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GrainGenes Sequence Report: AA022057

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Sequence
AA022057
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA022057
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAAAACTGGGCCTAAGAATCCGGGTCGACTGCGCAGAACCAAAGAAGC
TCGGAGGAAAAGGCGAACCCAACCCTAACCCGAACCCTATCCCGGGGGCT
GCTCGTCCTCCTCGCCGGCGTCGGCGATGGAGATGGTGGAGTCGGAGTCG
GCGCAGGAGCTTCCATCGGAGGAGGAAATGGCGCTGATCCGAGACATCGC
CGTCGCCGCGGAGTCTCATGCCAAGGAGGGCGACATCTTCTTCCTCATCA
CCAACAGGTCCGCTGCCCGCTTCCTTCTCCTACTTCTCGATCTGGTCTCG
GGTTTAGCCTTCTGCGTCGCGCTTTGATTTGAGGGACGCAGTTCGCAAGG
CTCGATTTTTTCGGTTGTCCATCTGCTGTTGTTTCGGTGGGCGGAAGGCC
CTTACGGATTCTAGGCTGGGCTACAACCTACAACTAGCGATTTGTAGGTA
TAATGGTTAGGGACTTAAGCCAGCTGGATATGGTGATTCCTGCCTCTGCT
TGTTGCTTCTCCCCCGAATTGTTGGTAGATACGTCCGCCTAGGGTGCGTC
TTTGTTGCAGATTCGAGGGCGTTTGCTGAGAAACGCAATGGGATGGTGCT
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ACAAATTGCTTCTGGAAATTCGGTAACTGCAGGACCGGTGTAGTGGACAT
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TTGCGGACAAATTTCCTGTAGTACCCCGTTAGACCAAGAAATCCCCGCAG
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GTGGGTCAGTTGCTACCCCGTCCGCCGAGATAATACGGCCAAGGTACTCC
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TTGTCTGAGCAGGGTCAAGACCTCTGTGAGGTGTTGGACGTGTTCCTGAA
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AGCGTTGCACAAGCCAAACGGCATCACCCTGAACTGGTAATGACCATGAT
GTGTCTTGAAAGCCGTCTTGTGCTCATCCGCTGGCAGCATGCGAATCTGA
TGGTAACCCGCCCTCAAGTCCAACTTAGAGAAAATCTGTGCCCCGGCCAA
TTCATCTAATAACTCATCTATAACAGGCATGGGAAAAGTGTTTTTGACTG
TGAGCTCATTCAGTCGACGGTAATCAATACAAAAACGCCAGGAACCATCT
TTCTTTTGGACCAACAGCACAGGAGACGCATAAGGAGACATGCTGGGCAC
AATGGTACCAGCCTCAAGCATAGCTTTGACTTGTTTCTCAATCTCATCTT
TGTGGGCAGGAGAATATCTGTATGGGCGTGCATTGAATGGAGCGGCATCT
GGTTTGAGAGGAATGGCATGATCGTATTCACGTTCAGGAGGGAGCTCAGT
TGGAGTGGCAAACACATCAGAAAATTTTTCCAGCACTTCCCTGATTTCTG
GAGTCAACTGAGAAGGTGCACTATCACCAGCAGGTTGTATAATGGCCATA
