Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039061

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039061
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039061
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCTATCCTCCTTGCAGCAAGCTACTGGAATTATGAAATGCCAAGTGAG GACCAAAGAATGCTACAGGGATGCAGTCTCTCCTTTATCTGGAATTCTTT TGAGGGGCAGCTGGTGATTGCTAGTTTCTTGCAAGCAGTGATTATCTCCT GCCTTGCTAGTGATAATATTTGATGGGATTCTGAGTTTATGGAATGGAAG ATTCCTTGGTTATACCACCATCCGCTACTGGGGAATTGGTTTCAGGTTTT TCCAGCTGAAATTGTTTTGTCGATCGACTTCTAGTACTCTAATGTTGACA ACAAGTCAGACAACCATTCTTTGCCTGGACTTGCTTGGCTTGGCTCGGTG CCTGCTCCTGTTTTTTTTACTCCTTGGTTCACCCCTGACCTCCCATTCAT GTGGTTCCTAGTTCCCACACCACCATGGTTATAATTCATACTTTTTCGAG TGAGGTAGTGAACTGGGTTCTTAACATTAGTGTAGACCAGAGAAATTTTC ACCATTTGTTCCTTGCGGCCGTGTACATACTGGTCAATATTCCTCCAGCA ACATCCAAGCCATGGCAAGGACTGCCACTGCCGATCGACTCTAAAGTCAG AGCGTTGTTCAATGCTTCAGTTAGATTCAAGCTTGGGAATGGTGAGAAGA TCAAATTCTGGACTGACCCATGGCTGCAGAATCTCAGCTTGTGTGACCAC ATGCCTGACCTATATGCTGTCTGCACTCGTTGTAAGCTCTCCACTCGTGA TGCCCTCTCTGCTAGCAAATGGTCAAAACACTTCCGACAGTTCCTCCCTG CAAATGCCATTGTGCAATTCGTTGAGCTGTGGGGTCTACTTGACCACATC GTCCTGGACGCCGCAACTCCGGATTCGGTATCCTTGCGATGGACTACAGA CGGTGTGTTTACGGTGGCATCGGCGTACAAGATTCAGTTTCAGGGAGCCG CTCACCTGGCGGCCAACACTCTCCTTTGGAAATCTGACACCACCCTTCGA TGCAAAATCTTCTCCTGACTTGCTGTACTCGGGAAGTGTTTAACTGCTGA CAATCTAGAAAGCAAAGGCGTGCCATGCAACCCTTGTTCCCTCTGCAGAA TTGAGCGTGAAACTGCTGTTCACCTCCTCACCAACTGCTCCTTCGGTAGA TCCTTGTGGGACAGGGTCTTGGTGCACTGCAACCTCCCGGCATCCCTCCA TCCGCGAGGCGTCGTGCTCTCTCTTTCTGACTGGTGGCAGATGACGGCAA ACTAGCTCCCGGCCCAGCAGTGCAAAGCTTGGAGCTCGGTGGTGCAACTC ACATGGTGGACACTGTGGAAGGAAAGGAATGAGCAAATCTTCAGACGGCA GGCCTCCCTCACACCGGCGGTGTTCGGCAAATTTAGAGCTGATCTCGAGC TTTGGCACCAGGCTGGCCGTAACAGAACCGTGGTCTTCACAGGACGACCA CGTGAACCAGACTGATCGATCGTGATAGCACAGGCTCCTTCGCCGGCTGA AACGGCTGGGGAATTTTCTGTTATTGATTTATCCGTTTTTTTGAGCTTCT TCAGTTTTATGCTTAGTTCCTTGGTTCGGCTCCCCCGAACCCTGTAACTC TTCTTAATCTTAATCAGTGAAAAGCTGCACTGCCAACCTTTTCGTCAAAA ATAAGTTCAGTAACTGTGAGATGATAAGCACTCTTAACAGAGAATAACCC TGTCATAATATTTTGATCTCTGTAGGTATTTGATCTGAGAGAATCCCTCG CAGAACTTTATGAAAGTGAAGGCAATTTGTCAAAAGCTGCGGATATTCTC ATAGGGATTGACTTTGATTCAAAAATAAGGTAAATGGTAAATTTTATCTT GCAAAACTTGCCCAATGCTTCTCTGATCCGCTGGTTGACCCATCTTTCTA AATATCAGGATTCTAGGAGATTACACGAAGTTTGTCAATTATGTGCACAT AGCAAATCTTTGCTTGCAGGTCAGTGGCTTTTCCTCCGGTTTGGTCATCA