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GrainGenes Sequence Report: AA019987

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Sequence
AA019987
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019987
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTAGATCTCTCGAGAACAAAACGCACGCGCTGTCGCCTCCATCCTCCCCA
ATACCACCGTCGGCCATCGCAGCCAACAGCCATTGCCCTCGCCCCAACTC
GCTCCAGTGTCCGAATTCCCCGCTGCACGCAGCACAAACCCTAGACGCCG
CCTAGCATCTCCCCCGCATCATCGTCCAGCTCTCGCTCGCATCGGCTCGC
GGGATGGAGCACGACGCCCCCTCGCACCACGCCCCGCCGCCTGCCGCCCA
GGGCGAAGGCGCCGTCGACGACTGGGCACGCGACGACGCGGAGCCCTCCC
ATCGCTACGAAGCGGGGCCCTCCCATCGCCACGACGCGGATGCTGCTGCT
CCTCCCGCGCCACCGGCAGAAGGTGCCTTCAATCTCCTCTCCTCTTAACT
GGTCCTATCGCGCTCGACTCGGCTGTGCCGTCTTCCGGTGTTGTGGAGGA
TTAGCAACGCTTATGATGGTATCCGCTGTGATGTAATAAAAGATTAAGGG
CGACGATTATTGTGATGAGTAATGTAGTGGCTGTTTCGTCTGTCCTGGTT
GACGATGCGGAAAAAGCTGTTCCAATTGACTTGGAAGATGCGGAAAATAT
AGAACCCAAGTTACCTAATCCTACTTCAAGTTAGGCCTCTGGCTAGACAC
TTGTTCACTCGATTAAATATCCGAAGCATCCCTCTGTCTGTTAGATGACT
CCTATCAGTGGAGTGCACATGCCTAATGGGTAGTAAAAACAAGGTTTACT
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TGTTGCCACATAACCTGAGTCGGTAGTCTGTATAATGGTCTGAATAGGAC
GTATATTCTCCATTAGATGGCATCCTCTGTGGTAATATGTTGTAAACAGT
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TGGAGTTGCAGACAAACGGTATGCATTAGACTCTTCTTCAGATTGTTAAT
GCAGTTACCGTTCCAAATTTCCAATACTATACCTTCTTAATTGTATCCCT
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GCAAGTGGTCTTAACTATTGAATGCAAGTTAAAAGTAACTTCAAGACAAT
GCCATCACCCTATTGTTATTACTTTGTGAAAATCTGATGCCAGGTTAACA
GATTGAAATAATTAAATATATCCTTTCCCATTTAACACAAAGATAAATTT
CTCAAGAGGTTGATGATCCAGATGGGTTCTTATATTTGATTCTATAAACT
TTTTTTATATGAAATGTCATGAATAATTCCATCAATGTTTTTAGGAATGC
CGTCATTTTTTGTACTGTCCCGCCTCTAATTTATTTCTGTGAGTATTGAC
TCTTAAGCAACCCTGACTTCTGTATCAATCCAGCGGCTGCTCATGATGAT
GTTCAAATGGTAGCAGACGAGGAAGAGGAAAAAAAGCGCCATTTGAATGT
GGTTTTTATTGGCCATGTTGGTACGTCAGTCTTCTTACTGCCTGCTTTCT
TTCAAACTTTTTCAGGTTGTAGCAAGACATGTGCATGAATACAGTTCCCA
ATTGATGTTCTTTTTCCATGTTCCCTTTTTTGATCGTTTCTGTCATATCA
