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GrainGenes Sequence Report: AA020929

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Sequence
AA020929
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020929
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAAGGTTCTATCTAGAAGCCCGCTCTTCCTCCTCCTCCAGCTGCTCTGT
ACTTGGTTTGCTCTGGTTGGACGATCGTTTCCGCCCGCCACCGCCGCCGC
CGCCTGCCGCCGATTCATTCCGTCCCCGCTCCCCACCCCTCCTCCGGCCG
CCTCTTCACCGCCGCCCACCTCGTCCTCCCACCGCCACCCAACGCCGGCC
CCGCCCACCGGCGCGCGCACCACCGGCGATGGCGATGGCGACGGCGCTGT
GGCAGCCGCAGGCGGAGGGACTGCGCGAGATCTGCGCGCTGCTCGAGGAG
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CTAGTTCTGCTGTAAATTTTCGTCCTGAATTCCTGACATAGTATGACTGT
AAGTCCAGCTACAATATATGGTCTCTGCTTGTAACTCTTGTGCCTATGCC
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GGATGGATCGAGTTGTTCCAGGCTCTGCATCAGTGTTTGGACAGCAATGA
TCTGGATCATATGGAAGGTGCTATGGATGCTATCTACAAGGTACTGTGCA
TCACTCCTTTATCTGAGCTTGAATTCTAATCAGTACATAGAGAACTACCA
CTTGTAGCTATATAGCGTGAGTGAAGTCAGAAAATGCGTAGGTTCTCCGC
ACACCTGCTTGCTTTTACATGGATATCAGTGTACGAAGCGAATCTGTAAA
TTTTGGTCCAAAACCATGTCGAATTGTGTGCTGTACAAGAAAAATTACTT
TCTGCCCCTATACTGTTTGCAGCCTGAAAACCTTGCCCTTTTTTGTGTAG
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GCTTTTCCTTTTGATGCCAGATATGTGAAGATGTTCCTGAAGAGCTTGAT
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TCAGTGAAACAGCTGTACTGTATGTTTCAACCAAGCACACCTCTGTGGTA
ATTTGACACTCTAGTTTGACATGTCTACAGGGCTTCCTCTAATAAAGTCA
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GTACGAGTCCCTCCCTCCCTGTCCATCTTATCTAACGCTTCGCTTTCCTA
ACCATTTTGATTTGTCTGCAGGCACTTTATATGTCCATGGATCAGTACCT
GCAGGGCTTATTTAGCCTTGTGAAGGATCCTTCAGCAGATGTCAGGAAAC
TGGTATTTCACTACAATAAATTGCATTTGAAGATATGAGTTGCATTACTT
TGTAATCTTGTATGAAGATACACAGTTGCGCTACGTCCATGACTTAGTAG
ATTCCACTTATGCCGTAGAGATCTGTTATGTGGCTGACCAATCTGGATGT
GCTAATAATAATGAGGGTGCATAGTTGTTGTTCTGCATAGTTTTAGTTGT
TCAATTGCATACTTTATCTTGATAAGCCTCCCTGTTTCTTTGATAGGTTT
GCTCGGCCTGGGTTCAGCTCATTGAAGTGCGGCCATCTATTCTGGAGGTA
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GAGTACATAGCCAGATTACTCAGTTTCTTATGCTCAAATGTTGTGCTAGA
TCTGACATTAAATAGTAAAATTGCAGCCACATTTGAAAAATGTCACTGAA
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TTGCGAATTCTGGTATGCATTCTGTCGACATGTTAAATTCAACGTGTCAA
TTACAAGCTTAGCACTATCATATATTTACATCTGATTTCTGCTCCTTGTA
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GCTAACTGATCTGTTAGAGGACTAAGTATAATTCAACCTTTCAGGTCGGC
ATACTGTGATGTTAGCATGCCTCCTGAAGGGCTGCGGGAGTTCTTGCCAC
