Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA033463

[Submit comment/correction]

Sequence
AA033463
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA033463
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCAATAGAATGGTAGGTCAAACAACCACAGCAAAAAAAAAATACCAGGT
TAGCACAAAACTGCAAACATCATCTATAAATATGTGAAGTGGTCCCATTG
TCATACCATTCCAGCCTTGGCGAGAGCATCAAGCAGCATGTTATACGCAA
ATATATCCAGCTTGTACCCCTTCCTGCGCATTTCGTCGTACACCTGGAAG
CCCTTGGACACTTCCCTGCTCCTCAAATGCGCCTGCAGGATGCACTTGTA
GGTGTATCCGTTAAGCCTGAGCCCCCACTTCATGGCCAGCTCCAGGCACT
TGGTCACCTCCACGCCTCCTCCGCCCATCCCGACCAGCAAGTTCACCGTG
GAGATGTTGCCGGCCACGCCGGCCCGCTCCATCTCCGAGACGAGCCGTAG
AGCCTCGCTGGGGTCCGCCCTGGTGCGGAAGAGGAGGGACAAGATGCGGT
TGTAGGAGAAAGCGTCGTGGCGGAAGCCCGGGAGGGAGGCGGGGGCGAAG
CGGAAGAAGGCGAGAGCAAGGGCGGGGTCCGGGGAGAGTGCCTTGACTAC
CTCGGAGGCCTCGGAGGTAGTGAGCGTGAGGCGTAGGCCGTGGAGGTAGT
CCGCGAGGTCGGCCAGCGGGGTCGGGGAGGCAGGGGAACGGAGGATGCGG
GCGACGGCGCAGACGAGGTGGCGGCGCGGGAGCGGGTGGCCGCGCGGGTC
GAGCGGTGTCGGGGGAGGCGTCGGGGAGACGGTGACGGTGAGGGAGGGGC
CCGAGGGTGACGGCGTGGCGGCGGCGATGCGGCCGGAGTAGGTCGTCCCG
ACGCGGCGGGGCATTTTGGCGTCTGCTGGGGGTTTCGGTGTGAGCTGCCT
GGGGGACTAAACCCGAATGGAGCTTGCTTACTAACCCCACTGACACGTGG
GTCCGCTTTGTTTAACCCTATCATCTTCTTCCTGCGCAGACTCCTCCTCT
CGAGCTAGAAACCTTCTAAAGTCTAAACCCCACCCGCGCGCAACCTCCTT
CTCAATGGCGCGGCTCCACCACCTTCTCTCCCGCGCGCTCGCTTCTCACC
ACCTCCTCCGTCCGTCTCCTTTCCCTTTGTCAGCGCGGCCGACTCTCCCG
CTCCACTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCCATTCCCGCAGCCAGGGCCCACC
TCCTTTCCTCGCCGCCGCGTCGCGGTACTACGCGTCATCCGTATCCGGAC
GACGGAGGCGCCGGTCACCGCCGCCGATGTTGCTGAGGCGGAGGAGGACC
AGGAGGAAGGGCTCAAGCGAGCTCAGCGTGCAGATTGGCATCGAAGAAGC
CCTCCCCGACGACCCCTTCATCCTGGTGACTGATAGCTTCCGCACGCAAT
TTTCCCTGCCTGTAATTGTTAAATTCTGGACCTATCTCTAATTGTGGATT
GCCGGGCAGAGTATTGCGGAAACGCTTCGAACGGATGTTGGGAAGGCAAT
GAAGCTGGCATTCGACAATCTGGAGAACTCGGAGTACAAGACTAGAGACA
CGTGTATAAGAAATGTGGATAGGTACGACAGCGTTGAGGTGTCTCTGCTG
CTCTGTGACGATGATTTCATCAGGAAGCTGAACAAGGAATGGAGGGATGA
