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GrainGenes Sequence Report: AA010640

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Sequence
AA010640
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA010640
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTGCACCGGCCTCGTGCTGCATCGCTCACACCTGCGAACCAAAAGCTCC
CCGCGTCCGCTGCCCCTCCCCCTTCCGGTGGAGCGAGCCACCGATGGCGG
CTGTCCACCTCCGCCCTTTCCACCCCCTCGCTCTCCCCGCGGCGAAAACC
ACCGCCAGTCCCAACAGGCTTCAGCTCCCGGCGAAGCCAAGGGCGGGGAA
CAGAAGCGCCCGCTTCGCTCTGCTCGTGTGCTCCGCTTCCAACCCCGCCA
CGCCCGCAGCCCCCTCCTCGTCGTCCTCCTCCGGGGATAAGAATGGCGCC
GCGTCGGCTGCTTCCAAGTGGGCCGCGTGGATCCCGCGCGCCGCGGTGGG
TGGGGTTGGCCCGGAGAAGCTCCTGAGGCTCATATCCGGCGCCGCGGCCA
CGCCCATCTGCCAGTTCGTCGACTCCCCTCGCACCTTCCTCCACTCCGTC
GATCCCCGCGTCAAGCTGGTAAGGGGTAACTAACCTTCCTCGCATTTCGG
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GTTGTAGTTCTGTGCAATTGTGGACTTGTGGGGAGACTTGTGGTTCTGTA
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TTCCAATTAAGTTTAAAGATCAACTGAATTATCCTGTACCTGTTGCTTTC
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CCCTTGTTGTCCTACCAGCCAGGTCAAATATTTATATGCGTTTTGGTTTG
GTAGCAGGCCTTGCTCTTCTTTCAATGTGGGTTCTGCCAAATCATGTTTG
GAAGGTATGGTGTTTGGTCTTAAGTTGAAATGCACATACATCATATCAAG
TTCTGGTTCTAATTGTCCCTAGTTATTTGAAATTTTCCTTACGATGTTTG
TTTGTGGGGCATTGATAATTTTCCATAATACTTGAAGTTTATGATTTGTG
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AACCCAGCTGGTCAACTCAGTTTGACAGGTGTCTGGTGTTTGGTATGGAA
AGACAGATTCCGTGGTTTGGTATTAGGTATAATCAGTAAAAACTGTGGGA
TAAATCGAATATATACCGAAAAAACTGGAATCTCTGTTGCACTTGCATAT
GGTCCCCAACACCCATGCACGATGAAAGATTCTTTTTGGACACGTTAAGA
GCATCTCCACTCCACCCCCCCAAATGGTTTTGGGGGGCGCCGGCGTGGAA
AATCCCTCCCAGCCGCCCTCCCTAAATAATATTTTCATCCGGCGGAGGTT
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GGGGGCGCTGGCTACCACTTTTGGCCCCAAGCATGGGCGGATCCAAGCTC
CCTGATGCCCGGGCAGCTGCCCGGGCTTCCGGCCACAAGTTGCCTTTAGC
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TTTACTTGAGGTTTGCCTGGACTTAGAAAATATTTTGGGTCCGCCACTGG
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CATGCGGGCTACTGCCGGACGCCGTGTGAGGGGGGGGGGGGGAGTGGAGA