TGGTTTTGGTGATAACATGTGATGAGGATGCCATGTCTTGGGGCTTACTA
AGCTCATTAATCTTGATCAGAATGTGCTCTTCTTCAGGACTATTTGTCTA
TTTAACAATGATGATGGTTAGAACGGGATACTTTTATCATGTATTCATGC
TTGCTTCTATGAAGATTGGTAGACACATTTAGTATGTTTTGGCATTATAG
ATCCTGGTCAGAGTTACCGCAATCTTAAATACAACAGACATGCCCCTTCT
ATGATATGTCCTAACTTAAGTGCTCATGGAAGATTTAGTATATGCTTAAA
TCTTAGATTTCTTTCATATGTACAAGACAGGGAGGAATTTTCTTTTACAT
GCTAAGAAGACCAATATACAGGTCATAATTGACATTTTTTTAATTGATTG
AGATCATTAAAATATGGCTGAGTTTATTTTTCCGGTTTCCTTTATAAGTA
CCTTGTTCCTAATATAAGTGGGGAGTGAGGAGGCAGAAATGAGGGAGTGG
GGAGGCAGAAAATGCAGAAGGGGATGCAACCTCATTTTTTTGTAGTTACA
GGTGGACCCTGCGGAGCAGGGGAAGCGCTTCCCTCAGGGAAGACCCCTGT
TGTCATCCGACTGGGTTAAACTGGGTCTCAGTGGTATTTCTGTCACCACC
TTGTCCTGCACACTAAAAGAAAATGAAAAAACTTTTAGGCTCTGTTTGGA
TGTATGTATTCACAGGCTTGGCATTGCATTGGCTCAAATATCAAAATCTA
GGCATATTTGCATTGATATTGATATCAATAATTTTGTTTGGATGTTTAGG
TATTTGGGGTCAAGAATTGATACTGAGCTTGAATATCAAATCCTGTTTGG
AAGGTCAAAGTGATGTATTGCATTTGTACCAGCATTATTGTTGTGCTATC
AAATCTAGATTATAAAAATAGAGAGAGATAATCAAGGTAAACAACGCTTG
ATTTGTCAAACAGAGTACATTGCAACTTTGGATCTTAAACCGTACGGTAC
AGAAAAATAAAGAGAGCAGTATCTTCACCAAACTTCATCAGCCGGAGGAA
TAGAACAAGGGCGACGGAGACATGCCTTGCCAAAGGGCCGACGCGTCGTT
CTCCGAAGGGCCGTCGTGCTGCTTACCAAACAGGAGAGGACCACACCGTT
GACCTTCGGCGCGAGGCCGGGATCTCGGCGGAGGATGGAGGGAGGCGGCG
GCTTCTAGAGAGGAGGATGGAGGCGGCGAGGTCCAGCCTCGACGGAGAAG
GTGGGGGTCAGGAGGCGGAGGAGGGAGGCGGCCGCGGGGTCCAGCCTCGA
CGGAGAAGGCAGGGGTCGGGAGGCGGAGAAGGAGGGAGGCGGCGGCTTCC
AACCTCGACGGAGCCGAAGAAGGCGGGGGTCGGGAGGCGGAGAAGGAGAG
AGGCGTCGGCTTCCAGCCTGGACGGAAGCGGAGAAGAGGGTCGGGAGGCA
GGGGTCCGGAGCGAGGGCGGCGGTTGCTACGAGATAGAAGGAGGGAGCGA
GGGTGCCGAATGCCACACGATGTCGAGGGTAGAGGCTCGTCTTTCGGAAG
GAAGGTCGTGCTGGCTTATTCGGCCCGCCTCAATATTCAGCCCGAATACC
TAGCCCCAATATCTAAAACATCCAAACACCCAATTTTGATGTATTCGGGC
CGTGAATGCCCGAATGTCTAATGCCAAGCCTAAATACATACATCCAAACG
CAGCCTTAATGTAATTGGGCTGAAGTTCCATGGATGGAAACCTCTGATGG
TGTGTGCTATAGATGGGAGATGGAGAATTAGCAGATGGTTGCTCTGCGCT
GGTTATAATCTGTGCAGGGGACCAATTTCACAGATTTATCTAAGAATTGT
TGTGTTACTTTGCATTGTTCGACATATGCATGCGCAAGTGTCATATGTGC
TCATGTACTTTGTTTAATATCAATATTGTTGTGCTGGTTGATGAGCCTGC