GCTTAATACCAGTATATAATTTATCTTGTCTAAATTAATTCCTGTTAGTC
CTAGGCCTGATTACAACTTTGACATGTTCCTTTTGTATTTATTTCATAGA
CTTTGGTGTCTAACATGGTCTATACTGACGACGATGAATCACTTGCTGAT
GCTGAGGTGTGGTAAATTTCTTTATATCCTGCATGTTTTAGCTGCTAGTC
ATTGTGTGATAGTGGCATGTTCTGATGAGTATTATATGTTTTCAGGAAGA
CGAATCCTTTCCAGACAGGGACCAGGTTGGTGGTCACTTCTTCTTTTCAG
TATTAGCGGCTAGATTGGATGGATGACTTTGTCCATGTATAATCGTATAT
TATTTTGGATTAGGTTTGTGTTTTAACTTAGTGTAATGCTGTGTATGGAT
TGAACATAGTCCAATCTGGAAGGCATATAAGTTATTTTTTGTAGTATATT
TACAAATAACATTTTAAGAACAATGCAATGCTTGTTTAGCAAGCATGTTG
TAATTTTGCCTTGCAATAAGATTACAGTAACAGTCTTAAAAGAAATGGAG
AGTGGCAGTAAGTTTACAGTTAAAGTAAGGGTCCCCTTTTTGTTGCTTGA
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CTTTATCTTTTTAAGCAGTGGAATGACTTTTTGCCTACTTATTAAATTAA
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AAATATTTGGAATTTGCGGAAATGTAGTGCTGCTGGGTTGGATGTCCTTT
CAAATGTTTTTGGTGACGCCATTCTTCCTACTTTAATGCCTTTGATTGAG
GTAACTGGAAGACTCCATAATCCCTCCCCTGGTATTATTGGCTTATTGGC
CCCATACGTGTCCAAGCCATCATCCAAGACCTTGTTATAGTGGTGCTTGG
TAAACTATTTATTGCTGCACTTGTAACTAAATTTGAATATGTTGGATAAA
TATAAATGAAATATTGTAATTTGGCAGCAAAATTTGGCTCGGACAGATGA
TGATGCCTGGAAGGAGCGGGAAGCTGCTGTTTTATCTATTGGTGCTATAG
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GTAACTAAATGTGGTTATGGTAGAAATGACTAAGCCTCAGTAAGAACACA
TGCCATGCATCAAATCATATTGAGGCAATTGTCTTGGATGATGATCTTTC
TGAAATTAGTTTTCAGAAGCATTTTAATTAACCTGAGTATTTGCTTCTCT
CATGAACCATCTATAACACATCCTTGAAATTTCTTCTCAATACGTGGTAA
CTTTTGAAAAGAATGAGAGAACAACACTCTGTTGGTGCAATCATTAGTTA
CATACATGATAAAAGATTGAAATTTTCAGTTGCATCAATAGTTACCTGCA
GAATAAATTTCACATTTTTGAGGATATATGAATCTGTGAAATTTTGGACT
TGTTGTATCTTGTGAGTTGTAGTCATAGTATTAGTTTTCCTATATTCCAC
TATCTACCTATATTTGTTCTGAGTTTTTCTTTTTAATTGCAGATTGTTAC
GTTCCTGATCCCTCTTCTTGATGATAAGTTTCCTCTTATACGGAGTATTA
CTTGTTGGACCCTCTCACGATATAGCAAGTTCATTGTTCAGGTAACAGAA
GAATAGTATCTGTTGATGCTACCTCATCTGCCTGGAAGAATCCCTTTCCT
TCAAAGGCTTTATAATTTTCTATCTAGGAGTAGCATTCAGTATAATTAGA
ACATGTAGTGCTTGGTTGTAGTAATAATTTATTTTATGTATGTTGTGTGG
TTAAGTATATGATGGTGGACTAGTCATTACGCATACCCAGTGGCATGTTT
TAGGGATGTACTTCTAATTTTTTTGGGGACTTCAGATAATGTTTTACAGA
TAACTCTTAACTTCTTATGACACTTATCTTTTGCTGGCGCAGAGCCTGGG
CCATCCAAATGGTCGCGAACAATTCGACAAGATCCTCATCGGTTTGCTTA
GAAGGATATTGGATACTAACAAAAGAGTGCAGGAGGCTGCTTGTTCTGCA
TTTGCGACGCTTGAAGAGGTTATTCACCTATTTTCTAATTGTTTTCCTAC
TACGAGATCTTTGTCTATAATTAGTACATGGTTTCTGTTTTCCAGGAGGC
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GTGCATATGGAAAATACCAGGTTAGTCAGGTTTTGAACATTCATAGTTTG
CACTCAATTAACAGGCATCACATCAGTTTTTTCTTGGTTCTAATATTATG
