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GrainGenes Sequence Report: AA018305

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Sequence
AA018305
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018305
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGGCAGGCACGGCAGGCGGGCGAGCGACCTCGCTCTTGCCTCTATAAAT
GCAGGGCCGCCCATCGCCTTAAACGCCCCAATACTCGGAGGAGAGGTCAA
GGAGACGGGAAACGAGAGGAGATAGATAGAGGCGGCGCGTTTGTTCTCAA
TCCGAACGCCCCCTTGCTCCGACGCTGCCGGCCGGCGAGAGGGCCCGTGG
GAGGGCCGAATCGGGCGAGAGTTGCCAAGCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGA
GGGAGATCAGGGGAGTACGCCACGCAGCGCGCGGCCTCGGTCCCATCTCC
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GCCAGAGAGCAGCATTGGGCTATACAACCCCGCCTTCGAGCGGGACTCCT
GCGGCGTTGGGTTCGTCGCCGAGCTATCTGGTGATGACAACCGGGAGACC
GTGAGTTCTATCGACAGAGACACCACCTGCAGTTTTCTCTCTGCAATCCA
CCACGTCTGATAATTATTTTATTAATTCTGCTATTGTTTACGCGCCAGGT
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TCTCCTCCAGGCCACAAAGGATGCTGGCTTCGAGTTACCTCCACCGGGTG
AGTATGCTGTTGGAATGGTTTTCCTGCCAACTGACGAGAAGCGTCGCGAG
CGGAGCAAAGCTGAGTTTAAGAAGGTTGGTGGTTGTTGTATAGAAATTTT
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TGAGCCCGTGATTCAGCAGGTTTTCCTCACCAAGAGTTCAATCTCGAAGG
CCGATTTCGAACAGCAGGTCATCCACGAGTTCATTTTTTTTCTGAAACAC
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GCTAAAAAGATCCGGGATTCCCAATTAAGATCTTCACTGTAACACATATT
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TCTATGTTCATGTGAGTAATTCTTAATAAATATTCCTTTTGTGGTTTTCC
AGGACCATTGTTTACAAGGGCCAGCTTATGCCGTCTCAGCTTAAGGGATA
CTACTATGCAGATATAGGTCATGAGAACTTCACCAGTTACATGGCTCTGG
TAAATACAAAACCTTGATACTCTTACACCAAAAGTCATGGTCGTAGTCAG
CGGATGGGAATCGATAATAGCAAGCCAGTTGTAAGATCAATACTCGCTCC
TGTGCAGCCATCAAAAATTGAATTGTCGTACATTCACTGCTATTCGTACC
CTATTTCACTCCTGGTTTGTGATGCCTTTAAGTGAAGTGCTAGAAATCTC
TATTGGTTGATATCCAATAACCATCTTGCAGAGTCCAGCTGCAGTTCTGG
TATGGCTGACTGCTTGCCGACTCTTGAGGATGTGACCGAAGAAATTGTGT
TTGGTTTGAGGTAGCATAGGGCTCCCAACTGTTTTGCATGAAATTATATG
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TAGACATGCAAAAGATGATTATGATATGATTTCTAATAGTAATATCGGAA
CAGGTTCATTCCCGGTTCTCCACCAACACCTTCCCCAGCTGGGATCGTGC
ACAGCCAATGCGTGTCTTAGGCCACAATGGAGAGATCAATACACTCAAAG
GGAACAAAAATTGGTAATCTTGTGAAACCTTTTCCTCTGGTATATCCTAG
ATGCAATCATCTCCATATGCCTTTGCCGTCTGGATTGATGATCCCAATTG
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TCTTCAGATTCAGGTCTGCAATGCAATATGCAGTATGGATTTTCACTTGG