TTTGAATACCTAGCTTGAATCATGTAGCTTGTTCAATCTTCATTCCGTTT
CTTATGGATTAGTTATCTGCTACACCGTCTTACTCTTCTGTTACTCTATT
TTCTTCTGTTATGGTTGATAGGTTCTCCATTTCTGTGTCTGCCCAATTTT
TTTGTATGAATAGTACCGATGTTCTGTAAGTTCACTTCTCTAGTAGAAGT
GGTGATTTCTTAATGAACATACTTAATTTTGTTTTTGTTGTTTCATGGCT
CCAGATGCTGGGAAGTCAACTGCTGGAGGGCAAATATTGTTCCTGAGTGG
TCAAGTAGATGACCGGACCATCCAGAAATATGAAAAAGAAGCAAAGGATA
AAAGCCGAGAAAGCTGGTGAGTAGGTCGTGAGCAATATTTAGCTTGTACT
CCCTCCGTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGCCTTTTTCTGAAACATATGT
ATCTAGACGCCTTTTAGTTTGTAGGTTCACTTATTTTGTTCCGAACCTAC
ACACTAAAAGGCTTCTAGATACATGCATTTCAAAAAAGCTAAAACATATA
ATTTGGAACGGAGGGAGTACATCCTTTATGCGAGGCTAATCCATACATTT
GAACATGGAAGTTATGACTGTTCATGCTAGTTAATAATTTGGGTATTCTT
TCATGCAATATTTAGCTTGTACTCCCTCCGTTCCAAAATATAAGATGTTT
TAGCCTTTTTCTGAAACATATGTATCTAGACGTCTTTTAGTTTGTAGGTT
CACTTATTTTGTTCCGAACCTACACACTAAAAGGCTTCTAGATACATGCA
TTTCAAAAAAAGCTAAAACATATAATTTGGAACGGAGGGAGTACATCCTT
TATGCGAGGCTAATCCATACATTTGAACATGGAAGTTATGACTGTTCATG
CTAGTTAATAATTTGGGTATTCTTTCACATAGATGGTTCTGTCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTGAATTCGACTATCCATACACTCTTTCAA
TCATAATCTGAATACTTGCAGGTACATGGCTTACATCATGGATACAAATG
AGGAAGAGCGACTTAAGGTATCTCTTTTGTATGGTTGCTTTATGATTAGT
GCATTAAAGCTCTATAGTTGACACTTCTTTTGCATGTCTTCAGGGGAAGA
CTGTTGAAGTTGGTAGGGCCTACTTTGAGACTGAGAATACAAGATTCACT
ATTTTGGATGCGCCGGTATTTCTCTTCTACATATTACAGTTATACTCTCT
CTGTTCCATATTATAAGACGTTTTGGCAAACCAAGTCCTATAATATGGAA
CAGAGGGGTACTTGTTAGTTTTTTTTTCTTGCACGACGCTCTTCTGGTTC
TCTGGATTTATCTGTGGCCACACCAGCACTGTGATGGCCAGACTATAGTT
TGAGCTGTACATAACTTCAGCTTCTTATGTTCCTGCTGAATCTGTTCTGG
TAGTGACCAAGGAATCTACATGTTCAACCTGAAAACTGCATGGATTGTTT
TTGGGACCATTTACGTATGTTAAGGTTCTTAAATATAATTTGCACTAAAT
GATATGAAAGTTGACAAAAAACTGTTGAACAGGATTGACATGCCATTAAA
TGCGCTTGTGTCAGTGCAAGAAAGTTGTCCTGAGATGATCTAAATATAAC
TTCAATTTTACATTACAATTACATACCATTAAATGGGCTTGTGTCAATGC
AAGAAAGTTGTCCCTAGATGTTTTGATCTAAATTTAAATCTTAATTTTAC
ATTATAAAATTGTGGAAACAAAAGATTTCACGTATGCAACCATTGAGTCC
AAAGCAAACACATGCACACTGCTTAACACTAGGAGATTTGCTATGGTTCA
TTCCTTTTCCATGTAAATGGCTTTCCTTCCAGCGATACATCAGCACATAT
