Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA027978

[Submit comment/correction]

Sequence	AA027978
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA027978
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCCTAACTGCCTAAGCTGTCCACTGGATTGGGCTTACTGCCGCCGCCGGG CCGCCGGCGCGGGCTGGGACAGGACATTTCGCCTGCACACCGAACAACCT CACCGGCACGGGCGCACGGCGGCACCGGCCATCTCGTCGCCCCCGTGGGG GAGGAGCGCCAAGCGTCCCGCTCGAGGCCTGCAGCCTCGGCCACCCAGCG GCGGGGATGGTGAAGATAGTGACGTACAACGTGAACGGGTTGCGGCCGCG GGTGGCGCAGCACGGCTCGCTCCGCCGCCTCCTCGACGCCCTCGATGCCG ACATCATCTGCTTCCAGGTCCGACCGGTCGTTGGTCCCTTCCTTCCCACT AACCAATCTCGTATGCCTGATCTGCCATTTAAACTAGGTACCATCTGTCT GAACCCTAGACTTAGCTGCCTGTGGTCACCAGCCAAATGTTACTACTTCA CTCACTACAGTCTACAGTTCGTTCCAAATTACGCAATTGATCGTACTGTT TATGCTCCATCAAGTGCGGATTCACCATGTTTGCGTTGTACCACGAACAA TTGCTGCTTGATCTGTGCTTATTGAGGCACATAGTTCAGTTACTAGATGA AGTGGGGTTAGGCACTCAACTCGTTTCAGCTGACGTATGGATGTTTGTTG TCATTAGGAGACGAAGTTGTCGAGGCAGGACTTGTCTGGGGACGTCATAA TGGCCGAGGGCTACGAGGCTTTTATTTCGTGCAATCGTACTTCCAGGGGG CGCGGAGCATACTCCGGTGAGTTGCTTTGAACCCATGGTGATCCATCCGA ATATTCTGATCAGTTGGTTTATGGTTTTGGGGTTTCCTAGTCTCCATCTC CTATGTGACATTTTGTTGTCAGTGAAGTCATTCTGAATGCTTTATCCGCT TTTCTTGATTAATTTATGCATTGTAGGTGTTGCAACATTTTGCCGGGTAA CATCAGCATTCTCCAGTCAGGAAGTTGCGTTGCCGGTAGCAGCTGAAGAA GGCTTTGCTGGAGTGCAGGGCTCTGCAAAAGACAGTGAAACTATTGGGGA TTTTAATCTTCAAATGCCTGTGGAAGAGGAAGGTCTTGGTGAAATAACAA GAGAGGAGCTGCTCAGGCTGGACAATGAGGGCCGCTGTATCATCACTGAC CATGGACATTTTGGTAATCTGCTTGCCTGGAATGGAGGACTATATGACTT CCTTATATTACGTCAATGTTCTTTTCTTCCCATTTGATTTTGGTTATCTG TATCTGATGATATCCACTTCATCATTTCTGTAGTTCTATTTAATCTATAT GGACCAGCCATTGGCGAGGATGATGAAGAACGAGTTCGTTTTAAGCTACT ATTTTACAAGATATTGCAGGTACTTATGTACATCTTACTTAGTATAGTAC TGGTTTTAAGCTACTATCTTGTTAGGTTAGTTAATGGCTTCTCTTAAACT GTCTTCATCTTCCTACAATCTTCCAGAAACGATGGGAATGTCTATTGGCT CTGGGGAAAAGAGTTTTTGTTGTTGGAGATCTGAATATTGCTCCTCGTTC TATAGACAGGTGTGATGCCCCTCCTGGATTCGAGAAGCAAATGTAAGCTC CTTTCCTTTTCCTTTTTATTGCAACTTTTTTGCACCAGTGGAATTGTGCA GAGAAAGGTTTGCTGAGCGGCATAATTTGAACGAAGAAAATTAAGCAAAT