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GrainGenes Sequence Report: AA020424

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Sequence
AA020424
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020424
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAAAAAAACTACCCGCTCCCCTCCG
GCGAAGTCCCCATGGCAGCGCCGCCCTCCTCCGCCTCGGCCTGCTCCAGC
GAGAGGTGGCCGCCGCTCGAGTCCAGCCCCGACGTCTTCAACCAGGTTCG
GGGCATCCTCTGTTTGACTTCTCCTCCAATCATCGCTGCTACGACTGTCA
ATCTGACCGAACGCCTCGCCGCCACTCGCGCAGTTCATGTGGTCGCTGGG
TGTGCCGCAGGGCGAGGCGGAGTTCCACGACGTGTACGGGATAGACGCCG
AAGCGCTGGCGATGGTGCCCCAGCCTCTGCTCGCCGTCCTCTTCTGCTTC
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CAATCCCCAACACCTTCGCTTTGTTGGGCCTAATGAATGCTTAGCGCTTA
TTGATTTGCATTGCCTGGGTTACCTGAGCGAAACTAGTAGGGTGATCATC
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TGTTCTTCAAATCAACAGCCAGCATGGACCCATATGAGGTTCTTATTTCT
TGCTAGTCAGACCTTACCTTGATCACTTTCACAGGTTTTTGCATTATTTT
AATATATTGTCTACTATACTTTTAGCGTGCAAGAGTTTTGGAGAAGGACG
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GTACTGCTATTTGGCTTATATGTAGTGGGATCCTATCTCGGGAACTGAAC
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TAGTTTATTAGTTTATATGTAGTTTAGCATCGAAGGATGTTAGAAAATGT
TGGAATAAACGGTCTTCCATTATTGTTTCATTCAGTATGAATGGACACAA
CGCTGTACCCAGTATGGTTATTAATGAGTTTCTAACAGACTGCCATATGA
TTATCTTCCAGATTGATACATCCATCTTTTACAGTTATCGATATTTGTGA
ATTAAAAATACAGAAAAAACTATAATCATAGGATTTATTGTGAAACAGTA
TTTTCCTCTTTCCAGTGAGAACATTAATCTCTAGACTTGGGCTTTGGTTG
GCAGCTCCCTGACGATGTAGAAGAGCATTATATCTGCTTCATGGCTCTCA
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ATTGCCTTAAACTAATTGTATTGTAAGGCAAAATTTATCTTCGTCTTCAC
ATGTGACAGCTTCTCAATTACTTGCTAATTTCCTCTTGGGGACGTAACAT
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AAGCAACAGAAAGCAGAGACCTGGATAGTTTTGATTGGACATAGCCATTT
TCGCAAATCAGCAATCAAATCAAGGATTCAGCACTACCAACCTGTGAATT
GTTTGGTTAGTGGTTACTTGGAGTCGCACTTGTTCTGTGTCCCCCCTGCA
TGGCCTCCTGGGCCTGTGGGGCCTTAATAGAATGGGGTTGAAGGGTATAT
CGATAATTTGATACTGAGAAAGTGCATTCAGTTACTCCAGTGTTTATCTT
TCTGCTCATTTGCATTTGCAATTATATTTCTCCTGCTGAACATTGTTTAT
GCTTTGAATTAATCAGGATGCCGTGGATATCATTAAGGCCATAATGCACA
AGATTCCCAATTCGATCAACTTCAACATAATGGTCCTATCAAAAAGATCG
AAGTAAAGTGATGCCAGTTCTGAAGTTGACAACTGACAGAATGCCACAAA
AGGGCGAAGATCATCTGTTTCAGCAAACAACACCAGCTTGTCACCCTTAT
GTGAGAACTTCTAACTAGTATTCTCATGTTATTTTAACTCTTTGAAGGTT
GTTTGTACTATTCCGTTAATCTACTTATTATTCTGTATGCACCCACTTAA
CTACAATTCTAATTAACATTTTACCTTTTTTATTATTATTTCCTAGCTGT
AACATTTGATCTAACTTTCAATTCTCAATGAACATATGGTTCATATTATC
TTTCTGTTAAGCTATTCTTCACTGTTTAGTTGTCTTGGCTGAAATCACAT
CATGATCAACGAACCGGAGTAGCTTCCGTTTGAGCAAATTCTGTCTATGT
CAACTGCCTAATTGCTCATTATGCCATTGTTCATTGATAAAACTGAAATT
GTTGCATTGTCATGGTAAAGAATGTTTGTTGATTTACCTTTGGGGGCTTG
TAGAAGCCAAGTCTATTGGAGTAATTTCCAAGTCTGTTAGAGAGATCTTG
TAAGGAAAGCTACTGGAGCTTGTCCTGAATTTTCAGCTAGTAGATCCATA
ACCAGTGGTCTTTCGGCAACTAAACGACAAGCCCACACTGACTTCTACCA
