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GrainGenes Sequence Report: AA017800

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Sequence
AA017800
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA017800
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCGGAAGTTGGGGCTCATCGCCCAGGACGAGGCGCCTTCGGAGGCTGC
TCTTGAGGCCTTCCACAGGATGTTTGAGACCCCTCTCACGGACGAGATGA
TCGAGGCGGTGGGGGAGCTCTATGGATGGACCCTCTCGGCGATCAGAGGA
TGCGTCACACCTCTACCGGGGGCGGTGTCAGGTGGCCACTTGGTGGCGGT
TTGACCCTTTGTGGTCTCTCCTCGGATGTCTACCAATGGTTTCCCGATGT
CGTACGATCCTATAATTCTTGTGTCCAACATGCGTGGTCTTAACGACCGC
GCGCGTCGTTCGGGTGTTAGGAGTGTCGTGTCCACAACGTGTGCGTCCAT
TGTTTGTCTTCAGGAGACTAAGCTTGCTATTGTAACACCTTCTATTGTAA
TGGAAACCCTAGGCGCGGACTTTGACGCTTACTTCTGCTTGCCGGCGACT
GATACGCGGGGTGGTATTATAGTGGCTTGGAAGAGTAGGGTGGTGCAGCT
CGACAGCGCACATGTCGACGTGAACAGCGTGACTGCGAGGGTGTCCCCCC
AGGGTGGCACATCCTGGTGGCTCACTTGCATTTACGGGCCCCAGGAGGAA
TCTGATAAGATTGCCTTCCTCGATGAGCTCCGGGAGGTCAGGGGGCTGCA
CCCGGGCCCCTGGGTCCTTTGTGGATACTTCAACATGATCTACCGCGATG
AGGATAAGAATAACAACAACCTTAACCGTCGTATGATGGGCCGCTTCAGG
AGGTTCCTGAATGACTGCCTGTTGAAGGAGATCTATCTCCACGGGAGGTG
TTTTACTTGGTCCAACGAGCGTGAAACCCCGACGCTGGTCAGACTTGATA
GGGTGTTCTGCACGTCGGACTGGGATGAGCTGCATGGATCCTGTTCCCTG
CGCTGCCTCTCGTCGGTCATTTCGGACCATTGCCCTCTGCTCCTGGACTG
TACTCCGGTCGCCGCAAGGCGTGGAAGGTTCCAGTTTGAGCATTTTTGGA
TGAAGTTGGAGGGGTTTAGTGAGGTGGTTACCGAGGCCTGGACGATGGTC
GACGGAGATCCCGACCCGTTCAAGAGATTGGTCGCCAAGCTCAAGCGGAC
AGCCCGTAGGTTGATGAGCTGGGCGGATAAGAAGGTAGGTTCGGTCAAAC
TGCAGCTCATGACAGCGCGGGTGATAGTCTACCATCTTGATGTCGCCATG
GAACACCGCCCCCTCTCCCCGGATGAGCGCGCCCTCCGCGCAATGCTGAA
ACGCACCTACCTTGGCCTCGCTTCGCTCGAGCGCACGATGGCGCGTCAGC
GCGCTAAGATCCGCTGGCTGGCTGATGGGGACGCCAACACGGCATTCTTC
CACCAACACGCATCTTATCACAGACAGAAGAACGTGATCCACAGTCTTCA
GGTCGACGGCGCAGTTGTTGTAGACCATGCTGCCATGGCTGAGGCTACAT
ATCACCACTTCCAGGGGTTGCTGGGTTCTGACTCTGGCCGACAACTCTCG
CTTGACCTGGACTTCCTTGGGCTCTTCCAGGAGGACCTATCGAGCCTTGA
GGCCCCCTTCTCGGAAGAGGAGGTATGGGAGGTCATCTCCCGGCTGCCAC
GTGGTAAGGCGCCAGGTCCGGACGGCTTCACTGCCGAATTCCTGCAGATT
TGCTGGGGGGGTGGTCAAAACGGACTTTATGGCCGCCTTCGACAAGCTGT
ACTCCATGAATGGGCGCGGGTTCCAGGGCCTCAATCAGGCCCTGGTAATA
CTGCTGCCCAAACATGCGGATGCGGCTTCTTTGGGTGACTACCGGCCGAT
