Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA036438

[Submit comment/correction]

Sequence
AA036438
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA036438
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCACGCCCGTTTGGCCCAGTTTCATAACAGGTCCCACTCCCGAGTTCCC
ATCGCAGTTCATTCGGAAATTCAAATTTCTCCGAGACAGGCGAAAAGGTC
GGCCTCCCTCTCCTCCTCTCGCCCTTCTCCCAAATCGCCGAGCCAAATCC
TGCAGAATCCACGCATTCCCCCCTAATCCGCCGCCCCAAATCCGAGCCCC
GGGGTAGTTCTAGGTGGCGCCGGGGGCATGGCGCAGACTCCGAACCCCAG
CCGGAGGTCGTGGGTGGGCCCGGCACCGACCCCCTTCCTCACGCCGCGGC
TAGAGCGCCGGGAGCTGCGGTGGGCGGAGGCGGGCTCGCACAGCTCCGTG
CGCCGCAGCGGCGTTGGCTTCATCGGTGGGAATGACGGAGACCGCGAGGC
CAACGTTCAGGTCGTACTCCGGTGCAGGTGAGGTGCTCTCGCTTTGGCTC
CACCGAGAAAACTGTTTATAAGCCACGCGGTGATTCACCAAGTAGCAGTG
TAGGAGTAAGGTGAATCGTGGCTTGTTCAGTGGAAATGCTAGCAGCTTTT
TGCCAACTGTGTATTTATTATTGACTACGGAAATTTGGAGCAAATTGTTG
CCGGTGCTAGTTCATGTTACTACCGAACACTAGGAGATGCTTCATGGTTT
CACTGATGCTTTTTGTGACCGGCGCACGGTTTAGGCCGCTAAACGAGGTG
GAGCAGAAAGCGAATGTACAGAGCGTCGTCTCTTGCAACGACATGAAAGG
GGAGGTCACAATTCTCAACAGCCTATTCAAGCAAGCCGACAAAACATACA
CCTTTGACAAGGTTAAGCCACTAGCTTATGATGTCTTTGTTTTTGCATGC
CTGTGGCGTCAAACAGTTGAATACATGGTTATGGCTCATTCAAAAGGATC
AGAATCTTATGCATTGAAAAATCTGTAATATGATCATTACATGCATATTG
AATACATGATTTGACTCGACTCACATGAATTTCCATTAATGTATGGTTAT
TGTTTGATACCAGGTCTTTGGCCCGAAATCTCAGCAGAGGGCGATATATG
ATCATGCTGTTGCACCAATTGTCAACGATGTCCTTGAAGGCTATAATTGT
ACTGTCTTTGCCTTTGGGCAAACTGGAACCGGAAAAACTTATACTATGGA
GGGGGAGATAATGCAGCAGGTAGTGAAAAAATTAAATTTTCTTGAAAAGT
TAGTAACATGCAGCAACTGAATAATTTGCCTCATCTGCTTTTTAGGTGGG
TGAACTGCCAGCTTCTGCTGGTGTCATGCCAAGAGCAGTGCGCCATATCT
TTGACATGTTGGAAGCACAGAAGGCTGACTATAGCATGAAGGTAACCTTC
TTGGAGCTCTATAACGAAGAGTTAACAGATTTGTTGGCATCAGAGGACCA
AAGCAGATTCCCTGAAGATAGACAGAAAAGGTCTACTGTATCTCTTATGG
AAGATGGCAAGGGTGGGGCGGTCATAAGAGGCCTTGAAGAGATTGTTGTC
TACACTCCTGGTGAGATATATGGTCTGTTACAACAAGGATCAGCTAGGAG
ACGCACTGCTGACACTGCGCTGAATAAGCAAAGCAGGTCAATGACCATTT
CAATTCTCTTTATGGGTGCCAAAAGGGACGTGTTGCATACTGAGCATTTT
GCATCCTGTACTTGCAGCCGATCACATTCTGTCTTTTCGATATACATCCA
TGTCAAAGTAACAACAATTGGGAATCAGGAATTCATGAAGTGTGGGAGGT
TGAACCTTGTAGACTTGGCAGGATCAGAGAATATTGATCGATCAGGTGCA
AAAGAGGTATGTGGTTCTCTTTCAAGTTAACAAGTGATTACATTATCTGT
TCGTCATACTCTATCCTATTGGTCTGCTTGGGTTTAGTCGATCTGTCCAT
ATTTTATATTGCTCGAACTGGTAAAGTACATGCTGGAAGATGATAAACTT
ATATATTATTCTATCACATTTAAATAGTTAAATCAAAGAAGTCAATGCAG
TTTAGAAATATTGCAGGTCCAATGGATAATTATCCTATCCTCTGAAGTAT