TCTTATTGCCTTAGGTCAAGGTATCTATTGGTCTGAATCCAGTCCTTGTT
TAGTGTTTTGGTCTATTCGTACCTCATTGTTAGCCTCTTAAAATCATACG
TGGGACAATTTCTTTAGCATGTTCACTCCTTTGTTGCCAATGCCACTGTT
CTGATTCATCCTTGTACATGTCATACTTGTTAGATTTACTTTTATGACTA
TTATGCCCATGCCCATGCATATGTTTTGTCAGACACGAAGTTTGCAACTT
CTGGTGACAAATCTGAATTTTTTACTGATGATGCTTTCATGTATTTGCTG
TGTGTGATTGGTCTACTTGCAATAGCTATTGAACTGAATTCTTGTTTCAT
GTACAGTATTTGTTTACTTGGATGGTCTGAATTTGCAGGGCCATAAAAGT
TATGTTCCAAATATGATAAGTGGTGCATCTCAAGCTGACATTGGTGTTCT
GGTAACTATAGGGCCATGGGCATTTCATTTTCATTTTTTTGGTCATTTCT
CTCAGTGAATATATTCCCCTTCCCTTTTCAGGTCATATCTGCTCGAAAAG
GTGAATTTGAAACTGGATATGAAAGAGGCGGGCAAACTCGGGAACATGTA
TTGCTTGCAAAAACTCTAGGTGTTGCTAAGTTGATAGTTGTCATCAACAA
GATGGATGAACCTACGGTACAATGGTCTAAAGAAAGGTAAGCCTGGGGAG
ACATACTTTTATATTTTTTTAATTGAAAGATTCGAATATTACAGAAGGTA
TAGCTGTAGCCAAACAATAAATTTTATTATTTGTTTCAGATATGATGAAA
TTGAAGGAAAAATGGTTCCTTTTCTCAAATCATCAGGATACAATGTTAAG
AGAGGTACTATTCTACTTTTGACGTTTTCTCAAAAAATAAATTGTCATTA
ACACGCAGTTTGAAGTTGGATTATGTGCAATTGCTTTCTGTGGTGTTTTG
TGTTTAGTAAATTGTGTCTTCAACATCACATGTTCATCTGTCGATGGTTT
TCTACATGTTTAAATAACTGGATGCGTAGACTATGTCTAGCAGCTTTCTT
GGCCATTCTGAGTTGACGACTGTCTCCTGTTTCACGACGTGTGGCATTAG
GATTTTGTTCAGTTATAAGAGGTGTTACATTGTGCTTGTGTATACCCTGG
TAGAGTACTGTGGCTATGTATAGCCAACTAGATGCTATTTCTTACTGTTT
CATTGCTTTGTTATCAGATGTACAGTTCTTGCCAATATCTGGTCTTTGTG
GAGCCAATATGAAAACCAGGATGGATAAAAGCATATGTAGCTGGTGGGAT
GGTCCTTGCCTTTTTGAAGTTCTGGACCGGATCGAAGTTCCTTTGCGTGA
CCCCAGAGGTCCAGTAAGGTTTAAAGGCTATGCTCATGCTCCTTTAACTT
TTATTAGTTTATATTCCATGTGCTGAAAAATATATGTCATTCTTTGGACT
GACATCATCTCCACTGTTTAAGGTTTTGATTATCAATATATAGATGATAT
GTTAGCAAAGATATATTATATTGCGTAACTACTTCTCTTTACAAATTGAA
TGATATTGCTTTTGCATTGTCAATATTGTATGTATGACGATGGAGAACAA
GTTTCTTGAAATATCATTTTGTTTTGACATAGGTAGTATTGCACAGTTAA
TATAGATGGCTTTGCTGCTCTTTACAGATATTTTTTCATTTTGAATTCAT
TGTGTCAATCTCTGTGCCAAAACAAATGGCTATTCAAATGAAAACTGATA
CTCCCTCCGTCCCAAAATAGATGCCTTAATATTGTCAAAATTTGGGTGAA
TCTAGACACTATTTAGTATATAGATTCATTCAAAATTTGAAAAACCTAAG
ACATCTATTCTTGGACGGAGGGAGTACATTTTCTTATATTATCCTCTTCA
TTTGGTTCTAGCCTTTGTATAGAAGGCTGATTTATTTGTTGTGTTGATCA
