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GrainGenes Sequence Report: AA027239

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Sequence
AA027239
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA027239
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTAAATGTATGTTCGCAGACAGATCTTGTAGCTCGGCTGCCTTGGCGTCG
CGTGCTCACTATGGGTACTGGAGAAACCAATCCAAAGAGGCAAATCAATG
AGGAATCCATCATAAACTGCCTTCCAGGAGACCTCATTGAGCGGATATTC
TTGAGGCTTCCAGTTAGCACTCTGTTGAGGTGCGCAGGTGTGTGCAAGCA
CTGGCACAACTTCATCCGGGATCCCCAGTTTGTTACATCACACCTCCAGC
ATGCACACCGTTATGCCCTTCTGTTCTTCCCGCAATGTTTAGTTTCAGGC
AAGCCCTACCCTAGTGATGCTATCCTAATTGATGAAGCCTGGTCACCGTC
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GTAACGGCCTGATTGGTTTATACATGAAAACATCAACAATCAAGATAGCT
AACCTTGCAACTGGTGAATGTATGCATCTTGAGAAACCTGCCAAGAATAT
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GAAATGGAAAGATATCCCAACACCAGAAGCTCTTAGCTTGAACAGTGTGA
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AAGTCGCTTGTTTGTTTGGATGTATACAAGAACGCTGGCATTGTACGTAG
ACCAAAACAGAGGCAAGGCTGGGAACTGAAGAAGTGGGAAGCATGGGAGA
ATGAGCTCCGGGAGGTAGAGAATTTGCGGAGCAACATTGACAAACTTCAG
CATGACTTAATTGTATGGCCAAACTATATTAGCCTTGATGAATACTCTCT
CTTTTTTTTCTTGAAGATTTGACGAGCTGCTAACTTGCCATTTTGTAGGA
AGCCGCAGAAAAAATGGTTAAAATGTATAAGTTTGATAAGCCACGTGACA
TAGCAGAACGTGTACGCATGGAACTAAATCAGGTGTTGGAGCACAAGCCA
GAAATTCCTAATCAGGTAAATTCTCTACTGAAATGATAGAATGAATGCCA
CCATACTTTTCACGTTTTAGTCCAAAACATTAATAATTATTTGTGTGCAA
AGGCATAATAATAGATAAAGTGTGTTGTAACTAGTGTGTTAACATGTGTC
CAATAGCCAAGGTTCCTCCGGCGGCTTAATTGGGTGGAACAGAAACGGGA
CACGAAGGAGTTAGTGTCGCGTTCAAGGAAGGCGAGAGGCAGTTTTCAGG
TACAGTGTGATTGCATTTATTGATTTGCTAGCCAACATTAATTATGACTT
TTGCTGAAATATGCCAAATTTGAGAAAAGTTTACCTTTTTATAGGCCATT
AAGCAGGCACAGGATAATATCTCTAGTATTGTAAGAAGTCATACATTGGA
TCAGGTAAACTTTTGCCTGGCTTCCAACTTCTAGGTTATCCGTGGTTTCT
GCTAGTTTGTTGGTTCTTTTGGTGACTTACTGGTTTCGTTTACCATAATA
ATTAATGCAATTAACTTATATTGAGAAATACGCAACTTAGCCCTGCTCTC
TCTATTTATATAAATGAATGACTTCCAAGCTTGTGATTACTTTCCATGAC
AAATGTAATCTTATACATTGCAAACCCAACATGCATATAGAGGTGCATGC
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CAACCATGGAGATCTAAACCAAAGAATTCTGTGAGTTGCAAAGAAAATTA
TATTCACATCGGTTACAAACTCTCATCTTTATTGTTCTGGTTTAAATGAT
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CATGGGATGAAAGGTACAAACACTTATTTATATTTGATAATCTGATCCAT
