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GrainGenes Sequence Report: AA022897

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Sequence
AA022897
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA022897
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGGTGCGGTGCGGTGCGGTGCGCACATGGAAGGTGCAGAGATTACT
GTATACTTCTCGTATGAGCGCGCGATTGTGCAATCGCAGGTGCAAATCAT
GCCAATTTGGTGCACACCAGACCCAATGCGAAGATTATTGTACATTTGGG
GGTTATGTTCACATCACATGCTGACGACCGACGATGCACCATTCCGGAAT
TTTGGGGTTCTAGCTGTCCCTGTGATTAGCTTTGGTATCTTAGGACTTTG
TACAAGTATAAACTATGCTAATTAGCATGTGATTATCATGGAATCCATCT
TACTGCTAGCTAGAGTGATTTATTTCAGTCATTTGAGAATAACTATGGTA
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GGTGTGCATGCTTAAGCGTTCAGGAAAAACATGCTCATTACCATATGATG
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TCACGAGGTTTACATTAACTGACGCCAATCACATATTTTATCTCGAGTTT
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GGGTCATGCTGTAATATTTTTCACTACTTGGAAAATTGTTCCGACAGAAC
CAGAATGGTATTTCTTAGTGAGTTGATAGAAGAGGGGCTGGTTAACAGAA
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CTTCATAGGAGGACAGCTCACAGCTACAGAGGAAAACCACATTACTTTAA
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TTATGCACCTCAGTAGTATATCGTTTATCTTATGCTATCATTAGGAAACA
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AAAACTCGTAGGCCTTTGATTGGTGGAATTATCATTGAGTTTGTCCACCG
TTCTTCCTTCACTTATTTGCGGAGGTTAGGCTGCATTGAATTAGTGAAAT
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TTATATATATTTAGGCAAATACTGATTCCGTCAATGTATTATCATATAAT
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GTCATGATGGAGAGTATGTTTCCTTAGCATGGTGACCTCTCACGCTAATG
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ATATCCACAGCTTGTTCTGGTTGTACATGACAACATTCCATGACTGTACC
GAGTGAATTCACAATGTTACTCTTGACAATGTGCAGATGGCACCAGCTTG
TTCTGTCATAACAAACACATCTTAGCATTGCACAGCACAAATATTTATTT
ACCTCAGTGGAATCATCCATACTCCCCCGAAAAAAAGAATCACACAATAC
TGAAAACTTACCAGAACACACCATTTGTGCACTTGTATCTCAAGTTCTGA
AATAGTCAGTGCAAAGCTGTATGTACATCGTTGGACTCCATCCAAAATCT
CCTGCTGTTGCTTGTTTCTGGAAATGATCATTTTGGAATAGCCAGGCAGG
AAGCCAGGAGAAATTTTCAGATTAGTAGCAAGAGACAGCCTGGAACCAAG
AAATCTGTGTGGCCCTCATTTGTGTTCTGTAAGTTCCACTTTGCAACAGC
TCTACTCCTTGGGACAAGAAGTTTTGTCCTCTTTCAGTTTAACTCTATTG
TCTACATCTAATAGCTCCATAAGAATCTACAATAATTTGTATCAACTTAC
AACAATGGGCTGTATGGATACCTGATTGGTGTCACATAAAGAATCGAGTT
TGGGAGCAAGTTGGTTCATGATTTTTTTACACCACTAAAAGTTTGGACAC