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TTCTAAACCAAGCATAACGAACTGTAGTGAAATTATTTTGATGTTTGGTG
TTGATACATGGCTTTAAGTTAGCCAATTTCAGCGATCCATGTTTTTCTTA
TGTTGTTATCCTTCGTAACCCTTATATACCTATGTTACTCACTAACTCGT
AGCATTTATTGCCTCGTATATCAAATTTATTCTTCTCATTGCACTTGCTT
TGCTTGTATCTATAAATCAAATTATATTTACTGTGTAGGATCAACTAGGA
AGGGTTACTCTTCTTTCAGGCATCATATTCATAATGCTGGGATTTGGTGC
TGATGGAGCGCCTTCGTTAGTCCAGACAAGAACTCCTCCTCCATCTGTTC
TAGGTGTGCCGAATATTCCTAGTTCCTTGAGTGGATATTCTTACACAATC
ATGAAACTAGGACCGCTACAGTTTACAAGGAAAGGCCTATCAGTAGCAAG
TACATCAGCATGCCTCTCCTTTGCGGTATGTCCTTCATTTCATCGAGAAG
CATGTTTTATCCAAGATCTTCATTATCTTATGCTTTATAATGCCTTTTGC
ATTCTCTAGCTGCTGACATACAGCAGACAAACACGTTCTTACTGCAAAAT
GCTCTGTTTTTTAGTTCTTTGAAATGCAAGTGGTCAATTTTGAGACTTTT
ATTTAAATACTTGTTTCGATGCAGATATTCCAAAGTGCAAGTCTCTGCTT
GACCACAACCACTCCTGAGCAGCTTGCTTCTGCTTTGTGGTGGTTTATGA
TTCCACTGAAGCTTATTGGTGTGCCAGTACCCGAGATAGTACTTACACTA
CTACTATCACTGAGGTTCATTAATCTAGTATTTGACGAGGCAAGTGTAGG
GTAACTACTAAAGTGAACGTCGCTGTTACCTTTTTAAAAAATACTCACAT
TGCTATTTGAAACCAAACTAGTATAATAACTTATTCAAATATTGTACTAG
GTCCGCAATTCAGCATTGGCAATCGTAACACGTCGGATTGATTGGAAAAA
GCTGGCCACTATGGAAACTATAGATAGTAAGTAATTTCTTTAACGTGGTT
ATCAGGGTTCTGGGATGAATCAACAGCTTTAAATATTATGTGGAAAACAT
CGAATTGAATCTTTGACTTATTATATAATTTTTGCAGTTTTCTTCAACTA
CGTCCTGCGGATTTTCAAAAATATATTTGATCATGCAGAGCAAATATCCA
AGGTTAGTGTATTTTCGATTTTTCACTATTCTCAGAAAATGTAAAATGAT
GATGTTGTGTGCGATTCATTGTGTTCATATGTTGTTTGATGAACTAATTA
TAATTTTCTGTGGTTCCATCTAGCAGTCCTTGGTCACACATAATTGCTAG
CATTAGTAGGATGATATATCTCGAGTACTTCTGCAACATTGTACTACCAT
TTGATGTTTGACTAGACTCAAGAAGCTTCATTAACTGTGTAGTGTACACC
TAAACGATGGTGGATGCTTAACAATGCTAACATGTATCCCCAAGCAATCA
ATAGCATGGTAGAATTAGAGGGGGCAGCTATCCCCATGGATAGCAGGCTA
TTTCCCTTTTTTTATAATCAAGTTGGATGTCTAAGAGGAAAATTGAACCG
GACATGGACTTCAGTGCTTGTGTAGAACCATCACACAGGTGAAACTTGTT
CAAGGTTTAGGACCATCACAACTGTATGAAATCTGAATGACTTTTTGTTC
GAGAAACTAACTGAAAGTTACATTGAGTACAGATGCATCATCACTAATTA
ATAGAAAGGCGCTCATCTGTAGTCTTATTGATACGGGGAGTTCCTAAGAA
TGGTGAAACTTGATTACATCATGGTTGATACATTACATTTTGAGTCATGT