GCCCAGATCTCATTTCCTTTATACCATTTAACCAATTGTTCCACTGGTAG
CTCCTTGATAGAATCTGGACTTGGTGCTGCTATGCCGGTCAGTGTGATGA
ATTTTCCCTTATGGGAGAAAGCCAAACGATGGTTCTTCCAATCAGTGACC
ATTGGGCTGTGTAGTTCTAACCAATCCATGCCAAGGATGGCATCATAAGC
TCCCAACTGCAACACTCTCATGTCAGTGACAAATGTTTCTCCTTGGCACC
ACCAAGTTAATTCAGGAACAAGCTCTGCACACTGCAGGTAGGAGCCATTT
GCTATTTTGACAGATACTGAATCTGTCTGTTGGACTTTGCAATTTAGTCT
GTCCACCAAATTCTTATTCACAAAACTGTGGCTACTCCCTGAGTCTACCA
AGATGACCAGAACTTGGTTGCCAATCATAGCCCTTAGTTTAAGTGTCTGA
CACCCTTCAGTACCATCCATAGCATGAATCGACAGACTCAATTGCTCTGT
TTGTGCCAGATCCCGCGTCTCAATCATGTTCAACACCTCGTCAGACAGCA
GCTCAGCCTGTTCCTCTAACTGCACAGCATGAATTTCGGCTCCTGGTTTC
TTGCCGCATTGGTGCGCCGGATCAAACTTATCACCACACTTGAAACATAG
CCCATTGGTACGCCTGTAATCGCGCAATTGCCTGTCACGCCAAAGATCAC
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ACGTCGGTTTTCAGGTATGTGGCGGTCTTGGATGTCCACGATTTGTTATC
AGCAAACACTTCCTCCTGAACCAATGCCAATAGAATGGCGCGAGCAACTG
TTGCTGGAACCTGAACTTCCACAGCTATCCGAATGTCAGACTTCAGACCA
CGAATGAATTGTGTGACGAAGAACGTCTCATCATAATTTGGGTTCTGAAT
AGACACCAAGTACGACAGTTCCTCGAACTTGAGCTGATACTCGGTGACAG
AACCACGCTGTTTGAGGGCTAAAAGCTGTTTCAGGTGTTTGCGGTGCTCA
TCGGACCCAAATTTCTCAGTAACTGCCGCCACGAGTTCGGGCCAGGTGTT
GATTTCATGGCGGAGACGGTAGGCTTTGAGCCACAGTGCAGCGTTGCCGT
CCATGTGCAGAGTTGCGGACACAAGCCACAGAGAGGGATGAACGTTGAAC
AGGCGGAAATAGTCCAAACATTTATCCTTCCAAATCTTCGGCTGCTCGCC
ATCAAACCTTGGGAAGGACATTTTCAGATTATGCTTCAGAGAAGGCTCGT
CCTGGTGCCCATGTCTGCCTCCACCAGCACCCCCAAATCCACCGCCCCAA
GCGCCCCCAAGCACCCCGCCACCGGTTCCGCCAGTTCTACCGCCGCCAGC
GCCCCCAATCACACCACCACCGACGCCTCCCGTGCTTCGTTGTACCTGAG
TGGACGCCGACGCACCTGGAGCATCGTCGGACCAATTAGCGGTGGTGGGA
TGAAGCGTACCCTTACTCGTCGGTCGCATATCCGTGAGATCAGGATCCTC
CTCGATTGGTGATGGCGACCGTGCGTAGTGCTCCAAGCGCTCGAGAGTAG
CCGAGAGCTTATCATCGAGAGCCGAGATGTGCCGAGCCGCGTCCTCCTGG
GCCTTCGAAGTGGCCTGGACCGCCTCCGAGATGAGTCCCATCTGGACGAC
GAGCCCTTGCTGGGTCGTGTCCATCGTCGCCACGCGCCCGTGCAGCAGAT
CGACAGCTTGCCTGCACTCGGTGAGGGCTGCGCCCGCCGTTGCTGCCGTC
TTGCCCATCGCCGCGAGCATGAGGAGAGTCTGCGGAGAAGCTTTGGGTGG