AGACCATGCTACCGATGTCCTTTCGATGTCGCAACATATCCCAGGGCTTG
ATATCCCCATTGTAAGAACTGAGGCGTGCTATTGGATTAGTTTATTTGCT
ACAGATGATTTTATTTTGATCTTTTATTATCTGTTGTATGGTTCAACAGC
TGCAGTTGGGAGACCTAGTAATTTCTGTCGAGACAGCCCGGCGACAAGCT
GAAGAAAGAGGCCATGCGCTTCTTGATGAGATGAGAATTCTCATGGTTAG
TCTGTTTCACTTATTGCTAGCTTCAAACAAAATTTCTTTACTGTGGTGCC
CCTTATGTATGTATTTGTTTCACCTTCACCAATACACAATCAATGAACAA
ACAGATGTGTAGTTCTTGTATGATATATGATTGACCAAACATAGTGATGT
TTGATAATGGTGTTGCTGAGTTCATATTGTAGTTGTAATGGTCACAACCA
AAATTAAAAATTAAGATGGAGATTCATGGGTTGTATTTTGAATTAGTGCC
AAGATGGAGATTCAACTGCTCCCTATTGGCTTAATCGCTTGAATACCATA
TGTGTGCAAGTGATTATTTCTGTGCTACTTCTGGTTTATCATCTTGTGAA
GAAACTTGCTGCTTCGAACACTATTCTATATTAAACCAAGTTAATCACCA
TTAGGTGCATGGATTATTGCATCTATTGGGATTTGATCATGAACTCGGCA
AGGAGGCTGAAGAAGAGATGGAGAAGGAAGAAGAACAAATATTAAATACT
CTTGAATGGAAAGGGAAAGGACTCATTAGGAGTGCATATCATTTCAGTTC
CGATATGGATCATTCGGAAAATCCAGATGGTAGGTTGCCCTTGCACGGTT
TCATTATGTTTTTTTCTTTATCCAAAGGGTTGCCTTGTGTTTCTTCTCAC
TGGAGTACCTCTTAATTATATGCAGAGGCCAATAAAGATCTAGAGAAAAT
GAGCTTCAGGGAGGGTCATCAGCCAAAGCTGACCCATATAGTCTGTGATA
TAGATGGTGAGTTGATGAAACATCAAGAATTATAATGTTTCTGCTGGATT
TTGCCAACTTCTAGCAAGTAACTTATTCTGAAAAAATCATTAAGGTACTC
TTGTGGATTATGAAGGACACCTGCGTGCAGAATCCATAAAATCTTTGAGA
GAGGCTATATCACAGGGAGCAACTGTTATCATGGTTACTGGCAAGGTAGG
TTTAACTTGTATTATTAATCATGAATACAAAGATATTCGATCATGCAATG
TGAATGACCCTGATCAGAGGTTAAGGCTAGTTCCCACTCTTTCCTTAACA
GTATTATCTATTTCACAGAAGGAAATAGTATGTACAAGTAGCCTTGATGA
AGGTTGTGAGTTATTTTCAGTAGAATGTTTACCGCTCCTGTATAGCTTAT
TATCTTAGTTGCAACTTCATTCTGATGGAATACAAATAATAAGCAATATA
GTTTCAACTTGTCATAAATTACAGGGACCATTTGTGATGTTAATCTTAAG
CATACTGAAATTTACTAGGAAATGCAGATGCATTTTTTGTTTAGTTGCAT
ATTTCTAATATTTTCTTGGCTTTCTTCTCTTTTAATTAGACCCGAGCTTC
CACCATAGCAACTTTCAAGCTTCTTAATATGGAAGATGAATTTATATCAG
AGAATTCACCTGGTGTATTTCTACAGGTAAATTCTCTCCATGCTACTTGA
ATAGTTCTGGGAAGTGTAAATTGGCTGTCAGAACCGTGTGGCTTTGTGCC
AGTGTTCTTTTGACACCCATGTTCTTTTTATTGTCAAATTGAACACGCCT