TAGCCTGATCCACATCTTTGCTAAACTAGGCGCGAAGGTGTTAGCATCAA
GGCTTGCCCCCCACCTTGGAACCTTGGTGGACGTAAACCAATGCGCTTTC
ATCAGGAAGCGCTGCATCCATGATAACTTCATGTTGGTTCAGCAGACAGC
ACGCTTGCTGCATAGACTGGGGGAACCGTGAGTCATGCTAAAGCTAGACA
TAGCCAAGGCCTTTGACTCCGTCTCTTGGGCGATGTTGTTCGAGGTTCTG
CAGAAGGCTGGGTTTGGCCCTAGATTCCGTGAACTGGTGGCCATCCTTCT
GTCGACTGCGAGCACCCGGGTGATGCTCAACGGCGAGCCGGGCCCTCCCA
TTTGGCATAGGAGGGGCCTGAGACAGGGAGATCCTCTGTCACCAATGTTG
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ATTCGGGGTGCTGAAGCGTGTTGCCTCCCGAGAGTTGGTGACGACCGTCT
CGCTCTACGCGGACGATGTGGTGATCTTCTGCCATCCCGATGGGCGCGAG
CTGCTCGCCGTGCGCGCTCTGTTGGATCTCTTTGGGGAAGCATCAGGGCT
GCACACCAACTTCACCAAGTGCTCGGTCTCACCTATTTCCTGCACTGATG
AAGTGATCCAGATGGCTGCGGCAACAATGGAGTGCCAGGTGGCACTCTTC
CCCGTAAGATACCTAGGGATCCCTCTCTCGCTGCGGCGCCTGTCTGTGGC
GGCGCTTCAGCCGCTGGTCGACAGCATTGCGGGCCGCCTGCCTACCTGGA
AGGCGGCAATGATGGCGAAGGCTGGGCGCCTTACCCTGGTCAAGTCGGTG
CTCCTGGCGATCCCCCTCCACCACATCATTGTGTTGGGCCTCCACAAGAA
GACACTTAAACAAATCCAACGGATTGTTCGGAGCTTCCTATGGGCCGGGA
GAGCGGAAGCCGAGGGAGGACACTGCCACGTGAGTTGGGACAAGTTTTGT
AGACCCAAGTGCCTCGGCGGCCTTGGGGTCCCCGACCTCTCCCGCTTGGC
GATCAGCCTTCGGTTGCGCTGGGTTTGGAGGATGCGTACGGATCCGTTGC
GGCCTTGGAGAGGTCTAGACATGCACTTCTCCAAGGCAGAGTTACAGGCA
TTCGACGCCTCTACCACGATGGTGTTAGGTGACGGAGCCACGACCCTCTT
TTGGATGGACCGGTGGTTAGACGGAAAGACCATTGGAGAGATAGCGCCGG
AGTTCTTCGCGCTGATTCCCGGCCGCGCTAGGAAGCGCCGCACTGTGAGG
GAGGCGCTTGTGGAGCGCCGCTGGATTGCTGACATCCGAGGCGCGATGAG
CCCGCTTTCCCTCTGGCAGTATGTCCAGTTATGGATCCGAGTGCGTAATG
TCGAGCTTGCCGAGTCGACTGACACCCTCCTTTGGAGGTGGACGCCGGAC
GCGCAGTACTCTTCCAAGTCTTGCTACGAATTCCTGTTCCAGGGATCGAT
TAGTTCGAGATCTTGGAAACTTAACTGGCACACTTGGGCACCCCCACGGG
TGAAATTCTTCATTTGGCTTGCCTGTCAGGATCGCTGTTGGACGGCTGAG
CGGCTCGCGCGAAGAGGGCTCGCGCACCCGCCAAGCTGTCCCCTGTGTGA
CCAGGAGGTCGAGACAATGTCTCACCTCCTGGTTGGCTGCCCCTTCTCTC
GGGCGCTTTGGCATGAGGTCCTATCTTGGATACGTTCGACGACCCTGCCT
CCGGATCGAGAAGACGACTTCGTGGACTGGTGGCAACACGCTGTGCTTTC
TACCCCCCGCGCCATGCGCAAGGGGACATCTTCGCTGATTATGTTGACGG
CATGGTGGATCTGGAAGCATCGCAATGCGGTCGTGTTCGATCATGTGTCG
CCTGACTTGGGTCGCCTTCTCACCACCATTCAAACCGACGCACGCTCCTG
GGGGACTGCCGGTGCGATTGGCCTCCACGCCTTGATCCCCGTGGTTCCAT
AGGTCTGGTGGGTTGTGTTGTATGGGTTGGTGGCTCTACTGAGCCTTGTA