ATTTACTTTTGGCAGGGTATTTCAACTGCTGAAGTTTCTTCCACTGGCGT
TAAAAAGAACGAAGAAGGGAACCTTCCGTGTAAAACCTAGCTTTCTTGGG
CACATCTTATTCTTGCCTGAGTTCAGTCCTGATGGGTTTTGTAACTTCTA
AGAGGTGGATTAGATGTGTGCAACCATCGGTCACGCGATGACGTGGCGAT
TTGGCCTTCTGTTACATCGGTTACTTGTTACATTGCATTTCATGTTTCTA
GCTGTGATTTTGTAAGGAGATTTTAATCAGTTTGCCATGTTCAAAAACTT
GAGATGTTGCAAACTTCGTGCTGGGTTTCTGGTGCTATTACTGTTCTCTG
ATGCACTTGCTATTGTGAATAAATATCTAGCAACGTTTATCCGGGGAAAT
TGTAAGGGTCGCGTCGTCCATGGATTCGGACAACCATGTCTTCACATCAT
GCAGCGGCCTGCTCTGCTTCTACAGGAAGTACTCTCTGAAAGTCTGAAGA
TGGTCAAACCCACGACTGGGCGATGCTTTGCATCACTCCAGACCTGACGG
AAATTGTTCCTGTACTGCTTCAGGTTCCACCCTACGACAGGGGAGTATAA
GCAGATATACTTCCTCTGGGAGCCCTGGCACGGCAGGTCATCAGAGCAGC
CGTTCTGCTTCAACTCCATTCAGGTGTACACCCTCGGCAAAGACAGTTGG
AGGAACGTCAGAGCTCCCAAAGAGAGCAGCCTGGTGAACCTGGGAGTCGT
CAACATGGAGCGATGTACTGGATCACGGAGAAGGTATGTGCTGCGGTGTG
GTAGTCCGCGGGGAGAAGATCCTGCGAGGGTGCCGCGTTCTGCCGGGATC
TACAGGGTGACGATATGCAGGTTGGGGACTGCAGTGAGGTGGCAGTGCTG
AACTTCAGGCCTCACACGTCCTACTTGTACAAGTAAACCGTTGGATGTGT
ACGCTAGGGCGGCCGTTGGCCATTGTTTGGTCACCGCACTGGCCTCTCGC
TCCACCAGGTGTCTGATATCAATGTAGCGAGACCATGAAGTTTGAAGTTC
TGGCAGCCTTGTTTTCTGAATTCGTGGTTACAATTCTGCATTTGCCTTTT
GAGGTCATGGTCCAGTATTGAAAGATGTATTTCGTATCTTTTGAAACTTG
ATCATGCCTGAAACATGAGTGATGCATTTCTGACGTAAATATTGGCGGAG
TTCTATGCAACTGCCATCGTAGCATATTCAGAACTATTTTTACTGTACTA
TGCTGTTAGCTTTGTTCATTCACTCTAATAGATTGTGTATCTTTTCTATA
TTGTACCCTGATACTGATGAAAAATGAAGCTTTGCGCTTCCATCAAGAGA
GAAAAAAAAAATGCACCGTTGACGTCGAACTGACCTTTTGTTGTCGTTGT
TTGAGATACAGAGTACCAAACATGATTACAGACTTCAGATTTTCTCTTTT
GTGATGAGTGCATACATCACATCTAACCAAAGTTTCATAATATAGTTTTG
AAAACAAGACTTTGTACAAATTTCTGCGCAACAGAAAAGAGAATATATTT
CAGGATATACACATATTATACCCTAAGCTGAGATCAGAGGCAGTGATGTA
AATTATTTTCTGCAAGTGTTTTTTTTTTTTTGAGAATTTTCTGCAAGTGT
GCAAGTGTATGTAATGCAGAAAGGCAGTGACCTAATATTTTGTTTAACTG
GGCCGACCATGGGCCTCCGCGCGATAAGAACTACTCCTCTCGTTCCTCCT
GGTCGAAACCCCGGAACCGCCAACTGCAGCCGCCGAGGATGGGGGAAGCG
GCGGAAAATCACTTCACCGCCTGAGGGGCGGCGGGGAATATCCATCCACC
GTCAAGCAGAGAGTCCTTGCTTTGCGGCGACAGCGGAGCTCGCCTGATCC
AGTCGTGCTCGTCCATGTGAGTCATCCCTTCAATTTCCACTTTTTACCTG
TGGATGCTTCACCCCCCACCCGTTGCTCTTCTCGTCTGCGCCCCTCCATC
TGTAATGTCAGCTAGGGTTTCTACTTTCTAGGAGTAGTAGTTAGTTGAGG
GATTGGGGCGCCGGATGGAGGGTGCACTTATGTTTGTTGGATTTGACAGT
CTAGTTATAAAACTGAATGAATTTTGGGTAGATTTGCTAAATCGCATGGT
AAAATCACTAAATAAATATTGAGTTGAATTATAAGAAGATTGGTTCACTG