GTTCATGTTCAAGTAACATTTTTTGTGCGCAATATTCTGCTAGATCAACA
CCCTTGTACTTACGCAAGTAACCCTGCTTTAGTATATGCTTGTGTGTGCG
CAAGCTTGTGCTTGTTTTTGTAATTGCTCTTTTAGAAGAGACTAGCACAG
GGCCCATGTGATGCTACGGATCTTTAAAATAGTTTTACTCCCTCCGACCG
CAAATAAGTGGACATTTAGGAATTTTAAGACAAATTATGGGATAGAGTAG
AAAGTTCATTGGGAATGTGTTAGCCATGTTCTCTCTCATCTTTAATTATC
CCACCTCCAATGAGATAAGTGCATGTATAAATTGAAGAGACCATTTGCTA
AATGTTATTGGGCTTGATTTCCGTGAAGCAATTTTTCCTACTTTAAAGTG
CATTCGGAAGGTAGAAGTACACTCTTTTGTGGACAAATTTTGAAGCCAAA
CGTACACTTATTTGTGGACAGAGGGAGTATGGTAAAAGAGTTTGTCTGCT
ACGGAGACAAAACAAGTTTCGATGAAGAACGTTGGTACAACCCAATATTT
GCGCCATAGTCATTACATCATGTAGTAGTAGTATATTTTAATGGATGTCG
GTTAGGTAGAGGAACCAGGATCTGTATTTTTTTTTAAGGATCTGTAACGC
GTCGCTGCTGCCCACTTGCCCAGCTGGCCACCTCCACCAGACCTAGCCCA
GCAGGTAGGACACAGGCACACAGCCAGCGCACACACAAAACGCACAAACG
TAAGTTTTTCTTCTTTTGAGATACACACACGGAAGTCGAACGAACGCATC
ACTCAAAACAAAAACCACCTCATCGAGTTCCCTTGGGCTCTTTTGCAGTG
ACCTCGCCGCTTTTAGCATTCCAAAGCAATCTAGTCTAGAGTCCTCTTCT
TCTGTAGCTCTCCTGTCCCCGATGACCACAACGCCTCCAAGCCCCACCGC
ATGCATCCTGCCGCCTAGACCCTCTCCCTCAGTACCTTATGTTCCCCTCG
TCTCTCTCCGCTCTGGCCCGAGGGCCGGCGCAATAGATCTCCAGCATCCC
ACCGCTTCTAGCACCAGCATAAGCGCTTAGCCGGTGCCCTCAAGGTTGTC
CTCCGTGCTGTTTCTTCGCTGCAGGGATGCTACCTATGGATTGGCGCTGG
AAAGATAAGACGGAGTGTGTCAATGGAAACAAGGAGGAGGGACGCATCTG
GGACAGGGGATGGATTTTGTGATTGCGATTCTCGGAGATAGGAGATGGAG
AGGAGGCCGTGCTGGACACGTGAGAACGGTGTGAGGCAGCCGCAGATAGC
GGCTCGCCGCTCGTGCTGGGTGCGTCTGCCCGTGCTGGGTGTGTGGGTGC
GTGAGAACAGCGTGAGGCAGATGGCGACTCGCCGGGTTAAGGCATCCCGT
CGCTCGGTCACGAAGGAAAAAACCGAACGAAACAGTACAACTTGCGGAGG
TAGCAGTGGGTAATTTTCAGTCGATTGTAGGGGCAAAACCGTCCAAAACG
GACAAAACTGCAGAAACGTTTCTGTTTTTATTAGTAGGTATAGATAGAGC
ACTGAAGGGGATGCCATGAAATGATATGGTTTTTTTTCCCCAATAGGATA
TGTTTTGTTGATGTTCAAATCTTGAGAAAGTATTGAACTGGACAAAGTTT
TGCCCATTTCATGTGAATTGTTCCTGCATCTCTATAAGATGCACTGCACC
AGCTTCATTATATATGAATCTAGAATTAAATTTAAAACATCATGCAGGTT
TATAAATAAGGATAAGGTAGATGGAAGTGAGTGCCAGCTCTCATCATTGT
CATTCTTATACTTGTTTGAACAATAATTATATGACGTTATTTCTTTTCCA