AACTTGTCTAGATCATAGTTCCTAGATGGAAATAGAAATCCTTATATTAC
ATGGCTGATACAGCTGTAATCGATATTACTTTGCACCTTTCGTTGCTTCG
CCTCTTTAACCCCTGATTTGTGCAGGCAATGATTGCTCGAGGATACCGTG
GTGACCCTAGCAACCACAAGATCTACTTCCTTACCGAGTCCTCATTTCGC
GTTGTGGATGCATTTTCGTTGCTTTGCCTATTTGCTGTAATGGGCCTGGC
TTCCTATTCAGATAGATTGGTTTGATAGTACCAGGTATTCAAGAGCTATT
CACATATTTCTTATCCTGGTGTTCATTAGAATTTACTGCATCTTCTCATT
TGTTTCAGGAACTATTCTAGATTGTCATATGAATGTCATACGCCATGTGC
TTCTCAAATTGCTATTTACAGAATCAATTTTGGGAAGCGGAAACAGAGCA
GTAGCATGATTCAATTGCCGAGAACAAATTTGTGATTTCTGCGTGTACAG
CAGGACCCCCTTGTGGAGAAAAGACCCACATCCATGAACTGATTACACTA
ACCTCAGGTTCTAAGCAGGTGAGCTATATGTGTTTTATATCCGAAGGAGG
GTCTCAATGTTAATTCAACTATTCCTCCCGTCCTAAAGTAAGTGACGCAA
CATGCGTATCTAGACAAAGCTGTGTTGGTTATTTGGGAATGGAGGGAGTA
GGTTTTATACTGCGTCATCTGATCTCAGACTCTTAGTTGTTCTCTGTGCA
GGTATTTACACATTGCAGGGGCACCACCTGTGGGCGCTGATAATGGAACG
CTTTCGGCTAACATTAGTCTAACTGTCTAAGCAGAAGGTGTTTGTTAGTA
CAGTGTTGCCAGATGGAACAACCTCAAATATATGTGTATCACTATCCCAT
GAATGCCATTCAAATCTATGTTAGGGCCTGTTTGGCTCCCATCATTTGGA
GCCAAAAACGTGAAATTCATTTGACAGTTCCATGCTAGACTTGTTTGGTT
ATACCAGAACTGGATCTGTCATTTCAATTGGAAATTCTAAAAAGTGGGTA
TTTGGAATTCAATCGAGATCCTATATACAATGTGTTTGACTGGCGTGGAA
TTGGAACCATCATTTCAATTGGAAATTCCATAAAATGGATATGATATGTT
GAGTCAATTCTTAGTCCAAACCTAGTCATTTGTCTAGAAATCATTTCATT
TCATAATCCATGTGGCAGCCAAACATGATTCTCATATTGAAATTTCAAAT
TGGACAAATGAAATGATGACAACAATGCCATTTCATTTTATTTCTACCAA
ATGAAATGAAATGATGGCTTCCAAAACAAGACCTTATGGGAAGATATGTT
CACTTCATTTGATAGCATTCACTTGTACTTCCATTTAGCTACATTTGCCA
ACAATTACCATCGTCAGATGTGAGAAAAGTGGCTTGGCAACACACAGTTG
TACAATCTTTATCTGATGAAAGTTCAGACGAGTGCCTGAATTCCAATAAA
TTAACCACTGTCCACTACCGTGGCTCATCAACTACAGTTAAATAAGATCC
TAGTTATGATAATACATGACCCAGTTCTCTTGCAACCCTCCTTGGGGGCT
TCTGGAACTCAACGTTACAATGCATCAGTATGTCGAAGTTGAAGAGTATT
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TGATAATGCCCAGATAGTCATCTTTTATCGTGCCGATGCAAAACTGATAC
AGAAAAGGATGAAACCATAAGAAAATTGTACATCGCAAAGCTTAAAAGGT
CAAGACGAAAGTGTCTTGTTTTTAGTACTTGGGTTTGTAACCCCCTCAAA
TTTAATTTTAACTATAACAATTTTAGAGTTATTTGTCACAAGGAAAATAC
