAGCTCT
TCTAGATCTGTTGAACCTCCTCTGGGATTTGAATCTTCTGCTAATTTTCC
TCCCAAAAGTCTTCCCGAGGAGTATGATGTCACCAGAGCTGAATGGGAAC
ATAGTGCTCTATCTGAGCCTCATGCTGCGGCAAGTCAAAAAGGTTGGAAA
CCAACCCAAGGACCCAGACCTAAGTCACTGCTGGAAATTCAAGCTGAGGA
ACAACTAAGAGCACAGAGGGTAGCTGCGGACAATGCTAAGATAGCTGTGC
CAGTGATATCCGTGCCATCACTTCCTTGGAGTACCATGTCAGCATCTTCT
GAGCAACAGCTTGGGGGTGCAGGTAGATCACTGGGTGGCCAGGAAAGTGC
TGGTGACTCCAGGAACAAGAGAAGCCAGTTGCACGATTTGTTGGCAGAAG
AAGTTCTAGCAAGGTCTAGTAATGCAGACAATGAGAACCTAGGTAGTGCT
AATGATGTGTCGTTTCCTCCTTTGTCGCCTGCTGTTCAGCCCGATGCTCC
TGCTTTTGATGATAATGACTTCATCGAGGCCAAGGACTCCAAAAAGAACA
AGAAAAAGGGAGCAAAGTCAAAAGGGCCTGCAGTCAAAGCCCCATTGCCT
GTTGGTTCTGTTGAATCAGCAATCTCTATACCCACTGAAAAGGTCAAATC
TTCAAAGCAAGCGCAACTAGAGAAAGAAATACTACCGGCTCCACCAAGTG
GTCCATCCTTTGGAGATTTTGTTCCTTGGAAGACGGATCAAACAAATTTT
GCACCTGCTCCAGCATGGTCCACTGACGCTGCAAAGACGCACAAACCCTT
GTCTTTGAGAGATATTCAGAGAGAGGAAGAAAGGAGATCAGGTGTTGTCC
AGCAACAACCACCCTCACCAACTCCAGCAAAGGTGCCTGTGAACCAACGG
AATCATGTTAATGTTCCTTCTTGGCAAGCTTCCGGGTCTTCTCCATCAAA
GGCAGTTGCTCCTGTCCAGATGAGTTCCAGTACTTCCAACCGCGCCAAGT
CAAATGCTGAAGATGATCTGTTTTGGGGCCCTTCTGACCACTCCAAACAA
GATAAGAAACAGTATGTTCCTATGTTCTTTGTGATGGTTCTTACAGCAGC
TTGATTGGTTTTTTGTTGCCAATTATTTTTATTACTATTAACCCTTTCCA
TGATGTATTGACTATAATCCTTCATAGTGAATAAGTATAAGCGAATTAAT
CAGTACAGTGAACTGCAGAGTTAGCACTACTACTTCTTGCAGTTCTATTT
ACATACAATTGGTCAAGAACTTTTGTAGAACATCTTGCAATTTGCACACT
AGGACTTAACAGTAATTATATTTCTCCAAATTATTTGAAGTTCTAGCTTG
TCCTAAGTCAAACTTCTTTAAGTTTGACCAAGTCTACTGAAAAATGTATC
AGTATGTCCAGTACAAAATTAGTTTCATTAGATTTGTTATAAAATATATA
TCCATACTATATACTCCCTCCGTCCCAAAATAGATGTCTTAGATTTGTCA
AAATTTGGATGAACCTATATACTAAATAGTGTCGAGATTCATCTGATTTT
TAACAAATCTGAGACATCTATTTTGGGACAGAGGGAGTATATTTGTTGTG
TAGGTATTAGCACATTTTCTGTGGACTTGGTTAAATATAAAGGAGTTTGA
CTTAAGATGAAGTTAAAACTTCAAATGATTTTGAACGTAAGGAGTACCTG
ATTTGATTTGTATATAGTGTCGTCAAATACTCCCTCCGTTTCAAGGAATA
AGGCGCACGCGCATTCCAATGCAAAGTTTGACCGAGTAAATAGAGCAACT
AAAATTTGATTATATTATGTAAAATTAGTATCGTTGGATTCGTATTGAAA
TACACTTTCCAATGATGCTAAATTTGTACCAACATTTTTTGTATATTTAG
AGTAAATCTTGGTCAAAGAAAAATCACGCAAAACGAGGGCGCCTTATTCC
TTGGGACGGAGGTAGTATTGGTTTGGTCATGAATGTTCTGCTCACATGCT