CAAAGGAAAAAAATTGCCTCAATCTTTTTGAGTTGTTAAGTAAAAACATT
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ATGATGTAAACATGGAGCCTGAGAAGAGAGCCCTCTATGAGTTTTTGTCA
GCCCTTATGGAGCCCTGGGATGGACCTGCTCTAATATCTTGTAATTTTCT
TAACCCATATCCTTTTCTGATCATACTCCTGATGGATTACTTAAGCTAAC
TTGGGTTTCACCTGTAGTTACTGATGGCCGTTACCTTGGAGCTACCCTTG
ACCGCAATGGCCTGAGGCCTGGTCGATTTTACGTGACGCACAGTGGACGT
GTAGTCATGGGTAGTGAAGTCGGTGTCGTGGATATTCCTGCCGAAGATGT
CCTGAGAAAGGGTAGGCTTAACCCTGGAATGATGCTACTGGTTGACTTTG
AGAATCATACAGTAGTGGATGATGAAGCACTTAAGGCACAGTACTCGAGA
GCTCACCCGTACGGCGAATGGCTCAAGAGACAAAAGCTGTACCTCAAAGA
CATTGTAGAATCTGTCCCAGAAACTGACAGAGTTACTCCAAGCATTTCTG
GTTCATTTACAGTAAGTATTTTATATGCTTCAACTTATTGATTTCATTGC
GCTATAATTTCGACTGGATTGTTGGTGAGATCTTGCTCAACGATAATTAA
CATAGAGATTCTGCTTTCTGTTGCAATTTTGTGTAGCAAAAAGATGTGAA
CAAGGAATGCGTAGGCATCAATGGAATTGTGACCCCGCTAAAGGCCTTTG
GGTAAGCAAGGGTTCAACATTGCTGATTATCACTGCTGTTTCGTTTTATG
CTGGCTAACTATCCAAACTTTAACTCCAGATACACAGTGGAAGCCCTAGA
AATGTTGCTGCTTCCAATGGCAAAAGATGGAGTGGAAGCTCTTGGATCAA
TGGGAAATGATGCACCTCTAGCAGTGATGTCAAACCGAGAGAAGCTGACT
TTTGAGTACTTCAAGCAGATGTTTGCACAAGTAACAAATCCGCCAATTGA
TCCAATCAGGGAGAAGATTGTTACATCCATGGAATGCATGATTGGGCCAG
AAGGTGACTTGTTAGAAATAACCGAAAAGCAATGCAACCGCCTTGCACTT
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CTACCGTGGTTGGCGCAGCAAGGTTCTTGACATAACCTACCCTAAGAAGT
CTGGAAGGAAGGGGTTAAAAGAAACTTTGGATAGAATTTGTTCTGAAGCC
CGGGAAGCTATAAGGGAAGGATACAAAATTTTGGTTCTGTCAGACAGAGG
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CAAGTTTTGATGGTACTAGTCACAACTTGGTAAAAACTGCTAGCAGATGG
GTCAGGTGCACTCATCGCTGGATAGTAACTTGAATACGTCATAGTTTTAG
TTAATTCACAGCCATTATTTCCATTGCAAAGTGTTGTATGATTGACATTC
TTACTTTGTCAGCTTGATCATAGATAGAATGTACATTGATGATATGATTT
TATTTCAGTTTCAATATATGAAATTTGTTGTATTTTCTTGATACAGGATT
TTCTTCCAACCGTGTTGCTGTTAGCTCTCTCTTGGCTGTTGGAGCAGTAC
ATCAACACCTTGTTGCAAATCTTGAGAGGACACGGGTAGGACTATTGGTG
GAGTCTGCTGAACCTCGTGAAGTGCACCATTTCTGCACGCTTGTTGGGTT
TGGTGCAGATGCTATATGCCCTTACTTGGCCATCGAAGCAATTTGGTGCT
TGCAGACTGATGGAAAGATTTCTCCCACCGACTCGAAGGAGGAACTTGTG
AAAAAATATTTTTATGCTTCCATCTATGGAATGATGAAAGTTCTTGCAAA
GATGGGAATATCTACCCTTGCATCATACAAAGGCGCACAGATTTTTGAAG
CTCTTGGACTTTCTTCTGAAGTGATTCACAAGTGTTTCGAAGGTACACCT
AGCAGAATTGAGGGTGCAACGTTTGAAATGCTGGCACGTGATGCTCTCCG
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GCTAACAAGATTTCTTTGGATGAGGTTGAACCTGCTAGTGAGATTGTGAA
