Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004301

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004301
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004301
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAGTCGGGTTCTTGGATATTAACAGTCTCTTTTGAATCTCAATAAAA ATGGATTTGCGTGCCATTGTTTTAGCTCTAGCCACTAGTGCAAGCGATTT CAAATCGCATGCCACGGTTGAACTGGAAGCGGACCTCCTCATATAGGAAT ATTTAGGACCTTGCCGACCTTTCTAGTCATGCTCTAAGATGCTTTTTGTT TTGATCAGGAACTGTAATCCCCAGTCGAACCTTCTCTTACGCAGAAGGTG GGTGCTCTAATTGGTCTATGCACCCCGTCTCGACCTCTTTCCAACCCTTC ACTGCAACTCCAGCAAACAGTTTCTCCTTAAGGTAAAATGTTGCCTGCTG GGCCGTATTCAATTTCTTTGCCATCGACTTCTGTCATTTCTAATCGCCTG TGTCGCCTTCGATTTTAACTATGTTTCTTGTTTATTGGGGCATTAGGAGC GCTAATGTGAGGTATTCCCGTGATTTTGTCAAGATACCGACAATTGGAAG AAATAGTGGACACTGTGCCATGAGTTCTGGACCAAATTCAGCTTCTAGGC CTGAAACGACTGGGGAGCAGGACTATACTGTGGGAGAGAATGATGGTGTG ATCATAGTCGACCATGGGTCACGTCGACAGGAATCTAATCTCATGCTAAG TAATGGACAGAGTATTTTTTTTCTAATTTCGTTGTTTTCTCATGGTGCTT ATCTTGAGTAATTGCTTCAAAATTGCAGACGATTTTGTTACTATGTTCAG GTCAAGGACTGGCTACAGGATTGTTGAACCTGCTCATATGGTTTGTTTAG CACTCTTGCATTTCTATGAAATTTACTTCTATGAATTTGTTAAGTTTCTT GAAGGTCTCTTGAGATTTTCTTATCATCAAGGGGGCTGTTGCTTCCATCA TTGGAGGGGTTGTACATCATTTGTCTGACGGAAGACTAGCAATCAACAAT TAATTTCTAGTTTGGATTTGAAGTTACATCAAGTATTTCTGGAAAAATGT CTTATCACTGAGCATGGCTAGAATGTAATTGAGTGAAAGGTTTTTACATA TAGCCTCAAGTTTATCAATTTTAAATTCAGATGGAGTGCAAACTATTCTC TGGCAAGACTAACAAGATCTCTCATTTAAACTTCTTTATCTGATATGATT TTATTCGGTAGCTATGCATCCAGTAAGAAATGCTTTCAATGCTCTCTCCT CTGCATCACTAGTTCACTACATGTTGTTATTGTACCAGTGTCCTTTACTT GTGTCGTGGGCTTGCTACTTCAGCGAAATCATGTTGCCAGCTCCTATTTT TCACTTCTCGCAATGGCCTTATCTGAGACCGGGAATTATCATGCCGTCAC CAATTTCTGTGTGTAAATGAATACCATGTGATTTTGGCAAAGGACTGAAA AGAGACTATTTACGTAAACAATAAATTCCATAGCCGGACCAACAGAAATG AGATCCTTTTTCATATCTCCAGTTTCATTTTATTTCTCATTTTGAACAAA ACATGTAGCACCATATAAACAGTGACTTTGAGTTACTACAAAGCTGTAAC TTTCATGCCATTGCTTGTCGAAGATGAAGTGAAAAGAATGTGAAGTGCAA GCATTATGCTAGCTTTGCCATTATTCCCCTTTCAAAGTGTCCATGTACAA TTGGTTACCTTGTACATTGGGTTTAATCCAGTTAAAATATTTAAAGACAT GTGCTTCTTTGGATCTCTTTTTATCAATACATACAACGGTTGAGAAGAAT ATTTAGGATCATTCTTCCATTTTTAATATGATGTTTACAGAGTGCAATTT AGATTAATCAGCACAAACAACTTCACATAAATGCATGTCTCCATTGTGGG CTAAATCTTTGGGTAGCATTTTTGCCATGTTAGATTAGATAACTATGAAT