GGGAAAATTTCTGGTACATTTTCAAGAAACGAGAGTGGCCTACAGTACAC
TATTAGACAGCCTCGTACATTGGAAGTATATACCGTAGACACATATGATC
AAAAGTATCTGGGCTTCTCTTTGAACAACATTAGGTCACATCCATTATCT
TTGCCTACAAGTCTTGTTTCCTCACTAATCATGCTGATGATCCATTGCCT
GTATCAACGTCATGAGGAACTCTACCTTGCTGCAGGCATGTGGGCATTTA
CCTTTTGTATACAGTTTGCTATTGAGGTTGTAATCTTTAGAATCATCTCA
CAGACTGAAACCTGTACAGAGACTCACCGTATTCAGGGGCTGAAACAGTT
CAGTTCTCGTTGTCCAGAATATGCTCCATTTATCTATCCTTTTATACCAA
GTTAAGAAGGAACAAACCACTATTTTTAACCTGAAGCTCACTGGAATCAA
ACACGTCAGATAAAGATAACTCCTAGCTCCAGTTACAGTACCTACTAACT
GTAGTTGTTTCGCCAATGGCCGGTGACTTCTATACTAAGTCCAGGCTACA
TACAGCTTGCTCGGCACCTGGGCGCCGATGTCCCCGAGATCTCCCCTGAC
ATAAGTATCAGAGCTAAACCCGAAATAATGAGTATGTGGTAACCTTCTTC
TCTCCCAAGACGCTTTGGAGTAGGCGGCACTCCGTGCCCTTGTCGAGCAT
CATGGAGAAGAGGGAGGAGGCCTGGCGTTTGGCAGAGACTCGGAGGGGCT
CTGAGGCTCGTCAGTGACCAGGGCATCAAAAGAGGACGGGGGCGAGGAGC
TCTACGGGGAGGTGGAAGGAGTCCAGGTCGCACAGAAGGGCTTGCTGCCG
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CTGGGCCACATAGATCGACGCTGAGCCGGAAGCCGCTCTGCTAGGGAGCT
AGGGACTCGGGGAGGCGTGGCGTGGAGATGATGTGTTGTGTATGTCATAG
GTAGGAGCCGATCGTGCTGGAGCAGTTCGCGTTCTGATCAGAAACGCCAA
ACTGAACATAGCACAATGCCTACCTTAGTGATCACCAAGTGATCAGGTGC
GCGAAGGACAACGGACGAACGGCGCGACGTATGCACGTACGTACCAGAAG
ATCCCAATTTAATAGTAAAGATTGCTTGGCGAGCAGGAGTTTATTTTGTT
GGTAAATTATTTTGAGGGCAGAGAGTTCGGATGCTATCAGTTTTTTCCTT
GGCGCATTGTTTGGTAAATAAATCTTGGAATTGAGACATATAAAATGTGC
ATACATTTGATGTTCTTTCTTTGCCCATAAGTCAATTAAATATCAGTTTC
TAGTAGTTTTTTCCTTGGCGCATTGTTTGGTAAATAACTCTAAGCAGTAT
GCTCTGTCTCATTTATTGAAATTTGTGTTTGCAGACGGATCTGGTAGCTC
GGCCGCCTTGGCGTTGCGTGCTCACTATGGTTACTGGAGAAACCAAATCA
AAGAAGCAAATAAATGAGGAATGCATCATAAACCGCCTTCCAGAAGACCT
CATTGAGCAGATATTTCATAGGCTTCCACTGAGCACTCTGTTGCGCTGCG
TCGGTGTTTGCAAGCACTGGCATGACTTCATCCGGAATCCCCAATTTGTT
ACATCACACCTCCAGCATGCACCCCATTATGCCTTTCTATTCTTCCCACA
AGGTGTGGTTTCAGGCGAGCCCTACCCTAGTGATGCTATCCTAATTGACG
AAGCCTGGTCACTGTCTACATATGCAGTACCAGTGATTGGGCCTGAGGAT
CTGCTTTTTGGTTCGTGCAATGGCCTTCTTGGCCTATACACAAAGACATC
AACGATAAAGATAGCTAACTTTACAACTGGTGAATGTATGCATGTTGAGA
AACCTGCCAAGAATATGAGAGGTGATCACTTCTCTTTCTATAGCTTTGGA
TTTCATCCTGTGACAAAAGAATACAAGATTACGCACTTCCTTGGTGATTG
GGTTGAGGGTCGCCCCCGTAATGAAGACAAGTCCAGCGTTATTCAAGTTT
ACACGCTTGGTGATGACAAATGGAAAGGTATCCCAACACCAGAAGCTGTT
AGCTTGAACAGTGTGAGAAACACTGGGGTTGTCAATGTTGATGGCACAAC
GTATTGGTTAACTGAAGATAAGAGAGCTAGCTGGCAGCACACACTTATGT