CATATCTGTACAAACTTCTTTTCCTATCAATGAATCGAAACGCAAGGCTT
TTGCGTTTTCGCAAAAAAAAAATGATTCCTGAAGAAATGCACATGCACAA
TCCTTGTTTGTGGAGATGAGACCTAACGACATGATGTACCATGGCCTGGT
TTGAGCGGATACTGAAAGGCATACTTGTGAGGAGTAAAATGGTCAAAGGA
CACAGATTTCTTGGCTAGAATAAGATCCGTGCAATCCCGCAACAGCAACC
AACATACATATGTCCTGACAATAACACTATCTTCTATTGGTGTTTGGAGT
AAAGATAAATCCATTCCATTTATAAACTAAAGAACATAACAGGCAACTTC
TTGATGCAGGAGCAAAACATGATAGCTGAGATCTTTAATATTCCTGACAC
CCTTCATTCACACCTAAAGAACTGATCAGAACCAAGCAGAAGTATATCTC
TGTAACATCCCAAATTTCATCAAATTCAAAACCATGTTGTTGCATTCATA
TCATCATGGCATGTTTACTTGGCATAAAAAAATTTCAAAGCTAAAACCCT
AATAAAACCATATTTAAACCCCTTTTATATTATATGTATGGGTCATGGTT
TTATTTTTATTTTGTGACCCAAAAATGTTTTGGAGTGTATAAATGTGTTT
GACACACTTGTTTAGCACTAGGATCACAACACAAAATATTGGTGAAAGTT
TGAATTGGATTGGATTTTAATAGACCATTCAAATCTTATTTAGAAAATCA
AAATAGAAAATAAAAAGGCAAAGAGAGAAAAAATAAGAGGCAACAACCCT
TCTGGCCCAGGCTCAGATGCAACCCATAGCCCACCCGAGAACCACCCCCT
CTCCCCTCTGTTTCTCACCCGCGCGCGCACCCCCTCACTGACAGCTGGAC
CCCGCAGCCACCTCACCTCGTCGTCTTCAATCACGCGCCAAAGACCGCGT
CGTTGCCGTTTCCTCCCCTCTTCACTTTCGAAATTGAAATCCGTTAATTG
CCATTGATTCAGCGCGAGATTTCCTCCCTCGCTCTGGCTACATAATCCCC
TTCCCCTCCGCAGGATTTCCCCTCACACAGCTAGATCTAAGTACCGCTAG
GCTGCACGAATTTTGCCTCGCACCACCGCAGTACCGAGAAGCTCTGACGA
GCTATTCCAGTGAGCACCATGCGCCCCTCAGCCTCTGGTTCACGCGATCG
TGTTCCCCTCTATCTTGCACATCTTCTAATGCTTATGGCTTGTCCAAATG
TGCCCCAGGTCGTCGCCCCCGTCGTCGTCTGCAAGCGTTCGAAGCCCAGC
TCAACTCCGTCAAGCCATTCCGGTGAGCCCCATGTTCCCCTTGACCTCTG
ATTCACGCGATTGAGTTCTCCTTTGTCTTGCGCATATGCTAATGCATGCC
GCTTGTCTCCTTGCACCCTAGGTTGTCGTCTTCGTCTCCGACTGTGAACA
CCCGACGCGCAACCGAACTTCGACGAGTGTTTGTGCCTGCGTCCGTGCAC
CCCAGCCCAACCGTGACCACGTTGATCATCGCCTCGTCTCTACAACCGTG
GTAAGCACCAGTGCCCCTCCCCTACCCCCTGACCTCCCCGGCGCATCACC
GCCAGAGGCGTCGCCGCCGCAGTGTCCATTCCTGCCGCTGAGTTTTGGTT
GGGCAGATCTGATCCATTGGATTTGGATCTAGTGGCTGTGATTAGATGAC
TAGGCGAAGCGGTAAGCACAGATCTGGACCACTAGATCTAACTTAGATCC
TACGGCTAGTGCGCGTGATCCACCCGAAACGGTATCGTCCAATCAGACGC
TGTCGCATAGCTCTGTTTTTGTTTCCAAATCCAGATTTTATGTATTAGTT
GTTTAAACTTGTAAATTGCATAAATTTTGTTCTGTAAATCCAAAAATTGC
AAATTTTATATATATGGATTCAGAAAAATGAGCCCTTTGCATCTATGGCC
TTGATTTGGCCATTTGCTTTCGAAAAATTAGGATTTTATGCAGAAGCATT
TGTAGGCCTATTTTGACTATAAAAATTATTTAGAATATTATTTTTAGGTG
GTTTTTGTGTTATTTAGACTTTAGATTATATGCTTTATCTTCAGTACAGT
