Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA011445

[Submit comment/correction]

Sequence	AA011445
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA011445
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTGGCCCTGTGTGTCAGATCGTGGCCGTCGCGAGCGAGTCGCGAGTCGCG TCCCCTCCTCCTCGTCCGCCCCGTCGTCTTTGCCCCATATCCGCCGATCC CAACCGGAGTCCTAGAGGCCGAGACCCCGTCGCCATGGCGGTGCGCGCGA CGGTATCCCGCTTCCCCGTGACGCAGGAGGCGCTGGAAGCGTGCGGGGTC CAGTGGGGCATCTCTGTGACGCCCTTCGCCGCCGCCGACGAGCGCGGCCA GCCGCCGGCCGCCGCCGACCACGGCGACCGTGTCCCGCGGTGCGAGCACT GCTGGGCCTACTTCAACACCTACTGTGACGTGGAGCGCTGGGGCTGGGCC TGCGCCCTCTGCGGCACCCTCAACGGCTTCGACGAAGACGCCCTACGCCG CCTCCAGCGCCCAGAGGAGTGCCCCGAGCTCAGCTCCTCCTTCGTGGACT TTGAGATCCCAGGTACTTGCGCCCGCCCCCCTGCGCGTGTTGGTGCCTTG TGATTTCGAGCTGGTTTCTCATGGCCTTGGTGATCGAAGTGTGACCCCCT GGATTGGGTTTGTGCAGTGGATGAGGCGGATGGCGTGCCGGCGCGACCTG TCTATGTGGCGGCGGTGGATCTCGCTTGTAAGTCAAATTATTCTGCTTAG TTCCTCGCGATCATGAAATTCCGTATTGGTGGAAGTTAATTTTACCTGTG AGTTTTGTACATTTCTCATGGCGTTACCGAAGTAAGCCACCTAGAAGAGA ATCATATAAAACGAGAACAGTTAGAGTGAATGCGTATAGCTCAAACTCTT GTTGCTTTATATGATCAAATTGACATGCTTGCGTCTGGATGCTCAGCGAT CAAATTTCAGTTGGATCATCAGATAGTCTCCCCGAGGTTGTGGTATGATT TATATGATTATTGTAAGAATTGATTGTTGTCCTGTTTCACTGTCTTCAGG TTCTGAAGAGTTCCTGGAACTCACCAAGAGTGCGCTTCTGGCAGCCCTAG AAGGTTAGCATGTTTAACTTGCTGAATTTTTGGTTCTCAAGCAATGTTGT GTCGTTGGCTTGTCAAGTTTCCCTTTGTCCTCAATTGGGTTTCTCCGTGC AACAGCTCTGATTCCAGGATCCCTTTTTGGGCTTATGACATTCAGCCACA AGATTGGCTTGTATGATGTACAAGGTCCAATTCCTGTTGTGAAGAATGTT TTCATCCCTCCAGACTCAGAAGAAGATGGAACACTTGTTCCCCTTGAAGA TGCCATGCCCCTGCTTTCGTTTTTGGCCCCTGTATGTTACATAACTATGC CACAGGACTTATTTCACTGTCTTCAGGTTCTGTAGAGTTCCTGGAACTCA TCAAGAGCTCTAGGAAGTGTTACAGGTTGGTTTAGTCAATCTCAGGATAA CATTTAATTGTAAGTTAATCTATGAGCAGGTCGATACATGCAAGGACCAA ATTGCCGCTGCCCTGGAGACACTGCGACCTACTTCTTCGTGGGAGAGAGG CCCTGCTTCCGGGCAGGAAGGAAATACTGTTTTGCTTGGTGGGCGAGGTT TTGGAACGGCCATGTCTTCTCTAATTGACTACCTAAGTTCAGAGTATGGT TCTACTTTTGCTTTGGGTGAGTTAACACATCCCTTTCTACAATTTTTAAG AAAATTATGCTTGTCAAGATAATTGTATTCTGCAAAGAGTTTTCTACTTT