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GrainGenes Sequence Report: AA026094

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Sequence
AA026094
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA026094
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTAACTTGATCATCTGTAGCTGGCATCCACATCTCATCTCTGCCAGCTG
CATCTTCTACATCTGGGAGCTAATCAGGATCCATCAGCACCGCATCATCT
CCAGCCGGACCGAACCTTTAGCGAGCTCGCCGGGCATTTCCCTGTGCAAA
GTGGAGTGGCGGTAGATGGGGGCCTCAAGCTCCAAGGACGCCTCTCCCGA
CTGGAGCAGTACTACTTCCCTCTCCGAACTCGAGTGGCAGCAGATGCCGG
ACTCGGGCTCGGCGAAGGGGATGCTCGAGATCATGCCCGCAGACGACCTC
GTCTTCCCCTGTATGCCATCGATCGCTCCGCCTCAACATTCCGTGTTTTT
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AGCCAAGCACTGCCGTATAATCTTCTCTTTATATTAGAGCGTGGAAGGCA
ATTTGTTTTATACCGTTTTTATGCTAATTATTTATCTATATGAATTGCGC
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GATATACAGCTTCAAGATGTGAGATCTTTGACCCTATGTTGATTGTTTTC
TGTTATGTCTTCGATCAGGCCATTTATTTTCATCTTAGCCTTGTGCAGAA
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AACTACTGCTTCAGAAAAGTTGTGGTAGAAAAAACCCATGGAGAAACTGC
GGTCCAATTCTTAACTGTCTCAGAAAAGTTGTGGTAGAAAAAACCCACGG
AGAAACTGTGGTCCAATTCTTAACTAGCTAGGAGCACTTCGACTATCACA
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CGCCCCTCCCACTCCTCCTCCTCCAACGCCATGGGGCGCGGCCGGGAAAA
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GCGAAGGCGTGCTTCTGTGCCAGGGCATGGAGCTACTCGGGGGCCATGTC
AGCGGCGCTCAGGCTTGGCCTTGTGGTGGTGCATGCATGCATGGGTTTCT
GTTGGCTGGATTCCTCGGGCGGCGAGGGTTGCGAGCGGCGTGGGCTGCCG
GCGATCGTCTCTGCGTTTCGATTGAGATGATGTCGCAGCGGAATAAAGGT
GGTCAGATCATGATGTTCTTCAAGCACCATGTCACCGATCCACTTTATGA
TGGCCCCCTCCATTTGGCCATCAACGAGTTCTATTCTTCCTTCTGTAGTT
TGGCGCAGGATGTTACTTGATCTTCCTTTTGTAGTTCGACGCACCCTTCC
TTTTGGTCGAGGTGCAAACCTTTGGTCTTCTTGTCAGTATCATGGCTGAT
GGACTGTTGGTTGACGTGGACTCCCTTCCATCCGCAGTCAGGTCCCGGGA
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TATAACCGTAACAATACAAAGAAGATACCAATACAAGCAAAAGAAAAGAA
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AGCCGCAGTAACCACCAGTCCCATAAGACTGGATCTAGCCTGCTGCTAAG
AAACATCGGCCGGAGGAGCCCTCCAAGCATCTTCAACGCCGGATCCAGGG
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AACCAGTAGCAATCCGCACCGCCGCACTCCAAGGCCGCCAGGACCAGATC
GGCGGCAAGATCAACACCACACAAAGCCGGAGCACACGCCCGGCGAAGAC
CAAATCCCACAGGCTTCTCGACGCCGCAAACGTCGCCGAGATGGGGTTGA
AGCCGGAGAGAGGAACTATTCGTTCCATGGTGGGATGTAGGGATGGTTGG
AGTGGCATTTTCATGTTTTAATAATGATTCGTTGGAAGGTTATATCTGGA
AAAAACCGAGAAACTCAAGAAACTACGGGGAGCTGTACTTCGATACACAT
GGGAGCAGTGGTGGCTGATTAATTAAGCGGTATATAGTTAGTTGTTTTGA
CTTATGCTTAACTTAGTACTTTTGTATCAAAAAAAAACTTAGTACTTAAA