TTACATATCCTCTGATGGTAGTTCATAATATACTATCATCTCTTTGAAGC
TCATTTTGCACCTTGCATATCCATACACGCACTTATGAGGTAGCCTAGAT
TTTCCCAGCAAAATTCTCCTGACGGTGTGCTATTCCATTGGCATGTCAAA
TGGGTTATCAGCAAACCTGTACCTATTATGAGAAGTAGAGAATAGAAATG
CCCCATGCATGGATTTTTGAATAAGCCATATTATTCACGTCTAATTTGTT
CGTCTGAACTGCTCAAAGTCCATTGGTTTAGTATGTGCCTGCTTTTTTGC
ATCACTCGAGACTAGATCTTCATATGTACTTGGTTATTTTAGCATTACTT
GACCAATCTTCATATGTGAATATGCACATGTCAACTGGATAATAAGGTGT
TTGTATACTGCTTCATGCTAAAAACATTTAGTAGGTGATACTCCCTCTAT
CCCAAATTAGGACGCATATAGTTTTTAGTCAAAGTCAAAAATTTCAAAGT
TTGACCGATTATATAGAAAAAATATACACATCTACGATGACAAATGCACA
TAATATAAAAATATATTTCATGAAGGTTCTAACAATTCTAGTTTGATATT
ATAGATGTTGATATTTTTTCTACATAGTTGGTCAAATTTTGAAAAGTTTG
ACTTTGACCAAAAACTATATGTGTCTTAATTTGGGATAGAGGGAGTACTA
TTGCGATTGTTATTCTAGCCATTTGCTCTGCTATTGACCTGTAGGATGTC
TGAGTGGATCGGCTAAGTTGAGGATGAGATTAGACCATAGACCACAGTGA
CGAACTTAATAAACATTATTGCTGGATGAATAGGAAGATAGCTATCTATA
CTAGTTATATCTTCTATCTATAACAAACTCAATCCCTAATAGATTGCTGC
CAACTCTACCTATAATTACGGACGGAGTTATCTATACTAGTTATATCTTT
TCTATGACTAACTGATAAGTTGGGCTGCTGCTGCCGCCTTCCACCCTAGG
TCCATGCGCTTCTGGTCTTCAAACATGACGAGTTATTTGTATATGCTTGC
ACAATTAGAATTTTATAGCATGTCTAGGGTGTACATCTGGGTAGTCTGGT
ACTGTACTTGACCATTGATGGCTGGAACATCCTTTCCTATTTTTCGGTCT
TACTACCCATTTTGTTTCTTTTGTATGAAACTTCTCTAAGAGGCTTGCAT
TTTTCTGTATTTAATAGGTCAGAATTCCCAAGTCTTTCAAGTCAGAGCAG
AAGTTCCATGACTAAAGACCAGGCTCCATTGAATCGTCAAAAGTCTCAGG
CTAGCAAGTTGCCACTTTCAACGGCTCCTACTGCCAACCTAATCGGGAAA
GGGAAGACAGAGACGGCAAACAAGCAGACAGGTAATGCTAGTTGGTTTTT
GCTCATATGTTTCTGAAGTCGCTGTGCTTCTATATGTCTTTCTAACACTC
TTATGCTGCAGAGGCAATGGACTTCAGGGATTGGTGTGACAGCGAGTGGT
CCAGGCTCACCGGAACGAATGGTATTAATTCAACACTACGGTAGTTGTTG
CTTAAAACTAACCAATCTTCTGATTTTGTTTATTCCATTTTGCCCACCCA
GATACAAGTTTTCTTGAGTTCTGCATTAAGCAGTCGACTGCTGAAGCAGA
AACCCTTCTCCGGGAGAACGTTGGCTCTCTGGACCGCAATGGCCAATTCA
TCGACAAGTTCCTCAACTACAAGGCCTTCCTATCCAAAGAGGTGATTGAG
ACGGCATTCAGAGCCCCCAGCAACCGTGGCCCTCGTGGGGATGCCGCCTC
ACGTCCGAACCCTGTTCCTGCAGCCAAAGGAGGCCCAAGTGTGGAAGCAG
AACAGGACGCAGGCGGAAAGAAGAAAGGAAAGAAAGGGAAGAAGGTGAGC
GCAGCAGTCTTAGGGTTCAATGTAGTCAGCAACCGCATCATGATGGGTGA
GATCCAGAATGTGGATTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.