CGCCGTGATGCTCCTCACCGGCCGGTACCAACCACGCCCCAAAGTTGGTG
GGATTTTACGGCACTTGGCGCAGCGAATTGGGAGAATCGACAACAACACG
CCGCCGTGGGGATGAGGATTGTTACCGGACGAGCGATCCGAAGACGGCCG
TCCGAACCTGTCGAACCCGCGGAGCACTCCCAGAACCGGAGAATCTGATA
CCAAGTGTACTGCACGCTAGTAAGATGGCTAGCGTGGCAGGATGATCTTC
GTGGAGAAGAAGTAGAAACAGAGAAAAGGGGGAAAGAGCGACAGCGAGAG
AGATACGTCTCAGACTTTTTCTTTCATTCAGATCATATCCTCCCATTACA
GACTCTTTGGTTTAAGTAATGACGTACTCTGGCACGTAGGCCCCACCACA
CGCACACCTCTGTGTCACCAGCTGTCGTACCTGACCCGCACCTGGTGACC
ACCCGAACATCTAAGGCTTGCCGTTCGTGACAAGGTGCTGACCGCTTCTA
GGGGCACTGGCAGGAATTTAGCGTGGCCGTAGTTTGCAAAATTCGTAGTT
TTAACATTTTATAAAATGGTAAGCTGTTGAGAGTTAATTCGTTTTATTAC
ATTTTCAATCTTAGCCATTATCGAAAGAATTGCCTTTGGTATCTTCTGAT
CTATCGCCATGTTATTGGAGCATTTTTTTAGTATAGTTTTAGCTGCTGGT
AAGATCCTTATATAACATAAGCGATTATACCCTCGGCGAATGTTAGTTAG
CTTCTAACAACATTCATTTGTATATGCAATTTATTTGGCAGATCGCTTGA
TTTGCATGTTTTATACTGGCTATACAATATAGATAGAACACACGAGAACA
CCTAATTCAGACATCTTCTGAAATGCAGATTTACATAAGATGCACATCTC
ATCTTTCTGATCCTAGCCTGCCGCTTCATTTTTGCACTCTTCATTTCTAT
CTTAGACACATGTTTATTGGTTGAATCAAATAGGTGGTGGCAAAGTTGGA
TTGAGTATGTCATTCAAGATTCGGCTGGTGTAACAAGTAATGGTTCTCAT
CAACATGAGTGCAGTTCAAGTACTCTAAGAAGGCCAGGAGCTATTGACAA
TACAGATTTATTGGATGACGTGGCATCTGAAGTCTCCAGTATGGATATTG
AGCTACATGATACCTTGGTTGAAGGCCGTGATTACATATTGCTCCCTCAG
CAAGTTTGGGAAAAACTACATGGTTGGTACGTCACTTTTGTTCAGAATGT
AGAATCTGATTCCCCAAATCTTATGTTCTCCAGATAAATCACATTTCTAG
TGCCACTATGAGTTTAATTCGTGTGATCTTTTTTCTTCTTGTGGTTGCTA
CACAGCTTTATGTAGCTGTTTACCTTTGTTCTTGTGCTATCTTATTTGAT
TCGACCGACTAATTTTGCAGGGTGTTTATAGTAGCCCATATATACCTGTA
TTACTGTATACTAAATTCATTCACTTTCTTTGACATGCTTGGTCATTGTG
TTAGTAAGTTATATTGGGACTGTCCTTTAACTCAAACCATTTCTTGTAGA
AGGTTACCTAATATATTCTTTTTCCTAAAATGGGTATATGGAGATATTGG
TGATTAAACAGTTTTTGGTCACATTATCTGAATCTCTCAAATACTTGACA
AGTGAAGGCACTGTTCTTATCTTTATAACAATTGTTTTGGCAGGGAGAGA
TTTCGTAGAATCTGATGGATAATTATCTGGATGTTGTTTGTTGCTGGTAA
ATAAAGACACAGAACACAATATATGCAAACTAGATAGATGTCATTAAGCT
ACCTACTATTCGTTAGTCAAGAAGATTTCATCTACTATTCATTTTATCCA