CTGTTTTTATGCCTAACTACCATTTGTTTCTTGTTAATTCAAGAACAGCT AGGGTATTTTCTTTTCTGTCTGGTGCTCCTGATTACGGAGATGGTCAACT AGATACAAGGAGATATGGTGAGCAATATGCTAGCAAAGGGGAAGATGCTG ACGCTGCGTTGCTCCCTGAACAGATACCATTCTATAGAGACCTAGTAAGC TTCTGTTGAATTTGTATTGAAAAAGAAGTTACATTTGCTTGACTGTGTCG ATCCTGTAGTGAGCTTAGTGAAATTTTGAAACAGGCAGCTGTTGCTGTTC AAGCAGGAGTATGTGTAGACATATTTGCCGTAACTGACGAGTACACTGAT TTGGCTTCATTGAAGTTTTTAAGTATCGAAAGTGGCGGCTCGGTATTTCT CTATGCAAGTGCAGATGATTCAACACTTCCTCAGGACATGTGAGCTTAAT CTTATGGCTGTAATCTGTACTTTATTTTTGAAATTTCAACTTCCTAGGCT CTTAATAAATTGTGAATGGGCTTTTCCTCAATGCTTTTCCTTTTTGTCTG AACAGATATCGCCTGTTGAGTCGACCCTATGCATTTGGATGTGTTCTAAG GCTGAGAACATCTTCAGATTTTGAACCTGGCCACTCTGTAAGCAATTAGG CTACCTGTGTTCACATTATGTATAGTGTTAAATTCCGTGTATGTCACTGC AAAGTTTTATAACCCAGTTTGGGTGCCACTGACTTGTTAGGTCTGGCCCC ACATGTCATTGATGCAATGAGTGGTATTAACAGTTACAAAAATTTACAGT GACAGACAAGGATTTAACTCTTAACTATATTATTCTATCTAGCCATTTTT TAATCCATCCATCTTTGTGCAGTATGGCCATTTCTTCCCTGATCCTCAAT ATGAAAATGTGCAACATATTATCTGCTGTGATTCTTTTGCTACTTATGCC TATGACTTTGACTTTACCCATGCTGATGGCTTCTCCAGGTATATTATTTT ATCACTATTTGATGTATTGATTTCTGTTAAATAATGATATGTTGAATTTG GAATGCATGCCAAGCATATGTGGTCTGCATATATCTGATATGCCTAATGA TATGGGTCCTGCTGTTCTGTGCGACATGATACGTAAAGTTTTGCATAAAT TAGATTTATTCAGCATAGGTCATACTTTTTCTGTGCGAGGGATATTCCTA CAATCAAATCCTTTTACTTGCAGTTATTTTGTAGTGAGCCAGGTAGTCAC TGACACAAGTGCAAAGAAGCAAAATTTTGTCTAGCTCGTTGTTCAAGCTT TATTTCATTTGGTCATACGAAATTTTCTGGAATTTCAAGTCATTATTTGT CGTACATGTATGGGTAACTCAACATACTAATGGGCTAATAATTTTCCTTA CATGATCATATGTAGAGTATCTACGAGAGCTTGTGCTATAAATCATAATT CATTTTCACTATTTGGATAAATCTAGGTTTTGTTGTATCCTATCAATCCA ATGTGCATGCGTCATATACTTCTTCACCAGTGGTCAAGTAATGCCAATAT GTGATTTACAATATTTACAGGCACACAGAACCTGCTGTTGTACAAATTGC TTTTCAGTACAGTGTGGTTGAGCCTGTGGAGGGGGCATCAGGGAACGAAC CACAATCATATCCAAGGTACAAGATATCTGAGTTATTTAAGTTTCCAAAC ATCCATCCTAGCTGTCAAGCTTTAACTAGCTTTTGGGTGCCTAACCTCTT GTAGTACTATTAATTTGTTTATCTCAACTAATGCTTGTGCTTACATTAAG TAGTACACTAGAATCATGTTAGCATCTCTTCATTCCATCTTTCGTTTTTC ACCCTGTTTTACTTTTGTATTTTGTAATGTTACATTTCCGCAGCTACCAG