CCTTTGATCTTAGGGAAGAAAGTTTTGAAATGATACAGCTGCCAGCAGAG
CGTGAAGATCATGATTATTTTGGTCCTCGTAAGTTCTGGATCAGAGATAT
AGATGGGAAATTATGTGTTGTAACTGCTCAAACTGGTCATTATGATGCCA
GAATTCTTGGTGAGCTGCAGATCTGGACACTTGACAACCCAGTAGAGCAA
AGGTGGAGCCAGAAGTACAATATTAAGAATCCACCAAATTACATTCCAGG
TCCACATTTTGTTCACATTGATAGGATCCTCGCACAGAGCCGCACCAGCG
TAGGTTCGTATGAGGTTATTGGTGAAAACATTGAGATTAGCTTCAGTAAA
ATGGCAGAGCTGTTTGATTTCAGCCCCCGCAAGCTGTACAACATGCAATC
CTTCATCTGTGTGAAGTCGCTTGTACGTTTAGATGTGTACAAGAAGGCTG
GCATTGTGCGTCGACCAAAACAGCAAGTAGGCTGGCAATTGAAGAAGTGG
GAGGCATGGGAGAATGAGCTTCGCGAGGTAGAGAAGGTGTGGAGCAAAAT
CCACAAACTTCAGCATGACTTATCTGTATGTTGGCCAGACTTTATTAGCC
TTGATGAATACTTTTTTTTGTAGATTTGACAAATTGCTAACTTGCTATTT
TGTAGGAAGTCACGGAAAAAATGGTTGAATTTTATCAGTTTTTGGAGGAT
AAACCACATGAAATTGTAGAACGTGTACGCACGGAACTGAATCAGGTGCT
GCAGGAAAAGCCAGAAAATCCAAATCAGGTAACTCTATACTGAAATGATA
GAACCTATGCTACCACACTTTTTCCATTTTAGTTCAAAACATTCATAGTT
ATTTGAGACCAAGGCATAACAGTATTTTAAAAAAGACTTGGTCCCCTGGT
GCGTGGCTGCGCACCCCTTACCTGCCCGGCACTTGGCCCATCCAGTCAAA
CTAGCTATGCCATCTGAGTGTTTACCCCCAGCTAATGGGCTGACACACAA
GCGATTAAAGCCATTTGAATTCAAAAAGGGGACCCTCCACCCATGCAGGC
ATGCAGCACCTACTACTGCCCTACTAGTTATTGAAGGGGCAGCCCCCGGC
TCAGATCAACGCAATCATGACAACACAGGCTGAAAATGTAGAATGATAAC
GCTTTTGCTGAAGGACCCACTTGATCCCTTGAGCTGATAATGCAAACATC
CAATTTGCATTATGGTCACACATGCTTGGAGCAGCACCACCTTGCACAAT
TCCACTCCCATGTCACTATTTAGAATCACTCGATACCAGCCCTACTCACC
GTTTTTCTACCTTTTAATTTTTACACGTGAATCATATTATGTACTGCAGT
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ATGAAACTGGGCATGTCCATGGAGTGCCCGCCTTTGGCCGCATCAGCCGC
AAGGACGACATGCAGGTGCTCATTTCCGCCATGCATGTAGGCTAAGCAGG
TTTAGCAGGCCAGGCGGACGTTTTGCGGACAGCATACTAAAGTGGATCCT
TGACTGACCGAGAATTTTAAGGCAATAGTGTGGACTGTGGACAACAGTAT
GATGTCTTTATCCACCGGGGCAATTCTTTTACCAACGAGTCAAAGGGGTC
ACGTAGCATCGAAAGAGTCACAGGTGGATTCAGAGTTCTCCCTTCCCGCC
ATTTCAACTATTGGACCCGCCAAGTTGTTAATAGTTTCCGCTGGAACAAG
GAATGTGCGCCATGTCCTTTTGCTATGCCGCCGAATTAAACAGCTTCCGC
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TGATTTTTTTACGAGAATCGGACGGTAACTAGTGGGTGTGTACCCACTAC
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ATTGCGAAGGAGTTAATATTAACATTATTTATGACTGTTGTGGGATATGC
CAAATTTGACAAAATGTTACCTTCCTACAGGCCATTAAGCAGGCACATGA
TAACATCTCTAGCATTATAAGAAGTCATAAGTTGGATCAGGTAAACTTTT
GCGCGGCTTCCAACTTTTATCCATTTTTCTGCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.