ATTGATAGTTTACCCTTATATAGTTATAGTTTTGCTCTCTTGGATGCAGG
GTTCACTTGTTTACGGAGGTCACGGACAACTGATTTATAGAGCAAACTTG
GATGTGGATATATGCAAGGAGGTAGGTATTTAGAATATGTCAGCTAACTA
CTTTCTGCTAGCAGCTTGCACTTTCATCAGAAGTATAGTTCTGTGCCTGC
TCTTCTTCCGTAAAAAAATTCAAGATCTGCCTACTGTTCTTTTGTTAGTA
GATTTGCAGAGCATTTGTCAAGTCTTGCCTGTTATTTATCATGAATTTGG
ATGTTAGGCATGAAATGTGCTATCTCTGAGCTCAGGTCCCTTTGGTATCA
ACTATTTGTTCGATCTGTTAAGACTTATGCGTCCCTTTTAGAGGTGTATA
AGATAGTCAGATATTATATTTAAATTCTTTTTTTTTCATTGGCAGGCATG
TTTGTACTCCTTGAAGCATAAAATTCCTCTTGTTGTATACTGTGAGGAAC
AATGTTTGACCTTGTTTGAACATCCTTCTGTCGACTTGTTGCACACTCTG
CACCATGAGACCAAGGTACAGTATTTAGGTTTTTGCTAGATAAACTTCTT
GCTCCTGCCCTTTTAACTGTGTTAAGCAGTTGAGCCAATGTTGAGTTTTT
GTCATAGGTAAAAGTGATGTCTTCAGTTGAGGACCTCTTGGAATATTCAT
CCATTCAGGTTTGTTACTGTAACTATGGTAACTCCAAAAGTTGATATGTC
GTTAAGGATGATAATGTTTTCTATGTTTGAATCGGTTTTGTGATGAGTAA
ACTTACACAGCTTAGTTGCATTTGCAGAAGTTGCTTTTCCTTGCCAATGG
GGAGGAAGATTTATCTGTCCTGACACGGCATTGGTCGGAACTAACAGAAG
GGAAAGCATCTGTTATCAAAGCACATCCAAATGCACTTGAGATTGTCCCC
CTTAATGCTTCTAAAGATGGTGGTATAAAGGTTCTTCTTGATCATCTCGG
AATAACTGAAGATGTACGAGTCCGTTCCATAACTGAACTGCATTTAATGT
TCCGTTTGTACGTTATTCTTTGTATTGTACTCACTTAGAAAGCATCACCA
CTGCGAAGAATTTCTTTACAAGTATTATATCTACTTATGCAGTCTGATCT
TGATGCAGTTGGAGACTAAACCAGATGGCTAAGCAACAAGTGATCCAGCT
GATATGATTATCGAAGTATTCTTTAGCAAGAGAGTGCTGACGGAGAGCTT
GAGATATTCTAAGGAACGGCATGTCTGGGATGCACAGAAGACAACGGATG
GTTATCCGGGAACTATGTACTTTGATAAAGGGATGTGGGTTTTGGAGTGG
CAAGTTTGATATTTCCTTAAGCTGTTGGCATTAAGTGGTAAGTTTAGTAT
TTCATTCAGGTAATATGGTTATAATGTTTAATATTTTGCACTTGTAGCAG
TTTCACCTGGTTTTATGAGAACCTTTCCCTTGTTAGCAGATGTCCTTCAT
GGAGGTGAACAGAAAAGAAAACCAGACGAGCCTATCCATGATATCATAAA
GACAAACACGAAAGCACATTTTTCAACTTGTGACTACCTTATAGAACTAT
TCCCGTGTCCCTTCATTCCGAGCAACCTTTCATTGTCATCATTCATGACA
GTACTGATTTTCCACAAAAATATTGGTACAGCTGTCCTTTGAAGAACATT
TATGATCATTGCTTAATACATCGTTTCCATACCTGATGACGATATGTTTA
TAAGAAGAGAATATATGATGTTGTATCGTGGGGAAGTTTAACAGAGGGAG