TTTTGCTTCTGAGCAGAGGCGAAACCTTAGGATACTCTATGATGCTCTCG
GTACTCTTGCTGATGCTGTTGGAGCAGAGCTAAACCAGGTCCAACATTTG
CTAAATTCCTCTCTTGCTTTTTTTTAATACTGAATATTGTATTTGATGGT
TTCCTTGTTCAGTTTTTCAGCGTGTTAGTTCCTTATAAAGATTGCTAATT
CCTTTTAAGATCTCACGCAGGCAAAATATCTCGATATATTTATGCCGCCA
TTAATCGCGAAGTGGCAACAACTTCCGAACTCCGACAAAGATCTATTTCC
TCTGCTTGAATGCTTTACATCTGTTGCACAGGTACTGTAATTTTCATCGG
TCAAAGACATTTTTGTAGTTTTGGAGTCTGAACTTGCTTTACCTTAGTAT
CAAAAGTCTGTAGTACCCATGTTAGAATACTTATTTTGTTATCTGAGTTA
TGAACTTCGCATGGTATATAAAATCATGTGAATTTGAATTTTCATTTGGT
TTATGCCCATGACCTTATTTCTTTCAGGCACTAGGACCAGGATTTTCTCA
GTTTGCCGAGCCAGTATTTCTGAGATGCATCAGTCTTATCCAATGCCAGC
AGTTGGCAAAGGTCCGTGCAATTTTTTGTTTCGTACTGTATGGACAGCGT
TAACTTAAGTATCCGCTTTGATTTGTACATCAAGTCTAACCACACAGTTC
CATCTTCCCATGCTCCAGTTGCTATGACAAGCAAGTCTTTTGTCTTAATT
GAGACCTTAACTGTGTGATGTTTAACACTAAATGATTAACATGTTCTCTT
TTTCACTTATGGAAAAGAATTAAGATATCAAGTTAAATCTTTCCAACTTA
TACTTTTCTTGTTGTAGTACAAACCAGTGGAAACCAAGTACATGATTCAT
CATTAGTATAGAAGATACTTTACTAAATTACTCGTTATCAGCTACACGTT
TGGTGAATAGTTTCAGTCGTAAGTTTGGTCAAGTCTAAGCATAGTTTTGT
TTCTTCTCATGCTGTAGCATGGTTTCTGGTACTCTGATCGTTAAGTACCC
TGGATTATGTCAACTAAAAAATCAATCTGTTTGGCACTTTGACATCAATG
TTTACTGGATTATGGAGTGCTTAATTACATCAGAGATTGAGGGGTCTCTC
CATTCTACATGCAGGTTGATCCTAACGCAGCGGGTGCCTTGTACGATAAG
GAATTCATTGTCTGTTCATTGGACCTGTTGTCTGGACTTACAGAAGGACT
TGGTGCCGGTATTGAAAGCCTGGTAAATTCAACTCTTTTGTCAATGATAT
TCCCCTTCCCTTCCCCCAAGTTGTCAACGTTGACCACCTCAGTAATTTTA
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CACGTAGTACTGGTTCTCATAATATGCACTTGTGACTTGTAAGGTTCATA
CACCCATCACACAGATGGGTTTCTTGTTCGGAAGTTATATAAACAGTAAC
CATTTAATCTGATGATAAACTTAAGAGCTTTACAAGACTACTATTAATTC
CGGATGTCTTAATATTTTTGATTAGATACTGATGTACATGCCATGCTGAT
GTATAGTTTTATTATTATATCATCAACACTTTCATGTTTGGTAAGCCATC
TTTGTTTTTGGTTTAGGTTGCACAAAGCAATTTGAGAGATCTACTTCTGC
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CTTGGGGACATTTCTAGGGTTAGTTCAAAGCTCCTAAATTAGTATTTGTT
AGTGGCATGCAATTTTCAGCCTATAGCACATTTTCATATTTAGGTCTGCC
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CAATTGGTAAGTGTGTGTATGTATTCTTTGTGGTCCAGTATTATGTTTTG
TCCATTTGTTGCTCACATTATTTTTGATCTAGACCCCGCAGTCTGTGAAG
GATGCTGTGTCAGTTGCTAACAATGCTTGTTGGGCCATTGGAGAATTAGC
AATCAAGGTTCATGCCACTTTAGCTATACTAAGCCTCATTAGCACTGTAA
CTTTTTTTTTTGCATGTCTGACTTACTAAATCTTTCCAGATCGGCAAAGA
AATTTCACCTGTGGTGATCAGTGTCGTTTCGTGCTTGGTTCCTATTCTAG
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GTCCAGACATTGTGGCCCCTCATATGGAACATTTCATGCAAGCGTGGTGC
AATGCCTTATGCATGTGAGCATTCTTTTTTTCCTGGAGCTTTTTTTGTTA