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ATTAGTCTGATGCCTACGTTTGTACTATTTAGGCAGTTTAACTATTTAGA
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AAATGGAATATACTGTCTTATATTTGCACTCCGGAGAGAAACTTGTACTT
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TGGACCCCTTTAAATTTCTTTGTATTTCAGATATTTGCTCCCTATACAGT
TAAATCTACTGCTATTTGTATCTAGCATGTACGACATATTTTTTTAATCT
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CATCTTCTATATGTGATATGGATGTACTAATTCTAATACGCCTTTGAAGG
TGAGGGAGGGGAACAGCCTTCTCGTATGGAACCTCTTCCTGATGGTTCGA
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CCTGGTCACAAGGTTATTGGTGACATTGCAGTTACAAGACATTCTACAGC
TGGTGTAGGCCTTATTAGCCCACCTCCTCACCATGACATATATTCTATTG
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AGCTAGAATCAGCGTCAAGCTTGTCTCTGAGGCCGGTGTAGGAGTTGTCG
CTAGCGGTGTGGTAAAAGGTCATGCAGACCATGTTCTTATTTCTGGCCAT
GATGGTGGCACTGGAGCATCAAGATGGACAGGTATTAAGAATGCTGGACT
GCCATGGGAACTTGGATTGGCTGAGACGCATCAAACTTTAGTGGCAAATG
GACTTCGTGGCAGAGCTGTTCTACAAACAGATGGTCAGTTAAAAACTGGT
AGAGATGTTGCTGTTGCATGCTTACTTGGTGCAGAGGAATTTGGTTTCAG
CACTGCTCCATTGATCACACTGGGCTGCATTATGATGCGAAAATGTCATA
CCAACACTTGTCCTGTTGGTATAGCTACCCAAGATCCAGTGCTTCGTGAA
AAGTTTGCTGGAGAACCAGAGCATGTCATTAACTTTTTCTTCATGCTTGC
TGAGGAACTAAGAGAAATCATGGCTCATCTTGGTCTCCGCAGCATTAATG
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TTCAGAGATTCGTCCTGGGGCTGCTCAGTACTGTGTTGAAAAACAAGATC
ATGGCCTTGACATGGCTTTGGATAATAAACTTATAGCTTTATCGAGGGCT
GCACTTGAAAAGGAAGTTAAGGTTTTCATTGAGACTCCGATTAAGAACAC
TAATCGGGCGGTAGGCACTACACTTAGCCATGAAGTCACAAAACGTTATC
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GCTGGACAGAGTTTCGGTGCCTTTCTTTGTCCTGGAATTACCCTTGAGCT
TGAGGGAGACAGTAATGATTATGTTGGCAAGGGATTATCTGGTGGAAAAA
TTATTGTGTACCCACCCAGGAACAGTACATTTAGTGCAGAAGACAATATT
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TGGTGGCATTGCTTATGTTTATGATGTTGATGGGACATTTAGTGCCCGCT
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GAAAAGGCTGCATCTAGGCACAAAAAGGAACCTAAAATGCCAAATGGCAT
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GATAAAGTGTTCTCCAAAGTGTTCTCCATTTGTACAAGTTTATCCATGAG
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TGTACAGAAAATACAAACAGAGCAGTCAACTAGCCGACCAACAAGTTCTG
CCAAAGCCACAAAGTACCGAGGTTTTATATCATACGAGCGAGAGGGTGTT
TCGTACCGTGATCCCAATGAACGTGTTAAAGATTGGAATGAGGTTGCCAT
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ATGTTTAGCTATTCAGCTTTCAAGCTCAAGGATAATAACTAATACATTTT
TATATCTTATTGGGGAAAAGAAGCTCCTTGCAGTCCTTGATCACAACTTG