AGAAGTTGAAATCTTCTCTGGCAAGCAACGCCTGTTTTTTGCATGCTTGA
CACAGTAAATAATGATGCATTGATGTGGTGTTTGGTATTTGAGTGCTGGA
ACTCCCACTAGAAGAATGTTAAGTGGGAGTCTTAGACCTTGTTGGTATTT
ACGTTTCTTTTTTTTAATTATTATTATCAAAATCCATTAACAGGTATGGT
GGAGGTCCAATGCTACAAAGAAAGGCAATCAATACTGGCTTGTCTCAAAC
TGATCTAGCCATAGAAGTTTATCCTTTACGTCTGCAGTTACTTCTGATGC
CAAAAGGAGAAGAAGCTGTAATAAGGATAAGCAAGAAGGTATGCTTTATG
TCTTCTTCCACTGTTGAACAAATCAAACAACTTTTTATTTCCACTTATTC
AGTGAAATGAACTATCTAAAATATGAGATGATAGATCTTTCTTAAGTAGA
ATTTGTGTTCTCATTTTAAAAGTTCGCTAGGTGCCCCCCCCCCCCCCCCC
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GTTGATGAACTCCATAAGAAGGCTTGTGAGGTTTTTGATCTGGTACCAGA
TGAGGTAGCTGTTGTATTTGAATATCTACAGCTATGGGTTTACTGTGTTT
ATAAGTTTTGCTTACTCATATGGCTATTATTTGCAGGTTTTCCTTTGGGA
CTACTATGGTCGAACAAAGAATGCTCTGATGGATAACTTGGAGAAAACTC
TTGATGATGCCAACATTCAGATGGATCAAGATGTGAGAACTGGACTTAAC
ATCATTGTTGGTAGTTGTGAGCTTTACAAAAATATTCTTGACTAGTGCTC
ATCGCTTTTTGTTTGGTGGTAGTGTCACTGAATTGTAGTGCGATTATGTC
GGCCCGACTTCAGAGTAAATGATCCTAACTATGAACTGTTTATCTTATTA
TGGCAGATTCTAGTTGAAGTTACTACTGATGCAAATGGTAGCTTGGATGG
TGGTTGCATGAGTTCGACCCAAGAAAACGATTATGTTGAACGATCATCAA
CTTGGATGGTAGATGCTTCAAAATCAGGATTCGCAAGTGAGAATTTGGCA
TCAATCAGTTACGTTTCTAGAAGCTACAGCTCTAGTCTCGTTCAAAGTCA
GTATCTGCGATCTTCCAACGGTGACTTGGATAATGTACCTGATACTGTTG
GTGTGACCACCAGGGGATCTTCATCAGGTCTTACTGGGTTACTTAACTTA
GGAAACACATGTTTCATGAACAGTGCTGTACAATGTCTCGTGCACACACC
AGAGTTTGCTAGATATTTTCGTGAAGATTACCACTGTGAAATTAATTGGC
ACAATCCGCTAGGTATGGTGGTAAGTAATCTTTCTAGCACAGACTTTGAA
ACCTAATTAGCCCTTATTTGGTGAAACTACATGACATTTCGTATGCATTC
AGTGTAATTTTCTGGCCATGATAATATTGGTAAGAAATACTCTCGATTGT
TGATAATATGGAACATGAAAGTAGTCAAATACTTGATGTGTGCTATAAAA
GTAAAATATATGCCCTGTTCAGTTAAATTTTAACCGCTGTAGTATTTCTG
CTATAATTTTGAGTGTTATGGTTGTTCAGATTCGTAATGTGTTCATCAAA
AAAAGATCTGCCAGTTCTTCTCAAACGTGGAGGAAATTTCAGTGTTTTCA
TCATCGTGCATCTGGTAGAGTGTGTCCTTTCTCTTCTTACAGTAGCTTTT
GTCTGGTTAAATTAAACTATATAGTTGTGTTTTAATTTTTAAATCGAACT
AGCTGTAGTTTCTTTGCAGGAGAGACGAAATCTCATTTTTATTTCCTTTT