AAGGATGTCAACATGATCCAGGCAAGCAAAGGCTAGAAAGCTTAAAGTGA TCACAACCTCAGTGTAGTATCAAGGTGGTCTACCTTATCTTACTTTTCAG GGACACTAGCTAAAGTTATATCTTTGTTATTGGGAGAAATTACCATGAAA AGTAGATACATATTTTTGTGAAGCATGTCATGTATCTGATTTCTGGCATC CTTGTTCCAACTCTGAAGTTCGAACTATACATACTCTGTTGCCAAAATTC ATCAAAAAACACTTTAAGTTCAGGTTCATATTACATGGTATTGTAGTTGA GGATACAGAACATATTTAATGAAGTCGCCGGCTTCTTTTAGCTAGTGAAC TGACGTGTCCAAGATAGAAGCTGGCACTGTTAATGGTTCTCATGTTCCTG TTTCTGATGCTTTGTAGTGACGCATACATAACTTAAATTTGTTTTACCAA GTAGTGATTTAGAAATATTTCCTGAAGATATTGTTTTCACAAGTTGTATT TCAAAATTGTTCCTAGAAGATATTTGTGGCATAATTGGAAATTTACTTGT TTATTGATACCATAGCTCAGATTATGTTGACACATATTTATGTTATGATA GTACCGTTCTTGTATGTTCCTGTCATGCCTATAAACATTGATCCAGTAGA TCCAATTCTCTGATGTATTTATCTTGTTGGTCTAGAAAGGCAACATTTTG CTGAATTTGTGCTTTTGCCAAAATGAAGGAGCTAGCGGAGCCTACTATTA AGGAAGCATTTGGAAAATGTGTGCAGCAAGGAGCATCCCGAATTATTGTC AGTCCGTACTTCCTTTCACCTGGACGGCACTGGAAGCAAGTATGTCACTG AGTCTTTTAATATTGGTTATGCTGAATGTTAAAGACTTATGACTATTTTT TGTTTCTTAAGATGTAACCGTTATCTATCTCTTACATTAATGCTTATATC ACTATAGTAAGACTAGAGTTTAACAGTTTCACAATTTGTTTTCTCAGGAT ATCCCTTCCTTAGCAGCAGAAGCCTCTAAAGAGCACTCGAACGTGGCCTA CATTGTCACTGCTCCTCTTGGATTGCATGAGCTTATGGTGGTATGTGTTC ATTAATTACCCTCTAGATTATTTCTATCACACTAGATCCCCATTGAATGT TTGAAACTACATTTGCTCAGACACTTATTATTCTTCAAGCCCTCGAAGCA AATCATGAAAAAAGAATGTGGATTTTCCTTGATAAGTAGATCTAGAACTG CCGCCGTTTTGATAATTTACTACTCCCTCTGTCCTAAAAAGGGTGTCGCA GATTTGTCTAAATTTAGATTATCTAGACACTATTTAGTATATAGATACAT CTGAATTTTCACAAATTTGCGACATCCTTCTTAGGACGGAGGGAGTACAT TTTTCTGGAAATGGATGCTGAACCCTTTTTTTCCAAACTATAAATCCAAA AATTATCAAGCACAACAAATTAACCTTTTGTTTCCTTAGAGTGCCATCAT GCTACCTACTTACCATTTTTAGTAAAAGATGTGTAATGTTATGGGACATG GCGATGTGGCTCCCAGGTCTAAACGCACCTATTATGAAAAATGCATTTTA TATGAATTTCAAAATCCCGGGTGTGCACCCGACATGCTATGTCCTCATAC AAAGTTTTGCAGTCAGAAGACATTTTTTGAGGTCTGTACAAAAAAGACAA AAAAATGTCTTGTGAAAAACTATTTTGCAACACCAAAAATTGTCTTTTTA CATGATCAACATAAAATGTCTTCTATTTGTGAAACTTGGTGTACGTACAT GGAATGTCAACATGTACATCCGAATATTTTTTTTCAAAATTTTCAACATT TTGAAGTATGTATTTTTGGCAGTGGGTGCATCTACACCTAGGAGCCAAAG TGGATTTCCGAAATGTTTTTGTAATTTTAACCTGTAGATCCCTTTGGTAT TTGATTCTGCTGTATATGTATGCCACTTTGTTGCTATGTTAGCAAGTGAT ATGCCTGCACGCAAAATTAGAAACTAAATTTATCACGCTAATCTGCTTCG ATTTGGCAATATGGCTTCACCGAGAGGGAATTGGAATGGTTTGGTATTAA