GTGGTCTTTCAGCTAGCATCACGCAATATTAACTCCAGTGCTGAAAACCA
AGTTGTACCTTGAGGTGGCAAACACGTGTAAAAACTACTTCCTATGGTAA
TGCATCGTGTGTTTCACTTTCGCATGGGTAGACCGATCATAAGAGGAATG
ATTCTCATGTTGATCATGTAGAGATAATAATACTGCCAGTGGCACACCTT
AAGGGATTAGACTTGAGGCCATATGGTACCGTTCTCACCACTTGAACACA
CTCCAGTACATAAACAGTGTTCTTCTAGCATCATCTACGGCACGAAACCT
TGCGTCCAAATCAGAAAAGCCCATCGATCGAGCTTGACAAACCCAGAAGA
AGATAGCTAGTGGTTCACAACCAACGTGTCAATGACACTACACTACACAC
ACCAAGTTGTGTCGGTTATGTTCTTCTGCCGGCTGGCTGGATAGCCATAA
AAGGGGATTTTTGGCGTGTTTCGGCCGGAATCCAGGTGCAAGAGGGAGAG
GTGAGGTGAGCTCCTCCTGCCCCGCTTAGTCGTCTCCGTTGGCAGGCGGG
TCGGCAGATTCACCTGACCCAAGTGTCCTAAACCCTGGGAACGAAGAGAA
CATGTGGGTGGGTTGGGGTGAACTGCCCCAACAAGGCAGGAAGGATGCAT
TCAATCAATATAAGTATTTTACCCGTTGGGATGGCCCTGTTTCTTTTCCT
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ACGATCCTGAATTGATAAATTATCACCGTACTATGTACTGATGGATTTTG
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GGTCGGCTCGTTGCTGTGGTCTTTTCGGTCAGGTAGCGGTGGCAGTCCAA
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TTCCTAGGCAGGGAATTGCCCATGCTCGAAACAGTCGCAGCGGTATCCTA
TCCATATGATCCCGACTTAACATATTAACTAACAAATATGCCCATGGGTT
GCTACTGTTTAATCTTACTCATTCACTATCAGACGGAGGGAGTACATAAC
TGGGTCTTGTTATTAATTCACTAATCTCGTTTGAAAAAAAAAGAGCTACC
ATGCATGTATGACATTGTTACCCCAAATTCAGTCAAGCATACATCTTCTT
AAAAGATATCAACAATTACATATCACCCCACAACTGATCTTTTGATCAAA
CTAAGTTGTAGTTAATGCGACATGTGAAGGAACATCTAAGATAAATCTGA
CATAGATATCATAATTACATAAAAGGGATATCTTCATAATCACCATTCCT
GTAAGAAAAAATGCATTTGTTATCCAATCTGATGTAGTAGCAATTAATTA
GAGCATACCTTCCTTTATCAATCATGTAAAAGCTATTAGGGCATAACATC
ATTGTTGTTTTTCTTAGACAGAGATCATAATATGAGAATGGAAATACATG
TGCCCAAGGCCATATTTTCTACCTCCGTCAGATAGGTGTTCTTACCGTTT
TGCTAACTCGAAGTAGTAAACGAAGCTTTTCTTCTTGTAGAAATACTGGC
ATAGGAGGCATTCTACCCATGATGCCAGGTGTCTCGCTACGAAATAAATG
TAAACAAAGCATTAAGCATAAGCTAGTTAATCGGCATAGCATATTAACAT
TGCTTTAGAATTTAATACAAGCTAATATACTACATGTTCTAAATGATGAC
AGTGAAAAGGCCTATGAGCAATGTATAGAACATGGCACATACAGAGCTTC
ACCTGTCTAAAATTGTTTTGATGTTGTTACTCGTCCGAAGAAAGAGACCC
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TGTAGAGTGTGTGCCCCTGCCACGTTCATCATGTTCTTTAAAGTTACGAA
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TGTACTCAATGGCTGATGGCATTTTCTACATGATATCTATAATTGATTTT
TTTGCACCAGCCCTTCGAGGCATAACCAAAGTCCTGTCATATTTCTCTTG
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GGCATCACTATATCAAGAATATAGGTTGTCAAATATGCTTACATATATCG
CATGTTTCATTATTTTGTTCAAAAATCCAAATAGTAGTATACACTATTAC
TATAGCAGGGATATGATCATGTCCTTTTTTGTGTGGAAGCACTAGTTTTG
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CACAATGAAATTCAGATGTTTGGCAGGCACCGTTTGCTCCTAGACTGACA
CTTGGGTGCTATAAAATGATGAATTTTAAGACCTGAAAATGGTTGGCATA
TAAACATACATACCTTGAATGTTTCAATATTTGTAGCAATCTGGCCAAGT
AACTGATTATTTTGCTCCAGGAGCTGCTGGTTTGAATTGTCCAAGATATA
TACTGCTTCAGAAAGTGACAAAGTGGGTGTTTCTTAGAAGAATTAAGGCA
TGAGGTTGATGGTGCTATAGAATGAATAGAGATTAGCCTCGTCGGATGAA
AAATGATCAATATGAGGTAATTCCATTCAACAACATTAAAGATGAAAACA
AATGAAGTGAAAATCAATGACATAAAACAATTAAAGCAGGAGCATGCAAT