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GAAACAAGATCCCAGAGTTCAATGAGCTAGTTCACCAAAATAGATGGCGG
GAAGCACTGGATCGTTTACTGGAGACAAATAACTTCCCTGAATTTACTGG
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TTTGAAGAAGGATGGATGGTACCACGACCACCACTTCAAAGAACAGGGTA
TTTCTTTTTTACCATTTAATTTAGTTTGTGTTTTCCATATTTTAATATCC
TTTGCATTTAGTAGGTAACATTTGAGTTGCACTTGCTGAAAGTACGTTGT
TCCTTTTGCAGAAAGAAAATCGCCATAGTTGGCAGTGGTCCTGCTGGTTT
GGCTGCCGCGGATCAACTAAATAAATTGGGCCATTTCGTAACTGTGTTTG
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AAGACAGACAAGATTGGTGTTGTTCAGCGCCGCGTAAATTTAATGGCTGA
AGAGGGTATTACATTTGTGGTTAATGCCAATGTAGGCAGTGATCCTTTAT
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TTATCTTATGTTACAGAAGTTCACTAGCAAGACTTTGAAAGAAATTTTGA
GCACTTGTGCTTTCTTATCTTTCCGAAAAGGAGGGAATGCCCCTGGCATC
TAGACGTGCTTTCTCATAGATGTATAATGACGTTTACTTTCTTGTATATG
CCTTTTTGATGCTAACATTATGCGGGATATCCTTGAACAGGGATCTCACT
ATTCCAGGCCGTGAGCTATCAGGAGTTCATTTTGCTATGGAATTTCTCCA
CGCAAACACCAAAAGCTTGCTTGACAGCAACTTGGAGGATGGTAGATACA
TCTCTGCCAAGGGGAAAAAGGTGGTGGTTATTGGTGGTGGAGACACAGGC
ACAGATTGCATTGGTACATCTGTTAGGCATGGTTGCAGTAGCGTTGTAAA
TCTGGAGCTTCTTACCAAACCACCAAGCAAGAGAGCTGCTGACAATCCCT
GGCCGCAGGTAAATATGTCAGTACATGTAATGATTTAGTCAGTACTTCTT
GCAAAATAAGGCCCATTTGCAAAAAAAAAAAAATGGAATATTGCCTTGCA
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TTTCCTATTGTTCCCTGCAGTGGCCACGTGTCTTCCGCGTGGACTACGGG
CATCAGGAAGCATCTAGCAAGTTTGGAAAGGACCCAAGAACTTATGAAGT
CTTGACCAAGCGTTTCATTGGTGATGACAATGGAAAACTGAAGGCTCTTG
AGGTGGTGCGTGTGAAGTGGGAAAAGGTAGATGGAAGATTCCAACTGAAG
GAGATCCAAGGATCAGAAGAGATCATTGAGGCTGACCTTGTCCTCCTTGC
CATGGGATTCCTGGGCCCTGAAGCGGTTAGTTATGCGGCCTCAGATGCCT
CTGTTTACCTTCATGATAATTTTTTTGACAACAACCAACTCACTGTTTAT
TTCTCTGTAGACTATCGCTGAGAAACTGGGTTTAGAGAAAGACAACCGGT
CCAACTTCAAGGCCCAATTCGGACACTTCGCGACCAGTGTGGACGGTGTC
TTTGCCGCTGGGGACTGCAGACGTGGACAATCACTGGTCGTTTGGGCCAT
CACGGAGGGGCGAGAAGCTGCTGCTGCGGTCGATAAGTACTTGTCAAGGG
ATGAACAAAATGCTGCTGAAGACATCACTGCCTCAGGTGCAGGTCTTGTT
CAACCAATTGCTGCATAAACAACACAGGCCTTATATAGATTTTTGGGTGC
TGATACCAACGTAATTAGGGTCGGTGGTTTTATCTTTTGATGATCATAGC
AAATTGTGCTGTAGTTGCATGATAAAGCCAGGCTCAATAGGGAAAGAAAG
AGGGGAGGGCCCTTTCATACTTTGGTAGACAAACAATTGGAAATTTTGGT
TGGCCATTGTTTCATGGCTCCTCATTGTTTAGCTATAATGTTTTTGTGTG
CTGAAATGCGGTTTTGTAGCCTGAATAATGTACAGTATTTTTGGTTAATT
AATAGATGCAAATTTGTTATAAGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.