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GrainGenes Sequence Report: AA008992

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Sequence
AA008992
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008992
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAAAGTGTTATGAATATGTAATTTACTCAACTCAGGCAGACACTCAGGC
AGCAGAACGAGCAGGGGAGCGCGAAGACCACCGGCGGCGGCAGTGGCAGC
GGCTCCTGCGGGCTCCGGCCTCTACTCCATGGTGCGCCCTCCTTACACCT
TCTCTTCTCTCGTTCCCTATTTTTCTCTCTTCTCTTGTCGAAGCATCGCA
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TTCTACTTGTCATTCTCTGGGCCGTGTAAGCTCCGAGCAATATTGTGGCA
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ATCCTCGCTCCTTGGAGCCATACCATCCGTGGACGAACCTTGGTCCTAGG
ACAGTTACCCACCATGATGCTGTGATAAACCCATGGTTGGGGTCTAATGG
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ATCTGCTTAGCATCATGTTAGATCACAACCAGGGTGGTTTAGGGCAAGGG
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GAGGGGTAAAATTAGAATTTTCCTACTTAATATTGCATGGCTTATTGTTG
TGTTTTAGTTATTTGTTTAGGTGTAGCAATTAGCATATGCATTGCATGAA
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GCCCGCGGGGGTGTTTGCTTGTAAGGCACGGTTATTATGGTGTACCTAAC
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TTTATCTGCAGGTTTACTTGGAAAAAGGGATAATGCTGTCTCAGACACAG
CTTTACGCATTGTAGCTAGCATGAAGCGAGACTGGATGCAGGCTAGCATC
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ATTGTAAGCTCGGATGCTCATGACAGATCTACTCATTTGAGAATTGTATT
TTAAATGATTTTCTTTTGTGTTAATCTTCATTTCTTCTATAAATGCAGTA
CATTCGGCGTAATGGACACTTGAACATGAATTGACATAAACTGTGTTATG
TTTGTCAGGTTGCTGTCGTGCATATATGTGAGGCAACACTAACTAAGCGC
TTGATAGAGTTTGAAAATACAGATTCTGGTAGCTTGACGGTATGTATCTG
CTTTACTTGAAATTGCCAAATTGGGCTGTCTGTTCATCAAATGACTTCAG
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ATTTCATATCGCTACAGTCTCTTCTTGCCATCTAGTACTCCCTCCGATCC
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TCTTCTTTTACCTCTCGACTCTCTTGTTTCTCTCATAAACACAAGAACCC
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CTTTTCTCTTTTCTCTATTTCTCTTATATAGCAAACCAGATTACATGCAC
GGGCTAACAACAAAACTCACGCCACCTGCCACCACTAACTCACGCACTAA
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CTAGACATACAACATGCATGCAGCTAACTAACTTGACTACAACTTACACT
ACGACATCTTCTTCAGATTGGAAGAGTTACCTGGTTTTATGGAGTGGGTA
TCTGTTTCTTGGAGAAAGCCCAGCAACAAATCATATAGCTCTGCCATTGT
GGCTGATAAGTTAAAAAACCTAAGGTATGATCTGAAGAAGTGGCATGTTA
GTCTTGCTAAATTAAAGGGGCTGATTCAAAATTGCAATAATGTGATTATG
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AGAATACAAAATTCTTTCACACAATGGCAACTGAAAGATTTATAATAAAT
AATATTGCTATGCTTAGGGATGATGCAGGTGTGGAGTTTACTGATCATCA
AATTATGGCTGGATTGCTCTGGAATAGCTATAAAGATAGGATGGGCCGAT
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GGTAATCAAGGCAATGCCGATAGACAGAGCCCCTGGGCCAGATGGTTTCA
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GTCTAGCTGAGGATTTTCACTCTGGAAATATTAAGTTGCAAAATATAAAT