GACATATCAGATATCAGAATGATTACACATAACAGTTGGTACAGATAGGT
AGCTTTATGGGAACACCCTGAAGCTCTAATACAGCAATGTTACGTGATCG
TACAGAAATAACTTCGCTATTATTTGGTGATATGTTTTTCTGGTCTCATG
ATCATTTGCATCTGTGTGCCATGTTAATTGTACTGAGATCTGATGGTAGT
CTTGTAGGGTGAACTTGCGTTAGCTTTTGGGGAGCTGTTGAGAAAACTTT
GGGCTCCTAGCCGTACCCCAGTTTCTCCACGACCATTTAAAACAAAGCTT
TCTCGGTTTGCACCTCAGTTCAGTGGATACAACCAACACGATTCGCAGGT
TTGATTCTTTAGTTGGATATTTCTTTTTTGTCTGCAGTTTTCTTAATCTA
TGTCTTGGGGAATTCATCCAGGAGCTGCTGGCATTCCTCCTGGATGGACT
GCATGAAGACTTGAACCGTGTTAAACATAGACCTTACTTAAAATCCAAAG
ATGCTGATGGACGATCAGATGAAGAGGTTGCTGATGAGTATTGGGCAAAT
CACATTGCCAGAAATGATTCTATTATTGTTGATGTATGCCAGGTTAGTCC
CAAGCGGCCAAACCTGTATGATTCACTTACTCGATGTTGTAGAGAGGTGG
TTCATTGCCTTATGGTCATGTTTTAAGTTTCTTGCAATATTTTTGGGTTT
TTTTGTACAACTGTCAGTTTAAAGTGGTAAAGTTGGATGACCTGTGCTAG
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AAGAAAGATTTGCAGTTTTTGTGTTTTTGATATACAGCAAGCTAGCACAC
AGATAAATGGTTAATGCAATGCTCCACTGCTTCTGCACGCTAAATGAAAG
GTCCGCAACAAATGTTACAATACTCATATTTGCTGTTAAGTATTTTTCCG
CAACAAATGTTACAATACTCATAGTTGCTGTTAAGTATTTTGAGTTTGAT
TTTATGTTTGTTGACTGGTCAAGCACTTTCAAATGCTACCCAATGCAGTA
AGCTTGAGACGTCTGGCATGAAATTATGGTGTGTTGATTTCTTATTGGTG
GGCAGAGGTATTTTGCTAAACATAACCACTTAATTTCCAGGGACAGTACA
AGTCAACTTTGGTCTGTCCAATTTGTGGAAAGGTTTCAGTCACATTCGAT
CCATTCATGTATCTTTCCTTACCCCTACAATTTACTTCAACACGAAGCAT
GACCATTGTGGTCTTCACTTGTGATGGAAGTGCTCCACCAACACCATACA
CTGTAAGTGTACCCAAGCAAGGTAGGTGCAGGGATCTTATCCAAGCCCTC
ACAAATGCATGCTCACTGAGAAATGAAGAGAGACTTCTAATTGCTGAGGT
TTGTTACAAATGCCCATTTGAACAAGAATATCTTGTTGTGTTTCATCGTG
TAAGTGTATTTTCCCTGTATTGTATCTGCAGATACGTAATCACCGTATCC
ATCTTATTCTTGAGGATCCAGTACTTCAGCTTTCTACAATTAAAGATGAT
GATCATCTCGCAGTTTATAGGCTTCCAAAATTGGAAAAAAGGGCGAGTTA
TATTCAATTTTTGCATCGTCGTGAAGACTTGTAAGCAAAGAGAAAAGACA
CAAGCTACATTTTATTCTGCTAGAGTGATTAACTGTAGTAATTTGCTTAC
CATGCCATTACAATTTGCTGTAGACATGCAATTGGGAAGGCAATTCTTGT
GCGTCAAATTCTTATACTATATAAGCTTTGCTTCTGTAGGGACCAGGAAA
ACAATAGCAGCTCAACCTCTTGGAAACCATACGGTGTTCCTCTTCTTGCA