GATGCCAGATACAAGCTTTACATTTCTCTTTGTTAACAATGTAGGATGCC
AATAATTGATAAATATAAAGATATGGGTACTGTTGTAATGGGGAAATTAG
AGTCTGGGACTATCAGAGAGGGTGACAGTTTGTTGGTTATGCCGAACAGG
GTATGTTTATCTTATCCAGTTAACTCTCACTGTCTACCCCTTCTACTTGG
GACTATGTGATTCAATTTGTGTGCAATGTCTCTTGTTCGAGCAGTCCAAC
GTGAAAGTCATTGGCATAAACTTGGATGAGAAGAAAGTACGGCGTGCTGG
ACCTGGTGAGAATGTTCGTGTCAAACTGTCTGGAATTGAAGAGGATGATA
TTATGGCTGGTTTTGTACTTTCAAGCGTTGGTAAGTACATTCTTCAAGAA
AAGCAATTTAATATATATTAGGTTGTCGTGACCGTGAATCCAGCTCGTGG
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TGAGCAGCTTGAGAGCAAACCTGCACAGTTATGATAGGATTAGGTTGTAT
ATCCGGTTAGTTAGTCCATTGGGGTTTTCTCTATTTATTGATATGGACAA
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CTAAGTAAGCCATCCCTCTAAAAGGGGCAGCTAGACAGTATGTAGTTAAA
CGTGGAACTGGATTGGAATCCAAGTCCAAAACTCATCCGTCCAACTAATG
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AGAGGACAGGGAGGGCGGGGCTGCAGGACGAGGGAGGCAGTCTGGGCGGT
GGCGGCCATGCAGGGAATCAGGGCGGGTAGGTAGGAGATGCAGTTTCCTT
TTCTCATGCTGAGGAGGTTGTTCTGGAGTACTCGTATTGCGTGACGTCGT
GACGACCGAGACTAGGGGCAGCACAAATCCATTGGACCACCGGACTATCC
AACTATTGAGGTCCAAGTTTGTTCAATGCTATTGGACCTAAAGTCCAGTC
GAGATCCACGTCCAATGAAGTCCAGTCCACTTAAATCCAATCTATTCCAG
GTCCAAAGTCCATGGATTTTACATGTCCAGTTCCTATATGTAGTCCATAA
CCATGAAGCAGTGAGAATTATCAAGTAAATATTCTACCCTCTTCTACCTT
GTCTCATCATATGACTCACGGCAAGCCAATCCTTACTCCTTGGAGCCACC
ATGACCCTACGTCTCTGTGCCCTTACCAAAAGTAGCATGTGACGTATCTT
ATTCACTGGCCTCCTAGACATTTTAATTTAACTTCCTCTTTTTTTGTGTG
ATGAAACATCTACTGTGGGTCCAGTTCTAGTGCTATGGTGTGATAGCACG
GCCCAGTCTTTGAAACAGATTCAGGCATTCATCCCAGGGTTGAGTGGGCT
GATTTAGCATGTGTTTGGCTTGACGGTGTAAGGAAACGATTCAGTTGGTT
GGCCCTCCCCTGTAAAAAAGAACAAAATTTGGATTGAGCTTAAGTCTTAT
TACAATACCACTACTAAACTAGCATAATTTTTCTAACCAAATAAGTTACT
ACTCCCTCTGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCCATTTTCTGGAACACA
TGTATCTAGACGCCTTTTAGTATTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGACTTG
GATTTGTCTAGATTCTCATGCACCTAGACGCGTTTTAGTGTGTAGATACA
TGCGAATCTAGACAAATCCAAGTCATTTATTTTGGGACAGAGGGAGTATG
TAGGTTCACTCATTTTGCTCCGAACCTACACACTAAAAGTCAGATTTATG