ATAGCCAAAGTATTAAGGAAGACTCTTTGTTTGTACCTTTCTCGACAACT
TATGGGATGTGGTGCATGTTTTTTATTATTATGCTTTCTTGCTAGCTTCT
TGGAGTTAACGATCTCTCTTGTGCAGGATAAGAGATGATTTTGAGAAAGA
GGACGCGTTCCATGGTCTATGCGCAATGGTACACCTGCAGCTCTTTATGC
TCGCTGTTACATTCTTCATAGCTGTGCATGATCACTTACATAAAAAACTC
TCGTGTGCGTACTACTAGGTGGCAGCGAACCCAACAGGGGCTGTGAGCTC
ACTATCTTACGTGTGCCAGGCCTGCGCAAGTTGGAATGTAAGATGCCGTT
TCTGCTAGATATGTACTCCCTCCGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAGGTT
TGTGAAGAAAATGTATGTAGACTTCTTTTAGTGTGTAGATTCACTCCAAA
CATGAATAAACCTATATACTAAAAGTAGTCTAGATATATTTTCTTTATAA
ACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTACCCTACAGTAGTGT
CGCATATGAGCTCACTTGGTTTTTTGGATTTGTGTATAGGAGATAAAAAG
TGAAGGTTTACACAATGAAGTGTCCCAGATTTTGAACGGCTACAAGCAGG
TAAAAGGCCCATTCATTATTTTTTGTTCCAGTTTTGTATTCTATACGCAA
GAAACTGACTGAAAATATTATTCCTAGATGCTTGGAAGTGCCGGTTGGGA
ACAGTGCATGTCCACCCTGGAACCAGCAGTGGTTCAGAGATTAGCGAGAT
ACGGGGTTTGAGGAAGCCAAGAGGCCCGTGTTACTGTTCTCACCATACAA
CCGGAGGCGAACAGCAGAAACAGAGGTGTTACTGTCGGGGCATGAGATTG
GGCAAAGTCGGTCGGGTGTCCATCAGCGTGTAGCACATTGTGTGATTTTT
CTATATGATGTGGTTGATTCTGCGTTGTATACTCTGGTTACATACTCCAC
ATAGAAACAAGGCTGCTGCTCAAAGCATGGTGCAAATGCGTTGAGCGGCA
ACAAGAATCACGACTAGGTTTTCCTTCAAGTTGGAAAAGGCGGTCGGCGC
CGTGTTGGTGCGTGCCGTGTAGGTTATAGGGACTCGGGGTAGGGTCAATT
TGTATTGGCTGGTTTTCAGTGGGCTTGGTTTTGTTGTCACTTGATTTGCA
TTGGAAGAGTTTTGTAGGGTGTATTCTACTATGTGAGAAAAAGGATTAGG
TCTAGGATTTGTTTTGTATGCTTGATAGGGCGTCCTTGTATTGATTCATT
CCTCACAATAAAGGAAAAAAGTTGGACAATCGGAAGCTTCTCAGTCTATC
CATCGGAGATGTTATTGACGGTAGGATTTCTATATTCTACTTCAAGACAA
TTTACATTGAAATGAAGTTGGAATTGTGTGAAAATGATGTAATATTGGAT
TTGAAGAGACTAGGTTTTTCTTTATTATGTGTAGCTTACTCCATTTGTCT
TTTCCCATTGCTCGTAGAGTAAATGCAAAATATGGACACATTATCACAAA
CTATGCCTTGATTCTAGCCATAATATTGGTCATTTGACCCGAAAGCCAGG
AAACCTTGAATAAGATAGGTCATTTTGTGAAGGTTTTTTTAAGACATAAT
CAATATACCAAGTTTAATATTTTTTCCTTCCAATCATGTCACATAATATG
ATCACATAATATGACACCACACGAAGGTTGTGCATTATTTGGATCATTTT
TAAATTTCTTATGTCCATTTTAAATTATATATAATGTTTTATGTTTCACT
TAATTATTATTCACAAATGTGTAATATTTAAGTGTAGATAGTTAGATCTT
ATTTTTCCGCAAATTTTGATATATTATTTGTTTTTTCTGAATTAGAATGA
TTTAGTTATGCTTTTGTAATATTTGAGTGTAGGCTACGCGAAGGCAATTC
TACGTCGACGGCTGTTTGGGTGGCTGGCTTGGTACGGTCCTACGTCGACG
GTGTGACCTTTGACCGTTGGTGCAGCGCTGGCCGTTAACGCACCGCGCCG
TTCCTATAGTGCAAGATAAACCGCTGATGAACACTCAGACAATGAATTTA
GATAGCAAATTCTTGATATTCGATCTAACGTTTTTCTACCACAATTCATG
GTACATGCTCGAAATTAATGTGTTCAAACGAATATAAGTCACATGGTGTT
TGACTTGACATTGCACACCCCTGACGTGTCTTACTGGCACCGCAGGGAAT
TCTGCATCCTGTCGTCTTTTTCAAATTGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.