TATCTTTGCAGCAAAAGAAATACTTGTTCTTAGAAAGTTACAATGGAAGT
TTTGATGGTACATATGTTGTCCTAATTGATTACTATTAAGTACTATATTT
AATCTTACTATTGTGCTAGCTTATAATGTCAATTCTTTTTACATGCCAAT
CCATTTCGAAGTCATGATTTATAGCATGCTGATAGGTTAGAGCAAGAGAA
GCGGGAGAATTGAATAAGAGCTTATTAACACTGGGTCGTGTCATCACTGC
ACTCGTGAAGCACTCAGGTCATGTACCATACAGGTACCAGCCGTTTCTCA
TAATAAACCAGAAAGCCGTCACATAACTTATTCATTGTTATTTATTATTT
TATTTTGAGCTTTACCAGGGACAGTAAGCTCACGAGACTGCTAAGGGAAT
CCTTGGGTGGAAAAGCCAAAACTTGCATCATAGCAACAGTAACTCCATCT
GTCCACTGTCTGGAAGAAACTCGAGTTACACTTGATTATGCTTATCATGC
TAAAAGCATAAGAAACAAACCAGAGGTGCTAGTTTCTCACTTCTATTTAT
TCATGGCGTTCCTGTTCAGCTGATATCCTTATCACAAACTTAACTAATGC
TGTAGGTAAACCAAAAAATTTGCAAGTCTGTTATGCTCAAGGATCTTTAT
CAAGAAGTGGAAAAGATGAAACAAGGTTCTCTTCAATCCTATATTTCTCT
ACCTGACACTATTATAGGGTCTCACAAGTCACAAGTACATTGTCAGATGT
GAAAGCCGCAAGGGAAAAGAATGGAATTTATATCCCTCATGAAAGGTTTG
TTCTAGAGGAGGCAGAGAAAAAGGTATATACTATTTCTAAAATAGCTTAA
TCAATTTTCTCTACTGCACTTGGAGAGAGATATGCACTAGGTTACATGGC
TTCACGGGCTTTGCCATGCTATGGGCTAAACTCTAGATATACAAGTAAGA
TATGACTAATACTCTCAACATATACAGGACTTCAGATTATATTAAACATA
GTTACCTCTGTGGAAGATATCGAAGTTATCTTAGTATTTTTGACTATATG
TTGCAGACAATGAGTGAAAAAGTGAAGTGCTTGGAGCTTAGTCTGGAGAA
GCAGAGCAAAGTATAGTTTTATCTAATTCAAGTTTTGATTTATTAGTTGG
TTTACTAGTTCAGGGTTGAACTGACTTGCACCTTTGGTGGTCTGGCAGGA
ACTCGAAAAATATAAAAAACTGTACCTAGAAGAACAGGAGAGCAGGATGG
ATTTGGAAAGTCACAATACAGAGTTAAAGGTGCTGCAGTTTGGTTAACAT
TGTTTTTACTCTGCAAAAACCTCCTAGTTTGTTAGGCTTTCAGATCTTCA
TATTTTCTATAATCTGATTATTTAGATGAAGACTGAAAGTTGCAAGGTGG
AATTTCTGGATCTGCAGAGAGCTCATTCTAGAGCTAAAGTATCTTTGAAG
GAAAAGGAATACATAATCTCAAATTTACTCAGTGCTGGTAATTGTTCTAA
ACCTTCAAATTTCTAGCTTAAAAAGCTTAATAGATGTAGAAAGCATAAAT
CTTGGATCAACTTCTGATGATTAGTACTTTTCATAACATTGTATAGAGAA
TGTAATTGCTGAACGTGCAAAGGGTATGTGTGTCTCCTTTGAGAATGCAT
GTGGAGATATTGCTGATCTTCAGAATAAACTAGGTAAACAGCTAGTTCTT
CACCCCCAGTTTAATCTAAGTGAATAAGTTGGTGCTTCTTGCACTGACTG
TCAGTGGTGCTTTGACTTATAGGAAGACAGTCACAAACTGAATCTGAAAA
TAGAGGGTTACTATTCAATTTTCGGTCTCAACTGGATGGAAGTCTTGGAC
TTCTTCGTAACACAGTTGTTGCATCTATTTGTGAGCAACGCCAATTTTTG
GAGTCAATGAATGAACAAATGAATTCATATTTTTCAGCTAAATCTCAGGT
ACTATTACTAAATTATTTATTTATTACAATTCAAGATCAGCATGATTATC
CTCATACACTAATTTATCTGCATTATGTAACTGCTTCCAGTCAGCATACC
ATTTGGAGGGAAGAATCACAAAAGCCAAAGATATGTATGCCTCTGGTGTG
CAATGCATAAACGAGCTTGCCAATACTCTGAGGCAGCTATCCATCAGAGA
CTCTGAACAAATGAAGCTGAATATATCTTCGCATGCAATAGCTGTTGAAA
ATGTAATAATAAAATGTTCAGTTTTAATCGCTATCTGCTTCAAATTAATG