ACCATTGGATACTTCTTAATTTATGAACCGTTAGGACTACAAAAATTTAG
ATGCAATGATCTCAACAGCACTGCAAGTGGAATTAGACCATCATCAAGTC
AAAAAATGAATAACGTATGGTAGTTACTCAGAGGTCCTGCCTCAAAATTC
TGAAGACCGAGCACTTCAGTTCAGAAATTTTGGTAAAAGAAAGTGTAACA
GACTTACAATTTCTGTTGCATCAACACGGGTGCCTATGATCTTCAAACGA
ACCTCACTCTCTTTTTGAATTTTCACCTGAACCAGATAAACATGCAATGC
CCACTTAACACAAGAAAATGACTAAAGCAAATCGCTTTCAACAGAATCAT
CCTTTTCGATTTCATAATGATACCCAGTACCTAAGTCCTACACGTTTCTA
TTAGCGAGATTATTTATATATACCTATTCATGTATGCAGCAAGCATTTAT
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GATATTTCATGACCTGCATATCGTTTCTTTTTCTTTATTTTCTAAACCAG
CAAACTTTCGTGCAACTCTCAAGTCTCAACAAACTAAAAAACATTCCTTT
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TATCCAGATTCGTATGTATCTAGTTAAGTATTTAGACTAGATGCATTCGT
ATATAGACAAAATTGGGGCCATTAATATGGACCAGAGGGAGTAGTTATAT
TCGACATATGATATATCATTGCTTAAATATTTCAACAAGCCAAATAACCT
CTTATGCTACTTTAAACAAACATTACCCCTTCTAGAAAGCAAAAGCCAGA
GTGATTTTGATATGCTTATACAAATATAAAGGTTGAAAGAGATAATCGTT
GGTCCAAATAAACATTTTTTACTCCCTTTTAAGAATGGAATGTGCAGCTA
GTAGTTACGGAAGATGAGAAGAACAGTAAGAACAGCTTATACAAAATACA
CATACCGATCCATCAGAAGTTGTGTAGTTTGGCACATCACCAGATTGGAA
CTCCATATCGTCAGGAATCAACTGCATACAAAAATAGGATAACACATCCA
GTAAGCCGGAATGTGCAAGGTCAGCAAGAACTTTATACTAGGACCTTTTA
CCAATTCACCATAGCAAGCACGTTAATTTCTACTGTGAACCTGCACTATT
CGACTCGGCGACACAACCAAATCAGATGTAAGAGCTTGTACTGAACTATT
GACCACAGAGAATTCTGAAGTTCATCGATTTACTCCACCAATTTGACAAA
GCAGCTCTAGCTAAAAGCACACAAGTCACTCACATGATTTGACACGAAGA
TCTGCACAGGCCCAGCCTCTGCGAAGAATCCCATCTGCAGAACCAGCAAG
ATGAACAATCGAAGTTCAGGAAACAACGCACTAAGGCACACCACACCTGT
GGATAAAAGGGCACAGTAGTGCAGTAAAATCCACAACCTTGTTGACCATG
GTGACGACGGCCTCGAGGATCTCGCCCTTGAAGGGGCGGAAGACGACGCA
CTGGTACTTGACGGGGAAGGTGACGAAGCCCGTGCCCTCCCGGATGAGCC
CCTTGCCGACGTCCTCCACCCCCGTGATCGCCACCACGAACCCGTGCCGC
CCGCTGCAAGAGAGGCATCGATTTCCAGCATTCAGCGCCCGACCGACCGA
GTTCTCCCACCACCTAGCCCTAGGGTTCAGCGATAATAAAGGAACCCTAC
CTGCAGGTGCCCTCGACGTCCTTCATGAGCTTGGCGACGAGCTTATCGCG
GAGATGCGGGCCGAAGTGCCGCGGGTGCAGCTGCATGTTCCGCTCCAGGA
TGATGTGGAAGAACATCTTGGCCTCTCCTCCTCGTCGGCCGGCGGCGGTG
GGGAGCGAGCGAGCGAGCGAACCCTTTCGCCGATTCGGGATTTCGGGGAC
