Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA021653

[Submit comment/correction]

Sequence	AA021653
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA021653
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTTCGATCTGCAGAACTGTAAACGGGTTGGTCTGGGGCCGGGTTCGATTC AGGAAACTGTCCCAACCCACCCAGCTTTCCTTCCAGTCGAAATCCTCAAG GCGGTCGTGGCGGCGCATCGGTGACGGCGCGGCGGGGAGGTGGAAGGCGC CAGCGGCGAGAGCGAAGCGGAAGTGGAGAGGGAGCTGGGGACGCAGAAGT GACTGCACGACGAGCGCGGCGGCGCATCTGCGTCTGTCACCGACGGCGAG GCATACGCCTTGTCACCATACTCGCGGCCCTCCGCGTGGCACAGGTGACG CATGCAGCGGCCTCGCCTCCTCCTCCCCGTGTTTGTTGCTATTATCCACT CGGAGCTCAGATCGGCGCCTACGAGATGAGCTGGGTTACCTCTAAACAGT GCCGGATTAAACATGCGAAGCGAATTAGGATGACATACAATACTGTCACT ATAGGCTTCTTGTAGTCAACTTCAGTATATCCTGCTAACAATAATATGTT GGATTGAAGAAATGGAAACTCATCTTGAATTATGCAATGTTTCTTTTCCT AAGGGTGACGCTCTATCAGTTTTAGGCGCTATGGGCGCTTGATAGTTAAC TTCATATTGCAATTGTGAAGTTCTGTAGTAGATTATAGAAGGGAAAACAT GCTCAACATCTCAAATATTGATATTTTCTTACACTTGCTAAACTTAACAG TCATGGTCGTTTACGTATCCGATGTGATCTTTTCATGTGACAAGTGCCAA AATTGATTTAATTATTTTATGGTTGTTGCATGTAGGCAATTGTGAAGGAA AGTGGTGATCTAAATAACAGGTTGATCCCTTCAATCTGGTTTCACAAGCA CTTCAAAGAACGAGTGGCCTGAGTGTCTGATGTACAGAAGCAAAGAAGAG TTGGTTGTTCCTGCAGCTGCTCAAGTGAAAATAGAATCACAAGAAATTGA TCCTGTTTTTTTGTTAAATCTGGTGATGTGATTAAATTCAAGACTGCTGC TGATCCCAGGGACACTGAAATGGCTGATGCGCCTAGAAATCCAGCACATC ATGATCCAACAGGACTAGAAACCATGAAAACTTTTGAATCTGAAGGAAAT CAACCTGGGGATTCTTTAGATCCACGAAACAGGTCAAAGAATGTTAGAGG AGTAGAAGCCAATTTTGCTTTGAAGCTTGCAAACAACCCTGCAAAGAGAT CCAGGTTGGATGAACACAAAGTAGCAATGCTGGGTAAAAAGCGAGCCAGG CAAACTGTGTTAATTAATGACGAGGATGCAAAGCAAGCTGGCATAGGGAC AATATCAACACCCAGAAGACCGTCTCGTGGTGCTGGTGAAGGAGCTGCAG AAACACAAAACCAGGTGGTCATTAGGGATCAGAGGCAAGCTGAAAGGATG GGGTCAGAACGAAGTAATTCTGCCGCTCCAGATGACCAAAATACTGTATC CAATGGTGATTTTGAGATGGCATCTCAGGGCTGGTCAAAGAAAATGAATG CTGAAGAACCCCCCTCAGATGGGTATGAACAATCTGTGCCAAGGCAGGCT TCTTTGAGGCAAACTATGGATTCCAAGCAGTTCAAGGGCCGACCAGTCTC TTCTCACAGAGCAGTTGTGACAGGACAGAACACTGCAGATCAGAAGCCTG CCAACAAGAGGTCTCTTGTTTCCAAGAAACAGGCTTCAGCAAATAATACG