CCTTCTGATAAGATGAAAAGAACTGGCCCTTTGTGGGTGAATTATGCTTC
CTTTAACATTGCTAACAAGTAAACTTTCTGTAGTTTGATTCAAATAAGAG
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CTTCGTGTGCCTTGTCGGCCTTCCAACGTGCGGGGAGGTTAGGACCGGGC
GGCACGGATGGTGAGTGGCAGGGCTCGCCGATGCGGGGGGGGGGGGGGGG
GGGGGATGTTCGCTGGCTCGCAGCTGGGAGGCAGGTGGATTGGACCCGAC
TGCAGGCATGTTATGGCGGCATGGCCATGGCAGAGGCTAGGCCACCCCTA
GGCGGCGGTGCTGCTATTCAGGATCTTGCGGACTTGGTCTCGATCTACTT
GTTCCGATCACCGGAAGCTGGCCGACGGTGTGGGGACCGCTGCATTGGTA
TCAATAAAGGAGATGGTCCTAGAGGTTCTTCCGCGCGAAGAAGAAGATCT
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GCTCCGCCGACAAACTCCCATGGGCGTACCATGCATGGAGATTTTTGGAT
CGGAAGGTATTCGGTCATGCGTACCCTATGTTTTTTCTGGCCGTTTGATT
TTAGAGGGAGCGTTGCCAAGCTACCTATTTGTTACCATCATGTGTCATGT
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ATTTTGTGATCTGTGACTCGCAGCAATGACTGTTTTTGGGGAAGACAACA
CATGACGAGTTCATAGTCCTACCTTGAAAGGTGAAAATCTAAGGTCTGAC
CTTAATTGGCTGTTCATGGCAATAGCCTTGTTGAAGGCATTGTTTTGTGA
GCGAAGCCTTTCTCCAGGGTGAAAACCTATGATCTCTTACCGGGCGACGA
TGGCGCGTGTGCACCGTTTCTTTCTTGAAGGTATCAATATTGGATTTTTT
GGACTACTGTGTTGTTCTGTTGGTGTTAGTATCGTTGCTACAAGGAATCG
TTCACTGTAGCGGGACTTTTCTTTTTTGTAATTCTTCTACCTTTTTTATG
TGTTGTCTGCATCCGTAAGGCCGCTAGGAAATGCGTTGTTGTAGACTCTA
TGTGTAATTGGTTTCTCCGTGATATTAATATATGCTCTTTGTCAAACAAA
AAAACACTGTGGCAACCATCCTCCGTGTTGCAGAATCAGAAGAAGGTCTG
CCCCTTCGCCCTTCGGGCTCTGATGGGGAAAACAAAAATTAGCAGGATGC
GAGATCTCTCATTTTATATTGTTCGTGTCATTTCTTGCTTGTTCTTAAAT
GCTTTAGATGTGATTGATCCTTTTCTAGATGCAGGAAAAGGGATAATAAT
TTAACACCTCCGAACCAATTCATAAAACAGTTAAGAGCAACTCTGTTAGA
CTCCCTAAAAATGGAGTTTGTAAAATAGTTTTCTAATGTTCTCTAAAAAA
ATATTAGATGCTCCAGGGTGTCTTCTACTATCAAGCTCACCTTTGTATTT
GAAGTAAATACATACTCCCTCTATTTCAAAATATAAGATGTTTTATCTGT
TTTACATTTATCTAGACACCATATAGTGTGTAGGTTCACACTTTGCTCTG
AACCTACACACTAAAATATGTATGAATACATGGGTTACAAAAAAAGGCTA
AAATAATTTTATATTTAAAAACAGAGGGGGTAGCAATTAATGACTTTATT
ATGCAATGTGAAACGGTTATATAACTCCATGACCTGTGCTTTTTTTTTGC
AAATCTCCATGAACGGTGCTAGATTGCTAGTACGAACACTAGGTTGGTGT
GACATCCATGTAACACATGGCCACACTAATTAATACTCACTCTGTATTGA
AATATCTTGCATACGGAGTACTATGTTAAGTTAAGATAAACTCTTGACCA
ATAATTACCCAGTTAGTATCATTATTTTTAAAGTTGTACTTATCCACAAA
TAAGTTCTTTAGAATACGAATTTAATGTCTAATTACTCATATTTAAAATA
TTTATATAGACTAATTATTTTTTTTAGATGTCCCAACAAACTATAATATG
ATAGTAGGTATTTTGGTAGGGAGATAGTATCAAGTATGTTACATATATGC
ATTATTACTTTCAAACTACTCTAGGAAAACTTGACCATTTACTTTTCACG
AGCCTGAAAATTGCCAAACAACCCATATTCCATATACTAACTTACTTATT
CACCAAGTTTGGGATAAACAGAAACCACCAAGTTGTACCTTTGTTTCTAT
AAAAGGTCTACATAATTCATAGTTTTTTATTATACTTACATCATATTTTC
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ATGGAATCATTCAATAATCCAAGATGACTTTATGCAGACAGGATCCACAC