ACATTAGCATGCCAAAATTGACTTGGTTTGGGCTGGTCAATGATCATAAA
TATTATTTTTCTGCAGAAGAGTCATACATAGAGTTGAAGTATTAAACTTC
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CCATTGGCACATGAGTGCAGGCCATAGGAACTTTGAAGTAGCAACGGCAC
ATAGTCCAATAATTGACTAGATGCTGCCACGTAGCACAATTTCATTCTCG
GAATATGCCATCAGCGTAGCGGCCAGGCCAGCAAAATGACACATTGCAGA
CGTATGCTTTGGTTTATTAATTTTATATTGATGTTTTGGGTGGTATGTAT
GTATGCTGTGAAGTTGGTGGAGAGCTACACAAGAGCCAGTCACTTCTAGT
TTGATCCATGCATTAGGCTCCAAGATCTGGACAGTTTAGCGTGCATCGGC
CATAAAATTAGGGCCCACTTATTCTCTTTCCTCCACTGCTAATCTCTTGC
CCCCCTGCCTTCTCATGGTGTGTATATAAGACACAGTGTGAAGCACACAA
ATCAATACAACTCTTATCATAGATAGCAACTAGAATGGAGACCATGTCTT
ATCCTTGTTCCCCTCTCTTCTCCTTCCCCACACATGAAGAGAGTAGTTTT
CTCCTATGGTCTCCTCAAGTAGCTCTCCATGAGAATGCCACCGTCCATGT
TGATCATTCCACTGACCAGCAACAGGCCAATGAGTTCTTGGACACTATGG
CCCAAGATTATGTTGGCGGTTGGCATCATCAAGATGCTTCTGATGTTGGT
GTGTTCCTCGATTGCGATGAGAGGATTCTGGGACAAGAGAGTGGCAACTT
GGCGGCCATCCAAGAGGAGCTCATGGAGGAGAACAGTTTAACTGATCTCC
TCCTCACTGGTGCAGAGGCCGTTGAGGCGGGGGATTCAGCACTTGCCTTG
GCAGTGTTCTCCAGGCTTGATGGCCTCCTCCCTGGCATCCCTGACAATGC
CTCAGCCAGCTCTTTTGATCGGCTGGCCGGCCACTTTGCCCAAGGTCTGC
GGTCCCGGATCTCCAGCGCAAGTGTCAGGTGCTCTCCGCCCGAGCCACTG
CCATCAGATAGAATGTCGGCACAACAGATTATACAAGAGCTGTCGCCGTT
CGCCAAGTTTGCGCACTTTACTGCCAATCAGGCCATTCTGGACGCCACCA
AGGGTGACACAGATGTGCACGTCGTCGACCTGAACATTGGCGAGGGCATC
CAGTGGCCATCACTCATGTCAGATCTTGCCCGTCATGGTGGCATATCATT
CCACCTCACGGCTATCACAACAGATGCTGACTACAGAGACGACATTCACC
ATGCATCTGCACGGCGGCTCTCGGAGTTCGCGGACTCCTTGAACCTTCCT
TTCCAGTACAGCTCTTTCTGTATACACAGTGATGAAGACCTGCAAGCCTT
CTCCAAGAGCTGTAAAGGCTCAGTGATCTTCTCGTGCGACACGACAAGCA
TGCCTTACAAATCCCTGAGCAAGTTACGGACACTCCTACCTGCCTGTGTT
AAAATGTTGCGGCCTAAGTTAATGGTCATCGTAGAAGAGGAGTTGGTTAG
AATCGGAAAGGAGGCGTCTCTATGTAACGCCTCCTTTGTCGACTTCTTCT
TCGAGGCATTGCACCACTTCACCACGGTGTTCGAGTCACTGGCAAGCTGC
TTCAGTGGTGGTAACCAGGGGTTGTGCCTGAGACTTGTGGAGAGGGAGAT
GGTGGGGCCAAGGATACAGGACTTCGTGGCGCAGTATGGGTCTGTAACAG
TTGATGCCAGTGCTCCTGGGATTTTGGAAAGGTACGGGGCTTGTGAGATG
AGTGGTTGTAATGTTGCTCAGGCCAGGATGCTGGTTGGGTTGTTCAATAG
GGGGTTTGGTGTTGTGCATGAGAAGGGCAGACTTGCCTTGTGCTGGAAAT
CCAGGCCGTTGACCTCCGTGTCTGTTTGGGCTCCAATCTGAAAAGAAAGG
GGGTTATGTGATGTTGTTCGCAATTTTTGTTGTAAGAGTTTGCAGTACCG
AGTTTAGAGGAAAACTTATTTGGCTGGTGAGCCACCTTTTTTTGTTTCTA
TCTCAGTTCTTATTTCTTGTTGCTCTCGTCGGCCTCTCATATCCCCTAGG
GAAACTTGCAGTGATGAATGGAGTAAATGTAGCCAGGGGACGAATGAATT
TTGCTCTTGTCAATCATATATGAGCTGTGTGGATTTTACTGCAAGAACGC
TCTAGATTTATCTTGATGTTTGTTCCCCTCTTATGAACCAGGTGTTAACC