CAATATCACGACACATCTATTGAAAGACTTCTACAGGAAGTGACAAGTGA TAAGTTCTGGCACAATCCAGGTTAGTTCTCCTATATTTTCCCTCTTTTCT TTTGGATTTTTTGAATTCAAGTAACATGGTAACACCATTGCTTAATCTGG AAAATTATGTGCTCTGCCATTAGAATATGCATTACTTTTGATGTGCTTGC TTAATCTGAAATATTTACCGCTTTGTGTTCTGTATTCTAGGCTGTTCTAT TTTTCTCAAGGTCGATTTCTTTGTTTTTCTTCTCATGTTCAATACCTTGG CACTTTTTTCCCTTAATGCATGCCTTGTACCTGATGATTGCATCTTCACA GTTCCATCATTGATGTGAAAATCCATGTTTACTCATATGCCCTTCATTTG ACAAAGAGCATTTTATATTTCTCATCTAAACAGACGAATCGCAACTTCAG TCTGTTCCTGGAAGCTTTGAATCTGCTGAGGAGTACATTAGCGTTTTTGA GCCTTTGCTTTTTGAGGAATGCAGAGCTCAGCTATACAGTTCATATGAGG AGTCTCTTGAGGCTGTATCAAGGGATGCACATGTAATGGTGCGCGTGAAA ACCGTTGAAAGGCGTGAAAGAGGCATGTTCTACTTCTTTTTGTATTGATG GCATATCTCGTAACAACTATAATAATTGATACACTCTTATTTCTCACTGC AATTGCCTGACTATTATGGTTGATGTGCACAGGATGGTATGATGTTGTTG TTCTACCAGCACATGAATGTAAATGGACTTTTAAAGAAGGTGAAGTCGCA GTTTTGTCATTTCCTCGGCCTGGTCCAGGTAGCTCTACTGTATTCCTTTT TTAGTTATGTATTAAGTGTGCAGATTTTTTACTCTGAAGGAACTGTTTGG CGAACTGGGCTCATGTATCCATTTCTTTGTTATTTAGCAGCCCAGTCAAG TAAGTCTAATATGAAGACTGTTGGTTCAGACGAAGATACTGAGTCAGAGT GTGGACGGCTTGTTGGTAGAGTCCGGCGCCATATGCCTTATGATACACGT GATCCCATTGGAGCAATTATCCGTTTTTATGTTGGGAATTCATCTGATTC TAGCTGGTAATTTGCGATATCATTGTTATTTAGCTTGTCCTATACTGATA AAACCACATATTCAATGTTTTTGAACTAGCTTTTGTTTAACTTGGTTTTA TCGGAACCTTGCTGCTAGTTCCTTACGCCTAACTGTCGTTCTTGAAGATT ATGTTACTGCGAAAGTTAATATCTCTGGTGTAGTTTGCTGATTAAGACTT CCACTATGCTCACATAGTCTGTAAATGAGATTTCCTGTAAGATAGACTTA TTAAATTGATCACAGGAACATTTTTTTTCTTACTAAGGGTTACTTGTGAC AAACAGTGTAATCTCTTTCCACTCGCAATTAAATCAAACAGTTGGAATGC ATACCTGCTCTGCAACTCATTGCAGCTTCCTAGTTCTTAATGCTGACAAC CATATCAGCCCGTTGCCCTACTGGATGAATTTAAGCTACACCCCAAACTA AACCTTGCTCGTCCGAACAGGCTTTGCCGTAAGGTTCATGGGTCAATCAA TTTTCTTAGGTTTTGGCTGCTAGGATGATAGGTTCAAGTTAAACTCACAT TTCTTTGCTAGTTTTGCTTGATTTTATGAACACTATTCTTGACCCTTTAT CTACTGTTTATACATATGTTAACTGAATCCTGTACTTACTGCCATCATCT TATTACTCCTTCTTTTGTGTTGTATTTACAGCAGTGGGACTAATGTTCTG GGGAAACTCCAACCTCAAAGCACATGGTATCTAACTGCTCTTGGTTCTCT TGCAACAACACAGAGGGAATATGTTGCGTTGCATGCATTCCGTCGTCTTA ATGTGCAGGTGATGTATATACTATATTTAGTTAAGTTCTATCTGCCTTCT