AGGTTTCTGTAAAAATGTCAACTGGTTCCCCCACTTGTTTTATAAGAAAA TGTTGTATATGGTCTGGTGATGTTTTCTCTGTGTTAGTGTAAAATTCACT AAAATACCTGTTGCTGGGTGCTATTTTTGTTCAAGAGCTGTTTTAAGATA GGGTGATTAAATTGGTTAAAGCATGAAAAACAACCGTGTCTCACAAAATT ATTATGAGATATATACTTTTTGACTTGGAAATCTTCAGGGGAGGCCCCTA TATATGTTTTTATGTATGAATAGAGACAGCAACAGGAAGGAATTATGAGA CATTTCAACTGGAGTCCCATCTGACCTATATCAACAGTTGGGCTTCAAAC TAATTTAACTAATGGTTTGCAGAGTAGACCTTCAACTTTTGATGAATGCA TTAGTATGCTCCCTTTTCAATAGCCGGCTTATATTTCCTTCGTTTCTCTC GTAATAACTTGATTTACCTTGTTGTGTGAAGGCTTCAAGCTCATTACAAA ACTAGAAATTGTTTATGACACCGGTTTACAGTCAGGCTTCAAACTAATGT TACGACTGAACTTTCAATTTATGATGAATGCACTTGCATGTTCTCTTGAA AGTTAATTTAATCATGAAATCACTCAGTAATAACAATAGTTGGTTCATAT CCTCTCCCTAATACAAGGTTTCGGGAATGGCTGAGGTCCTTGCTAAAAGA AAATGGTGGTCCCTTTTTTGATGCTTTCAGATCAAAACACCCTGAAAGGT ATTGCAAGTCCACTTTATTTCCTTGCTTACTTATGTGCTACTCCAACCTA TTCTACTCGTGGTTTCATAACTTTGTTACACTAGTTAGTCCATGCCCATG CAAGTGCATATTTCACTATTTGGTAAACAAATGCACCTGAAATGTAAGCA CTACACCCACGAGAATTACTTACTAACCCTGTATTGTATGCTTGCTGCAT TTATTTAATGCAGGACCGGAGCTTATACTTGTTTTAATCAAAAAGTTGGA GCTGAAGAATACAATTATGGTTCTAGAATAGATCACATTCTTGTTTCTGG TGCCTGTTTCCATCATTGCAATTCTATGGAAGACCATAGCATTTTCCACT GTCATGTGGAGGATTGTGAGATAATGAATCATTTTAGAAGAGGGGATTCG GAAAATATCTCAAAGTAAAGAAGGGTGAAAACATTTCTTTTCAGAGAGCA AAGTGGATAACATACAAGATTTGCTTACTGTTACATTGTCAACAGGTGGA AAGGAGGGAGAAGTATTAAGCTAGAAGGATCCGATCATATTCCAGTTTAT ATTATATTGAATGGAATGCCTGAACTTCCAGTCCATAATACCCCATCATC AGCTGCAAGATATCTCCCAGAAATCCGTGGACGCCAACAGAGTATAGGTG AGCAATATTTATGTTCTGGAACATTTGCCATGCCATAACTTGACTTTGAT CCCTCCAGTATACAAGCTGAAACCAGGGTATTGTATTGTCATTCTTCTAA CGTAGCCAAACTTGGTGAACTACTATATGACTTGGCTTCCCATTAGATTC CTCTATTTTGTTACTTGTGAACACTCTTTTTAGTTGTTTTACTGTTTAAA CAACTGACAAGATCTAAATTTCCTTCCTTATTTTTAATAATTAACTGTCT GTATTTTTATATTCACATGGAGTAATTCTCTCCTTGGTTGGACACTCTTA CTAAACATGCTATAGAACAAGTGTACGTATGCATGTTAACAACTTCAATT GAAAAGAGAAAAAAGTATTTATGCAAAATAACTTCCATACTATTCACCAT TGAGTTTTGAGTTGTTAGAGTATGTTGATTAGAATTTCTAGTTTCTACAC CATACCTAGTTCTGACCAATTGTGTTACTCCAACTTGCAGTATCATTCCT CAGTAAAGGAAAAATTTGTGAAGTTGAAGATGTCACAGGTTTAAATATGT