ATACATACTTTGGTTTGAATAATGTTGATGTGTTGATTGTTGTAGGATAA AGATGTGCTTAAAGCCGAACCGTACATCGAGAAGGCTTCAAGACTTGTGC AAGAAATCAGTGAACCAGATTTAATATTGAATTACAAGGTTTGTGTACTG ACCTAAACAACAAATTCCAGAAAATTTTTTTTTTAGAAAATTGAAAAGAT AGAGTTTGATTACAAGCCCCCTAAGAGGTTAAAACAGAAGCAACGAATCA ATGTACATCCCAGGTTTCTGGCAGCACACTATAAATTTAGAAATCTCAGT AAATTTAGAAATTGGATGAGAAATCAGGGAAATCTGAGGTTAAAACTAGA GAAAGGAGATAAGCACCGAGCCAGAAGGCGGCGGTGGTCTAGGATTTTTG TGTTTATTGGAGAAATTTCTTGAATTCTCTCACTACACTGTTCCACATAC ACTCTCTATACACACTATAGTAAATGAGCCTCATATGGGCCATACAGCAC AACACAAAAACACAAAACATAAATTATATTCAATGCTCCCCCTCAAATGT GAATCTTGTGGAACTATGTCACCCCGGTCAACATCATAATATGAAGAAAT AAAACAGAATTGTGCATACCCAAGTAAACATCTGCAGGATAATATTTTAA CCCAGCAGTTTGTTGTATGATCTGAAGGGTGATAATTTATTACCCATGTT TAGCATTCAAGGAGGTGGTCGACAACCCTTGTAATCCATGCTTGCAGTAT GGTTTTGCCGACGTGATTTTATGTTTTTCAGGTTGTGCATGCTTGAGTTC CCTGCATTAAAAAAACATTCATTACTAAAGTAAAGTTATAGTAGCATTTT ATAAGTACATGCTAGCCCAAGCAAAGAACACCCTCAGAACCTTGTAGAGC TTGCCATAAATCGCAATCTTCTTATAGAGAGCAAAAGTGATGGCATTAGG TCATCTTGCACTTCAGTACCTGCCATGGTTATCAATCCAACAAGCAAGCG TTTTGCATTAGAATCTGCAAGTGTCTTGCAGAGAACTGGGTGCCTTGGGC TTGGGCTTAAACTGGCTAAAGGCTACAAGCTGGCTAAAGGCTAAAGCTTC AATTAAACCGCTCCTGTACAAGGAAGGGTGCCTTGGGCTTAAACTGTTTC ATCAGTGTCTTCTCAATGACCAGTGGGTCTGAAGCTGATTGATTCTGCAT TTATGTCATATATCATTAATGTGAGGTTAATGCACCAAGAGTGTCAGCAA TCTGTGCAGGGGAAGAACATGATTCAAGACTTTCACCAAGGCTTGAGATT ACATAATATGAACCACCAGAAATATTTGCTAATGCACACATCACATTTTC TTCCAGTGCTTGGGCAGGTTCTCCTTGCATGAACTTTTTTTATGGAGCAA TAGTAGCATTTATAAGAGCAGGAATCCCATTAGAGCTAGCTATCTCACGC TGAGCTTCTTTACTCTTGAGATACCTTTTTCAATTTGAGCAAGATTGATA AAATTGCCAAGATTTGTTGTTTTCCCACTTTGTTTGGAACCTTTTGCACT TTTCTTTAATTGTTTCATTTTATCGAACTCCTAGATTTTAAGCATCTCAC TTCATCCTTTTGCCGTGAAAATCAGTTTGTCTTTTTCACCTTGAGCAGTT GAGCCAATTTCTCTGCAGCAGTCCATCAGCTCACACAGAAAGCCACACCA CTCCTCCGCTGTCCTTTACTCTCTTTCCTCTTCTCCAGACCAGCAAAACC ACCAGCAGCAAGTCAGCAACAGTGTTATATCCTCTTCACTTCTCAGAGAA ACAGATCCAAACTTGCCTTCTTCACTGCAGCTCAAGCCACTCCTAGATGC ATGAATCTCATCTGGCCTACTCCCGCTACAGCCTTCTCAAGCTCAGACAT CTGAAGCAGATGTGAACAACTCTCTTCCTTGCAGCACCGGATGCAGCACT TCTCTTCAGTCACACGGACACAACTGCACAGCTCGCTCTACTTTGCACTT TCTTCCAGACCAGCGCCTCGGCAACCCTTTCTCTTGCAAATTCTCATGTA GCAGCAACTCACGAACAGATTCAGGCAACACACAACTTCTCTGCTCCTTG CTACATCCAGGAGCTCTCTCCCCCTTCTCTGCTTATTGCCGCAGTATTCA CTGCACTAACACAGCTACTTCCAGTTGCTAGCGCCCACAGCTCTCTCCCT CACCAGTCCCTTGCCTGACTACTTTGCGTGAAGCAAGAACCTCTTCTCTT