TGGTTATTATTTTGCAGTTGTTTTGATCAAAATCTTTCCATCAGATGCAA AATGCAATTCTTCAGCCAAGCCCAGAGTACTTCCCCAAGTATCAGGAGCA GCCACCTTCTATGCCGGACTGTTTCACTCCAAACTTTTCTTGTCATCTCC ATCATTCATTCAATGGGCCTCAGCTATCAGCAATCCATTGGGCTGCAATG CATACAGCTGCTGGCACAAGCAATGGGGCAGTGAAGAAACAAGAACCATG GCCTTTCACATTGGTACAAGGTCCTCCAGGGACAGGGAAAACCCATACTG TTTGGGGAATGCTAAATGTTATTCATCTTGTTCAGTATCAACGTTACTAT GCTGCTCTGCTAAAGAAACTTGCTCCTGAAAGTTACGAGGAAATTAGTGG TAGTTCTAGCAACGTTTCAGAGGATGTTGCTGCAGGCTCAATGGATGAGG TTTTGCAGAGCATGAATCAGAACCTGTTTCGCACTCTTCCCAAGCTTTGC CCCAAACCACGGATGCTTGTTTGCGCCCCATCAAATGCTGCAACAGATGA GCTGCTTGCTCGAGTTCTTGACCGTGGCTTCATAGATGGTGAGATGAGGG TCTACCGCCCTGATGTCGCCCGTGTTGGAGTTGATTCACAATCCCGTGCT GCACAAGCTGTTTCAGTTGAGCGACGCACGGAACAGCTTTTAATGAAGGG ACGTGATGAGGTAATTGGTTGGCTACATCAGCTAAAATGCCGTGAGCACC AGTCATCGCAGGAGATAGCTATTCTGCAGAGGGAACTTAATATGGTTGCA CAGGCTGGTAGATCCCAGGGTTCATTTGGAGTAGATCCAGATATGCTTGC TCAAAGGGATCGTAACCGTGATATTCTGCTTCAGAAACTTGCTGCTTCAG TGGAAAGCAGGGATAAAGTACTGGTTGAGATGTCACGCCTGCTGATATTA GAAAGCAGATTCCGTGTTGGCAGAAACTTCAATCTAGAAGATGCTAGGGC TAGTCTGGAAGCCAGTTTCGCTAGTGAAGCGGAAATTGTTTTTACTACAG TATCAAGCAGTGGTCGCAAGTTATTTTCTGACCTTAGTCATGGATTTGAT ATGGTTGTTATTGATGAGGCTGCTCAGGCCAGTGAAGTAGGAGTCCTTCC CGCACTTTCACTTGGTGCAGCTAGATGTGTTTTGGTTGGTGATCCACAAC AGCTTCCTGCTACTGTTATTAGCAAAGCAGCTGGAACTTTACTCTACAGC AGGAGTCTTTTTGAGAGATTTCAGCAAGCTGGTTGCCCTACGATTTTGTT GTCAGTGCAATATAGGATGCATCCCCAGATCCGTGAATTTCCATCAAGAT ACTTCTACCAAGGGCGCCTTACAGATAGTGAAAGTGTTGCCAACTTGCCC GATGAGGCTTACTATAGAGATGCACTAATGGCACCATATGTTTTCTATGA CATCTCACATGGCCGTGAGTCCCATAGGGGCGGGTCATCTTCATACCAGA ATGTTCATGAAGCGCAGTTTGCATTGCGTTTGTATGGTCATCTTCAGAAG TTCCTGAAAGCTAATGGTGGCAAGAGAGCATCTGTTGGTATAATCACTCC ATATAAGTTGCAATTGAAGTGTCTTCAGCGGGAATTTGCGGAGGTTATGA AGACTGAGGAAGGGAAAGATATCTACATAAACACAGTTGATGCTTTTCAA GGCCAGGAGCGTGATGTCATTATTATGTCATGCGTCCGTGCCTCTAACCA TGGTGTGGGTTTTGTTGCAGATATACGCCGTATGAATGTTGCTCTCACTC GAGCTAGGAGAGCTCTATGGGTATGCTTTTTGTCCTCCTTCCAGAAATAT GCCTCAATTTATTCCTAGACTTATGCTATCAGGCTAATAGTCTTTGTTGT TTTTCAGGTTATTGGTAATGCAAATGCCCTCATGCAGTCAGAGGACTGGG