TGTGGAAATAACAAGTGAGACAGACAGATGCCTGCTGATGCAGGAGTTTC
ATGAAGACTTTGACCGTAGTTGTCATTATTTTATTTGAAATATCTAGCAT
ATTTTTCTGCCCATCTGCACAAAATAGAGAAACATCAAAATAGTCTGAAA
GTGACACCCTTGGAAACATAATAGTGGTTGGTTATTGTAGTTGCTCCATT
TGTGGAGCTAGGATCAATTGCAGACTTCCTAATATTGACAAGGCACAAAA
TACCTTTTGCAGTTGTATTTATGAAAAGGTAAAAATAAGAAAACTGAAAT
AAATACTTTGTATTGTGTAGGAGTGTTCAACTGTGTGAACTGCTTTCAGT
CACTATCATCCCAGTGTTATGATTCGGGCAGACTGCAGGCTTTCTCGACC
CTGTTATGTCACCTCTGGAATCGTGTCACTCTTTGGGAATTAATTTCCAT
TAAGATCATTTTTCCCAGGGAGGTCTTGTCACGTGAAGTTCTGATTTCTG
CAGTTGCAGGTGATCTTGTCAGGTTTATCTTATTCCTGGCTCAAAGATAT
GGCATTCAAACTTGTGACGAGGATGATAGTGAAGGCTGGAACTGAAGGCA
GAGGGGCGGCACATCACAAAAAGGAATGTTCTTGCAGCTGAAGGCACTCA
TCGAGGGCATGTATCTCAGGTACTCCATGCCCGACAGGCTCAAGCTTCAG
TCCCTTGGAGAAGATAACATTGATGATGATGAGGTGAGTGTTTGGAGCTA
ATCCTTTGCTGAATCTACTTTTTAACACTGTCAAGCACCTTCGGGTTTTG
TGCTCCTGGAACAGAAAGCACAGGAAAGTTGAAAGGTGTCCTTGAACGGT
AGCATGGATCCTGATGAACACCCAAAACTGGTATCTCTTGGCATACAATT
AGCCACACTCCTACAGGGATCATTTCTTGGCGTAAACATACTCGGTGAGT
TGCTCAGAGTGAATCAAACTCGCAATTCTGCCGGGGCATATTATCTAGCA
TAAGAGGGCCAGTCTGAGAGCACTTGTCTTCTTCTGGAACACACGATGAG
GATGTTCTTGGGCGAATTTTCCCTATCAATTTCGCCAATGCAGCCTTGGT
GGGTGGTCAAGCTCAAGGTTACTTGGCGTATGATCTTAGGGACGCGGGAG
GATGGCCCTGCGCAAAGTGAGCTGCCAAAGCTGACATACAAGAGCTGCTG
ATGGGTGGTTATAATCCTGTTGAAGACAAGTTTGAGGTGTTGGTATGTAG
ATCTCGAACCTTGCCTCACAGTGACTACGCTATTACTATGAGAAACAGAA
GCAATGTCACAGCATCAGCAACAAAAGTCCTATGGCACTGAGAAAGCATC
AACATAAATGTTAATTTGGTAAACAGAAGTGCGAAGAGGGATTATACATA
TCCCCATCCTTATAGTTTAATAGTTAATTTTCCCTTTTTCTTTACTGATT
ATATGTATCCACAATTGTTAAATGTTAGGTGGGGTATGTAAAGTGCAGTC
AGTTCCTGTTGCTAGTTTGACTCCTGTATGACATAGAAACCTCATGAAAG
GAAACTACTTCACGATTCTGACTAGTGTGCTGTGTGATCAGTTTAACTTA
AAACAGTATGTGGTGATCACTAATTGGCTTCAGACACACCACTTTCATCT
AGTCTTGGGCAACTGGCAGTTGCCTTTATTGACTGAACTTTACCTTAGCC
CTATGCTGCTTTCCAATTAAGAAAATTGTGTGGGAGTTGCTTCCTGGTTT
CCTGCGAAGGCTCACAATATTCATTCTCATCTCTGCACTTGCAAGTGACA
GGAGGACCTCGAAATGCTGAGATGCGTGCTTCCACCCAGGGATCAACACC
ACTGTCGAGAAGGTGGAGGCACAACAGATCACAAGCCGAGAAATGGTCCA
GCTCAAGGAAAGTTACAAAAAAATCTTCGCAGAGGAAAGAGCCACCTCAC
TATGTGAACTTTAGGCTGTTGTCATACATTTCTGGTAGGTTTGCAGTCTT
TATTGACCTCATTTTCCCATCTCTGAAATCTCGTCTTCCTTTGCATATTA
ACATCTGATCACTTGTTCCTCAGGAGGGCACAGCTCATCTTGGCATGGAG
GTTCTGATTTCAGCAGTCGTAAGTGATCTTGTAAGCCGGTTCTTCTCTTT
CCTAGCACAAAATTTTATCGCTCACACATGTGAGGAGGATGATCGTCAAA
GGCTGGAAGGCATCTTGCTCAGGATGAACACCATTGTTGAGGAAGCAGAG