CGTTTCAGAAAAATGCTAAAGCATCTTATATTTTGAAACGAGGGAGTATA
TGGCAACCCAAAATGAGGTCATATTCTTTTAAATTGCTGTTCGCTGTACA
TCTGATCTGTATTTTATGTTCTGATAATTTAGTTTTTCATTGTGGTCCTT
GTAGATTTTTGAAAGATTTGTGTACTTGCGTTGGTGGATCATTTCTTAAT
TTGACATATATTCTCATTTGGATAATGCCTACACATGCAGCTAATCCCGT
TGGTGCTTTCACTGAATTTAATGCTCAACTGCAGATTTTAGAGTTGCTCG
ATAATGTAAGTGTTGCTTGATACTTTCAGTGAAGTTGAAGGAGACTACTC
TTTTACATTTATCATGTTCTTTTCCTGCATGTGTGCTTATATTGCATAAT
TTGTATTGTATGGATGGGCATCTTACTCTTGTTGGATTTCAATTTGCTGA
TGAGAATACATGGTTTATGCGTATGCGGATATAAAATGTGTATGTATGTT
GTTTGAATATGGAAGAGATTTGCTTAAATGAAATCGGATTTGACATTCTT
TGCTCTGTACTTAGTGTGTATGTAGGTTACCTTTCAGTGTGCGATTGAAA
TGCTACGTCTATAACATGTCATAGTTTTAGTTTAATGTTTTTCCAAACAT
TTGATTTTCTGTAAGAGTGATCACCAATTTGCATAATTCCAAGTATAATT
ATCACTGCTACTGTGCTACACCATTATGAACAGTAGTGTTCATCTTCCAA
ATGCTTTGGTCTTGTATTTAATTGACATTCTATGTTTGCAATATTCTAGG
CTATTTTCACTGCTGGCTACAAGGCAGTGTTACATATCCACTCTGTTGTT
GAGGAGTGTGAGATTGTTGATCTCATAGAGGAGATTGAGACGAAGAAAAT
GAAAGAAACTGATCCAAAGAAAAAGAAGCCAAAGCGGAAACCTCTTTTTG
TGAAGAATGGTGCGGCTGTAGTTTGTCGCATTCAGGTATTAATCCAGAAC
GTCATTAGTACAGCATAACTTTTCATTTGCTTATAGAGCTAATTGTAATG
TATCATGCATTTAGGTGAATAATTTGATATGCATAGAGAAGTTCTCTGAT
TCACCTCAGCTTGGAAGGTTTACTCTACGATCGGAAGGCAAGTATACAAG
CTTCAGAACATATTTTCTTTACCCTTTAGAGTGAATGCAACAGTCGTTTT
GTTTTCTTAGACGACCGCTATTGATTAATTTTTGTAGCATTTCCTCATGA
TCCTCGGCACTACTACATATCTTATTAGCATGAACTTTTTATTTACTAGT
TCTTGTTCTTATTTCTGGCTGCTGCTCCAGGTCATAGTTCATTGCATCCC
TGAAGCTAGCCCTGTTTTATTATTTATTAATGTTGAATTTAGTTTATTTT
CGTCGCTCAGTGAATGGAAGGCCCTTGGGTGAATAATTTGATATGCATGT
TTCCACTTCAGTTTATTTTCTGGACTCCCGTGTTACTTACCTACGTCCTT
TTCTGCAGCACTTCTCTGGGTATATCTCTTTGCATGTTCATTGAATCGTG
TGCTAAATTATTAATAGTTTGTTTTACCTGTGCTGTTGCAGGAAAGACAA
TAGCTGTAGGGAAGGTTGTTGCTGTTCCTCCAGCGGGGCGCACAACATTT
TCTGCTTAAGCCAATTTTGACAGAATGGCGGGTAGGCACTTATGCTCATC
TTTTTCTTACTAATCTCTGCGTCCAAGATTTATCGTGTTCTGCGAGTTGT
TTTGTAAACAAAGACTTCTTTTTCACTAGCTTGTTGACAGGAGAATGAGG
TGGCTAATATTTTTGGGAAGCAGCTGAGATTGATTTGAGTATGATTTTCT
GGCCTGGTTCTATCAGTCACTTAGGCGGCATAGTTATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.