CCCAAGATAGAGCAAATGAAAGCTGTTGTAGTGATGGCCTGGAGAGCAAA AGTTTATCCAAGGAAGAATTGCCAATTGGTATAACTGAGTTTTCTGGAGG TGGTAACCTTCCTAGTCCGACGTGTAAGCGGAGGAATCTTGATCATTGGA TTAATGAAGGTTCAAGCGGCAACTCCCAAAATAGTAATGCAACATTCCTG TCACAGCATGGTATGAAAGCTTCTTTATCTGGCATCAAGTCTATGTCAAA CAAGAAGACCAAACATAACTTATCCTCACAGCCAACAATCAAGTCATTTT TTCGAAGGCCAGAGCCAAGGGCAGGGGATGCCAATATCAATAGCTTAGTT GGTTCAGTAGATACAGTACCTAGTATGGATGAATTGTGTTATCCAAAAGA TGATAGTCTGCTGGAAAACATCCAGTGTACAGCTGCAGCTGAAGAAGATC AGGATAACCCTGTATCATGTTCACTTTCAACTGATAAGTGTAACGTTGCA ACGCTTGAGTGGCAAAGAATACATCAGAGAATGAAGATGAGCATTCCACT TTGCAAAGGGCATCGTGAACCTTGCATTCCAAGGTCTGTGAAGAAGGGCT CCAATATCGGTCGCCAATTCTATGTCTGTGCCCGTGCTCAGGTACTTTAA CTTCAGAGTTTGCTACTCAGCACATATAAGAGGAACAGCCATAATAGGCT GTGCATATTTGAAAGCATTTCTGTGGAAGGATGTAAAGCATTGATATTGT GATGTGACCACCATGTTCCTATATTTGCAGGGACCTTCATCAAATCCAGA AGCTAACTGCAATCACTTTCAGTGGGCCTCTGTAAAATCTAAAGGGAAGC GACAATGACTCTTTTTGTTTGTCATTTGTTACTTCCACTGTGCAGGTCAA AGGACTTCTTTCAGCCCCTGCTGTAAGTAATATCAGCATTTTGCTACTGT TGATGCTTTTGTTCGACATTTTTTGTTTGTTTTCGTGCTAACCTCTGTTT TTTCCCAGTAGCCCTAGACACTTGTCAACCTGGATTTCGCGTGAGTCTGA TGTATCACCTGCTCTCATGTTGGAAGCAAGATGGTCCTGATTCAGGGTGA ATTGGTTTACTAACAGAGGTACATAGTACATCCTTGTATAGTTCAAGTTA GATGGCGTTGTATCCAGCACCCTCCGCCGTTGTTGTAACTTGTAAGTCAA ACAGACAAAATATGGGTCTCTGTTGGGGGGCTAATAAAATTCCACTTGGA GTCCGCTTGTGGTTCTGTTTGTTGAGTCGTGGCTAGTTTATCTTTGAAAA CTAATTACATTTAAAACCTGGAGAAATCAACTGAGCTAAATTATATATTA CTAATATTTTGTGATGTAGCTAATTCAAAACAATCATGCTGTAGCTAATG TTGGAAGTATGCACCTAAATCATGCCAGTATTATAGTGTTGCTGTTGTCC ATCTCTATCAAGAAATATAAGTGCTATTTGTGATGGTGGTCTACTGATAC AGTGTATGCATCAAAGGATGCATCTCTATTTGTTCTCCACCTGGTGGCAT TCCAAGGCAGGCTCTATATGGGTTTCTGAATTGTTATTTTAAAAAATATT ACCATATGGGGTTTATTAAAATCAAGGTTGATGCTACATTTCCAGTATAT GGATATGTTGGACTAAAAAAAAATTATGGTATGTCCAAAAAGGATTTGAT GGACCTTACCAATTAAAAGCACCCAATCATCCTTTCCGTCTCATGAAGTG CAATTTTGAATATATGGTAGCTGTGCTACTTCTACTAGTATTTGGCATTT GCATATACACTATTCTGAATTCTTTCTGTGGAATATAACTTTGTCTCTGA GAGATGTTTTGGGGATATTACCTGAAGTTGTGAACATTTTTGTTTTGGGA AAGGAACTGTTTGTTCTGTTGCAGTCTGGCATCGTGCTACAGTTCCCTCC