AGATTTTGATTTTAAAAGTGTGGCAATACATCTCATTGCATTTTGCATGC
ATTCATATTATTTTTGTATGTATATTGATTTGTGAATATTTGTTGTATGA
ATTTGTGTGTAGATTTTGTGGATTGTGGAGAGTGTGATTGTGAGGATTGT
ACCTATGCTCCTAGATACCAAGGAAAGTGATATATCATCACATGTCCTAC
TATTTTCCTTATTGCACTAGCACTATTTTGAGTAGGATTTGCATGATGAT
TTTCAAAGTATATGCTATGTTATGGTAAATCCTATAGATGTTGTCTTAGT
AGTTTTTCCCTAAGTTAAGAGACATGTTGTGCTAGTATGCTTAGCCTAGC
TTATAGAATGCAAAGGTGGAATATTCATGTTATGATATTATGCAAAGTCT
ATTGCTATGTTTTTTATTAATAAAACAACTTTGTAAACGAATCACCTGGG
TGGAATGAGACTTGTATGGTTTGTGTTGAGTGGTTACACAAGGCCCATGT
CTATGGTTTACCTTGTGTATCACACTTGTGGATGGCCACCCAGGAACAAA
GGGATTTGAGATATTTTGTGTCAAGGAGCTTCTAGTGCAATCACATGGCA
TATGGGCTCTGCCTTGACCAACTAAGTTGTAAGAACTCAGCCAGATGGAC
AGATGGTGGTAGAGTTGGTAGGATGGAACGCGTTCATGGTGGTCTGAGGG
ATTGCTTCTAAAAATTCTCGTCTCCATGCATGTCGAGTCTTGTGGGAAAA
GTGTACCACCTCTCGAGAGGGTAAAACTAAGTACTTAGCCGTGTCCCCGG
TTATGGACAATTCTGAGTGACAAGACATTGAAATGGTCAAGAATCTCCTC
ATCCCAATTTCTCTAAGTTAAAACTTATGGTTGAAAAGGATAGAGGTTCA
CCAATGTTTATTGGTGGTTTCTTGGTGTTTTTGTCAAAAAAAACTTAGTG
TTTTCAAACTAATAAGACAAACCTTATTTTTTGAGCGAAGCCAGCCGGAA
CTATACTTAGCCAAATTCATATAGTTATTAGATGTTACTACACTACTATG
GTATCACTTGACAATACAATTCCAAATGTATTGACCCTCTGTGGTTGTAA
CTTATTATGTTGCAGGTTACTCTGATGGTGACTAGGGTTATGAGTCTACA
CTTAACATGTTTGTCTGTGGCATATGAAGATGAAGACTTTATTTATACTG
TTAAGTGTTGAGAACTCTATGTATTAGCCTTGGGATAATGGGTTGTAAGA
ACTTTTGAATCTCTGGAATTACGATGTAATAATGACCTTTGTATCTGTGT
ACTTTATTTTAAACTGTGGATGCTATAATTTCGATCCAGGGACTAGCATT
GCAATCACAGGGGCCTTTACCTTAAAGGTTGAGGTTTTACAATATCCTTC
ACCTCCTTGCACAGTGTAATAACCTACCACTATAACGGTATAACCTGGGG
TTTGTAGGTGAACTGATTTATGGCCGAGTGGATATGACATTAACGTCCGG
ACAAGAAGGGGAAGAAAATACTAGTGGATGCGACCTGATGGTCAGAGGCA
ACATCAAATCTACGATGGCCCATTGGGAAGAGCTTACGTCGTTGACACTG
GACTTGTGAATGGAGCCCCCACTCAGCTGCACCACCAGGAGAAAGGCGGG
AAGTGCAGCGTCTTTGTCATTCCACCGCACCTACGATTCAATCGCCACGC
CGGTAGGAGGAGAGAACCCTGCGGGTGAGGCCAGAGAGAAGAGAGAAGGT
GAGGCCACTGTTGGTGCCACACCCTAACGCCAACGGTGACTCCATCTTGT
CTCCTCGCCCTCCGTGGCCTCCCGAGTTTTCTACGAGAGAGATGGGGGAA
GGGGAGGGTGGGGAGAGGACGAACAAAGGTGAAGCTAAAACGACGGATAT
TTTCGGGACGGGATACAGAAAGACAGGAAAGAAATAGATAAAATGGGCTT
TCAAAACACAGTTTCTGAACCAGATTTAGCCCGACTGACGACAGGACACC
CAGGTCCGTTTAGGGAGCAGCAGCCCAGTTATGTTGGACTGGCCGTGGGC