CAGCACTGGTAGCAGATGCAAAGGCGAGGAAATGTTTCATGGACTTGAAT AGCATTCCTAGTGACTTCCTACCCATGAATAATTCTTCTAACACCCGAGG CATGAATTCTTCAAACAACACGAGGAACATGAGAGCTAGTGGACCAAGAC CGATGCATTTCAACATGCTTTCTGAACCCAGGATTGGCATGAGAGCCGGT GAGGATGATCGTTCCAACTCTTTTCCGAGAAACGGTAGTTACCGGAATCC AGATGTTCGCCCTGGTGATCGGTCTGGGGATGATTTGCAGTTTGGGACGA CCTGGAGGCCGAATTCGTCCAATGATCCAAGGAGACAAGTCTAGGGAGAA CATACTGCTGGTTGCAACTTTTTGTGTGGGATGATGCAGCAAGGTGTTGC CTGTTCGGAAGATGTGCACCACGGGTAGTGGTCATGTGCAGGACCAGACG ACCAATTCCTCATGATATGGCTAGACCTCTTGGTGGGGGTGGGGGGTTGC AGTCATAGCTGCCACGACTAGCTAACTCGTTGCTGTCGGTTGGGCGATGG CTCTTGATTTTGTCAGGCCACGGAACAAAGAAAGTCTGCCTCAGGCCCTT GGTGTTCTGGAAGCACGCAGGATGTGTTATGCCCATTTACATCGACTGGG CTTGAGCAAGGCTGTCAGCTGGACAGACATTTGTCTGGCATTTTGCCACC TGCTTATCGATCATTTTTGCATAGATATATCGTATGTTATACGGGAGCAG GCATTTTCATTTCAAAAGCCGCCATATGGCTGGTGAATATGGGGATTTTC GTTTTGGGAGACTGCTATGGCTGGTAAGCGTTCAAGCTTTGCTGTTAGAG CTGCTAGCTGTGAACTTTCCCGCTTGACATGCACTGTATAATCAGTTTGC TCGCTTACACAGCGGCACATCGCTTCTTCTGTGGCATAAATACGCCGTAA GCCCTGTCTGTATTTGCAATGTCGGCATCTTGAGAAGCTGCGTTATTTGA TTCAGCTCTGCCCTGTTTGTCACCTACGGTATGTTCTGTTATGCGTTTTC CATGATCGTTGGTTGGTTCCTGAATGCTGTGTTGTACACTTGTATTACAT GGAAGATGCTTCTGTCTTTGCAGTTGGTTCCTGATTCTTTCCTTGTACTA GGTTTTACCGTGGTTTAGTTTTCGTCAGCAGTTGGTGTCTAGCAACAGTT AGATCGTTAGACACCAGCTCACTATCAGCCAGACTAGTGCCAGTCTTGAC GGTGATGTTTCTACCTCAGCCAATTTACCCAGAAAAACAAGATCGGCAGT TTTGACTCCAGCAACCTTATTCACTTTGCCTTTCTGTGCAAAAGCTGTCA CCTGCGTAGGAGACCGTCTGCTTCATCTTTTTACTGTGCTCCTCTTCTCG TTCTGAATGATCCACATGAACCGCTTCGGTACTGCTGTAATAATCCTCCG GCAGTGGAATGAATAATTGCAGTTATTACTATGTACCGTCGAAATCTTCC AAAGGGATCAACTCTCAACTTCTCACTACTGCTGATCAAAAAACACCTCA CTACTGTGGTGTCCGCGTCTTTGAGCGAGAACAAGGGCCTTATCAACAAA TAAGTATGCAGGCTCTGAAGTGCAACACGAACCATGGCATGCACAGCGGA ATTCGATTTTTGTTGTTCTTATCAGTATCTGAATTTTACATTATGGTAGA TGTAGGTTGCAACAATAATGTTAGCAAGAAATTAGGAGTTTCCTATTGAA ATGTAAAAAGTCCGCTTTTCATTGCAGAACCCTTAAGTTTTTTTCTTTTG ATAAAGAGCGTTTTTATTAACCTTCAAAGTTTACATCAAGGCGAAACAAA AAAGGCCACACTCGGCCTGCATAGCTAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.