ATCCTTTGGCAATGCTACGGTGCTGCACCTACGCACCAGGCCTGATCAGC TGAATTACTTGAAACAACATAGCACTGAGTAACCGACCTCTGTTTCCAGA TGATTACAGGGCATCTCTGGTTGACCTGATGATTCTTTTTTTGTTCTTGG GGGGTAAAAGTACGTGACCGTTGCATGGCATGCTGACGCTCTTGTGGCTG ACCGTGTGTCACAGTGTGTGAGCCTTCATTTTGGGCCATTTGATTGAGAG TTACCGATTATACCCAGTAGCCCTGCTGCCCTAGACACTTGTTAGACAGT TTAGTTTGTTTTTGTGCTAACCTCTGTTTTTCCCCAGTAGCCCTGGACAC CTTTCAGCTTGGGCTTCCCCGTGTGTCTGATGTATCACCTGCTCTCAGGT TGGAAGCAAGATGATCCTGATTGGTGCAAATTCGTGTACTAACAGAGGTA CATAGTTTATCCTTTTTAGAGTCTAATTAGACAGCCACTGTACCCAGTAC CCTCCGCCATTGTTGTAACTTGTAAGTGAAACAGACAAAATATGGGTCTC TGTTGGGTGACTAATAAAATGCCACTTGGAGCCCTCTTGTGGCCTTTTGT TGAAATCTGGCTAGCTTATCTTTGAAAACTCATGGCATAAAAACCTGGAA AAATCAACTGATCTCAATTATATATTAATGAGTTGTGATGTAGCTAATTC AAAATAATTGTGCTGTTGCTAATGTTGGAGGTGCGCACCTAAATGGCATC AGTATTATAGTCTTGCTGTTGTGCATCTCTATCAAGAAATAAGTGCAATT TGTGAAGGGGGTCTACTGATACAGTCTATTTCTGACACATGTGCATCAAT GGATATGTATCAATTTAATCTCCACCAGGTGGCATGCCAAGGCAGGCGCT ATTTAGTTTCTTAATTCTTATTATAAAGAAATATTAACATAGAAGGATTT ATTAAAGAAGTAACAAGCAATCTGCTCATCTGTATTATATGCCTGATACA CCTGTTTCTGACCGCTGACCACCACGTGTAGTGCGGCATTTCCAGTATAT TGGTATGTTACATGTTGGGCCAAGAAAATTTTATAATATCTCCAAAAAAG ATTTGATGGTGCTTACCATTTTAAAAGCACCCAAGCATCCTTTTCGTCTC GTGAAGCGCAATATGGGTATATGGTAGCTGCACCTATACGTTATTCTGAT TTCTTTAATGGAAATATAACTCTGTTTCCGAGATACTGTTTGCTCTGTCG TGGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAGAAACTGTTTGCTCTGTCTCGA TCTGGGATCGTGCTATAGTGCCCCCTTCAGCCCGGCGATGTTATGGTGCT GCACCCACGCACCAGGCGTGGTCAGCTGAATTACTCAAAACAACATAGCA CCGAGTAACCGACTACCATTCCCAGATGATTACAGGGCATCTCTGGTTGA CCTGATGATTCTTTTTTTCGTTCTTGGGGGAGAAGTACGTGTCACTTGCA TGACACCGTGTAGGTCAAAGGACTTCTTTCAGCCCTTGCTGTAAGTAATA TCAGCAGTTTGCTACTACTATTGATGCTTTTGATAGACAATTTATTTTGT TTTTGTGCTAACCTCTATTTTTCCCAGTAGCCTGGGCACTTGTCAGCTTG GGCTTCGCGTGGGTCTGATGGATCATGTGCTCCCATGTTGGAAGCATGAT GTTCCTGATTCAGTGCAAATTCGTTTACTAACAGAGGTACATAGCTTATC ATTGTAGAGTTCTAGTTAGACAGCCACTGTACCCAGTACCCTCCGCCTTT GTTGCAACTTGTAAGTGAAACAGACAGATGTGGGTCTTTGTTGGATGACT AATAAAATGCCACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.