ACTGGATACGATCGAACTAATTTAGGATGTTGTTTACGGATCGAACGTCC
ATCAAGCCCAAATCGCTGTGAGCAGCCGCAGCTTGATACTTTTTTACTGT
TTCTTAATGCCTTGCTCGATCGATCAAAGAAAAATAAAAAGGAAATTTTG
ATACAGGACATCGTTATTTTCTGTCATTTGCTAAAACACACTATTTAATT
ATGTCTTTACTAGATACCATTATAATTTTATGACACATTTGCCAGAACAC
ACCATGTGGCCGCAACAACCGTCGCCCCTGACTGCGAGATGCCGAGACCG
GGACGCCTACAGCGAAACATTCCACGACGGCGACTCGAGTGCACGGCGAT
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TCCATGATCCAGGCCTAGTCTAATCGGCTGCACTCCGTGATCAGTCTGTA
GTGTCAACTATTTTCATTGTTAATTCCACCGAGAGCTCCCCATTATAATG
ATTTTTGAGAGGATTTTGGTCCCCTGGTTACTAGATGAATTTCATAAAGC
TGTACTTGGTTGGAAAATAGAATAATAGAATTTTACAGTGTATATGTATG
ATTAATTTGCCAAATTTTAATGTCATCTCAAATTTTTGTTTATCTAAACA
CATGTGCATGATGGATAGGTTTGTTGTCAAAAGAAAACGCACATCACAAG
ATGTCTCGGAAGAACGGAATTGGAAAGAGGAGATTCAATATGACCCAGGC
AAGAGAAAATTGATAGAACATTATCATCCTAATTTGAAAGAAGTGGTAAG
AAGAAAGTACTTAGTTAACAGACCTTGCCAGCCAAGAGAAATTGCTTTTC
CATATTCATTGTTTGGAAATAGAAATAGAAATAGAAGGTTCAATCCTGAT
TGTTTTGATGAATTTTGGAAGTTGTCTTGAATATAGTGAAGACAAGGACA
AATCATATAGATTTTGTTGTTTCTGATTTAGAAACCATGGCAGCAAGAAG
GAAGCTGGGTACGAGACATTTGTTGTGAATTGTTGGAATAGCTGGAACAT
GAAGGTGAGGTTAAAAGATCATGTTAGTGATGTGGATAGTATTCATAATC
AAGAAATGAAAAAATGTGTTGATTTGCTAAGAAGAGACCAGGAATGAAAA
AAAGATGTTGCAAAGAATGCTACGATGGGGTCTCCAGAGGTCCAGAAGGA
TATTGCTAAGGGTTTTGCACATGTTATAGTCCAATCTATTCTCAAAGAAG
TTGAAAATAGTATGTTTTGTTTGCTTGTTGATGAATCTAGGGATGTTTCT
TGCAAAGAACGGATGGCAGTGGCCTTACGGTATGTTGATAGTTTTGGAGA
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CGTATCTCAAGACTACAATGGATTCTCTATTTGCAAAATACAAGCTGAGT
TACAATCAAGTGAGTCGACAAGGATACGATGGTGCTACCAATATGTGAGG
TGAGTTCAGTGGCCTAAAATCATTGATAATGAGAGAAAATAACATTCTCC
AACTTGCTTGTTTGGTCAACGGCTTTGACTCAAAGAGACATGTTTTGTCA
TTTTAATTTGGAGAGTTTGATAAACTTGGCTAAACTATATCCTCATGATT
TTGATTCTGGGGAACTGAGGGATCTTGATAAAGATCTACGCCTATATATT
GCTGATGTACATACGGATGATAGCTTTTCCAGCATCGCAACAATCATTGA
GCTTTCTCAAAAAGTGGTGGAGACACAGAGGCATATCATGTATCCTTTGT
TTTATCGGTTGTTGAAACTAGTGATTATGTTGACTGTTGTCACTGCTACA
GTTGAGAGGTGCTTTTCATCTATGAAACTAGTGAAAACATTTTTGCACAA
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ATCTACTTCTACAATTCTAGTCATTCTACTATATTCAACTTGAAAATTGA
ATATATTTGTTTATTTTGCAGGTTACTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.