Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA018743

[Submit comment/correction]

Sequence	AA018743
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA018743
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TTGTTCTTTTTCGTTGACTTACAAGAGATGATGCTCTCTGCGGTGGAATA TATCTTGATTGATGATGCAGTCGGTTTCCTCGCAGAACAATCTGCTCAGC GAAGTTTTTGCATCGACGGCCGCGAGCATGGCTTCGCCGCGGTTGTCTTG CACAAGGAGCATCCCTGCGAGGTACGTATGGCACGCGGCGGTGATACGCG GCAGTCTACATATCTTGCCGGAAGGCACGGGTTCATCTTCCCCACAACAC TTTTTTGCCCTATATTTTCTCTATTCACGACATTGGTTATTGACCTTTCT TCTCCTTCCCAGCCTAGAGCACCATGGCTCCGATTGGTGTGGGAAGCACC CTCCCCGACTACCAGCTCGAGTGGTTCAATGAGACTGACACCCATCTGCA GGTCGATCTTCTCCTCCTCCCATACTTTTGTATCCATTGTTATACAGATC GTGGGCATCATAGTTGGTTCTACATGATTCCAGAAAAGGTTCAACAATAT ATGGTGCTCTGGTTTGTGATTTTGATGCCTAACAAGTGTTTGTTTATGCT TTTGTAAGAACCAAGTCAATGTATATTAGATATCTCATTTGGTCCGTCTG TATACATCTTATGGCTGTTTGAGACGTATTGCATAGTTCGTGATTGCAAA TTTCAGCTGCTCTTTCATATAGAGATAGACCGCAACTAAATGAAGGATCA GTCTACATATTTTAGATGTTCATTGTGGTTGAAGCAAAAAGAGCGTACAG AGATTTCAGGAAATCTCTCCTCAGCTCAGACAATTTTCCAATGTTTTAGG TGTCCTAGGAATGAGTTGGGGAAGTAGTACTCTTCTACCTGGTGTCCCAT GACTGATAATGGTTTGTCTCAATTCACATTTTTTCTTTACCAATCAAACT CCTTTGGCCAGAAAATGATGCTAGGCTTCTATCACACGATATGTACCAGG GCCAAAAAAGGAACTCTAAACATCATAATGTAATTCCGATGCAAATATGT TCTTCTGAAATTATAGGACAAAATAATTTGTTCTCACTTTTCTCCAATTC ATTTCAGAGTGTACACTGTTGATCATATTTCCTTATACTAGCATACATCC TTAGTAAAAGTGAGACTAGGTAGAGGAGGTTGAAAATAAGGCCTACCGTG TACTCCCTCTGTTTAGAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGGAGATG TATCTAGACACCTTTTAGTGTATAGGTTCAAACGAATCTAGACACTAAAA GGTGTCTAGATACATCTCATTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTCCAA ACGGAGGGAGTATATGGGACTGCTTGAACTCAAAAAGTCCTGGGCTCCTT CTCGCTGAAGTATAGCTGCTATAAAATTTAAGAGCCTTTGTCATGCTTCT GCACTATTGCTATCTACAGAATTCATTGCCATTCTGAAATGTTAGTACTC TCTAGGTTTGTTGTGTATTTTTGTTGTTGCTTGCTTATGCCCCTGGTTTC TTATTATTCTGATATTTTTTTCCATCTTGTGTTGCTATCTACTTGGCCTG GCCGATCATATTATGGCAGGCCGTACATGCCAGTATGTTATTTCTCGAGG ATAAAAGTCTAGCTACTTAAATTCATAAGGATTCATAACATACACTAATA CACTAATTATAAGGTTTTACATAATTATTGTGAAGTGCTATGTATGCTGT ATGTATAGCCATTTTTCTCTGCCAAGAATTTTGCACTACATTTATATGTC GATTTCCTTTGCTGTTTAAGGATTGTCTTGATCTGATCAGCTAAATTAAC ACCCACTTTTCATTGTCATCAGAATAAAGGTGCAAATAGCCTAACATAGG AGAACCGGTTGAGGTTGCTGAACAGGATAGAAATATGCCTTCATTATCAT