CTGTAAGCTGCTCTATGATCTATTGAGTTCTTCTGATTATGGTTGACGTG
TGCCACTTCATCCATTTTCACTGTTAACTTTCATACAGACTAACATAAAA
TCAGACCTGAGAAAATTCAGGTTGATCCCAAAAGGAAAATTACTAGTTTG
AATTCCACGTGGAAGTGTACACTAAGTACAGCATGTTTGCGGGAAGTGGA
GGCCTGGCACGCTAGTTATTATGTACTACCTCTGTTCCATATATTAACTG
TCGCAGATTTGTCTAGATTCCCATGTATCCACACACCAAAATGTGTCTAG
ATACAATCGGTGACAGTTAATTTGGAATGGAGGGAGTATTTCCATGGTTT
CACTTTGTTAAGAGTTCATATGCATCTGTACATCTTTCTTGTTCTGCTGT
GCAGCTAAATTTGCACTGCTGCACAAGAGTTTGGTGCTGCTTGCTCTGGA
CAGTAGACAAGCAAATGAACCTTTTGAAGGCCTCTTCGCTATCATCTTGT
TGCATGTCCTAGGTGAGTGATTCGACCGCTGATTCATGCCTAATCCTGCT
GTATAGCTCTTGCATGTCTTCATCCTCTTATTGTAAGTAGCTTCTTTTCC
AAGGTCCTGAAGACATGTAGCACTAGATATTGATGTGAATGACTGGGACT
TTCCTTGGTAGTACTTGGAGAGCCCTCTCCTGTGGAAATGGAATAACTAG
TTAGAGGTCATTTTTTAATGCTTTGCAACTTATGAGGCTTTTTTTTTATA
AAATTAATATGGAGAATATGATTCTTTAAGAGCTATGACATTCTGTCCTC
CAGTTTTTTGATTTATTTTATCTTGAGAAAAATGTCGGTAATGAGCTAAT
AGTTGCGTAGTGACATTGAATATTTGCGTGCTTGTCATATGTATTGTGCG
AAGGGGAACCTCTTCAAGATATCACATGGGATTATCACTTTGAATTCAAC
CATGGGATTTTGAAGATGTGTATCACAATCAATAAGTTGTTTAGTATGGA
AAAAGAACACTGCAGCACAAGATTATGATTAGAAAAGAAGAACCGTAATT
TTGAGATGTCAAGACTCTACCATTACTTTCGATGTGAAGTTTTATATACC
TGTCTAATTTGCAAATGGTATGTGCCAGGAACTATGTGACATTCATGTTT
CTGTGGATGGTGACAACTATTGGTTTGTTGACACAAATAGGAAACTGCAA
ACGGTAAATTCAGCGGTTTGAGCGTGCACGGTCTCCATGAAACTCAGAGA
TAACTGAATACATGTGCAGGGGGCGAGCGAAGCATGTACCTGGCAGCAGG
AAGCTGTGCCAGCAGAGAAGACAGCTCGTAGAGTGGTCCCTCGGAATCCA
GCTGCAAGGTGCTCGACGACGACGACGCTGAAGACGACCCTGCTGAGCGA
TCAGGTGGAGAGTAACCTGCATCATCGCTCAGATTCGACGATGCCAATGA
GCACACCGACCCATCGGACGACGTGCCTGAGGCAGAAGCCACGTCAGCGT
GATCCTCTCCTAGCTCTGCGTAGGCGTCCTCATGGCACAGAGCCATGTTG
CGGTCTTTATCCATTCCAGGAGGGCGGGAGCGATGGTTATCTCTCGGGGT
GTCCAGGGCTTGGACGGGGAAGGAAAGGACCCCATGCTCGTCTATATATG
CAGACGCAAGAGACGGCCGTCTTGCCCGTTCAGATAGGCATCCATGGACT
TGGACGCCGCAAAGTAAGAGCCGGAACAAAACATATCCTTACCGTGTGCA
GAGACCGCTATATTTCCTCCTGTGCCATCTTATCGCGAATCAATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.