GGATCATTCATAACTTTGGTTCCTAAGGTGGCTGCTCCTATGGGAGTTAA
TGACTTTCGCCCTATCTCACTCACCAATGTATGCCTTAAGTTTCTCACAA
AGCTGGCTGCAAACAGGCTTCATGGAAGGATTTTGGACTGTATAAGCAAA
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GTCTTTTGAGTACCTACATTTGTGTAACATTTCAAAAAGGCTAATCATCA
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ATCCTTCTGGTGATGCAACATCTTGGTTTCAATCAGATTTGGCTGGGCTG
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AATCCCAGGGAAGCAATTTTCTTGTAGACGAGGTGTACGACAGGGTGACC
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GATGCTCTACGCCACTTAAAGAAAGGTTCCCACGATTGCATTCCTATGTT
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CACAATGTTCTACCTGCCTCTATCCAGGTTAGCTTATAACGAGCTATTAG
AGTTGCAACAACTTATGACTGCATGTCCATTAAACAATCAGAGCATCTCC
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TGGCTCGCCGATGACGATGCCGCGCGAGCGTGTCCGCGGAGGCGAGCGTA
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GTCGGCGTATGGAGCGGCGTGGAGCCCGATGAGTGGGAGGCCGAGGCGGA
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CAGCGAGGGCGGGAGGGGTGTAGCGGCGAGGACGGGAAAAAGGGAAACAA
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GGCGCGGCAATTCGGCGACGCGTGGCCGAAGCGACGGGCGTGGTCGCCGC
GTGTTTTTGAGGATGACGACGACTCAGCCTCCGTCACTGACTCGGCGGGT
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GCTCTCAGCATGATGTTTGGACATATTGTTGGGGAGAGCGGTACACGCCA
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TAAGTGGCTTTGGAGATCCAGTTGCACTATGAAAACAAAAGTGTTTGCTT
GGTTGTTGCTTAGAGATAGGTTGAATACAAAGGACCTGTTACAGCGTCGA
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CCATCTAACACACCTAAATACATGCAACTACAACATGAATCAAGATTAGT
GCTAACATGTCTAGATTCGTATGTATCTAGACGTGTTTTAGTGTCTAGAT
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ACAAATGTATCATTATCTGTTTTGACCTTGGATACCATGCAAATATAAAT
GTATTGTTGTGTATGGGCTGTATGCTCTACTGTAAATGAAAATGACTGCT
AAGGATTAGGGGCAGGTTTTTTTTTTACTAATGACCAACTGTATTTACTG
CTCCTTTTTTTTCACATTCACACATATTTATAAGCACTTCATGCTCCTAT
GCAAGATTGAAGATTTTCTGGCAAAGGCTGATGAAGAAGAGCCTGTCCCA
ATTTTTTCACCCAAATCTGGAGAAGTCCTCTGCAAGCATAAGGATAAAGA
TGCCGAGCATTTTGCTCATGGACTTTGTGAGAAATGCTACAACAAAGTAA
TACACATTTACTATGTTTGTAATGCATTAGTTTTGATATTTCATTCACCA
TTGACACATGACCTGATTGTTCAGTTTACTAAACTGTCCGGTGGACTGGA
GGGTGGTGCTGACCCTCCAGCTTTCCAACGAGCTGAAAAACAAAGACTGG
AAGCTGCTAAAAAAGCCGAGGAAGCTGCTGCAATGGACTTAACGCTAGGA
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TACCCTTGCTTGAGTAATTTATACTTTCCATGTATTGCTGTGTATTTTTT
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CCCTATCTACTCAACAAATCAAGAGCCTACAGTGCACCTGCCTCTGCCTT
CACTCATCTGAGATGCCACTGATGATGTTGTTGTGGCCAAGAGTAGCATC
CCCACTGCTTTTGGAGATGGACTAGATTTAGGTGGGAAGGAAAAAAACCT
CACCAGTGTTCTGTTTCTTGGTGGTATCGAAGAAAACTTCACTGATACTG
GATTCTTGCTAGATGAGGAAGATCTAAGGCACTGTTGACCCTCCTAGCTC