CACCATGCATCCATACAATTGATATTTCTTGCGCTTTCACCTTTCTCATA GATCCCTTTTGCCTTAAAGACATTAAGGAACCAAGAACTCTTTTGCTCTC TGATCTTTGTTTCTTACTAGAATAGTTGTTTGAAACTCTAAATGAGTGAA CTCTTTTATTTTCATAATCCTGCTCAATGTTGCTTGGTACTTTAGTGACA AGAGTGAGTTATGCTTAGTACTACCTCCGATAGATACATGTGTATCTAGA CAAGTTAAGACACTTATTTTGGATTAGAGGGAATAACATATTAGTGTGAC CTTTATCGGGGATTCATCTGACATTATCAATTCAATAACTTTGATGTTAA AAGAGAGGACTAGCTAGCTGGTTTTGTTACATATTACTATATTTCCAAGA TATCTTGTGTTAAGATTTTGAGTTGTCATTTCTTTATATTCTCTTACATT TGAGCCATTGTCCAATAAAGATTTCAGGGTTGAGGCGCCCAAGGAAGATG ACAACACCGAGATAGCATTTACTTGCATAATGAATTTTATAATTAGCAAG TCAGGATCCAGTATGAAGGCATGGTACACAAATATTAATATCTATTTGAT GTTGTTGTTGCAAGTTTCCAGTTATTTAGCTGCTGGTTCATCAATTCTAT CTTGCCCATTGGTCATTAGATTGTTGTAATTTGTTTTTTAAACATGCTTA AACTCCTCAAGTGAAGGTTGGCAGCTAGGCATGGCTATCAGGCTATCCAA GGTGGAACTGGTGTTCTCTTCATAACCTACAATGAGAAGTGGCTAGACAT TGAAGAAGAATTCTAAGAAAATAGAAATTGCTCTGAACTAGAAGATGGTT AACTATACCGGTAGACTTATCCCCTTCAACCAGCGGGAGGCTAGCGAAAA GAGAAGGTAGTAGCGTGGAGCTTAGGGAGGAAGGATACATGCATATGTCT TCTACCACGAGTGCCACCAGTGAGGGCGGCCTCCAGCCCCGCGAATGGCA CATAGAGGAGATGTCGTTAATTTTGTTGCTATCGCTTCATGTGTCTGGTT TAGATGACTGTTTTCTTCTCTCTTGTTTTTTTCCTGTCCAATTTATCTAT TCTCTTGTAGGAATTATGTCCACAATTTTACCGTAGTGCTTAGTTGTAGT CTTTTTTATCTTCCGTGTGTTGAATTATATCACTTGCGTGATACTGCATC TCATCACATTAATCTACCCCTTTATTTTGCACGGTTTGATTGCACACCTG AACTGAAGATTTTCCTAGAATGAGTGAAGCATCATTAGCATATGAGAAGG TTGTGTTATGATATTTTTAGATTAGTATAATCTATCCTCTTTGCCTATAG CGCCTGTGGAATTTATTCTTTGCCTCAAATATTTTATTCTTGATGAAATC GCTGGAAATCATTTTGCATGCTTTTTTTGTCCTGTAAGATGACATTTGTT GATCACCCTCTCATATTTTAAAATAGAAAATTATAGGAAAAAGGTCCTCA TGTAATTACCTTTTGTAGATTAATTATCCATATTTTTGTGTGTACAATTG CTTCTGTCGTACATTGTTAGTAAAGTAATTTTTGGTATTCTAAATTGGTA CGACTCTCATTTTTTACTTATCAGGACTTTATTCTCTAGCTCTTCCAATG TGGCTATTATTTTATTTATTCTTGAATCTAACTATTGCATCGTAGGAAGC AACCGATTTTGTTTTGTAGTTGTATGCATGTGATGTGGTGTGCAAGTGTG GATGTGGGCATAGTTGTGAGGATATGTGGTTTCAACCTGGGATTTGGTAG TGTTGATTCTCAACAAGCTTTTGTGGACGGTGTGAATTCCGCCTAAGTTG CTTTTGTGATACATTATAATTGGAATAGTGAATATATGGCGCGTTTAAAC AAAAAAAGTGTAATGAATTGGGAAAAGAGGATTTGGGTTTTTACCTAAAA AATTCATTTCTATTGTATTTAATGTAGTCGCTCTACATACTCAAAATGCC TACAACTATATACAAAAAGGGAACACAACTAAGATTCAATTATTATGGAT TTATAGACTTAGTTCTAGAGATGATTTTTCTTTAGACAAAGAAGATGATG TTTTATATTTATACCTCCGTAGTAATTTTAGCCTCACAATTGTTGTTCTA