TTTTGTCTGAAGAGACGGTTGAGAATAAGGACACTGCAGTATCGACCGGC CAAGAATATCATTGAAATGTATGACAGTGTTGATCCAGAGGCTGTCCTAC ATATCCTTGTTCATAAGGTAATCATATTTAGTTCGTTTAATCATACACAG TTTTCTGTGAAGATATTCAGCAGGTTGACACAAGATAGATCATTGTAAAA TAAATATTCGAGGTGATTAGTTGCAAGGTATATCAATAAGATTAGAAATG GTTTGCGCAAGATCATTGAGTTAATTCTGTACAGATTTCGATTGTTGAAG ATTCTTCTAGCTGATCTGTTTTTTTGTAAGAAAGATGTTCCGCCTTTTAA TTAATGCACACCCTAGAAAATTACTGTTTTTCTTATTTAATTTTGATGAG GTGCACACATATTATTTTTATCATGTTAATTTGATTCTCATCTGGAACAC TGCCATCAGGTTATTTTAGTTTCATTGGAAAACGGGGTTAGAGAAGGCAG GCATTCGGTGCATGATTGGCTGGCTATCCTTATAACCCGGTATAATGACG TGTTGAGATCTGATGCACGAAATCCAGAATCACACATTGATATAGACTTC TCACAATGCCCACAGCTGCAAATGTTACCTCAGTTTGTGTTTGCAATGTT GAGAAGCCCTCTTCTTCGCTTGCATGAAGAAGGCATCCACCCAGATTACA GAATCTATCTGCAATGCCTTTTCAGGTACATAATTCTCTTTATTTTGTAA TGCATTTCACAAGGCTTAGTGCTTGCAAGTCTTGGAGAATGTCCAAAAAC TTCTCTTGTGGTGATAGTTACTACAGCAGTTTTTCTTAATATATTGTTGG TGCTGTGGCGATATCTCGTTCTTGTCAATCAATGCGGATTAACTTTCTCA CTTGCGAGTTTATAATTCTACTTTGAACTGTTCTTGCAGTGCACTGGAGC CATCTTCTCTAGCCAAAGCTATATATCCAGTTTTAACTTCGTACTCCTCA CCTAACAAGCAAGCATTCCCACGGCACACTTTGAGCCGTGCTGCTCTGAC AATGAGTGAGAGCCCGATATTTCTTCTGGATGCATTTACCAACCTTGTCG TTTATTATGCATCGACCGCCGATCCTTCACTTCCTTTTCCTCCACCCCAT GACTGTAAGTACACCACCCTCTTGCAGTTTCTGGGGCTTGCATTTTTTAA GTTGCGTGTTTGTCTCAGCTTCTTATTTTGTTGGCCACTGAATATATCCT GCAGGTCTGTTGAGAACAGCGATTAACGCGCTGAAGCAGGACAGGTGTAT AACACCAAAACTTACATTTGTTCGTGGAGGAGAAGATGATTCGTCATTGT TTGAGAACTATCTTATTGAAGAGCAAGATGTTGATGGTTCAGGGTTTGCA ACTGGTAGAGGGTTCATATCGTTCCGTGAGAGTATAAGGAATGAAGTAGC CGAGATCCTCAAGGAAGAAAGTGGCAGCTAGCTCCTGATCGCTATGGCCT TATGGTTCCAAAGGTGGTGTAAATTGTGTCAACAGCTCTTGTTTTAACCT TATCTCGTAGACTGCAACTATTAGTTAGCTGAAATTGAGAGAGAGATAGC CATGGAGTAATAAAGAGGGGAGGCGTGTTCCAATCTTACAAGTAGTTGCT TGTGTCAATAGCTCAATATTCTAGGAATGATCAGTCAGAGAAAAACTTTT TATTTCGTGTATTCCTATTACATCTGGCACTGGTTACTTTTCATCTTATT CCGTTAGTAGCAAAGATGCCGATGAACTCATGAGTTTTACAGTAATACAT ATACTCAATATACTGCTGGAACTTGCCCAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.