GGGCTACTGCCTAATCGATGCCCTCGCCCAGTGAGCTAGCTGCGGGAGTA
ATAGCCCGGAGACTTGACGCTCTGGGCCGTCAGATCTGTCGTCTCTGAAT
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AGAAAAAACCAAAACCCTACCCCGCCGCCCCATCGATGAGCTTCCGGATG
GCATCGAGGAGCGCGGCGAGGCTTCCACAGCAACCATGCGCGGCGCCGCG
GTCCCTTCAGGCGAGGTCGCGGGCCTTGGTACGTCCGGCGAGATCCGGCG
CGTCAAGTATGTTTTCCCCTTTCGAATCCCCCCGTGGCTTGAGATGCATT
GCTACGGTGTCTGGTACTCTGGTTGATAGTCGGGGTTATGAGATTGGCTG
TGCGTTTTGGCAGGAGGACGTGCAGTGGCGTGCGCCGTTAGCTTCAGACC
ATGTATCGACATCCACAAGGTCAGTAGCCAGTAGGAAGAGACTCAATAGT
GCTAATCATTTGCCCTTCTGTGATCAATGAGTGCTGAGCACTGCACTTTT
GGTGTGTTTGCAAACTGATCTCTAGTTTCTCGCGAGTGATTTCTAACCAT
TTTGCTGCGGTGTGATTCGCAAGTGGACTGCATAGTGCTGAAATTGTGCT
CAACGAACATTTTTCTGTACAGCTAAATGTTTATCATCACCGTTTATCTG
ATAGGTTGTTTTTCGTAAACTCCCAGGGAAAAGTTAAACAGATTGTTGGC
TCCACCCTGCGCGATGCGGTGGATGATGGCACGGCACTAGTGACCAACTT
TGAATCGGACAAGTCCGCAGCAGAGTTTGCCAATGTTTATAAGGAAGATG
GACTTGTTGGTGGGCATGTCATAATGCTTGGTGGAGACGATGCAAGCCGT
TCTGCTGCCCTGGAAGCACTACATGCATATCCTGGTGAGAATATGTTATC
TAGTTATTAGTTATTACCTGGACAAGGAGTATTATTCATTTGTGAGGTTT
TTGAAACAGAGCCCCATTATTTTATTTTTTGTATTTTTTCACCTTTTGTG
GGATCTGGATGTTTCTATGGTTGCTTATATTGCATACACGGATTGATGTT
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AAACCTTCTTTAAGCTTACACACCAAATATTGGCTTCATTGCAAGGGCCT
CGTAGTGCTGTTGTTTACAGTTATTTAAGGCTGTTGCCATCAACTTTTGC
CTTGCGAGAGTTTTTAAATCTGCTAGTGGTGCTCAAGCAGCATTATTTGT
TTCTGTTTTGTTTCTGTTGTAAGCCATGAGATATGATCAATTTTGATATA
TTGTCATAAACTTGGGCTGTCATAATACTAGGTGGTTTGCAAGTTGGAGG
TGGAATAAATTTGGAGAATGCAATGTCTTACATTAATGAAGGGGCAAGTC
ACGTGATTGTAACTTCTGTACGTGCTCATGCTCTAATTTTGTGTAAATAA
TGCAAATTATCTTTTTCTTCATGCCATGAACCCTTTGCGCCTCTGTTTGT
TAAATGTATATATGTATATTAGCTTATGGAATAAGATTCGGGCCTGGCCA
CGTCATATTTCACTTCCTATCCATCTCTTGTTTGTAATAGTTTAAACATT
ATTGTTTTTCTTCAATATCAATATTGTTGTTTCACCAAAACCTAAAATGA
TGCCAGCTTAATATTACCTATATATCCCATTGATAATCACTTATCCACAG
CTGTTACCATTATCCTCTACCTTGCCAATTGTTTTGATTGTCACATTTTG
GCTACTCCTCTATTGTCAATTTTGCGATTGTCACATTTTGGCTACTCCTC
TATTGCCAATGTGGTTGCTTTGTGGCTTTGTTTTTATTGACAAAGCCTCC
CTAAGAGCCTCAATGGCTAGTATTAGCTATAACACGTTCTTTGAAGTTGG