TCAATATATGAACTGAGTCAGTTATGATGGAGAACAAGCACTCAAGCATA GTTCATTTAATTTTTTTCAAAACTTTCTGTTTCATATGAGCCATGTTCTT CAGGAGAAAATATAAATTAATAGCCTATCATCTTTTGTGTATTTTACACT AACTAGAACGTTAGCTAGCATAGGTAAGATGGGGTTTAAATAATTCATTA TTAATTTTGTTACACTAGGACGTGATTTGCACCCAGCTACTCATATAACA TGTTTTGTTTTGAGAAACCAAAATCACAAAATCTAGCATGCTCATAATTG TGTCATTACACATGTGATGGGATGGATCTCTTAAATGGTCTGTCTTAAGG CCATATATATTACTATATGTAGAAATCAATGTCTCATATACATCTCAAAC TGTTTTGCTTGTATTTCAAGTAATTTCAAGTTCTAGAGGCTGATGGGTTG TGTTCTTAATCAAAATAAGTTTGTTAAGTAGACAATATAAGTTGTTTAAA ATTTATGTGCCACACTAACCCATTGGAGAATATCTGTCTGATAGTGTATC ATGTGTTGAAAATTCTTCTTGGGTCATAGTTACTGCCAAATGTGTCGTGC ATCTAAACAATGGTTTGGCTCTTTTTGCTTTTGCCTCTCTGTTTCGTTTC TTGCAGTGCTCATCTTCTAGGGGTGTCATGGTGTGGATTTTGACAATTTC TAGATGTATTAGTGAATCATATTGACACCATCGTGTTCCTTTTCGCTTGA TTGATGGCAATTTACTTATCTTGATTTAGTAAAAAAGTGGATTATCAAAT TGCAAACAGGTTTAAATTTGTGCAGAGCTAGCAAGAAATGATCTCTGATC TATATAAATTTTACCAAAAAATGCATGTTTATTTTCTTTTGTGTAGATGG ATGTTAATTTTCGTGTTTTTTGAAATCTATTTCTAGATTTATCCATTGAT ACTTACATGTGTATGTAGGTTGTAGGTTGGCATAATCATAAGATTTGCTT CAATTTATTGACATTTTACTTAGCCTAAAGTGGGTTGGTAAAAGTGGCAT CCATCACTTTGAATGTTGTGTTCCAGTTAACAATAGTAGTATATCATTTC GTCTAATTGTGTAAGTTGATTGTTATTGTTGAGCCCATGAAAGTACAGTT TTTATCCTTGACATTTTACAGAGCTAGCATGGAAATGATTTCCTCATATG TAACATATATACGTCTTAAACGTAAGCATGAATGCATCGTTAAATTAATG TTGGTCAAAGATATTAGTCTTCTTAATTAGGAGCATCGTAAATTAATATT GTTGTCCTGGATAGTGGATTTTAGCTTGCAAGTTGGTACATGCAAGCTAA CCATCCAGACTTAATTAGGAGCATCACTTTGCACTAGATTGTTCATCCTA TGTGTGACATGAATTGGAAGCTAAATCTTACATTTATGCAGGCATCGTTT TCTACTTTGAAATTACAAAACACACTTGACAACTAAAAGGGATCTAATGG AAAAGTTGAGTACCTGCCGAAGAGTTTTGATATCGGCATTTACACCTCTA TAACTCCGGTAAGTTTTTGGTCTGTCTAGATATCTTTAACATGAATTGGT AGCTACATCTGGCATGTATGTGCTTTTTAACTTTTAGAATTAAGATTCAC TTGATAGCAGAATGAGACCTAATGGAAGAAGTGAGAACTCAATAGTTTTG GTATTAGCATTATATTTCGATAACTCTAATAAGCATTATGTTCATGTTGC TTTTCTATAATTCTTCTAATCTAAATCCCGGAGAGTTGTGGCTCATTCCA GGACATCTGTCGACGATGTGATGCTATTTGGTAGCCCAGGCAAGCACGGT CTCTCGATGGTGGTCATTTTACCGTGTTGCATCTGTGCATTGCGGCTGGC GCAGGATGCTGCAGCTGGCGTCCATGTGTCCAGTCATTGGGTGGTTGTTG TGGTTTATTATGCCACAGAGGATTTCCTTCTATTTCCTCCGTCTGGTCCG TTTGAGATCAGATCTTGCCTTTGCCAGCGAGACGGCGAGGGTTTGAGGTT GGTTTAGCAGGTGCAACATTGAGGCATCATTGCTCTTGCTGTGCTGGACA GGGGCAGGGTGTTTGGCCTGTGTTTGCGACCTAGGTCTCAGCCTGCTATC