CTTCTGCCAAAGCACGCTTCGCTCCCGAGCCGCTCCGGGGCGCCCAAACC CTAGGTGGCACAACCCCCCAGAACCGAGCTCCCCTGGCCGCTGCCGCCCG GCCGCCAAAGGTGGAGGGAGAGGCGGTGAACCGTGGTGCTTCCTTCTTCG TGCGGAGAGGGGGTGCTGGGGGCCGCGGGTGGCGCCGGGGTGATTTGGCG TGGGGCGGTGGACCGGGAGGGCGGCTTGCGGTGGTGGTGGGGGTGCTGCG AGGCTGCTATGGCACGTGGAGGCCGGCGGTGGGGTGACGATGACAGCGCC CACGCGGGTCCGATCTGGGCTCACCCTCGGCCTAGATCTGAGGGCAGCCA CTCAGGCCCATCCGGGCCCGGCCCAGGCTTCGCGGCTGAGCGCGGCCGCA GCTCGGGTTTGGTGGCGCGCCAGACCCCTGCTCGTGCGGAGGCTACCGCG GGCTGTCTGTGGCCTTGCTAATTCCCTCCCCTACTGCGAGGTAAGATCCC TGGACCACCGTGGGTTGGTCTGTCGGCGCGTCAGCGAGCTGCTTGTCGTC GGCGTCGAAGACCGGCGGGGTGATGGTGGAGGATGCCTGCAAGGCGCGAT GCTAGGCTGGGCCTTCGCGACGCGACGGGTGCGCTATCCACGATGGCGGC GCCCCTCTCCTCCTCCCACCTACCCCTCCCCACCGCATACAACGGTGACG TCGTCCTATTGCTGCCCCACCTCATCGTTGATGGCGCCGATGGACGGGCG ATGCGCTTTGTGGTGGGTGCAGCTCGGCCACCTTTGGCGGCGAGCTGCTG TGTGCATCAGCATCGTGTTGCTGTTTTCGGCATCCTTGCCACGGATCAGT GCCGTCCGGTGCATGGGTGTTCATGCGACGAGGTTCCTAGCTCAGGCGGT GCTCTATCGCCACGGACCCTGCAACTTGGGGTGGCCTTCGCCGGCAGAAT GGTGGGCCAACCGGGTTCTCGAACTGATGCGGTGTCGTCAGCGACAAGAT CTTGCTGTCGGGTCTCGGAGGTTGCGCCGATGCGTGAGTGGTGATCGAGG TGCTCTGGGCGAAAGCCCTGCCCAACCTTTGTTGGTGCCGACGGCGGCGG CGTCCTCGGGCGTCGTTTCCCTCTTGGGGGCGTTGTCAAGGAGCATCGTC CCATCACCCATCCCACGTGGTTCAGTTCCCTGGGTGAAAACCTAGATCTG GCTTGCCAGATCGGATGACGAAGGCGTCCTGGACGTCGCTCCTTCCTTGG AGGCGTTATCCTTGGTGGTACGGCTGTAGGTGGCACGCATGGTGATGGCG CATGCTTTGACTCTGGCGAGCAGATCCTTGGAGCTCCGACGTCGTGCTAG CTCGGCCACCCCTATGGCAAGGATTGAGGTTTGCGGAGGATCCTCTGTTG CGGTGTTTAGGTTGCATGGATCCACTCGACTGGGGTGGTTGACGGCTGCT GGCTTGGTTGCAACGACGAAGATTGCGGTGGTGGGCGGTGGTGCTGCTTC CTGACCGTCTTCTCCAAAACCGGAGTGGCCCAACTCTGCCCTTCTTTGCG GATTGGATTCTCCCTCCGGTGGCGAGGCTTGTGTTCAGTGTGCGCATCTA GACTAGGGCTTGTTTGGTGTCGTCTGTTGTAATGTTCGGCCTCGGCTATG TACTGTCTTGAGTGTGTCGGGTGTGCGCCTTTTGGCGCCTGTGTATACTT TGTACAAAACTCTCTTTTTCTATCAATGAATCAAAACGCAATGCTTTTTG CGTTTTCGCGAAAAAAAACTTCTGCCAAAGCAAGTTTTGTGGAAAATATG ATGTTTACTGAGTATACCATGTGAGCTCCTACTCCTTTGTTCTCATTATC CAGAGCAGAGCTTCCTGTTAATACAGGAGGCAAAGGTCTTATCACTGCTA GCAAATAGAAACAGGGATGGTTGACGAGTTGCTCGATATCATATCTCAGT GGATTGGTTGTAAATTCCATGCCAACCATGTTTTTGCAGGACATTATGAA CGACCGCATCAAGTACTGCCTGAAGCACGTCGCTGGTGATGCCGATGAGT GTACAGTATGTGCTGGGACTGGAAAGTGCCACCTCTACTCTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.