ATTTTTTTTGGAACCAGCTGGTTGTCACCTACGCTCAGGGTCTGGAAATT
TGTCTCATTTATTCTGGTTGCTAATCTTTGTTTTGTAGAGGATTGATCAG
TTGAATATTTGAAGCTTATGTATTTGAGTCTTTTATGCAGTATGTATTTA
GTGATGGCAAAATGAACATCGAAAGACTGACGCAACTTGTCGAGCTTGTT
GGGAAGCAAAGGCTTGTTTTGGACCTTAGTTGTCGAAAAAAGGTACATTT
CATCTTGTGTTAGAACTTTGAAGTACGTTAATGCACTGAAAATCAGTGCT
AATTTACAGTTCTGTTTTGTTGTGATCTACCTTCTGAATTTCGAGGCAAC
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AGTTCTTTGATGGCCACTGTTATCTTACTGATAGCTCTTTCTATCTTCGG
TTTATCTTACCAAAATGTTTCTGGTTAGGATGGCAGATATGCCATTGTAA
CTGACAGATGGCAGAAGTTCAGCGATGTCTATGTGGATGGGCCAACATTA
GAACATCTTGCGGCCTATGCAGATGAGTTTTTGGTTCATGGAGTTGATGT
GGAGGGCAAAAGGTGAACCATGTTCTTTCTGTATTTAATTAATCCTTCTT
TTGTTGATATGCAGTAGTATAGTCACCCTTGGTGGATATAATTTTCTTGT
CGTTTTTATTTCCCATGAGTCTAATTTATATGACGATTTACTTGCTACAG
TTATTCTTGAGATGCTGAATTAATTTCATCTGCACATATCTTTGTGCGGC
CTGTGCATGTGTTTGAGCTCAATTCGTAAATTTGAAGATGAGTGAAGTTA
CCTCTTGTGTGGTTGATTATACCAAGTGGTACATCAATGTGATTGGTCCT
AGAGAAAAGCCATCCTTTTTTATGTTGATATCCCTCCTAGTCCTAGATGC
CGCACCATATTATCCAGCATAACCTGTCAAACTCCATTGCAGTACATCTG
TACATGGACCATCCCATCCAGCAGCATCCCACAACTAAAAACACTGTTAT
TCTGGTTCTCCAAAAAATGCTAGTATTTGCAGGCAGAAATTTTGTGTACT
TCTGTGTTCAGTTACAGTTTACTGGTGACTTATCAGTACTGCACATTTTA
TTCACCCATGTTTAAGTATTTAATCTCACCAGAACCAGATATAAGCTGAA
TTATCTTCCTGTTGATCGTCCAGTTATGGGACCATAATAAAAACGTTATT
TGAGCAGTTATTTGGTTTAATTTAAGCTTGTTGTCGGTTGGTAAACACTG
ATCTTATGATATATAGTTATACTCTACTCATTGTGAAAGCTGTTATGTGA
GCTGCAGGCTAGGAATTGACGAGGAACTTGTGGCATTGTTGGGACTTCAT
TCACCTGTATGTACAGTTCTATACTTGATAATATAAATCCGAGCTTTATG
TTCTGTTTTCTCTCTTTTTTTCGTTTTAAATCCTATTCCGCTATGTAGCA
AGTTGAATCGTACACTTATTACTAGTTGCTCAAACATCTTTTCATTTATG
ATTTTATCGAACTCAAATGTGTTTAGAAATGGAATTTCATGCTTATGTTT
CATTCCAGATGTTCGAGTTTATATTTTGAGTTGCTTTATTATGTTTACGC
ATACTCAGTAATCCCTCTCTAATTTATCTTTGGTTCTGTAGATCCCTACA
ACATACGCTGGGGGTGTGTCGACAATGGATGACTTGGAGAGGATAAAGCA
GGCAGGCAAAAGCCGAGTCGATGTTACTGTCGGGAGTGCCCTAGACATAT
TCGGAGGAGATTTGCCGTACAGTAAAGTTGTCAGTTGGCACAAGGAGCAA
AACATGGTTAGCCAACGGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.