AGGCGCGCTACAGAATCTAATCAATGCTTGTTTATTAACAGTTTCTAGCA
GTGATGGTTTCAGAGGCTGAACAAGTACTGACTGAAGTTTTAAGATCCAC
TTCTGAACTCAAGGAACTACTAGCCTTTTCTACTGAACAGCAAGAATTAG
TATGTCACATTGACACTAGCTTTTGTTAATATCTGCCTCTGTTGCATACA
TTATGCCAGATGCTGCAACTCATTCTTCTAATTTTCTGGTAGGGATTGCA
AAAGAGTCTTACCTCGGCACAAGCCATGTCAAAGACATCAATTGATTTCT
TTAACGACATCAGCACACAGGCGTCTAGGATCATGAATCTTATGGACCAA
AGTCAAATAGGAAGCTCCTCTCAACTTGTTGAATTTGAGAAAGGATTTAA
GGTTTGTTTGTTTTGGTACATATACAGTTCATGTATTGACAAACTCATTG
ATAACATCCTTCCTTTCAATAGGAACTTGCTATTCGAGAAGAGCAAGATG
CTCGTAACAAGATTGATGGAATTTTGGCTGACTTGACTGCTAAAAAAACG
ACAATGGTCAGCTTATCTGTTGTTTAATAATTGAGAAAAAGACAACCCTC
TTTGTATGGCTTAGGCAATAACTGGCCTCCCTTTTGGCAGGTTTCAAAAT
ATGTCAGGCAACTGAATGAGAAACATAGTGAAGATCAGAAACACATTATA
CAGGAAATGTCCAACCTACAACAAGTTTCATGTAATGGCAAAAAAGAGGC
TACATCCTGTGCTGGAAAGATAGAGAGCCAGTTCCAAGAGGTCAAGTCAT
CACATGCTAACACCAAAGATCAAATGGGGGACGTCTTGCAGAAATGGTAC
GAATCTCACTTTCCTACCTAAAATTATGTGCAATATGAATTACTTTTTCT
CCTTTCAAGTCTTTCTGATTGCAGGATTTATTTATGCTGAACAAACTTTG
TTGATTGCAGCTTGGAGAGAAACGACCATTCTGTTTCTTACTGGTCACAT
ACACAGTCATGTTTAGAACATATAAATAAGAGCTCAGTTGTGGAAGCTGA
TGCTTTTATAGAGTAAGTTGTATTCTTTTTTTAAAAAAGCAACCATTCTG
TGCAGAACTGTTATAAACCTTGCAGTGAAGGGTCTTTTCATTTGTTTCTT
ATGATTTTCTTGCATGCAGTGAGAGAAGAAACGAGAATGACAGTATTATC
CAGGAGTTTTTGCTTCTTTCTTCACAGAATGATGCAGGGTTTCATGCGAT
GATATCTGATATTATGGACGCTTCCGAGAGTAAGATATACTTGGATTATC
GCATATTTTTCTGCCACAAGATGGTCTTTATTCTTACATTGCCCATTTTT
CATTTCCAGATTCTCAGTTACTGGATCATGAAACTAGCAAGAGAATGGAA
GCTGTATCCACCTCGCTCTCGAATCAGTTGGCATTGCTGAATGGACAACA
CACTCAAGGCACAGAATCTATAAGAGACATTGCAAGTAACTGTATTGAAA
AGGATTACTTGGTAAGCTTTTATATCCCTATCCGCAACAAGTTAATTTAA
AACTAGAAGATAGAAACAAGTAATTATCTTCGGAAACACGAAATGGTTAT
CTGTTGCTCAAGTTTAACTAAATAGTTGAACTTTGTTGAGTATATATTAC
AGTAAATTGTTAAGAAGGCCGCCATTGATGATGCGACTATTAGCTGAACC
ATATTAACTTATGTAACCTACCATATGGACATGCTTAACGCTTCCTACGT
TCTCTTTTGGCAGGTCATCAGTCCAATTCATCATCGTTCACGGGAGCTGC
CGACCAGTGCATACGGCTTAGAATCAATCGAGGAGCTGAGACCCTCGCTG
CCAGACCTCGTGGCGCGATTCAAAGCGGAGAACAAGCCGGACGAAGCCGA
CAAAGGGAAGCGGCACTCGGATCAGAGGGCGCGTGCTCCAAGAAGTCCTC
TCACGCCAGTCAATCACTAGGATCGGTGAAAGACACTAGAGTAGCAGCAA
ATTGTGAGATGGCCCAGATGTCGTAAAGATGGCAAGATCTCTCTCTTGCT
GGTTTTATCGCCTTGTTGAATTAGCGTGCATCGGCAACGAGACGTTGCGC
CTGCGTGCGTGCACTGTTTCTGGTTATAGGGCAGTGATGACAAGAAATGT
AGAGGGCAGGCGTTTTGTAATAATCCAGGCGTATTTACTCCTTCCGTTTC
AAAATATAAGATGTTTTAGGTTCATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.