GGACGGCACATCACAAATCCAGGAATGTTCTTGCAGCTGAAGACACTCAT
CGAGGGCGTGTACCCTGGGTACTATATGCTCGACAGACTGAAGGTCGAAT
CCCCTTGGACAAGAGAGTGTTGAAGGTGATGAGGCGAGTCATCATTCAGA
GCCAATCCTTCGCCATTTTTACTTTTAACACTGCCAAGCGCCTTCTTTTT
TCTTCTATAATGAAGACACCAGTAGCATCTGGTACCGGAAGCACAATAAA
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AGTTTATCATCCTCCTCAGCAGCTGCCCTCGCCTTGTTTGCCAGCCATGC
AGTACGCATCTTTATATGGATAGTGTATGTTTGGTTGCCATATCGAGAAA
GAACAGCTCATCAACTTCTTGCTATACGATGGCAGCTATGATTGCATAAA
TATTAGTATCCTTCCGATCATCGGTCAACACATGATCAGAAAGAAAACTC
TCGTGCAACATGCTTGCAAGTATGAAAGCGTGCACGATCATTTCTCCCGC
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TGTGGATGAAACAGCATGGACAAACTTCCGACCATATATGCAGAAGCTGC
CAGGTACTTGGATTAAAATTGCAGTCATAGGCAGAGGGGGGAAAATTGCA
GAATTGATGACTAAACCCATCAGGATGAAGTTTTTGTCTCAAGAAGAGTA
CTGGTACTACTTCAAGGCACTTGCCTTTGCAATCATGGATCCTGATGAGC
ACCCAAAACGGGCATCTTTGGGCATGCAGAGCTAGCTACTGAGATACATG
GATCATTTCTTGCTGCAAATATAGTCGGTGGAGTGTTAAGAGCTAATCCT
AATGCTAAATTTTGGTGCAACATATTACTTGTGTAAGAGAACTACTAGTA
TGGACACACTGTTCCTTTGGCATAAACCACGAGGATCTTTACGAGAGAGA
TTTCCCCGTTGAATTCACGAAATTGTCCTCAGCAGGTGGTTCGCTTCAAG
GTTATCTGGTTTATGATTTGAGGGAGGCTGACCCTGGGTAAAGTGAGCTG
CCAAAACTTTTATGGCAAGAATTACTAAACAGTGTCGAAGTTCCTGATGA
AGACAAGTTTGATGTGTTGGCATGGAGACCTGGGTTCCACCTTAGAGTGA
CTATATAATTACTTTTGAGAAACAGAAGCCACGTCGTAACTCATAAAGCT
AGCAGGAAGAATCATCTGGCATGGAGGAAGCATCAATATAAATGTTAATT
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GTAATATTCTACTCCTGAATTCTCTTTTAGAAGATGGAAGAACTTCATTA
CCCTGACACTCTTGTTTACTGAAGGCTATAGCTGTATGTAACTGCCCTTG
TTAGTTTGGATATGTAAAATCTGCACGATCAGTTACCGGTTGCTACTTTA
AGTTTGAATTTTGATGTTTTGCTAATTGGAGGCTCGGTTATTTTTAGCCC
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ACTGCCTTATTTCTGGCCCATGGAACTTGTACAGTCAAGATAGGCAGAAC
AGAGAAAGTTGCTAACTTAGAAACTGCTCAACCTCTCAGGCTGAAGAATT
TTTCTCCAGAGGAGTACTTTTATTACTTCAAGGCACTTGCTTTTAGAAGT
ATGGATCCTGATGAGCATCCAAAACTGGCAGGGCATGCGACTAGCAACAC
TCCCACATGGAGCATTTCTTGGTGCTAGCATCCTCGGTGAGCTACTAAGA
ACCATCCCGAATGCTCAATTCTGGTGTGGTGTATTATCAAGCATAAGGGT
ACTAGTTCATGAACACTTGTCCTTAGGCACACGCCCGGAGGAGACAAATG
CGGCCTCACCGCCTGTTCGGTTTGAGTGGGATTGACATGGATCGGGAGGT
ATCCGTATTGCCAGGGAATTGAACTGCATTCCCTGGCGTTCCATGTCAAT
CCCTCCCAACCCAGGTGTAACCGAACAATGCCTCAGTGGGTGGTAACGCT
CAAGGATATCTGGTATATGATCTCAGGGGGCTGACCCTGCACAAAGTGAG
CTGCCAAAGCTGGCATAACAGGAGCTACTGACAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.