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AATGAGGGAATAATTGGTAGAGGTGGTTTTGGTGTGGTTTACAAGGTAAG
GTTAAGTAGTTACTTTTTTCTCAAATTTGAAGTTGTACTTTACGAAAATC
TTGTGCAATCAATGTCGAGTTCACAAGAGCAAATGGGAAAACTTTATGCA
GGGAGTGCTAGGAAATGGGAAAATAGTTGCGGTGAAGAAACTTGTGCAAT
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AAACTGAAGCACCCTAATATAGTGCAACTATTAGGGTACTGCTATGAAAC
ACAACACCTACGGAATATTCATAAAGGAAAATCTATTTTTGCTGAGAACA
CTGAATGTTTGCTTTGCTTGGAATGTCTTCCTAAGGGAAGTCTCGAGAAG
TACATTTCAGGTACGCCATTTAAATATGGAATGGTTCTTCTATATCTGCT
TTTCATCATACTTTTAGATTGCAATTTTTCATGTTCTGATTATAATTCCT
AAATACCTTGTTCTTAGGAATGAAAAATGTGAATATACAATGGTAATTTA
GAAATCCTCCTATATATAGAGCACAATAATAATAATAGATATAAATAAAA
TCATCTTCAAAATTATCTTGTATTATTAACAAATGCAGATGCATCTTCCG
GACTTGATTGGCCGACACGCTACGGAATAATTGAAGGGATTTCCTATGGT
CTGCAATACCTGCACAAGCAAGTCAATGGTCCAATTATTCACTCAGACCT
AAAACCTGGAAACATATTACTTGATGAAAATATGATACCAAAAATTACAG
ACTTTGGTCTATCAAGACAGTATGACCGAAAACAAACGGTTCATACAGAA
AAAACTAGTGGAACTTTGTAAGTGAATAGCCACTTGATAATCCATTGTTC
TTTGGTAATCAATGGAAGTGTTTTATCTTAAAACTCCATATTCACCCATT
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TAACTGGACACAGGGACTACCCATATGAAATAAAAAAATCTTCCGCGGAC
TTCATCGAGCTTGTAAGACAAATCTTTGTAAACTTTCAAGGGACCTGCTT
ATCGTAGACACTGTGTGAAAGTTTACCATTTCAAGGTAATATTTCCAATT
TATTTTGTGTTTCACAGGAGCTTCAAAAATGGAGAAATGTGCTAGAAAAT
GTACCAGGGTATACATTGCTAGAAACAAATTGCCAACAAATAAAAAGATG
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CAATGAAGAAGTTGATAGATATGCTTGAAGGGTTGGAAAGTATGAATTGG
TACATCAGCAATGAGGTAACGTCACCTGCCACCAACTTATGATAATGGCA
GGGTATTACATACCATTTAATGCATGTAATCTCCTGCTCATAATCTAGAG
AGTAAAACCTTATATTTATATATATGTACCTGGAAAGTAAATTATCTATA
ACTTATTTCAAATTCTGGTTTAAATAATCTATGTACTTAATGCTTATATT
ATGACACGTTGTAACTTTTAATTAATTCCCACTATCACAAATTTATTTAG
TGTAGGTAGAAAAATTGCTTTCAAATTAGTTGGAGCCCGAAAGTGAATAG
TTTCTGAGTTCCAATGTCCATTTAAGACATTTTGATAGTATTGGGGATTA
GCATTTACACGGAGCTGTATTGCTTCAACTACTGAAGTTCAGAGTGTCTA
TTACTAGTGCCGTCCTCAAAAGGTTGTCATTTTAAGCATATGTAAAGTCA
AGTCTCAAAACTTTGATTCCATGTACATCGTAAAATACTCATGTTAGCTA
ATATCATATGTAATGTAATGTATGAATGTGCCACAACATAAATAGCTTGT
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TTCTAGTTATCAAGCCACGGAATCAAGGGCGGAGCCCTAGTGTAGCAAAG
GAAATCGTCACAACTTCCATCGGTTCTGCCTTTCTGGTATGCATGTTTAA
AAAACATCAACTGCTTAGTAATGCTATAAAGTGATTGATGCATATAATCC
AGTTCGTTTAAATTGTTCTACAGCGTGTATGATTTCCATAACTCCATTAT
GCTCGGTGAGCAGCTACACAAGCTTTTCAAATGCCTGGTCTCTGAGTTCT
AGTTGTAACAAGTGAGTATGCAATCCCATGGACATGTGATTCTTTGATAG
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ATCGATTTTCTTGTTCGATTGTTGCATGTGTCCTATGTTGTAAGCTATAT
ATAGCGATTAAATAAAGAGTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.