GTAGTGGAATCTTTGCCTCCTACAAGGACATACTAAGAACCTTCTGCTTC
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TCTTCACCTTTGCATTGTGATCTAGGAAATGACATCCAAATATAGAAACA
CACCAAGTGAAGTCATCACAAGGTTGCTTCGAGATGATGCTTTGTACCCA
ATACAAGCAAGCAAACCATCAAGACCTCAAGCAAATGAAGTGTGTTTTGA
ATTCTAAGAAATCACCAATTTTAACAAGAGTAGCCGAAGAAAGTTTTCAA
CCATTCACAAAATTTATGTTAATTCAGCAAAGCTGCCTTTTAAACCATGC
GGGCAATGAAAATTACATAGAGAGATACACCGAGGATAGCTGGTTTCTAA
TAGTTTACGCCATTCAAAATCTAATGATATTTCTTTTTGATAATTTTGGA
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GTTTTTGAGAATGGATAATACAATACTAGGTACTACTAAACAAGAGCAGG
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ATGGTTTCCATGTGAACCGTGTTGTCCTGTATTGGCTGTCCAAGAAGCAA
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TCTTAAAATTTGCTTAGCAATTTATATTTTATTTTTGTTGAGAATGAAAT
AAAGCTCAGATTCAAAATATAAGTAGTTTAATATATTGACACATTCAAAG
TGAACTCCCTTAAAACCACTCGCGCCGTTCAAAAGTATATGACTTGCTAG
GAAGCGTGACGCTAAACGTATCTGGAATCTACCACTAAAATATTATGAAA
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TTCGCATTGTGTGTTTCGTTGTGATTCCTCCAACCTACCACTCCAACTTT
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TGGTCGAAAGATAATTTGAGTTTTTTAAATCTTTGTTACAATGGCACATA
TTGTTCTCACATCTCCAATAGCTCGATACCCCTTATGTCCGGTCAGTATT
TCTGTGAGAATAACCCCAAGACTATACAAGTCCACGCTGCGTGCAATTAT
ACCCCCTTCATGAACTTCTGGTGCTAAATATCCTCTGTATGAAAAAATAA
AGCTCAGATCGATTAATGTACAGAGAGAGTGCAACTGGAAACACAACATA
AAACACCGAGCTTCATGAAGAGTGAACTAGCTTACATTGATCCAAATATA
TTTTTGGTTATCTCTCGAGTTTGGTTTTCAGAGAAGCATCTTGACAATCC
AAAATCGGTAATTTTTGGTATCATGTTGGTGTCAAGGAGTATATTGGCAG
GTTTTAGATCCAAGTGAACAATATTATTCTCATGAAGGTACCGCAGACCC
CCACAAATCCCTTTGATTATCTCATAGCATGTTCTCCACTCACGACATGG
ATCTAGAGAGAGAGAGAGATGTTATATGACACATTATGCACTCTGTACTA
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GTTGTACATCAGCCATGACAAGTTTTCCATCGTACCTTTCCATACTTCCT
TGTGTGTCAGCGCAGTACCCTAGAAATCTTACAACATTTCTGTGCTTTAC
CTGCATGAGGCATTCAACCTCTCGGTGAAATTGCTTTTCATGCATATAAC
TGTTGGATAACCTCTTCACGGCCACCGCCCTATGGCCAAGTATCCCCTGC
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GTGTGATGTCCTCCAAAAATGATAATGGCAGGGCCTTGGGCTCTGCGGTT
TCATCGACTAACATCTGCTCTAAGTCATGTCGTGCAATTCTAGCTTTCCG
GTCCATTAATTTCCGGTCAGTATGTAATTAACCTAGAAACAGGAGCACAC
ATCTTATATTATGGGATGGAGTGAGTAATATCGGTCGACATACACTGAAC
AAATTAAGATTATTCACCTGTGTTATGCAAACAGCAAGCAGTAATTTTGA
TTCTGACCCTCCTTGTACACTGCAGCAACTCGAACTATCCCGGAACCCGT
GTGGCTTGACTGCGCAGCCGCTGCAAATCGCGGTGGTAAGTTGGTCTGCC
AGAGAGCTGGGACGATCAATGATGAATCCGTGGAGGACAGGTCCTCAAAC
TGAAGCTGGCGAGAAGACCAGCTGTAATTTGTGACTTCTCAGTGAAACGA
AATTGATAATTATAGAACCTGGACAAGCCTTGCTGCCGCTGTCGCCGCCT
GGCGAAGTCGACGAATCTTCAGATTTACGTGCCTAGTGAAGTAGAAGGGG
TATGGAGCTGGGGAAGAAGAACTAAAGGTTGAAGGGATGCAATGAACACG
TTTCAGGATATTTGAGCTGTTTTTTCATGAACATGCGTGTGTGAACGTGT
GTGGGGCTAGCAACATCCCATTCCCACAGAATGAATGGCACCATGGAGTG
GAGATGCCCCGCGCGCGGTTGGAGGGATTAAAAGGATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.