ACTTGCTTCTTTCCAGCTCCTTCCACTTGCCAAACAGCCCAGATTCCAAT
CTGGCTTAGACCTAATCAACATTTGGGTTGGCCATACAGAACTAACCATT
TGCATTTTTCAGAACTCAACTCATGCAAAATGTTTAATCCATGGTTAAGT
GCCTTGGAATCCTTGGCCTTATATGTTGGTGGTCAGGGACGGCTTTGTGT
TTTACGGGGCCCTAGGCGAAGTCGACCACATTGCCCTTATACTAATGTAT
ATGTAGACATATCTAAAAAAATACATATACATATCCCTTTTTACTTACAA
AATTTAATGATTAACATCCAATCATACTTTTAGTCTTAAAATATAACAAG
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ATCATGCATTTCTAGATGCAAAATTATTTAATACAATCTTAAGATCAATT
TTTTTAAGATATCCTTCTCAATACAACATATAGCCAAACCCTTCAATCTG
TCTTGTAACATAGTACATAGAACCCTAATACTATCCTAAAAAGACAAGGG
ACAAGCAATTTAAATATACCAGGGGCTCGAGGCATCAGGTCGATATTCCC
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ATCGCGTGGCGTAACTCGGGTTTGCTCTTCGCTGGGTCATGCGCGCCTGC
GCGGAAGGCAACAACGTGTAGTGCATGGGCACATGCGGGGCCGGGCCTTC
AAAAAAAATCCACGTAGATGTGTAGGATATAGGTATACAGAGGACTACGT
ATTCACGGGCCCTCTCCTTGCATGGGCCCTTGGCCGTCGCACCATGTCGC
CATGGGTCAGAGCCGGCGCTGTTGGTGGTGCTCGGCTATTTTCTCAAATG
TGCTCATGCATGCATTCACCCACTAGTGGGCTGCACTTGGGGCCTAATTT
CTACTGGGGGAGGGCTGCACTTGGGGCCTAATTTCTACTGGGGGAGATTG
TCACACAAAGCTCACAAGATAGGACATAAGAGCAAATAGTCCACTTATCT
GAACAGACACAGGACATGCCAATAGCAAGCATAAATCTACTAGTCCTGCT
GTACTCCGAAGGACATGAAAGACAAAAATATACTGGTTAATTAATTCTGT
TTGGTGCTATACCAGACTACCGTCCTGCTGCGGTATCTTCTGATGGAATA
TTCGAACCTGTAAAATCTATTTATATTATTGAACTATTGATTTATTGCAT
TGCAATGTATCCCATACGTGTCACCTGTTCACTACATCTGCATTAGCTCT
TTCTGTTATTATTATCCATTCTGTGTGCTCTATATGTACACATTATATGG
AAATTCAGTTTCCTTATTTGAAAGCAGAATTCAGCTGGAGATAAATCTTC
AACAATTAGTTCTGAGGACATTGCAAAGGATTATGTACCTTCGAAGGATC
CTGAAGTGGAAGGTTGCCAGTTACCTGTAACATGCAACAGTAATTGCAGT
TCAGTTTACGTGACCCCTTTTGGGTTCCATAGTCAAGTTGATTGTTGCTG
ATCAGCTTTTGAATGCTATTTGGCATCCTTAGGTGAAAACGGCAAAGATG
ATGCTGACCCAGAAAGTTTTTCTGATATTGACGATGTGGAGGTACCTTTA
TTTATACATCTCTTGAGCACACTTTTCAGACTAATTCGTGGCAGTCTTTA
AGCCTGAAAGATGTCCAGATAGGTTATTTGGGATTTCTAGTTCTCCATTA
CTTTTGTAGGTTGATGGGTATCTTCACAATGAGGAGGAGACACAGTACAA
AAAGATAATTTGGGAGGAAATGAACAAAGAATACCTAGAGGTAGTTATTG
TATCTCTAGCAACATGTGGCAGTTAACTTCTTATTCACACCAGAGAGTAA
CTTTCTGCTGCTTTCTTTTATAGGAACAAGCCGCAAAGGAAGCTTTAGCA
GCTGAGTTGGCAGCTAGAGGTGTGGGCGTCGGAGAGAAGGTATGAAATCT
TACTAGCGTAACACGAATGTGCTGTATATGCTTACTATTTTGGATTGAGT
TCATGATTAAAGCGATTCATTTTTAATGTAGAAACGGAGACGCAACGAGG
ACACAAAGAATTCGACACCTGCTGAAACACCAGCAGAAGCAACATACAAT
ATGTTAAAACGGAAGGTACTGAACAGTTTGTTTAGCCTAGACACCCAAAA
ATTGGTTGTCCTGTGAACCTTATATATATAAACCAAAACATATATAATGT
GATTTCTTGCAGGGACTTGGGTCAAAAATCAACGTGGATGCAGTTGGTGG
ATTGTACAATGTATGTTTTCCTTGTTTATGTTCACATGCTCACGGAATTC
GTATTTTCGCCTCTGAGTTTAGTTGACATTTTTCTTGTCTACTTCGTTGT
GTTCCTGCTGCCCGAATGCTTGCTGCGAGCAGACTAAAGATGAAGATAGC
GAGGCAAATGAGAAAGGAGACATGGACTTTGATGGGGAATACACACATGA
CACTGGTGACGGTGAAACATTTGAAGGTGGCTATGACTATGCTGATGACA
ACAAGGATAACTATGCTGATGGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.