CTTGTACTCAGCAAGCAACTACAGCTTCCTTGCTTTTTCCATGCAACTAC AAACAGCTGCACCTCACCCAGCTGTCTCCTTTCACCACCATGTCCCAGCG CCCGCGGTCTTTGTGCTTGGCCATACACCACAACACATAAACACACAGCA GAACTTATGTTCCATTGTTCTATTACTTGGCGAATATTTGGAACAGCGTT TAGGTTTACAGTCTAGCACCCCAATAGCTCCAATCAACAGAGATCAAACG GAAATAATGAGGATTATGAAAGTTGCATCTTTATAACTGCAAACCGGTAT AGGGTGTTATTGTATGACCGTTAGCTGGATTGTTCTTGGTGTCAATTTCT TTAGGCAACCGATTTTCAGAGTATGACAGTTTGTGCTGCACAAATAGTTT TTTTTTTCAATGTACAAATTAAAGAATTTTGAACTCAGTTATCTGTTTTG TATTCTTGAAGCTTTGCAAAGCAGAATACCTTGATATGAACTTGAAGTTA TTGGAAGCTGCCAAGCACTATCATGAAATTTCAGAAACAAGACAGCATGA AATTGGAACTATGTAAGATCCCCCGCCCCCACTTCCATCTTTCAGATTGT TGGCATTCTACTTACCTCTTCTTTGGTAAGCTGTATTTAAAAATGGGGTT CCTTTTTTATTGGGATGTTGCATACGAATGCAGTGAAATCATAGAAGAGG AAATGCAAGACGTCTTGAACTCTGCTGTAACGTGTGCGTTACTGTGTGGT GCTTGTCCAGAACGCTCTCGGGTACTTAATATGTTATCTCAGGTATTGGT TTTGTTCTCTCCCCAATATTTCTTTCTGGCAGCGCCGTATGTTGCATTCC CTAAGTCTATTATGTTCCATGATTGCATATCTGTGATGCTATTGCCCTTT CCCTTTCTCAGGATAAGAGGTGCAGTAAACTCAAGATATACCCAGTCCTG CAGAAAGTATGTAATGCATAGCTTCACTAAACATTATGTCTTGTCCAGAA CGTATTGATGAATTTGGATTTATTTTTTAAATATTATAAGGTTATTCTTG GAGAATTTTTGTACAAAGATGATATTGCTTCACTGGAGGAGAATCTAATG CCCCATCATGTATGTGAACTGTCAGTTCATAAACTCCTTCAAGATAACCT GTAAATTCTGACATTCTTGACTGAAAATTCTCTGTAACAGAAAACTCCCC TGCCAGACAGCTCTACTTTACTCGACCAGATGATGGTCGAACATAATCTA CTTTGTACCAACAGCGAGAAATATCCAAGGTCCATCGATTCACTGTTTTA TTTCTAGATTAAGTATACCTTTATTCTAACTAACTGTAAAATATTTCTGC AGTTTTGATTTGTTCAACAGCATGTTGGGCATAGACCCCCGGAAGGCAAG TTTGAAGGCTGATTCCTCATTATTTCTGTTGGCAGAAAACTGCAGTACTG AAACCCATTCGAAAATGCAATTTATTAAAAAAGAAATTTGAAGTCATAAC AACTGTAACATTCTCATTCTAACCATCTTAGCTGTTACTAGTATAGCAGC CAGACTTATTTTGTTCTACCAACTTGACCATTGCATAAATTCTGTAGTGA ATTTTACTTTTCACCTCCTACTCCTAAGATGTCAAAATTGACAGTGATGA TCCCATTTTACAAATTTTGATTTAGTTTAGTTTGATCTATACTATCAATT TTTATGATGTTCGACAAGTTCTGAGCAAGTTAATGTTATTTCTTCTTTTG CTTTTTAATGATTTCTAGGTGACCAAGTCTGCTGCAGTTATGTCTGCATC TAAAATGAGAAGTGCTCTTTGCTCAGTAAAGGATGAAGTAACCAAGATTC AGCATAGTCTACGGCTAGAGCGTGATGCTTATGGTGCATATGAGGTACTT CAGACAGAAAGGCGGCTACATTTGGACACCGCACAGGCACATGAGCGTGC TGACAGAGGGTATTCTGAGTTGACTGAAACTGTTCAAAACATCATAAAGA AGATTGTGAGTGAGTTGGATGCTGCTGCAGATAGTTTAGGATCAGAGCTC GAGAGCATTGATCTGACCTTGTCCGAGCCATGAATTCTAGTTAACAGTGG TCACAGCTATGTCATGTTATCTTGTGGACAAGATGCAACTTTGAACACCT TGAATATATATATAGGAATGTTATGTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.