AGGAGGCATCATGGTTGGCTGGAGTTTGTTATTCTTATTATGTGTTTGTC TATTTTTACTGCCACGTCTCCTCATTTCCTGAATGTGTTGTTTGTTTCTA CGTCGCTTTTGGGCTGTAGGTTGTGGCGTGGGGCTACTGGTACTCACCAT TTTTGTCCCGTTCACTTTCCCGCTTATGTAAGGCTGGTTGATTTTCCAGT TTAGTTGTTCCGTTATCTTTTATTTCATTGATTACCGTGTGTTGCACAAT TTCTGTGACATCAGGAACCACATGAGCTTTCATGAAATAAAATTCTTAAT CTTAGACTACCTTTGAAATTTTAGTTGATTCATTTCAGTTGCTTTCCAAA ATCTCTTACAGATCTTCTGAAGTACTTGCTCTTGGCAGCACTCATTGCAA GTCTAATTCAGATTCATGGCCAATGGTGTGGAAAGTGCCTCAGGCTTAGT CAGACATTTTTTCGCCATGGCTGCTAGATACCAGAGACCATGTGGATCTT CTCTATTTCAATGTATGAAGGTGTTGTTTTCGTACATGATGTATAAGGAG TACCACACGGTAGTTTCTTTTGCTCTCTTTCAAAATAGTATTTCTAGGTT TATTTTTACTTAGCCATGATTGGACCATTACCTAAAGAAAGTCTGTTGGG CCTTTTTATTTGACTGTGACCATTGTTGTTTGTAGGGATGCATTGATTCA AGTTATTTCGGGATTCATTGATATATCTAAGCTTGCACTGGTGATGGATA GCCTATATTCACCGATAGAAAGGACAGACTTGAGTTGTTGCACATGCTTC TTAATAGAAACATGGACGCTAGGATCGGTGTATCCTAACAACTAGGTTTT TAATACACGAGTCTTTCTCCCGTCGCCTTAGTTTGTTTTGTTTCATGGTT CAATCCTTTGGGTTGTGTCAACATTAGTTTGCTTTTGCATAAAACTTGAA TTAACCTGACCGGTAGTTTAGTTTAAGTGGAAAGTATGAATAGTTGATGC TCATGATATCTCTACCGATGCTTATTTTCTACATGTCGTGAATCCTCCTT TATTTTTATTTTATACTTTCAACATATCAATAGATAATAATTGGGTTGCT GAGATAATATAGCTTTACCCCTCCCTCCTTCCCACTAGACACATGGAATA TATCTGAATTGTAGCCTATCTTGCTTCTGAACATGGCAAAAAATCTTAGC ATATTGTCCCAGTACACTTACATTCCCTAATTATCCTTTTTATTACTTGC TTGAAGCATGCACCTTTGAATTATGTATCTAGGATGAAGGCATGCTACTA GGTGTTGATATATATTTGTTTTGGTTTGCACAATCAGGATTACCAAAAGG TTTGTCAATGTCAACTGCAATTAGCTTAGGTATTATGATTTGTTAGAAGG TTCCAGCTGTATTCTGAACATATTGTCTTTTTTTGCAGGTCATCTGCCAG GTGTTCGCAACACTCTATTTAGGATGCTCTCCGGGATTTGTGCGTGTCAG ACATGTTTTTTTGTTTAGACTTGGCTCTATTGTATGTATAGAGTAGACTA TTTCTTTTTTGGATATACGGTGGAATCTAAGGATTACAATTTTGTTAGGT ATACTATTACACACTAGCGGACCTTGGACCGAAATCCCGGGGTGGCAAAC GAGCCGGGGGACGAAAAATGGGCTTCCGGCTGAGTTTTAGTTGGAAAATG GGCCAAATACCTGTAAATACTAGGCGATTTTTTCATGGGCTAGGGGCGAC GTCCCAGGTTCGCCCCTGTGATGGTCCGCCAGTGCTACTACATATATGTT TTATGTTTTTATCAAGATGCTATAGTTCGCTAGGGCTATTAAGTACACTT CCTTGCATGATATCGGAACAATGATTTTCGCTAAAGATATGTTTTTAAGA TGAAGCTAGATGAGTTGAATGCTGAGGTGAAGTATGGTAGTGCATGCGGG CCTACCCGTGGATGCATGTGGTTGTATTTATTCTTTTTGTTGTTCCTCTG CGTATGTTGTTTTATGGTTTGTGTTGATTTCTCGACATTTGTTTGTTTTT CAGCTTTCTACCTTGTTCAATTTCAGAAAAGGGGGTTTCCACATGCTCAT ATGGTGATTTGGCTAGATCGTCTATGAGGCCGGATTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.