CAAATCTCTCGGAATGTAACTGTCACTGGTTCTGATATCCATGAGATGGC
CTGTAAAATGCTTTTTCCCATGTTAAGAAATCAGGTGGCACAACATTCGG
CAGTTCAAAGTTCTCTTTCCACAAGAACGCAGAGTTATCATACCGACAGC
AGCACATTTCAGCTACAATTGATTGATGATAGCAACACAGTGATTGAGCA
TACGAATTATGCCATCAGGGTTCCACAGTCTTCACTCGCAACTGTAATAT
TCATCAATTGGTCCAAGTCAGATCTTAAAAAGGTTAACACTAATCATTTA
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TGGCGAACCTCTCTCACTCTATGCATGCTTGGATGCTTTCTTAAGAGAAG
AACCACTTGTTCCCGAAGAAATGTGGTTAGTTTTCATTTTTAATTCCTGA
AAGATACATTTGGTTGCTTCAAAATATTTTGTCCACCCAAGTATTGCTTA
ATGCTAGCTTAGCTGATTCAGTTTCAGTCTTCATAGGGGTTGTAATATTT
CAAGTAGTAGCTGTGTGTCTGCATTTGCATTTCAGTTGATATAACCTATC
TCATCCGCTTAAGATTTAGTATTTCAATAGATACCTTGCATTACAGAATA
TGAAATTTCTGAAGTGATAAAATCCTATAAAATGTCAGTCCCCTCTTTGA
TACAGATAATAATTGTTCTGTTATTGTGCTGTGCAATGACCTTGAAAGCA
TTACTTTTAGCCTATTATAGATTATCAGAAGTGCAATTTAAATCCTTCAT
TTCATTGCCTGAGATTTGCTGAAAATGATTAGTTACATCATATAACAGGC
ACATGCTAACTGTTCCTCCCTGGTTTCTGGAACCTTAATTTTACAGTTTA
GTTTAACAAAGTTATGTTAATTGGATTAGGTACTGTCCAAGGTGCAAGGA
GCAAAGGCAAGCTAGTAAAAAGCTTGATTTATGGAGACTACCAGAAGTGT
TAGTTATTCACTTGAAGAGATTTTCGTTTAGTAGGTCAACTAAGCATAAG
CTGGAAACTTTTGTTAATTTCCCAATACATGACTTGGATTTGACAAACTA
TATTGCTAACAAGATCTCTCAGCGTCAAATATATGAGTTATATGCTGTAA
GCAATCATTATGGCAGCATGGCGAGTGGGCATTATACCGCATATATAAAG
GTTAATTTCTCAAGCTCTAATTTTTTTTTCTGCAATTCAAGCTTATTTCT
CTGCCAAGCACTAATCATAAGTTTCTAGGAATTCTATTGTGTTATTGGTG
TCTGTAACCTATTGAATATCTGAGTTTGTGCTTGAAGTAGCAATTAAATC
ATGGGTTATTTTAGTTGTCCATGTACTGTTTTTAACTATAGTTCCCTTTT
GGTCCCTCTATTGTTTCTTTAGACATAGCTCACAATGCGACTAAGTAAAT
GTTTAAATTGTTCCAGTTTTTGCTCTCGTATCTGAATTGTGAGAGATCAG
AAACCTTTTATAGATATTTTTATTACCATGTTGTCTTGTAGAATTCTTAA
GTGCCACTTATTGTGCTCAGGTATTTTCTATAGGCTGTACTCTAGAAATC
TAATAGGGACTTCTATTTTCTGCAGCTCTTGGATGAGAACAGGTGGTACA
ATTTCGACGATAGCCATGTTTCTGCCATCAATGAGGAAGATGTGAAGTCG
GGTGCAGCTTACGTGCTGTTTTACAGAAAAGTTGCAGAGCTGGACGGAGC
AGCAAGCAACAGAACTCAGTTGAGCGTGAAACGAAGCCACAGATCAAGCC
AAAGATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.